Comunicao
e suas relaes com a agricultura
Tecnologias da Informao e
Comunicao
e suas relaes com a agricultura
Tecnologias da Informao e
Comunicao
e suas relaes com a agricultura
Embrapa
Braslia, DF
2014
Editores
Tcnicos
Silvia Maria Fonseca Silveira Massruh
Analista de sistemas, doutora em Computao Aplicada
Pesquisadora da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Maria Angelica de Andrade Leite
Engenheira-civil, doutora em Engenharia de Computao
Pesquisadora da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Ariovaldo Luchiari Junior
Engenheiro-agrnomo, Ph.D. em Agronomia e Solos
Pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas - SP
Luciana Alvim Santos Romani
Bacharel em Cincia da Computao, doutora em Cincia da Computao
Pesquisadora da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Autores
Adauto Luiz Mancini
Cientista da computao, mestre em Cincias da Computao e Matemtica Computacional
pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Alan Massaru Nakai
Cientista da computao, doutor em Cincia da Computao
analista da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Aldemir Chaim
Engenheiro-agrnomo, mestre em Agronomia
pesquisador da Embrapa Meio Ambiente, Jaguarina, SP
Alexandre Camargo Coutinho
Bilogo, doutor em Cincias Ambientais,
pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Antnio Mrcio Buainain
Economista, doutor em Economia,
pesquisador do Instituto Nacional de Cincia e Tecnologia em Polticas Pblicas, Estratgia
e Desenvolvimento (INCT-PPED), professor livre docente do Instituto de Economia da
Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), Campinas, SP
Ariovaldo Luchiari Junior
Engenheiro-agrnomo, Ph.D. em Agronomia e Solos
pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Aryeverton Fortes de Oliveira
Economista, doutor em Economia Aplicada,
pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Carla Geovana do Nascimento Macrio
Tecnloga em Processamento de dados, doutora em Cincia da Computao,
pesquisadora da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Carlos Alberto Alves Meira
Matemtico, doutor em Engenharia Agrcola,
pesquisador da Embrapa Informtica Agropecuria, Campinas, SP
Cssia Isabel Costa Mendes
Advogada, doutoranda em Desenvolvimento Econmico pelo Instituto de Economia da
Universidade Estadual de Campinas (Unicamp),
analista da Embrapa Informtica Agropecuria e membro do Instituto Nacional de Cincia e
Tecnologia em Polticas Pblicas, Estratgia e Desenvolvimento (INCT-PPED), Campinas, SP
Agradecimentos
Como organizadores desta iniciativa multi-institucional de colaborao tcnico e cientfica,
desejamos registrar nossos sinceros agradecimentos aos colegas e s instituies, os quais, por
meio do trabalho colaborativo e compartilhamento de ideias, tornaram possvel a realizao
deste documento sobre desafios e oportunidades de desenvolvimento do tema Tecnologias de
Informaao e Comunicao (TIC) na rea de pesquisa agropecuria.
Inicialmente agradecemos ao Programa Cooperativo para el Desarrollo Tecnolgico
Agroalimentario y Agroindustrial del Cono Sur (Procisur), por estabelecer o grupo de Tecnologia
da Informao aplicada Agricultura, como constituinte da Plataforma de Tecnologias
Emergentes, no mbito do qual surgiu a ideia da elaborao deste documento. Dentro deste
grupo, agradecemos as contribuies e o apoio dos colegas do Instituto Nacional de Tecnologa
Agropecuaria (Inta Argentina), Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuaria (Inia Chile),
Instituto Nacional de Investigacin Agropecuaria (Inia Uruguay) por elaborarem os captulos
referentes aos trabalhos que vm sendo desenvolvidos em seus respectivos pases. Ao Instituto
Interamerciano de Cooperao para Agricultura (IICA-Procisur) agradecemos pelo suporte financeiro.
De forma decisiva, foi a participao dos empregados da Embrapa Informtica Agropecuria. O
corpo tcnico se dedicou, com afinco, a elaborar captulos deste livro no medindo esforos para
divulgar as pesquisas e os trabalhos que esto sendo realizados neste centro de pesquisa sob sua
responsabilidade. Com igual empenho agradecemos aos participantes do Comit de Publicaes
(CP), pela reviso tcnica; ao Ncleo de Comunicao Organizacional (NCO), pelas atividades
de editorao e reviso gramatical; s bibliotecrias, pela reviso bibliogrfica; e equipe administrativa, por todo o suporte recebido.
Tambm agradecemos aos colegas do Instituto de Economia da Universidade Estadual de
Campinas (IE-Unicamp), da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA-USP),
da Escola de Engenharia de So Carlos (EESC-USP), e da Embrapa Instrumentao que se uniram a ns trazendo sua experincia tcnica e cientfica.
Diretoria Executiva da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria (Embrapa) agradecemos
imensamente pelo seu apoio constante e por acreditar em nosso trabalho. s Unidades Centrais
e Descentralizadas da Embrapa agradecemos por sua colaborao. Por fim, agradecemos a todos
os nossos parceiros e clientes que nos desafiam continuamente a desenvolver solues de TIC
que suportem o tratamento dos dados, da informao e do conhecimento referentes s pesquisas
da agricultura brasileira.
Apresentao
A Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria (Embrapa) participa do Programa Cooperativo
para el Desarrollo Tecnolgico Agroalimentario y Agroindustrial del Cono Sur (Procisur) que se
constitui em uma iniciativa conjunta dos Institutos Nacionais de Pesquisa Agrcola do Cone Sul,
visando promover sua cooperao, junto com outros atores globais envolvidos em cincia, tecnologia e inovao, para ajudar a melhorar a produtividade, a competitividade e a sustentabilidade
dos recursos naturais, segurana alimentar, desenvolvimento territorial rural e equidade social da
agricultura regional. Os pases representados no Procisur so: Argentina, Bolvia, Brasil, Chile,
Paraguai e Uruguai.
O Procisur se organiza em Plataformas Regionais, com o objetivo de articular e integrar os diferentes atores pblicos e privados, de um setor especfico, em empreendimentos cooperativos
para promover o desenvolvimento tecnolgico e a inovao em uma rea de interesse comum.
A Embrapa Informtica Agropecuria coordena o grupo de Tecnologia da Informao aplicada
agricultura no escopo da Plataforma Regional de Uso das Tecnologias Emergentes.
Visando promover o intercmbio de conhecimento e estabelecer a participao das novas
tecnologias sobre a competitividade e a sustentabilidade da agricultura regional, a Embrapa
Informtica Agropecuria tomou a iniciativa de organizar a elaborao deste livro que trata
do uso das tecnologias da informao e comunicao e suas relaes com a agricultura. Este
o fruto de um trabalho conjunto com o Instituto Nacional de Tecnologa Agropecuaria (Inta
Argentina), Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuaria (Inia Chile), o Instituto Nacional
de Investigacin Agropecuaria (Inia Uruguay) e o Instituto Interamericano de Cooperao para
Agricultura (IICA-Procisur).
O leitor ter a oportunidade de acompanhar os principais resultados nas reas de biologia computacional e bioinformtica, automao e agricultura de preciso, gesto da informao e do conhecimento, modelagem e simulao, processamento de alto desempenho, mercado, transferncia
de tecnologia e perspectivas futuras das TIC sob a tica de seu uso, para aplicao em temas
como recursos naturais, mudanas climticas, segurana fitossanitria e solues envolvendo
dados espaciais. A expectativa inicial difundir a situao atual do uso das TIC na agricultura
dos pases do cone sul. Alm disto, o ponto de partida para o estabelecimento de uma base para
futuras discusses, que permitam o intercmbio de experincias, o fortalecimento de parcerias e
a promoo do desenvolvimento sustentvel das cadeias produtivas agrcolas do cone sul. Como
resultado, espera-se o estabelecimento de incentivos que possibilitem que as TIC exeram cada
vez mais seu papel de impulsionar o crescimento do setor agrcola e a melhoria das condies
sociais, ambientais e econmicas do meio rural.
Maurcio Antnio Lopes
Diretor-Presidente
da Embrapa
Prefcio
Este livro o resultado de um esforo que vem sendo realizado pelo grupo de Tecnologia da
Informao aplicada Agricultura no mbito da Plataforma de Tecnologias Emergentes do
Programa Cooperativo para el Desarrollo Tecnolgico Agroalimentario y Agroindustrial del
Cono Sur (Procisur). Na ltima reunio deste grupo do Procisur, ocorrida em julho de 2013,
em Montevido/Uruguay, a Embrapa Informtica Agropecuria juntamente com os representantes do Instituto Nacional de Tecnologa Agropecuaria (Inta Argentina), Instituto Nacional
de Investigaciones Agropecuaria (Inia Chile), Instituto Nacional de Investigacin Agropecuaria
(Inia Uruguay), Instituto Paraguayo de Tecnologia Agraria (IPTA Paraguay) e Instituto
Interamerciano de Cooperao para Agricultura (IICA-Procisur) identificaram a oportunidade de
relatar e consolidar em um documento o que vem sendo discutido com as instituies participantes sobre os desafios e oportunidades de desenvolvimento do tema Tecnologias de Informaao e
Comunicao (TIC) na rea de pesquisa agropecuria.
Globalmente, as TIC esto sendo consideradas como o terceiro pilar da pesquisa cientfica, junto
com a teoria e a experimentao. Avanos em TIC tm um carter estratgico e poltico em todas
as cadeias produtivas da economia, incluindo a agricultura.
Os novos desafios da agricultura onde necessrio maior produtividade e eficincia, por meio da
otimizao do uso dos recursos naturais e ambientais, demandam cada vez mais a necessidade do
uso de diferentes tecnologias de informao. A integrao das TIC permite desenvolver solues
para a mecanizao, a fitossanidade, o bem-estar animal, a rastreabilidade e segurana alimentar,
o desenvolvimento de biocombustveis, a agricultura de preciso, o gerenciamento de risco agrcola, a avaliao de impacto e mitigao das mudanas climticas e a reproduo e biotecnologia.
Novos desenvolvimentos como a simulao, a modelagem, a gesto do conhecimento (ontologia,
web semntica), os sistemas especialistas, a inteligncia artificial, as redes sem fio, a mobilidade, o
processamento de imagem em conjunto com padres abertos para facilitar a troca de informaes,
permitem o progresso cada vez mais rpido em pesquisa e inovao, oferecendo solues em benefcio da agricultura.
A sociedade industrial encontra-se em transio para uma sociedade baseada na informao.
Neste conceito, as TIC so um conjunto de ferramentas que oferece um grande potencial para a
disseminao e a transferncia de tecnologia. Os novos canais e as formas de comunicao de
massa esto comeando uma nova era da revoluo da informao. essencial que os pases
latino-americanos priorizem o desenvolvimento em cincia e tecnologia, inovao e particularmente em infraestrutura e recursos humanos capacitados na rea das TIC.
Neste livro apresentado como os pases do Procisur esto contornando as questes que envolvem os sistemas produtivos agrcolas por meio do uso das TIC. Em particular, com relao ao
Brasil, apresentado um mapeamento do que est sendo desenvolvido na rea de TIC, nos ltimos cinco anos, considerando os projetos de pesquisa que a Embrapa Informtica Agropecuria
vem desenvolvendo em parceria com os 46 Unidades de Pesquisa da Embrapa. Seu objetivo
proporcionar subsdios para se fazer uma reflexo das principais perspectivas tecnolgicas das
TIC para os prximos anos, junto com os demais pases participantes do Procisur.
Com este propsito, o livro foi dividido em sete partes, onde descrita a situao atual das TIC
em diversos temas. Na parte I, apresentada uma viso geral de possibilidades de inovao
tecnolgica a partir das ferramentas de TIC e de suas aplicaes (AgroTIC) na agricultura bem
como o mapeamento da insero de TIC no meio rural.
A Parte II tem um foco mais voltado para o papel das TIC na Biotecnologia distribudos em quatro
captulos sobre genmica, bioinformtica, biologia computacional e o papel da viso computacional na fenotipagem de plantas.
Na parte III apresentado o papel das TIC no escopo dos recursos naturais e mudanas climticas. Aqui, os captulos abordam desde a questo de TIC na agrometeorologia, zoneamento de
risco climtico, mudanas climticas bem como aplicaes que envolvem dados geoespaciais.
Na parte IV apresentado o papel das TIC no mbito das cadeias produtivas. O primeiro captulo
aborda o uso de TIC na segurana fitossanitria. Os demais captulos abordam o tema de automao e agricultura de preciso. Nestes captulos, contou-se com a experincia e expertise dos
pesquisadores da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA-USP), da Escola de
Engenharia de So Carlos (EESC-USP) e da Embrapa Instrumentao.
Na Parte V, o objetivo discutir sobre algumas ferramentas de TIC e o desenvolvimento tecnolgico na rea de TIC para construo de aplicaes na agricultura (AgroTIC). Com este objetivo,
essa parte foi dividida em cinco captulos que descrevem desde a infraestrutura para armazenamento e processamento de alto desempenho e de grande volume de dados, passando pela gesto
de dados, informao e conhecimento e culminando em uma discusso sobre modelagem e
simulao e minerao de dados.
Na parte VI, abordada a questo de gerao de tecnologias, aplicaes AgroTIC, bem como sua
transferncia. Primeiramente, so descritas as aplicaes de AgroTIC e seus mercados, e tambm alguns estudos de casos de modelos de transferncia de tecnologia para produtos AgroTIC.
Finalmente, algumas tecnologias emergentes assim como o futuro e as perspectivas de evoluo
tecnolgica de AgroTIC so apresentadas.
A parte VII, refere-se s experincias que vm sendo desenvolvidas, nas reas citadas nos captulos anteriores, em outros pases participantes do Procisur como Chile, Argentina, e Uruguai.
Sumrio
Parte I
.........................................................................
21
23
39
Parte II
53
55
67
85
Parte III
.................................. 119
Parte IV
.................................................. 157
Parte V
233
Parte VI
.............................. 303
Parte VII
351
Parte
Captulo
23
Os novos desaos e
oportunidades das
tecnologias da informao e da
comunicao na agricultura (AgroTIC)
1 Introduo
Nos dias atuais, a humanidade est passando por um momento de transformao em que se vive
em uma grande dicotomia. Por um lado, as pessoas vivem em tempos extraordinrios de grande
prosperidade, vida longa saudvel, tecnologias disponveis associadas ao acesso informao
e ao conhecimento e crescimento do nvel de educao. Por outro lado, deparam-se com vrios
riscos ao planeta, nveis altos de pobreza, enfermidades e necessidade de melhoria da qualidade
da educao.
Este mundo contemporneo e globalizado remete todos a uma busca por uma economia mais
sustentvel e mais justa, em que a bioeconomia ganha fora e visibilidade porque a sustentabilidade entrou definitivamente como uma das prioridades da sociedade. No escopo deste trabalho,
a bioeconomia considerada um ramo da atividade humana que promete reunir todos os setores
da economia que utilizam recursos biolgicos (seres vivos) para oferecer solues coerentes, eficazes e concretas para grandes desafios - como as mudanas climticas, substituio de insumos
de origem fssil, segurana alimentar e sade da populao (EMBRAPA, 2014).
Neste contexto, em que o foco a sade, a qualidade de vida e o bem-estar, cada vez mais os
avanos em tecnologia de informao tero um carter estratgico e poltico para o Brasil e
para o mundo. No relatrio elaborado pela National Science Foundation dos Estados Unidos
da Amrica, Converging Technologies for Improving Human Performance Nanotechnology,
Biotechnology, Information Technology and Cognitive Science, foi apontada a sinergia entre a
nanotecnologia, a tecnologia da informao, a biotecnologia e a cincia cognitiva como o maior
potencial de futuro para a humanidade nos prximos 20 anos (ROCO; BAINBRIDGE, 2002).
As tecnologias da informao e da comunicao (TIC) tm contribudo, h vrias dcadas, de
forma impactante, para as diversas reas de conhecimento, permitindo o armazenamento e processamento de grandes volumes de dados, automatizao de processos e o intercmbio de informaes e de conhecimento. Seu grande potencial reside na sua transversalidade podendo agregar
valor e benefcio para as diversas reas de negcios, mercado, agricultura e meio ambiente.
Algumas das inovaes mais recentes em TIC prometem alavancar as pesquisas na agricultura
gerando novas AgroTIC. Neste trabalho, AgroTIC definido como um conjunto de aplicaes
especficas para agricultura que utilizam ferramentas baseadas em TIC, tais como sistemas de in-
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Outro grande desafio da agricultura a grande disperso geoespacial. Vrios pontos em uma
cadeia de suprimentos agrcolas esto muito dispersos e o sistema agrcola global pode ser
dividido em subprocessos interligados nas trs principais etapas de uma cadeia produtiva, a
saber: pr-produo, produo e ps-produo (Figura 1). Um desafio relacionado disperso
geoespacial refere-se ao tratamento de algumas matrias-primas, como a pecuria e culturas
perecveis. Assim, na etapa de ps-produo, a logstica e as longas distncias, entre os pontos
de processamento da cadeia de abastecimento, podem apresentar riscos para a viabilidade global
de todo o processo.
Outras questes esto relacionadas com os requisitos de segurana alimentar e alimentos seguros
que so fundamentais para os sistemas agrcolas em duas escalas de tempo separadas. Em uma
escala de tempo curto de dias ou semanas, a segurana dos alimentos crtica porque muitos
produtos so eventualmente ingeridos por seres humanos. Proteger a sade humana requer um
processo de gesto da cadeia de oferta de produtos agrcolas a uma escala global. Em uma escala
de anos ou dcadas de tempo mais longo, a sustentabilidade do ambiente natural fundamental
para a sade de longo prazo da sociedade. Melhorias agrcolas, como pesticidas ou fertilizantes,
devem ser usadas de modo a aumentar a produtividade sem afetar negativamente a qualidade de
vida global. Da mesma forma, os recursos, como a terra e a gua, devem ser utilizados de uma
forma que possam ser mantidos indefinidamente.
Todos esses desafios devem ser atendidos dentro das limitaes inerentes ao processo agrcola.
Por exemplo, a quantidade de terra arvel relativamente fixa no mundo, especialmente nos
pases mais desenvolvidos. O tempo tambm impe uma restrio, particularmente em sistemas
sensveis a prazo, como gado e produtos perecveis. H uma janela de tempo finito durante o qual
estes produtos agrcolas so viveis durante o processamento. Adicionalmente, estes desafios
devem ser atendidos dentro dos limites de viabilidade econmica (ou seja, custo).
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Diante destes grandes desafios da agricultura, surgem novas oportunidades para a utilizao de
inovaes na rea de tecnologias da informao e comunicao (AgroTIC) em todas as etapas da
cadeia produtiva. Conforme apresentado na Figura 1, na pr-produo tem-se a oportunidade de
utilizar tcnicas de modelagem e simulao, minerao de dados e computao de alto desempenho para, por exemplo, tratar o grande volume de dados moleculares gerados no melhoramento
gentico com apoio da Biotecnologia e da Bioinformtica. Na etapa de produo, pode-se destacar as tcnicas de sensoriamento remoto, SIG para automao das etapas de plantao e colheita,
avanando para uma agricultura de preciso e robtica. Finalmente, em relao ps-produo,
as TIC j esto amplamente utilizadas nas etapas de distribuio, processamento e consumo,
conforme apresentados na Figura 1 (computao em nuvem para armazenar grandes volumes de
dados, anlises de dados para orientao de mercado e logstica, alm de dispositivos mveis e
tecnologias sociais para monitorar o mercado).
Na prxima seo, o papel das TIC e suas aplicaes na pesquisa agropecuria so apresentados.
Na seo 3 apresentado o mapeamento de tendncias das publicaes em TI na agricultura, bem
como o centro de pesquisa da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria (Embrapa) que tem
como misso viabilizar solues de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovao (PD&I) em TI para
a agricultura. A seo 4 trata das perspectivas de TI na agricultura. Finalmente, na seo 5, so
apresentadas as consideraes finais deste captulo.
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projetos no mbito do monitoramento de fronteira agrcola e dos biomas; uso de ferramentas inteligentes na gesto de recursos hdricos, no diagnstico de doenas e no licenciamento ambiental;
sistemas de suporte deciso para anlise de impactos ambientais; sistemas de modelagem e
simulao de cenrios agrcolas futuros frente s mudanas climticas; modelagem e simulao
de sistemas de produo agrcola; e sistemas de rastreabilidade para produtos de origem animal
e vegetal, entre outros.
Avanos na rea de modelagem e simulao de crescimento de plantas so outro grande desafio
na pesquisa agropecuria. Aplicaes como anlise funcional-estrutural de plantas, desenvolvimento de modelos de crescimento de plantas, anlise de fentipos para genmica animal e
vegetal e realidade aumentada para instrumentao e controle envolvem a construo automtica
de modelos tridimensionais a partir de imagens digitais, de modo que possam ser produzidas e
utilizadas em larga escala.
A construo automtica de modelos tridimensionais para objetos simples, provenientes de atividades humanas, tais como prdios e mveis, recebeu muita ateno da comunidade de viso
computacional nos anos 1990. Entretanto, a construo de modelos tridimensionais (3D) de
plantas a partir de imagens digitais muito mais complexa, dadas as estruturas orgnicas das
plantas e as condies de ambiente externo que influenciam seu crescimento, tais como luz e
sombra. Trabalhos de pesquisa nessa rea envolvem estudos e investigaes na rea de computao grfica, processamento de imagens e reconhecimento de padres. Algoritmos desenvolvidos
no mbito desta linha de trabalho visam auxiliar as pesquisas em botnica, ambiente, genmica
e protemica. Em um horizonte mais longo, outros campos que se beneficiariam dos resultados
seriam sistemas de realidade aumentada aplicada instrumentao em agricultura e o uso de
robs em agricultura de preciso.
Conforme apresentado acima, diante dessas consideraes, possvel ver que o cenrio cientfico
atual passa por um processo de mudana de paradigma, no qual cada vez mais comum projetos
de pesquisa utilizarem tecnologias capazes de adquirir e/ou gerar terabytes/petabytes de dados
de alta qualidade e a um custo razoavelmente baixo. Alm disso, esses grandes volumes de dados exigem a utilizao de equipamentos de alto poder computacional para serem analisados de
forma integrada, visando obter o mximo de informao e conhecimento.
Para fazer frente a esse novo cenrio, a Embrapa Informtica Agropecuria aprovou o arranjo denominado Armazenamento e Processamento de Dados Experimentais da Embrapa DataExp,
que tem por objetivo estruturar e organizar uma infraestrutura computacional de hardware e
software para suporte a projetos de pesquisa da Empresa, que estejam enfrentando a questo de
armazenamento, processamento e anlise integrada de grandes volumes de dados. Por meio deste
arranjo ser criado um centro de dados da pesquisa agropecuria brasileira. Para tanto est sendo
construdo um novo laboratrio que ir abrigar a infraestrutura computacional a ser adquirida
para a sua instalao.
A Embrapa Informtica Agropecuria tambm vem participando de outra proposta de arranjo, denominado Mtodos Quantitativos Avanados e Computao Cientfica na Pesquisa
Agropecuria - AgroMQCC, envolvendo 23 centros de pesquisa da Embrapa. O foco deste
arranjo est no desenvolvimento e aplicao de modelos e mtodos quantitativos e de computao cientfica para anlise de dados da agropecuria em estudos prospectivos e descritivos. O
arranjo AgroMQCC poder atuar junto ao arranjo DataExp para disponibilizar e validar mtodos,
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tcnicas, modelos e recursos de software e, ainda, fazer uso dos dados que sero armazenados
no DataExp.
Como resultado final desses dez ltimos anos, foram observadas 147 reas de aplicaes e 49
diferentes modelos computacionais. Os principais resultados obtidos podem ser observados nas
Figuras a seguir, considerando-se os grupos:
Para auxiliar a prospeco das atuais contribuies e tendncias futuras de vrios grupos de
interesse que se ocupam da aplicao da TI na pesquisa agropecuria, a Embrapa Informtica
Agropecuria vem realizando um estudo de avaliao das publicaes cientficas brasileiras e
internacionais nessa rea. Considerando as duas vertentes de atuao: computao e agricultura,
tem-se considerado representativa a comparao entre as publicaes dos congressos internacionais de agroinformtica, tais como o European Federation for Information Technologies
in Agriculture, Food and the Environment (Efita), os congressos da American Society of
Agricultural and Biological Engineers (Asabe) e os congressos da Associao Brasileira de
Agroinformtica (SBIAgro). Soma-se a essa comparao a produo cientfica da Embrapa
Informtica Agropecuria, para que se tenha um retrato da sua atuao frente aos tpicos
cobertos por esses congressos. Em Massruh et al. (2011) foi apresentada uma anlise dessa
comparao entre 1997 a 2009. Como as publicaes dos Congressos da Asabe no esto publicamente disponveis em formato digital, para se ter uma comparao estatisticamente mais
justa, tem-se considerado apenas as publicaes dos demais congressos a partir de 2003, que
quando o congresso da SBIAgro passou a disponibilizar publicamente seus anais em formato digital. Acredita-se que este fato no prejudica uma anlise global porque Efita, SBIAgro e Asabe
participam da rede Internacional Network for Information Technology (Infita) e, desta forma, os
avanos norte-americanos esto tambm contemplados nos anais do Efita.
Desta forma, nas ltimas anlises conduzidas, tem-se os resultados dos ltimos dez anos (2003
a 2013), considerando os anais do Efita, do SBIAgro e da produo cientfica da Embrapa
Informtica Agropecuria. Nessas anlises, tem-se utilizado dicionrios de vocabulrio controlado para solucionar o problema de diferenas entre tpicos e subtpicos entre os anais dos
congressos, bem como a publicao tcnico-cientfica da Embrapa. Para encontrar esses tpicos e subtpicos comuns a todos, utilizou-se os vocbulos do Thesagro, tesauro do Ministrio
da Agricultura, Pecuria e Abastecimento (Mapa) e do Agrovoc da Food and Agriculture
Organization of the United Nations (FAO), para cobrir os termos da rea agrcola, consideradas
como reas de aplicao. Na rea de modelos computacionais presentes nas publicaes, optou-se por utilizar a taxonomia da Association for Computing Machinery (ACM) e uma traduo
elaborada pela Embrapa Informtica Agropecuria.
Para identificao de uma taxonomia de classes de modelos e aplicao foram utilizados mtodos
e tcnicas de minerao de textos, de acordo com a metodologia TopTax (MOURA, 2009), na
qual a informao automaticamente extrada das publicaes e comparada aos vocbulos dos
diversos tesauros agrupada, descrita e, posteriormente, avaliada por um especialista do domnio
de conhecimento, em um processo retroalimentativo. Desta forma, a categorizao de assuntos,
aqui apresentada, resultado de um processo semiautomtico, no qual o julgamento semntico
subjetivo realizado por especialistas em agroinformtica.
Ttulo do Grfico
0
Mdia
SBIAgro
Efita
10
Ttulo do Grfico
SBIAgro
1
Efita
Figura 3. Principais modelos computacionais utilizados nas publicaes entre 2003 e 2013.
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de; alm dos temas transversais: mercado, polticas e desenvolvimento rural; agricultura familiar,
produo orgnica e agroecolgica; inovaes gerenciais nas cadeias produtivas agropecurias;
comunicao e a busca de um novo olhar sobre a agricultura.
No contexto do Sistema Agropensa, a Embrapa Informtica Agropecuria, que tem como misso
viabilizar solues de pesquisa, desenvolvimento e inovao em tecnologia da informao para
agricultura, est fazendo uma reflexo do que est sendo gerado nesta rea e das principais tendncias nos prximos 20 anos.
Nesta reflexo importante pensar sobre o papel da Embrapa Informtica Agropecuria
no apenas no Brasil, mas tambm na Amrica do Sul e no mundo. A Embrapa participa do
Programa Cooperativo para o Desenvolvimento Tecnolgico Agroalimentar e Agroindustrial
do Cone Sul (Procisur)5 com o Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuria (Inta, Argentina),
Instituto Nacional de Investigcion Agropecuria (Inia, Chile e Uruguay), Instituto Paraguaio de
Tecnologia Agrria (IPTA, Paraguai) e Instituto Interamericano de Cooperao para Agricultura
(IICA). A Embrapa Informtica Agropecuria participa do grupo de tecnologia da informao
aplicada agricultura, no mbito da Plataforma de Tecnologias Emergentes do Procisur, e vem
discutindo com as instituies participantes sobre os desafios e oportunidades de desenvolvimento deste tema na rea de pesquisa agropecuria dos pases envolvidos na plataforma.
Nos ltimos anos, na era da globalizao e da comunicao, uma rpida transformao tem
acontecido na rea de TIC e uma terceira plataforma define uma nova TI. Enquanto a primeira
plataforma era baseada no mainframe para atender milhes de usurios e a segunda plataforma
era baseada na internet e em redes locais, numa arquitetura cliente/servidor para atender a centenas de milhes de usurios, a terceira plataforma motivada por quatro importantes tendncias
para atender a bilhes de usurios: computao em nuvem, mobilidade, big data/anlise preditiva
e plataformas sociais.
A tecnologia de big data inclui o processamento de alto desempenho e armazenamento distribudo. Em funo desta tecnologia possvel armazenar e processar imensos volumes de dados
resultantes, por exemplo, das varreduras de satlites, produzindo mapas de alta resoluo e alta
frequncia de imageamento, em que podem ser analisados dados de recursos naturais, uso da
terra e mudanas climticas no ambiente.
Uma vez que se tenham armazenadas as caractersticas dos solos, dos recursos hdricos, dos microclimas, dos ecossistemas, dos organismos, e seus genomas e proteomas, pode-se entender os
processos globais que envolvem a natureza e a agricultura e suas influncias na biosfera, incluindo os efeitos antrpicos. Atravs do uso de tcnicas de inteligncia artificial, modelagem e simulao e otimizao de sistemas complexos, ser possvel agregar o conhecimento de todos os elos
das cadeias produtivas para permitir entender o seu comportamento mediante a modelagem das
variveis biofsicas, econmicas, sociais e ambientais envolvidas em sua logstica. Aplicaes
nesta rea vo desde a simulao de crescimento de plantas, simulao de experimentos, predio
da produo at o armazenamento e a distribuio otimizada dos produtos e a logstica reversa
envolvendo o monitoramento e o descarte controlado de resduos.
Atualmente, fala-se em Internet das Coisas (Internet of Things) (LEE et al., 2013) considerando
o aumento da oferta de dispositivos conectados internet podendo ser tanto mveis como fixos,
5
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34
importantes na rea de bioinformtica. Por exemplo, o jogo chamado Dizeez visa solucionar
questes relacionadas prospeco de dados genmicos e da estrutura das protenas, conforme
publicado pela Communications of ACM, de maio de 2014.
No mbito das cadeias produtivas do agronegcio, o conhecimento nas suas diversas etapas, aliado nanotecnologia, robtica e agricultura e pecuria de preciso representadas por nanosensores, nanorobs, veculos areos no tripulados (vant) e mquinas agrcolas, tornar possvel o
desenvolvimento de aplicaes inteligentes capazes de capturar dados dos nanosensores e vant e
criar aplicaes de mapeamento sofisticadas para a tomada de deciso. Estas aplicaes podero
ser adaptadas s mquinas agrcolas, vant e aos nanorobs, para que atuem de acordo com a necessidade da cultura e em funo do entendimento das suas necessidades, em aes de irrigao,
aplicao de fertilizantes e pesticidas e realizao de colheita de forma inteligente.
Dada a complexidade e heterogeneidade das tecnologias emergentes como as TIC, a nanotecnologia, a biotecnologia, a robtica e a agricultura de preciso, e suas aplicaes na agroindstria,
natural que ainda no se tenha uma perspectiva sistemtica, integrada e interdisciplinar entre
elas, como apontado no relatrio NBIC (ROCO; BAINBRIDGE, 2002).
Em um exemplo mais direto apontado pelo relatrio NBIC (ROCO; BAINBRIDGE, 2002), a
agricultura poderia aumentar grandemente sua produtividade e reduzir o desperdcio com o uso
de redes de sensores baratos que monitorariam constantemente as condies e necessidades das
plantas, animais e insumos de uma fazenda. O relatrio vai alm, apontando que os desenvolvimentos recentes em abordagens sistmicas, matemtica e computao permitiro, pela primeira
vez, entender o mundo natural, a sociedade humana e a pesquisa cientfica como sistemas complexos, hierrquicos e fortemente acoplados. Esto previstos impactos na eficincia do trabalho
e aprendizado, melhoria da capacidade cognitiva e sensorial individual, mudanas drsticas na
medicina, melhora na criatividade individual e coletiva, formas de comunicao altamente eficientes, incluindo comunicao crebro-crebro e interface homem-mquina, entre outros.
Em artigos apresentados em fevereiro de 2008 na edio Especial Robtica da Scientific
American Brasil, especialistas afirmam que por volta de 2025 existiro computadores custando
US$ 1 mil com poder de processamento de 100 milhes de instrues por segundo (mip), o
equivalente a um crebro humano, capazes de imitar o raciocnio humano para diversas aplicaes prticas. Os mais otimistas afirmam que, em 2055, o computador pessoal ter o poder de
processamento de todos os crebros humanos juntos.
Tambm na Europa e no Japo, h um crescente interesse na utilizao da computao em modelagem e simulao. Dentro do Programa Quadro 7 (UNIO EUROPIA, 2006), financiado
pela Comunidade Europeia, no mbito do tema tecnologias da informao e comunicao,
existem projetos destinados ao progresso conjunto das TIC e cincias biolgicas e de estudo
do funcionamento do crebro. No projeto Sistemas Computacionais Auto-Construdos (Selfconstructed Computing Systems - SECO Project), a partir de partes mais simples, cujo comportamento se pode determinar, busca-se explicar o surgimento de funes mais complexas;
por exemplo, como a mente surge a partir de alguns poucos tipos de neurnios inibidores e
excitadores interconectados existentes no neocrtex. A ltima fronteira - construo de um rob
humanide pensante - est ainda distante. Entretanto, importantes passos j foram dados: os
robs humanides japoneses j apresentam um alto grau de avano, mas ainda no apresentam
conscincia.
35
36
O Programa Quadro 7 (UNIO EUROPIA, 2006) estabeleceu tambm como desafio a construo de bibliotecas digitais e de sistemas gestores de conhecimento que incorporem algum
grau de inteligncia e tratamento semntico. A Web Semntica tem sido usada com sucesso nas
reas mdica e farmacutica: a indstria Eli Lilly a tem usado para organizar dados heterogneos
de diferentes fontes, tais como registros de pacientes, estruturas qumicas, sequncias de cido
desoxirribonucleico (DNA), imagens, processos biolgicos e artigos cientficos, com o objetivo
de priorizar alvos biolgicos para descoberta de novas drogas.
O documento Vises para o Futuro da Nanotecnologia (SCHMIDT, 2007), organizado pela
National Science Foundation e National Institute of Health dos Estados Unidos, apontou o papel
crucial da TI tanto na organizao da informao de uma biblioteca sobre o mundo nanomtrico
(Nano Library), quanto no tratamento da informao gerada por nanosensores. A manipulao
da matria no nvel de tomos e molculas, realizada em escala nanomtrica, est beneficiando
a chamada biologia sinttica: o projeto e construo de novas partes, dispositivos e sistemas que
no existem no mundo natural, bem como o reprojeto dos sistemas biolgicos existentes para
executar tarefas especficas.
Em um artigo elaborado pelo ETC Group para o governo canadense (EXTREME GENETIC
ENGINEERING, 2009), comenta-se que no existe barreira tcnica sntese de plantas e animais
e que isto ocorrer logo que algum se disponha a financiar tais projetos. Neste mesmo artigo,
um pesquisador do Massachussets Institute of Technology (MIT) prev que os engenheiros biolgicos do futuro comearo o trabalho em seus laptops, no nos laboratrios.
Para contemplar estes desafios em escalas antes inimaginveis, um conjunto de ferramentas e
tecnologias se tornam necessrias. A sntese da tecnologia da informao e cincia para lidar
com grandes volumes de dados de forma colaborativa e multidisciplinar o que est se denominando e-science (BELL et al., 2009). Outra nova rea de estudo a Data Science, que se refere
ao estudo sistemtico, a partir de conhecimento extrado de grandes volumes de dados, para
gerar explicaes e predies nas vrias reas do conhecimento, conforme artigo publicado na
revista Communications of the ACM (Association of Computer Machinery) de dezembro de
2013.
