Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
Mdulo I.I
Biologia Molecular
da Clula
In Cooper 2 Edio
2007/2008
ndice
ndice ............................................................................................................................... 2
Capitulo Um (pg. 27 44) Uma Viso Geral das Clulas e Pesquisa Celular ..... 8
Origem e Evoluo ....................................................................................................... 8
Evoluo de Metabolismos ........................................................................................... 9
Procariontes Actuais ..................................................................................................... 9
Clulas Eucariticas ..................................................................................................... 9
Evoluo dos Eucariontes .......................................................................................... 10
Desenvolvimento dos Organismos Multicelulares...................................................... 10
Captulo Um (pg. 52-57) ............................................................................................. 12
Crescimento de Clulas Animais em Cultura ............................................................. 12
Cultura de Clulas Vegetais ....................................................................................... 13
Vrus ........................................................................................................................... 13
Captulo Dois A Qumica das Clulas ..................................................................... 14
A composio Molecular das Clulas ........................................................................ 14
Glcidos ....................................................................................................................... 14
Lpidos ........................................................................................................................ 15
cidos Nucleicos ........................................................................................................ 16
Protenas .................................................................................................................... 17
Enzimas ...................................................................................................................... 18
Mecanismo de Catlise Enzimtica ........................................................................... 18
Coenzimas .................................................................................................................. 19
Regulao da Actividade Enzimtica ......................................................................... 19
Energia Metablica ..................................................................................................... 19
Membranas Celulares ................................................................................................ 19
Transporte Atravs das Membranas Celulares .......................................................... 20
Captulo Trs (pg. 113 138) Fundamentos de Biologia Molecular .................. 22
Hereditariedade, Genes e DNA .................................................................................. 22
Genes e Cromossomas .............................................................................................. 22
Genes e Enzimas ....................................................................................................... 24
Replicao do DNA .................................................................................................... 24
Expresso da Informao Gentica ........................................................................... 24
Funo do RNA Mensageiro ...................................................................................... 24
O Cdigo Gentico ..................................................................................................... 25
Vrus de RNA e Transcrio Reversa ........................................................................ 25
DNA Recombinante .................................................................................................... 25
Endonucleases de Restrio ...................................................................................... 26
2
2007/2008
3
2007/2008
4
2007/2008
5
2007/2008
6
2007/2008
7
2007/2008
Faculdade de Medicina
edicina de Lisboa
(menores,
sem
ncleo,
organitos
Atmosfera
Atmosfera Primitiva
Macromolculas
Polimeros
Capacidade
Capacidade de Auto-Replicarem-se
Auto
Proteinas ou Acidos Nuncleicos ?
Apenas
Apenas os acidos Nucleicos so capazes de controlar a sua autoreplicao
RNA
RNA (Sistema Gentico Inicial)
1 Clula
8
2007/2008
Evoluo de Metabolismos
A capacidade de obter alimentos e energia directamente do meio
ambiente um dos factores limitadores para as clulas primordiais, foi assim
necessrio criar mecanismos de desenvolvimento prprio. Houve assim uma
evoluo da gliclise que permitiu a existncia de energia qumica (ATP),
surgiram os primeiros organismos fotossintticos o que levou a um grande
aumento da quantidade de oxignio na atmosfera e desencadeou a evoluo
dos mecanismos oxidativos (Respirao Aerbia).
Procariontes Actuais
Os procariontes actuais podem dividir-se em:
- Arqueobactrias (Bactrias em Ambientes Extremos)
- Eubactrias (Bactrias Actuais)
Os procariontes so constitudos pela membrana celular, alguns por uma
parede celular rgida, pelo nucloide (agregado de DNA) e pelos ribossomas.
Clulas Eucariticas
So mais complexas, possuem ncleo limitado por uma membrana
porosa, vrios organitos citoplasmticos e citoesqueleto.
Complexo de Golgi:
organizao e transporte
de protenas, sintese de
lpidos e alguns
polissacarideos (em
plantas)
Mitocndrias: respirao
aerbia
Retculo
Endoplasmtico:
organizao e
transporte de
proteinas, sintese de
lpidos
Lisossomas e
Peroxissomas: digesto
e reaces oxidativas
Cloroplasto: fotossntese
Clula
Eucaritica
Citoesqueleto: rede de
filamentos proteicos que
se estende pelo
citoplasma
9
2007/2008
Faculdade de Medicina
edicina de Lisboa
11
2007/2008
12
2007/2008
Vrus
Os vrus no considerados seres-vivos, so parasitas intracelulares que
necessitam de uma clula hospedeira para originarem descendncia, fazendo
uso dos mecanismos dessa mesma clula.
Existem retrovrus cujo material gentico no , como seria de esperar,
o DNA, mas sim o RNA. Este vrus fazem uso da transcriptase reversa para
originarem cDNA que possa ser incorporado no genoma da clula hospedeira,
visto que esta enzima menos eficiente, os vrus tm elevadas taxas de
mutao.
Os bacterifagos so altamente eficientes chegando em apenas 20 a 30
minutos, infectada apenas uma clula, a originarem cerca de 200 novas
partculas virais.
13
2007/2008
Captulo Dois
A composio Molecular das Clulas
As clulas so genericamente compostas por gua, ies inorgnicos e
molculas orgnicas, sendo a molcula de gua a mais abundante (cerca de
70% da massa da clula).
A interaco entre a gua e as restantes molculas de elevada
importncia: destaca-se o facto de ser uma molcula polar, podendo formar
pontes de hidrognio e interagir com ies carregados electricamente. Assim
sendo as molculas polares (hidrfilas) so muito solveis em gua, enquanto
as molculas apolares (hidrofbicas) so fracamente solveis em gua.
Devido ao facto de serem fracamente solveis, as molculas apolares
tendem a associar-se entre si de modo a minimizar o contacto com a gua
efeito hidrofo.
Os ies inorgnicos (sdio, potssio, magnsio, clcio, cloro e
bicarbonato) constituem 1% ou menos da massa da clula e esto envolvidos
em vrios aspectos do metabolismo e funes da clula.
As molculas orgnicas podem ser na sua maioria divididas da seguinte
forma:
- Protenas (Aminocidos);
- Glcidos (Oses);
- Lpidos (cidos Gordos);
- cidos Nucleicos (Nucletidos).
So macromolculas formadas por polimerizao dos seus monmeros
e que constituem entre 80% a 90% da massa restante da clula, de seguida
iremos falar individualmente de cada um dos grupos anteriormente referidos.
Glcidos
Os seus monmeros so as oses, a mais conhecida a glicose, e tm
como funo o consumo no organismo, enquanto os polmeros, como o
caso do glicognio, tm uma funo de armazenamento.
Os glcidos associados a outras macromolculas, como exemplo as
protenas, podem funcionar como marcadores em vrios processos de
reconhecimento celular.
Dentro dos glcidos destaca-se a glicose pois a principal fonte
energtica das nossas clulas, esta pode ocorrer na sua forma linear ou na sou
forma cclica. Quando se encontra na sua forma cclica pode encontrar-se em
conformaes diferente ou (respectivamente trans ou cis) que
dependem da conformao do carbono um. Estas diferentes conformaes vo
14
2007/2008
com
outras molculas,
Lpidos
As principais funes dos lpidos so:
- Armazenamento de Energia;
- Sinalizao Celular (Hormonas);
- Principais componentes das membranas.
Os lpidos mais simples so os cidos gordos, mais frequentes as
cadeias com 16 ou 18 carbonos, estes podem ser insaturados (uma ou mais
ligaes duplas entre carbonos) ou saturados (sem ligaes duplas entre
carbonos).
cidos Nucleicos
Existem dois tipos de cidos nucleicos, o DNA (desoxirribonucleico) e o
RNA (ribonucleico), que diferem entre si apenas no acar (ose), que num caso
a desoxiribose e noutro a ribose, respectivamente.
Existem vrios tipo de RNA:
- mRNA (RNA mensageiro)
- rRNA (RNA ribossmico)
- tRNA (RNA transferncia)
- RNAs envolvidos no processamento e transporte de protenas
Os monmeros dos cidos nucleicos so o nucletidos, que so
constitudos por uma base purina ou pirimidina, um acar (ose) e um fosfato.
As bases purinas so a:
Adenina e a Guanina; e as pirimidinas
a: Citosina e a Timina/Uracilo.
importante referir que a Adenina e a
Timina/Uracilo se ligam por apenas
duas pontes de hidrognio, enquanto
a Guanina e a Citosina se ligam por
trs pontes de hidrognio.
A polimerizao feito por
intermdio de ligaes fosfodister
entre o grupo fosfato no C5 e grupo
hidroxilo no C3 da base que se segue,
no esquecer que este processo
16
2007/2008
Protenas
Os cidos nucleicos guardam a informao, as protenas tm como
principal funo executar as tarefas contidas nessa informao, e ainda
funes de estrutura, de transporte e armazenamento de pequenas molculas,
transmisso de informao, defesa e em situaes extremas podem ser
utilizadas para produzir energia.
A principal capacidade das protenas a de agirem como enzimas,
catalisando as reaces nos sistemas
biolgicos.
As protenas so polmeros de
aminocidos, existem cerca de 20
aminocidos, e cada um deles possui
caractersticas
especiais.
