INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS ABEL SALAZAR S.R.

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UNIVERSIDADE DO PORTO
Ano lectivo 2009-2010
Lic. Bioquímica- Biologia Molecular I
Mestrado Integrado Bioengenharia – Biologia Molecular e Celular II

Responsável: Prof. Cláudio Enrique Sunkel Cariola (cesunkel@ibmc.up.pt)

Aulas teóricas BQ-MIB: Prof. Cláudio E.Sunkel
Aulas Práticas BQ: Prof. Cláudio E.Sunkel
Aulas práticas: Doutor Carlos Conde (CConde@ibmc.up.pt)

Datas e temas das aulas teóricas

Data Aulas
Fev 24 1. Introdução
Fev 25 2. Estrutura e organização do DNA I
3. Estrutura e organização do DNA II
Março 3 4. Estrutura e organização do DNA III
4 5. Replicação do DNA I
6. Replicação do DNA II
10 7. Transcrição I
11 8. Transcrição II
9. Processamento de RNAs I
17 10. Processamento de RNAs II
18 11. Código genético
12. Tradução
24 13. Técnicas DNA recombinante
25 14. Técnicas DNA recombinante
15. Técnicas DNA recombinante
Abril 14 16. Técnicas DNA recombinante
15 17. Técnicas DNA recombinante
18. Técnicas DNA recombinante
21 19. Técnicas DNA recombinante
22 20. Técnicas DNA recombinante
21. Técnicas DNA recombinante
28 22. Mutação
29 23. Reparação
24. Recombinação
Maio 12 25. Regulação da expressão genica Procariotas I
13 26. Regulação da expressão genica Procariotas II
27. Regulação da Expressão genica Eucariotas I
19 28. Regulação da Expressão genica Eucariotas II
20 29. Regulação da Expressão genica Eucariotas III
30. Virus
26 31. Oncogenes e anti-oncogenes II
27 32. Indução de Tumores
33. Ciclo celular I
Junho 2 34. Ciclo celular

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Horários

Teóricas BQ

Quartas: 14:00 – 15:00 Sala: I2

Quintas:11:00 – 13:00 Sala: Rua dos Bragas

Teóricas MIB

Quartas: 13:00 – 15:00 Sala: I2

Quintas:11:00 – 13:00 Sala: Rua dos Bragas

Práticas: BQ

Sala TP2

T1 Quartas 15:00-17:00
T2 Quintas 14:00-16:00
T3 Quintas 10:00-12:00

Avaliação: BQ

Exame final 70% (50% aprovação mínima)

Relatórios práticas 30% (2/3 das práticas são obrigatórias)

Cada grupo de trabalho deverá entregar uma cópia dos Relatórios das
práticas na forma de um livro indicando na primeira página os nomes de
todos os membros do grupo até o dia 18 de Junho.

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Sumários dos temas a abordar nas aulas teóricas:

1. Introdução e enquadramento

2-4. Estrutura e organização do DNA

Descoberta do material genético. Composição do DNA. Estrutura do DNA.
Desnaturação e renaturação do DNA. Estrutura da cromatina. Tipos de DNA. A matriz
nuclear. O scaffold. Tipos de DNA, cópia única, moderadamente repetitivo e altamente
repetitivo.

5-6. Replicação do DNA

Dogma central da biologia moderna. Polimerização do DNA. Modelo geral da
replicação. Enzimas envolvidas na replicação. Replicação tipo “rolling circle”.
Replicação tipo “D loop”. Replicação do fagos de cadeia simples.

7-8.Transcrição
Tipos de RNA. Estrutura do promotor. Proteínas envolvidas no inicio da transcrição.
Complexo de pre-iniciação. Elongação. Terminação.

9-10. Processamento
Processamento de RNAs. Intrões e exões. Processamento de tRNAS. Processamento
de rRNAs. Processamento de mRNAs. Processamento nas mitocôndrias. RNA editing.

11. Código Genético

O código genético. O código genético universal. Alterações ao código genético.

12. Tradução
Quadro de leitura. Estrutura dos tRNAs. Conceito wobble. Iniciação. Elongação.
Terminação.

13-20. Técnicas de DNA recombinante

Enzimas de restrição. Vectores: plasmideos, fagos l, cosmideos, fagos P1, YACs.
Mapas de restrição. Vectores de expressão. Radioisótopos. Bibliotecas genómicas.
Bibliotecas de cDNA. Bibliotecas de expressão. Chromosome walking. Sequenciação
método Maxam-Gilbert. Sequenciação método Sanger. Deleçóes unidireccionais.
Sequenciação utilizando M13. Southern blot. Northern blot. Western blot. Primer

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extension. Hibridação in situ. Análise promotores e interacções por retardação em gel
e Footprinting. Bancos de dados de DNA e proteínas. Análise por computador.

21-22. Alterações no DNA e reparação

Mutações espontâneas e induzidas. Mutações frameshift. Mutações pontuais.
Transição, transverção, nonsence, missence. Mutações silenciosas, neutras,
transposição, reversíveis. Mutações supressoras. Reparação de DNA.
Fotoreactivação. Alquilação. Excisão. “mismatch”. Recombinacional ou pós-replicação.
Genes SOS. Reparação propensa a erros.

23. Recombinação
Homóloga. Local específica.

24-25. Regulação da expressão genética em Procariótas

Modelo geral da regulação. Operão da lactose. Operão da arabinose. Operão do
triptofano. Terminação da transcrição. Regulação genética do fago λ .

26-28. Regulação da expressão genética em Eucariotas

Sinais de controlo celular. Análise experimental de promotores. Transcrição.
Processamento. Transporte e estabilidade do mRNA. Tradução do mRNA. Proteínas
activadoras. Expressão dos genes GAL. Expressão dos genes de choque térmico.
Metilação. Matriz nuclear.

29.Virus
Classificação. Estrutura. Infecção. Estratégias de replicação.

30-31. Oncogenes e indução de tumores

Oncogenes Oncogene viral. Oncogene celular. Tipos de oncogenes. Mecanismos de
indução de tumores. Activação de oncogenes. Indução da proliferação por
desregulação do ciclo celular. Tanslocações e mutações. Anti-oncogenes. Inactivação
de anti-oncogenes, retinoblastoma e p53.

32-34. Ciclo celular

Organiozação do ciclo celular. Regulação do ciclo celular. Mecanismos de regulação.
DNA damage checkpoint. O checkpoint mitótico.

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Bibliografia recomendada

• Lewis,B (2001) Genes IX - Oxford University Press.

• Watson, J.D., Gilman, M., Witkowski, J. & Zoller, M. (2006) Recombinant DNA
- Scientific American Books 3nd. Edition.

• Alberts, B., Bray. D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. & Watson, J. (2000) The
Molecular Biology of the Cell. Garland Publishing, NY, USA. 5rd Edition.

Online:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.TOC&depth=2

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.TOC