PROTENAS- CARACTERSTICAS GERAIS

As protenas so as biomolculas mais abundantes e

importantes nas clulas, constituem o 50% ou mais de
seu peso seco, sendo 80% nos msculos, 70% na pele
e 90% no sangue.
So encontradas em todos os compartimentos celulares
e so fundamentais para a estrutura e as funes
celulares.
As protenas so formadas pela polimerizao de
aminocidos, atravs da condensao do carboxilato de
um aminocido e a amina de outro aminocido, com a
formao de uma ligao covalente tipo amida e
liberao de gua.


PROTENAS- CARACTERSTICAS GERAIS
Seu peso molecular varia entre 5000 a 1.000.000 Dalton
contendo de 100 a 8000 resduos.
Altamente heterogneas na composio e seqncia de
aminocidos. Uma cadeia com 100 unidades de
aminocidos h 1,27x 10
130
seqncia possveis de
aminocidos.
Existem muitas espcies diferentes de protenas, cada
uma especializada para uma funo biolgica
determinada.
A estrutura tridimensional fundamental para a funo
biolgica.



Aspectos Relevantes da Estrutura
Tridimensional
Cada protena tem uma estrutura tridimensional
unica definida pela sequncia de aminocidos.
A estrutura de protenas est intimimamente
relacionada com a funo.
A predio da estrutura tridimensional de protenas
um dos grandes desafios da bioqumica molecular e
da biolgia computacional.
A predio da estrutura e funo das protenas nos
permiter entender os mecanismos de interao e
regulao molecular.
Cada Proteina unica em sua
estructura
Sequncia de
Aminocidos
NLKTEWPELVGKSVEE
AKKVILQDKPEAQIIVL
PVGTIVTMEYRIDRVR
LFVDKLDNIAEVPRVG
Folding
ou enovelamento,
dobramento da cadeia
Existe uma Intima Correlao entre a
Estrutura e Funo da Protena.
enzyme
A
B
A
A forma o complexo
ES
Digesto
de A
enzyme
Reconhecimento
da forma e de
cargas do
Substrato no
sitio
Cataltico
Hormone receptor Antibody
Reconhecimento do substrato
no sitio cataltico da enzima.
enzyme
substratos
A sntese protica ocorre nos ribossomas ou
reticulo endoplasmtico dependendo do destino
da protena
protena produzida:
As Protenas so Fundamentais para
os Organismos

Catalisadores:
A maioria das reaes quimicas
so catalizadas por enzimas de
natureza proteca.
Transportadores:
Muitas protenas transportam
molculas ou ions: O
2
,Fe, Cu e
lipdios
Transferem informao biolgica:
hormonios
Alcool
desidrogenase
oxida alcools a
aldedos ou
cetonas
Hemoglobina
Insulina
controla a
quantidade
de acar no
sangue.
ORGANIZAO
DA ESTRUTURAL
DAS PROTENAS
Estrutura Primria - Sequncia de aminocidos

Estrutura Secundria Enovelamento da
estrutura primria na forma helicoidal, - hlice
ou de cadeias paralelas, -pregueada

Estrutura Terciria - Estrutura espacial
tridimensional formada pela associao de
domnios em estrutura secundria

Estrutura Quaternria - Estrutura tridimensional
formada por mais de uma cadeia polipeptdica
Nveis de Organizao Estrutural de
Protena
ESTRUTURA DE PRIMRIA DE PROTENAS
N-terminal
C-terminal
A maioria das CADEIAS POLIPEPTIDICAS DAS PROTEINAS; contm entre 100 e
2.000 resduos de aminocidos
O peso molecular mdio dos AA em torno de 110 Daltons.
-Hlice mostrando
o esqueleto da
cadeia peptdica
Estrutura Secundria
NOTA
1.A unidade peptdica e mostrada na
configurao trans (exceto para prolina).