Os
aminocidos
podem
ter
diversas
conformaes, dependendo da posio
relativa do grupo amina em relao ao
carbono , como verificamos na imagem
2007/2008
ao lado. Estando a
cadeia
lateral
localizada inferiormente
e o grupo amina e
hidroxilo no mesmo
plano, se o grupo
amina
estiver
esquerda, temos um L
aminocido, so os
nicos encontrados nas
protenas humanas; se
o grupo amina estiver
direita do carbono ,
temos
um
D
aminocido (ter em
conta
que
este
raciocnio apenas
vivel se o radical se
encontrar representado
inferiormente).
17
Enzimas
As enzimas catalisam,
aumentam a velocidade, das
reaces que ocorrem no interior
das nossas clulas. Estas
possuem duas caractersticas
que as tornam adequadas para a
sua funo, aumentam a
velocidade da reaco sem se
consumirem e sem alterar o
equilbrio qumico da mesma.
O princpio de funcionamento das enzimas consiste em diminuir a
energia de activao, aumento a velocidade da reaco tanto no sentido
directo como no sentido inverso.
Coenzimas
Para que o complexo enzima e substrato posso estar activo necessria
a ligao de um grupo prosttico enzima, que pode ser uma vitamina ou
ies metlicos. Uma das diferenas das coenzimas que estas so alteradas
durante a reaco, no entanto so recicladas de modo a poderem ser
utilizadas de novo.
Energia Metablica
Este tema referido no nosso programa de bioqumica e por isso no o
vou referir aqui devido sua extenso e no ser muito relevante para a
Biologia Molecular da Clula, mas aqui ficam algumas palavras-chaves centrais
deste tema:
- ATP
- Gliclise
- Respirao Aerbia
- Fotossntese
- Oxidao
- Sntese de Protenas, Glcidos e Lpidos
Membranas Celulares
As membranas so barreiras entre o meio intracelular e o extracelular;
dentro da clula definem os diversos compartimentos existentes. A sua origem
19
2007/2008
21
2007/2008
Genes e Cromossomas
Os princpios bsicos genticos foram deduzidos por Gergor Mendel em
1865:
Alelo cpia de um gene, que especifica uma determinada
caracterstica. Existem dois alelos para cada gene, sendo que um herdado do
pai e outro da me.
Dominante demonstra-se sempre, quer em homozigotia, quer em
heterozigotia.
Recessivo expressa-se apenas quando em homozigotia.
Gentipo constituio de um indivduo em genes.
Fentipo caractersticas fsicas que advm do seu gentipo.
Cromossomas so como que carregadores de genes.
Diploide (2n) existem no organismo duas cpias do genoma, existem
cromossomas homlogos.
Haploides (n) apenas existe uma cpia do genoma.
Existem dois tipos de diviso celular, sendo que uma a mitose e outra
a meiose. Na mitose existe uma conservao numrica do material gentico
22
2007/2008
Genes e Enzimas
Atravs de vrias experiencias chegou-se concluso que uma
determinada mutao alterava uma determinada via metablica, logo alterava
uma enzima, e que diferentes mutaes em genes diferentes afectavam
diferentes vias ou diferentes pontos de uma mesma via e dai conclui-se que
cada gene correspondia a uma protena.
Este princpio de que a cada gene corresponde uma protena um
dos grandes pilares da actual gentica.
Replicao do DNA
A descoberta das cadeias duplas de DNA originou uma soluo para a
questo de como o material gentico se replicaria, as duas cadeias poderiam
separar-se e servir de molde para a sntese de uma nova cadeia atravs da
complementaridade de bases hiptese semiconservativa.
A replicao do DNA na clula mediada pela enzima DNA polimerase
e ocorre sempre no sentido de 5 para 3.
O Cdigo Gentico
Como que a sequncia de nucletidos do mRNA traduzida numa
sequncia de aminocidos?
Visto que os aminocidos e nucletidos no so estruturalmente
relacionados, no possvel o emparelhamento directo entre o mRNA e os
aminocidos. Assim sendo o tRNA serve de adaptador, permitindo a relao
entre o mRNA e os aminocidos.
Cada aminocidos ligado a um tRNA especfico, que tem uma
sequncia (anticodo) que emparelha com uma sequncia do mRNA (codo),
permitindo desta forma direccionar correctamente a sntese de protenas.
Atravs da determinao da sequncia de nucletidos que origina
determinado aminocido foi criado o cdigo gentico. Todos os organismos
tm o mesmo cdigo gentico, sendo que os dois primeiros nucletidos
iniciais so mais especficos do que o 3, ou seja, uma alterao no 3
nucletido menos propcia a provocar uma mutao patognica. UAA, UAG e
UCGA so codes de finalizao, indicam ao ribossoma que a traduo deve
terminar. Existem apenas 4 nucletidos, que se agrupam 3 a 3 (tripletos), o que
origina 43 combinaes possveis, temos assim 64 codes possveis. Visto que
apenas existem 20 aminocidos, e temos 64 codes, indica-nos que o cdigo
gentico redundante, sendo um aminocido codificado por mais do que
um codo.
DNA Recombinante
A tcnica de DNA recombinante permitiu aos cientistas isolar,
sequenciar e manipular os genes individuais de qualquer clula,
revolucionando assim a Biologia Molecular e Celular. Esta tcnica inclui alguns
25
2007/2008
Endonucleases de Restrio
So enzimas que clivam o
DNA em sequencias especificas,
de quatro a oito pares de bases, e
que foram pela primeira vez
identificadas em bactrias, onde
clivam o DNA estranho como modo
de defesa contra vrus.
Existe uma enorme variedade
de endonucleases de restrio, mais
de uma centena, cada um
reconhece apenas uma sequncia
especifica, sendo esta uma das
suas caractersticas.
Aps a clivagem num ponto desta determinada sequencia, no maior
parte dos casos, originam-se extremidades coesivas, que so
complementares; porm existem excepes, em que ao clivarem, estas
enzimas, no originam extremidades com cadeia simples, , que surgem neste
caso, so complementares com qualquer outra extremidade cega, no entanto
mais difcil fazer com que estas se unam.
Electroforese em Gel
O mtodo mais comum em que as
molculas so separadas com base na
razo da sua migrao num campo elctrico,
tendo em conta que se usam gis de
agarose ou de policrilamida. Este gel
colocado num compartimento contendo uma
soluo tampo e elctrodos, a amostra
pipetada em poos abertos no gele o campo
elctrico ligado. Os cidos nucleicos,
carregados negativamente, devido ao grupo
fosfato, migram em direco ao plo
positivo. O gel funciona como que uma
peneira, retardando o movimento das
molculas maiores e facilitando a passagem
de molculas menores, o que permite a sua
separao pelo seu tamanho e peso
molecular.
26
2007/2008
Gerar
Molculas
Recombinante
de
DNA
27
2007/2008
Sequenciao do DNA
A clonagem de DNA permite o isolamento de sequncias de DNA em
quantidades suficientes para a sua caracterizao detalhada, incluindo a
determinao da sua sequencia. O mtodo mais utilizado o baseado na
terminao prematura da sntese de DNA resultante da incluso de
didesoxinucleotdeos (no contm o grupo hidroxilo no carbono 3).
28
2007/2008
A sntese de DNA
comea com um primer, pois a
DNA polimerase no capaz
de iniciar a sntese a partir de
uma cadeia simples de DNA,
este primer marcado com um
radioistopo. So feitas quatro
reaces separadas, cada uma
delas
contento
um
didesoxinucleotdeo, alm dos
restantes componentes comuns
(primers, DNA de interesse,
nucleotdeos
e
DNA
polimerase). A incorporao de
um
didesoxinucleotdeo
bloqueia a sntese da restante
cadeia, existem assim em cada
reaco diversos fragmentos
com diversos tamanhos, no entanto todos eles terminam num
didesoxinucleotdeo (A,G,C ou T). Estes fragmento so separados por
electroforese, em gel de policrilamida (que permite uma maior resoluo), o gel
exposto a um filme raio-X. visto que o tamanho de cada fragmento
determinado pelo didesoxinucleotdeo terminal, a sequencia do DNA
corresponde ordem dos fragmentos lidos a partir do gel.
Actualmente a sequenciao em grande escala feito por sistemas
automticos que contendo primers ou didesoxinucleotdeos florescentes, so
submetidos electroforese e ao passarem num laser so excitados e emitem
luz, que detectada por um fotomultiplicador e analisada por um computador,
assim feita a sequencia do DNA (em fluorogramas de sequenciao). Se forem
utilizados didesoxinucleotdeos florescentes, desde que cada um emita uma luz
distinta, a reaco pode ser toda efectuada num mesmo microtubo.
Amplificao
de
DNA
pela
Reaco em Cadeia de Polimerase
(PCR)
Para realizarmos a PCR, que consiste
numa DNA polimerase usada repetidas vezes,
produzindo de forma exponencial; no entanto
necessrio conhecer alguma sequencia da
molcula de DNA que desejamos amplificar.
So usados primers de DNA, de 15 a 20
nucletidos, que flanqueiam a regio em ambos os
lados e que hibridem apenas uma vez na molcula
de DNA presente. A soluo contendo DNA, DNA
polimerase, nucletidos e primers aquecida
(95C) para que haja a separao das cadeias
duplas de DNA. A temperatura diminuda para
permitir a hibridao dos primers, permitindo
assim que a DNA polmeras inicie a sntese de
novas cadeias, o que feito a uma temperatura
ptima (75C). Estes ciclos so repetidos cercas
de 30 vezes e permitem originar de uma nica
molcula de DNA inmeras molculas de DNA,
cerca de 230.