As principais empresas de tecnologia como a Google e a Microsoft vm concentrando seus
esforos na rea de deep-learning, um campo relativamente novo de pesquisa em inteligncia
artificial baseado no estudo de redes neurais voltado criao de produtos que podem entender e
aprender a partir de imagens, textos e vdeos. Atividades como o reconhecimento facial em vdeo
ou palavras na fala humana, com traduo de voz em tempo real, so alguns dos resultados j
alcanados nesta rea, conforme descrito em artigo publicado em Communications of the ACM
(Association of Computer Machinery), em outubro de 2013.
Mirando todos estes novos desafios e para manter sua competitividade no cenrio internacional
e conquistar novos mercados, os pases-membros do Procisur devero aumentar a eficincia de
seus sistemas produtivos em termos de uso de insumos agrcolas, incluindo o provimento de
alternativas orgnicas, biolgicas ou naturais, alm do uso otimizado de gua e energia. A essas
restries somam-se questes como a necessidade de preservao dos biomas, os mecanismos
de sequestro de carbono, certificao de qualidade dos produtos e rastreabilidade dos alimentos,
garantia de bem-estar animal, equilbrio social, as mudanas climticas e a intensificao da agricultura na matriz energtica mundial por meio dos biocombustveis. Por ser uma rea transversal,
5 Consideraes nais
No mbito do Procisur, a Embrapa Informtica Agropecuria representa a Embrapa no grupo
de tecnologia da informao aplicada agricultura, da Plataforma de Tecnologias Emergentes.
Neste captulo, tendo como perspectiva os novos cenrios agrcolas e o desenvolvimento rural
sustentvel, foi apresentada uma viso geral de como as TIC tm contribudo para as diversas
reas de conhecimento, focando especialmente em suas aplicaes na agropecuria.
Tambm foi mostrada uma anlise das tendncias de publicaes dos principais congressos de
TI na agricultura, considerando os congressos do Efita, da Asabe e da SBIAgro, comparando
com a produo cientfica da Embrapa Informtica Agropecuria, para construir um retrato da
atuao desta frente aos tpicos cobertos por esses congressos. Ainda no que se refere Embrapa
Informtica Agropecuria, outro ponto de destaque foi o mapeamento da sua atuao na rea de
TIC, nos ltimos cinco anos, tendo como base os projetos de pesquisa por ela liderados e executados em parceria com os demais 46 centros de pesquisa da Embrapa. Com relao Embrapa, foi
descrito seu sistema de gesto da pesquisa, por meio das figuras programticas, e de iniciativas
corporativas como os laboratrios multiusurios e unidades mistas de pesquisas, bem como seu
Sistema de Inteligncia Estratgica Agropensa.
No mbito da Plataforma de Tecnologias Emergentes, as instituies participantes vm discutindo sobre os desafios e oportunidades de desenvolvimento das TIC na rea de pesquisa
agropecuria. Tecnologias como big data, anlise preditiva e plataformas sociais, a mobilidade
e a computao em nuvem so alguns dos pilares para inovao nas empresas, alm de modelos
computacionais como tcnicas de geoprocessamento, modelos de inteligncia artificial, software
para anlise de dados, anlise estatstica de dados, modelos de simulao, integrao de base de
dados e servios web que permitem aos cientistas construir e simular modelos de fenmenos
complexos na agricultura.
Neste livro esto sendo abordadas as perspectivas de TIC para incorporao destas tecnologias
avanadas no agronegcio, em reas como biotecnologia, recursos naturais e mudanas climticas, automao e agricultura de preciso, assim como uma viso de transferncia destas tecnologias. Desta forma, nos captulos que se seguem, espera-se provocar uma reflexo dos principais
desafios e oportunidades do uso das TIC na pesquisa agropecuria, em todos os elos da cadeia
produtiva e sua insero no meio rural visando gerao de inovao na agricultura nos pases
do cone Sul.
37
38
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Captulo
39
Uso de computador e
Internet nos estabelecimentos
agropecurios brasileiros
1 Introduo
As tecnologias da informao e comunicao (TIC) so responsveis coadjuvantes pelas profundas transformaes nos modelos de produo e acumulao at ento vigentes e configuram o
surgimento da denominada Sociedade da Informao (IBGE, 2009)1.
Os impactos revolucionrios das TIC sobre a sociedade contempornea so por demais visveis
e j assimilados no cotidiano das famlias e das instituies. No entanto, no to visvel quando se trata da agropecuria, ainda que isto no signifique que no seja importante. Ao contrrio,
a aplicao das TIC na agropecuria uma realidade, como na agricultura de preciso, nas
mquinas que interagem com sinais de satlites, em sistemas de monitoramento das condies
de solo.
O uso de TIC na agropecuria pode trazer como benefcios agrcolas e econmicos a melhoria da
gesto da produo e da propriedade rural, a disseminao de importantes informaes do setor,
melhoria no planejamento, monitoramento e acompanhamento de produo integrada e o acesso
aos mais recentes resultados de pesquisa na rea (GELB; VOET, 2009).
Goyal e Gonzles-Velosa (2012) complementam o rol de benefcios esperados com o uso de TIC
no espao rural indicando o papel que podem ter na:
1) Reduo dos custos de comunicao entre os agentes (como os relacionados ao uso de celulares e ferramentas de internet).
2) Reduo dos custos de acesso a servios (como seguro e crdito) e informao (de mercado
ou tecnolgica).
3) Reduo dos riscos relacionados a eventos climticos, pragas e desastres naturais, viabilizados
por sistemas de monitoramento e de informao acessveis.
4) Ampliao de renda, qualidade e atendimento s demandas dos consumidores de produtos
agrcolas.
O intercmbio entre agricultura e TIC fez surgir uma rea denominada agroinformtica, que estuda as aplicaes de
TIC para o ambiente rural, em nveis mundial e nacional. Para informaes sobre o surgimento e evoluo da agroinformtica no Brasil, ver Zambalde et al. (2011).
40
A despeito dos benefcios esperados com o uso de TIC como um dos elementos motrizes da
agricultura, o produtor rural brasileiro ainda tem acesso restrito e usa pouco tais tecnologias em
seu empreendimento agrcola.
O ltimo Censo Agropecurio brasileiro inseriu na categoria de eletrodomsticos utilizados na
propriedade rural o acesso a computador e internet. Embora se admita que alguns dados referentes a uso de computador e internet, relativos a 2006, estejam ultrapassados - dada a rapidez
na propagao desses instrumentos -, considera-se que questes de fundo subsistem, e ainda
so responsveis pela desigualdade no acesso tecnologia da informao ao longo do territrio
nacional. Entre as questes, podem ser mencionadas as atinentes ao nvel de instruo dos produtores, a condio do produtor em relao s terras, o grau de dinamismo das diferentes atividades
econmicas, entre outras variveis.
H imperativa necessidade de se conhecer e entender estes dados - tanto por instituies pblicas
e privadas de pesquisa, extenso, ensino e fomento que atuam com TIC rural, como por usurios
atuais e potenciais - para que se tenha uma noo do caminho j percorrido na busca de tentar
prover as condies necessrias para acesso a computador e a internet na rea rural, e estimar a
distncia que falta para alcance desta meta.
Este captulo analisa os dados de acesso ao computador e internet pelos agricultores brasileiros,
segundo o Censo Agropecurio 2006, em relao ao nvel de instruo, condio do produtor,
direo do estabelecimento, grupos de atividade econmica e distribuio por regio. O captulo
estrutura-se em quatro sees, incluindo esta introduo. Para contextualizar a relevncia do
tema na esfera internacional, a prxima seo relata alguns estudos sobre a adoo de TIC no
campo em pases da Europa e nos Estados Unidos. Em seguida, analisam-se os dados de acesso,
pelos agricultores brasileiros, ao computador e internet em seus empreendimentos agrcolas.
Por ltimo, seguem as consideraes finais.
Debrecen
(Hungria)
2003
72.5
Villa Real
(Portugal)
2005
96.7
Glasgow
(Esccia)
2007
94.4
Wageningen
Praga
Torino
(Pases Baixos) (Repblica Checa) (Itlia)
2009
2011
2013
90.3
90.0
78.9
Tabela 2. Fatores limitantes do uso de TIC pelos agricultores (% de SIM nas respostas).
Conferncias EFITA
1999 - Bonn (Alemanha)
2001 - Montpellier (Frana)
2003 - Debrecen (Hungria)
2005 - Villa Real (Portugal)
2007 - Glasgow (Esccia)
2009 - Wageningen (Pases Baixos)
2011 - Praga (Repblica Checa)
2013 - Torino (Itlia)
Inabilidade
em usar TI
22,4
29,3
5,9
45,0
12,5
45,2
<45,0
56,1
Aspectos de
infraestrutura
18,9
0,0
19,6
35,0
28,6
23,8
0,0
21,0
Custo
17,6
32,3
39,2
23,0
42,2
29,0
<25,0
19,3
Falta de
treinamento
8,6
16,9
35,3
16,7
17,9
58,0
>65,0
54,3
(2012, 2013), as questes de infraestrutura parecem ter sido resolvidas em grande parte no contexto mais amplo de servios de comunicao, tanto regionais como nacionais para as realidades
europeia e norte-americana.
Nos Estados Unidos, no perodo de 2003 a 2013, verificou-se um crescimento no uso de computadores, que chegou a 70%, em 2013, e a 65% o acesso Internet, no mesmo ano. A utilizao
nos negcios agrcolas tambm tem aumentado ao longo deste perodo, que saltou de 30% para
40% (ESTADOS UNIDOS, 2013).
No entanto, como se ver mais adiante neste captulo, no Brasil3 a agricultura vive uma situao
bem diversa dos pases europeus e americano.
De acordo com os dados da Tabela 2, os custos representaram um baixo fator limitante. Talvez
uma tendncia futura seja supor que os custos das inovaes em TIC sero compensados por
menores custos de produo e maior eficincia de equipamentos, sistemas, comunicaes e da
capacidade das pessoas envolvidas com o desenvolvimento de solues em TIC (por exemplo,
a automao).
Os problemas para adoo de TIC no campo apresentam como fatores limitantes os listados na
Tabela 2.
As interpretaes das tendncias apresentadas na Tabela 2 so: desde 1999, o custo e os aspectos
de infraestrutura no foram observados como uma restrio/limitao dominante. Segundo Gelb
A lista e o perfil dos especialistas em agroinformtica que responderam os questionrios esto em Gelb (2012, p. 10).
So reconhecidas as enormes diferenas - social, econmica, estrutural e cultural - entre Brasil e Estados Unidos. A
apresentao dos dados norte-americanos serve para evidenciar como o Brasil est distante de proporcionar condies
bsicas de infraestrutura mnima aos agricultores brasileiros, iniciando pelo acesso internet e computador, como se
discute na seo seguinte deste captulo.
41
Para Gelb e Voet (2009), a identificao de problemas especficos de adoo em TIC pode levar
a benefcios significativos para os formuladores de polticas pblicas, instituies de pesquisa,
extenso rural e ensino que atuam com tecnologia da informao rural.
No Brasil, a adoo de TIC na agricultura ocorre a partir de duas grandes vertentes. A primeira,
denominada exgena, relaciona-se disseminao de solues de TIC de outros setores econmicos para o setor agrcola. Esta vertente divide-se em dois blocos: a disseminao da infraestrutura bsica de TIC e a posterior adoo de solues em TIC de gerenciamento empresarial. A
segunda vertente, de carter endgeno, diz respeito ao desenvolvimento de aplicaes/solues
em TIC especficas para a agricultura. Isso se deve ao esforo de empresas em desenvolver
solues de TIC e sofisticao de mquinas e equipamentos que requerem o uso de eletrnica
embarcada.
A Figura 1 ilustra estas duas grandes foras simultneas de expanso da TIC na agricultura nacional que, ao atuarem, constroem a cadeia de valor de TIC agrcola, de acordo com estudo da
Agncia Brasileira de Desenvolvimento Industrial (2012).
Desenvolvimento
de solues de TI
especficas para o
agronegcio
Modernizao de mquinas
e equipamentos agrcolas a
partir da adoo de eletrnica
embarcada
Construo da
infraestrutura bsica
para a adoo de TI
no agronegcio
Nmero de agentes
42
Vertente exgena
Vertente endgena
rm, muito diferente e reflete a indigncia digital dos produtores rurais no que tange ao acesso
a computador e internet, como retrata a seo seguinte.
Segundo a Agncia Brasileira de Desenvolvimento Industrial (2012), a expanso de infraestrutura em TIC pode configurar um vetor inicial de disseminao no espao rural. Essa disseminao
pode se tornar um catalisador da adoo inicial da agroinformtica, mesmo por parte de propriedades de pequeno e mdio porte.
Como mostra a Figura 1, a vertente endgena refere-se ao desenvolvimento de aplicaes em
TIC especficas para a agricultura, que pode contribuir para a sua expanso no campo. Neste
sentido, a Embrapa Informtica Agropecuria busca desenvolver solues em TIC aplicadas
agricultura, como evidenciado em outros captulos deste livro.
Os estudos corroboram a relevncia de se avanar no conhecimento sobre o tema, principalmente
atinente aos fatores condicionantes para uso da TIC. A infraestrutura de acesso a computadores
e a internet um dos pr-requisitos essenciais para que essa adoo ocorra. Como apresentado
no incio do captulo, nos estudos de Gelb (2012, 2013) a infraestrutura no foi considerada uma
restrio/limitao dominante para a realidade americana e europeia. A realidade brasileira, po-
Computador
Acesso internet
Percentual
4,54
1,87
Os dados do Censo Agropecurio 2006 (IBGE, 2006) apontam, para o estado de So Paulo,
que 16,87% dos estabelecimentos tinham computador e que 9,48% deles tinham acesso
internet.
Outra fonte de informao sobre o uso de computador e internet no Brasil a TIC Domiclios,
realizada desde 2005 pelo Comit Gestor da Internet no Brasil (2012). Trata-se de uma pesquisa
amostral, a qual em sua edio de 2012, analisou 25 mil domiclios. Na pesquisa so considerados como equipamentos de TIC: televiso, antena parablica, televiso por assinatura, rdio,
telefone fixo, telefone celular, console de jogo (videogame), computador de mesa (desktop),
computador porttil (notebook), computador de mo (palm top). No presente trabalho sero tomados da TIC Domiclios os dados referentes a computador e ao uso da internet, de modo a tecer
comparaes de suas ocorrncias nas reas rurais e urbanas do Brasil.
4
Trata-se do Censo das Unidades de Produo Agropecuria paulistas, realizado pelo Instituto de Economia Agrcola
(IEA) e pela Coordenadoria de Assistncia Tcnica Integrada (CATI), rgos da Secretaria da Agricultura e
Abastecimento do Estado de So Paulo.
43
44
A TIC Domiclios analisou, a partir de 2009, separadamente, os dados quanto ao uso de TIC obtidos em municpios urbanos e rurais. Cabe esclarecer que o domiclio rural nem sempre implica
em uma propriedade agropecuria. A pesquisa de 2012 evidencia a disparidade envolvendo a
posse de computadores em reas urbanas e rurais, descrita na Tabela 4.
Tabela 4. Percentual de domiclios com computador e com internet no Brasil,
segundo CGI.br para o ano de 2012.
Tipo de eletrodomstico utilizado
Computador
Acesso internet
Permetro
Urbano
Rural
Urbano
Rural
Sim
51
16
43
10
No
49
84
57
90
Nas duas pesquisas fica evidente a necessidade de aumentar o acesso ao computador e internet
na rea rural. Este quadro apenas uma reproduo da conhecida marginalizao pela qual foi
historicamente submetido o espao rural no Brasil, carente de investimentos em infraestrutura de
desenvolvimento e na proviso de servios sociais bsicos.
3.1 Regies do pas
Para caracterizar o produtor rural que tem acesso a estes instrumentos de TI foram utilizados
os dados desagregados do Censo Agropecurio (IBGE, 2006). A Tabela 5 ilustra o nmero de
estabelecimentos agropecurios com computador e acesso internet segundo as regies do
Pas.
Tabela 5. Nmero de estabelecimentos agropecurios com computador e acesso internet, distribudos
por regio do Brasil, segundo dados do Censo Agropecurio 2006.
Regies
Sul
Sudeste
Centro-Oeste
Norte
Nordeste
Tipo de eletrodomstico
utilizado
Percentual
Computador
83.330
9,59
Acesso internet
29.795
3,43
Computador
61.859
8,11
Acesso internet
30.144
3,95
Computador
12.939
5,19
Acesso internet
5.244
2,1
Computador
4.284
1,31
Acesso internet
1.295
0,4
21.211
1,16
8.929
0,49
Computador
Acesso internet
estas duas regies que apresentam a maior participao no Produto Interno Bruto (PIB) brasileiro. Isso confirma que as desigualdades regionais tambm se traduzem em desigualdade de acesso
s tecnologias da informao.
Outros indicadores de modernizao da agricultura tambm mostram esta concentrao no Sul e
Sudeste do pas, em detrimento das demais regies (DELGADO, 2005).
Corroboram com esta afirmao Souza Filho et al. (2011) a partir da anlise de dados do Censo
Agropecurio 2006. Segundo estes autores, 36% dos estabelecimentos agropecurios nacionais
usavam adubao e 16% faziam aplicao de calcrio e/ou outro corretivo de pH do solo. Das
propriedades rurais, 69% tinham acesso energia eltrica, facilitando o uso de tcnicas mais
avanadas de manejo, processamento da produo e de gesto da propriedade.
Quanto orientao tcnica, um dos meios de acesso informao e s novas tecnologias, 22%
dos estabelecimentos agropecurios mencionaram ter recebido assistncia tcnica ocasionalmente ou regularmente. Todavia, as diferenas entre as regies brasileiras eram evidentes. Por
exemplo, para os indicadores uso de adubao, aplicao de corretivos do pH do solo e de uso
de servios de orientao tcnica, as regies Sul (72%, 39% e 48% dos estabelecimentos rurais
daquela regio, respectivamente) e Sudeste (53%, 31% e 31%, respectivamente) apresentavam
o maior nmero de estabelecimentos agropecurios com acesso a esses itens. Por outro lado,
na regio Nordeste, 20% dos estabelecimentos rurais utilizavam adubao, apenas 3% usavam
algum corretivo do pH do solo e 8% recebiam orientao tcnica (IBGE, 2006).
3.2 Grupo de atividade econmica
No que tange ao grupo de atividade econmica, os dados da Tabela 6 apresentam que predominava o acesso a estes instrumentos pelo produtor que trabalhava com pecuria e criao de outros
animais.
Surpreende o destaque dos estabelecimentos cuja atividade principal era a pecuria no que se
refere presena de computador e acesso internet. Isto porque na pecuria brasileira, apesar dos
notveis progressos nos indicadores de produtividade, ainda predominam os sistemas extensivos
de produo.
Entretanto, na anlise dos dados nacionais do Censo Agropecurio de 2006, se considerar conjuntamente as atividades ligadas produo vegetal, e mais especificamente, aquelas passveis
de serem enquadradas como um conjunto de lavouras (somatrio de lavoura temporria; horticultura e floricultura; lavoura permanente; sementes, mudas e outras formas de propagao vegetal),
os percentuais de uso de computador e internet se aproximam aos da pecuria, com vantagem
para o conjunto de lavouras.
Este fato ocorre no caso do Brasil, das regies sudeste e sul e do estado de So Paulo (Tabela
7). J nos casos das regies Norte, Nordeste e Centro Oeste predominam os estabelecimentos
que tinham computador e que utilizavam a internet no grupo de atividade econmica pecuria e
criao de outros animais.
Interessante ressaltar que a importncia relativa de acesso ao computador e internet na pecuria
(Tabela 7) coincide com a maior disponibilidade de software agronegcio para a rea de manejo
animal, o que permitiria inferir que a indstria e estrutura de prestao de servios esto atentas
a essa demanda (MENDES et al., 2011).
45
46
Tabela 6. Nmero de estabelecimentos agropecurios com computador e acesso internet em relao aos
grupos de atividade econmica, no Brasil, segundo dados do Censo Agropecurio 2006.
Tipo de
eletrodomstico
utilizado
Computador
Percentual1
183.623
4,54
Lavoura temporria
53.493
1,32
Horticultura e floricultura
12.011
0,3
Lavoura permanente
26.265
0,65
305
0,01
85.861
2,12
3.324
0,08
873
0,02
78
1.413
0,03
Total
75.407
1,87
Lavoura temporria
21.303
0,53
5.320
0,13
11.881
0,29
Horticultura e floricultura
Lavoura permanente
Sementes, mudas e outras formas de
propagao vegetal
Pecuria e criao de outros animais
Produo florestal - florestas plantadas
Produo florestal - florestas nativas
Pesca
Aquicultura
1
Nmero de estabelecimentos
agropecurios
Unidades
Total
Tabela 7. Percentual de estabelecimentos agropecurios com computador e internet para o Brasil, nas
macrorregies, segundo dados do Censo Agropecurio 2006.
165
Acesso internet
Grandes grupos de
atividade econmica1
Brasil
Norte
Nordeste
Sudeste
Sul
CentroOeste
4,54
2,28
2,12
1,31
0,34
0,91
1,16
0,52
0,60
8,11
4,16
3,76
9,59
5,22
4,02
5,19
1,76
3,34
0,10
0
0,03
0,04
0
0,02
0,02
0
0,02
0,13
0
0,05
0,29
0
0,06
0,05
0
0,04
1,87
0,95
0,84
0,40
0,09
0,29
0,49
0,21
0,25
3,95
2,07
1,77
3,43
1,92
1,35
2,10
0,81
1,24
0,05
0
0,02
0
0
0,01
0,01
0
0,01
0,07
0
0,03
0,14
0
0,03
0,03
0
0,02
Total
Lavouras
Pecuria e criao de
outros animais
Florestas
Pesca
Aquicultura
Total
Lavouras
Pecuria e criao de
outros animais
Florestas
Pesca
Aquicultura
Adaptado pelos autores, onde: a) Lavouras correspondem soma de lavoura temporria; horticultura e floricultura;
lavoura permanente; sementes, mudas e outras formas de propagao vegetal e b) Florestas correspondem soma
de Produo florestal - florestas plantadas e Produo florestal - florestas nativas.
Fonte: Mendes et al. (2013).
1
33.967
0,84
1.647
0,04
385
0,01
25
714
0,02
Em pesquisa realizada com 162 empresas desenvolvedoras, prevalece a oferta de software rural
para a rea animal (Tabela 8).
A anlise da categoria manejo animal (Tabela 8), desagregada por reas de aplicao, confirma oferta de software dedicado produo animal (Tabela 9), com destaque para bovinos de
corte e de leite. No clara a razo da relativa concentrao da TIC na pecuria, uma vez que
a produo agrcola apresenta indicadores de modernizao mais elevados que os da pecuria.
Mendes et al. (2011) esclarecem que os produtos de software voltados para a pecuria auxiliam
em algumas etapas da produo animal, tais como para controle de custos de produo, balanceamento de raes, controle da reproduo por meio da gentica e controle sanitrio, incluindo
a rastreabilidade.
Tabela 8. Percentual de software rural ofertado, por categorias.
Categorias
Administrao/Gerenciamento
Manejo animal
Cultivo vegetal
Controle de processo e/ou de atividades rurais
Total
47
48
Tabela 9. Softwares ofertados para o agronegcio, por reas de aplicao na categoria Manejo Animal.
rea de aplicao
N de software1
% da rea de aplicao
em relao ao total de software
da categoria Manejo Animal
22,6
Bovinos de corte
53
Bovinos de leite
45
19,2
Sunos
31
13,2
Aves
19
8,1
Ovinos (ovelhas)
19
8,1
18
18
7,7
7,7
15
6,4
Peixes
3,8
2,6
Abelhas
0,9
Total
235
100
Por outro lado, tendo como base os dados estaduais do Levantamento de Unidades de Produo
Agropecuria na agricultura paulista, Francisco e Caser (2007) mostraram que no perodo de
2000 a 2006 a maior concentrao de uso de computador e acesso internet na agricultura paulista ocorreu em unidades produtoras de gros, cana-de-acar, citros, caf, ou seja, em atividades
nas quais So Paulo se destaca na produo nacional.
3.3 Escolaridade
Algumas variveis condicionam a incorporao da TIC e de inovaes nesta rea, entre as quais
a disponibilidade de energia eltrica, o acesso rede pblica de comunicaes e o nvel de instruo do responsvel pelo estabelecimento.
A Tabela 10 apresenta o nvel de instruo do responsvel pelo estabelecimento.
Em relao varivel nvel de instruo do produtor os dados do Censo do IBGE mostraram,
como era de se esperar, uma concentrao no uso de computador e internet nos estabelecimentos
onde as pessoas que os dirigem tm maior grau de instruo (segundo grau completo e ensino
superior). Este fato se observa nas diferentes dimenses territoriais analisadas (Brasil e grandes regies). Em relao do nvel de escolaridade, ficam evidenciadas as grandes diferenas
regionais quanto ao acesso a computador e internet, com Sul e Sudeste apresentando as maiores
mdias para todos os nveis de escolaridade, com destaque para o Estado de So Paulo, cujas
mdias ultrapassam as dessas duas regies. A Regio Norte foi a que apresentou a pior situao
nacional, seguida pelo Nordeste. O acesso internet, em 2006, representava uma proporo bem
menor que a presena do computador no estabelecimento, chegando prximo metade, ou mesmo menos, nas regies Norte e Centro Oeste.
O nvel de instruo integra as principais variveis determinantes da adoo de tecnologia reportadas na literatura, dentre outras, como: tamanho da propriedade; rea destinada atividade;
Tabela 10. Percentual de estabelecimentos agropecurios com computador e internet segundo o nvel de
instruo do produtor, para o Brasil, nas macrorregies, segundo dados do Censo Agropecurio 2006.
Tipo de
Nvel de instruo da
eletrodomstico
pessoa que dirige o
utilizado
estabelecimento
Computador
Total
Alfabetizao de adultos
Ensino fundamental
incompleto (1 grau)
Ensino fundamental
completo (1 grau)
Ensino mdio ou 2 grau
completo
Ensino Superior
Nenhum, mas sabe ler e
escrever
No sabe ler e escrever
Acesso internet Total
Alfabetizao de adultos
Ensino fundamental
incompleto (1 grau)
Ensino fundamental
completo (1 grau)
Ensino mdio ou 2 grau
completo
Ensino Superior
Nenhum, mas sabe ler e
escrever
No sabe ler e escrever
Brasil
Norte
Nordeste
Sudeste
Sul
CentroOeste
4,54
1,26
3,6
1,31
0,31
0,78
1,16
0,38
0,83
8,11
2,18
4,53
9,59
4,41
6,7
5,19
1,28
2,66
8,29
2,19
2,36
10,08
14,77
5,67
16,7
7,26
8,5
20,74
25,32
12,19
32,32
0,95
20,16
0,48
26,58
0,49
35,92
1,74
39,49
3
21,07
1,46
0,24
0,2
0,17
0,55
0,89
0,66
1,87
0,31
1,03
0,4
0,07
0,18
0,49
0,09
0,24
3,95
0,62
1,59
3,43
1,03
1,74
2,1
0,27
0,82
3,05
0,58
0,91
4,19
5,04
8,02
2,54
4,03
10,95
11,56
5,27
19,78
0,25
8,48
0,08
15,73
0,12
23,2
0,54
24,29
0,75
10,88
0,38
0,06
0,02
0,04
0,16
0,19
0,16
mercado; idade; sexo (gnero); renda anual; atividade; acesso informao; comportamento de
adoo no passado; experincia; comportamento de risco financeiro; infraestrutura e regulamentao governamental (MACHADO, 2008).
A condio do produtor em relao s terras tambm nos ajuda a caracterizar os produtores com
acesso a estes instrumentos de informtica. Conforme demonstra a Tabela 11, predominava o
acesso entre os proprietrios da terra.
Tanto o nvel de instruo como a condio do produtor em relao terra so fatores que influenciam o acesso a computador e internet no estabelecimento agropecurio. Estes aspectos
esto inseridos num grupo mais abrangente de fatores que impactam na deciso de agricultores
em adotar, no adotar ou retardar a adoo de uma tecnologia. Souza Filho et al. (2011) agrupam
tais fatores segundo a natureza das variveis envolvidas:
1) Condies socioeconmicas e caractersticas do produtor.
2) Caractersticas da produo e da propriedade rural.
3) Caractersticas da tecnologia.
49
50
Tabela 11. Nmero de estabelecimentos agropecurios com computador e acesso internet no Brasil
quanto condio do produtor em relao terra, de acordo com dados do Censo Agropecurio 2006.
4 Consideraes nais
Tipo de
eletrodomstico
Condio do produtor
utilizado
Computador Total
Proprietrio
Assentado sem titulao definitiva
Arrendatrio
Parceiro
Ocupante
Produtor sem rea
Embora se admita que alguns dados referentes a uso de computador e internet, relativos a 2006,
estejam obsoletos dada a velocidade de propagao desses instrumentos , sabe-se que questes de fundo subsistem, e ainda so responsveis pela desigualdade no acesso tecnologia da
informao ao longo do territrio nacional. Entre elas esto o nvel de instruo dos produtores,
sua condio em relao s terras, o grau de dinamismo das diferentes atividades econmicas,
entre outras variveis.
Acesso
internet
Total
Proprietrio
Assentado sem titulao definitiva
Arrendatrio
Parceiro
Ocupante
Produtor sem rea
Percentual
183.623
166.559
1.400
8.687
1.775
3.695
1.507
4,54
4,12
0,03
0,21
0,04
0,09
0,04
75.407
68.224
332
4.537
717
1.116
481
1,87
1,69
0,01
0,11
0,02
0,03
0,01
4) fatores sistmicos.
Souza Filho et al. (2011) detalham a anlise de tais fatores. As condies socioeconmicas
do produtor e de sua famlia referem-se s caractersticas que podem ter papel de destaque na
trajetria da unidade de produo, tais como a experincia e a capacidade de obter e processar
informaes, a habilidade no uso de tcnicas agrcolas e de mtodos de gerenciamento mais
sofisticados que podem contribuir para o sucesso do empreendimento.
No que concerne s caractersticas da produo, verifica-se qual o papel que a tecnologia exerce
na determinao do desempenho econmico-financeiro do estabelecimento, pois ela pode permitir elevar a produtividade do trabalho e criar elos a montante e a jusante. Quanto caracterstica
da tecnologia, interessa apontar se ela possibilita ter como os efeitos esperados a elevao da
produtividade e a economia de mo-de-obra, que correspondem s principais necessidades dos
agricultores familiares.
Quanto aos fatores sistmicos, analisam-se as condies dos segmentos da cadeia produtiva
em que a explorao agrcola est inserida, bem como as instituies e organizaes que lhe
provm suporte tecnolgico, de informaes e financeiro. A infraestrutura fsica (energia, telecomunicao, armazenamento), a infraestrutura de cincia e tecnologia (institutos de pesquisa,
universidades) e servios de educao bsica so de fundamental importncia no sentido de gerar
externalidades positivas para aes de adoo de tecnologia.
5 Referncias
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(Relatrio de acompanhamento setorial).
51
52
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brasileiro de software para o agronegcio. Campinas: Embrapa Informtica Agropecuria: Campinas, 2011. cap. 2,
p. 38-72.
Parte
II
TIC na Biotecnologia
Captulo
55
Genmica e biotecnologia
aplicadas a adaptao a
mudanas climticas
1 Introduo
1.1 Mudanas climticas globais e seus impactos na agricultura
Pases em desenvolvimento, muitos dos quais situados em regies de clima tropical, subtropical
e semirido, tm sua produo agrcola e florestal especialmente vulnervel s mudanas climticas globais (SOLOMON et al., 2007). Alm dos efeitos diretos decorrentes das elevaes tanto
da concentrao atmosfrica de dixido de carbono como da temperatura global mdia, esses
setores devero sofrer grande impacto em consequncia do aumento da frequncia de eventos
extremos, como ondas de calor, estiagens, secas, alagamentos e inundaes (SOLOMON et al.,
2007). No Brasil, mudanas climticas podem levar a perdas de produo agrcola da ordem de
R$ 7,4 bilhes em 2020 (DECONTO, 2008). Alm das perdas econmicas diretas, profundos
efeitos sociais associados a menor disponibilidade de alimentos e energia para a populao devero ocorrer consequentemente.
Nas ltimas trs dcadas, milho e trigo tiveram sua produtividade global afetada negativamente
por alteraes de temperatura e de precipitao, enquanto que culturas que no sofreram impacto
global, como arroz e soja, foram afetadas negativamente por esses estresses nos nveis nacionais
e regionais (LOBELL; GOURDJI, 2012; LOBELL et al., 2011). Tambm nesse perodo, as produtividades de milho, soja e trigo no Brasil sofreram impactos climticos negativos (LOBELL
et al., 2011; SAKURAI et al., 2011). Milho e soja sofreram impactos das alteraes de temperatura e precipitao que variaram fenolgica, temporal e geograficamente (BERGAMASCHI
et al., 2007; FERREIRA; RAO, 2011; SAKURAI et al., 2011). Na Regio Sul, a qual responde
por aproximadamente 30% da produo brasileira de milho e soja, diversas safras agrcolas
apresentaram desde o final dos anos 1990 graves perdas por secas associadas a ocorrncias da
fase La Nia do fenmeno El Nio-Oscilao Sul (CONAB, 2013; SLEIMAN; SILVA, 2010).
Notavelmente, a perda de produo agrcola nessa regio foi de aproximadamente 25% na safra
2004/05 em comparao a safras imediatamente anteriores e posteriores, as quais foram menos
afetadas por reduo de precipitao.
Exemplos de eventos climticos extremos com consequncias drsticas na produtividade agrcola foram observados recentemente nos EUA e no Brasil. A reduo da produo de milho na safra
2012 norte-americana, devido seca e ao calor recordes, foi estimada em cerca de 40 milhes de
toneladas (Mt), valor equivalente mdia da safra anual brasileira no perodo 2005-10 (49 Mt)
(ESTADOS UNIDOS, 2013; FAO, 2013). No Nordeste brasileiro, a seca mais severa das ltimas
cinco dcadas provocou ao menos R$ 3,6 bilhes em perdas agrcolas diretas e graves consequncias sociais (BARROS-NETO; MOURA, 2013; NAES UNIDAS, 2013).
A produo mundial de gros dever crescer 70% (FAO 2009) para satisfazer a demanda por
alimentos da populao global em 2050, estimada em mais de 9 bilhes de pessoas. Agravadas
por investimentos insuficientes em pesquisa e desenvolvimento agrcola, as baixas taxas de
crescimento da produtividade agrcola observadas nas ltimas duas dcadas podem ter consequncias profundas na produo e nos preos futuros (ALSTON et al., 2009). Para que os efeitos
das mudanas climticas globais sobre a agricultura possam ser minimizados, fundamental que
o melhoramento gentico vegetal desenvolva continuamente variedades mais adaptadas aos estresses decorrentes que possibilitem maior estabilidade produo agrcola de forma ambiental,
econmica e socialmente viveis. Para que o melhoramento gentico faa contribuies efetivas,
so necessrios esforos que visam a ampliao da diversidade gentica disponvel em bancos de
germoplasma e a gerao de novas variedades com desempenho agrcola superior. Nesse sentido,
a biotecnologia moderna pode contribuir significativamente, pela introduo de novos genes que
confiram capacidade adicional de adaptao restrio hdrica e ao aumento da temperatura s
variedades desenvolvidas pelo melhoramento gentico convencional. Para tanto, a descoberta e a
validao de genes com esse potencial devem ser realizadas por meio de pipelines de pesquisa e
desenvolvimento (P&D) de grande capacidade (Figura 1), que renam ferramentas avanadas de
biologia molecular e genmica, como a caracterizao em larga escala de genomas, de expresso
gnica e de fentipos, marcadores moleculares e transgenia (PARK et al., 2011; PELLEGRINO
et al., 2007; TESTER; LANGRIDGE, 2010).
