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FACULDADE SANTA EMLIA DE RODAT


Curso de Bacharelado em Biomedicina
Disciplina de Bioinformtica
Turma: BIO_3NA (2015/1)
Professor: Rodrigo Niskier Ferreira Barbosa
Contato: rodrigo.niskier@uniesp.edu.br

BIOINFORMTICA

DESENHO DE PRIMERS E
BANCOS DE DNA FORENSE

Faculdade Santa Emlia de Rodat

Prof. Rodrigo Niskier - Biomedicina - 2015

ASSUNTOS E 
TRABALHOS PARA N2
Assuntos:
Anlise de Biomolculas (DNA, RNA e Protenas)
Desenho de Primers (PCR)
Bioinformtica aplicada a gentica forense
Trabalhos para N2:
Trabalho A (5,0 pontos) Anlise de biomolculas de um gene escolhido
Entrega: 19/05 (neste dia o laboratrio estar reservado para concluso dos trabalhos
e para tirar dvidas). Dever ser enviado por e-mail at esta data.
Trabalho B (5,0 pontos) Realizar o desenho de um conjunto de primers para o
diagnstico molecular de uma doena.
Entrega: 09/06 (neste dia o laboratrio estar reservado para concluso dos trabalhos e
para tirar dvidas). Dever ser enviado por e-mail at esta data.
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DIAGNSTICO PELA PCR

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DIAGNSTICO PELA PCR


Diagnstico de doenas genticas
Marcadores moleculares do cncer
Gentica forense
Diagnstico gentico pr-implantacional

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DESENHO DE PRIMERS

PCR REAO EM CADEIA DA POLIMERASE

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PRIMERS = ESPECIFICIDADE

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DESENHO DE PRIMERS

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ESCOLHENDO UM ALVO

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ESCOLHENDO UM ALVO

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DESENHANDO PRIMERS

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ESCOLHENDO OS PRIMERS

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ESCOLHENDO OS PRIMERS

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TESTANDO OS PRIMERS

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TESTANDO OS PRIMERS

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RESULTADO NO BLAST
PRIMER FOWARD

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RESULTADO NO BLAST
PRIMER REVERSE

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ATIVIDADE PARA N2

1) Entrar no NCBI e escolher um gene alvo relacionado ao


diagnstico molecular
1) Copiar parte da sequncia FASTA deste DNA-alvo
2) Colar no Primer3plus
3) Gerar os primers
4) Escolher um par de primers
5) Testar cada primer do par escolhido no BLAST
6) Enviar para o e-mail da disciplina um arquivo com:
a) A identidade do gene escolhido no NCBI
b) Um printscreen das informaes sobre o par de primers
escolhidos
c) o printscreen do BLAST de cada primer escolhido
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BANCOS DE DNA FORENSE

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REPETIES STR

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IDENTIFICAO PELO DNA

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IDENTIFICAO PELO DNA

Incluso de paternidade

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Excluso de paternidade

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STR BASE

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IDENTIDADE PELO DNA

Alelos do SP/Freqncia (p)


19/ 0,010
18/ 0,1811

1
IP =
2p

IP(19) 50
IP(18) 2,7609

14/ 0,225

IP(14) 2,2222

14/ 0,015

IP(14) 33,3333
IAP 10225,4431
PP = 0,99990221428 ou 99, 9902214%

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