Transferncia
Plantas e Animais
de
Genes
em
30
2007/2008
31
2007/2008
Captulo Quatro
A complexidade dos Genomas Eucaritas
Os genomas eucaritas so maiores e mais complexos do que os
procaritas, o tamanho pode estar relacionado com uma maior complexidade,
no entanto no parece que assim seja, pois organismos menos complexos
possuem mais DNA que outros mais complexos.
Este paradoxo foi solucionado pela descoberta que no genoma
eucaritico no existe somente genes funcionais, mas sim uma grande
quantidade de sequencias de DNA que no codificam protenas. Apenas cerca
de 3% do DNA codifica protenas. Isto deve-se ao facto de existirem intres e
exes, juntamente com as famlia de genes e as sequencias repetitivas, que
aprofundaremos de seguida.
Intres e Exes
Parte do DNA no-codificante situase entres os genes e denomina-se por
sequncias espaadoras. No entanto
sequencias
no
codificantes
so
encontradas nos genes, assim sendo temos
os exes, que codificam realmente as
protenas, e os intres, que no codificam
as protenas e so removidos do mRNA
aps o seu processamento.
O gene inteiro transcrito, e
seguidamente atravs de splicing os intres
so removidos. Os intres no entanto esto
em grande quantidade, e so geralmente
maiores que os exes, o que ajuda a
manter uma baixa taxa de mutaes; pois
mais provvel que esta ocorra em sequncias no codificantes. Apesar de a
real funo dos intres ainda no ser conhecidos, alguns deles codificam
pequenos RNAs. Em todos os genes existem ainda sequencias que os
flanqueiam, e que so transcritas, no entanto no so traduzidas, as UTR 5 e
3.
Cromossomas e Cromatina
O genoma dos eucaritas muito mais complexo do que o dos
procaritas, mas tambm organizado de forma diferente. O genoma dos
procaritas est contido num nico cromossoma e que usualmente circular.
Nos eucaritas o genoma composto por vrios cromossomas, contendo cada
um uma molcula linear de DNA, que se encontra associado a protenas, as
histonas, que o empacotam de modo ordenado.
Cromatina
A cromatina composta
pelo DNA eucaritico juntamente
com as protenas associadas a
este, sendo que estas se
encontram numa proporo de
1:2, existindo na cromatina uma
maior proporo de protenas do
que de DNA. Alm das histonas
existem outras protenas que
contribuem
para
o
empacotamento do DNA nuclear
e ainda as que participam nos
processos de replicao e de expresso do DNA.
A unidade estrutural bsica da cromatina o nucleossoma, cuja parte
central constituda pela cromotossoma e uma histona. Fazem ainda parte do
nucleossoma protenas no histnicas que esto flanqueando a parte central
deste, sendo duas, e que esto separadas por cerca de 200 pb.
Os nucleossomas so empacotados em fibras com cerca de 30 nm, cuja
estrutura ainda no foi determinada, no entanto sabe-se que o grau de
condensao da cromatina varia ao longo do ciclo celular; podemos assim
distinguir a eurocromatina, quando esta se encontra descondensada, e a
heterocromatina, quando esta se encontra condensada.
33
2007/2008
Centrmeros
Os centrmeros so uma regio
especializada do cromossoma que assegura a
distribuio correcta dos cromossomas
duplicados durante a mitose, aqui que se
ligam os microtbulos do fuso acromtico, e
garantem ainda que os cromatdeos esto
unidos.
Os centrmeros so compostos por
sequencias altamente repetitivas e outras no
repetitivas, nos seres humanos composto
por DNA satlites e protenas associadas.
Os centrmeros humanos formam
grande cinetocoros que se ligam entre 30 a 40
microtbulos durante a mitose.
Telmeros
Os telmeros so as sequncias nas extremidades dos cromossomas,
que desempenham um papel crucial na replicao e manuteno do
cromossoma, sendo compostos por repeties de uma nica sequncia do
DNA que contem em uma das cadeias um agrupamento de guanina. Estas
sequncias so repetidas milhares de vezes e terminam com uma extremidade
de cadeia simples.
A DNA polimerase no capaz de iniciar a sua funo numa cadeia
simples, sendo a sequencia dos telmeros replicada usando a actividade de
uma transcriptase reversa, que juntamente com outras protenas constitui um
complexo, a telomerase. Esta enzima apenas se encontra activa na fase
embrionria e inicio da vida
A manuteno dos telmeros importante na determinao do tempo de
vida e capacidade de reproduo das clulas. Pensa-se que, a fim de evitar
que as extremidades dos cromossomas de degradem, a extremidade do
telmero se dobra sobre si mesmo de forma a forma uma estrutura circular.
O Genoma Humano
O genoma humano constitudo por cerca de 3 x 109 pares de bases, e
estima-se que existam cerca de 100.000 genes humanos. Existem 24
cromossomas (2n), sendo que 22 so autossomas e 2 so cromossomas
sexuais. Todos as nossas clulas so diploides, ou sejam possuem 12 pares
de cromossomas, com excepo dos gmetas que apenas possuem 12
cromossomas, so por isso haploides.
No nosso genoma existem polimorfismos, que so sequncias diferente
de individuo para individuo, que se originaram por alterao no DNA, mas que
ocorreram em zonas no codificantes ou no originaram nenhuma patologia.
Existem diversos tipos de polimorfismos:
34
2007/2008
35
2007/2008
Captulo Cinco
DNA Polimerases
A capacidade desta enzima de copiar um molde de DNA prova a base
bioqumica para a hiptese de replicao proposta inicialmente, hiptese semiconservativa. Existem vrias DNA polimerases que desempenham diferentes
papeis na replicao e reparao do DNA. Conclui-se aps vrias experiencias
que a DNA polimerase I e III so necessrias, e de grande importncia, para a
replicao na E.Coli.
As clulas eucaritas contm as DNA polimerases ,,, e .
A DNA polimerase localiza-se na mitocndria e responsvel pela
replicao do seu DNA. As restantes localizam-se no ncleo e so possveis
intervenientes na replicao do genoma nuclear.
As polimerases encontram-se activas tanto em clulas que esto
diviso como em clulas que no esto, o que nos sugere que pode
primariamente estar envolvida em mecanismos de reparao.
O papel das polimerases , e na replicao foi comprovada em
vrias experiencias, como exemplo a replicao do vrus SV40 em clulas
livres, que nos mostrou a importncia a importncia das polimerases e ; e o
facto das , e serem encontradas em leveduras e clulas de mamferos
demonstrou que sem qualquer uma delas no ocorre replicao em leveduras,
mas foi igualmente demonstrado que as polimerases possuem um papel
especifico nas leveduras, concluindo que as polimerases e so as
grandes responsveis pela replicao nas clulas eucaritas em geral.
Todas as polimerases possuem duas caractersticas indispensveis para
a replicao do DNA:
- Sintetizam DNA somente na direco de 5 3, adicionando um dNTP
no grupo hidroxilo da cadeia nascente;
- Apenas conseguem adicionar um novo desoxirribonucleico a uma
cadeia de DNA dupla; assim sendo as DNA polimerases no so capazes de
iniciar, por si s, a replicao sem a existncia prvia de uma cadeia dupla;
um dos aspectos em que difere da RNA polmeras, pois esta consegue ligar-se
a uma cadeia simples e iniciar a sua funo.
Estas caractersticas parecem ser criticas na manuteno da alta
fidelidade da replicao do DNA para a reproduo celular.
Nota: O facto de a DNA polimerase apenas sintetizar no sentido de 5
3 deve-se ao facto de o grupo fosfato que clivado, de modo a fornecer
energia para a formao da ligao do nucletido que se ir juntar de novo.
Se fosse sintetizada no sentido 3 5, o grupo fosfato clivado seria o do
nucletido na extremidade na cadeia que est a ser sintetizado, assim sendo
se houver um erro e for necessrio substituir este nucletido no existe j o
grupo fosfato que permita a formao de uma nova ligao, se a sntese for
36
2007/2008
A Forquilha de Replicao
Durante a replicao das molculas circulares de DNA podiam ser
observadas duas forquilhas de replicao, que representam as regies
activas na sntese de DNA e so constitudas por duas cadeias de DNA
parental separadas e duas filhas sendo sintetizadas. Surgiu ento um problema
devido ao facto de as cadeias terem que ser sintetizadas em sentidos opostos,
no entanto a DNA polimerase apenas consegue sintetizar na direco 5 3,
como poderiam duas cadeias ser sintetizadas em simultneo?
Ficou ento demonstrado que apenas uma das cadeias sintetizada de
forma contnua, no sentido da forquilha, a outra cadeia sintetizada de forma
descontinua, sendo composta por fragmentos descontnuos que so
sintetizados no sentido oposto ao da forquilha, permitindo que sejam
sintetizados no sentido de 5 3. Estes fragmentos so denominados por
fragmentos de Okazaki e so posteriormente unidos por uma DNA ligase.
A cadeia que sintetizada no sentido da forquilha designa-se por cadeia
de sntese continua, enquanto que a outra cadeia de sntese descontinua.