Estrutura Secundria:
RESTRIES QUE AFETAM A FORMAO
DA ALFA-HLICE

1. A repulso ou atrao eletrosttica entre os radicais
dos resduos de aa
2. A massa dos grupos R dos aminocidos adjacentes.
3. As interaes entre os grupos R dos aa distantes 3
ou 4 resduos.
4. A ocorrncia de resduos de prolina.
5. A interao entre aa nas extremidades da hlice.
Alfa hlice- estrutura helicoidal contendo 3,6
aminocidos por volta, estabilizada por pontes de
hidrognio entre a ligao peptdica do 1 e o 3 aa
localizados no interior da hlice e os radicais dos aa
orientados na parte externa da hlice
Estrutura Secundria : Folha Beta Pregueada
Conformao
distendida da
cadeia
polipeptdica,
estabilizada por
pontes de
hidrognio entre as
ligaes peptdicas
de cadeias
paralelas
Estrutura Secundria
A folha pregueada mantida por pontes de
H ou ligao de hidrognio que se dispem
perpendicularmente esqueleto carbnico.
Estrutura da Folha pregueada
Antiparalela
Paralela
N-terminal
C-terminal
C-terminal
N-terminal
N-terminal
C-terminal

Comumente de 4 ate 10 filamentos
peptdicos podem se reunir em
folhas beta.
Unidades Bsicas da Estrutura
Secundria de Protenas
-helix
-sheet
Estrutura secundria, -
hlice and -pregueada,
estabiliza por pontes de
hidrognio.
Enovelamento da cadeia polipeptdica em estrutura
secundria, estabilizadas por interaes entre os
radicais dos aminocidos.
Estrutura Terciria
DOMNIOS:
UNIDADE FUNDAMENTAL DE
ORGANIZAO
Qualquer parte da cadeia
polipeptdica que pode
enovelar-se
independentemente para
formar uma estrutura
compacta e estvel.
Contm tipicamente de 100 a
150 aa
Fosfoglicerato quinase
Elastase
Refere-se tanto ao
enovelamento dos
DOMNIOS, quanto ao
arranjo final dos domnios
no polipeptdio

Hexoquinase
Estrutura Terciria
DOMNIOS
DOMINIOS: regies da estrutura
terciaria que apresenta uma
caracterstica estrutural e uma
funo especfica. Forman parte da
funo global da protena.

Os domnios contm tipicamente de
100 a 200 resduos de aminocidos

GLICERALDEDO 3-FOSFATO DESIDROGENASE
Domnio especfico para NAD
+
.
Domnio especfico para gliceraldedo 3-fosfato.
Protenas com diferentes propores de
arranjos moleculares na estrutura terciria
originam diferentes motivos
Hemoglobina Lisozima
Triose Fosfato
Isomerase
Estrutura Supersecundria
ou Motivos Estruturais
e) dedos de zinco
f) zper de leucina
DOMNIOS: so considerados as unidades funcionais e de estrutura tridimensional de uma protena.
DOMNIOS: so regies altamente conservadas responsveis pela funo biolgica da protena.
A estrutura tridimensional de protenas
adota diversas conformaes.
Estrutura
terciria
Pontes de hidrognio
Ligaes inicas ou salinas
Ligaes hidrofbicas
Foras de van der Waals
Ligaes covalentes
Ligaes que Mantm a
Estrutura Terciria
Estrutura Quaternria de Protenas
Refere-se ao modo pelo qual duas ou mais cadeias
polipeptdicas interagem.
Cada uma das cadeias apresenta os trs nveis
estruturais citados.
mantida principalmente por ligaes inicas,
pontes de hidrognio e por interaes do tipo
hidrofbicas entre as cadias.
Estrutura Quaternria
Protena dimrica
Protena oligomrica
AS LIGAES FRACAS ESTABELIZAM
A ESTRUTURA ESPACIAL NO MEIO
AQUOSO
Protenas em Soluo Aquosa
A estrutura espacial
das protenas no
meio aquoso
estabilizada
principalmente por
interaes
hidrofbicas e
inicas
So estabelecidas
entre radicais de
aminocidos apolares.