A genmica funcional caracterizada pela anlise de funo gnica em larga escala (portanto,
almejando centenas ou milhares de genes-alvo) e envolve, entre outros recursos e abordagens
experimentais, a utilizao de grandes colees de gentipos contendo variantes allicas (incluindo mutaes pontuais e inseres de T-DNAs e elementos de transposio que modificam
a expresso ou funo do lcus-alvo) e de eventos geneticamente modificados com expresso
alterada de genes-alvo. No mbito da genmica funcional e da biotecnologia agrcola moderna,
duas possibilidades distintas, mas no mutuamente exclusivas, de gerao de variedades geneticamente melhoradas so:
a) Desenvolvimento de marcadores moleculares (mais comumente genticos) para seleo assistida de genes ou alelos de interesse em programas de melhoramento gentico.
b) Identificao e validao, em sistemas ou plantas-modelo, de novos genes e alelos de diferentes fontes, seguidas de introduo em gentipos-elite.
1.2 Pesquisa e desenvolvimento de tecnologias transgnicas
Ao longo da ltima dcada, a transgenia foi a tecnologia mais rapidamente adotada na histria
da agricultura (CHASSY, 2007). A reduo da aplicao de cerca de 224 milhes de quilos de
pesticidas juntamente com os ganhos de produtividade e a diminuio nos custos de produo
devido ao cultivo de plantas transgnicas contriburam, no perodo de 1996 a 2004, com a alocao de valores entre US$ 20 a US$ 30 bilhes na renda dos agricultores em todo o mundo
(HERDT, 2006).
Figura 1. Cronograma, fases e estgios de P&D do pipeline de gerao de tecnologias transgnicas das grandes empresas transnacionais de biotecnologia agrcola.
I. Descoberta Inicial: Identificao de genes com o objetivo de obter o carter de interesse (hits). II. Descoberta Avanada: Introduo dos hits em plantas-modelo.
Se observado o carter de interesse na planta transformada, tem-se a sequncia lead. III. Otimizao de Construes: Otimizao temporal, espacial e de nvel de
expresso do transgene. A cultura-alvo transformada e tem fentipo avaliado em casa de vegetao e/ou campo. IV. Produo e Seleo: Construes gnicas
com os leads so usadas para produzir eventos de qualidade comercial, eliminando-se eventos com mltiplas inseres. Avaliao fenotpica ainda realizada. V.
Introgresso, Melhoramento e Testes de Campo: Eventos de qualidade comercial so introgredidos em germoplasma-elite para produo de hbridos ou variedades
para avaliao da performance em testes de campo. VI. Cincia Regulatria: Conduo de estudos regulatrios: caracterizao completa do evento e confirmao
de segurana alimentar e ambiental. VII. Regulamentao e Registro: Preparao e submisso de documentao para plantio comercial em diferentes pases.
56
57
58
Uma das principais caractersticas das grandes empresas de biotecnologia agrcola atuantes no
mercado de sementes a capacidade de inovao no desenvolvimento de novas cultivares que
incorporam biotecnologia avanada. Para isso, contam com pipelines robustos de pesquisa e
desenvolvimento (P&D) que combinam melhoramento gentico (convencional e assistido por
marcadores moleculares) e a modificao gentica (transgenia) para a gerao de novas cultivares mais produtivas que incorporem resistncia a herbicidas, resistncia a pragas e doenas e,
mais recentemente, cultivares tolerantes seca, entre outros caracteres. Esses pipelines avaliam
anualmente inmeras construes gnicas introduzidas diretamente em plantas economicamente
importantes, como milho e soja.
Bancos de dados baseados na World Wide Web (WWW) de vrios genomas de plantas tm se
revelado um recurso inestimvel para os bilogos de plantas em todo o mundo. Pesquisadores
podem facilmente adquirir informao gentica diversa tanto de sequncias codificantes como
no codificantes, elementos regulatrios, famlias de genes, polimorfismos que potencialmente
originam marcadores moleculares e variabilidade gentica entre diferentes espcies de plantas.
Os recursos dos bancos de dados de genoma podem servir como uma fonte substancial para a
identificao de genes responsivos a estresses biticos e abiticos, associados a aumento de
produtividade, qualidade nutricional e outras caractersticas agronmicas de interesse. Entre os
vrios bancos de dados existentes, o Phytozome1 um exemplo de banco de dados e portal que
permite acesso informao de conjuntos completos de genomas de plantas, genes e sequncias
homlogas, informao funcional e de famlias gnicas, alm de alinhamento de sequncias
(GOODSTEIN et al., 2012).
A gerao e a seleo em larga escala de plantas transgnicas com fentipos de valor comercial
normalmente compreende seis fases distintas de P&D (Figura 1), caracterizadas por diferentes
estgios e atividades. A fase de descoberta de genes compreende a avaliao de milhares de genes
e tem como objetivo identificar aqueles capazes de conferir as caractersticas desejadas para a
cultura alvo. A genmica funcional apresenta-se como uma poderosa ferramenta para auxiliar
esse processo.
59
60
61
62
indicado pela Unicamp e por um conselho constitudo por pesquisadores da Embrapa e professores da Unicamp. A UMiP GenClima tem como meta o desenvolvimento, em mdio prazo, de
tecnologia gentica de adaptao a condies de seca, calor e alta concetrao atmosfrica de
dixido de carbono, usando como planta-modelo o milho, e potencialmente aplicvel para outras
culturas de grande impacto socioeconmico no Brasil. Consequentemente, a UMiP GenClima
pretende contribuir, juntamente a outras unidades da Embrapa, para o fortalecimento da posio
dessa empresa como um ator importante no cenrio da biotecnologia agrcola mundial.
4 Consideraes nais
A utilizao de estratgias de seleo assistida por marcadores, juntamente com a incorporao
de novos caracteres por meio da engenharia gentica, permitir, no futuro prximo, a gerao
de gentipos de culturas agrcolas mais produtivas e adaptadas aos novos cenrios climticos
decorrentes de mudanas globais. Com a evoluo das tcnicas de NGS e fenotipagem de alto
desempenho (Captulo 8), ser possvel, respectivamente, a rpida caracterizao molecular e fenotpica de uma grande diversidade de gentipos com propriedades contrastantes de crescimento,
produtividade e adaptao a estresses abiticos e biticos. Essa abordagem permitir a identificao e a localizao de genes e regies do genoma responsveis por diferenas fenotpicas,
alm da compreenso dos mecanismos que controlam as redes de expresso gnica. A Embrapa
Informtica Agropecuria, por seus Grupos de Pesquisa de Modelagem Agroambiental, de
Bioinformtica Aplicada, de Novas Tecnologias e da UMiP GenClima, vem atuando na criao
e disponibilizao de crescente infraestrutura computacional e nucleao de recursos humanos
multidisciplinares necessrios para a utilizao efetiva dessas tecnologias.
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Captulo
67
Bioinformtica
aplicada agricultura
1 Introduo
Os avanos nas reas de tecnologia de informao e das novas tecnologias de sequenciamento
tm provocado uma necessidade cada vez maior do uso da bioinformtica na agricultura, principalmente com relao ao melhoramento gentico vegetal e animal. Uma vasta quantidade
de dados genmicos tem sido gerada a partir de diversas espcies de plantas, animais e micro-organismos, trazendo desafios no sentido de se desenvolver novas ferramentas de anlise e de
integrao dos dados, alm de solues para se armazenar e tratar esse grande volume de dados.
Dada a importncia da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria (Embrapa) no cenrio brasileiro da pesquisa agrcola, aes no sentido de prover comunidade cientfica, condies para
que informaes biolgicas possam ser obtidas a partir dos dados gerados pelas tecnologias genmicas e adequadamente utilizadas em programas de melhoramento gentico, na caracterizao
de recursos genticos e na biotecnologia, tm sido realizadas.
Este captulo tem por objetivo colocar o leitor a par do estado da arte das principais aplicaes da
bioinformtica na agricultura, particularmente quelas relacionadas ao melhoramento gentico
animal e vegetal, executadas no mbito da Embrapa.
68
Alm dos drafts publicados dos genomas acima mencionados (animais e vegetais), uma srie
de pragas agrcolas, assim como endo e ectoparasitas que causam doenas e perdas econmicas
em lavouras e rebanhos, tambm tem tido seu genoma sequenciado. Alguns exemplos incluem
o nematoide do n da raiz (Meloidogyne incognita), que ataca um amplo espectro de plantas e
tem alto poder destrutivo (ABAD et al., 2008), o caro Tetranychus urticae, considerado um dos
caros fitfagos mais importantes do mundo (GOTOH et al., 1993) e um dos principais caros
praga do Brasil, em funo do nmero de espcies vegetais atacadas e dos danos a elas causadas (MORAES; FLECHTMANN, 2008) e o besouro Tribolium castaneum, que causa danos a
gros secos e s farinhas (TRIBOLIUM GENOME SEQUENCING CONSORTIUM, 2008).
Genomas bacterianos de importantes patgenos de plantas como o da Xylella fastidiosa (THE
XYLELLA CONSORTIUM OF THE ORGANIZATION FOR NUCLEOTIDE SEQUENCING
AND ANALYSIS, 2000), Xhantomonas axonopodis pv. citri e X. campestris pv. campestris,
bactrias causadoras do cancro ctrico e podrido negra em crucferas (SILVA et al., 2002),
respectivamente, alm de outras espcies de Xhantomonas, como X. oryzae pv. oryzae (LEE et
al., 2005; SALZBERG et al., 2008), que ataca culturas de arroz e X. albilineans (PIERETTI et
al., 2009), patgeno da cana-de-acar, tambm foram decodificados. Outros exemplos ainda
incluem algumas Pseudomonas (BUELL et al., 2003; JOARDAR et al., 2005) e a Ralstonia
solanacearum, bactria que infecta as razes das plantas (SALANOUBAT et al., 2002). Alm
de genomas bacterianos, o de fungos patognicos, como alguns do gnero Phytophthora (HAAS
et al., 2009; TILLER et al., 2006), Neurospora crassa (GALAGAN et al., 2003) e o Fusarium
(JEONG et al., 2013; MA et al., 2014), tambm foram publicados.
Importantes patgenos que atacam animais de produo tambm tiveram o seu genoma sequenciado, como a Salmonella enterica (CHIU et al., 2005), Brucella abortus (HALLING et al.,
2005), Mycobacterium avium (LI et al., 2005), Dichelobacter nodosus (MYERS et al., 2007),
Clostridium perfringens (MYERS et al., 2006), Brucella suis (PAULSEN et al., 2002) e a
Corynebacterium pseudotuberculosis (SOARES et al., 2013) e uma srie de outros mais.
O sequenciamento do genoma de patgenos animais e vegetais permite-nos desvendar os
mecanismos responsveis pela patogenicidade das espcies e tambm desenvolver testes moleculares para o seu diagnstico. Uma vez conhecidos os mecanismos patognicos, aes de
controle podem ser implementadas. Nesse sentido, a Embrapa, por meio da RGAII (CAETANO
et al., 2012), pretende sequenciar o genoma de 25 cepas de lentivrus de pequenos ruminantes
(LVPRs), que causam considerveis perdas econmicas em rebanhos caprinos e ovinos no
Brasil. No caso da decodificao dos genomas das espcies animais e vegetais, alm de sua
importncia no avano das pesquisas biolgicas, a existncia de um genoma referncia facilita
a identificao dos transcritos sintetizados por esse organismo e a anlise dos transcriptomas,
como veremos a seguir.
2.2 Genmica comparativa
O crescente acmulo de informaes sobre espcies de interesse econmico depositadas nos
bancos de dados, juntamente com o desenvolvimento de ferramentas de anlise adequadas, tem
permitido a realizao de anlises comparativas com dados de organismos modelo, facilitando
a descoberta de genes envolvidos em caractersticas fenotpicas economicamente importantes.
De acordo com Sharma et al. (2014), o sequenciamento do genoma da Arabidopsis, planta modelo da famlia Brassicaceae, revolucionou nosso conhecimento no campo da biologia de plantas e
69
70
tornou-se um marco nos estudos envolvendo a genmica comparativa. Hoje, a existncia de bancos de dados integrados acessados via web, contendo uma srie de informaes genticas obtidas
em estudos com Arabidopsis, alm de ferramentas de anlise, tem nos permitido obter avanos
importantes em estudos envolvendo genmica comparativa. Dentre esses bancos, podemos citar
o TAIR (SWARBRECK et al., 2008), considerado o repositrio de dados e de ferramentas de
anlise mais importante relacionado pesquisa com Arabidopsis (MOCHIDA; SHINOZAKI,
2010), o SIGnal, mantido pelo Salk Institute Genomic Analysis Laboratory1 e o RARGE
RIKEN Arabidopsis Genome Encyclopedia (SAKURAI et al., 2005). Outros bancos de dados
que incluem dados de Arabidopsis so o Brassica Genome Gateway2, BRAD3, Phytozome4,
PlantGDB5, EnsemblPlants6 e ChloroplastDB7. Alm dos bancos de dados de Arabidopsis, informaes genticas e genmicas de plantas de interesse econmico tambm podem ser acessadas e
utilizadas em estudos de genmica comparativa: SOL Genomics Network8, Gramene9, PLAZA10,
GreenPhylDB11, BarleyBase12 e PlantTribes13.Os bancos acima citados compreendem dados de
plantas, no entanto, dados referentes a animais e micro-organimos tambm existem e esto disponveis publicamente, apesar de no citados aqui.
2.3 Anlise de transcriptomas
O RNA-Seq, metodologia que utiliza o sequenciamento de nova gerao na anlise de transcriptomas, tem sido utilizado em estudos da expresso gnica de vrias plantas de importncia
econmica, como o arroz (LU et al., 2010), milho (HANSEY et al., 2012), cevada (MAYER
et al., 2012), laranja doce (XU et al ., 2013) e cana-de-acar (CARDOSO-SILVA et al., 2014;
FERREIRA et al., 2014), e animais de produo, como bovinos de corte (BALDWIN et al., 2012;
LI et al., 2011; PATEL et al., 2013) e leite (MCCABE et al., 2012), sunos (ESTEVE-CODINA
et al., 2011; RAMAYO-CALDAS et al., 2012), aves (PERUMBAKKAN et al., 2013), caprinos
(GENG et al., 2013, LING et al., 2014) e ovinos (ZHANG et al., 2013).
A anlise de transcriptomas essencial para se conhecer os elementos funcionais de um genoma
e os constituintes moleculares de clulas e tecidos especficos. Sua aplicao tem como objetivos especficos catalogar todos os transcritos identificados (RNAm, RNAs no codificadores e
pequenos RNAs), determinar a estrutura transcricional dos genes (3 e 5 UTR, stio de iniciao
da transcrio, padro de processamento dos xons e modificaes ps-transcricionais) e quan1
10
11
12
13
71
72
ou mesmo animais extremos para essa caracterstica dentro de cada raa e identificar os genes
responsveis pela maciez.
A busca por genes e/ou mecanismos envolvidos na resistncia de animais a doenas e parasitas
responsveis por perdas econmicas no setor tambm tem sido objeto de estudos na Embrapa.
A comparao do transcriptoma de caprinos e ovinos resistentes e susceptveis ao parasita
Haemonchus contortus, principal helminto que ataca os rebanhos no Brasil (COSTA et al., 2000),
assim como o estudo do transcriptoma do prprio parasita, esto em andamento em projetos conduzidos na Embrapa Caprinos e Ovinos. Outro parasita que causa srios prejuzos econmicos
ao Brasil e ao mundo, o carrapato bovino Rhipicephalus microplus, tem sido tema de muitas pesquisas na Embrapa, que buscam formas de controle por meio da compreenso dos mecanismos
ativados pelo hospedeiro e/ou pelo caro no momento da interao e tambm na identificao de
genes diferencialmente expressos em animais resistentes e susceptveis. A Embrapa Pecuria Sul
tem desenvolvido importantes projetos na rea, juntamente com a Embrapa Pecuria Sudeste e
a Embrapa Gado de Corte. Estudos acerca da identificao de genes relacionados a problemas
sseos em frangos de corte, que causam dificuldades de locomoo nas aves e consequente
reduo do crescimento, tambm tm sido investigados por meio de RNA-Seq pela Embrapa
Sunos e Aves.
2.4 O estudo de comunidades microbianas
As pesquisas envolvendo o estudo de microbiomas tambm foram alavancadas com o surgimento das novas tecnologias de sequenciamento, as quais trouxeram inmeras vantagens em relao
aos mtodos at ento existentes, baseados em cultura de micro-organismos in vitro. A utilizao
de NGS tem possibilitado o conhecimento da composio da comunidade microbiana, por meio
do sequenciamento de regies hipervariveis do gene 16S RNAr de bactrias e regio Internal
Transcribed Spacer (ITS) de fungos, e tambm de uma quantidade bastante grande de genes presentes nas comunidades microbianas, por meio do sequenciamento do DNA total delas extrado
(metagenomas). A metagenmica tem se mostrado mais eficiente do que os mtodos culturais
principalmente pelo maior poder de identificao das cepas e por tornar possvel a caracterizao
e o monitoramento de alteraes na dinmica de uma comunidade microbiana como um todo,
e no apenas de indivduos em particular. O conhecimento dos membros e dos genes presentes
em um microbioma permite-nos inferir o papel de cada um na comunidade. No entanto, alm
de identificar quem est presente no microbioma, saber o que fazem igualmente importante e
nos possibilita entender a dinmica das relaes entre os micro-organismos e tambm a relao
entre microbiota e hospedeiro. Essa informao pode ser obtida por meio do sequenciamento dos
transcritos expressos pelos membros da comunidade microbiana e obteno do metatranscriptoma. A tcnica de RNA-Seq, j discutida neste captulo, tem sido utilizada com esse objetivo.
No caso dos estudos genmicos, duas abordagens de estudo de comunidades microbianas podem
ser adotadas, utilizando-se as novas tecnologias de sequenciamento: a) anlise de amplicons do
gene 16S RNAr, onde uma ou mais regies hipervariveis do gene 16S RNAr de membros individuais da comunidade amplificada, por meio de reaes em cadeia de polimerase, do ingls
Polymerase Chain Reaction (PCR), utilizando iniciadores complementares a regies conservadas
do gene (que flanqueiam as regies hipervariveis) e sequenciada, com posterior comparao das
sequncias com aquelas depositadas em bancos de dados existentes, classificao e clculo da
abundncia relativa e b) anlise do metagenoma, por meio do sequenciamento em larga escala
do DNA extrado de toda a comunidade microbiana, o que permite a identificao dos genes
que compem o microbioma e tambm da diversidade da populao, embora de maneira menos
precisa do que a obtida com a classe anterior (OVIEDO-RONDN, 2009). O sequenciamento de
amplicons do gene 16S RNAr a abordagem mais acessvel e utilizada em estudos que visam
identificao de membros de uma comunidade microbiana, sendo considerado um bom marcador
para se caracterizar a composio filogentica de uma amostra, identificar novas espcies ou
mesmo grupos filogenticos desconhecidos (GABOR et al., 2007). O fato de vrios organismos
possurem sequncias do 16S RNAr idnticas, mas funes diferentes, no nos permite utilizar essa abordagem para inferir adequadamente as funes dos membros de uma comunidade
microbiana. Essa limitao da tcnica pode ser superada com a anlise de metagenomas e/ou
metatranscriptomas.
Dada a importncia dos micro-organismos na agricultura, so vrios os exemplos de aplicao
da anlise de sequncias de 16S RNAr e de metagenomas nos estudos de comunidades microbianas. Em recente reviso publicada por Kao-Kniffin et al. (2013), os autores citaram estudos
onde a abordagem metagenmica foi utilizada na identificao de genes e compostos com ao
inseticida, e genes de resistncia a herbicidas, para utilizao no controle de pragas em sistemas
agrcolas. De acordo com os autores, o isolamento do DNA diretamente das amostras ambientais,
sem passar pelo processo de cultivo em meio de cultura, aumenta muito a diversidade de micro-organismos recuperada das amostras e, consequentemente, a possibilidade de identificao de
compostos de interesse.
Por se tratar do ambiente que abriga a maior biodiversidade do planeta (MOCALI; BENEDETTI,
2010), o estudo de comunidades microbianas do solo apresenta um potencial imenso para a agricultura: os micro-organismos do solo desempenham um papel crtico na regulao da fertilidade
do solo, sade das plantas e na ciclagem do carbono, nitrognio e outros nutrientes (FIERER et
al., 2012a). Nesse sentido, vrios estudos acerca da caracterizao da microbiota de diferentes
tipos de solos tm sido realizados (FIERER et al., 2007; FIERER et al., 2012b; GROS et al.,
2006; SCHLOSS; HANDELSMAN, 2006). O efeito das prticas agrcolas sobre as comunidades
microbianas do solo tambm tem sido alvo de estudos, que j identificaram o pH e a disponibilidade de gua como os principais fatores abiticos que afetam as populaes (KBERL et al.,
2011), alm da quantidade de N depositada no solo (FIERER et al., 2012b).
Acredita-se que as plantas recrutam micro-organismos benficos do solo, a partir de suas rizosferas, para neutralizar o ataque de patgenos (COOK et al., 1995). Ainda, existem certos tipos
de solos, conhecidos como supressivos, que abrigam comunidades microbianas que impedem
que os agentes patgenos causem danos s plantas. Assim, a caracterizao de microbiomas da
rizosfera de plantas sob condies diversas, e aquela presente em solos supressivos, uma outra
rea que tem se beneficiado dos estudos metagenmicos e com imenso potencial para gerar resultados importantes para a agricultura, como a identificao de novas bactrias fixadoras de N2,
supressoras de patgenos e promotoras do crescimento.
No mesmo contexto, na rea animal estudos tm sido realizados com o objetivo de se identificar
micro-organimos benficos, que aumentem a produtividade e o bem estar animal. Nesse sentido,
a caracterizao de microbiomas do trato gastrintestinal tem sido foco de bastante ateno, uma
vez que, alm do seu papel na digesto, a microbiota do trato gastrintestinal exerce influncia
tambm na proteo contra patgenos, detoxificao e modulao do sistema imune do hospe-
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deiro (AMIT-ROMACH et al., 2004; OVIEDO-RONDN, 2009). A identificao de micro-organismos com baixa produo de metano em ruminantes tambm tem sido objeto de estudos,
uma vez que a emisso entrica de metano tem sido apontada como responsvel por cerca de
15% da emisso global de metano, de acordo com o Painel Intergovernamental sobre Mudanas
Climticas (IPCC) (ROSS et al., 2013; SHI et al., 2014).
A Embrapa tem liderado e atuado em parceria em vrios projetos que utilizam a metagenmica
na caracterizao de microbiomas e para identificar micro-organismos com potencial biotecnolgico. Dentre eles podemos citar o estudo do microbioma da rizosfera e folhas de plantas
resistentes seca e a patgenos, com participao da Embrapa Meio Ambiente, alm do estudo
de microbiomas do trato intestinal e sistema digestrio de frangos de corte, da glndula mamria
e rmen de ovinos e sistema respiratrio de sunos, como parte dos projetos em desenvolvimento na RGAII.
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2012), que possui um projeto componente (Projeto Componente 3) focado na incluso de seleo
genmica em programas de melhoramento gentico de bovinos, ovinos e caprinos.
3.3 Estudos de associao genmica amplo (GWAS)
O termo Genome-Wide Association Studies(GWAS) deve-se ampla cobertura dos marcadores
SNP ao longo do genoma, tornando-os atrativos para anlises de associao gentipo:fentipo
envolvendo efeito polignico. Estes estudos tm como objetivo identificar padres de polimorfismos que variam sistematicamente entre indivduos com diferentes valores de expresso de
um determinado fentipo (BALDING, 2006). Para realizao de GWAS so necessrios trs
elementos:
1) Uma grande quantidade de amostras;
2) marcadores genticos que cubram grande parte do genoma;
3) mtodos analticos poderosos o suficiente para identificar sem vis a associao entre os marcadores e os fentipos analisados (CANTOR et al., 2010).
Os procedimentos computacionais para anlise de dados de experimentos de GWAS envolvem
uma srie de passos (ZIEGLER et al., 2008), existindo diversos mtodos para identificao
dos SNP associados com o fentipo estudado. Dentre estes, os mais comumente utilizados
constituem-se em testes univariados por SNP, com correo para mltiplos testes (ZIEGLER
et al., 2008). Abordagens envolvendo a anlise simultnea de mltiplos marcadores baseiam-se em tcnicas de regresso, paramtricas ou no paramtricas, com seleo ou encolhimento
(shrinkage) de variveis (MOORE et al., 2010; ZIEGLER et al., 2008).
A Embrapa tem desenvolvido diversos projetos envolvendo anlise de GWAS, sendo que alguns
j possuem resultados publicados. Mokry et al. (2013) analisaram um conjunto de dados 400
animais da raa Canchim genotipados com o BovineHD BeadChip (ILLUMINA INC., SAN
DIEGO, CA), visando identificar SNP associados com espessura de gordura. Foi encontrado um
conjunto de SNPs capaz de explicar aproximadamente 50% da varincia do valor gentico derregredido (dEBV) para espessura de gordura e um pequeno conjunto de 5 SNPs capaz de explicar
34% da dEBV. Foram encontrados diversos Quantitative Trait Loci (QTL) relacionados com
gordura na vizinhana desses SNPs, bem como genes envolvidos no metabolismo de lipdeos.
Tizioto et al. (2013) conduziram um estudo de GWAS com 800 animais da raa Nelore genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA), visando identificar SNPs
associados com diferentes fentipos relacionados com qualidade de carne: fora de cisalhamento
Warner-Bratzler, medida em diferentes tempos de maturao, espessura de gordura, rea de olho
do lombo, parmetros de cor da carne e gordura, capacidade de reteno de gua, perdas no cozimento e pH do msculo. As regies genmicas na vizinhana dos QTL encontrados e as vias
das quais esses genes fazem parte diferem daqueles identificados em raas taurinas. Espera-se
que esses resultados subsidiem futuros estudos de mapeamento de QTL e o desenvolvimento de
modelos para predio de mrito gentico para qualidade de carne para a raa Nelore.
Diversos outros projetos encontram-se em andamento na Embrapa, fazendo uso de GWAS
para identificar genes e regies gnicas associadas com caractersticas fenotpicas de interesse
zootcnico. Na RGAII (CAETANO, 2012), o projeto componente 4 est conduzindo trs experimentos de GWAS: (i) estudos de associao para caractersticas de presena/ausncia de chifres
e criptorquidia em 250 ovinos da raa Morava Nova, genotipados com o Ovine SNP50Beadchip
(Illumina Inc., San Diego, CA); (ii) estudos de associao para 85 caractersticas avaliadas para
1.000 aves da populao de Referncia TT, representativa da melhor linha paterna de corte do
programa de melhoramento gentico da Embrapa Sunos e Aves, genotipados com o Chicken
SNP60BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA); estudos de associao para a caracterstica
de presena de chifres e batoques em rebanhos Nelore Mocho BRGN, pertencentes Embrapa
Cerrados e de rebanhos de importantes criadores de Nelore mocho, como a Guapor S/A, utilizando 350 animais genotipados com o Bovine SNP50Beadchip (Illumina Inc., San Diego, CA).
5 Consideraes nais
Dada a importncia do melhoramento gentico na agricultura sustentvel e na segurana alimentar no nosso pas e do mundo, o uso de dados genmicos para o melhoramento de espcies
animais e vegetais de interesse econmico de fundamental importncia, e faz parte das aes
da Embrapa que visam garantir a demanda da produo de alimentos frente ao crescimento da
populao e tambm aos cenrios futuros de mudanas climticas. O desenvolvimento e otimizao de ferramentas de bioinformtica que permitam a anlise dos dados gerados pelas tecnologias
genmicas em crescente avano, assim como sua disponibilizao comunidade cientfica,
preocupao constante da empresa, que trabalha sempre no sentido de prover as melhores solues para o aproveitamento das informaes geradas, no sentido de contribuir para o avano no
setor e manuteno do Brasil como um pas de excelncia em pesquisa agrcola.
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83
Captulo
85
Fenotipagem de plantas
em larga escala:
um novo campo de aplicao para a
viso computacional na agricultura
1 Introduo
Tecnologias visando aumentar a acurcia e rapidez das mensuraes fenotpicas para melhor
caracterizao e entendimento das funes biolgicas dos organismos em resposta a diferentes
condies ambientais vm sendo alvo de intensas pesquisas nos ltimos anos. Este esforo
recente busca diminuir o gargalo de fenotipagem (phenotyping bottleneck), como vem sendo
chamada pela comunidade cientfica a lacuna entre a quantidade e qualidade de dados genmicos
e fenotpicos disponveis. Tcnicas correntes de sequenciamento tornaram a caracterizao de
genomas um processo eficiente e barato, gerando uma enorme massa de dados para pesquisa.
Porm, um avano similar ainda no ocorreu na caracterizao em larga escala de fentipos, e
isso retarda o avano no entendimento das associaes gentipo versus fentipo.
Para alcanar a mesma velocidade observada atualmente na caracterizao genmica, necessrio incorporar fenotipagem avanos nas reas de computao, robtica, viso computacional
e anlise de imagens (COBB et al., 2013; FIORANI; SCHURR, 2013; FURBANK; TESTER,
2011). Com o foco neste objetivo, uma nova rea do conhecimento cientfico est emergindo
e vem sendo chamada de fenmica, em aluso s cincias micas que estudam os genes,
transcritos, protenas e metabolitos de um organismo. Esta nova cincia, fenmica, se concentra
na aquisio de dados fentipos em larga escala e dimenso, em um curto espao de tempo, oferecendo com isso uma oportunidade nica de visualizar, em vrios nveis hierrquicos, o fentipo
de um organismo.
Viso computacional e anlise de imagens so hoje um dos principais componentes em qualquer
plataforma moderna de fenotipagem (FIORANI; SCHURR, 2013; FURBANK; TESTER, 2011).
Tcnicas baseadas em imagem so capazes de capturar grandes volumes de dados quantitativos
sobre o fentipo, atravs de metodologias que no so invasivas ou destrutivas. A fenotipagem
de plantas uma aplicao desafiadora viso computacional, por apresentar problemas nas
reas de modelagem tridimensional (3D), segmentao e classificao, metrologia por imagem
e processamento de nuvens de pontos. Um exemplo da aproximao entre as reas pde ser
visto em 2014, quando a tradicional Conferncia Europeia em Viso Computacional - European
Conference on Computer Vision (ECCV) incluiu um workshop dedicado a problemas em fenotipagem de plantas (Computer Vision Problems in Plant Phenotyping) (CVPPP).
86
O presente captulo apresenta uma viso geral dos avanos recentes na fenotipagem em larga
escala (Seo 2) e como a viso computacional surge como ferramenta para a caracterizao
fenotpica no-destrutiva da parte area de plantas (Seo 3). O captulo se encerra (Seo 4)
apresentando cenrios futuros de pesquisa nessa rea.
Alm de serem aplicadas isoladamente, as tcnicas baseadas em espectroscopia e imagens podem ser combinadas para permitir uma anlise mais compreensvel das caractersticas mensuradas (CHAERLE et al., 2007; GOETZ et al., 1985). Neste contexto, uma das tecnologias mais
promissoras, imagens hiperespectrais, rene anlises de imagens e espectros ao longo de uma
ampla extenso de comprimentos de ondas em duas ou trs dimenses do espao (GOWEN et al.,
2007). Imagens hiperespectrais vm sendo utilizadas para detectar contaminao biolgica em
gros (DEL FIORE et al., 2010, WILLIAMS et al., 2009) e na anlise de crescimento e desenvolvimento de plantas (WALTER; SCHURR, 2005). Similarmente, imagens com fluorescncia da
clorofila em um contexto espacial tambm vm sendo usadas para investigar resposta a estresses
abiticos (KONISHI et al., 2009) e biticos (ROLFE; SCHOLES, 2010).
Apesar das interessantes possibilidades que as tecnologias de fenotipagem utilizadas em laboratrio ou ambientes controlados podem oferecer, a maioria das caractersticas de importncia
agronmica precisam ser avaliadas em campo. Felizmente, vrias destas recentes tecnologias
podem ser adaptadas para caracterizao fenotpica no campo (HATFIELD et al., 2008). Vrios
tipos de sensores vm sendo desenvolvidos para serem usados no campo. Ao nvel do solo, sensores esto disponveis em equipamentos manuais tais como espectro radimetros, medidores de
clorofila, e termmetros infravermelhos (MONTES et al., 2007a, 2007b; WELLE et al., 2003,
2005) e acoplados em tratores, picadores, colheitadeiras e mesmo em pivs de irrigao, o que
permite o ganho de escala e possibilita a anlise de milhares de amostras em um curto espao
de tempo. Sensores manuais portteis esto disponveis para detectar deficincia de nutrientes
e predizer contedo total de nitrognio, biomassa, produtividade de gros e variaes em status fisiolgicos (BABAR et al., 2006a, 2006b; OSBORNE et al., 2002a, 2002b; POSS et al.,
2006). A aplicao de NIRS acoplados a tratores e picadores foi demonstrada por Montes et al.
(2006, 2007b) e Welle et al. (2003, 2005) durante avaliao da qualidade, teor de matria seca
e produtividade de silagem de milho. Algumas destas caractersticas puderam ser medidas com
preciso superior s dos procedimentos clssicos de NIRS em laboratrio. Caractersticas de
crescimento tambm tm sido mensuradas utilizando tecnologia de sensoriamento remoto no
campo (PETERS; EVETT, 2007; WINTERHALTER et al., 2011a, 2011b). Sensores e cmeras
podem tambm ser acoplados em torres, dirigveis ou drones, para nomear alguns, o que permite
a aquisio de dados de uma rea extensa e favorece a anlise de caractersticas fenotpicas dinmicas em milhares de plantas (FURBANK; TESTER, 2011; JONES et al., 2009).
Mesmo utilizando estas novas tecnologias, muitos dos equipamentos disponveis para fenotipagem em larga escala ainda requerem o manuseio do operador. Este processo muitas vezes
exaustivo, tedioso e custoso. Para minimizar o vis individual obtido pelas mensuraes manuais
e garantir escala, acurcia e preciso nas medies, a mecanizao e a automao de alguns processos surgem como alternativas, principalmente envolvendo o cultivo das plantas e o processamento de imagens e dados gerados (COBB et al., 2013; FURBANK; TESTER, 2011).
Empregando os ltimos avanos tecnolgicos em fenotipagem bem como tecnologias robticas e analticas, sofisticadas plataformas de fenotipagem em configuraes automatizadas
e semiautomticas vem sendo desenvolvidas, tais como: Phenopsis (GRANIER et al., 2006),
Growscreen (BISKUP et al., 2009; NAGEL et al., 2012; RASCHER et al., 2011) e TraitMill
(REUZEAU et al., 2006), alm de solues comerciais de empresas como LemnaTec, GmbH1
1
87
88
e Qubit Systems2. Desenhadas para cmaras de ambiente controlado, essas plataformas ajudam
a automatizar vrias etapas do processo de cultivo e fenotipagem, como preparo do substrato,
enchimento de potes, plantio, fertilizao, irrigao, aquisio e anlise de dados fenotpicos
(HENTEN, 2006). Sistemas de cdigos de barra e identificao por radiofrequncia podem tambm ser includos na plataforma, permitindo com isso identificao e rastreamento automtico
de amostras. Computadores de alta capacidade, bancos de dados e software tambm esto sendo
desenvolvidos e utilizados na aquisio, armazenamento e anlise de quantidades massivas de
dados que tais plataformas so capazes de gerar (HARTMANN et al., 2011; LI et al., 2011;
VANKADAVATH et al., 2009).
Centros de fenmica utilizando essas plataformas surgiram nos ltimos anos, principalmente
na Austrlia e Europa. Exemplos incluem a Australian Plant Phenomics Facility (Adelaide e
Canberra, Austrlia), o Jlich Phenomics Centre (Jlich, Alemanha), o Leibniz Institute of Plant
Genetics and Crop Plant Research (Gatersleben, Alemanha), a PhenoArch (Montpellier, Frana)
e a Crop Design (Zwijnaarde, Blgica). No entanto, muitas destas plataformas foram desenvolvidas para aplicaes com plantas modelo ou culturas de grande importncia econmica.
Plataformas genricas e solues modulares e flexveis que permitam a avaliao simultnea do
fentipo de mltiplas espcies e capazes de acomodar necessidades experimentais diferentes no
esto ainda disponveis (COBB et al., 2013; FIORANI; SCHURR, 2013). Buscando unir esforos no sentido de padronizar as metodologias de fenotipagem empregadas, desenvolver novos
sensores, instrumentos e estruturas para acessar, gerenciar e analisar a informao tecnolgica
gerada, muitos destes centros se organizam em redes, como a Rede Europeia para Fenotipagem
de Plantas (European Plant Phenotyping Network - EPPN)3.