Outro dos problemas que surgiu foi: como conseguiria a DNA polimerase
sintetizar os fragmentos de Okazaki, se esta necessita de primers?
Existem pequenos fragmentos de RNA que actuam como primers e so
sintetizados (fragmentos de 3 a 10 nucletidos) por uma enzima especifica
primase.
ento necessrio remover os fragmentos de RNA que existem nos
fragmentos de Okazaki, esta aco realizada pela DNA polimerase I na
E.Coli, que tem o papel de uma exonuclease, nas clulas eucaritas
desempenhada por outras exonucleases e o espao que surge preenchido pela
DNA polimerase .
Funo
Eucaritas
Sntese
de
cadeias
DNA Polimerase
continua e alongamento
da descontinua
Remoo de Primers
Exonucleases
Sntese de pequenos
fragmentos DNA-RNA
Unio dos Fragmentos
de DNA
DNA Polimerase +
Primase
DNA Ligases
Procaritas
DNA Polimerase III
RNase H + DNA
Polimerase I
DNA Polimerase II
DNA Ligases
37
2007/2008
Fidelidade da Replicao
A exactido da replicao do DNA crucial para a reproduo celular,
as estimativas indicam que apenas existe uma nica base incorrecta a cada
109 ou 1010 nucleotdeos incorporados. Esta fidelidade nos dada pela simples
complementaridade de bases, no entanto ela to elevada devido s
actividades da DNA polimerase.
A DNA polimerase no catalisa apenas a incorporao de qualquer
nucleotdeo, mas ela evita a incorporao de uma base erra, mal-pareada,
atravs de uma presumvel adaptao conformao da base correcta, este
mecanismo permite aumentar em 100x a fidelidade da replicao. Outro
mecanismo a correco dos erros pela DNA polimerase, que atravs das
38
2007/2008
Os Telmeros e a Telomerase
Visto que a DNA polimerase no capaz de copiar as extremidades dos
cromossomas, visto que apenas sintetiza no sentido 5 3 e com inicio numa
cadeia dupla; por isso necessrio a presena de mecanismos especiais para
replicar as sequncias dos telmeros.
Os telmeros so sequencias repetidas directas, que so sintetizadas
por intermdio da telomerase, que capaz de catalisar a sntese de DNA na
ausncia de um molde de DNA. A telomerase uma transcriptase reversa e
que como tal sintetiza DNA apartir de um molde de RNA, que est contido nela
e complementar s sequencias repetitivas dos telmeros. Este molde permite
que a telomerase estenda a extremidade 3 do DNA cromossomal uma unidade
de comprimento alm do seu tamanho original, podendo assim a cadeia
complementar ser sintetizada pelo complexo DNA polimerase + primase. A
remoo do primer de RNA deixa a extremidade 3 numa cadeia simples, o que
pode levar a formao de laos nos cromossomas eucaritas.
39
2007/2008
Reparao do DNA
O DNA, como qualquer molcula, pode sofrer reaces qumicas, sendo
alterado, o que no deve acontecer pois ela responsvel pelo nosso material
gentico.
As mutaes vo desde a incorporao incorrecta de base durante a
replicao, alteraes qumicas espontneas ou como resultado de
exposio a agentes mutagnicos.
Os mecanismos de reparao do DNA pode dividir-se em dois grandes
grupos: reverso directa da reaco qumica responsvel pelo dano e
remoo de bases alteradas por substituio com DNA recm-sintetizado.
Onde a reparao do DNA falha, desenvolveram-se mecanismos para que a
clula posso lidar com o dano provocado.
40
2007/2008
Reparao Ps-Replicao
Os mecanismos de reparao referidos anteriormente ocorrem antes da
replicao ser concluda de forma a que esta possa ocorrer de forma correcta.
A replicao geralmente bloqueada a quando do aparecer de uma
leso, no entanto esta pode recomear logo aps a leso atravs da sntese de
um fragmento de Okazaki. Este tipo de falhas pode ser reparada por dois
processos:
- Reparao por recombinao: necessrio que uma das cadeias
parentais estivesse integra, originando uma cadeia filha normal. A cadeia
parental pode por recombinao entre sequencias homlogas preencher a
regio lesada. A falha localiza-se oposta a uma regio integra, podendo ser
preenchida pela DNA polimerase. A outra cadeia apresenta ainda uma leso,
mas pode ser corrigida por exciso;
- Reparao sujeita a erros: uma falha oposta a uma sitio lesado
preenchido com DNA recm-sintetizado, este DNA foi sintetizado usando uma
41
2007/2008
cadeia lesada como molde, o que pode levar a mutaes. usada apenas em
bactrias e em condies extremas.
43
2007/2008
Rearranjos do DNA
A recombinao homloga produz rearranjos entre cromossomas
homlogos (crossing-over), no entanto no altera a disposio dos genes ao
longo do genoma. Outro tipo de recombinaes levam a rearranjos do DNA
genmico, estes so importantes para a regulao gnica ou tm um papel
importante na evoluo e contribuem para a biodiversidade.
Recombinao Stio-Especifica
Em contraste com a recombinao homloga, que ocorre em qualquer
regio com ampla homologia entre as sequncias, a recombinao stioespecifica ocorre entre sequncias especificas do DNA, normalmente
homlogas em apenas uma pequena parte do DNA. Esta interaco
mediada por protenas e no por complementaridade de bases. exemplo
desta recombinao stio-especifica a integrao e remoo do DNA viral a
quando a infeco da E.Coli pelo bacterifago .
Esta recombinao ainda importante para os rearranjos programados
que ocorrem nos genomas celulares, como o caso do desenvolvimento do
sistema imune. Os anticorpos so resultado da recombinao stio-especifica
entre os genes para as imunoglobulinas e os receptores de clulas T, o que
lhes permite identificar um grande nmero de antignios.
RAG 1 e RAG 2 esto envolvidos em processos de clivagem e
juno na recombinao stio-especifica para a formao de anticorpos.
44
2007/2008
Amplificao Gnica
Os rearranjos at agora discutidos alteram a posio de uma dada
sequencia de DNA dentro do genoma, a amplificao gnica modifica a
estrutura do genoma, gerando cpias mltiplas de uma regio. As sequncias
amplificadas do DNA podem ser encontradas como molculas
extracromossomais ou como sries repetidas no cromossoma, ambas
contribuem para uma maior expresso do gene amplificado.
A amplificao genica pode ser benfica ou prejudicial para a clula,
como o caso de uma amplificao dos genes que codificam o ribossoma no
ocito de modo a que posso existir uma resposta necessidade de produzir
grandes quantidades de protena, mas por outro lado pode ocorrer como um
evento anormal em clula cancerosas provocando um aumento da expresso
genica que leva a uma intensa e descontrolada diviso celular.
45
2007/2008
Captulo Seis
Transcrio em Procaritas
Os mecanismos de transcrio foram estudados na E.Coli, tal como os
mecanismos de regulao da mesma, que permitem clula responder a
variaes no meio ambiente.
sua transcrio controlada pelo operador (o) que est adjacente ao stio de
inicio da transcrio. O gene regulador codifica uma protena que regula a
transcrio ligando-se ao operador. O produto normal do gene um repressor
que bloqueia a transcrio quando ligado ao operador (o), por exemplo a
lactose liga-se ao repressor inibidor e impedindo que este se ligue ao operador
e a transcrio posso ocorrer. O operador chamado de elemento de controlo
em cis, porque apenas afecta a expresso de genes ligados fisicamente na
mesma molcula de DNA, enquanto que o repressor apelidado de elemento de
controlo com actuao em trans afecta a transcrio de genes em outros
cromossomas.
Atenuao da Transcrio
Os mecanismos atrs referidos interagem, activando ou bloqueando, no
inicio da transcrio, no entanto a atenuao da transcrio age impedindo o
alongamento a partir de determinados stios, que no so mais do que
sequncias especificas.
47
2007/2008
Os Factores Gerais da
Transcrio e a Iniciao da
Transcrio pela RNA Polimerase
II
A RNA polimerase II apenas capaz
de iniciar a transcrio se as protenas
adicionais foram adicionas reaco, estas
protenas designam-se por factores de
transcrio. Existem dois tipos de factores
de transcrio: os esto envolvidos na
transcrio de todos os promotores de RNA
polimerase II e os factores de transcrio
adicionais, que se ligam s sequencias de
DNA que controlam a expresso dos genes
individuais e so, portanto, responsveis
pela regulao da expresso gnica.
Antes do local de inicio de
transcrio existe uma sequencia, a TATA
box, qual se vai ligar um factor geral de
transcrio, o TFIIF, sendo composto por
vrias
subunidades.
Uma
dessas
subunidades a protena de ligao a
TATA, que se liga a TATA box e aos
factores associados da TBP, os ltimos
ligam-se a outro factor geral de transcrio,
o TFIIB. o complexo TBP-TFIIB que
recruta a RNA polimerase II e promove a
sua ligao ao promotor.
Para que se inicie a transcrio
necessria a ligao de dois factores
48
2007/2008
adicionais, o TFIIE e o TFIIH. O TFIIH tem duas subunidades, uma com funo
de helicase e outra que fosforila sequencia repetitivas permitindo a quebra de
ligao com o complexo de iniciao e que a RNA polimerase prossiga.
