CDIGO GENTICO E SNTESE PROTEICA Juliana Mara Stormovski de Andrade As protenas so as molculas mais abundantes e funcionalmente diversas nos

sistema biolgicos. Praticamente todos os processos vitais dependem desta classe de molculas. Apresentam uma incrvel diversidade de funes, embora todas compartilhem a caracterstica estrutural comum de serem polmeros lineares de aminocidos. As protenas so compostas de um ou mais polipeptdeos, que por sua vez so formados por aminocidos. Embora mais de 300 aminocidos diferentes tenham sido descritos na natureza, somente 20 so comumente encontrados como constituintes das protenas dos mamferos. Existem 20 aminocidos diferentes para formar vrios tipos de protena, as quais diferem pela posio dos aminocidos, como o alfabeto, que contm 23 letras formando milhares de palavras. O DNA uma molcula presente em todas as clulas nucleadas do organismo de seres vivos. No DNA nuclear e mitocondrial de cada clula esto contidos todos (e sempre os mesmos) os genes daquele organismo, genes esses responsveis pela transmisso das caractersticas genticas. O DNA nos fornece receitas de produo de protenas. A informao gentica, armazenada nos cromossomos e transmitida s clulas filhas atravs da replicao do DNA, expressa atravs da transcrio em RNA e, no caso, de RNAm, traduo subseqente em cadeias poliptdicas. Este fluxo de informao do DNA ao RNA e protena denominado de dogma central da biologia molecular, sendo descritivo de todos os organismos (com exceo de alguns vrus que usam o RNA como repositrio de sua informao gentica). O processo de traduo requer um cdigo gentico, atravs do qual a informao contida na seqncia de cidos nuclicos expressa para produzir uma seqncia especifica de aminocidos. A ligao molecular entre estes dois tipos relacionados de informao (o cdigo de DNA dos genes e o cdigo de aminocidos das protenas) o cido ribonuclico (RNA). Os constituintes da molcula de DNA so denominados nucleotdeos. Um nucleotdeo formado por trs componentes bsicos: uma base nitrogenada, um acar (desoxirribose) e um grupo fosfato. As bases nitrogenadas podem ser do tipo purinas (adenina A, e guanina G) ou pirimidinas (timina T, e citosina C). As bases purinas e pirimidinas, encontradas nos nucleotdeos podem ser sintetizadas de novo, ou ser obtidas atravs de rotas de salvamento que permitem a reutilizao das bases pr-formadas resultantes do metabolismo normal da clula ou da dieta. O CDIGO GENTICO A informao gentica estocada no DNA por meio de um cdigo (o cdigo gentico) no qual a seqncia de bases adjacentes determina a seqncia de aminocidos no polipeptdeo codificado. O cdigo gentico, ento um dicionrio que fornece a correspondncia entre uma seqncia de bases nucleotdicas e uma seqncia de aminocidos. Cdigo gentico=Receita gentica (livro de receitas de protenas). Em