2.1 Representao de fentipo
Enquanto o genoma de um organismo pode ser caracterizado atravs de suas sequncias de bases,
virtualmente impossvel caracterizar totalmente seu fenoma. Como expresso por Cobb et al.
(2013): o fenoma de um organismo dinmico e condicional, o que representa um conjunto
complexo de respostas a um conjunto multi-dimensional de sinais endgenos e exgenos que so
integradas ao longo do desenvolvimento de um indivduo.
Contudo, se nos restringirmos aos aspectos macroscpicos da parte area da planta, um modelo
3D pode atuar como uma representao temporal concisa e verstil do estado do indivduo, permitindo que diferentes medidas quantitativas sejam computadas, como rea e angulao foliar,
porcentagem de rea afetada (em patologias), curvatura e enrolamento foliar ou altura. Outras
medies podem ser computadas a posteriori, destinadas a responder outros questionamentos,
formulados posteriormente dentro do mesmo experimento ou de um novo. Dado o carter no-invasivo e no-destrutivo dos procedimentos de aquisio de imagens, o comportamento do
espcime ao longo do tempo pode ser avaliado comparando os vrios modelos tridimensionais
construdos ao longo do tempo.
O procedimento de criao desses modelos tridimensionais frequentemente chamado na literatura em fisiologia vegetal de digitalizao de plantas (plant digitizing) e diversas metodologias
para tal fim foram propostas ao longo dos anos.
2
89
90
ao longo do dia. Dada a importncia do movimento para o experimento, o sistema era capaz de
processar at trs imagens por segundo, recuperando assim a informao 3D necessria para o
cmputo da inclinao.
Dados de profundidade oriundos de cmeras ToF podem ser combinados a dados RGB de cmeras convencionais para produzir reconstrues 3D de folhas apesar da baixa resoluo dos
dispositivos ToF atuais. Song et al. (2011) combinaram dados de um par de cmeras RGB (480 x
1280 pixeis) e de uma cmera ToF (64 x 48 pixeis) utilizando a tcnica de minimizao por cortes
em grafos (BOYKOV et al., 2001). O par de cmeras prov uma resoluo mais alta enquanto
a informao ToF auxilia na resoluo de falhas no cmputo da profundidade em regies sem
textura, nas quais a determinao de correspondncia entre imagens mais propensa a falhas.
Aleny et al. (2011) empregaram uma abordagem mais simples: os pontos 3D produzidos por
uma cmera ToF foram transformados para as coordenadas de referncia de uma cmera RGB
e, em seguida, projetados para o plano de imagem da cmera - pontos nesse plano que no apresentassem uma contraparte 3D da cmera ToF foram descartados. Apesar do mtodo simples, os
autores foram capazes de produzir bons resultados pois: a) a cmera ToF empregada apresentava uma resoluo maior (200 x 200 pixeis) e b) um brao rob foi utilizado na movimentao
das cmeras, permitindo a aquisio de mais dados, uma abordagem de sensoriamento ativo
(sensing-for-action) proposta pelos autores.
No arcabouo de triangularizao, uma cmera do par estreo pode ser substituda por um projetor. O mesmo princpio de interseco de raios pode ser aplicado se a posio do projetor e seus
parmetros internos forem conhecidos. Bellasio et al. (2012) utilizaram um par cmera-projetor e
um mtodo de luz codificada (coded-light) para determinar a correspondncia entre pixels, recuperando a superfcie 3D das folhas de pimenteiros. Chn et al. (2012) empregaram uma cmera
RGB-D (um Microsoft Kinect) para segmentar folhas e estimar sua orientao e inclinao.
Tais cmeras RGB-D consistem em um par cmera-projetor e um sistema de triangularizao
embarcados em um nico dispositivo, tambm utilizando luz codificada para estabelecer correspondncias entre pixels (FREEDMAN et al., 2013).
Recentemente, viso estreo mltipla multiple-view stereo (MVS) passou a ser empregada em
digitalizao de plantas como uma tentativa de solucionar problemas de ocluso encontrados
na reconstruo 3D. Paproki et al. (2012) empregaram o software 3D SOM. (BAUMBERG et
al., 2005) para criar modelos tridimensionais de espcimes de algodo (Gossypium hirsutum) e
ento estimar a altura de suas hastes, a largura e o comprimento das folhas. Os espcimes foram
colocados em uma mesa giratria contendo um padro de calibrao utilizado pelo 3D SOM na
estimao da posio relativa da cmera em cada quadro.
Santos e Oliveira (2012) empregaram o arcabouo de estruturao por movimento, structure-from-motion (SfM) (HARTLEY; ZISSERMAN, 2004), para recuperar o posicionamento da
cmera em cada imagem. SfM estende o arcabouo de triangularizao incorporando uma etapa
que simultaneamente busca pelas melhores estimativas para as posies da cmera e as posies
dos pontos 3D na superfcie do objeto. Tal processo, bundle-adjustment, um procedimento de
maximizao da esperana que avalia mltiplos ngulos ao mesmo tempo, minimizando o erro
de reprojeo para cada imagem. Ao invs de empregar um padro de calibrao, os autores
utilizaram a deteco de caractersticas visuais locais nas imagens e suas correspondncias intra-imagens, como proposto por Snavely et al. (2008) no contexto de reconstruo 3D de arquitetura
(b)
(d)
(c)
(e)
(f)
Figura 1. Resultados para girassol produzidos a partir de 302 imagens com 3888 x 2592 pixeis de resoluo
(a-c) pela metodologia proposta . O modelo 3D composto por 829.722 pontos 3D (d-f).
Sirault et al. (2013) tambm reportam resultados em reconstruo 3D a partir do sistema PMVS
de Furukawa e Ponce (2010). Os autores utilizam um conjunto de cmeras fixas e calibradas,
imageando plantas em vasos posicionados em uma mesa giratria de alta preciso (2,5 milhes
de passos por revoluo). Sua plataforma de digitalizao, PlantScanTM, uma cmara esquipada
com trs cmeras RGB CCD, uma cmera NIR e dois varredores laser LiDAR, alm de dois sensores trmicos. Seu sistema de reconstruo estreo emprega os mtodos de viso estreo mltipla (PMVS) e colorizao de voxels, voxel colouring (LEUNG et al., 2012), que so combinados
aos dados LiDAR com o uso de algoritmos de registro RANdom SAmple Consensus (Ransac)
e Iterative Closest Point (ICP). Os autores reportam que sua plataforma capaz de digitalizar
plantas de poucos centmetros at dois metros em altura e at um metro de dimetro, permitindo
assim a fenotipagem da parte area de diversas espcies diferentes.
Santos et al. (2014) estenderam sua metodologia inicial (SANTOS; OLIVEIRA, 2012) incorporando uma aplicao que seleciona automaticamente quadros de uma sequncia de vdeo em
91
92
tempo real. O aplicativo computa caractersticas visuais locais e suas correspondncias entre
quadros utilizando uma unidade de processamento grfico (GPU), selecionando um conjunto de
quadros capaz de produzir boas reconstrues tridimensionais (o algoritmo garante um nmero
mnimo de correspondncias entre quadros que possibilite ao mtodo de SfM recuperar a posio
da cmera). O usurio pode mover livremente a cmera ao redor da planta, o que possibilita a
resoluo de ocluses.
Metodologias que empregam uma nica cmera mvel apresentam duas vantagens. A flexibilidade na definio do caminho percorrido pela cmera permite um melhor tratamento de ocluso
e variaes no tamanho e na morfologia das plantas. O trabalho de Aleny et al. (2011) ilustra tal
caracterstica, mostrando como o planejamento apropriado de movimentao para um brao rob
capaz de posicionar a cmera em locais onde ocluses podem ser facilmente resolvidas. A outra
vantagem diz respeito ao baixo custo de tais solues. Um experimento que requer fenotipagem
de alto-desempenho pode exigir a digitalizao de centenas de indivduos por dia. Metodologias
baratas de reconstruo permitem que diversos mdulos de digitalizao sejam montados para o
experimento e empregados na paralelizao do trabalho.
mais esparsa em outras. Outros problemas podem ocorrer, como buracos causados por ocluses
no resolvidas ou reflexo especular da luz. Considerando-se todos esses problemas, a nuvem de
pontos precisa ser analisada conforme os seguintes passos:
1) A superfcie da planta deve ser inferida a partir dos pontos para que medidas quantitativas
como rea foliar possam ser devidamente computadas (Figura 2);
2) O modelo deve ser segmentado em partes significativas para caracterizao da estrutura da
planta;
3) Cada segmento deve ser classificado em categorias significativas (folhas, entrens, pecolos,
frutos, flores etc.) para que medies quantitativas sejam devidamente realizadas em cada
estrutura diferente do organismo.
(a)
(b)
(c)
Figura 2. Inferindo superfcies a partir de nuvens de pontos. Nuvem de pontos produzida por SfM e MVS
(a). Malha triangular produzida pelo algoritmo ball pivoting (b). Visualizao da superfcie suavizada (c).
93
94
(a)
(b)
automtico das mesmas estruturas ao longo do tempo, por exemplo, para registrar o desenvolvimento de uma folha ao longo de um experimento.
Outro problema de interesse diz respeito fuso de dados de mltiplos sensores. Na tentativa de
obter uma caracterizao mais completa do fenoma de um indivduo em um dado instante, informao oriunda de outros sensores, como termgrafos, espectrmetros e fluormetros, poderia
ser incorporada ao modelo tridimensional da planta, permitindo o registro da variao de leituras
ao longo da superfcie do indivduo ou, no pior dos casos, um registro preciso da localizao da
leitura. A ideia obter o snapshot mais completo possvel do estado da planta no momento da
medio.
(c)
(d)
Figura 3. Segmentao do modelo. (a) Nuvem de pontos produzida pelo mtodo. (b) Segmentao atravs
de spectral clustering - cores diferentes indicam segmentos diferentes. (c) Vista superior do mesmo modelo.
(d) Vista superior da segmentao.
4 Consideraes nais
Novos equipamentos para imageamento 3D tm surgido nos ltimos anos. Cmeras baseadas
em mtodos como ToF (KAZMI et al., 2014) ou luz estruturada (FREEDMAN et al., 2013)
so hoje disponibilizadas como produtos comerciais com valores inferiores a 500 dlares. Esses
equipamentos apresentam resolues crescentes ano a ano e devem disseminar a produo de
dados 3D a baixo custo. Paralelamente, avanos em viso estreo mltipla e estruturao por movimento (NEWCOMBE et al., 2011a, 2011b; PIZZOLI et al., 2014;) iro permitir a construo
de modelos 3D em tempo real, permitindo que o modelador (seja ele um operador humano ou
um sistema automatizado) identifique, durante a aquisio das imagens, quais regies da planta
necessitam de mais detalhes e quais ngulos precisam ser fornecidos para completar o modelo e
resolver ocluses.
Considerando que tais tecnologias iro produzir uma quantidade cada vez maior de dados tridimensionais, tornam-se cada vez mais necessrias metodologias capazes de analisar esses dados,
identificando automaticamente as estruturas de interesse, realizando as medies necessrias
para a caracterizao do fentipo e detalhando o comportamento dessas estruturas ao longo do
tempo. A principal vantagem de mtodos no-destrutivos permitir que os indivduos continuem
se desenvolvendo ao longo do experimento e registrar esse desenvolvimento. Novos mtodos em
viso computacional e aprendizado de mquina so necessrios para permitir o reconhecimento
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Captulo
101
Biologia computacional
molecular e suas aplicaes
na agricultura
102
principalmente devido ao fato de que um pequeno nmero de resduos situado no stio cataltico
responsvel pela funo enzimtica, e participa diretamente do processo de catlise. Os arranjos
espaciais, bem como as propriedades fsicas, qumicas e fsico-qumicas destes resduos determinam a reao qumica catalisada pela enzima.
Os fatores que determinam a funcionalidade do stio ativo de uma protena so muito complexos
e dependem de sua estrutura tridimensional, alm das propriedades bioqumicas e biofsicas.
Stios funcionais podem ser entendidos como uma redondeza fsica, qumica e fsico-qumica
que acompanha uma funo, em contraposio a um grupo de resduos fixos que no participam
diretamente, porm, providenciam o arcabouo estrutural. Um melhor entendimento deste complexo processo tem um significante impacto no desenvolvimento de novas drogas, bem como na
identificao de desordens genticas e na engenharia de protenas com novas funes.
Metodologias de atracamento protena-ligante (docking protena-ligante) so amplamente utilizadas tanto para a descoberta de novas substncias bioativas, tcnica conhecida como triagem
virtual (virtual screening), quanto para o aperfeioamento de compostos bioativos j identificados (GUEDES et al., 2014). A metodologia de desenho racional de frmacos baseado em estrutura tridimensional consiste de seis etapas bsicas, como pode ser visualizado esquematicamente
na Figura 1, que so:
Diversos mtodos matemticos e estatsticos tm sido propostos para calcular informaes sobre
as propriedades estruturais, fsicas, qumicas e fsico-qumicas dos aminocidos (e.g. energia de
contatos, potencial eletrosttico, hidrofobicidade, densidade). Estas propriedades so denominadas descritores estruturais de protenas, e tais propriedades permitem realizar diversas anlises
segundo diferenas e semelhanas entre aminocidos de vrias regies de uma protena. Alm de
descritores fsicos, qumicos e fsico-qumicos, existem descritores baseados na conservao da
estrutura primria da protena, ou seja, baseiam-se em evidncias evolutivas obtidas a partir da
comparao entre sequncias de aminocidos das protenas homlogas, determinando quais aminocidos so mais frequentes em certas posies da sequncia, o que sugere sua importncia na
manuteno da funcionalidade da protena. Outro descritor utilizado em sistema de predio de
aminocidos posicionados em determinados distritos proteicos a propenso (propensity, em ingls), definida como sendo a porcentagem entre o nmero de aminocidos de interesse e aqueles
que no tm preferncia para determinada posio, para cada um dos vinte tipos de aminocidos.
1) Escolha adequada do alvo teraputico (protena ou enzima) relacionada doena cuja funo
deva ser bloqueada ou ativada.
2) Obteno da estrutura tridimensional do biorreceptor atravs de tcnicas experimentais, tais
como difrao de raios-X, ressonncia magntica nuclear ou ento por modelagem por homologia. Hoje existem bancos de dados de estruturas tridimensionais de molculas de acesso
livre, como o Protein Data Bank (PDB)1 e bancos de dados de estruturas moleculares de molculas ligantes, como o Maybridge e a Cambridge Strutural Database (CSD).
3) Triagem in silico com virtual screening docking (esse procedimento no diferente da metodologia tradicional de triagem s cegas). A diferena que agora a busca de micromolculas
Doena
Identificao do
alvo molecular
Estrutura 3D
Triagem computacional
Banco de
compostos
Docking
Otimizao dos compostos
selecionados
Modificaes
estruturais
Testes clnicos
Frmaco
Figura 1. Fluxograma com as etapas bsicas do desenho racional de frmacos baseado em estrutura.
Fonte: Magalhes (2006).
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candidatas feita com os recursos computacionais, sem gasto de materiais e a tempo reduzidssimo.
4) Identificada uma molcula promissora, o prximo passo consiste na anlise por um profissional especialista para identificar as alteraes que sero necessrias na molcula para se obter
a resposta biolgica desejada. Modificaes subsequentes so realizadas para aprimorar a molcula ligante e torn-la mais especfica para um determinado alvo e ajustes farmacocinticos
como absoro, distribuio, metabolismo e eliminao. Nessa fase so utilizadas metodologias de docking mais acuradas, para a identificao da conformao de ligao das molculas
selecionadas e a otimizao dos compostos modificados estruturalmente por proposio do
especialista.
5) O penltimo passo consiste na sntese laboratorial da molcula candidata e teste in vitro.
6) Finalmente, so requeridos testes in vivo para a anlise do comportamento do frmaco e sua
toxidez (MAGALHES, 2006; MAGALHES et al., 2007).
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108
2002). H muitos anos tem-se testado o uso de inseticida contra os insetos-vetores desta bactria,
porm no houve suficiente eficcia.
Os mecanismos de virulncia da Xylella fastidiosa e a forma como esta interage com plantas
hospedeiras no so totalmente compreendidos. A explicao mais plausvel a formao de
agregados como biofilmes que, ao colonizar vasos do xilema, causa um bloqueio ao fluxo de
seiva e culmina nos sintomas da doena. Hopkins e Purcell (2002) sugeriram que a colonizao
e a patogenicidade da bactria Xylella fastidiosa que levam doena de Pierce esto estritamente
relacionadas com a sua capacidade de se movimentar dentro dos elementos de vaso do xilema, o
que permite a colonizao de outras regies da planta.
O projeto genoma da Xylella fastidiosa (SIMPSON et al., 2000) revelou a presena de genes que
codificam protenas envolvidas na biognese e funo do type IV pili (T4P). O Twitching motility
uma forma de movimento associado superfcie pelo qual as bactrias puxam-se rapidamente
ao longo das superfcies atravs de ciclos de polimerizao e despolimerizao do Pilus (T4P).
A energia necessria para o movimento fornecida por meio de hidrlise do ATP por protenas
chamadas PilB e PilT para montagem e desmontagem, respectivamente, do Pilus. A perda de funo da protena PilT ou da PilB resulta na ausncia deste tipo de motilidade, associada privao
da extenso ou retrao do pilus.
Essa inveno se refere a um mtodo para identificar regies-alvo existentes na interface de
monmeros constituintes da protena PilT, com o objetivo de desenhar molculas potencialmente aplicveis no comprometimento da atividade desta protena, controlando, assim, processos
infecciosos. O mtodo caracterizado pela:
1) Seleo de, pelo menos, uma sequncia de aminocidos constituidora de monmero de PilT.
2) Desenvolvimento de um modelo computacional tridimensional da estrutura homo-hexamrica
da PilT.
3) Anlise computacional para determinar os resduos de aminocidos formadores de interface
(IFR) e suas caractersticas fsicas, qumicas, fsico-qumicas e estruturais para todas as cadeias dos modelos de complexos hexamricos gerados.
4) Seleo das regies a serem usadas como alvos teraputicos e alvos teraputicos preferenciais
na interface entre os monmeros baseada na intensidade dos seguintes parmetros:
- Energia de contatos interfaciais.
- Exposio, em rea em complexo.
- Propensidade do aminocido-alvo em estabelecer pontes de hidrognio (como doador ou
aceptor).
- Propensidade do aminocido-alvo em estabelecer contatos de cunho eletrosttico.
- Preferencialmente, presena em pockets (em isolao ou em complexo).
- Preferencialmente, que estejam presentes somente em organismos-alvo em relao a organismos no patognicos.
5) Modelagem computacional para o desenho de molculas potencialmente capazes de efetuar
ligaes e/ou interaes entre regies-alvo dos monmeros (EMBRAPA INFORMTICA
AGROPECURIA, 2010).
A pesquisa resultou na patente da metodologia para identificao de alvos teraputicos especficos para o desenho de novos frmacos em estruturas modeladas da protena PilT da Xylella
109
110
Grande parte das doenas de plantas que causam prejuzos para a agricultura brasileira e mundial
causada por fungos fitopatognicos, e a maioria deles de solo. Seria importante a reduo do
potencial patognico destes fungos em reas infestadas. Uma medida que tem sido utilizada a
de incorporao de matria orgnica no solo, j que a introduo de antagonistas uma medida
de controle biolgico. Entretanto, o ndice de controle obtido com este mtodo, isoladamente,
est abaixo do necessrio para impedir danos cultura. O uso e desenvolvimento de cultivares
resistentes seria uma melhor opo de controle destas doenas; todavia, muitos hospedeiros no
apresentam resistncia a esses patgenos. A funcionalidade nem sempre possvel, devido inexistncia no mercado de cultivares com todas as caractersticas desejadas. Existem mtodos de
controle qumico contra os fungos fitopatgenos, como, por exemplo, o realizado, at h pouco
tempo, com um agrotxico de amplo espectro, o brometo de metila utilizado nos ltimos 60 anos
como fumigante de solo em pr-plantio. Embora altamente eficaz, rpido, de fcil penetrao no
solo, amplo espectro e baixa resistncia dos fungos, foi comprovado que este confere riscos para
o ambiente, para o homem e para a camada de oznio.
A inveno que descrevemos em seguida para ilustrar o trabalho do GPBC da Embrapa nessa
rea refere-se ao desenho computacional de novos compostos com potencial inibitrio para enzimas endopoligalacturonases (PG) de fungos fitopatognicos, com o intuito de evitar ou diminuir
a colonizao desses microrganismos nos tecidos vegetais. A PG integra um grupo de enzimas secretadas por microrganismos fitopatognicos durante o processo de invaso dos tecidos vegetais,
participando na catlise da hidrlise da pectina, culminando na desestruturao do arcabouo da
parede celular, o que favorece a invaso de hifas dos fungos. Uma gama de microrganismos fitopatognicos utiliza essas enzimas como fatores de patogenicidade que levam a doenas em uma
grande variedade de plantas de interesse econmico como o trigo, a cevada, o tomate, o morango,
a manga, o arroz, a cana-de-acar, dentre outros.
Com o objetivo de minimizar as perdas causadas por estes patgenos, foram desenhadas pequenas molculas planejadas (Figura 4) para se ligarem com alta afinidade aos resduos do stio de ligao ao substrato desses patgenos. O ligante dh3211 posicionado no stio-alvo da 1HG8 (PDB)
(Figura 5), o ligante que apresentou melhor resultado de interao entre os resduos especficos
de PG fngicas: D194, H188 e G305, tanto na 1HG8 quanto na 2IQ7. Possui grupos qumicos
que conferem polaridades diferentes para cada extremidade da estrutura desta molcula o que o
faz encaixar na regio do stio ligante e do cataltico atravs de complementaridade eletrosttica.
111
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A regio cataltica predominantemente negativa e na imagem aparece na cor vermelha; a regio ligante, majoritariamente positiva, aparece
na imagem como azul; as regies em rosa claro
so apolares.
Com o objetivo de diminuir as perdas agrcolas estocadas causadas pela ao de insetos, foram
desenhadas estruturas que se ligam alfa-amilase com alta afinidade terica. Na Figura 6 podemos identificar a trade cataltica da alfa-amilase do Tenebrio molitor (TMA, 1JAE.pdb) com
os resduos de Aspartato (D185 e D287) e Glutamato (E222) destacados em preto onde deve se
ligar as estruturas inibidoras da enzima. Dessa forma, os insetos cuja alfa-amilase foi inibida no
conseguem obter os resduos de acar necessrios para obteno de energia e, em consequncia,
morrem de privao energtica (EMBRAPA, 2012).
Figura 6. Viso da trade cataltica da alfa-amilase do Tenebrio molitor (TMA, 1JAE.pdb) com os resduos
de Aspartato (D185 e D287) e Glutamato (E222) destacados em preto. Imagem gerada pelo Molegro Virtual
Docker.
Fonte: Embrapa Informtica Agropecuria (2012a).
113
114
4 Consideraes nais
O planejamento e desenvolvimento de novos frmacos e agroqumicos, que servem para proteo
de plantas, animais e humanos, um processo bastante complexo e longo, demandando investimento contnuo para que se possa chegar ao resultado/produto com potencial para ser oferecido
ao mercado.
Convicta da importncia de o Brasil diminuir a dependncia de importao de matrias ativas
para a formulao de agro defensivo e passar a produzir no Pas esses princpios ativos, o Grupo
de Pesquisa em Biologia Computacional da Embrapa j deu os primeiros passos neste sentido
e patenteou algumas tecnologias com as quais se pode desenhar os compostos qumicos identificados com elevado potencial de atividade in silico contra alvos proteicos encontrados em
patgenos.
Agora, preciso avanar, na direo da sntese desses compostos desenhados, acompanhado de
ensaios in vitro e in vivo, devendo, necessariamente, ocorrer uma interao permanente e retroalimentar entre o desenvolvimento in vitro e in vivo com a anlise terica (in silico) no sentido
de aperfeioar o desenho do agro defensivo.
O produto desse esforo ser um inventrio de novos agroqumicos e frmacos que pode ser
um dos mais importantes desafios perante o agronegcio do pas, representando um dos fatores fundamentais de conquista de vantagem competitiva no mercado internacional em futuro
prximo.
No final deste caminho, ser necessrio investir esforos no preparo do processo de produo
dos novos compostos qumicos em escala piloto e, posteriormente, em larga escala industrial.
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117
Parte
III
Captulo
121
TIC em agrometeorologia e
mudanas climticas
1 Introduo
A agricultura a atividade econmica mais dependente das condies climticas. Alm de influenciar o crescimento, o desenvolvimento e a produtividade das culturas, o clima afeta tambm
a relao das plantas com insetos e microrganismos, favorecendo ou no a ocorrncia de pragas
e doenas (SENTELHAS; MONTEIRO, 2009). Muitas prticas agrcolas de campo, como o
preparo do solo, a semeadura, a adubao, a irrigao, as pulverizaes, a colheita, dentre outras,
dependem tambm de condies especficas de tempo e de umidade no solo, para que possam
ser realizadas de forma adequada (PEREIRA et al., 2002).
A preocupao crescente com o aumento da populao mundial, com a degradao dos recursos
naturais, com as mudanas climticas e com a sustentabilidade da agricultura tem exigido esforos no desenvolvimento de prticas agrcolas mais sustentveis, inclusive a partir do melhor
entendimento das relaes entre a agricultura e o clima. Por isso, instituies governamentais,
ligadas agricultura e ao meio ambiente, tm buscado desenvolver ferramentas de informaes
agrometeorolgicas que auxiliem no planejamento e no processo de tomada de deciso na produo agrcola, buscando maior produtividade, maior resilincia dos sistemas produtivos e menor
impacto ambiental (SIVAKUMAR; MOTHA, 2007).
Informaes agrometeorolgicas so aquelas que consideram os dados meteorolgicos associados s necessidades dos cultivos e dos rebanhos, com o objetivo de estimar os respectivos
impactos sobre estes, bem como sobre as prticas agrcolas. Por isso, os servios de meteorologia
e agrometeorologia tm muito a contribuir com a economia de seus respectivos pases, por meio
da divulgao e do uso eficiente de tais informaes (RIJKS; BARADAS, 2000). De acordo com
Sentelhas e Monteiro (2009), as informaes agrometeorolgicas podem ser classificadas em trs
graus ou nveis. As informaes so de primeiro grau, quando so dados meteorolgicos puros ou
derivados de clculos simples, como o balano hdrico. De segundo grau, quando so produzidas
a partir de dados meteorolgicos e parmetros especficos da cultura, indicando o estado ou a
resposta da cultura condio meteorolgica observada. De terceiro grau quando indicam, alm
do estado ou resposta da cultura, a ao de manejo correspondente.
Nesse contexto, os recursos da rea de tecnologia da informao (TI) vm ampliando continuamente as possibilidades do monitoramento meteorolgico, melhorando aplicaes para transmis-
122
so, armazenamento e anlise de dados, assim como para a produo e difuso de informaes
de forma didtica e acessvel.
2 Monitoramento agrometeorolgico
O monitoramento agrometeorolgico consiste na coleta sistemtica e contnua de dados meteorolgicos para a produo de informaes de interesse ou uso agrcola. Sistemas que integram
de forma coordenada e simultnea as funes de coleta, transmisso e processamento de dados
podem fornecer informaes agrometeorolgicas atualizadas em tempo quase real.
Existem vrias prticas agrcolas que podem se beneficiar de informaes agrometeorolgicas,
destacando-se: o preparo do solo, a semeadura, a adubao, a irrigao, o controle fitossanitrio, a colheita etc. Estimativas de produtividade, de qualidade da produo e de favorabilidade
ocorrncia de doenas tambm necessitam de dados meteorolgicos. Por isso, informaes
atualizadas so essenciais para o processo de tomada de deciso, ou seja, para a converso das
informaes disponveis em uma determinada ao visando maximizar a produtividade ou melhorar o aproveitamento de insumos. Decises corretas representam maior eficincia e eficcia
do sistema produtivo (SENTELHAS; MONTEIRO, 2009).
Atualmente, o Brasil conta com diversos sistemas de informaes agrometeorolgicas em operao, disponibilizando, basicamente, as informaes de primeiro grau e algumas de segundo
grau. Os mais conhecidos so o Agritempo1, da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria
(Embrapa) e o Sisdagro2, do Instituto Nacional de Meteorologia (Inmet), ambos de abrangncia
nacional, o Ciiagro3, do Instituto Agronmico de Campinas (IAC), no Estado de So Paulo, o
Sistema de Informaes Agrometeorolgicas do Instituto Agronmico do Paran (Iapar)4, no
Estado do Paran. Existem, ainda, outros exemplos, como o Centro de Informaes de Recursos
Ambientais e de Hidrometeorologia de Santa Catarina (Ciram)5 e a Fundao Cearense de
Meteorologia e Recursos Hdricos6. Nestes sistemas, as informaes contemplam diversos aspectos dos efeitos do tempo e clima na agricultura que auxiliam na previso de safra, na definio
das melhores pocas de plantio, na indicao das condies para manejo do solo, para irrigao
e controle fitossanitrio.
Uma das caractersticas em comum desses sistemas que seu principal veculo de distribuio
de informaes so stios na rede mundial de computadores. Desde o seu surgimento at o presente, a internet evoluiu rapidamente para se tornar um dos principais meios de comunicao do
mundo contemporneo. Vrias vantagens comparativas levaram a isso como, por exemplo, os
baixos custos, a interatividade, a possibilidade de integrao de recursos audiovisuais, recursos
grficos, aplicativos e, em muitos pases e regies, ampla cobertura. No Brasil, no entanto, a
internet ainda apresenta disponibilidade muito restrita para o grande pblico, tanto pela falta
de cobertura nos locais mais distantes dos grandes centros urbanos quanto pela dificuldade de
acesso pelas classes mais baixas. o que indica a pesquisa TIC Domiclios, realizada entre
2013 e 2014 pelo Centro de Estudos sobre as Tecnologias da Informao e da Comunicao
(COMIT GESTOR DA INTERNET NO BRASIL, 2014). De acordo com a pesquisa, nas reas
urbanas, a proporo de lares com acesso internet de 48%, enquanto que nas reas rurais
de 15%.
Outra caracterstica em comum dos sistemas de informaes agrometeorolgicas citados o uso
da TI no gerenciamento de bancos de dados, no processamento de dados e na produo da informao, seja na forma de grficos, mapas ou textos. Atualmente, no mais possvel dissociar os
servios de monitoramento agrometeorolgico do uso intensivo de recursos de TI.
Dentre os sistemas citados, o Agritempo (EMBRAPA INFORMTICA AGROPECURIA,
2014) no possui uma rede prpria de estaes meteorolgicas de monitoramento. Na realidade, ele integra, em uma nica base, os dados das redes de estaes meteorolgicas de diversas
instituies diferentes, nacionais e estaduais (Inmet, CPTEC, ANA, Cemig, entre outras). Com
isso, o sistema consegue compor uma base de dados com maior densidade de pontos de observao e com abrangncia nacional. Operando desde 2003, o sistema foi atualizado em 2014 para
uma verso mais interativa, com mais funcionalidades e de acordo com o conceito de Web 2.0
e com a opo de acesso por meio de dispositivos mveis. Algumas das tecnologias envolvidas
no desenvolvimento da primeira verso do sistema Agritempo foram mantidas, como o Sistema
Gerenciador de Banco de Dados PostgreSQL7 e a linguagem Java. Por outro lado, outras como
Ajax8 e o framework DojoToolkit9 foram incorporadas nova verso. O uso da tecnologia Ajax
permitiu tornar as pginas na internet mais interativas, utilizando requisies assncronas para
recuperao de informaes. J o framework DojoToolkit foi utilizado para facilitar o desenvolvimento de interfaces para pginas de internet multiplataforma.
As principais funcionalidades do sistema Agritempo esto agrupadas em Monitoramento e
Previso. Na categoria de Monitoramento, diversas variveis medidas e calculadas podem ser
visualizadas de forma espacializada, como os mapas nacionais apresentados na Figura 1. As mesmas variveis podem tambm ser visualizadas em mapas estaduais, com maior detalhamento. As
variveis espacializadas medidas e calculadas so: estiagem, estiagem agrcola, disponibilidade
de gua no solo, necessidade de reposio por chuva, precipitao, evapotranspirao, temperatura mnima, mxima e mdia.
Na categoria de Previso, as variveis e indicadores derivados so obtidos a partir de modelos
meteorolgicos de previso do tempo, com condies previstas com at dois dias de antecedncia
(48h), como ilustrado na Figura 2. Dessa forma, a partir de uma consulta ao sistema, o usurio
pode decidir e planejar a execuo ou no de determinadas atividades agrcolas para os prximos
dois dias. As principais variveis e informaes derivadas da Previso do Tempo disponveis
para consulta no sistema Agritempo so: condies para tratamento fitossanitrio, necessidade
de irrigao, condies para manejo do solo, condies para colheita, precipitao e temperatura
mnima, mxima e mdia.
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Figura 1. Dados mdios de temperatura mxima e disponibilidade de gua no solo nos cinco dias anteriores
consulta em 26/09/2014.
Fonte: Embrapa Informtica Agropecuria (2014).
necessidade de reposio por chuvas, temperaturas mximas, mnimas e mdias, localizao das
estaes meteorolgicas.
Figura 2. Estimativas de necessidade de irrigao e condies para manejo do solo estimados a partir de
dados de previso do tempo.
Fonte: Embrapa Informtica Agropecuria (2014).
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automaticamente o clculo dos mapeadores atravs das mquinas do cluster, conforme ilustrado
na Figura 4.
Figura 4. Arquitetura de software do
sistema computacional SCenAgri.
No Brasil, um dos mtodos de zoneamento mais difundido o baseado na quantificao de riscos climticos. Esse zoneamento consiste na espacializao das informaes de risco, baseado
em anlises de frequncia que retornam a probabilidade de ocorrncia de condies especficas.
Essas anlises de frequncia consideram sries de dados meteorolgicos medidos por um perodo longo o suficiente para que seja representativo da variabilidade natural das condies locais
analisadas.
Atualmente, o Ministrio da Agricultura Pecuria e Abastecimento (Mapa) do Brasil utiliza o
Zoneamento Agrcola de Risco Climtico (Zarc) como um instrumento de poltica agrcola e
gesto de riscos na agricultura. O estudo elaborado com o objetivo de minimizar os riscos
Por fim, uma interface web flexibiliza o acesso ao sistema por parte do usurio, que pode realizar novas simulaes e recuperar resultados obtidos anteriormente. Atualmente, este sistema
restrito para atividades de pesquisa ligadas programao da Embrapa. Fazendo uso dos dados
estimados de modelos de projees climticas futuras, este sistema vem atendendo s necessidades de diversos estudos e avaliaes de impacto sobre mudanas climticas na agricultura.
4 Zoneamento agroclimtico
Dentre as informaes agrometeorolgicas empregadas na fase de planejamento agrcola, o zoneamento agroclimtico a de uso mais difundido no Brasil.
Para se alcanar uma produtividade econmica cada cultura necessita de condies favorveis
durante todo o seu ciclo vegetativo, isto , exigem determinados limites de temperatura nas vrias
fases do ciclo, de uma quantidade mnima de gua, e de um perodo seco nas fases de maturao
e colheita. Um zoneamento agroclimtico consiste na determinao da aptido climtica das
Figura 5. Zoneamento agroclimtico para o cultivo de pinho manso (Jatropha curcas L.) no Estado de
Minas Gerais, considerando necessidades hdricas e trmicas da cultura.
Fonte: Yamada (2011).
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sempre esteve relacionada e se beneficiou diretamente da evoluo dos recursos das tecnologias
de informao e comunicao disponveis.
Uma ferramenta de TI que merece destaque e se tornou comum nos ltimos anos so os sistemas
de informaes geogrficas (SIG), cada vez mais usados para a distribuio, processamento,
anlise, modelagem de dados espaciais, sendo aplicados em diversas reas. Na elaborao de
zoneamentos agroclimticos, em particular, tm sido til pois muitos softwares dessa classe
de sistemas podem executar procedimentos diversos a partir de dados bsicos e gerar informaes georreferenciadas na definio de reas propcias ao cultivo de determinadas culturas
(YAMADA, 2011).