Alm da TATA box, os promotores de vrios genes que so transcritos
pela RNA polimerase II contm uma sequncia que cobre o sitio de inicio da
transcrio, a Inr; no entanto alguns genes apenas possuem a Inr e no
possuem a TATA box.
Sequncias Regulatrias
Promotores e Enhancers
com
Actuao
em
Cis:
49
2007/2008
Repressores Eucaritas
A expresso gnica tanto regulado por activadores como por
repressores, que equivale aos inibidores procaritas, inibindo a transcrio.
Alguns repressores intreferem com a ligao de outros factores de transcrio,
outros competem com activadores (alguns apenas diferem deste por no
possurem o domnio que recruta outros complexos) pela ligao com a
sequncia regulatria; existem ainda os repressores activos que inibem a
transcrio atravs de interaco protena-protena, sendo criticas na regulao
do crescimento e diferenciao celular.
Metilao do DNA
A metilao outro mecanismo geral pelo qual o controlo da transcrio
em vertebrados est ligado estrutura da cromatina. O DNA especificamente
metilado nos Cs que precedem Gs na cadeia (dinucleotdeos CpG), o que est
51
2007/2008
relacionado com uma reduzida actividade transcricional nos genes que contm
alta frequncia de CpG na vizinhana, pois uma protenas especifica liga-se ao
DNA metilado e inibe a transcrio.
Apesar do seu baixo significado em termos de regulao gnica, a
metilao do DNA, no caso da marcao genmica parece adquirir uma
extrema importncia. Em muitas clulas ambos os alelos de uma gene so
transcritos, mas h alguns poucos genes marcados cuja expresso depende se
foram herdados da me ou do pai. Apesar do papel da metilao do DNA na
marcao ser incerto, parece distinguir entre os alelos maternos e paternos de
genes marcados.
52
2007/2008
Mecanismo de splicing
O splicing do pr-mRNA ocorre em duas
fases: primeiro o pr-mRNA clivado no sitio
5 de splicing, sendo a extremidade 5 do intro
unida a um nucleotdeo de adenina dentro do
intro; forma-se uma estrutura em lao; de
seguida ocorre em simultneo a clivagem do
sitio 3 de splicing e a ligao dos dois exes.
Existem trs sequncias criticas no prmRNA que esto relacionadas com o splicing:
- Stio 5 de Splicing;
- Stio 3 de Splicing;
- Ponto de Ramificao.
O
splicing
ocorre
em
grandes
complexos denominados spliceossomas,
compostos vrias subunidades, que por sua
vez so complexos de protenas e RNA. Os
RNA que constituem o spliceossoma so
pequenos
RNAs
nucleares
(snRNA)
chamados de U1, U2, U4, U5 e U6; estes
associam-se a pequenas protenas e formam
particulas de ribonucleoproteinas (snRNPs)
que desempenham um papel central no
splicing. Cada snRNP contem apenas uma
molcula de snRNA, excepo dos snRNAs
U4 e U6 que esto associados na mesma
snRNP.
53
2007/2008
Splicing Alternativo
O pr-mRNA contem mltiplos intres, o que permite atravs de diversas
combinaes entre eles, de um pr-mRNA originar distintas protenas.
importante referir que a ordem dos exes nunca alterada, sendo as
combinaes possveis apenas aquelas que so criadas pela incluso total ou
parcial de determinados exes.
Existem ento as protenas acessrias de splicing que iro permitir estas
diversas combinaes entre os vrios exes. Tanto podemos ter uma protena
que estimule a ligao do spliceossoma ao SS ou uma que o iniba, sendo
assim iremos ter diferentes padres de splicing. da competio destas duas
protenas que ir surgir um determinado padro, pois se estiver a protena
indutora em excesso, o intres poder ser removido, se esta estiver em menor
quantidade, muito possivelmente este ser includo total ou parcialmente. Estas
protenas ligam-se a sequncias e recrutam geralmente a subunidade U1, pois
esta que inicia o mecanismo de splicing, sendo a juno das outras um
mecanismo em cascata. No entanto existem outros que estimulam a ligao
das outras subunidades em outros locais, o que permite assim que o inicio do
intro se mantenha, no entanto este pode terminar precocemente, ou ser
alongado.
54
2007/2008
Edio do RNA
A edio do RNA consiste num processo de processamento diferente
do splicing, comum em mRNA mitocndrial, mRNA de cloroplastos e alguns
mRNAs nucleares.
um mecanismo onde existe a mudana de uma base simples, como
exemplo a desanimao da citosina em uridina. Este fenmenos, ou um de
substituio, podem originar protenas com sequencias diferentes, ou um
codo de STOP prematuro, o que ir originar protenas diferentes com funes
e estrutura que podem ser idnticas, ou diferentes. exemplo deste
mecanismo a edio do mRNA que codifica uma Apo protena, que no fgado e
expressa por um determinado mRNA, e que nas outras clulas por edio do
RNA surge um codo de STOP prematuro, que origina uma protena truncada,
mas que funcional e mais especifica para a clula onde se encontra.
55
2007/2008
Degradao de RNA
A nvel celular a quantidade de RNA mantida atravs de equilbrio
entre a sua sntese e degradao.
Os RNAs ribosomais e de transferncia so bastante estveis e por isso
encontram-se em grande quantidade, em contraste com os mRNAs que so
rapidamente degradados, o que permite clula responder rapidamente s
mudanas no ambiente, podendo sintetizar novos mRNAs que sejam
necessrios.
A degradao dos mRNAs iniciada pelo encurtamento da caude de
poli-A, segue-se a remoo do cap 5 e posterior degradao do restante RNA
por nucleases.
A estabilidade de alguns mRNAs pode ser determinada por factores
exteriores de modo a que a clula pode responder s necessidades consoante
o meio extracelular.
56
2007/2008
RNAs de Transporte
Os tRNAs possuem aproximadamente 70 a 80 nucleotdeos e tm uma
estrutura de trevo devido ao pareamento de bases complementares em
diferentes regies da molcula.
Os tRNAs tm duas regies distintas, uma sequencia CCA na
extremidade 3, onde os aminocidos se liga covalentemente ribose do A
terminal, e uma sequncia de 3 bases, que ir reconhecer o condo, localizada
na ala, sendo chamada de anticodo.
A ligao entre o aminocido e o tRNA catalisada por um conjunto de
enzimas designadas tRNA aminoacil sintetases. Em caso de existir um
aminocido incorrectamente ligado, existe uma reviso, que hidrolisa em vez
de serem ligados definitivamente no segundo passo deste reaco; este
processo torna o reconhecimento do aminocido altamente fivel.
Os aminocidos so alinhados no molde atravs da complementaridade
entre o codo e o anticodo, no entanto existem tRNAs capazes de reconhecer
mais do que um codo, atravs de um pareamento atpico entre o anticodo e
a terceira posio de alguns codos complementares.
O Ribossoma
Tantos os ribossomas eucaritas, como os procaritas, so compostos
por duas subunidades, uma subunidade grande e outra pequena, que por sua
vez so constitudas por protenas caractersticas e RNAs ribossomais
(rRNAs). Os ribossomas eucaritas e procaritas so similares no seu
funcionamento, a sua grande diferena reside no seu tamanho.
Uma das caractersticas a destacar que estes podem ser formados in
vitro espontaneamente da juno do seu RNA com os constituintes proteicos.
Atravs de sucessivas experiencias, que consistiam na omisso sucessiva de
protenas que constituem o ribossoma, constatou-se que apenas havia um
decrscimo da actividade do ribossoma; conclui-se ento que a reaco
catalisada pelos rRNAs e que as protenas facilitam o dobramento do rRNA e
posicionam-no correctamente.
57
2007/2008
O Processo de Traduo
A traduo geralmente dividida em trs etapas: iniciao, alongamento
e terminao.
Um iniciador especfico de tRNA metionil e o mRNA ligam-se
subunidade ribossomal pequena. A subunidade grande liga-se ao complexo e o
alongamento prossegue.
A iniciao em eucaritas mais complexa do que em procaritas e
requer no mnimo dez protenas que so designadas de IFs. Os factores de
iniciao eucaritas reconhecem tanto a extremidade 5, como a extremidade
3.
O alongamento similar tanto em eucaritas, como em procaritas,
tendo o ribossoma 3 stios para ligao do tRNA, o sitio iniciador (P), segue-se
o sitio A e o sitio E, este ultimo antecede o P. O alongamento continua at que
um codo STOP seja translocado no sitio A do ribossoma, as clulas no
possuem anticodes complementares para estes codes, t, antes factores de
libertao que terminam a traduo.
Os mRNAs podem ser traduzidos por vrios ribossomas, assim que um
abandona o sitio de iniciao outro pode-se ligar e iniciar a traduo.
Nota: Existe na clula mecanismos que controlam a transcrio de
forma a que, no caso de existir um codo STPO precoce devido a uma
mutao, o mRNA que se forma degradado. este fenmeno que
explica que muitas das vezes no so originados protenas, nem
detectados mRNAs, de genes mutados. Este mecanismo apenas eficaz
de o codo de STOP for originado no inicio da sequencia, pois os que se
localizam no final so mais dificilmente detectados e do geralmente
origem a uma protena truncada.