Estes radicais se
aproximam e repelem
gua.
Ligaes Hidrofbicas
Ocorrem pela atrao um tomo de hidrognio e
outro elemento mais eletronegativo geralmente
oxignio ou nitrognio.
Pontes ou Ligaes de Hidrognio
Ocorre entre grupos
eletricamente carregados

Atrao eletrosttica
entre grupamentos com
cargas opostas
Ligaes Inicas
Foras de Van der Waals
Foras de atrao inespecficas entre molculas
de baixa polaridade
Distncia entre os centros atmicos deve ser
inferior a 0,5nm
A especificidade surge quando um grande
nmero deste tipo de ligao ocorre
simultaneamente
Ligaes Covalentes


Unem tomos formando molculas durveis e
resistentes
Ocorre quando tomos compartilham eltrons
Presente somente na estrutura terciria

Cys-S-S-Cys
Ponte de dissulfeto,
ligao covalente entre
resduos prximos de
Cys estabiliza a
estrutura terciria de
protena
Protenas contendo diferentes propores e
arranjos de elementos estruturais secundrios
ENOVELAMENTO
Proteco
Dobramento da cadeia polipeptdica
induzido pela interao da gua com as
cadeias laterais dos aminocidos
Enovelamento das protenas
As protenas se
enovelam para adquirir
um arranjo
tridimensional especfico
e estvel. A maior fora
que direciona o
enovelamento das
protenas no meio
aquoso o efeito
hidrofbico, onde os
grupos apolares se
localizam no interior da
protena, para diminuir
seu contato com a gua.
Formao de domnios ao longo da
cadeia polipeptdica.
A estrutura primria direciona o dobramento da cadeia
polipeptdica.
O dobramento da cadeia polipeptdica
auxiliado por protenas especficas.
Dissulfeto Isomerase: direciona a formao de
pontes de sulfeto em locais especficos.
Prolil cis-trans isomerase: promove a
mudana de configurao do resduo de prolina.
Chaperonas: protenas expressas junto
protena em formao auxiliando a conformao
biologicamente ativa da molcula.
Chaperoninas: complexos proteicos que
direcionam o enovelamento e o reparo da
estrutura tridimensional.
Processo de Enovelamento das Protenas
FOLDING
CHAPERONAS
Protenas de choque trmico
Heat-shock proteins - hsps
No alteram o
processo final
de
enovelamento
Ligam-se s cadeias
polipeptdicas no
momento da sntese
nos ribossomos
Impedem a
agregao
Aumentam a velocidade
do enovelamento
MECANISMO DE AO DAS CHAPERONAS
Doenas Associadas ao Enovelamento
Defeituoso de Protenas
As protenas com enovelamento defeituoso no se
renaturam ou degradam, se agregam formando longas
fibras insolveis chamadas de depsitos amilides, e
do origem a doenas como Alzheimer, Parkinson, ou
mal da vaca louca.
Desnaturao
Protica

Perda parcial ou total da estrutura
secundria, terciria ou quaternria com
diminuio da atividade biolgica.
Protena
nativa
Protena desnaturada
a alterao da estrutura
da protena sem ruptura das
ligaes peptdicas
Desnaturao Proteica
Fsicos
Qumicos
Alteraes de temperatura
Raio X
Ultra-som
cidos e bases fortes
Detergentes
Uria
Mercaptoetanol HS-CH
2
-CH
2
-OH
Agentes Desnaturantes
Impede a formao de pontes dissulfeto
Ureia
Detergentes
aninicos
Detergente
Agente
desnaturante
Protena Nativa
Hidrocloro de Guanidina
Desnaturao de Protenas por
Alterao do pH do Meio
Reduo da solubilidade
Aumento da digestibilidade
Perda parcial ou total da estrutura
tridimensional e da atividade
biolgica, de enzimas, hormnios,
anticorpos ou receptores.
Alteraes das Propriedades
de uma Protena Desnaturada