Entre as anlises espaciais do SIG possvel calcular a regresso por meio da interpolao dos
dados de probabilidades de ocorrncia da varivel climtica em questo para todos os outros
pontos onde no h estaes meteorolgicas usando-se as relaes existentes entre a varivel
em questo, a latitude, a longitude, e a altitude (por ex. imagens SRTM como modelos digitais
de elevao do terreno) para cada um dos pixels existentes no mapa, obtendo-se assim valores
estimados para todas as localidades da regio representada com informaes a respeito do comportamento espacial da varivel (ASTOLPHO, 2003; CMARA; MEDEIROS, 1998).
Figura 6. Classificao de pocas de semeadura em relao ao risco hdrico cultura da soja no estado do
Paran, em nove pocas de semeadura, para cultivar precoce (120 dias) e solo de mdia reteno de gua
(CAD= 50 mm).
Fonte: Farias et al. (2001).
No mbito dos assuntos relativos a zoneamento, um dos recursos disponibilizados pelo Simulador
de Cenrios Agrcolas (SCenAgri), j descrito no tpico Anlise de Risco, a gerao de mapas
com dados espacializados a partir dos resultados da anlise de risco para deficincia hdrica.
Dessa forma, possvel identificar os municpios de alto e baixo risco quanto ao suprimento
hdrico, para datas de plantio a intervalos decendiais, seguindo os mesmos critrios atualmente
adotados na metodologia do Zoneamento Agrcola de Risco Climtico (Zarc) (Figura 7).
Figura 7. Zoneamento de risco por deficincia hdrica para a cultura da canola para o perodo de dados
1961-1990, gerado pelo Sistema SCenaAgri/Embrapa, considerando ciclo mdio de 125 dias, CAD de 60
mm, e plantio no primeiro decndio de janeiro.
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O SCenAgri foi criado para permitir a vinculao de conjuntos de dados histricos ou de projees futuras - como as geradas pelos modelos de circulao geral da atmosfera - ao prprio
modelo do Zarc e de outros modelos semi-empricos ou determinsticos para a simulao de
cenrios agrcolas futuros. Isto tem permitido, por meio dos resultados tabulares e espaciais do
SCenAgri, avaliar os possveis impactos que as mudanas climticas tero sobre o Zarc e sobre
as culturas agrcolas em geral (Figura 8).
Figura 8. Zoneamento de risco por deficincia hdrica para a cultura da canola para projees futuras
2041-2070 (modelo ETA, inicializao HadGen2ES RCP 4,5), gerado pelo Sistema SCenaAgri/Embrapa,
considerando ciclo mdio de 125 dias, CAD de 60 mm, e plantio no primeiro decndio de janeiro.
escala, viabilizando o uso de dados, informaes e sistemas nas cadeias produtivas agropecurias
e nas instituies que coordenam as aes produtivas. A agricultura torna-se, desta forma, uma
atividade intensiva em conhecimentos, complementando os recursos de capital, trabalho e terras
tradicionalmente utilizados.
Na pesquisa cientfica h um uso bastante ampliado de modelos (PIDD, 2010). Os modelos mais
teis capturam a essncia do conhecimento disponvel sobre o fenmeno, podendo ser manipulados e ajustados a um custo substancialmente menor que a experimentao. Essas estruturas
analticas podem incorporar conhecimentos gerais e especficos, partindo das definies de componentes e de seu relacionamento no sistema representado. A modelagem torna-se, desta forma,
um mtodo para analisar um fenmeno em bases qualitativas e quantitativas, em que exerccios
mentais so utilizados. O esforo de modelagem torna-se tambm um esforo de aprendizado,
o que facilita muito a difuso de conhecimentos. A utilidade da modelagem tambm est na
especificao da informao de interesse final. Ao se perseguir a utilidade para a tomada de
decises e desenvolver mtodos computacionais eficientes, todo o conjunto de informaes e
conhecimentos incorporados no modelo geram um produto de maior facilidade de comunicao.
Dessa forma, as tecnologias de informao e comunicao proporcionam recursos importantssimos para a viabilizao do conhecimento cientfico da atualidade, tanto na agricultura como em
outras reas do conhecimento.
A modelagem um fenmeno alavancado com a produo de grandes volumes de informaes e
capacidade de processamento, permitindo o teste de hipteses e verificao da validade de teorias
fundamentais (PIDD, 2010). O estudo do relacionamento entre as variveis, o entendimento dos
problemas de interesse e a explorao de dados tornam os modeladores potencialmente melhores, estabelecendo mais claramente relaes de causa e efeito e lgicas. Este aspecto crucial
para a agricultura. A modelagem tambm uma das melhores maneiras de especificar demandas
adicionais de informaes, em um processo custoso, que efetivamente ocorre quando h um uso
justificado para atender a demanda de um usurio ou criar uma forma inovadora de encarar um
problema.
A modelagem agroambiental, por exemplo, tem sido sensvel demanda de informaes para
gesto de polticas pblicas. Informaes sobre relevo, classes de cobertura vegetal e uso das
terras, alm do mapeamento dos solos, so utilizadas em zoneamentos de risco climtico, agroecolgicos e ecolgico-econmicos, estabelecendo as bases para a gesto territorial. Os modelos
agrometeorolgicos tm concentrado esforos de especialistas na caracterizao de elementos do
clima, dos solos, do manejo agropecurio e da fisiologia das culturas, tornando-se uma ferramenta essencial para o conhecimento do clima, para o zoneamento agrcola com a identificao das
melhores regies e pocas de cultivo; para o monitoramento agrometeorolgico com diversas
aplicaes, desde a favorabilidade ocorrncia de doenas, ao manejo de irrigao; e para projetar os impactos das mudanas climticas na agricultura.
Em um sistema de produo real, outros elementos interferem diretamente nas possibilidades
de produo, como mquinas, recursos naturais e elementos de integrao da agricultura com
cadeias produtivas, mercados e as instituies de um pas. Uma fronteira essencial neste contexto
a integrao de conhecimentos e modelos biofsicos e econmicos. As pesquisas bsica e aplicada buscam relaes lgicas essenciais para objetivos especficos, evitando-se a introduo de
elementos desnecessrios para a compreenso de um sistema e tomada de deciso.
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devem ter sua robustez verificada em diferentes cenrios de mudanas climticas. Isto implica a
busca por solues de armazenamento, recuperao, processamento, transmisso e visualizao
de grandes volumes de dados, requerendo mtodos sofisticados.
No Brasil h carncia de anlises que considerem custos e benefcios de aes de adaptao s
mudanas climticas mais especficas. necessrio continuar a trabalhar com o tema e a oferecer
alternativas para produtores rurais e formuladores de polticas pblicas. Em uma perspectiva de
aliar estratgias de mitigao como externalidades positivas, Seo (2013) defende que adaptaes
inteligentes, que reduzem os danos do aquecimento global e as emisses de carbono ao mesmo
tempo, devem ser enfatizadas nas opes polticas. Adaptaes inteligentes envolvem ativamente
o setor pblico, coordenando a sociedade na elaborao de estratgias.
desejvel, diante das demandas acima, que estudos como os realizados por Pinto e Assad
(2008) sejam ampliados e utilizados na discusso sobre os fatores que determinam a vulnerabilidade dos sistemas produtivos. A construo da capacidade de resposta dos atores depende de
informaes consistentes, que convenam os envolvidos das solues mais robustas de produo
diante das incertezas do clima futuro. A gesto do risco, quantificado a partir de bons contedos e
sistemas de informaes, depende de um esforo crtico de modelagem econmica, caracterizando o manejo e alternativas de produo de alimentos. Linhas distintas de modelagem climtica,
biofsica, agroambiental e econmica esto desenvolvendo ferramentas para tratar dos impactos
de mudanas climticas, e esforos de produo tcnica e intercomparao de modelos devem ser
o caminho para a pesquisa na rea. A melhoria dos modelos promissora, enfrentando desafios
como incorporar os efeitos de eventos climticos extremos e integrar elementos econmicos e
ambientais aos aspectos tcnicos da produo.
Segundo Antle e Capalbo (2001), modelos de avaliao integrada, que utilizam modelos disciplinares interligados para avaliar sistemas complexos, naturais e humanos, esto se tornando uma
metodologia padro de anlise em questes ambientais. A avaliao integrada utiliza simulaes
do comportamento de um sistema biofsico e as introduz em modelos econmicos. Segundo
Kauffmann e Snell (1997), por exemplo, existe uma alternativa de modelagem que combina resultados de modelos estatsticos para a produtividade observada com informaes de modelos de
culturas. Esta opo de modelagem est sendo desenvolvida em um projeto de intercomparao
de modelos na Embrapa, o AgMIP-BR. Tambm esto em desenvolvimento modelos derivados
dos trabalhos de Mendelsohn e Dinar (2009), compreendendo as escolhas de insumos, produtos
e os impactos derivados na renda e nos preos das terras.
Cada abordagem tem suas vantagens no entendimento do efeito de mudanas climticas.
Contudo, a maior incerteza nos estudos o escopo da adaptao. A adaptao no observada,
mas existe efetivamente na realidade, e contingenciada por uma srie de escolhas. A adaptao
toma um tempo longo para realizao e, portanto, a evidncia direta s surge aps longos perodos de tempo em condies estveis. No caso do Brasil, no entanto, as transformaes recentes
dos sistemas agroindustriais criam uma estrutura de produo sem comparao com o passado
distante, que muda as possibilidades para o futuro.
O Simulador de Cenrios Agrcolas (SCenAgri), j descrito no tpico 3. Anlise de Riscos
Climticos na Agricultura e 4. Zoneamento Agroclimtico, um sistema de TIC que foi criado
para permitir a vinculao de conjuntos de dados histricos ou de projees futuras - como as
geradas pelos modelos de circulao geral da atmosfera - ao prprio modelo do Zarc e de outros
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DEAN, J.; GHEMAWAT, S. MapReduce: simplified data processing on large clusters. Communications of the ACM,
New York, v. 51, n. 1, p. 107-113, Jan. 2008. Disponvel em: <http://doi.acm.org/10.1145/1327452.1327492>. Acesso
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DOORENBOS, J.; PRUITT, W. O. Guidelines to predicting crop water requirements. Rome: FAO, 1977. 155 p.
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7 Consideraes nais
A Tecnologia da Informao e Comunicao (TIC) um dos componentes mais importantes do
ambiente da Pesquisa, Desenvolvimento e Inovao (PDI) atual, e as organizaes brasileiras
tm utilizado ampla e intensamente essa tecnologia, tanto em nvel estratgico como operacional.
No mbito da PDI em agrometeorologia e mudanas climticas, assim como em outros temas de
relevncia nacional, a Embrapa Informtica Agropecuria ocupa uma posio muito favorvel
produo de conhecimento e de inovao por estar capacitada a atuar no desenvolvimento de
sistemas e aplicaes especficas de TI que, apesar de necessrias, seriam inviveis para outras
organizaes.
A Embrapa Informtica Agropecuria compreende que um esforo significativo de anlise dos
sistemas produtivos, obteno, armazenamento, recuperao e processamento dos dados obtidos
deve ser a base para muitas atividades tcnico cientficas. Por isso, alm dos esforos de construir
uma equipe de desenvolvimento de software, alia competncias multidisciplinares para executar
as anlises da realidade e escolher os melhores caminhos para a construo dos sistemas que a
agricultura demanda.
8 Referncias
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Economics, Saint Paul, v. 71, n. 5, p. 1272-1279, 1989.
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- Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de So Paulo, Piracicaba. Disponvel em: <http://www.
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Captulo
139
Tecnologias da informao
aplicadas aos dados geoespaciais
1 Introduo
A dimenso espacial permeia, direta ou indiretamente, uma srie de temas relacionados ao agronegcio, sendo um fator essencial que deve sempre ser considerado nas diferentes atividades
de pesquisa nos mais variados domnios. A avaliao de riscos climticos, o levantamento, a
caracterizao e o monitoramento de recursos naturais, o mapeamento do uso e cobertura da terra, as anlises socioeconmicas, os zoneamentos e a avaliao de cenrios so alguns exemplos
de atividades nas quais a pesquisa geoespacial fundamental. A anlise de dados geoespaciais,
produzidos a partir das geotecnologias, pode ser vista como uma das etapas de um processo de
diagnstico cientfico que, a partir da formulao de um problema, define um plano de execuo,
orienta a coleta e a integrao de dados relevantes, define estratgias de anlise e d suporte para
a compreenso de fenmenos naturais ou antrpicos e a tomadas de deciso.
Nesse cenrio, h uma gama de dados geoespaciais produzidos por diferentes tcnicas e propsitos, e por distintos perfis de usurios. Existe um aumento sem precedentes na produo e na
disponibilidade de tais dados, provenientes da maior quantidade de dispositivos sensores, pela
adoo cada vez maior de padres para representao de dados geoespaciais que viabilizam o
seu compartilhamento, e pelo nmero crescente de dispositivos mveis que favorecem a coleta
georreferenciada dos mais diferentes tipos de dados. Alm do enorme volume de informaes, o
contexto atual na produo destes dados georreferenciados caracterizado pela velocidade em
que eles so produzidos e pela sua redundncia.
Em contrapartida a esse crescimento da quantidade de dados, a sua capacidade de tratamento e
anlise integrada permanece associada a paradigmas caracterizados pela baixa escalabilidade,
baixas capacidades de reso e repetio, representados por solues apoiadas em Sistemas de
Informaes Geogrficas (SIGs) de uso local ou solues para geoprocessamento individuais.
No contexto do tratamento de dados geoespaciais, esse cenrio gera impactos importantes, uma
vez que esses dados so a base para o desenvolvimento e a integrao de diferentes pesquisas
multidisciplinares.
A necessidade de tratamento eficiente desse volume de dados geoespaciais tem promovido uma
mudana no paradigma na construo de aplicaes cientficas, incentivando o surgimento de
novas plataformas e ferramentas caracterizadas pela capacidade de processamento intensivo de
dados e escalabilidade dinmica. Novas solues para a construo de aplicaes em geopro-
140
entre outras, so classificadas como geotecnologias. Quando uma informao geoespacial derivada de uma ou mais geotecnologias, ela denominada geoinformao ou geodado. Por fim, o
processo de aplicao de uma ou mais geotecnologias para adquirir, processar, visualizar, analisar e/ou disponibilizar dados espacialmente referenciados, com o intuito de gerar geoinformao,
denominado geoprocessamento.
2.1 O GPS
Entre as geotecnologias de aquisio dos dados geoespaciais est o GPS. O GPS, tambm conhecido por Navigation System for Timing and Range (Navstar), foi idealizado na dcada de 70
pelo Departamento de Defesa norte-americano, mas tornou-se totalmente operacional somente
em 1995. Trata-se de uma constelao de satlites dispostos em rbitas especficas que fornece
a um aparelho receptor sua posio geogrfica em qualquer parte do planeta. Seu uso para fins
civis se intensificou a partir do ano 2000, quando a disponibilidade seletiva, artifcio que intencionalmente degradava o sinal para usos no militares, foi desativada, reduzindo os erros de
posicionamento. Apesar de no ser o nico sistema de posicionamento global - existem tambm
o Galileu (europeu), Glonass (russo) e BeiDou (chins) - o GPS o sistema utilizado pela maior
parte dos receptores. Com a reduo do custo desses equipamentos, eles esto presentes em um
nmero cada vez maior de dispositivos mveis, como telefones celulares, tablets e relgios. A
presena do GPS e das redes de acesso Internet nos dispositivos mveis tem provocado uma
revoluo tecnolgica, trazendo uma srie de benefcios aos seus usurios. Nas grandes cidades,
j comum o uso de aplicativos em dispositivos mveis desenvolvidos para as pessoas localizarem o txi mais prximo e solicitar uma corrida, possibilitando ao passageiro a visualizao de
informaes detalhadas sobre o veculo, bem como um perfil com foto e avaliaes do taxista que
pretende chamar. Existe ainda uma gama de aplicativos que, em conjunto com as informaes
de localizao geogrficas providas pelo GPS e das informaes das redes mveis de Internet,
auxiliam as pessoas a encontrar a melhor rota para escapar do trnsito, o posto de gasolina mais
prximo para abastecer o seu veculo, a localizao de uma pizzaria nas redondezas, etc.
2.2. O sensoriamento remoto
importante caracterizar esses termos. Dados geoespaciais, tambm denominados dados geogrficos, pertencem a uma classe particular de dados espaciais, uma vez que eles descrevem
fatos, objetos e fenmenos do globo terrestre associados sua localizao sobre a superfcie terrestre, num certo instante ou perodo de tempo (CMARA et al., 1996). Os dados geoespaciais
se distinguem essencialmente dos demais pela sua componente espacial, que associa a cada entidade ou fenmeno, uma localizao traduzida por um sistema geodsico de referncia terrestre.
O processo de aquisio, visualizao, processamento, anlise e/ou disponibilizao de dados
geoespaciais realizado a partir de uma categoria especial de tecnologia, denominada geotecnologia. Neste contexto, tecnologias como o sensoriamento remoto, o Global Positioning System
(GPS), a topografia, os Sistemas de Informaes Geogrficas, os bancos de dados geogrficos,
Outra geotecnologia de aquisio de dados geoespaciais o sensoriamento remoto, que pode ser
entendido como um processo de obteno de imagens e dados da superfcie terrestre por meio da
captao e registro da energia eletromagntica refletida ou emitida pela superfcie, sem que haja
contato fsico entre o elemento sensor e o alvo. O sensoriamento remoto pode se dar nos nveis
terrestre, suborbital e orbital, sendo esse ltimo o mais comum, onde os sensores imageadores
ficam a bordo de satlites em altitudes que variam de 400 a 36.000 km. Existe um conjunto de
princpios fsicos que define uma base terica necessria ao entendimento das imagens de satlite, as quais no podem ser meramente chamadas de fotografias, uma vez que so obtidas a
partir de sensores, denominados radimetros, capazes de captar a energia refletida e/ou emitida
pela superfcie terrestre em diferentes comprimentos de onda do espectro eletromagntico, no
apenas no visvel.
Uma imagem de satlite oriunda de sensores que apresentam quatro tipos de resoluo:
a) Espacial, que define o tamanho do pixel da imagem e que representa a capacidade do sensor
distinguir objetos.
b) Temporal, relacionada ao tempo de revisita do sensor a um mesmo local na superfcie terrestre.
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c) Espectral, que define as larguras e quantidades de faixas espectrais que o sensor capaz de
enxergar; e
d) Radiomtrica, relacionada capacidade do sensor em distinguir diferentes nveis digitais, ou
seja, a eficincia do sistema em detectar e registrar diferenas na energia refletida e/ou emitida
pelos elementos.
Atualmente existe uma gama de produtos oriundos do sensoriamento remoto orbital, com as
mais variadas resolues espectral, temporal, radiomtrica e espacial, cuja utilidade depende
de sua aplicao. Por exemplo, satlites meteorolgicos, como o Geostationary Operational
Environmental Satellite (Goes) e o National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA),
apresentam baixa resoluo espacial (4,0 km e 1,0 km, respectivamente), mas oferecem altssima resoluo temporal (15 minutos e 12 horas, respectivamente). Tais caractersticas fazem
todo o sentido quando o objetivo monitorar o deslocamento de nuvens ou estimar a presena
de frentes frias e massas de ar quente em escala continental, fenmenos que demandam pouco
detalhamento espacial, mas alta periodicidade de informaes. Por outro lado, se o objetivo
monitorar, por exemplo, mudanas do uso e ocupao da terra em uma cidade ou identificar
focos de desflorestamento na Amaznia, essas imagens tero pouca utilidade. Para esses outros
casos, devem ser utilizadas imagens provenientes de sensores com maior detalhamento espacial
que, em alguns casos, chega a nveis submtricos; em contrapartida, sua periodicidade menor,
chegando a dias ou at semanas.
As primeiras pesquisas envolvendo o uso das imagens de satlites no monitoramento de recursos naturais terrestres ocorreram na dcada de 70, sobretudo a partir do programa Resources
Technology Satellite (ERTS), que em 1975 passou a se chamar Landsat. Trata-se do programa
mais bem sucedido de desenvolvimento de satlites de observao de recursos naturais terrestres,
implementado pela National Aeronautics and Space Administration (Nasa), e em operao at
hoje com o Landsat-8, lanado em fevereiro de 2013. Atualmente, as pesquisas envolvendo o uso
de imagens de satlite encontram-se em um patamar cientifico elevado, no s pela diversidade
de dados, mas principalmente pela poltica de disseminao e compartilhamento livre dessas
informaes pela internet, o que estimula seu uso nas mais variadas reas do conhecimento. O
Brasil foi um dos precursores dessa poltica de liberao de imagens, pelo Instituto Nacional
de Pesquisas Espaciais (Inpe), que desenvolveu um catlogo de imagens com mecanismos de
buscas simples, com o objetivo de disseminar e estimular o uso das imagens do satlite CBERS
(China-Brazil Earth Resources Satellite), fruto da parceria tcnico-institucional com a China.
Outros exemplos dessa poltica podem ser encontrados em repositrios dos Estados Unidos,
como no caso da gama de produtos pr-processados do sensor Moderate Resolution Imaging
Spectroradiometer (Modis), e no caso das imagens do programa Landsat. Tambm so encontrados repositrios da Comunidade Europeia, como no caso de alguns produtos derivados do
programa Satellite Pour lObservation de la Terre (Spot).
Uma das tecnologias responsveis pela popularizao do sensoriamento remoto o Google
Earth, um programa de computador desenvolvido e distribudo pela Google, cuja funo
apresentar um modelo tridimensional do globo terrestre, construdo a partir de um mosaico de
imagens de satlite obtidas de diversas fontes, em diversas resolues. Apesar de no ter sido
o pioneiro neste tipo de servio (o primeiro foi o Nasa World Wind), o Google Earth est em
constante evoluo, levando aos usurios um conjunto de inovaes nunca antes vista, que inclui
atualizaes regulares da base de imagens, a integrao com outras bases cartogrficas e outras
funcionalidades.
2.3. O Sistema de Informaes Geogrficas
Considerando as geotecnologias para visualizao, anlise e tratamento dos dados geoespaciais,
destacam-se os Sistemas de Informaes Geogrficas (SIG), cujo nome vem do termo em ingls
Geographic Information System (GIS). Existem diversas definies sobre o que so SIGs, desde
as mais complexas s mais simples. Pires et al. (1994) definem SIG como um sistema que realiza
o tratamento computacional de dados geoespaciais, armazenando, gerenciando e recuperando informaes. Estes sistemas so muito utilizados em ambientes de deciso, provendo aos usurios
facilidades de combinar as informaes de uma determinada regio. A principal diferena entre
um SIG e um sistema de informao convencional sua capacidade de armazenar tanto os atributos descritivos dos dados, quanto as geometrias dos diferentes tipos de dados geogrficos. As
principais caractersticas de SIGs so: inserir e integrar, numa nica base de dados, informaes
espaciais textuais e outras fontes de dados como imagens de satlite e dados de GPS; e oferecer
mecanismos para combinar as vrias informaes, por meio de algoritmos de manipulao e anlise, bem como para consultar, recuperar e visualizar o contedo da base de dados geogrficos.
Do ponto de vista computacional, os dados geoespaciais podem ser representados dentro de um
SIG a partir de dois modelos principais: o vetorial e o matricial (tambm chamado raster). No
modelo vetorial, a apresentao de um elemento ou objeto uma tentativa de reproduzi-lo da
forma mais precisa possvel do ponto de vista geomtrico. Neste tipo de representao, qualquer
entidade ou elemento grfico de um mapa reduzido a trs formas bsicas: pontos, linhas e
polgonos. J o modelo de representao matricial consiste no uso de uma malha quadriculada
regular sobre a qual se constri, clula a clula, o elemento que est sendo representado. A cada
clula, atribui-se um cdigo referente ao atributo estudado, de tal forma que o computador saiba
a que elemento ou objeto pertence determinada clula (CMARA et al., 2001). A Figura 2 ilustra
como uma rea do mundo real pode ser representada a partir dos modelos vetorial e matricial.
Mundo real
Vetorial
Matricial
Figura 2. O mundo real e sua representao computacional a partir dos modelos vetorial e matricial.
Fonte: Adaptado de Satar (2014).
143
144
Para que a informao geogrfica seja tratada usando um computador, necessria a sua representao computacional, ou seja, a adoo de estruturas e arquivos que representem essa
informao no mundo computacional. Por exemplo, como representar uma determinada rea
florestal que est sendo alvo de desflorestamento? Diferentemente dos dados tradicionais, constitudos basicamente de atributos descritivos como nome, data e descrio, a representao de um
dado geoespacial requer, tambm, a descrio de sua forma geomtrica associada sua posio
geogrfica. Assim, usando os relacionamentos espaciais, torna-se possvel executar diferentes
anlises considerando as caractersticas espaciais dos elementos envolvidos. No exemplo citado,
a rea florestal poderia ser representada por um polgono e as reas desflorestadas por outros
polgonos menores. Uma relao de est contido indicaria quais, dentre vrias reas identificadas, fazem parte da rea original. Nesse caso, atributos temporais permitiriam a manuteno
de um histrico das reas.
Para que esses dados sejam manipulados, necessrio o seu armazenamento em estruturas adequadas. Surge ento o conceito de Banco de Dados Geogrficos, que nada mais do que um banco de dados que manipula dados geoespaciais. Em um banco de dados geogrficos, os dados so
georreferenciados, analisados por meio de operaes espaciais e, geralmente, sua visualizao
cartogrfica. Assim como em bancos de dados tradicionais, existem, disponveis, os Sistemas
Gerenciadores de Banco de Dados (SGBD) com extenso para dados geogrficos. A maior vantagem da adoo desses sistemas que eles implementam os tipos e operadores espaciais, alm das
outras funcionalidades de um SGBD, como independncia de dados e acesso eficiente; compartilhamento de dados e reduo de redundncia; integridade de dados e segurana; administrao
uniforme de dados; desenvolvimento de aplicaes em tempo reduzido e acesso concorrente.
Tudo isso facilita a tarefa do desenvolvedor de sistema de informao geogrfica. As principais
extenses para dados geogrficos so DB2 Spatial Extender (IBM CORPORATION, 2014a),
Informix Spatial (IBM CORPORATION, 2014b), OracleSpatial (ORACLE CORPORATION,
2014) e PostGIS (POSTGIS PROJECT STEERING COMMITTEE, 2014).
A maioria dos sistemas em uso trata principalmente de dados vetoriais, oferecendo meios de
armazenamento e operaes para sua manipulao. No entanto, muitos dados geoespaciais so
disponibilizados em formato matricial, como as imagens de satlite; neste sentido, extenses
para manipulao desse tipo de dado tm sido apresentadas. Um exemplo a extenso Raster
Well-Known Text (WKT ) do PostGIS, que possibilita armazenar e analisar os dados matriciais,
promovendo avanos em seu uso.
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146
O banco de dados geoespaciais considerado parte de um SIG, sendo responsvel por prover
funcionalidades de armazenamento e de manipulao dos dados. A Figura 4 ilustra a arquitetura
de um SIG. Nela, os dados so armazenados num banco de dados geogrficos, que gerenciado
por um SGBD-geogrfico. O usurio acessa os dados via uma interface grfica e as operaes
disponveis para ele tradicionalmente so: entrada e integrao de dados; consulta e anlise
espacial desses dados, por meio dos relacionamentos espaciais; e visualizao dos dados e dos
resultados das anlises na forma de mapas.
Alm disso, envolvem desde padres de formato para troca de dados geoespaciais at padres
para armazenamento, processamento e acesso aos dados.
3.3.1 Padres OGC voltados aos bancos de dados geoespaciais
A especificao OGC - Simple Feature Access (SFA) define um modelo padro para representao de geometrias georreferenciadas bidimensionais. Esse modelo especifica tanto as estruturas
de dados para representao das geometrias quanto as operaes possveis para cada tipo de dado
geoespacial. O principal impacto dessa especificao pode ser verificado pela padronizao no
armazenamento e acesso a dados geoespaciais pelos diferentes SGBDs disponveis do mercado.
A extenso PostGIS do SGBD PostgreSQL (THE POSTGRESQL GLOBAL DEVELOPMENT
GROUP, 2014) o principal exemplo de aderncia ao padro SFA no mbito dos softwares livres.
Nesse SGBD, os tipos de dados geoespaciais, funes e suporte a consultas, considerando relacionamentos geoespaciais, seguem a especificao SFA. O mesmo padro adotado por mais 50
solues para armazenamento de dados geoespaciais implementadas por mais de 20 empresas,
dentre as quais podemos destacar as extenses geoespaciais j citadas dos SGBD Oracle, DB2
e Informix.
3.3.2 Padres OGC voltados aos servios geoespaciais
O modelo OGC Reference Model (ORM) (PERCIVALL, 2003) descreve um ambiente de computao distribuda baseado na infraestrutura da WWW, o qual tem como objetivo definir uma
plataforma padro sob a qual so elaboradas as especificaes OGC. Essas especificaes descrevem aspectos relativos representao e ao processamento de dados geoepaciais, tais como,
formatos padres para representao de dados obtidos de sensores, representao de objetos
georreferenciados, formatos para intercmbio de dados geoespaciais, alm da arquitetura e integrao de servios geoespaciais.
Alguns exemplos de tipos de servios especificados na infraestrutura proposta pela ORM so:
1) Web Map Service (WMS): servio que gera mapas dinamicamente a partir de dados georreferenciados, sejam na forma matricial ou vetorial. Um WMS implementado como uma aplicao Web que pode ser acessada em uma Uniform Resource Locator (URL) por meio de um
navegador. O formato da URL reflete os parmetros necessrios para execuo das operaes
pelo servio.
2) Web Map Service (WFS): servio previsto no ORM provendo acesso remoto a dados geoespaciais vetoriais. Este servio possibilita, alm da consulta, operaes para criao, remoo,
atualizao e seleo de dados. O acesso a esse servio possibilita a troca de dados geoespaciais entre instituies diretamente por meio de ferramentas de SIG.
3) Web Map Service (WCS): servio que permite a recuperao de dados geoespaciais no formato
raster. O WCS fornece essas informaes em formato adequado para uso em modelos cientficos e visualizaes, por exemplo.
4) Web Processsing Service (WPS): este servio define uma estrutura geral padro para que instituies que desejem oferecer funcionalidades de geoprocessamento possam disponibiliz-las
pela Internet. As funcionalidades podem ser desde simples combinaes de planos de informao at a execuo de modelos sofisticados sobre dados geoespaciais. Para descrever esta ampla gama de necessidades, o WPS especificado como um mecanismo geral de interface entre
os clientes e servidores do servio de geoprocessamento. Esta descrio no impe nenhum
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formato especfico e nem nmero de entradas e sadas que um servio necessita e nem mesmo
o modo de interao com o servidor. Ao invs disto, a especificao WPS apresenta elementos
de como estas necessidades especficas podem ser descritas e invocadas pela da web.
5) Catalogue Service (CS): este servio de catalogao fornece uma viso integrada de todos os
demais servios OGC. Os servios de dados, visualizao e processamento so implementados e publicados de forma independente. Os servios so descritos em um catlogo gerenciado
pelo servio CS, o qual permite a busca considerando diferentes caractersticas de um servio
desejado e, desta forma possibilita a sua localizao.
O consrcio OGC responsvel tambm pela especificao da linguagem Geography Markup
Language (GML) que permite a modelagem, transporte e armazenamento de informaes
geogrficas. Um dado expresso em GML corresponde a um documento eXtensible Markup
Language (XML), cuja estrutura reflete o modelo de entidades genrico elaborado pela OGC
com o objetivo de possibilitar o intercmbio de informaes geogrficas entre diferentes aplicaes em diferentes domnios. Essa linguagem um dos principais recursos, possibilitando a
troca de dados geoespaciais vetoriais entre instituies. A atuao do consrcio OGC tem sido
fundamental para viabilizar o compartilhamento e o uso de dados geoespaciais em nvel mundial
e suas especificaes devem sempre ser consideradas durante o desenvolvimento de novas solues ou ferramentas de TI que envolvam o tratamento de dados geoespaciais.
3.3.3 Infraestrutura Nacional de Dados Espaciais (Inde)
No Brasil, o Governo Federal vem implementando medidas que visam integrar os dados geoespaciais produzidos por diversas instituies nacionais. A principal delas a Infraestrutura
Nacional de Dados Espaciais (Inde), instituda em 2008, com o propsito de catalogar, integrar
e harmonizar dados geoespaciais existentes nas instituies do governo brasileiro, produtoras e
mantenedoras desse tipo de dado, de maneira que possam ser facilmente localizados, explorados
e acessados para os mais diversos usos, por qualquer cliente que tenha acesso Internet. Os
dados geoespaciais devem ser catalogados por seus respectivos metadados, publicados pelos produtores/mantenedores desses dados. O acesso aos dados deve se realizar por meio do geoportal
denominado SIG Brasil (BRASIL, 2014a).
De acordo com o Decreto N6.666 de 27/11/2008, a Inde tem como principais objetivos:
1) Promover o adequado ordenamento na gerao, armazenamento, acesso, no compartilhamento, na disseminao e no uso dos dados geoespaciais.
2) Promover a utilizao, na produo dos dados geoespaciais pelos rgos pblicos das esferas
federal, estadual, distrital e municipal, dos padres e normas homologados pela Comisso
Nacional de Cartografia - Concar.
A plataforma NatData fornece todos os dados necessrios por meio de um sistema nico, usando
um formato comum, tornando mais fcil para os usurios a sua busca. Alm disso, a maioria dos
sistemas semelhantes disponveis oferece apenas instrumentos de pesquisa tradicionais, com
base em palavras-chave que, no contexto dos recursos naturais, no suficiente por conta da
busca por informaes considerando questes diferentes. Neste sentido, a plataforma tambm
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150
de permitir download de mapas e imagens de satlite, essa ferramenta auxilia na implantao das
aes exigidas pelo Novo Cdigo Florestal para todo o territrio nacional.
Com uma mdia mensal de acessos em torno de 2,7 mil e mais de 3.000 usurios cadastrados, j
foram registrados aproximadamente 200 mil acessos ao sistema, desde a sua implantao em outubro de 2008. Entre os usurios esto rgos pblicos, como Ministrios, Secretarias Estaduais
de Meio Ambiente, universidades, Polcia Ambiental, instituies de pesquisa; e privados, como
Organizaes No-Governamentais, bancos, empresas de consultoria ambiental, cooperativas,
sindicatos, produtores rurais, entre outros.
151
152
Em 2008, atendendo a uma demanda do Governo Federal que buscava identificar quais eram os
destinos dados s reas desflorestadas da Amaznia Legal, como uma maneira de aprofundar
o conhecimento sobre o fenmeno dos desflorestamentos e de promover, alm das polticas de
comando e controle para conteno dos desflorestamentos, uma agenda positiva para orientar e
estimular o bom uso das terras das reas j desflorestadas, foi articulado o projeto TerraClass
Sistema de Monitoramento do Uso e Cobertura da Terra nas reas Desflorestadas da Amaznial
Legal (COUTINHO et al., 2013).
Os avanos percebidos na rea de Tecnologia da Informao e Comunicao das ltimas dcadas, tanto em termos do aumento da capacidade de armazenamento e processamento de dados e
informaes, quanto na sua capacidade de comunicao e compartilhamento, tornou possvel o
enfrentamento, o desafio de desenvolver e implementar um sistema de monitoramento da dinmica de uso e cobertura de uma regio to vasta e de acesso extremamente complexo.
A adoo de geotecnologias relacionadas aquisio, ao processamento e disponibilizao de
dados geogrficos, possibilitou a integrao de diferentes metodologias de processamento de
dados de sensores remotos orbitais, para a gerao sistemtica de mapas sobre o uso e cobertura
da terra de toda a regio e, mais importante do que isto, tm viabilizado a sua publicao integral
por meio da internet.
Com a ampliao da srie histrica de dados do Projeto TerraClass e a ampliao da sua rea
de abrangncia, incluindo tambm as reas antropizadas do bioma Cerrado, para atender nova
solicitao do Governo Federal, surge uma nova demanda, relacionada disponibilizao de
servios geogrficos pela internet, para potencializar ainda mais a adoo dos dados e informaes gerados pelo projeto. Considerando a importncia estratgica dessa demanda, a Embrapa
Informtica Agropecuria est desenvolvendo um novo ambiente computacional que permita,
alm de organizar, armazenar e disponibilizar dados e informaes sobre esses biomas, oferecer
servios geogrficos via web, para potencializar o atendimento das demandas dos diferentes tipos
de usurios desses produtos.
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154
1) No processo de evoluo das informaes geoespaciais, considerar a passagem da viso comum para a gesto de informao geoespacial nacional e mundial.