58
2007/2008
A Regulao da Traduo
Um dos mecanismos de regulao a ligao de protenas repressoras,
que bloqueiam a traduo, em sequncias especficas do mRNA. Outro
mecanismo envolve a modulao da actividade dos factores de iniciao,
particularmente o IF-2, no entanto este processo tem efeitos globais na
actividade de traduo, em vez de ser especifico. Contrariamente a estes
processo, existe um que envolve o factor IF-4E que se vai ligar extremidade
5 dos mRNAs e age como uma protena reguladora da traduo, estimulando
o inicio da traduo, pelo recrutamento da pequena subunidade do ribossoma.
Clivagem Proteica
A clivagem proteica da cadeia polipeptdica, designada de protelise,
um passo importante na maturao de muitas protenas. So frequentemente
adicionadas sequncias sinalizadoras, que marcam o destino da protena,
pois preciso clivar essa sequncia para que a protena se torne madura,
exemplo a peptidase sinalizadora.
interessante notar que muitas protenas de vrus tal como hormonas
humanas, derivam da clivagem de precursores maiores. exemplo a insulina,
que sintetizada contendo uma nica cadeia, tendo uma sequncia sinal.
Inicialmente clivada essa sequncia sinal, a restante cadeia estabelece as
ligaes que iro dar origem a sua conformao tridimensional e no sim esta
cadeia cliva em dois pontos, sendo retirado um segmento intermdio,
originando dois domnios diferentes. A presena daquele segmento no para
a funo da protena, mas sim para a sua correcta conformao, permitindo
que as ligaes se formem entre os resduos de aminocidos correctos.
Glicolizao
Muitas protenas so modificadas por adio de glcidos, num processo
denominado de glicolizao, e passam a designar-se glicoproteinas. As
pores de glcidos desempenham um papel importante no dobramento no
reticulo endoplasmtico, na marcao de protenas e como stios de
reconhecimento nas interaces clula-clula.
As glicoproteinas so geralmente segregagas ou incorporadas na
membrana, e o processo de glicolizao ocorre no reticulo endoplasmtico,
geralmente, durante a traduo.
Existe a N ou O glicolizao, dependendo do local onde est ligado o
glcido, e isso faz com que difira o local onde realizada a glicolizao, este
tema ser abordado mais afrente.
Ligao de Lpidos
Algumas protenas so modificadas pela ligao de lpidos cadeia
polipeptdicas, que geralmente marcam e ancoram essas protenas
membrana plasmtica.
60
2007/2008
61
2007/2008
Captulo Nove
O primeiro passa para a distribuio das protenas ocorre ainda durante
a traduo, visto que vrias protenas com destino ao reticulo endoplasmtico,
ao complexo de Golgi, membrana ou aos lisossomas so traduzidas em
ribossomas associados ao reticulo endoplasmtico, dentro ocorre o seu
processamento.
Retculo Endoplasmtico
O retculo endoplasmtico (RE) uma rede de tbulos envolvidos por
uma membrana e vesculas que se estendem desde o membrana nuclear por
todo o citoplasma.
Existem dois tipos de RE, estando cada um envolvido em funes
diferentes:
- Retculo Endoplasmtico Rugoso, possui ribossomas associados e
funciona no processamento das protenas;
- Retculo Endoplasmtico Liso, sem ribossomas associados e est
envolvido no metabolismo de lpidos.
Direccionando
Endoplasmtico
Protenas
para
Retculo
63
2007/2008
O Reticulo Endoplasmtico
Os lpidos so sintetizados no RE Liso devida s suas caractersticas,
sendo estes hidrofbicos, so sintetizados em associao com as membranas
j existentes e no no citosol; so de seguida transportadas por vesculas ou
protenas para os seus destinos.
Alm do seu papel na sntese dos glicerol fosfolipidos, o RE tambm
serve como principal local de sntese de outros dos lipidos de membrana: o
colesterol e a ceramida. So aqui produzidas igualmente as hormonas
esteroides, a partir do colestrol, so por isso muito desenvolvidos (RE Lisos)
em clulas secretoras de hormonas esteroides.
Para manter a membrana do RE Liso estvel alguns dos lpidos
sintetizados de novo so transferidos para a poro exterior da bicamada, este
processo catalisado pelas flipases.
Exportao
Endoplasmtico
de
Protenas
Lpidos
do
Retculo
O Complexo de Golgi
O complexo de Golgi funciona como uma fbrica na qual as protenas
recebidas do RE so processadas e separadas para que sejam transportadas
para os seus destinos. No entanto neste que ocorre a sntese de alguns
lpidos, como glicolipidos ou esfingomielinas, ou de polissacarideos.
protenas entram pela rede Golgi cis, sofrem a maior parte das alteraes na
pilha de Golgi e saiem pela rede de Golgi trans, sendo distribudas e
direccionadas para os seus destinos.
Fuso Vesicular
A fuso de uma vescula de transporte com o seu alvo envolve dois tipos
de eventos: a vescula transportadora deve reconhecer especificamente a
membrana alvo-correcta; e a vescula e a membrana-alvo devem fundir-se,
libertando assim o contedo para o interior do organito-alvo.
A hiptese de SNARE diz-nos que a fuso vesicular mediada por
interacces entre pares especficos de protenas, designados de SNAREs, na
vescula (v-SNARE) e na membrana alvo (t-SNARE). A interaco entre as vSNARE e a t-SNARE leva fuso das membranas atravs de mecanismos
ainda no conhecidos.
65
2007/2008
Lisossomas
So
organitos
envolvidos por membranas
que contm uma variedade
de enzimas capazes de
hidrolizar todos os tipos de
polmeros biolgicos. Servem
para digerir tanto o material
captado do exterior como
componentes
da
clula
absolentos.
Hidrolases
Lisossomais cidas
Os
lisossomas
possuem
cerca
de
50
enzimas,
que
degradam
todos
os
polmeros
biolgicos. Mutaes nos
genes que codificam estas
enzimas so responsveis
por mais de 30 patologias,
que so chamadas de
doenas de armazenamento
dos lisossomas, pois o
material no degradado e
acumula-se nos lisossomas.
Como exemplo temos a
Doena de Gaucher, que
originado pela mutao no
gene que codifica uma
enzima responsvel pela
degradao de glicolpidos.
Todas as enzimas
lisossomas so activas em
pH baixo, que mantido
dentro dos lisossomas, mas inactivas em pH neutro. O que permite evitar uma
digesto descontrolada dos componentes da clula, o pH mantido cido no
interior dos lisossomas por transporte activo de ies H+ para o interior do
lisossoma.
66
2007/2008
67
2007/2008
Funes do Peroxissomas
Os peroxissomas possuem, pelo menos, 50 enzimas diferentes
envolvidas em uma variedade de metabolismos.
Como o perxido de hidrognio txico para as clulas, os
peroxissomas possuem tambm a enzima catalase, que decompe esse
composto, convertendo-o em gua, ou utilizando-o para oxidar outros
compostos orgnicos.
Diversos compostos so degradados nos peroxissomas, um exemplo a
oxidao dos cidos gordos, que representa a principal fonte energtica
metablica.
Os peroxissomas esto ainda envolvidos na biossintese de lpidos, de
cidos biliares. Nas plantas desempenham dois papeis importantes , a
converso dos cidos gordos em glcidos, atravs do ciclo do glioxilato; esto
ainda envolvidos na fotorespirao, que serve para metabolizar produtos
secundrios formados durante a fotossntese.
68
2007/2008
Captulo Onze
O Citoesqueleto
Citosqueleto uma rede complexa, dinmica e interdependente de
filamentos proteicos que se estendem ao longo do citoplasma. As suas funes
so:
- Suporte de organitos celulares;
- Sustentao da membrana plasmtica;
- Importante para a mobilidade celular;
- Mantm a forma e confere elasticidade clula;
- Permite o transporte de vesculas.
Existem trs tipos de filamentos proteicos, dos quais iremos falar em
particular de seguida, os microtbulos, os filamentos intermdios e os
microfilamentos ou filamentos de activa. A ordem a cima descrita est por
tamanho decrescente.
Microtbulos
Encontram-se dispersos pelo citoplasma. Podem participar na
constituio de organitos (clios, flagelos e centrolos), que desempenham um
papel importante nalguns tipos de mobilidade celular. Tambm esto presentes
nas dendrites e nos axnios. Os microtbulos desempenham funes de:
- Estabelecem a forma da clula;
- Fornecem fora mecnica;
- Locomoo da clula;
- Trfego intracitoplasmtico de vesculas e organelos durante a
interfase;
- Construo do fuso mittico e movimento dos cromossomas;
- Criao e manuteno de domnios citoplasmticos.
rapidamente
por
70
2007/2008
liga-se
s
molculas de tubulina impedindo a sua
polimerizao, originando a formao
de agregados paracristalinos desta
protena.
Taxol associa-se a polmeros
de tubulina, tendo uma aco
estabilizadora. Baixa a concentrao
crtica de tubulina necessria polimerizao, que promove mesmo em
condies desfavorveis (ausncia de MAP e GTP, baixas temperaturas).
Filamentos Intermdios
Os filamentos intermdios tm um dimetro entre o dos microtbulos e
o dos microfilamentos. Formam uma rede perinuclear, donde se estendem at
membrana celular. Ocorrem sob a forma de pequenos feixes ou constituindo
feixes muito compactos nas clulas epiteliais. Constitudos por protenas
fibrosas, cujo domnio central constitudo por uma hlice , com cerca de 310
a 350 aminocidos e duas pores globulares em ambas as extremidades, de
dimenses e sequncia muito variveis. Podemos assim dividi-a em dois
domnio distintos:
Domnio central responsvel pela idntica organizao estrutural dos
diferentes tipos de filamentos intermdios.