teoria, so possveis variaes quase infinitas na disposio das bases ao longo de uma cadeia polinucleotdica. Uma vez que existem 20 aminocidos diferentes e apenas quatro bases diferentes de RNA, uma nica base no pode especificar cada aminocido. Em qualquer posio existem quatro possibilidades (A, T, C, G). Assim, existem 4n combinaes possveis em uma seqncia de n bases. Dessa forma, aminocidos especficos no podem ser determinados por duplas de bases, porque so possveis apenas 16 ou 42 pares diferentes. Entretanto, se trincas de bases forem traduzidas em aminocidos, h 43 combinaes possveis de trincas, ou seja, 64 combinaes podem ser obtidas, mais do que o suficiente para especificar cada aminocido. O cdigo gentico foi decifrado em 1953. Watson e Crick demonstraram, de modo elegante e apurado, que o cdigo consiste em cdons, cada um composto por uma trinca de bases nitrogenadas (tripletes). Dos 64 cdons (RNAm) possveis, trs indicam o fim de um gene, e so conhecidos como cdons finalizadores (ou sem sentido) porque designam o termino da traduo do mRNA neste ponto. So o UAA, o UGA e o UAG. Os outros 61 especificam aminocidos. Como existem apenas 20 aminocidos essenciais, isto significa que a maioria dos aminocidos pode ser especificada por mais de um cdon. Por exemplo, a leucina e a arginina so especificadas por seis cdons. Apenas a metionina e o triptofano so cada um deles especificado por um nico cdon O cdigo gentico , portanto, dito redundante (ou degenerado). Embora um determinado aminocido possa ser especificado por mais de um cdon, cada cdon s pode designar um aminocido. Essa redundante descoberta fundamental para, entre outras coisas, compreendermos que nem toda alterao no cdigo gentico leva a uma doena. Uma alterao de TTT para TTC, por exemplo, no dever causar absolutamente nenhuma alterao no fentipo de um individuo, porque ambos codificam o mesmo aminocido. Porm h alteraes na seqncia de cidos nuclicos que podem resultar em um aminocido inapropriado sendo inserido na cadeia polipeptdica, potencialmente causando uma doena ou mesmo a morte do organismo. Uma caracterstica significativa do cdigo gentico ser universal, ou seja, virtualmente todos os organismos vivos usam os mesmos cdigos de DNA para especificar aminocidos. Uma exceo conhecida a esta regra a das mitocndrias, as quais tm suas prprias molculas de DNA extranuclear. Vrios cdons do DNA mitocondrial codificam aminocidos diferentes dos cdons do DNA nuclear. O cdigo gentico extremamente conservado. Os mesmos trpletes correspondem aos mesmos aminocidos, seja em seres humanos, seja em bactrias. A correspondncia entre cdons especficos e aminocidos conhecida como cdigo gentico. . Em sntese pode-se dizer que o Cdigo Gentico tem as seguintes caractersticas: - Especificidade - Universalidade - Redundncia A informao gentica est contida no DNA dos cromossomos dentro do ncleo celular, mas a sntese de protenas, durante a qual a informao codificada no DNA usada, ocorre no citoplasma. Devido compartimentalizao das clulas eucariticas, a transferncia de informao do ncleo para o citoplasma um processo muito complexo. Enquanto o DNA se forma e se replica no ncleo da clula, ocorre no citoplasma a sntese de protenas. A

informao contida no DNA deve, portanto, ser transportada para o citoplasma, e assim usada para ditar a composio das protenas. Isto envolve dois processos, transcrio e traduo. Resumidamente, o cdigo do DNA transcrito para o RNA mensageiro, que ento deixa o ncleo para ser traduzido em protenas. RNA Existem trs tipos principais de RNA que participam do processo da sntese protica: RNA ribossmico (RNAr), RNA de transferncia (RNAt) e RNA mensageiro (RNAm). Assim como o DNA, esses trs tipos de RNA so molculas polimricas no ramificadas, compostas de mononucleotdeos unidos por ligaes fosfodister. Entretanto, eles diferem do DNA em vrios aspectos; por exemplo, so consideravelmente menores, e contm ribose em vez de desoxirribose e uracil em vez de timina. Os trs principais tipos de RNA diferem um do outro em termos de tamanho, funo e modificaes estruturais especiais. RNA ribossmico: encontrado em associao com uma srie de protenas diferentes, como componente dos ribossomos, as estruturas complexas que servem como stios para a sntese de protenas. No citosol eucaritico, existem quatro espcies de RNAr de tamanhos diferentes (28S, 18S, 5,8S e 5S). ["S" a unidade Svedberg, relacionada ao peso molecular do composto]. Juntos constituem at 80% do RNA da clula. RNA de transferncia: a menor das trs prinicipais molculas de RNA (4S), tem entre 74 e 95 resduos de nucleotdeos de tamanho, e forma de trevo. Existe no mnimo um tipo especfico de molcula de RNAt para cada um dos 20 aminocidos comumente encontrados nas protenas. Juntos, eles constituem cerca de 15% do RNA da clula. As molculas de RNAt contm bases incomuns que possuem extenso pareamento de bases intracadeia. Cada RNAt serve como um "adaptador", que transporta seu aminocido especfico ao stio de sntese de protenas. L, ele reconhece o termo do cdigo gentico que especifica a adio de seu aminocido cadeia peptdica em formao. RNA mensageiro: compreende somente cerca de 5% do RNA da clula e o tipo mais heterogneo de RNA em termos de tamanho. O RNAm transporta a informao gentica do DNA ao citosol, onde usado como molde para a sntese de protenas. As caractersticas estruturais especiais do RNAm eucaritico incluem uma longa seqncia de nucleotdeos adenina (uma "cauda poli-A") no 3'-terminal da cadeia de RNA, mais uma "cabea" no 5'terminal ( cap 5).