6 Consideraes nais
A demanda por processos eficientes para tratamento e organizao de uma massa crescente de
dados geoespaciais tem estimulado uma mudana de paradigma no que se refere construo
de aplicaes cientficas, incentivando o surgimento de novas plataformas e ferramentas de alta
capacidade de processamento.
As capacidades de armazenamento e de processamento de dados geoespaciais devem ser incrementadas para que seja possvel superar os desafios representados pelo chamado Big Data, definido como um conjunto de dados caracterizado pelo seu grande volume, sua alta velocidade de
atualizao e pela sua abrangncia ou variedade de temas. Este tipo de dado se tornar cada vez
mais presente nas atividades de pesquisa, sendo um resultado da utilizao crescente de dados
de sensores de maior resoluo espacial e temporal, pela maior facilidade de acesso a produtos
geoespaciais, e pela necessidade de uma anlise integrada destes dados com dados no-espaciais.
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Parte
IV
Captulo
159
TIC na segurana
tossanitria das
cadeias produtivas
1 Introduo
Com a intensificao da indstria agropecuria, tm crescido os desafios e as preocupaes
relacionadas segurana sanitria dos alimentos produzidos. A circulao de volumes cada vez
maiores desse tipo de mercadoria exige que as medidas necessrias para garantir sua segurana
sanitria sejam implementadas de maneira rpida, eficiente e barata. O controle manual tradicionalmente utilizado muitas vezes no capaz de atender a esses requisitos. Como resultado,
tecnologias de informao e comunicao tm sido cada vez mais utilizadas para:
1) Aumentar o grau de automao e, consequentemente, a velocidade dos processos de controle
fitossanitrio.
2) Identificar problemas sanitrios to cedo quanto possvel, minimizando possveis prejuzos
econmicos, ambientais e sociais.
3) Identificar, a partir de variveis ambientais e histricas, reas potencialmente sujeitas a problemas sanitrios, antes mesmo destes se manifestarem.
Este captulo trata especificamente dos dois ltimos itens. Na Seo 2, so mostradas iniciativas voltadas ao diagnstico de doenas em plantas, explorando tecnologias como processamento digital de imagens e sistemas especialistas. A Seo 3, por sua vez, apresenta iniciativas
voltadas construo de modelos de previso e sistemas de alerta de doenas de culturas
agrcolas.
2 Diagnose de doenas
Desde os primrdios da agropecuria, uma das principais preocupaes dos produtores tem sido
evitar prejuzos ligados manifestao e proliferao de doenas em suas lavouras, viveiros e
rebanhos. A fim de que o combate a essas doenas seja eficaz, essencial que o diagnstico seja
no apenas correto, mas to rpido quanto possvel. Na maioria das vezes, o monitoramento
das condies sanitrias feito visualmente, atravs da ida a campo de especialistas capazes de
reconhecer possveis problemas que estejam ocorrendo. Essa estratgia tem alguns problemas
potenciais:
160
- Especialistas nem sempre esto disponveis para realizar o monitoramento com a frequncia
necessria, especialmente em locais remotos.
- O custo associado a esse monitoramento por especialistas pode ser proibitivo para pequenos
produtores.
- Ainda que haja disponibilidade de mo de obra e recursos, pode ser muito difcil fazer um
monitoramento minucioso, especialmente no caso de grandes propriedades.
Como resultado, esforos vm sendo despendidos na criao de ferramentas computacionais
que auxiliem no combate aos problemas sanitrios. O objetivo dessas ferramentas reduzir o
tempo necessrio para que as primeiras aes sejam colocadas em andamento, especialmente na
ausncia de um especialista.
Esta seo apresentar alguns dos principais avanos alcanados nos ltimos anos nas tcnicas
para deteco, quantificao e classificao de doenas na agropecuria, com nfase naqueles
baseados em imagens digitais dos sintomas das doenas, os quais so a grande maioria. Ser
dado particular destaque s aes que tm sido realizadas na Empresa Brasileira de Pesquisa
Agropecuria (Embrapa).
2.1 Sistemas automticos
Sistemas automticos so aqueles que realizam todas as operaes automaticamente com base
nas imagens digitais a eles submetidos, com pouco ou nenhum envolvimento por parte do usurio. Este alto grau de autonomia possui algumas vantagens:
- O usurio no necessita de qualquer conhecimento especfico a respeito do problema, j que
toda a informao necessria para o diagnstico est contida no algoritmo.
- Computadores no se cansam, portanto possvel fazer um grande nmero de avaliaes ininterruptamente, o que possibilita monitoramento permanente.
- Computadores no esto sujeitos a iluses de tica que frequentemente acometem avaliadores
humanos.
- Em geral possuem baixo custo de operao.
A principal desvantagem deste tipo de sistema sua dependncia em relao qualidade da base
de dados de imagens digitais utilizada no seu desenvolvimento. O resultado disso que, embora
seja possvel conferir um certo grau de flexibilidade ao algoritmo, este s ser capaz de lidar com
situaes para as quais ele foi treinado. Assim, possvel afirmar que um sistema automtico para
deteco, medio ou identificao de doenas s poder ser to bom quanto a base de dados
utilizada. Na verdade, a falta de bases de dados abrangentes o principal problema enfrentado
atualmente nas pesquisas deste tipo, j que as tcnicas de processamento de imagens e inteligncia computacional esto suficientemente maduras para permitir o desenvolvimento de mtodos
realmente efetivos. Por esse motivo, h vrias iniciativas em andamento para a construo de
bases de dados mais completas, inclusive na Embrapa, conforme ser descrito mais adiante.
A seguir apresentado um breve estado da arte, bem como as iniciativas realizadas na Embrapa,
relacionados aos temas de deteco, quantificao e classificao de doenas. importante ressaltar que plantas tm recebido mais ateno nesses temas que animais, motivo pelo qual apenas
plantas so tratadas nas sees apresentadas a seguir.
161
162
Figura 2. Ilustrao dos passos do algoritmo para contagem de moscas brancas em folhas.
mogeneidade dessas caractersticas. At onde vai o conhecimento dos autores, o nico mtodo a
usar este tipo de abordagem foi proposto por Zhou et al. (2011).
2.1.3 Classificao de doenas
Figura 1. Passos do algoritmo. a) Imagem tpica presente na base de dados. b) Mscara binria antes
do ajuste fino. c) Imagem aberta morfologicamente. d) Imagem contendo as localizaes do caule e do
pecolo antes da eliminao de objetos esprios. e) Imagem contendo apenas as regies de interesse. f)
Representao da imagem no canal amarelo do espao de cor CMYK. g) Primeira estimativa para a localizao das leses. h) Representao da imagem no canal magenta do espao de cor CMYK. i) Estimativa
final para a localizao das leses.
A contagem de elementos ou estruturas que caracterizem a doena tambm uma abordagem comum. Um exemplo desse tipo de estratgia pode ser encontrado em Boissard et al. (2008). Como
mencionado anteriormente, o projeto Contag foi criado exatamente para lidar com o problema da
contagem de objetos, embora seu escopo seja mais amplo que a simples contagem de estruturas
relacionadas a doenas. Os resultados desse projeto foram aplicados, majoritariamente, a problemas de contagem de microrganismos (BARBEDO, 2012, 2013b, 2013c, 2013d). O algoritmo
foi tambm aplicado contagem de moscas brancas em folhas, as quais podem causar doenas e
so uma importante fonte de perdas na agricultura (BARBEDO, 2014c). A Figura 2 fornece um
exemplo de uso deste mtodo, o qual tambm inteiramente baseado em regras ad-hoc, geradas
a partir de conhecimento de especialistas, e morfologia matemtica. Todas essas ferramentas de
contagem estaro tambm disponveis como aplicativo web a partir do incio de 2015.
O uso de caractersticas de cor e textura para medir a severidade de doenas mais incomum que
as outras duas estratgias, provavelmente devido s dificuldades em se garantir que as imagens
capturem com fidelidade as caractersticas visuais dos sintomas, e tambm devido falta de ho-
163
164
ses, uma web, a ser usada em computadores com conexo com a internet, e uma mvel, a ser
embarcada em aparelhos celulares e tablets, no dependendo da existncia de uma rede para
funcionar.
2.2 Sistemas semi-automticos
Sistemas semi-automtico so aqueles que, alm de terem uma parte computacional que realiza
certas operaes que levem ao diagnstico, dependem tambm de uma participao humana para
funcionarem corretamente. Pode-se dividir estes sistemas em dois tipos, os quais so apresentados nas subsees a seguir.
2.2.1 Correo manual dos resultados
Ateno especial foi dada tambm captura das imagens. Embora se pretenda utilizar imagens
capturadas sob condies normais ao longo do projeto, as etapas iniciais de desenvolvimento
do mtodo se beneficiariam de imagens com condies mais controladas de iluminao, e corrigidas em termos de cor e geometria. Por esse motivo, foi criado um dispositivo, consistindo
de uma caixa e de um padro (Figura 4), o qual, alm de garantir condies homogneas de
captura, permite que se utilize um software para correes geomtricas e de cor das imagens.
Detalhes a respeito do dispositivo podem ser encontrados no website do projeto1.
Neste tipo de abordagem, a parte automtica do sistema fornece uma resposta, a qual, se apresentar falhas ou erros visveis, pode ser corrigida pelo usurio. Evidentemente, este tipo de
abordagem no serve para a classificao de doenas, uma vez que se o usurio sabe que houve
erro; ento, ele j saberia a resposta de antemo, no havendo necessidade de usar o programa.
Contudo, em anlises quantitativas possvel, por exemplo, identificar manualmente objetos que
o algoritmo no detectou, ou corrigir as bordas das reas com sintomas detectadas. A interface do
programa criado no contexto do projeto Contag permite ao usurio realizar este tipo de correo,
conforme exemplificado na Figura 5.
No comum, na literatura, encontrar mtodos ou sistemas originais que permitam a correo
manual por parte do usurio. Por outro lado, ferramentas genricas de processamento digital
de imagens, tais como o ImageJ2, o Assess3 e o SigmaScan Pro4, naturalmente dependem das
Figura 5. Exemplo de correo manual presente no sistema desenvolvido no contexto do projeto Contag.
Figura 4. Caixa e padro usados na captura das imagens de sintomas de doenas, no contexto do projeto
Digipathos.
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166
Figura 7. Tela inicial do sistema especialista para diagnstico de doenas em videiras Uzum.
167
168
pelo usurio. Este fato aumenta consideravelmente a probabilidade de erros, uma vez que uma
nica pergunta respondida de maneira errnea pode fazer com que o sistema se desvie irremediavelmente da resposta correta.
Uma maneira de se limitar o universo inicial de possibilidades fornecer ao sistema especialista
informaes objetivas capazes de eliminar diagnsticos improvveis antes mesmo do usurio
comear a responder as perguntas. Tendo esse objetivo em mente, est em andamento um projeto
para acoplar o sistema automtico baseado em imagens digitais a ser desenvolvido no projeto
Digipathos, com um novo sistema especialista, o qual aproveitar muitos dos conceitos usados
no sistema Diagnose Virtual para criar uma ferramenta com abrangncia ainda maior. Assim, o
sistema baseado em imagens ser capaz de reduzir o nmero de respostas possveis, e o sistema
especialista ser responsvel por dirimir qualquer incerteza advinda da parte baseada em imagens. O novo sistema dever ser implementado em duas verses, uma web e uma a ser embarcada
em dispositivos mveis.
2.3 Concluso
O uso da tecnologia para auxiliar no diagnstico de doenas na agropecuria tem experimentado significativos avanos nas ltimas dcadas. Dada a importncia deste tema, a Embrapa tem
adotado diversas iniciativas para desenvolver tecnologias prprias e contribuir para o avano do
tema, como pode ser comprovado por ferramentas como o Diagnose Virtual e o Uzum, e projetos
como o Contag e o Digipathos. Contudo, os desafios a serem vencidos ainda so considerveis,
ensejando que novas iniciativas sejam levadas adiante num futuro prximo.
Sistemas de previso de doenas de plantas podem ser classificados de vrias maneiras, de acordo com o tipo de informao usada para fazer a previso ou com a abordagem conceitual para
a previso. Especificamente, previsores podem ser classificados com respeito a (CAMPBELL;
MADDEN, 1990): se informao da cultura, da doena, do patgeno ou do ambiente, ou uma
combinao dessas, so usadas para fazer as previses; se as previses so pr-plantio ou ps-plantio; se informao emprica ou fundamental foi usada no desenvolvimento do sistema; e se
caractersticas especficas das epidemias, tais como inculo primrio, inculo secundrio ou taxa
de aumento da doena, servem de base para as previses. Uma ampla reviso bibliogrfica de
sistemas de previso de doenas de plantas, abrangendo importantes doenas de vrias culturas
agrcolas, encontra-se em Reis e Bresolin (2004).
Um sistema de alerta, para que tenha sucesso, precisa ser adotado e implementado pelos produtores, devendo haver a percepo de que possvel obter benefcios especficos e tangveis
com o seu uso. Atributos que asseguram o sucesso incluem (CAMPBELL; MADDEN, 1990):
confiabilidade, simplicidade para implementar, importncia da doena, utilidade do alerta, disponibilidade aos produtores, aplicabilidade a vrias doenas/pragas e eficincia de custo.
Segundo Bourke (1970), para desenvolver um sistema de alerta preciso que a doena satisfaa quatro requisitos: a doena causa perdas economicamente significativas na qualidade ou na
quantidade da produo; a doena varia entre cada estao de cultivo; medidas de controle da
doena esto disponveis e so economicamente viveis; e h informao suficiente a respeito da
natureza da dependncia da doena em relao s condies meteorolgicas.
Muitos estudos a respeito do papel das condies meteorolgicas nas doenas de plantas indicam
que a doena mais afetada pelas condies microclimticas no dossel das plantas do que pelas
condies macroclimticas medidas a uma certa distncia da cultura em estaes meteorolgicas
padro. Entretanto, condies macroclimticas produzem o microclima - possvel usar regras
para determinar relacionamentos entre o macro e o microclima - e existe um limite na extenso
com que o microclima pode facilitar o desenvolvimento da doena sob condies macroclimticas desfavorveis (COAKLEY, 1988). Ele chegou ainda a sugerir que tentativas de relacionar
dados macroclimticos com doenas podem ter alcanado resultados limitados, em parte, por
causa da dificuldade de analisar grandes quantidades de dados sem o auxlio de computador.
Anteriormente, desvantagens de usar dados microclimticos de dentro dos campos de cultivo
no desenvolvimento e/ou implementao de sistemas de alerta incluam perodos de tempo
relativamente curtos e poucos locais para os quais estavam disponveis os dados, alto custo de
coleta desses dados e frequncia considervel de perda de dados devido a falhas nos equipamentos (COAKLEY, 1988). Nos ltimos anos, os instrumentos manuais deram lugar s estaes
meteorolgicas automticas, que podem ser instaladas prximas aos campos de cultivo. A cada
gerao, essas estaes tornam-se mais sofisticadas, confiveis e de menor preo. Mesmo assim,
exigir de produtores a instalao e a manuteno dessas estaes meteorolgicas e o gerenciamento dos dados de cada campo no prtico nem economicamente vivel.
Como alternativa a essa questo, esforos tm sido feitos para desenvolver e validar sistemas de
alerta que utilizem dados de redes regionais de estaes meteorolgicas (GENT; SCHWARTZ,
2003) e tecnologias para a obteno de dados de locais especficos sem sensores in loco
(MAGAREY et al., 2001). Outra tendncia utilizar dados meteorolgicos estimados a partir
de modelos de previso do tempo para antecipar ainda mais os alertas, permitindo um tempo
169
170
de dois anos ou locais precisam ser estudados e anos adicionais so necessrios para a validao
(MADDEN; ELLIS, 1988).
O foco principal desta seo apresentar modelos de previso e um sistema de alerta da ferrugem
do cafeeiro desenvolvidos pela Embrapa Informtica Agropecuria. Outra iniciativa semelhante
da Embrapa o SisAlert, um sistema web de previso de doenas de plantas baseado em modelos
de simulao modulares e genricos para predizer o estabelecimento de doenas a partir de dados
meteorolgicos obtidos de estaes meteorolgicas automticas e de prognsticos de tempo de
curto prazo (FERNANDES et. al., 2011). Esse sistema est operacional para duas doenas do
trigo e cinco doenas da cultura da ma, alm de ter modelos de outras culturas agrcolas em
avaliao e em desenvolvimento.
Coakley (1988), baseado em sua experincia, sugeriu um mnimo de oito a doze anos de registro
de dados, de campos com fontes naturais de inculo, para identificar com segurana quais podem
ser os fatores climticos de influncia no desenvolvimento de uma doena. Sugeriu tambm,
quando se tem menos de oito anos de registro, que dados de diferentes localidades de uma regio
geogrfica podem ser utilizados.
Madden e Ellis (1988) indicaram duas formas pelas quais modelos de previso empricos podem
ser desenvolvidos. A primeira, chamada de qualitativa, envolve o desenvolvimento de critrios
de previso sem qualquer anlise estatstica formal. Alguns exemplos de modelos desenvolvidos
dessa forma so: previso da mancha preta do amendoim (JENSEN; BOYLE, 1966; PARVIN
JUNIOR. et al., 1974; PEDRO JNIOR et al., 1994), previso da requeima da batateira (COSTA
et al., 2002; WALLIN, 1962), previso da pinta-preta do tomateiro (MADDEN et al., 1978) e
previso da queima das folhas da cenoura (SOUZA et al., 2002).
A segunda forma de desenvolvimento dos modelos de previso, chamada de quantitativa, baseada em anlise estatstica e modelagem dos dados observados. Os mtodos e tcnicas utilizados
so variados. Em uma retrospectiva dos modelos apresentados na literatura, possvel perceber
que o emprego desses mtodos e tcnicas acompanha a evoluo nas disciplinas relacionadas
com a anlise de dados.
O predomnio de mtodos e tcnicas estatsticos, sendo a anlise de regresso a mais popular
(MADDEN; ELLIS, 1988). Como exemplo, cita-se o uso de regresso linear mltipla no desenvolvimento de modelos para predizer a severidade de epidemias da ferrugem asitica da soja
(DEL PONTE et al., 2006). Alguns mtodos matemticos e estatsticos para a modelagem de
dados epidemiolgicos foram revisados por Hau e Kranz (1990).
Mais recentemente, os trabalhos publicados relatam o uso de mtodos e tcnicas modernos e
sofisticados, no necessariamente inovadores, mas que ganharam/recuperaram visibilidade e
importncia nos ltimos anos, como redes neurais (PAUL; MUNKVOLD, 2005), regresso logstica (DE WOLF et al., 2003), rvores de deciso (MEIRA et al., 2009) e anlise estatstica de
sries temporais (XU et al., 2000).
O segundo tipo de modelo chamado emprico ou correlativo. Os modelos empricos so desenvolvidos a partir da coleta e anlise de dados atuais e histricos sobre nveis da doena e outros
fatores biticos e abiticos (MADDEN; ELLIS, 1988). Eles descrevem um relacionamento observado entre duas ou mais variveis do conjunto de dados, normalmente derivados a partir do
ajuste dos dados a um modelo aceitvel (CAMPBELL; MADDEN, 1990). Conhecimento terico
relacionado a mecanismos bsicos no exigido (CAMPBELL et al., 1988).
Modelos empricos esto relacionados com uma previso apenas por estao de cultivo ou podem
envolver mltiplas previses. Os primeiros so teis quando importante predizer o inculo
inicial ou o nvel inicial da doena, e o seu desenvolvimento geralmente requer observaes de
vrios anos e/ou locais. Aqueles que envolvem mltiplas previses so teis quando a doena
pode aumentar rapidamente durante a estao de crescimento, ou quando o valor econmico da
cultura justifica vrias intervenes de controle. O seu desenvolvimento requer observaes feitas sobre a doena, o ambiente e/ou outros fatores por toda a estao de cultivo. Em geral, mais
Alm da importncia econmica, a ferrugem atende outros requisitos, como a variao na sua
intensidade entre cada estao de cultivo e a disponibilidade de medidas de controle economicamente viveis, que justificam o desenvolvimento de modelos de previso e um sistema de alerta
ou aviso.
A ferrugem, causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berk. & Br., a principal doena do cafeeiro
em todo o mundo. No Brasil, em regies onde as condies climticas so favorveis doena,
os prejuzos na produo atingem cerca de 35% em mdia, podendo chegar a mais de 50%. Os
principais danos causados pela ferrugem so a queda precoce das folhas e a seca dos ramos, que,
em consequncia, no produzem no ano seguinte (ZAMBOLIM et al., 2005).
O cafeeiro alterna anos de alta e baixa produo (carga pendente de frutos), caracterizando um
ciclo bienal. A ferrugem ataca com maior intensidade em anos de alta carga. A curva de progres-
171
172
(1)
Valores de RSLPM a partir de dados observados no campo, para um intervalo de 28 dias antes
da data de predio (DP), foram relacionados, por anlise de regresso, com taxas de infeco da ferrugem observadas 28 dias aps DP, corrigidas para o crescimento do hospedeiro
(KUSHALAPPA et al., 1984). Esse intervalo de predio foi escolhido por causa da mdia observada do perodo latente do fungo, de outubro a maro, que foi de aproximadamente 28 dias.
Vrias equaes foram desenvolvidas para predizer a taxa de infeco, considerando diferentes
parmetros de rea de produo de inculo no clculo dos valores de RSLPM (KUSHALAPPA
et al., 1984). As equaes que obtiveram os melhores coeficientes de determinao (R2) foram:
k = 0,00044 + 14,766 x RSLPM - 2511,21 x RSLPM2
(2)
(3)
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174
Tabela 1. Matriz para clculo dos valores de severidade da ferrugem (VSF) do cafeeiro, com base no
perodo de molhamento foliar e na temperatura mdia do perodo.
Molhamento foliar (h/dirias)
0
0<h8
8 < h 17
17 < h 24
h = 24**
A partir desses limites, um sistema de alerta simples e outro mais complexo foram desenvolvidos
para recomendar aplicaes de fungicida para o controle da ferrugem do cafeeiro. O sistema
simples se resumiu em uma tabela, que foi formada pelo agrupamento dos valores de inculo
(RSB), de produo (EPMH) e de condies do ambiente (EPMA), observados no Estado de
Minas Gerais, em certos intervalos convenientes.
No caso do sistema simples, em intervalos quinzenais, deve-se quantificar a incidncia (percentual de folhas atacadas) ou a severidade (rea foliar atacada) da ferrugem e indicar a produo
como alta ou baixa; depois, basta consultar a tabela sobre a recomendao ou no de aplicao
de fungicida.
Temperatura (C)
< 16
0*
0
0
0
0
16-18
0
0
1
2
0
19-20
0
1
2
3
1
21-24
0
2
3
4
2
25-26
0
1
2
3
1
27-29
0
0
1
2
0
30
0
0
0
0
0
**
Em uma lavoura de alta carga pendente (101,5 sacas beneficiadas/hectare), foram recomendadas
duas pulverizaes com fungicida sistmico quando o valor acumulado de VSF atingiu 29-31,
igualando-se as duas aplicaes do tratamento com calendrio fixo. Em uma lavoura de mdia
carga pendente (22,4 sacas beneficiadas/hectare), recomendou-se uma nica pulverizao quando o valor acumulado de VSF atingiu 49-51, enquanto todos os outros tratamentos demandaram
duas aplicaes. Portanto, o sistema baseado no VSF foi to eficiente quanto o calendrio no
controle da ferrugem do cafeeiro, porm com economia de uma pulverizao na lavoura com
carga mdia de frutos.
Os resultados mostraram que, normalmente, em lavouras com baixa a mdia carga pendente de
frutos, uma nica aplicao de fungicida sistmico, no momento oportuno, indicado com base
no nmero de horas de molhamento foliar e na temperatura mdia durante o perodo de molhamento, como sugerido pelo modelo de aviso proposto, foi suficiente para se alcanar um controle
eficiente e racional da ferrugem do cafeeiro.
Para se identificar, ento, os perodos favorveis ferrugem, nos quais as plantas deveriam ser
atomizadas, foi desenvolvido um sistema de previso ou de aviso (GARON et al., 2004). O
objetivo foi criar um sistema simples - simplicidade um atributo importante para a aceitao
do sistema, pois maiores so as chances de adoo pelos agricultores - e confivel de prever o
desenvolvimento da doena no campo, determinando o momento propcio para iniciar o controle
qumico por meio de pulverizaes com fungicida sistmico, bem como o intervalo entre as
aplicaes.
(4)
175
176
Essa equao foi usada para dar uma ideia de quo severa a ferrugem poderia ser durante certas
estaes ou meses do ano. Moraes (1983) sugeriu, com base em estimativas obtidas pela equao
4, para o perodo de outubro a maro, os seguintes nveis de severidade de ataque da ferrugem
do cafeeiro: risco alto de ataque severo, quando o PI estimado for inferior a 35 dias; risco mdio
de ataque severo quando o PI for estimado entre 35 e 45 dias; e pequena probabilidade de risco
de ataque severo, quando o PI estimado for superior a 45 dias.
Chaves et al. (1970) citado por Kushalappa (1989b), logo que a ferrugem do cafeeiro surgiu
no Brasil, consideraram desnecessrias aplicaes de fungicida, de maio a agosto, devido
aos perodos latentes mais longos. Kushalappa (1989b) argumentou que a razo de no haver
necessidade de aplicaes de fungicida nos meses mais frios seria diferente: a temperatura
durante o perodo de molhamento foliar geralmente fica abaixo de 15C, o que limitante para
a infeco.
Alfonsi et al. (1974) estudaram a associao entre nveis de infeco (mdia de pstulas por folha), variveis climticas e rea foliar das plantas. A mdia das temperaturas mximas, a mdia
das temperaturas mnimas e o total de chuvas, registrados em perodos de 15, 30 e 45 dias, foram
correlacionados com os nveis de infeco observados ao final dos respectivos perodos. Os coeficientes de determinao (R2) obtidos entre o nvel de infeco e as trs variveis climticas,
independente da rea foliar, mostraram que a associao com o perodo de 45 dias expressou
melhor a proporo de acrscimos de pstulas (cerca de 95% de explicao da variao na severidade da doena). Na literatura consultada, no h registro de sistema de alerta da ferrugem do
cafeeiro baseado nas equaes de regresso obtidas.
Tambm por anlise de regresso, vrios fatores meteorolgicos e biolgicos foram considerados
para explicar a taxa de progresso da ferrugem (KUSHALAPPA; ESKES, 1989). Os fatores mais
significativos foram identificados pelo critrio de seleo stepwise. Como variveis dependentes, foram consideradas a severidade da doena na data de previso (DP) e a taxa de infeco
da ferrugem para os intervalos de um a dois perodos latentes (28 dias) aps DP. A equao que
explicou a mxima variao (94%) na taxa de infeco foi:
k = 0,031 + 4,881 x PAFE + 0,022 x PNF - 0,001 x MIN - 0,001 x MAX - 0,001 x CHUVA (5)
onde k a taxa de infeco, corrigida para o crescimento do hospedeiro, para 56 dias depois de
DP; PAFE a proporo de rea foliar com esporos na DP; PNF a proporo de novas folhas
formadas durante 14 dias antes de DP; MIN a mdia das mnimas e MAX a mdia das mximas
temperaturas (em C) para 14 dias antes de DP; CHUVA o total de chuvas (em mm) entre 14 a
28 dias antes de DP. No foi encontrado, na reviso bibliogrfica, trabalho a respeito do uso das
equaes desenvolvidas em sistema de alerta da ferrugem do cafeeiro.
Correlaes significativas foram observadas entre variveis independentes usadas na formulao de equaes de regresso para predizer a taxa de progresso da ferrugem do cafeeiro
(KUSHALAPPA et al., 1983). Como resultado, alguns parmetros, que independentemente
explicaram variao significativa na doena, foram eliminados devido multicolinearidade. O
sucesso preditivo de tais modelos depende da ocorrncia futura dos diferentes parmetros, incluindo aqueles no usados no modelo, em combinaes semelhantes quelas observadas. Isso
torna esse tipo de modelo menos estvel sob condies de campo, a menos que esteja baseado
em vrios anos de registro de dados (KUSHALAPPA; ESKES, 1989).
Mais recente, Pinto et al. (2002) avaliaram o potencial de redes neurais para descrever a epidemia da ferrugem do cafeeiro. Elas foram empregadas para estabelecer relaes entre variveis
climticas e produo e a incidncia da ferrugem. As seguintes variveis foram utilizadas para
construir as redes: precipitao pluvial; nmero de dias com e sem precipitao; umidade relativa
do ar; horas de insolao; temperaturas mdia, mxima e mnima, calculadas como mdias ou
somatrios para os 15, 30, 45 e 60 dias anteriores s avaliaes da incidncia da ferrugem; e a
varivel produo, a qual assumiu valor 0 para as plantas antes do incio da produo e 1 para
as plantas em fase de produo. Sries temporais da incidncia da doena, isoladamente, tambm
foram utilizadas na elaborao de redes neurais.
A camada de entrada para as redes foi formada pelas variveis climticas mais a varivel de
produo (variveis independentes) e a varivel de sada foi a incidncia da ferrugem (varivel
dependente). Os menores valores do erro mdio de previso (EMP = 1,17%) e do quadrado
mdio do desvio (QMD = 3,43) foram obtidos para a rede neural elaborada com as variveis
produo, umidade relativa, horas de insolao e temperatura mnima, relativas ao perodo de
30 dias anteriores avaliao da incidncia da doena. A melhor rede neural (EMP = 4,72%
e QMD = 3,95) elaborada a partir das sries temporais teve como variveis de entrada as observaes da incidncia da doena de quatro quinzenas anteriores data de avaliao (PINTO
et al., 2002).
As redes neurais elaboradas poderiam ser utilizadas como modelos de previso da ferrugem do
cafeeiro. Apesar do melhor desempenho do modelo que incluiu as variveis climticas, os autores sugeriram que o uso de sries temporais, apenas, poderia facilitar a previso de epidemias da
doena. Eles consideraram que avaliar a intensidade da doena mais fcil para o produtor ou o
agente de extenso do que coletar variveis climticas.
A induo de rvores de deciso uma tcnica de modelagem alternativa. O seu propsito descobrir a estrutura preditiva do problema e/ou produzir modelos de predio precisos (BREIMAN
et al., 1984). A induo no prejudicada por multicolinearidade entre as variveis independentes como na regresso (BUTT; ROYLE, 1990). Alm disso, diversas variveis, numricas ou
categricas, podem ser analisadas ao mesmo tempo, sendo que o prprio algoritmo de induo
se encarrega de selecionar as de maior importncia.
A rvore de deciso um modelo representado graficamente por ns e ramos, parecido com uma
rvore, mas no sentido invertido (WITTEN et al., 2011). O n raiz, no topo da estrutura, e os
ns internos so ns de deciso. Cada um contm um teste sobre uma varivel independente e os
resultados desse teste formam os ramos da rvore. Os ns folhas, nas extremidades, representam
valores de predio da varivel dependente ou distribuies de probabilidade desses valores.
Paul e Munkvold (2004) usaram este tipo de modelagem para predizer categorias de severidade
da cercosporiose do milho em estgio avanado do cultivo. rvores de deciso tambm modelaram epidemias de giberela do trigo, procurando predizer se a severidade da doena seria maior
ou igual a 10% (MOLINEROS et al., 2005). Baker et al. (1993) desenvolveram uma rvore de
deciso para predizer o risco (alto ou baixo) de mortalidade de pnus em decorrncia de podrido
das razes causada por Heterobasidion annosum.
177
178
Com relao ferrugem do cafeeiro, Meira et al. (2008) analisaram manifestaes epidmicas
da doena com o auxlio de uma rvore de deciso. As variveis explicativas mais importantes
foram a temperatura mdia nos perodos de molhamento foliar, a carga pendente de frutos, a
mdia das temperaturas mximas dirias no perodo de incubao e a umidade relativa do ar.
A rvore de deciso demonstrou seu potencial simblico e interpretvel, auxiliando na compreenso de quais variveis e como as interaes dessas variveis conduziram as epidemias da
ferrugem no campo.
Modelos em rvore de deciso foram desenvolvidos para alerta da ferrugem do cafeeiro em
lavouras com alta carga pendente de frutos e em lavouras com baixa carga (MEIRA, 2008;
MEIRA; RODRIGUES, 2009; MEIRA et al., 2009). Dados de incidncia mensal da doena no
campo coletados durante oito anos foram transformados em valores binrios considerando limites de 5 e 10 pontos porcentuais (p.p.) na taxa de infeco. O alerta indicado quando a taxa de
infeco, prevista para o prazo de um ms, atingir ou ultrapassar o respectivo limite.
A acurcia do modelo para lavouras com alta carga pendente e limite de 5 p.p. foi de 81%,
calculada por validao cruzada, tambm com valores bons e equilibrados para outras medidas
de avaliao; o modelo para o limite de 10 p.p. teve acurcia de 79%, sem apresentar o mesmo
equilbrio entre as demais medidas. Os modelos para lavouras com baixa carga pendente no
apresentaram o mesmo bom desempenho.
A partir do mesmo conjunto de dados preparados por Meira (2008), Cintra et al. (2011) desenvolveram modelos com um mtodo de induo de rvores de deciso fuzzy. O mtodo, denominado
Fuzzy DT, baseado no algoritmo clssico C 4.5 (QUINLAN, 1993), acrescentado de caractersticas interessantes da lgica fuzzy relacionadas interpretabilidade dos modelos e manipulao
de atributos contnuos.
Valores numricos dos atributos preditivos foram transformados em trs valores lingusticos
fuzzy: baixo, mdio e alto. Foram utilizados conjuntos fuzzy triangulares uniformemente distribudos nas trs parties. O nmero de conjuntos fuzzy foi definido empiricamente. Os experimentos utilizaram o mtodo de raciocnio fuzzy tradicional, que classifica um novo exemplo
usando a classe da regra com a maior compatibilidade com ele (CINTRA et al., 2011).
Comparados com modelos correspondentes obtidos pelo mtodo clssico, os modelos fuzzy
apresentaram taxas de erro competitivas (CINTRA et al., 2011). Alm disso, o uso dos termos
lingusticos evitaram alteraes bruscas de deciso com base em limites numricos dos atributos
preditivos, uma desvantagem do mtodo tradicional, e permitiram uma interpretao mais natural das regras dos modelos.
Foram ainda desenvolvidos, em colaborao com grupos de pesquisa internacionais, modelos
para a ferrugem do cafeeiro com outras tcnicas de modelagem: equaes de regresso capazes
de predizer intervalos em vez de pontos, usando support vector machines (SVM) (LUACES et
al., 2010); modelos de predio obtidos por aprendizado no determinstico (LUACES et al.,
2011); e predio usando redes bayesianas (PREZ-ARIZA et al., 2012).
Modelos selecionados foram validados com dados diferentes dos usados no treinamento desses
modelos (DI GIROLAMO NETO et al., 2012). Uma vez que os modelos no mantiveram o bom
desempenho nessa validao, iniciou-se um novo ciclo do processo de minerao de dados. O
objetivo foi a evoluo de modelos em rvore de deciso e a gerao de novos modelos com
as tcnicas mquinas de vetores suporte, redes neurais e florestas aleatrias (DI GIROLAMO
NETO et al., 2014).
No novo ciclo do processo, alm do acrscimo das tcnicas de minerao de dados, houve
outras mudanas em termos da metodologia (DI GIROLAMO NETO et al., 2014): incluso de
dados de dois outros municpios da regio cafeeira Sul de Minas, com caractersticas climticas
distintas; uso de mtodo de balanceamento de classes nos dados oriundos das lavouras de baixa
carga pendente; seleo de atributos por meio de mtodos objetivos e automticos; e utilizao
do espao Receiver Operating Characteristic (ROC) para avaliao, comparao e seleo dos
melhores modelos.
As tcnicas de mquinas de vetores suporte e de florestas aleatrias geraram os modelos com os
melhores desempenhos. O procedimento de balanceamento de classes melhorou a taxa de acerto
dos modelos para lavouras com baixa carga pendente. Para alta e baixa cargas pendentes, as
melhores taxas de acerto foram 85,3% e 88,9%, respectivamente. Outras medidas de desempenho como sensitividade e especificidade tambm apresentaram valores altos e equilibrados (DI
GIROLAMO NETO et al., 2014).