Domnios terminais muito variveis em tamanho e nas sequncias de
aminocidos, conferem-lhes especificidades prprias.
As suas principais funes so:
- Desempenham funes estruturais (papel de suporte):
- Reforam as clulas (resistncia mecnica);
- Participam na organizao das clulas em tecidos;
- Reforam a membrana celular nos locais de contacto com outras
clulas;
- Transporte de macromolculas e vesculas.
71
2007/2008
72
2007/2008
Filamentos de Actina
Os filamentos de Actina tm aproximadamente 7nm de espessura e
alguns m de comprimento, a aparncia da dupla hlice, so polares e
organizam-se em forma de feixes ou de redes.
Polimerizao/Despolimerizao
A actina G ou globular forma estruturas com 3 unidades, a unio destas
estruturas forma a actina F ou filamentosa.
Os monmeros de actina podem ligar-se a ATP, que facilita a
polimerizao e dificulta a despolimerizao, e a ADP, que dificulta a
polimerizao.
Existe um equilbrio entre a actina G e a actina F, assim sendo quando a
concentrao de actina G superior, a polimerizao favorecida, quando
inferior, a despolimerizao favorecida.
Na extremidade positiva existe uma velocidade de polimerizao cerca 5
a 10 vezes superior do que na extremidade negativa, sendo que na positiva se
ligam o monmeros associados a ATP e na negativa os associados ao ADP.
Visto que a polimerizao numa extremidade favorece a
despolimerizao na outra, para que haja uma estabilidade dos filamentos de
actina, existe o efeito treadmilling, que favorece igualmente a adio na
extremidade positiva e a remopo na extremidade negativa.
Protenas
que
Regulam
Despolimerizao da Actina
Polimerizao
73
2007/2008
liga-se
individualmente aos monmeros de actina,
reduzindo a sua concentrao no citosol,
induzindo a despolimerizao de actina F.
Existem ainda protenas que regulam
a polimerizao/despolimerizao formando
um cap numa das extremidades, inibem a
polimerizao ou a despolimerizao
consoante se ligam a extremidade positiva
ou negativa, respectivamente.
74
2007/2008
Miosina
A miosina funciona geralmente em
associao com filamentos de actina e
protenas motoras, estando envolvida no
transporte celular e nos movimentos da
clula. A miosina pode ser divida em dois
domnios:
- Cabea, liga-se actina;
- Cauda, liga-se a cargas a transportar ou a outras subunidades de
miosina.
Contraco Muscular
Msculos esquelticos so constitudos por fibras musculares
compostas por clulas alongadas, contendo miofibrilas: filamentos de actina e
filamentos de miosina; que se dividem em sarcmeros, ou seja, unidades
contrcteis responsveis pelo aspecto estriado dos msculos.
As miosinas das clulas musculares so do tipo miosina II. As fibras de
miosina so constitudas pela unio das suas caudas, ficando as suas cabeas,
que se associam a actina, livres para o fazer.
Existem diversas teorias para explicar a contraco muscular, a mais
aceite consiste no seguinte:
- Filamentos de miosina ligados actina;
- Ligao do ATP;
- Filamentos de miosina desligam-se da actina;
- Hidrlise do ATP;
- Mudana de conformao da cabea da miosina, permanncia do ADP
+ P i;
- Ligao da miosina a um novo local do filamento de actina, mais
prximo da extremidade positiva;
- Libertao do ADP e do Pi;
- Retoma da conformao inicial;
- Avano do filamento de miosina em direco extremidade positiva da
actina;
- Contraco Muscular, ou seja diminuio entre as miofribilas.
75
2007/2008
Captulo Treze
Sinalizao de Molculas e seus Receptores
Diferentes tipos de molculas transmitem informaes entre clulas de
organismos multicelulares, embora a sua funo seja idntica, a sua estrutura
varivel. Umas transportam sinais a longas distncias, outras para locais
especficos e outras paras as clulas vizinhas.
Certas molculas atravessam a membrana e ligam-se a receptores no
citoplasma ou no ncleo, enquanto a maior parte se liga a receptores
expressos na membrana da clula. Existem diversas formas de sinalizao e
de receptores, cujos mais importantes sero abordados de seguida.
GMP Cclico
O GMP Cclico igualmente um segundo mensageiro, no entanto no
se encontra to bem estudado como o cAMP. A sua sntese mediada pela
guanilil ciclase e a sua degradao a GMP por uma fosfodiesterase.
Quando existe a ligao do ligante, as guanilil cilcase so estimuladas a
sintetisar cGMP, que por sua vez ir desencadear respostas bio-fisiolgicas.
79
2007/2008
Caspases e Apoptose
Em contraste com a morte acidental de clulas,
a morte celular programada um processo activo
caracterizado por mudanas morfolgicas distintas
conhecidas como apoptose.
Durante este processo o DNA cromossomal
normalmente encontra-se muito condensado e
fragmentado. O ncleo fragmenta-se, sendo de
seguida a clula que diminui de tamanho e se
fragmenta; os fragmentos que dai surgem denominamse de corpos apoptticos. Estes fragmentos so
facilmente reconhecidos e digeridos pelos macrfagos,
o que faz com que a apoptose seja muito diferente da
necrose celular, onde no existe uma eficaz remoo
dos fragmentos de clula que se originam.
So as caspases que so responsveis por
desencadear todo este processo a nvel celular, sendo
elas proteases que tm no seu centro activo resduos
de cistena e clivam depois de resduos de acido
asprtico.
Os principais alvos das caspases so: um inibidor de um DNase, que ir
fragmentar o DNA nuclear; as lminas nucleares, o que provoca a alterao da
membrana nuclear; e as protenas do citoesqueleto, levando sua destruio e
fragmentao celular.
As caspases so sintetizadas sob forma inactiva, a sua activao feita
por clivagem proteoltica, o que por sua vez catalisado por outras caspases.
O Apaf-1 um dos activadores das caspases, promovendo a clivagem de
outras caspases e dos substratos alvo; em contraste temos a Bcl-2 que inibe a
activao de caspases. Nos mamferos existe a chamada famlia Bcl-2, onde
se inclui o Bcl-2, no entanto dentro deste grupo existe elementos prapoptticos e anti-apoptticos.
Uma das caspases iniciadoras a Caspase-9, que para ser activada
no basta que existe Apaf-1, ainda preciso que a este complexo se junto o
citocromo c. O que em condies normais no possvel, pois o citocromo c
encontra-se dentro da mitocndria. A quando da estimulao pr-apopttica, ou
na ausncia de factores de crescimento, as clulas induzem danos na
membrana da mitocndria, sendo o citocromo c libertado.
Forma-se ento o complexo caspase-9/Apaf-1/citocromo c que
activo e inicia a clivam de outras caspases, as efectoras, e dos seus alvos.
80
2007/2008
81
2007/2008
82
2007/2008
83
2007/2008
mittico, para que estes sejam distribudo de forma exacta para as clulasfilhas.
85
2007/2008
86
2007/2008
87
2007/2008
Correlaes
Clnicas
88
2007/2008
ndice
ndice ............................................................................................................................. 89
Vrus e Cancro .............................................................................................................. 90
Fenilcetonria ............................................................................................................... 91
HIV e SIDA ..................................................................................................................... 92
Terapia Gnica para a Deficiencia de Adenosina Desaminase ............................... 93
Cancro do Clon e Reparao do DNA ...................................................................... 94
Factor de Transcrio Pit-1 e a Deficincia da Hormona do Cresc. ....................... 95
Antibiotico e Sntese Proteica ..................................................................................... 96
Doena de Gaucher ...................................................................................................... 97
Doenas das Mitocndrias: Neurapatias pticas Heredittia de Leber ................. 98
Distrofia Muscular e Citoesqueleto ............................................................................ 99
Fibrose Cistica ............................................................................................................ 100
89
2007/2008
Vrus e Cancro
A Doena
O cancro um grupo de doenas caracterizado pela proliferao
incontrolada de clulas. Em contraste com um crescimento regulado normal, no
cancro as clulas crescem de forma no-regulada, acabando por invadir e
interferir com a funo de tecidos e rgos normais.
O cancro uma das maiores causas de morte nos nossos dias, e por
isso alvo de estudos por parte da Biologia Molecular.
Preveno e Tratamento
Os cancro humanos que so causados por vrus incluem o cervical e
outros cancros anogenitais, como exemplo o papilomavrus e os vrus da
Hepatite B e C.
Este cancros podem ser prevenidos atravs de uma vacina contra o
vrus responsvel, como o caso da vacina eficaz contra o vrus da Hepatite B.
A maior parte das mutaes que causam cancro so adquiridas durante
a nossa vida e no herdadas.
90
2007/2008
Fenilcetonria
A Doena
A fenilcetonria, ou PKU, um erro inato do metabolismo dos
aminocidos com efeitos devastadores. Se no for tratada resulta em um grave
atraso mental, no entanto j possvel o seu diagnstico precoce e o seu
tratamento.
