UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO

ICAQF - Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas

Campus Diadema

UC Desenvolvimento de Fármacos – Farmácia Noturno

Questionário Aula 11 – LBDD e SBDD
Núbia Araújo – RA:135652

Dentro do conceito de “desenvolvimento racional de fármacos”, existem duas principais metodologias a serem
aplicadas: o método direto e o método indireto. 
Considerando estes dois métodos, responda:

a) Por que são denominados de “direto” e “indireto”?

SBDD, do inglês Structure-Based Drug Design, é o método direto no qual se conhece a estrutura tridimensional do
alvo biológico na tentativa de compreender as interações dos complexos ligante-receptor. Ou seja, permite a
aplicação de estratégias de planejamento de fármacos baseado na estrutura do receptor.
LBDD, do Ligand-Based Drug Design, é o método indireto no qual não se conhece a estrutura do receptor.
Trabalha-se através de ligantes conhecidos na tentativa de propor novos análogos a fim de otimizar a ligação dos
ligantes com seu receptor. Ou seja, se obtém parâmetros eletrônicos e estéreos que elucidem as relações
estrutura-atividade biológica.

b) Cite a principal técnica utilizada no LBDD e no SBDD. Comente rapidamente sobre cada uma delas.

No SBDD, utilizamos diversas técnicas a serem utilizadas. A docagem molecular (do inglês, molecular docking), ou
simplesmente docagem ou ancoramento (do inglês, docking), é um dos principais métodos de SBDD empregados.
Para o docking o sistema é rígido/estático concentrado no sítio ativo. Já para o molecular docking o sistema é
flexível e lava-se em consideração a energia do sistema, ou seja, a energia.
No LBDD, a principal técnica utilizada é o QSAR. O QSAR (ou QSPR) é um modelo quantitativo representado por
meio de uma equação matemática que relaciona as propriedades dos compostos investigados com suas
atividades biológicas e que possui significância estatística. De todas as metodologias, o QSAR transforma todas as
modificações estruturais em algo mensurável. A atividade biológica é uma função de diversos fatores mais os
valores constantes para melhor padronização desse modelo.
Caso clínico 3: Covid-19