TRADUO Um grande nmero de componentes so requeridos para a sntese da cadeia polipeptdica. Estes incluem todos os aminocidos que so encontrados no produto final, o RNAm a ser traduzido, os RNAt, ribossomos funcionais, fontes de energia e fatores proteicos necessrios iniciao, elongao e terminao da cadeia polipeptdica. A traduo o processo pelo qual o mRNA fornece um molde para a sntese de um polipeptideo. O mRNA transportado do ncleo para o citoplasma, onde a seqncia de RNA codificada, ou traduzida, para determinar a seqncia de aminocidos na protena que est sendo sintetizada. O mRNA no pode, entretanto, se ligar diretamente a aminocidos. O RNA transportador (tRNA) fornece a ligao molecular entre a seqncia

de bases do mRNA e a seqncia de bases da protena. A ligao do anticdon do RNAt ao cdon do RNAm segue as regras da ligao complementar e antiparalela - isto , o cdon do RNAm lido de 5' para 3' por um anti cdon pareado em orientao invertida (3' -5'). No citoplasma, o mRNA traduzido em protena pela ao de uma variedade de molculas de tRNA, cada uma especifica para um determinado aminocido. O RNAt tem a funo de transferir os aminocidos corretos para suas posies ao longo do molde de mRNA, para que sejam adicionados cadeia polipeptdica crescente. O tRNA tem um sitio em sua ponta 3 para a ligao de um aminocido por uma ligao covalente. Na ponta oposta do trevo h uma seqncia de trs nucleotdeos chamada de anticdon. Esta seqncia faz um pareamento complementar de bases com um cdon apropriado no mRNA. O mRNA, portanto, especifica a seqncia de aminocidos agindo por meio do tRNA. O local citoplasmtico da sntese de protenas o ribossomo, que consiste em protenas enzimticas e RNA ribossomal (mais abundante). A funo do rRNA auxiliar a ligao do mRNA e do tRNA ao ribossomo. O ribossomo primeiramente liga-se a um stio de iniciao na seqncia do mRNA. Este stio consiste de um cdon especifico, AUG, que especifica o aminocido metionina. O ribossomo ento liga o tRNA a sua superfcie, de modo que possa haver pareamento entre o tRNA e o mRNA. O ribossomo move-se ao longo da seqncia de mRNA, cdon por cdon, no sentido usual 5 para 3. O ribossomo ento desliza ao longo do mRNA a cada trs bases, alinhando o cdon seguinte para o reconhecimento por outro tRNA com o prximo aminocido. medida que cada cdon processado, um aminocido traduzido pela interao entre mRNA e tRNA. A ligao entre o cdon e o anticdon coloca o aminocido apropriado na posio seguinte no ribossomo para formao de uma ligao peptdica com a ponta carboxila e a cadeia poliptdica crescente. Neste processo, o ribossomo fornece uma enzima que catalisa a formao de ligaes peptdicas covalentes entre aminocidos adjacentes, resultando em um polipeptideo crescente. Quando o ribossomo chega a um cdon finalizador na seqncia de mRNA, terminam a traduo e a formao de polipeptdeo. O terminal amino (NH2) do polipeptdeo correspondente ponta 5 do filamento de mRNA, e o terminal carboxila (COOH) corresponde ponta 3. Quando a sntese esta completa, o mRNA, o ribossomo e o polipetdeo se separam um do outro. O polipeptdeo ento liberado para o citoplasma. A traduo de um mRNA processado sempre iniciada em um cdon AUG, que especifica metionina. A metionina , portanto, o primeiro aminocido codificado (aminoterminal) de cada cadeia polipeptdica, embora em geral seja removido antes que a sntese da protena esteja completa. O cdon para metionina (iniciador AUG) estabelece a matriz de leitura do mRNA. Todo esse especializado e refinado processo pode ser dividido em trs etapas bsicas: Iniciao: A iniciao da sntese de protenas envolve a reunio de componentes do sistema de traduo antes que ocorra a formao da ligao peptdica. Estes componentes incluem as duas subunidades ribossmicas, o RNAm a ser traduzido, o aminoacil-RNAt para metionina, especificado pelo cdon iniciador AUG na mensagem, o GTP (o qual fornece energia ao processo) e fatores de iniciao que facilitam a montagem deste complexo de iniciao.