Preveno e Tratamento
A deficincia da enzima no causa nenhum problema enquanto o feto
est dentro do tero, de modo que crianas com fenilcetonria so normais ao
nascimento. Se no tratadas tornam-se gravemente e permanentemente
afectados antes de completarem um ano de vida. Felizmente o diagnostico
pode ser feito por testes de rotina, conhecido por teste do pezinho, no entanto
um diagnostico mais especifico deve ser feito atravs de testes genticos, para
verificar de outras enzimas foram afectadas igualmente.
O tratamento desta doena baseia-se numa alimentao controlada,
com baixa ingesto de fenilalanina, o que permite manter, os nveis desta,
aceitveis, abaixo do limite txico.
91
2007/2008
HIV e SIDA
A Doena
A Sindrome da Imunodeficincia Adquirida (SIDA) uma doena
recente, descrita pela primeira vez em 1981. No entanto rapidamente se tornou
numa pandemia mundial, que j provocou vrios milhes de mortes.
As manifestaes clnicas da SIDA resultam, principalmente, da falha do
sistema imune, o que torna o paciente vulnervel a infeces oportunista, que
de outro modo seria facilmente resistente. Existe ainda uma grande incidncia
de cancro nestes pacientes, no entanto a grande causa de morta so as
infeces oportunistas.
Preveno e Tratamento
At ao presente a nica forma de prevenir a SIDA evitando a
contaminao pelo HIV. O HIV um vrus que no exterior se perde
rapidamente. O HIV pode ser transmitido por contacto sexual, atravs de
contacto com produtos contaminados com sangues e de me para filho durante
a gravidez ou no aleitamento.
Quanto ao seu tratamento, este pouco eficaz, no entanto actualmente
j possivel prolongar a vida dos pacientes infectados com a combinao de
diversos frmacos. Um dos mais utilizados o AZT, que consiste num
nucleotdeo modificado que no possui na extremidade 5 o grupo OH de modo
a permitir a ligao ao nucleotdeo seguinte, inibindo assim a transcrio do
DNA viral.
92
2007/2008
Preveno e Tratamento
Algumas crianas com deficincia na enzima adenosina transaminase
podem ser curadas pelo transplante de medula ssea. Em outros casos esta
doena por ser tratada pela terapia de reposio enzimtica, na qual a
adenosina transaminase funcional administrada por injeco endovenosa.
Embora este procedimento seja benfico e atenue a patologia, ele no cura a
doena.
Foi ento criada a primeira tentativa clnica de terapia gnica no
tratamento de duas crianas com esta doena. Foram obtidos linfcitos destas
crianas e estimulados a proliferarem; um cDNA de adenosina desaminase
funcional clonado num vector retroviral foi introduzido nesses linfcitos, os
quais, retornaram aos pacientes. Estes tratamentos foram repetidos 11 a 12
vezes num perodo de 2 anos, e verificou-se que o vector era mantido aps o
tratamento e um dos pacientes produziu cerca de 25% do nvel normal de
adenosina transaminase.
Estes resultados so sustento para o sucesso da terapia gnica como
tratamento neste tipo de doenas.
93
2007/2008
Preveno e Tratamento
A identificao dos genes responsveis pelo HNPCC permite, atravs de
testes genticos, identificar os indivduos com alto risco. Esta identificao
pode ainda ser til na preveno da doenas em indivduos com maior
predisposio ou para o diagnostico pr-natal, para casais portadores que
pretendam ter filhos.
importante um diagnostico precoce, pois com o avanar do cancro as
hipteses de sobrevivncia diminuem. No entanto existem frmacos que esto
a ser testados, e que podero inibir o desenvolvimento destes cancros.
94
2007/2008
Preveno e Tratamento
Crianas com deficincia em hormonas de crescimentos podem ser
eficazmente tratadas por injeces desta hormona. At muito recentemente
esta hormona apenas era possvel de obter de crebros humanos, no entanto a
partir de 1979 foi possvel expressar com sucesso na E.Coli esta hormona de
crescimento, passando ser usado para fins clnicos a partir de 1985.
Quando esta deficincia em hormonas de crescimento de origem
gentica, importante a existncia de testes genticos para um diagnstico
mais correcto.
95
2007/2008
Preveno e Tratamento
O uso de medicamentos teve um grande impacto na medicina moderna
por permitir curar infeces, que de outra maneira levariam um individuo
morte. No entanto mutaes no genoma bacteriano podem levar a uma
multiresistencia das bactrias aos antibiticos.
Esta situao preocupante pois surgem muitas vezes em hospitais
bactrias deste tipo e que levam os mdicos a no encontrar uma maneira
rpida e eficaz de controlar as infeces por elas causadas.
96
2007/2008
Doena de Gaucher
A Doena
A doena de Gaucher a mais comum das doenas de armazenamento
dos lisossomas, que so causadas por uma falha dos lisossomas em degradar
substancias que eles normalmente degradam. A acumulao de compostos
leva a uma aumento do tamanho e nmero de lisossomas dentro da clula,
resultanto falncia das clulas onde isto acontece.
Existem trs tipos da doena que diferem na gravidade e no
envolvimento do sistema nervoso. A forma mais comum (tipo I), o sistema
nervoso no est envolvido; a doena aparece com o aumento do bao e do
fgado e o desenvolvimento de leses sseas. As formas mais graves da
doena (tipo II e III) so mais raras, sendo a mais devastadora a do tipo II,
onde o envolvimento neurolgico detectado logo na infncia e os indivduos
morrem precocemente. A doena do tipo III intermediria e caracterizada
pelos sintomas neurolgicos por volta dos 10 anos.
Preveno e Tratamento
Esta patologia pode ser tratada pela terapia de reposio enzimtica, na
qual a administrao exgena da enzima utilizada para corrigir o defeito
enzimtico. Atravs de diversas experincias descobriu-se que os macrfagos
expressam receptores na superfcie celular que ligam resduos de manose em
glicoprotenas extracelulares e depois internalizam estas protenas. assim
possvel dirigir especificamente a glicocerebrosidade para os macrfagos
atravs de modificaes que expusessem os resduos de manose.
97
2007/2008
Doenas
das
Mitocndrias:
Neurapatias pticas Heredittia de
Leber
A Doena
um doena hereditria que causa a cegueira devido degenerao do
nervo ptico. A perda de viso ocorre entre os 15 e os 35 anos, sendo
geralmente o ncio sintoma da doena.
As mulheres so menos afectadas, o que nos poderia sugerir que uma
doena ligada ao sexo, no entanto neste caso os homens nunca transmite a
doena. A doena apenas transmitida por via materna, o que nos leva a
concluir que uma doena de herena citoplasmtica, visto que o citiplasma
resulta quase na sua totalidade do ocito.
Preveno e Tratamento
A identificao das mutaes no DNA mitocndrial pode ser decisiva
para o diagnostico precoce de pacientes com historial familiar de LHON. No
entanto a identificao da mutao no genoma mitocndrial pouco
conclusiva, pois no possvel determinar com certeza de o individuo sofre ou
no da patologia, o que contraste com a identificao de mutaes no DNA
nuclear.
Uma das terapias consiste na terapia metablica, ou seja, administrar
substratos ou cofactores da via de fosforilao oxidativa; outra das hipteses
seria a terapia gnica, introduzindo um gene saudvel para a protena em falta
no DNA nuclear, com a particularidade que essa protena possuiria um sinal
que a levaria at mitocndria.
98
2007/2008
Preveno e Tratamento
A identificao do gene DMD possibilitou o desenvolvimento de testes
diagnsticos sensveis. Mulheres portadoras do alelo mutante para este gene
podem ser identificadas, e as suas geraes monotorizadas a fim de preceber
de houve transmio do alelo mutado.
assim possvel identificar em embries in vitro a presena desta
mutao, antes que estes sejam implantados no tero da me. A combinao
do aconselhamento gentico e o diagnostico pr-natal representa uma medida
potencial de preveno de DMD hereditria.
Infelizmente a eficincia destes procedimentos limitada pelo facto de
que aproximadamente um tero dos doentes de DMD no so hereditrios.
assim necessrio desenvolver terapias para os doentes que se encontram
nestes casos, e para os restantes que sofrem de DMD hereditria; actualmente
existe o esforo para desenvolver uma terapia gentica para restabelecer a
produo de distrofina no musculo.
99
2007/2008
Fibrose Cstica
A Doena
A fibrose cistca uma doena gentica recessiva que afecta crianas e
adultos jovens. a doena hereditria mais comum em brancos, que
caracterizada pela produo de um fino muco por vrios tipos de clulas
epiteliais, incluindo as que envolvem as vias respiratrias e gastrintestinal.
Os primeiros sintomas consistem numa obstruo das vias areas
superiores por acumulao de muco e uma consequente infeco bacteriana.
As glndulas sudorparas apresentam-se igualmente alteradas, sendo
caracterstico uma presena excessiva de sal no suor.
Os procedimentos para esta doena incluem terapia fsica para
promover drenagem bronquial, administrao de antibiticos e reposio de
enzimas pancreticas.
Preveno e Tratamento
O isolamento do gene da fibrose cstica possibilitou identificar os
indivduos portadores do alelo mutado; o que juntamente com a compreenso
do funcionamento da CFTR como canal de Cl- tem sugerido novas abordagens
para o tratamento. Uma das possibilidades a utilizao de drogas que
estimulem a abertura dos canais de Cl-; outras das alternativas a terapia
gnica com a reposio do gene da CFTR nas clulas afectadas.
100
2007/2008