3.3 Sistema de alerta da ferrugem do cafeeiro
Sistemas de alerta que utilizam modelos de previso ajudam a promover o uso racional de
agroqumicos, ao indicar as condies que favorecem ou deixam de favorecer uma doena ou
praga, permitindo agir somente quando necessrio. A dificuldade de adoo desses sistemas
um problema comum, que inclui certas restries (CAMPBELL; MADDEN, 1990): complexidade do modelo; dificuldade de obteno dos dados necessrios ao uso do modelo; e custos de
implantao e manuteno do sistema para os produtores.
A abordagem normalmente utilizada no desenvolvimento de modelos empricos consiste em
realizar experimentos de curta durao (dois a quatro anos), em que equipamentos com sensores
para a obteno de dados meteorolgicos so instalados no interior da cultura. Dessa forma, os
modelos obtidos carecem de representatividade quanto s condies meteorolgicas, pelo pouco
tempo de observao dos dados, e o uso deles provavelmente vai requerer dos produtores a instalao e manuteno de equipamentos em suas lavouras.
Outro fator que contribui para a no adoo dos modelos a falta de planejamento das atividades seguintes modelagem. Muitas vezes, o prprio desenvolvimento do modelo o principal
objetivo, como forma de se compreender a epidemia da doena, terminando com uma avaliao
estatstica do seu desempenho. No planejada a sua validao, nem como coloc-lo em situao
de uso real.
A Embrapa Informtica Agropecuria, buscando contribuir para reduzir essas dificuldades, coordenou um projeto em que modelos de predio da ferrugem foram desenvolvidos com diferentes
tcnicas de minerao de dados (DI GIROLAMO NETO et al., 2014), a partir de uma infraestrutura estabelecida h vrios anos de monitoramento de doenas e pragas do cafeeiro. Alguns
dos modelos de melhor desempenho foram selecionados e incorporados em um sistema de alerta
na Web (THAMADA et al., 2013). O propsito do sistema servir como instrumento adicional
de apoio aos tcnicos da Fundao Procaf na elaborao dos comentrios e das recomendaes
fitossanitrias para o pblico-alvo dos seus boletins de avisos mensais.
179
180
A Fundao Procaf, sediada em Varginha-MG, inaugurou em 1998 uma estao de avisos fitossanitrios para a cultura do caf. Com o passar dos anos, junto com o Ministrio da Agricultura,
Pecuria e Abastecimento (Mapa) e outras instituies parceiras, expandiram as estaes de
avisos para outros municpios da regio Sul de Minas e para outras regies produtoras do estado,
como o Tringulo Mineiro e o Alto Paranaba. Mais recentemente, iniciou tambm atuao na
regio Mogiana do Estado de So Paulo.
Em cada estao de avisos, so feitas avaliaes mensais da incidncia de doenas e pragas do
cafeeiro e so registrados dados meteorolgicos por meio de estao meteorolgica automtica.
A partir desse monitoramento, so elaborados e divulgados avisos fitossanitrios em boletins
mensais destinados a tcnicos de assistncia ao produtor, imprensa, cafeicultores, estudantes e
pesquisadores.
O Sistema de Alerta da Ferrugem do Cafeeiro - SafCafe (THAMADA et al., 2013), desenvolvido
pela Embrapa com o apoio do Consrcio Pesquisa Caf e em parceria com a Fundao Procaf,
analisa e informa o risco de epidemias da doena por meio de modelos de alerta desenvolvidos com tcnicas de minerao de dados, no mbito das estaes de avisos fitossanitrios da
Fundao Procaf na regio Sul de Minas Gerais. Os modelos incorporados no sistema obtiveram desempenho satisfatrio durante a modelagem, com acurcia em torno de 83% obtida por
validao cruzada.
Figura 8. Tela de predio do SafCafe para agosto de 2013 em Varginha; destaque da aba de carga alta,
lavoura adensada e limiar de 5p.p. da taxa de progresso da ferrugem do cafeeiro.
O sistema web SafCafe carregado com arquivos de registros horrios das estaes meteorolgicas instaladas nas cidades de Varginha, Carmo de Minas e Boa Esperana e prepara os dados
de entrada para os modelos preditivos. Esses modelos avaliam as condies propcias ou desfavorveis ao desenvolvimento da ferrugem, a partir dos dados preparados e de acordo com certas
caractersticas das lavouras, como a carga pendente de frutos (alta ou baixa) e o tipo de plantio
(largo ou adensado).
predio representam as combinaes dessas opes. A aba selecionada (Alta - 5 p.p. - Adensada)
mostra que o sistema indicou que no haveria aumento acima de 5 p.p. na taxa de progresso da
ferrugem para aquele ms, considerando lavoura de carga alta e plantio adensado. O sistema
exibe esse resultado textualmente e destaca-o por meio de um sinal verde (cone maior verde
esquerda na Figura 8).
O resultado da predio do SafCafe considera um sistema de votao simples entre trs modelos
escolhidos e incorporados ao sistema. O alerta positivo (sinalizado em vermelho) caso dois ou
mais modelos indiquem esse resultado; o mesmo feito para a emisso do no alerta (sinalizado
em verde). No caso da Figura 8, os trs modelos indicaram um no alerta para agosto de 2013
(Alta - 5 p.p. - Adensada).
No fluxo normal de uso do sistema de alerta, o tcnico carrega, no incio de cada ms, um arquivo
contendo dados meteorolgicos registrados ao longo do ms anterior e os valores do nvel de
incidncia da ferrugem nas lavouras avaliados no final daquele ms. Os dados de incidncia da
doena no so usados na predio, mas so importantes para o acompanhamento da evoluo
da ferrugem no campo e do desempenho do sistema. Automaticamente aps o carregamento, o
SafCafe processa os registros para que possam ser utilizados pelos modelos e o sistema fica apto
a realizar as predies.
Abaixo do resultado da predio para o ms escolhido, o sistema apresenta o histrico das predies nos meses anteriores, desde o incio do ano agrcola (quadro inferior da tela do SafCafe
na Figura 8). Alm das predies anteriores, o sistema apresenta os valores de incidncia e da
taxa de progresso da doena que foram observados no campo, na realidade, permitindo, assim,
acompanhar o desempenho do sistema com relao acurcia (taxa de acerto) de seus alertas
positivos e negativos.
Para realizar a predio, necessrio escolher como opes: a estao (Varginha, Carmo de
Minas ou Boa Esperana); a carga pendente de frutos do cafeeiro (alta, baixa ou todas), o limiar
de pontos porcentuais da taxa de progresso da ferrugem a ser considerado (5 p.p, 10 p.p. ou
todas); e o ms para qual desejado realizar a predio. Escolhidas essas opes, o processo
preditivo pode ser acionado.
Com a finalidade de adquirir a confiana necessria para que o SafCafe fosse utilizado no procedimento de elaborao dos boletins, foi realizada uma etapa de validao e confirmao do bom
desempenho dos modelos incorporados ao sistema. O teste do sistema e dos seus modelos foi
realizado com dados no utilizados no treinamento desses modelos durante a fase de modelagem.
A avaliao foi realizada no perodo de trs anos agrcolas (2011/2012, 2012/2013 e 2013/2014)
com dados obtidos na Fazenda Experimental de Varginha.
A Figura 8 mostra uma predio realizada para Varginha, considerando todas as cargas e limiares
da taxa de progresso, para agosto de 2013. As abas situadas logo abaixo da seleo das opes de
A Tabela 2 apresenta os valores de acurcia do SafCafe nos anos agrcolas de validao, para
as combinaes de produtividade (carga alta e carga baixa) e tipo de plantio (adensado e
181
182
limiar menor do que 5 p.p. pode permitir um melhor desempenho dos modelos de previso e,
consequentemente, do sistema de alerta em anos de baixa carga pendente.
Plantio largo
Mdia
2011/2012
2012/2013
2013/2014
2011/2012
2012/2013
2013/2014
2011/2012
2012/2013
2013/2014
2011 a 2014
Limiar 5
81,8
90,9
72,7
72,7
100
81,8
77,3
95,5
77,3
83,3
p.p.*
Limiar 10
90,9
90,9
63,6
90,9
81,8
63,6
90,9
86,4
63,6
80,3
Limiar 5
72,7
81,8
63,6
63,6
81,8
63,6
68,2
81,8
63,6
71,2
p.p.*
Alerta emitido quando a taxa de progresso da ferrugem do cafeeiro est prevista para aumentar alm do limiar definido
em pontos porcentuais (5 p.p. ou 10 p.p.).
Um aspecto bastante importante a ressaltar que o sistema de alerta foi exato na identificao do
incio da epidemia da ferrugem nos trs anos agrcolas avaliados. No ano 2011/2012, o sistema
acertou o incio da epidemia em janeiro de 2012, indicando acertadamente que a evoluo mais
acentuada da doena no comearia em dezembro de 2011. Nos anos seguintes, 2012/2013 e
2013/2014, o sistema indicou corretamente o incio das epidemias em dezembro. A confiabilidade desse tipo de informao importante para ajudar o produtor a decidir pelo melhor momento
de iniciar o controle da ferrugem do cafeeiro nas lavouras.
Conclui-se que o sistema de alerta da ferrugem do cafeeiro apresentou desempenho bastante
satisfatrio nos anos agrcolas avaliados, especialmente para lavouras com carga pendente alta
e considerando os alertas para o limiar de 5 p.p. Dessa forma, acredita-se que o sistema SafCafe
vai ser til aos responsveis pela elaborao dos comentrios e das recomendaes divulgados
nos boletins de avisos fitossanitrios da Fundao Procaf.
largo), como tambm as mdias em cada ano e a mdia geral obtida no perodo todo de 2011
a 2014.
A acurcia do sistema no ano 2011/2012 ficou bem prxima da obtida no treinamento dos modelos, considerando carga alta e alerta para o limiar de 5 p.p. no plantio adensado (81,8%). No caso
do plantio largo, houve um decrscimo da taxa de acerto (72,7%) devido a dois falsos positivos
- previso de aumento maior ou igual a 5 p.p. que no se confirmou no campo - emitidos pelo
sistema. Tambm para carga alta, o desempenho em 2011/2012 dos alertas para o limiar de 10 p.p.
foi timo (90,9%), nos dois tipos de plantio.
O SafCafe obteve os melhores resultados no ano agrcola 2012/2013, com desempenho excelente
para carga alta e alerta para o limiar de 5 p.p. (90,9% no plantio adensado e 100% no plantio largo) e resultados muito bons do alerta para o limiar de 10 p.p. (90,9% e 81,8%, respectivamente).
Em outras palavras, o sistema previu com exatido a evoluo da taxa de progresso da ferrugem,
considerando o limiar de 5 p.p., durante todo o ano agrcola de carga alta na lavoura de plantio
largo.
No ano agrcola 2013/2014, o desempenho do sistema no foi to bom para as lavouras de
carga alta, principalmente com relao ao alerta para o limiar de 10 p.p. (63,6%). O sistema
acompanhou razoavelmente a evoluo da ferrugem com relao aos alertas para o limiar de
5 p.p. (72,7% no plantio adensado e 81,8% no plantio largo), incluindo o perodo em que a
doena esteve pressionada pela falta de chuva (janeiro a maro), mas no identificou a evoluo tardia da doena a partir de abril. Nos trs meses em que a taxa de progresso da ferrugem
no campo ultrapassou 10 p.p. (abril, junho e julho), no foram emitidos alertas considerando
esse limiar.
A acurcia do sistema para lavouras de carga baixa foi boa somente no ano 2012/2013 (81,8%
nos dois tipos de plantio). Nos outros anos avaliados, o desempenho foi fraco. Uma possvel
explicao que o limiar do alerta em 5 p.p. pode no estar adequado, uma vez que a evoluo
da ferrugem menos acelerada em anos de carga baixa. Sugere-se, ento, a hiptese de que um
4 Consideraoes nais
Este captulo mostrou como a aplicao de uma srie de tecnologias pode contribuir significativamente para a reduo de perdas e riscos associados a problemas sanitrios que afetam
virtualmente todas as reas da agropecuria. Apesar dos avanos significativos j alcanados,
importante observar que a histria da aplicao das TIC a problemas zoofitossanitrios muito
recente, havendo ainda muitas oportunidades de pesquisa a serem exploradas no futuro. Com
a evoluo dos recursos computacionais disponveis, tecnologias com custo computacional e
financeiro proibitivos passam a ser opes viveis, ampliando ainda mais as possibilidades de
avanos.
Esforos de pesquisa futuros devero se concentrar na criao e aplicao de novas tecnologias
aos (muitos) problemas para os quais ainda no h uma soluo satisfatria e estender tecnologias bem-sucedidas j desenvolvidas a problemas similares que ocorram em outras lavouras,
criadouros e rebanhos. importante enfatizar que muitas dessas tecnologias esto sendo planejadas, desenvolvidas e adaptadas de modo a explorar a crescente popularizao e o aumento do
poder computacional de dispositivos mveis, expandindo significativamente a aplicabilidade e o
alcance das novas ferramentas desenvolvidas.
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189
Captulo
191
AgroTIC em agricultura de
preciso e automao agrcola
10
1 Introduo
A agricultura est incorporando tecnologias emergentes para enfrentar novos desafios que levem mudana do padro tecnolgico a fim de produzir alimentos para uma populao global
estimada em nove bilhes em 2050. Tal fato exigir um aumento de 70 porcento na produo de
alimentos de forma sustentvel e segura (FAO, 2009).
Nesse contexto as tecnologias da informao e comunicao aplicadas agricultura (AgroTIC)
j esto sendo utilizadas e tm uma participao crescente e importante na gesto da cadeia valor. As AgroTIC esto evoluindo de forma contnua e tm atrado e aumentado os investimentos
pblicos e privados em pesquisa agrcola, transferncia de tecnolgica, extenso rural e desenvolvimento agrcola.
AgroTIC um termo abrangente, sendo definido como: a combinao de hardware, software
e instrumentos de produo que permitam coleta, armazenamento, troca, processamento e
manejo da informao e do conhecimento. De acordo com a Agncia dos Estados Unidos para
Cooperao Internacional (Usaid), as TIC incluem tecnologias e mtodos para armazenar, manejar e processar informao (por exemplo: computadores, softwares, livros, PDAs, tablets, androides, livrarias digitais e no digitais) e para comunicar a informao (por exemplo: correio, correio eletrnico, rdio, televiso, telefones, celulares, pagers, internet etc). A reduo de seu preo,
acessibilidade e adaptabilidade, alm de suas novas capacidades, tornaram seu uso indispensvel
no setor agrcola. Produtores podem utilizar a internet, telefone e outras ferramentas e tecnologias digitais para: previso do tempo, manejo de frota de veculos, rastreamento de produtos agrcolas, informaes sobre preo de insumos, servios, produtos, acesso a mercados, variedades,
tcnicas de produo, servios de armazenamento, processamento etc. Servios especializados,
disponibilizados pelos setores pblico e privado, como o uso de satlites ou sensores remotos,
armazenamento e processamento de grandes quantidades de dados em aplicativos mveis tm
sido utilizados para planejar a produo, evitar perdas de safra, gerir a cadeia financeira etc.
Estudos realizados pelo FutureFarm1 confirmam esses fatos e adicionam que as AgroTIC contribuiro para o estabelecimento de prticas de manejo baseadas em robtica e automao de
processos agrcolas.
1
192
Para exemplificar o uso das AgroTIC possvel citar que as perguntas feitas pelos agricultores
podem ser respondidas de modo rpido e preciso quanto s formas de aumentar a produtividade
e minimizar os riscos devido s condies climticas. O uso das TIC tem permitido o encontro
entre agricultores, especialistas e outros agentes para selecionar as melhores solues tecnolgicas em uma determinada situao ou local.
Esses exemplos representam apenas um subconjunto dos servios de informao e comunicao
que podem ser fornecidos para o setor agrcola por meio das TIC, cada vez mais comuns e acessveis na agricultura. Tais fatos tm promovido mudanas nas formas de produo de alimentos.
Com esse conjunto de tcnicas possvel planejar a produo agrcola, florestal e animal e
usar de forma mais eficiente os recursos naturais biticos e abiticos, os insumos qumicos e
biolgicos, o capital humano, a infraestrutura e o que h de mais relevante no conhecimento
gerado pelas instituies de cincia e tecnologia. O uso das TIC tambm permite minimizar
os riscos associados s mudanas climticas e s doenas e pragas. As inovaes associadas s
TIC permitem produzir, de forma eficiente, aumentando a quantidade, a qualidade e atendendo,
dessa forma, aos requisitos do mercado. Hoje a produo de alimentos, quer seja pela produo
convencional, orgnica ou por outros protocolos, como a Produo Integrada do Ministrio da
Agricultura, Pecuria e Abastecimento (Mapa) e o GLOBAL-GAP, devem atender s normas
para que sejam rastreveis e tenham conformidade de certificao de qualidade, de bem estar
animal e de pegada ecolgica.
Novas formas de produo e gesto tm se beneficiado do uso das AgroTIC. Queirs et al. (2014)
mostram como a agricultura de preciso (AP) tem se beneficiado da utilizao das tecnologias
da informao e comunicao na agricultura. Rusten e Ramirez (2003), citados por Queirs et al.
(2014), apontam que o conhecimento tecnolgico um componente importante para o desenvolvimento do setor agrcola e que as AgroTIC aceleram o desenvolvimento do setor por organizar e
facilitar a transferncia do conhecimento entre os atores que atuam no setor. Afirmam, ainda, que
as organizaes de pesquisa tero um papel fundamental tanto na identificao de necessidades
de mtodos adequados de manejo e de tomada de decises, como tambm na identificao de
novas necessidades tecnolgicas para que o uso das AgroTIC em Agricultura de Preciso e na
Automao Agrcola seja mais eficaz, eficiente e mais fcil de ser utilizado. Estudos realizados
pelo projeto FutureFarm indicam que aps 2030 a agricultura ser norteada pelo conhecimento,
fato que exigir a adoo integral das AgroTIC para a gesto racional, eficiente e efetiva dos
processos produtivos.
importante ressaltar que as AgroTIC no so isoladamente um fim para o desenvolvimento
agrcola. Incertezas ainda permanecem em como tornar essas inovaes replicveis, escalveis
e sustentveis para uma populao mundial diversificada e crescente, que exige alimentos seguros, tnicos, rastreveis e produzidos de forma sustentvel. Nesse contexto, o propsito central
desse captulo o de diagnosticar e de analisar a situao atual, as tendncias evolutivas e as
possveis mudanas das AgroTIC na pesquisa agrcola, na transferncia de conhecimento e no
desenvolvimento da agricultura brasileira relacionado Agricultura de Preciso e Automao
Agrcola.
2 Estado da arte
2.1 Uso de padres para integrao e interoperabilidade de dados em agricultura de preciso
Estudos direcionados a padronizar o armazenamento de dados e a arquitetura de sistemas de
informao distribudos que permitam a integrao desses dados, de forma simples e transparente, so de extrema importncia para facilitar o uso das AgroTIC (QUEIRS et al., 2014).
O projeto europeu FutureFarm produziu uma especificao para um sistema de informao de
gesto agrcola com ateno para essas questes. Nessa especificao todos os dados devem ser
documentados e armazenados na linguagem padronizada para troca de dados agroXML e a arquitetura distribuda deve ser a arquitetura Service-Oriented Architecture (SOA) (BLACKMORE;
APOSTOLIDI, 2011). Nos Estados Unidos a AgGateway, uma organizao sem fins lucrativos
que tem por viso ser reconhecida internacionalmente por promover o uso das TIC na Agricultura
de Preciso, lanou o projeto padronizando o intercmbio de dados da AP (SPADE) . O projeto
visa atender s demandas dos produtores no sentido de tornar mais amigvel o uso de equipamentos e aplicativos em AP (AGGATEWAY, 2013).
No Brasil, a Rede de Agricultura de Preciso da Embrapa - Rede AP - atenta necessidade de
adoo de padres para armazenamento e intercmbio de dados e informaes, e de uma arquitetura orientada a servios que permita a interoperabilidade entre sistemas, mantendo a memria, a
preservao, a recuperao e o intercmbio com qualidade dos dados produzidos pelas unidades
pilotos, desenvolveu um repositrio de recursos de informao2 que usa o perfil de metadados
Perfil de Metadados Geoespaciais do Brasil - verso homologada em 2009 pelo Comit de
Planejamento da Infraestrutura Nacional de Dados Espaciais (Concar) - para catalogar os dados
geoespaciais e com arquitetura que permite a integrao e interoperabilidade de aplicaes. Na
Figura 1a mostrada a estrutura do banco de dados e sua integrao com a camada de aplicao.
Os recursos de informao digitais suportam os formatos shapefile, raster, txt, doc,xls, jpg e pdf,
e esto associados a elementos de metadados. J a camada de aplicao composta pela integrao de ferramentas de softwares livre, como banco de dados PostgreSQL3, WebGIS i3Geo4
e o aplicativo para catalogao de dados geoespaciais GeoNetwork5, e de conversores de dados
dos equipamentos de sensoriamento usados pela Rede AP, com a funo de realizar a interface
com os usurios. Na Figura 1b so ilustrados os elementos de metadados selecionados, customizados, criados e em uso, para a catalogao de dados geogrficos e no geogrficos (somente
tabulares). Nesse diagrama os elementos de metadados foram agrupados numa generalizao e
especializao. A generalizao do diagrama representa os elementos de metadados que devem
ser preenchidos, independente do tipo de dado ser tabular ou geogrfico. J na especializao
expressa, os elementos de metadados devem ser preenchidos somente para o tipo geogrfico.
Vale ressaltar que dois novos elementos foram criados dentro da Seo Identificao do Perfil
de Metadados Geoespaciais do Brasil: Observao para contemplar qualquer observao ou
necessidade de documentao que por ventura no possa ser expressa pelos demais elementos
2
193
194
de metadados selecionados; e Responsvel pela Catalogao para identificar o autor de documentao dos metadados. Com relao ao elemento Observao, a ideia analisar a frequncia
de necessidade de uso desse descritor para, posteriormente, eleger ou criar novas sees ou elementos que atendam s especificidades de documentao do projeto AP (QUEIRS et al., 2011).
O grande avano conseguido pelo projeto permitir a obteno de sries histricas espaciais e
temporais de dados do clima, das propriedades fsicas e qumicas do solo, dos parmetros de
desenvolvimento e de produtividade de plantas, sendo elemento chave no s para alimentar as
novas necessidades de pesquisa, mas tambm para rastreabilidade e comparao entre sistemas
que adotaram a AP. Considerando que o repositrio da Rede AP e seus resultados permitiram o
estabelecimento de padres adequados para operacionalizar, armazenar, recuperar, intercambiar
e interoperar os dados e informaes obtidas nas unidades pilotos, de forma quantitativa e qualitativa, possibilitar tambm que essa experincia seja extrapolada para o manejo de propriedades
agrcolas. Esse repositrio foi concebido para atender necessidades futuras de organizao e
tratamento de informao.
2.2 Sistemas de suporte deciso e sistemas de informao para gerenciamento integral da
propriedade agrcola
A Figura 2 exemplifica o sistema de produo e os processos que nele ocorrem. Informaes
georreferenciadas dos atributos do solo (caractersticas fsicas, qumicas e biolgicas) so coletadas, transmitidas e analisadas para que sejam estabelecidas as capacidades produtivas de reas
do terreno. Em funo dessa anlise, informaes so transmitas s mquinas e aos equipamentos
para a aplicao automatizada de corretivos e fertilizantes em taxas variveis. Em seguida, ocorre
a operao de semeadura/ou plantio (mudas) automatizada com a utilizao de plantas adequadas
s diferentes capacidades produtivas do terreno, ou seja, para explorar a mxima capacidade produtiva do solo. Posteriormente, ocorrem as operaes de manejo da cultura. Os estresses biticos
(patgenos, insetos e plantas daninhas) e abiticos (deficincias hdricas e nutricionais) podem ser
determinados e georreferenciados pela utilizao de sensores remotos (por satlite, avio, Vant).
Todas essas informaes so armazenadas e transmitidas numa linguagem padro de intercmbio,
por exemplo AgroXML, para uma central, onde sero processadas e analisadas por um sistema
especfico de deciso, que encaminhar as decises, em conformidade com o padro ISOBUS6,
para as mquinas equipadas com sistema de direo automtica e equipamentos, que realizaro
as operaes de aplicao georreferenciadas em taxas variveis de insumos (gua, fertilizantes,
defensivos, agentes de controle biolgico etc). O ciclo iniciado novamente aps a colheita com
a utilizao de sensores de produtividade e/ou de qualidade (contedo de protena, leo ou outro
parmetro), cujos dados so enviados central de processamento para a obteno de mapas.
Sistemas de Suporte Deciso (SSD) e AgroTIC so partes essncias da Agricultura de Preciso
para a coleta, manejo, anlise e uso das informaes espaciais e temporais.
Os SSD seguem alguns princpios essenciais:
1) Inteligncia, que se refere tomada de decises baseadas em informaes.
2) Design, refere-se ao desenvolvimento de uma soluo ou ao alternativa que pode mitigar ou
aliviar o problema.
3) Escolha, refere-se escolha da ao ou soluo mais apropriada ao problema identificado no
processo de design.
4) Implementao da ao ou soluo escolhida, no processo de design, para remediar o problema.
Uma possvel maneira de se realizar essa categorizao, de maneira a cobrir quase todos os aspectos da combinao TIC/Agropecuria, base-la no fluxo que vai da observao do cenrio
vigente tomada de decises. Sob essa tica, os desafios podem ser divididos em trs grupos
principais:
1) Gerao de dados a partir da realidade observada.
2) Tratamento dos dados de modo a gerar informaes relevantes.
3) Explorao das informaes a fim de subsidiar a tomada de decises.
O primeiro ponto basicamente o objetivo da Agricultura de Preciso (AP), a qual vem ganhando cada vez mais espao devido aos benefcios que esta pode trazer a toda a cadeia produtiva
195
196
(SCHEPERS et al. 2000; WOLF; WOOD, 1997). Com isso, vem sendo gerada uma grande quantidade de dados relacionados aos mais diferentes aspectos da cadeia agroindustrial.
O segundo ponto colocado acima ocupa-se exatamente do tratamento, processamento e explorao desses dados para que possam ser efetivamente transformados em informaes relevantes.
Dentre as tecnologias capazes de realizar essa tarefa, encontram-se mtodos de modelagem baseados nos dados gerados (PAPAJORGJI; PARDALOS, 2009), tcnicas de processamento digital
de imagens e viso computacional capazes de explorar a grande quantidade de dados visuais
que vm sendo gerados (BARBEDO, 2013a), e tcnicas de Big Data para os casos em que a
quantidade de dados gerada muito grande para ser processada por mtodos mais convencionais
(HOWE et al., 2008).
Por fim, o terceiro ponto visa explorar toda a informao gerada para ajudar nas tomadas de
deciso que iro definir os rumos da lavoura. A integrao de toda essa informao proveniente
de diferentes fontes, de maneira que essa possa ser explorada de maneira sistmica, um dos
maiores desafios da pesquisa agropecuria no momento. Sistemas capazes de realizar essa tarefa
so comumente chamados de Sistemas de Gerenciamento de Informaes da Lavoura (Farm
Management Information Systems) (NIKKILA et al., 2010).
Como exemplo do uso das TIC/Agropecuria possvel citar Barbedo (2013b, 2013c) que
vem desenvolvendo uma metodologia semiautomatizada, tendo como base ferramentas como
aprendizado de mquina e morfologia matemtica, e uma parte interativa baseada no conceito de
sistemas especialistas para a deteco de doenas de plantas.
Outro caso do uso das TIC/Agropecuria so os estudos com as culturas do caf (GIROLAMO
NETO et al., 2014; LUACES et al., 2011; MEIRA et al., 2009) e da soja (MEGETO et al., 2014)
que explora a descoberta de conhecimento em bases de dados para a anlise e para formular o alerta
de doenas de plantas por meio de tcnicas de minerao de dados. A partir de dados de ocorrncia
e de incidncia de doenas de culturas agrcolas e de outros dados de interesse, como, por exemplo,
registros de estaes meteorolgicas automticas, o objetivo descobrir padres e gerar modelos
capazes de predizer o progresso das doenas estudadas e auxiliar na tomada de deciso. Segundo
os mesmos autores a tomada de deciso consiste em identificar os momentos oportunos para a
aplicao de medidas de controle das doenas, visando racionalizao no uso de agroqumicos e,
consequentemente, diminuio de custos para o produtor e menor risco de contaminao das pessoas e do ambiente. Os autores selecionam os melhores modelos que so incorporados em um sistema
web de alerta para apoio a tcnicos responsveis pela emisso de boletins de avisos fitossanitrios.
Para a operacionalizao de Sistemas de Informao para Gerenciamento Integral da Propriedade
Agrcola (FMIS), a integrao, ubiquidade, alta capacidade de processamento de dados e sistemas de controle de decises devem ser incorporados.
Queirs et al. (2014) recomendam que a integrao de dados e informaes obtidas por redes de
sensores sem fio, ou que dados espaciais e temporais dos agroecossistemas, sejam tratados por
padres de representao e comunicao (agroXML, ISOBUS entre outros) entre sistemas numa
arquitetura computacional distribuda, como o Arquitetura Orientada a Servio (SOA). Devido
vasta quantidade de dados e informaes obtidas, o processamento e anlise em infraestruturas
de alto desempenho computacional, como a computao em nuvens, grid, processamento paralelo, entre outros, necessrio, para o desenvolvimento de um sistema de informao de gesto
agrcola automatizado, que seja robusto e confivel.
O avano dos sistemas embarcados aliado ao custo decrescente de equipamentos digitais tem
sido fecundo para realizao de constantes investimentos em infraestrutura de telecomunicaes
em todo mundo (BALLANTYNE et al., 2010). Equipamentos como celulares, tablets, computadores pessoais - cada vez mais presentes no dia a dia das pessoas - conectados Internet traz uma
grande oportunidade de conectividade entre a cincia, produtores e demais atores relacionados
ao contexto da Agricultura. Essa conectividade facilitada quanto mais simples, autnomos e
imperceptveis forem os sistemas embarcados e equipamentos associados. A busca por no notoriedade da presena de computadores entre humanos, por meio da simplicidade de operao e
maximizao do funcionamento autnomo, tem sido conhecida por computao ubqua. Torre
Neto (2009) aponta como concepo da computao ubqua a fuso dos computadores com o
ambiente, a ponto de tornarem-se invisveis para os usurios.
As tecnologias da AP tem se beneficiado dessa conectividade, em especial conectividades por
meio de redes sem fio, e da computao ubqua, nas quais sensores, redes de sensores, atuadores
e sistemas de controle podem coletar dados, process-los, realizar atuao e encaminhar informaes para um computador servidor na sede da fazenda ou diretamente para algum servio de
nuvem disponvel de forma autnoma e em tempo real. Como exemplo, a tecnologia de piloto
automtico, amplamente difundida na AP, permite que um veculo agrcola trafegue pela lavoura sem interveno humana - sendo a coleta de informao dos sensores do motor, direo,
localizao espacial, entre outros, e a atuao na direo so realizadas de forma transparente e
automtica. Ainda nesse exemplo, o agricultor poderia monitorar em tempo real a rota realizada
por meio de um aplicativo instalado em um tablet em qualquer lugar do mundo (HEST, 2013).
Esses equipamentos, por atuarem de forma transparente, auxiliam o produtor a reduzir os erros
e, portanto, reduz a variabilidade espacial antrpica e natural do campo.
Torre Neto (2009) tem abordado o monitoramento de controle de processos na agropecuria
atravs do uso das inovadoras tecnologias de rede de sensores sem fio e da computao ubqua
por meio das seguintes atividades: a) a irrigao espacialmente diferenciada; b) a pulverizao
de preciso; c) o mapeamento da fertilidade do solo; d) a rastreabilidade animal e vegetal; e) as
mudanas climticas e os problemas fitossanitrios.
2.3 Manejo de insumos em funo da variabilidade espacial do campo
A principal hiptese para a adoo das tecnologias de Agricultura de Preciso a existncia
da variabilidade espacial no campo. Luchiari Junior et al. (2001) conceituam zonas de manejo
como sendo reas do terreno de iguais produo potencial, eficincia do uso de insumos e risco
de impacto ambiental. Os autores utilizaram mapas de colheita, mapas de condutividade eltrica
do solo, mapas de classificao de solos, imagens do solo e de plantas para delinear zonas homogneas de manejo e para direcionar as amostragens de solo. Shanahan et al. (2000) usaram
procedimento similar para analisar o efeito de diferentes densidades de plantio em funo das
caractersticas do terreno e seus efeitos nos rendimentos do milho. Luchiari Junior et al. (2002)
aplicaram o conceito de zonas homogneas de manejo em solos tropicais de cerrados, cultivados
com culturas anuais em plantio direto.
O uso de nutrientes dentro do conceito de zonas de manejo deve focar vrios aspectos. A demanda por nutrientes pelas culturas depende de vrios fatores, dentre eles a cultura e suas variedades,
o potencial de rendimento e qualidade dos gros, a distribuio de chuvas e o potencial produtivo
do solo. Os principais atributos do solo que determinam seu potencial produtivo so aqueles res-
197
198
ponsveis por manter a gua no solo e fornecer nutrientes, como a textura, estrutura, agregao
e sua estabilidade, relao macro e microporosidade, grau de compactao do solo e densidade.
Os atributos fsicos do solo muitas vezes so utilizados de forma reduzida na definio de zonas
de manejo. Alguns deles, como a densidade do solo, poderiam ser incorporados no plano de manejo, pois impedimentos fsicos para o crescimento radicular, mesmo em reas onde a fertilidade
qumica alta, fazem com que o potencial produtivo do solo seja reduzido, bem com o potencial
da cultura.
Fraisse et al. (2001) desenvolveram o primeiro aplicativo para delinear zonas homogneas com
o propsito de aplicao de nutrientes em taxa variada, o Management Zone Analyst (MZA). O
software MZA requer informaes quantitativas e georreferenciadas do terreno, condutividade
eltrica aparente, da altitude, para que matematicamente o campo seja dividido em clusters e um
nmero otimizado de zonas de manejo seja determinado automaticamente. O uso do software,
conforme relato dos autores, tem sido usado por pesquisadores, organizao de produtores,
consultores e provedores de servios agrcolas nos Estados Unidos e em 35 pases ao redor do
mundo. O conceito de zonas homogneas vem evoluindo para selecionar os cultivares, densidade
de plantio, prticas de manejo integradas de soloplanta-gua e aplicao de agroqumicos de
forma racional e criteriosa, baseada no potencial produtivo de cada zona homognea. Bassoi et
al. (2012) utilizaram essa prtica em videira irrigada e mostraram que, mesmo no primeiro ciclo
de cultivo, foi possvel diferenciar a aplicao de gua na rea com o uso de sensores de umidade
do solo instalados em zonas de manejo, previamente estabelecidas com base em atributos fsico-hdricos do solo, e mostraram que a lmina de gua aplicada foi reduzida em algumas dessas
zonas sem prejuzo produtividade da cultura.
como a classificao da p1 em cinco classes com intervalos iguais. Esse tema fica disponvel na
rvore de temas da unidade piloto aps o upload, e os usurios do repositrio podero efetuar o
download do mesmo em formato shapefile se essa permisso foi concedida pelo autor no momento do upload. A Figura 3, abaixo, mostra a sequncia de passos executados, desde a coleta de
dados em campo at a exibio das informaes em forma de mapa. Pontos fortes dessa ferramenta so: a) a transformao de arquivos texto obtidos em campo para um formato capaz de ser
visualizado e manipulado pelo usurio em forma de mapa, cuja interface de upload de arquivos
pode ser visto na Figura 4; b) a relao exibio dos dados, inicialmente os temas de condutividade eltrica do solo so criados com legenda padro e classificao em cinco intervalos iguais
referentes s medidas de p1 (0 cm a 30 cm) e permite ao usurio modificar essas configuraes,
variando os campos utilizados na classificao, bem como o mtodo utilizado para a realizao
Speranza et al. (2011) criaram um sistema de armazenamento e recuperao de dados georreferenciados de condutividade eltrica do solo para duas profundidades de medidas - 0 a 30 cm (p1)
e 0 a 90 cm (p2). Os arquivos gerados pelo equipamento durante a coleta so em formato texto e
seguem um padro especfico. Cada linha do arquivo, contendo uma coleta realizada, disponibiliza a latitude, longitude e altitude do ponto coletado, alm dos valores de p1 e p2, em mili Siemens
por metro (mS/m). Para construo do conversor dos dados da condutividade eltrica do solo
obtidas pelo equipamento VERIS foram utilizadas as linguagens PHP e JavaScript. Esse conversor foi includo como uma ferramenta do repositrio de dados da Rede Agricultura de Preciso
da Embrapa (SPERANZA et al., 2011), baseado no servidor de mapas MapServer (Ambiente de
software livre para construo de aplicativos espaciais na internet) e no software i3Geo (http://
www.mma.gov.br) que um WebGIS (aplicativo desenvolvido para o acesso e anlise de dados
geogrficos via web) que permite a exibio dos dados coletados em forma de mapa que pode ser
disponibilizado e acessado via Web. Os dados vetoriais do repositrio da Rede AP so armazenados no Sistema Gerenciador de Banco de Dados (SGBD) PostgreSQL com extenso espacial
PostGIS. Cada coleta de dados pode conter um ou mais arquivos e, por esse motivo, a interface
da ferramenta permite o upload de vrios arquivos ao mesmo tempo.