Alongamento: A elongao envolve a adio de aminocidos extremidade carboxila da cadeia poliptdica em formao. Durante a elongao, os ribossomos movem-se do 5' -terminal ao 3' terminal do RNAm que est sendo traduzido. H vrios fatores de alongamento envolvidos com esse processo. A formao das ligaes peptdicas catalizada pela peptidiltransferase. Aps formar-se a ligao peptdica, o ribossomo avana trs nucleotdeos em direo ao 3' terminal do RNAm. Isto causa a liberao do RNAt descarregado Terminao: A terminao ocorre quando um dos trs cdons de encerramento movem-se ao stio. O fator de liberao faz a protena recm sintetizada ser liberada do complexo ribossmico e causa a dissociao entre o ribossomo e o RNAm. O polipeptdeo recm sintetizado pode sofrer modificaes subsequentes; as subunidades ribossmicas, o RNAm, o RNAt e fatores proteicos podem ser reciclados e usados para sintetizar outro polipeptdeo. Modificaes Ps-Traducionais: Antes que um polipeptideo recm-sintetizado possa comear a sua existncia como protena funcional, freqentemente sofre outro processamento chamado de modificao ps-traducional. Estas modificaes podem ter uma variedade de formas, incluindo a clivagem em unidades polipeptdicas menores, ou uma combinao com outros polipeptdeos para formar uma protena maior. Outras modificaes possveis incluem a adio de cadeias laterais de carboidratos ao polipeptdeo. Estas modificaes so necessrias, por exemplo, para produzir o dobramento apropriado da protena final, ou para estabilizar sua estrutura. A cadeia polipeptdica que o produto primrio da traduo dobrada e associada em uma estrutura tridimencional especifica que determinada pela prpria seqncia de aminocidos. Duas ou mais cadeias polipeptdicas, produtos do mesmo gene ou de genes diferentes, podem se combinar para formar um nico complexo protico final. Os produtos proticos tambm podem ser modificados quimicamente por, por exemplo, adio de fosfato ou carboidratos em stios especficos. Outras modificaes podem envolver a clivagem da protena, seja para remover seqncias amino-terminais especificas aps terem direcionado uma protena para o seu local correto dentro da clula, ou para dividir a molcula em cadeias polipeptdicas menores. Nem todos os genes esto funcionando (se expressando) em todas as clulas. Alguns genes que codificam para polipeptdeos essenciais a todos os tecidos se expressam em todas as clulas do organismo, porm alguns genes, cujos polipeptdeos codificados tm uma funo muito especifica, s se expressam em determinado tecido, ou em determinados momentos da vida ou do ciclo circadiano. O fato de todo o contedo de genes, o genoma de um organismo, estar presente em absolutamente todas as clulas, a despeito de estar se expressando ali ou no, permite que o resultado de uma anlise do DNA seja o mesmo quando realizada em qualquer clula do organismo. Por exemplo, para verificarmos se um paciente tem uma alterao hereditria no gene da desidrogenase alcolica, gene esse que se expressa preferencialmente nos hepatocitos, no preciso realizar uma bipsia de fgado, para estudar a atividade enzimtica. basta analisarmos o gene que codifica a desidrogenase alcolica presente em uma clula do sangue, ou da pele, ou da saliva, ou da urina, pois a constituio do DNA do gene da desidrogenase alcolica dessas clulas ser a mesma do DNA do hepatcito.

Mitocndria A mitocndria contm molculas circulares de DNA (DNAmt). Assim como ela tem genes especficos, ela tem um cdigo gentico diferente. O DNAmt herdado maternalmente, porque a mitocndria da clula espermtica no entra no ovo fertilizado (embora estudos recentes estejam evidenciando a presena de mitocndrias nos espermatozides). O DNAmt possui uma elevada velocidade de mutao (cerca de 10 vezes maior que o DNA), e acredita-se que possam contribuir para uma srie de doenas humanas.

BIBLIOGRAFIA CONSULTADA 1. MULLER RF: Emerys Elements of Medical Genetics, 11ed. 2001. 2. JORDE, CAREY, BAMSHAD: Gentica Mdica, 2ed. 1999. 3. Thompson e Thompson Gentica Mdica, 6ed. 2002. 4. WILSON GN: Clinical Genetics A Short Course. 2000. 5. CARAKUSHANSKY G: Doenas Genticas em Pediatria. 2001. 6. ALBERTS B; et all: Molecular Biology of The Cell, 4ed. 2002.