Evoluo

DNA MITOCONDRIAL
Prof. Msc. Ronaldo Celerino Centro Acadmico de Vitria Universidade Federal de Pernambuco

DNA Mitocondrial
Mitocndrias contm vrias cpias de DNA:
Ovcito 108 cpias; Clulas somticas 1000 cpias;

Variam muito em tamanho 6 kb at 2500 kb;

mtDNA - forma circular, mas existem lineares;

Estrutura do DNA Mitocondrial

Animais mtDNA pequeno, compacto e sem ntrons; mtDNA Humano:

Tamanho: 16659 pb;

N de Genes - 37, sendo 2 (rRNA), 22 (tRNA) e 13 (polipeptdeos envolvidos na fosforilao oxidativa);

Conservao bsica de estrutura dentro do sub-ramo dos vertebrados;

Estrutura do DNA Mitocondrial

Invertebrados organizao diferente devido a rearranjos estruturais dos genes dentro da molcula circular; Fungos mtDNA maior que em animais (78 kb):
N de genes 33, sendo 2 (rRNA), 23 a 25 (tRNA), 1 (pnt ribossmica) e 7 (fosforilao oxidativa);

Leveduras - vrios genes contm ntrons e existem longas sequncias no codificantes;

DNA Mitocondrial
Plantas mtDNA - muito maior que os de outros organismos; Estrutura varivel; Plantas no vasculares - 94 matrizes de leitura aberta (ORF) genes conhecidos e com funes genticas no conhecidas; Plantas superiores muitas sequncias no codificantes e algumas duplicadas;

N real de genes - desconhecido e situados em posies diferentes em espcies diferentes;

Sofreu muitos rearranjos genticos;

DNA Mitocondrial em Plantas

Genes mitocondriais - separados em molculas circulares diferentes; Processo de recombinao intramolecular;
Mediada por sequncias repetitivas no mtDNA; Troca entre 2 sequncias repetitivas separao do crculo de mtDNA master 2 crculos menores;

Expresso de Genes Mitocondriais

Vertebrados mtDNA - 2 unidades de transcrio codificam informao de vrios genes; Filamentos H e L ambos transcritos; Filamento H codifica 2 (rRNA), 14 (tRNA) e 12 (polipeptdeos); Filamento L 8 (tRNA) e 1 (polipeptdeo);

Expresso de Genes Mitocondriais

Transcritos clivados para separar os tRNA dos rRNA e mRNA;
mRNA so poliadenilados; mRNA - traduzido usando ribossomos mitocondriais e uma combinao de tRNA nucleares e ribossmicos; Traduo semelhante a do citosol diferenas nos cdons cdigo gentico no universal;

Expresso de Genes Mitocondriais

Plantas e protozorios peculiaridade muitos transcritos de mtRNA sofrem edio;
Alterao da informao codificada no mtDNA; Permitindo a sntese de polipeptdeos funcionais;

Expresso de Genes Mitocondriais

Alguns mtRNA mensageiros so formados pelo processo de trans-splicing (transrecomposio);

Segmentos de um gene so dispersos na molcula de mtDNA;

Cada segmento transcrito independentemente; xons de transcritos diferentes so recompostos por interaes dos ntrons que os flanqueiam;

Evoluo das Mitocndrias

Genoma mitocondrial sofreram mudanas significativas; Variao no contedo gnico: Protozorio Reclinomonas americana 97 genes, sendo 62 que codificam pnt; mtDNA protistas, animais e fungos derivados do Reclinomonas ampla perda de genes; Plantas genes - condio ancestral ao Reclinomonas - muitos genes em comum e sequncias adicionais; Variao estrutural ou na organizao dos genes dentro do DNA: Disposies diferentes regies do mtDNA foram realocadas; Variao nas sequncias de nucleotdeos de determinados genes: Genes mtDNA - para citocromo b em humanos e Drosophila muitos nucleotdeos diferentes sequncias gnicas evoluram desde que divergiram do ancestral comum; Vertebrados genes mitocondriais evoluo rpida 5 a 10 vezes mais que genes nucleares; Explicaes: produtos gnicos sejam mais flexveis e capazes de tolerar mais mudanas de aminocidos; ou a taxa de mutao seja maior nas mitocndrias do que no ncleo;

Evoluo

DNA BARCODINGS
Prof. Msc. Ronaldo Celerino Centro Acadmico de Vitria Universidade Federal de Pernambuco

DNA Barcoding
Cdigo de Barras da Vida; Mtodo taxonmico - utiliza um fragmento curto de DNA como marcador gentico de um organismo para identificao como espcie particular; Seqncias vistas como um cdigo de barras; Cdigo Universal de Produtos identificao de produtos do mercado varejista; Emprega 10 nmeros alternados em 11 posies - 100 bilhes de identificadores nicos.

DNA Barcoding
Cdigo de barras genmico 4 nucleotdeos alternados em cada posio, mas a cadeia de stios disponveis para a inspeo maior;
Anlise - 15 dessas posies de nucleotdeos - 415 - 1 bilho de cdigos identificao de cada txon;

DNA Barcoding
A funo essencial identificao correta de um indivduo dentro de um espcie ou uma amostra como pertencente a uma nova espcie;
No tem inteno de fornecer dados precisos sobre as relaes filogenticas entre as espcies;

Complementar filogenticos;

os

estudos

Nvel de identificao taxonmico espcie.

DNA Barcoding
Baseado no DNA mitocondrial:
Amplamente distribudo entre os animais; Alto nmero de cpias por clula;

Taxa de mutao rpida variaes significativas entre as espcies;

No sofre recombinao; Herana predominante materna;

Baixo polimorfismo ancestral;

Animais - Curto fragmento de mtDNA - regio de 658 pb na subunidade I do Citocromo C Oxidase;

Plantas genes rbcL e dos cloroplastos matK;

DNA Barcoding

2004 - Consortium for (www.barcoding.si.edu); Objetivo:

the

Barcode

of

Life

(CBOL)

Auxiliar no desenvolvimento de um sistema capaz de identificar todas as espcies do planeta, usando um pequeno fragmento padronizado de DNA; Estabelecer uma biblioteca pblica de DNA barcodes, possibilitando o acesso a esta informao, ampliando e democratizando estudos e conhecimentos sobre a biodiversidade;

Procedimentos Bsicos do DNA Barcoding

Mtodo direto; Amostra de tecido retirada do indivduo; Extrao do DNA referncia para que uma ou vrias regies gnicas; Amplificao de alvos por PCR; Sequenciamento sequncias resultantes etiquetas de identificao da espcie; Disponibilizao em um banco de dados descrio da espcie e outras informaes; Sequncias adotadas como padro de referncia para identificao da espcie;

Procedimentos Bsicos do DNA Barcoding

Vantagens e Desvantagens
Vantagens: A informao de seqncias de DNA meio digital e no influenciada por uma anlise subjetiva; Anlise reproduo em qualquer tempo e por qualquer pessoa ferramenta universal; Desvantagens: Anlise dos limites entre a variabilidade gentica intra e interespecficas.
Anlise de vrios espcimes da mesma localidade;
Visando detectar a existncia de hapltipos polimrficos, cuja variao preceda a divergncia das espcies;

Aplicaes do DNA Barcoding

Identificao de espcies:
Vegetais a partir de folhas; Larvas de insetos; Dieta de um animal com base no contedo estomacal ou das fezes; Produtos comerciais pesca e caa ilegal; Fins forenses;

ronaldocelerino@yahoo.com.br Material didtico: http://ronaldocelerinogenetica.blogspot.com