Alm disso, essa interface possibilita a informao de alguns metadados pelo usurio, como
Ttulo, Data e Crditos, constituindo uma pr-catalogao da informao. Quando o upload
realizado, a ferramenta cria um novo tema que conter a configurao bsica para a exibio dos
dados em forma de mapa. Cada um dos pontos de coleta convertido no formato POINT disponvel no PostGIS, e armazenado em uma tabela juntamente com os dados de profundidade (p1 e
p2) e de altitude. O tema criado possui algumas configuraes bsicas geradas automaticamente,
199
200
Outra forma de definir zonas de manejo e o vigor de cultivos pode ser utilizando imagens multispectrais. Luchiari Jnior et al. (2011) utilizaram esse procedimento para detectar, georeferenciar
e mapear regies de variabilidade causadas por doenas, deficincia nutricional, estresse hdrico,
que refletem diretamente no vigor da planta, causando um declnio na produo de biomassa; e
para mapear nveis de nitrognio nas plantas que correlacionam resposta espectral com elevados
nveis de clorofila e altas taxas de fotossnteses. Dentre esses ndices podemos destacar o de vegetao de diferena normalizada na faixa do verde - Green Normalized Difference Vegetation
ndex (GNDVI) (SHANAHAN et al., 2001) e o de Vegetao Ajustado do Solo (SAVI) (BARET
et al., 1989; HUETE, 1988; RONDEAUX et al, 1996). Estudos para estabelecimento de algoritmos para manejo de nutrientes utilizando sensores ativos de dossel, utilizando o ndice de
vegetao normalizada (NDVI) vm sendo realizados no Brasil. Resende et al. (2014) destacam
que um avano importante foi a disponibilizao de sensores multiespectrais. Quando acoplados
a veculos agrcolas, esses sensores podem viabilizar de maneira gil a obteno de informaes
espacializadas sobre o estado nutricional das lavouras em relao ao nitrognio (N). Se associados a equipamentos dotados de controladores de aplicao em taxa variada de fertilizantes,
possibilitam o redimensionamento de dosagens de N em tempo real durante as adubaes de cobertura. Resende et al. (2014) citam que no Brasil a utilizao desse tipo de sensor encontra-se em
fase de teste para desenvolvimento de algoritmos para aplicao de N em tempo real nas culturas
da cana-de-acar (AMARAL; MOLIN, 2011), do milho (POVH et al., 2008; SHIRATSUCHI et
al., 2011; 2014) e do trigo (GROHS et al., 2011; PIRES et al., 2014; POVH, et al., 2008).
Recentemente est crescendo a utilizao de imagens multiespectrais adquiridas pelos Veculos
Autonomos no Tripulados (VANT) pelas instituies de pesquisas e servios de imageamento
disponveis no mercado por companhias privadas. As vantagens da utilizao dessa tecnologia
so: aquisio de imagens multiespectrais com alta resoluo espacial; custo de obteno inferior
a imagens de satlites ou fotos areas; aquisio de imagem a qualquer instante; aquisio de
imagens em tempo nublado por ser possvel realizar voos abaixo da altura das nuvens; capacidade de execuo de trabalhos repetitivos e perigosos em locais de difcil acesso.
Devido aos poucos estudos sobre a aplicao de fitorreguladores (QUEIRS et al., 2005), propuseram e desenvolveram um sistema para automatizar o mapeamento de alturas de plantas de
algodo com a inteno de auxiliar na formulao de dose variada de reguladores de crescimento.
Os autores desenvolveram um prottipo baseado em conjunto de sensores ultrassnicos montados em uma barra, acoplada na parte frontal do pulverizador de maneira a no entrar em contato
com as plantas sobre as fileiras de produo (Figura 6). Cada sensor estima a altura das plantas de
uma fileira de produo considerando o tempo gasto entre a emisso e o retorno da onda sonora
emitida na parte superior da planta. Shiratsuchi et al. (2005) justificam o desenvolvimento desse
sistema com o mapeamento de uma rea comercial de 50 ha de produo de algodo no municpio de Correntina, BA, onde constataram alta variabilidade na altura do algodo, conforme pode
ser observado na Figura 7.
Segundo os autores, a justificativa de desenvolvimento do prottipo corroborada por Thurman
e Heinieer (1998, 1999), onde foi conduzido experimentos em duas diferentes resolues de
amostragem (a cada 0,1 ha e 0,3 ha) de alturas de algodo em fazendas na Carolina do Norte.
Os autores concluram que a variabilidade de altura das plantas de algodo grande o suficiente
para justificar a aplicao taxa variada de regulador de crescimento e relatam ganho de produtividade de 51-74 kg.ha-1 em relao a reas com aplicao tradicional uniforme devido
variabilidade de altura inerente do algodo. (QUEIROS et al., 2005) concluem que o sistema
prottipo vivel para mapeamento automtico das alturas, entretanto ressaltam a importncia
de mais pesquisas para o contnuo aprimoramento e adequao s realidades de produo do
cotonicultor brasileiro. Uma evoluo do sistema proposto por Magalhes et al. (2010) e Queiros
et al. (2005, 2010), que desenvolveram um sistema de controle para aplicao taxa variada e
em tempo real de fitorreguladores na cultura do algodoeiro, foi a criao de um dispositivo de
controle. Os autores consideraram a hiptese que utilizando este dispositivo de controle com
sistema hidrulico e controle eletrnico, possvel, em tempo real, variar a taxa de aplicao de
fitorreguladores no algodo, baseado nas informaes obtidas nos sensores de ultrassom, que
detectam a altura das plantas tambm em tempo real; no algoritmo de crescimento da planta
e na dosagem do fitorregulador estabelecido pelo usurio do sistema. O dispositivo proposto
(Figura 8) composto de trs sistemas: Hidrulico, Ultrassom e Controle. O sistema Hidrulico
Figura 6. Prottipo para estimar a altura de plantas de algodo com sensores ultra-snicos - (A) ilustrao
da emisso e recepo da onda sonora, (B) ilustrao do arranjo de sensores montados na barra acoplada
da parte frontal do pulverizador.
Fonte: Queirs et al. (2005).
201
202
Figura 7. Variabilidade espacial de altura do algodo constatada numa rea comercial de 50 ha no municpio de Correntina, BA. Cada cor corresponde a regies de alturas diferentes sendo c0 at c9 as regies de
alturas em cm e s o desvio padro de altura em cada regio.
consiste do comando de pulverizao e circuito eletrnico para aquisio de dados e atuao nos
componentes desse comando. O sistema de Ultrassom um circuito eletrnico composto por
um conjunto de sensores ultrassom que realizam a medio da altura de plantas de algodo. O
sistema de Controle o ncleo do dispositivo, pois o responsvel por gerenciar as informaes
dos sistemas Hidrulico e de Ultrassom e, com um algoritmo de controle Proporcional-IntegralDerivativo (PID) retroalimentado pelo sensor de presso e regras de aplicao de fitorregulador,
capaz de variar a dose em tempo real, controlando as vlvulas do comando de pulverizao. Os
circuitos eletrnicos foram desenvolvidos com base na arquitetura microcontrolada PIC18F452
e comunicao sem fio por meio de mdulos de rdio frequncia que implementam o protocolo
ZigBee. Para o desenvolvimento das interfaces (Figura 9) de validao dos trs sistemas, adotou-se tecnologias de software livre, como a linguagem de programao Java, ambiente de desenvolvimento Netbeans6 e sistema operacional Linux. Para a validao do Dispositivo proposto, foi
utilizado um mapa de uma rea de 7.3 ha com o registro georreferenciado de alturas de plantas
de algodo e regras de aplicao de fitorregulador, considerando as velocidades de pulverizao
2,5 m.s-1 e 5 m.s-1. Independentemente das velocidades simuladas, houve potencial economia de
aplicao de regulador de crescimento. Tambm foram realizadas validaes para verificar se
o dispositivo proposto manteria a presso desejada, simulando o entupimento de bico de forma
lenta e rpida. Os resultados mostram que em ambas as situaes a presso mantida prxima
ao valor desejado. Com os resultados obtidos, conclui-se que o dispositivo proposto atende ao
objetivo de sua proposio.
Figura 8. Viso geral dos componentes desses sistemas que formam o dispositivo de aplicao de fitorreguladores taxa variada.
203
204
Os autores relatam que as aplicaes realizadas em laboratrio pelo sistema de controle mostraram que possvel variar a dose de fitorregulador em tempo real. Entretanto, necessrio que
mais pesquisas sejam realizadas com a finalidade de buscar seu aperfeioamento contnuo.
Para incrementar a eficincia da aplicao de agrotxicos, Pessoa e Chaim (1999) desenvolveram um programa de computador em linguagem Qbasic que calcula o dimetro mediano
volumtrico, dimetro mediano numrico e uniformidade de tamanho das gotas, bem como
o volume de calda depositada em litros/ha. Posteriormente, outra verso do Gotas foi desenvolvida em linguagem Delphi para sistemas operacionais Windows, incorporando a anlise de
imagem das amostras digitalizadas por scanner. As imagens eram analisadas pelo programa,
fornecendo os resultados de volume de calda depositado por hectare, tamanho de gotas (DMV
e DMN), uniformidade de tamanho de gotas, densidade (nmero de gotas/cm) e porcentagem
de cobertura (CHAIM et al., 2002, 2006). A verso mais moderna do Gotas fornece os seguintes
parmetros:
1) Nmero de gotas encontrado na amostra. Informao para dar maior confiabilidade nos quesitos relacionados aos tamanhos das gotas, pois, quanto maior o nmero de gotas da amostra,
mais confivel o resultado da anlise.
2) Nmero de dimetros de gotas. Refere-se quantidade de classes de tamanhos de gotas encontrados na amostra e est relacionada ao fator de disperso e volume de calda depositado na
amostra.
verso para computadores na rede de software livre para a agropecuria - Agrolivre7. As Figuras
10 e 11 ilustram a interface do sistema Gotas, disponvel para execuo em computador, e a interface do sistema Gotas para execuo em plataforma Android, respectivamente. A verso para
a plataforma Android, disponvel para tablets e smartphones, esto disponveis na loja vitual da
Google - Play Store.
As condies de clima e tempo afetam todo o ciclo de produo dos cultivos. Damalgo et al.
(2014) abordam a importncia do uso da agrometeorologia e monitoramento climtico para
melhor compreenso dos processos da produo agrcola quando se utiliza tecnologias da agricultura de preciso. Ortiz (2013) descreve o AgroClimate8, um sistema de suporte deciso
para ser usado em prticas de manejo de stios especficos. O Agroclimate informa sobre os riscos
climticos e ajuda na identificao das melhores prticas de manejo a serem usadas na produo
agrcola para mitigar ou reduzir riscos especficos.
Por experincia, recomenda-se o sistema Agritempo9 para uso em agricultura de preciso. O
sistema til no monitoramento de variveis meteorolgicas, disponibilidade de gua no solo e
condies do tempo que possam prejudicar a aplicao de insumos qumicos e biolgicos. O sistema desenvolvido pela Embrapa e Universidade Estadualde Campinas (Unicamp) permite aos
usurios o acesso, via Internet, s informaes meteorolgicas e agrometeorolgicas de municpios e estados brasileiros. Alm de informar a situao climtica atual, o sistema alimenta a Rede
Nacional de Agrometeorologia (RNA) do Mapa com informaes bsicas que orientam o zonea-
3) Fator de disperso de tamanho de gotas. Esse parmetro oferece informaes das disperses
dos tamanhos das gotas dentro de uma amostra.
4) Volume de calda na amostra (L/ha). Esse parmetro indica quantos litros de calda atingiram a
amostra analisada.
5) Densidade de gotas (n/cm). Esse indicador fornece informaes de quantas gotas atingiram
uma rea equivalente a um centmetro quadrado que um parmetro internacionalmente indicado para a calibrao da deposio de gotas.
6) Dimetro volumtrico D10 (mm). Representa a distribuio dos dimetros das gotas de maneira tal que os dimetros menores que D10 compem 10% do volume total de lquido da
amostra.
7) Dimetro volumtrico D50 (mm). Representa a distribuio dos dimetros das gotas de maneira tal que os dimetros menores que D50 compem 50% do volume total de lquido da
amostra. Esse parmetro tambm conhecido como dimetro mediano volumtrico, internacionalmente conhecido como VMD, e muito importante para a calibrao da deposio,
pois expressa o padro de dimetro de gotas que atingiu a amostra.
8) Dimetro volumtrico D90 (mm). Representa a distribuio dos dimetros das gotas de maneira tal que os dimetros menores que D90 compem 90% do volume total de lquido da
amostra.
9) Porcentagem de cobertura. Representa a porcentagem de rea coberta pela mancha das gotas
em relao rea total da amostra.
O programa Gotas uma ferramenta importante para a calibrao da deposio de agrotxicos
em agricultura de preciso. O acesso ao mesmo gratuito e est disponvel para download em
205
206
mento agrcola brasileiro. Tal fato importante na seleo dos melhores cultivares adaptados s
zonas homogneas de manejo definidas na propriedade rural. O sistema oferece boletins e mapas
com informaes sobre estiagem agrcola, distribuio temporal da precipitao pluvial, evapotranspirao, necessidades de irrigao, condies para tratamento fitossanitrio, condies para
manejo do solo e outras que suportam a deciso do produtor na aplicao de insumos qumicos
ou biolgicos e no emprego de prticas agrcolas relacionadas ao manejo de gua e solo.
2.4 Uso de AgroTIC em processos produtivos agrcolas: formas, protocolos e normas de
produo
Quando as tecnologias da Agricultura de Preciso so combinadas com as AgroTIC possvel
obter, armazenar e processar informaes que permitam aes de comando e controle da forma
de produo. Isto permite atender, analisar, monitorar e rastrear a conformidade da produo com
os requisitos de vrios protocolos e normas, tais como: da Produo Integrada e da Produo
Orgnica, do Mapa10, do Globalgap11, das produes agrcolas baseadas em princpios tnicos, e
por contrato de produo de alimentos funcionais, entre outros.
Entretanto, o uso dessa forma de produo no Brasil no tem sido to intenso. Furlaneto e
Manzano (2010) citam o sucesso do uso de tcnicas da agricultura na produo integrada e no
processo de rastreabilidade do pssego.
A coleta, registro e processamento das informaes e documentao das produes certificadas
esto caminhando para um sistema de manejo integrado com todos seus processos automatizados
em funo da tipologia e categorizao dos produtores. Fundamentalmente todos os padres e
regras de produo possuem estruturas similares, que contm:
10
11
207
208
iPhone
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
iPad
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Android
Sim
Sim
No
No
Sim
Sim
Sim
No
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Sim
Cost
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
Gratuito
$ 0.99
Gratuito
$ 1.99
Gratuito
automao para culturas anuais, perenes e semiperenes que vo desde operaes de preparo de
solo at a colheita e controle de frota. Aqui no sero citados os nomes das empresas, mas sero
apresentados, de forma geral, os equipamentos, atividades e servios disponveis. Servios para
estabelecimento de zonas de manejo j esto acessveis, embora com uso restrito devido a sua
natureza, isto , somente uma passagem do equipamento suficiente para estabelecer as caractersticas do terreno. Amostragens de solo georreferenciada utilizando cdigo de barras tm sido
utilizadas por produtores e provedores de servios, e consideradas como efetivas para reduo
dos erros associados coleta e anlise das amostras de solo. Para o preparo do solo existem solues na construo de terraos, curvas de nveis, canais de drenagem e nivelamento do terreno
com economia de tempo e mo de obra. Solues para o plantio em taxa varivel, com comando
e controle da semeadura, e da aplicao de nutrientes, associadas aos mapas de prescrio e
realizadas por pilotos-automticos e com controle de sees para evitar sobrepasses esto sendo
incrementadas.
J se encontram no mercado sensores ativos e passivos, baseados na assinatura espectral das
plantas e no ndice de Vegetao por Diferena Normalizada (NDVI), alm de outros equipamentos e mtodos de sensoriamento contendo aplicativos baseados na web ou em dispositivos
mveis para determinar, em tempo real, as necessidades de nitrognio requeridas para as culturas
de milho, trigo e algodo, determinamdo a presena ou ausncia de plantas daninhas, insetos
e doenas. Essas tecnologias j esto em utilizao por produtores, provedores de servio em
vrias regies produtoras de gros e fibras no Brasil. A localizao georreferenciadas dos pontos
monitorados e as doses aplicadas so enviados atravs do celular ou Wi-Fi para uma estao de
armazenamento, controle e anlise de informaes para efetuar recomendaes.
O uso das tecnologias da agricultura de preciso, principalmente a aplicao de insumos a taxas
variadas, est se beneficiando muito do uso do piloto automtico que aumenta a eficncia de uso
dos insumos, faz a aplicao nos locais pr-determinados, evita sobreposio, diminiui falhas,
diminui o tempo e aumenta o rendimento e a qualidade das operaes e reduz a fadiga dos operadores.
Softwares e hardwares para o controle e manejo operacional da frota e equipamentos, em tempo
real, j esto disponveis para rastrear, monitorar as horas de funcionamento, diagnosticar remotamente as condies de manuteno, de uso e desempenho das mquinas, e equipamentos em
atividades de preparo de solo, plantio, pulverizaes, colheita, transporte e outras operaes.
Um aspecto que deve ser considerado refere-se poltica de propriedade e acesso aos dados, visto
que o fornecimento e uso de AgroTIC para a Agricultura de Preciso e Automao de Processos
Agrcolas tende a aumentar fortemente nos prximos anos.
3 Consideraes nais
As tendncias futuras indicam uma evoluo e crescimento do uso das AgroTIC, eletrnica
e mecatrnica nos temas de Computao Ubqua, Tecnologia da Informao em Sensores e
Equipamentos Agrcolas, Automao e Controle de Mquinas, Implementos Processos e Prticas
Agrcolas. A evoluo e desenvolvimento de novas tecnologias elevaro os ndices de produtividade, da eficincia do uso de insumos, promovero a reduo de custos com mo de obra, a
qualidade do trabalho, a segurana dos trabalhadores e a diminuio dos impactos ao meio ambiente. Estas tecnologias melhoraro a forma de gesto da propriedade, permitindo a obteno
de produtos com garantia de qualidade que atendam a protocolos de produo e requisitos de
conformidade. A forma pela qual as informaes e conhecimentos esto sendo disponibilizadas
na web e em dispositivos mveis j esto permitindo que os atores envolvidos nas cadeias produtivas tenham acesso s informaes e aos conhecimentos originados de fontes pluralsticas
(GAKURU et al., 2009; GANDHI et al, 2009). Isso significa que, no somente o conhecimento
gerado pelas instituies de pesquisas vem sendo utilizado, mas tambm o conhecimento tcito
obtido por produtores, provedores de servio e extensionistas est sendo utilizado nas inovaes.
A maioria das inovaes j est sendo transferida de modo ubquo, ou seja, o usurio est acessando um volume enorme de informaes e utilizando formas de filtragem que selecionem as
tecnologias e conhecimentos mais relevantes para sua situao.
Considerando as mudanas ocorridas na sociedade, devido aos impactos das novas Tecnologias
de Informao e de Comunicao, so exigidos da Embrapa novos procedimentos e instrumentos
para a organizao e disponibilizao das informaes e dos conhecimentos de forma a culminar
em transformaes em direo a novos padres tecnolgicos de produo. Diante desse cenrio,
fica evidente a necessidade do desenvolvimento de sistemas de informao que ampliem a gesto
alm da propriedade, abrangendo toda a cadeia de valor.
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tb00650.x.
213
Captulo
215
Automao de mquinas
e implementos agrcolas:
eletrnica embarcada, robtica e
sistema de gesto de informao
11
1 Introduo
O desenvolvimento e a aplicao de tecnologia no setor agropecurio tornou-se um dos elementos fundamentais para insero ou manuteno da competitividade comercial no mercado globalizado de pases com vocao para o agronegcio. Nesse sentido, o baixo nvel de aplicao de
tecnologia conduz baixa eficincia e baixa produtividade dos processos de produo vegetal e
animal e pode colocar o pas em uma posio de inferioridade nas relaes comerciais internacionais, principalmente no caso do Brasil que tem ainda um grande potencial para desenvolvimento
do agronegcio (FAO, 2009). Associado a isso, a escassez de mo de obra, as restries para
ampliao das reas de cultivo e a busca pela sustentabilidade econmica, ambiental e social
desse setor, tambm geram desafios importantes para a evoluo tecnolgica e tm demandado
inmeros esforos de pesquisa, desenvolvimento e inovao.
Uma das tendncias atuais para superao das carncias apontadas a aplicao de sistemas
de automao em reas como, por exemplo, mquinas e implementos agrcolas, irrigao, criadouros, processamento, armazenamento e transporte de produtos agrcolas, construes rurais e
ambincia. Tambm, junto a essa evoluo tecnolgica, surgem novos conceitos ou prticas que
procuram maximizar os seus benefcios. Entre os conceitos atuais que buscam a automao como
suporte para as prticas agropecurias destaca-se a Agricultura de Preciso (AP).
O conceito de AP foi definido de vrias formas ao longo dos anos. Seu significado pode ter
distintas interpretaes em funo do foco de anlise, tecnologia disponvel e mtodo adotado. Atualmente a Comisso Brasileira de Agricultura de Preciso (CBAP) do Ministrio da
Agricultura, Pecuria e Abastecimento (Mapa) define a Agricultura de Preciso como um
sistema de gerenciamento agrcola baseado na variao espacial e temporal da unidade produtiva e visa ao aumento de retorno econmico, sustentabilidade e minimizao do efeito ao
ambiente.
A escala de amostragem das variveis envolvidas e a preciso na execuo das tarefas para as
novas prticas, muitas vezes, so maiores que as exigidas pela agropecuria tradicional, demandando tecnologias de informao e comunicao que as viabilizem em custo e eficincia
(STEINBERGER et al., 2009). A tendncia aumentar a sua frequncia de amostragem com
seu limite chegando ao tratamento por planta, o que j pode ser constatado em culturas perenes
como em fruticultura. Entretanto, a escala amostral para cada fator especfico deve ser definida
216
atravs de um balano que leve em conta fatores como, por exemplo, custo de tempo e financeiro
em contraposio a elevao da produtividade associada ao aumento de preciso. O controle de
insetos e o monitoramento do clima para o gerenciamento das tomadas de decises para o cultivo
so exemplos de variveis que so gerenciadas em larga escala. Outros fatores como fertilidade
do solo e distribuies de doenas podem variar significativamente em nvel de talho durante a
semeadura e a germinao. Por esta razo, importante observar o gerenciamento agrcola em
termos das unidades espacial e temporal para tomada de deciso. Estas escalas so vistas como
um fluxo contnuo de informaes das reas de atuao, desde uma planta at a propriedade
como um todo.
Entre as tecnologias que podem ser consideradas como o estado da arte para automao de
mquinas e implementos agrcolas destacam-se: sensores que permitem aferir variveis agronmicas em campo atravs de sensoriamento local ou remoto; sistemas de aplicao de insumos
em taxa varivel e sistemas que realizam sensoriamento, processamento (tomada de deciso) e
atuao durante o movimento da mquina (PEETS et al., 2012). Essas tecnologias possuem um
ponto de convergncia que a eletrnica embarcada, ou seja, o conjunto de sistemas eletrnicos
que possuem processadores (hardware) e programas dedicados (software ou firmware) para aquisio, processamento, armazenamento e comunicao de dados. O incremento acentuado de tais
sistemas eletrnicos atravs do desenvolvimento de monitores e controladores para mquinas e
implementos agrcolas demandou a padronizao dessa eletrnica embarcada, que hoje viabilizada atravs da implantao da norma ISO 11783, conhecida no mercado tambm como Isobus
(AGRICULTURAL INDUSTRY ELECTRONICS FOUNDATION, 2014; INTERNATIONAL
STANDARDIZATION ORGANIZATION, 2014). A padronizao fundamental para viabilizar
a eletrnica embarcada em mquinas e implementos agrcolas na medida em que evita a duplicao de instalao, elimina obsolescncia por compatibilidade, possibilita intercambiabilidade,
reduz custo de manuteno, libera o agricultor de fornecedores exclusivos de sistemas comerciais
e pode permitir a simplificao da integrao de informaes com sistemas computacionais externos s mquinas.
Um dos desafios relacionados ao uso da rede Isobus a pesquisa e desenvolvimento de controladores automticos compatveis com tarefas agrcolas especficas e seus respectivos implementos
tendo em vista a diversidade de tratos e implementos agrcolas existentes (BACKMAN et al.,
2013). Esse fato acentuado no Brasil, pois a agropecuria nacional possui caractersticas prprias e demandam mquinas, implementos e equipamentos adequados para a nossa realidade.
Junto a isso, embora haja no Brasil o entendimento da importncia desse padro, os fabricantes
de mquinas e equipamentos agrcolas, e, principalmente, os fabricantes nacionais de implementos deparam-se com barreiras tcnicas por no possurem, tradicionalmente, departamentos para
desenvolvimento de eletrnica embarcada e pela carncia no mercado de empresas fornecedoras
de eletrnica prpria para aplicaes agrcolas. Essas barreiras impem s empresas a necessidade de investimentos significativos para serem superadas, e, alm disso, demandam-se investimentos para formao de mo-de-obra especializada (INAMASU et al., 2011).
Alm das tecnologias descritas, frutos de pesquisas e de inovaes desenvolvidas nas ltimas duas
dcadas, atualmente outro foco de pesquisa recente e importante em tecnologias para agropecuria tem sido a busca por sistemas inteligentes que tornam vivel a aplicao de Robs Agrcolas
Mveis. Nos ltimos anos, trabalhos de pesquisa como, por exemplo, os apresentados por Bakker
et al. (2011), Cariou et al. (2009), Cheein et al. (2011), Dong et al. (2011), Griepentrog et al.
(2013) e Slaughter et al. (2008) tm gerado solues viveis para o desenvolvimento de sistemas
inteligentes de automao e de sistemas robticos que possibilitam operaes mais precisas para
reduzir custos, aumentar a produtividade e minimizar o impacto ambiental em tarefas agrcolas.
Embora na ltima dcada muitos trabalhos de pesquisa tenham proposto arquiteturas diversas de
controle para sistemas automticos inteligentes e para robs mveis, ainda h grandes desafios
para a pesquisa de arquiteturas para sistemas que atuam em ambientes pouco estruturados. A
imprevisibilidade natural, a variao temporal e espacial de certos parmetros fsicos como umidade, luminosidade e temperatura, principalmente nos ambientes abertos, elevam a impreciso
natural nas medies dos sensores conduzindo a elevados graus de incerteza, como relatado por
diversos autores (GRIEPENTROG et al., 2013; PETERSON et al., 2011). Essas caractersticas
adversas constituem desafios a serem superados pela pesquisa e desenvolvimento de sistemas
inteligentes de automao e de arquiteturas robticas. Alm disso, a capacidade de aquisio,
armazenamento e processamento de dados dos sistemas de um rob demandam tecnologias de
informao e comunicao muito bem estruturados e capazes de operar dados, em volume e
diversidade, superiores aos das mquinas e implementos agrcolas convencionais.
A quantidade de projetos e publicaes internacionais em automao e robtica para agropecuria ganhou volume expressivo nos ltimos cinco anos e ainda crescente. Revistas cientficas internacionais como a Computers and Electronics in Agriculture e a Biosystems Engineering1 tem
entre os temas de seu escopo a automao e a robtica. A International Federation of Automatic
Control (IFAC)2, que em seus 66 anos tem sido uma das mais importantes associaes internacionais de promoo da cincia e da tecnologia em automao e controle, conta hoje com comits
tcnicos especficos na temtica de modelagem e controle para sistemas agropecurios e ambientais (TC8.1, TC8.2 e TC8.4), com destaque para a robtica, especialmente o comit TC8.1, que
promove a Conference on Modelling and Control in Agriculture, Horticulture and Post Harvest
Industry - Agricontrol, e em sua quarta edio, em 2013 (AGRICONTROL 2013)3, contou com
sesses em instrumentao, mecatrnica e controle para sistemas agropecurios, alm de trs
sesses especficas em robtica nessa temtica.
Identifica-se projetos internacionais que concentram esforos de diversos centros de pesquisa
em robtica para a agricultura, como, por exemplo, o projeto Robot Fleets for Highly Effective
Agriculture and Forestry Management (RHEA)4 que conta com integrantes de centros de pesquisa de oito pases diferentes e apoiado por comisso europeia de pesquisa do European Unions
Seventh Framework Programme. Outra iniciativa notvel o projeto ICT-AGRI financiado
pelo programa ERA-NET da Comisso Europeia por meio do 7th Framework Programme for
Research5 que tem o objetivo de promover a pesquisa em tecnologias de informao e de comunicao (TIC) e em robtica para a agricultura.
Entretanto, se o panorama internacional de pesquisa em automao e robtica para a agricultura
tem se tornado um tema de destaque, a realidade brasileira da pesquisa em sistemas inteligentes
217
218
de automao e em robtica para a agricultura bastante limitada. Nesse contexto, estabelece-se um cenrio negativo para a agropecuria e para o agronegcio nacional, a medida em que o
Brasil como potncia do agronegcio mundial carece de pesquisa, desenvolvimento e inovao
em tecnologias de controle e automao para os sistemas de produo vegetal e animal.
Outro desafio importante a pesquisa de metodologias e tecnologias de informao e comunicao para integrao entre robs mveis ou mquinas e implementos agrcolas, com eletrnica
embarcada compatvel com o Isobus (NIKKIL et al., 2010), e sistemas de interpretao e manipulao de quantidades massivas e diversas de dados coletados, que auxiliem na compreenso
das causas da variabilidade espacial e temporal dos processos agropecurios. Pesquisas atuais
tm buscado, atravs do mapeamento de processos agropecurios e dos respectivos fluxos de
informaes, propor arquiteturas para sistemas automticos de coleta e comunicao de dados
e sistema de controle baseados na norma ISO11783, assim como propor o respectivo modelo
conceitual de integrao entre tais sistemas automticos e sistemas de gesto agropecurio
(NIKKIL et al., 2010; SRENSEN et al., 2010).
A indstria de manufatura possui solues bem estabelecidas baseadas em sistemas de informaes gerenciais (Management Information System - MIS) que so parte integrante do sistema de
planejamento de recursos e gesto global de empresas (Enterprise Resource Planning - ERP)
(KARNOUSKOS; COLOMBO, 2011). Entretanto, o desenvolvimento e a aplicao de conceitos e de metodologias similares no setor agropecurio ainda apresenta grandes desafios,
principalmente devido diversidade e variabilidade dos processos de produo vegetal e
animal (SORENSEN et al., 2010). O projeto, o desenvolvimento e a implantao de um Farm
Management Information System (FMIS), que pode ser traduzido por Sistema de Informao de
Gesto Agropecurio, para processos de produo vegetal ou animal, devem contemplar vrias
entradas de dados, originadas de diferentes equipamentos em diferentes formatos, incluindo
formatos que atendam norma ISO11783. Alm disso, necessrio oferecer suporte ao gerenciamento de informaes geogrficas e capacidade de processamento de modelos biolgicos,
capazes de relacionar parmetros descritivos com informaes de solo, atributos biolgicos dos
cultivos e parmetros climatolgicos (NIKKIL et al., 2010; SORENSEN et al., 2010).
Diante do panorama apresentado, pode-se verificar que h demanda premente para a pesquisa
e desenvolvimento de metodologias e tecnologias agrcolas aplicadas a aquisio automtica
de dados e controle inteligente de operaes em processos de produo vegetal e animal, e que
tenham interfaces automticas para integrao das informaes desses sistemas com sistemas de
gesto.
2 Sistemas embarcados
Na dcada de 1980 a eletrnica comeou a ser embarcada em veculos, e nos EUA, Europa e
Japo surgem os primeiros prottipos e padres para sistemas de controle automtico para mquinas e implementos agrcolas. J na dcada de 1990, sistemas comerciais incorporam os receptores GNSS (Sistemas de Navegao Global por Satlites - Global Navigation Satellite Systems)
e monitor grfico na cabine do trator para realizar mapeamanto de variveis de desempenho
da mquina e variveis agronmicas da lavoura. O GNSS conhecido pelo nome do sistema
norte americano Geographic Positioning System (GPS) por este ser o primeiro sistema GNSS
219
220
redes robustas e mais simples. Esse padro ou protocolo tambm tem sido adotado para promover
a interconexo entre dispositivos de automao e controle em mquinas agrcolas e viabiliza a
implantao de sistemas distribudos. Tal protocolo foi adotado compondo o padro internacional da International Organization for Standardization (ISO) para aplicaes em mquinas e
implementos agrcolas, denominado ISO11783, e tambm conhecido atualmente no mercado
como Isobus.
dadosamente testados e analisados antes de uma aplicao, pois h modelos em que o algoritmo
de controle de aplicao de fertilizante nitrogenado est programado em seu sistema proprietrio
e os ajustes so ainda de acesso restrito. Os sensores que permitem a leitura de dados possuem
interface serial com liberao de dados sequenciais em tempo regular, sendo que os protocolos
de comunicao ainda no so estabelecidos em normas.
2.1 Eletrnica embarcada
Recentes tecnologias disponveis no mercado foram concebidas para aquisio, armazenamento
e transmisso de uma grande quantidade de dados que podem ser eletronicamente adquiridos
na lavoura. Sensores agrcolas, dispositivos de processamento e armazenamento, e atuadores
so implementados usando padres de comunicao para troca de informaes diferentes. A
eletrnica embarcada em tratores e implementos no pode ser dissociada de sistema que inclua
microprocessador e, consequentemente, de sistema eletrnico digital com hardware e software.
Tal sistema computacional caracterizado como computador embarcado e, normalmente, possui
Unidade Central de Processamento (UCP), memrias e conjunto de elementos para entradas e
sadas de dados. As entradas so associadas a elementos que fornecem os dados por meio de
sensores ou de dispositivos de leitura e recebimento de dados. As sadas, por meio digital, podem
comandar diversos dispositivos presentes em mquinas agrcolas, desde lmpadas, mostradores,
vlvulas, e at o motor e a transmisso so considerados como atuadores.
d) Levantamento das mensagens definidas na norma ISO11783 que atendam aos requisitos identificados em b e c.
221
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ISO11783 (camada fsica). O hardware da I-ECU tambm contm entradas e sadas para sensores
e atuadores com padres comuns de mercado.
A Figura 3 apresenta um exemplo de conexo entre implementos com sensores on-the-go e uma
mquina (trator) no padro Isobus. Nessa Figura 3 utiliza-se a simbologia definida pela Norma
ISA-S5 International Society of Automation (ISA) (em portugus, Sociedade Internacional de
Automao) para compor o diagrama esquemtico no qual a I-ECU descrita e ilustrada anteriormente na Figura 2 utilizada como interface para um Sensor de Condutividade Eltrica do
Solo (SCE) e um Sensor de ndice de Vegetao (SIV). Essas estruturas foram utilizadas no projeto
mencionado anteriormente e os sensores comerciais empregados foram: sensor de condutividade
eltrica do solo, desenvolvido pela Embrapa Instrumentao (RABELLO at al., 2011), e sensor
ativo Crop Circle ASC 470, da empresa Holland Scientific, que emite e capta o espectro de luz
refletida em comprimentos de onda especficos pela planta, calculando ndices relacionados com
o seu estado nutricional. Os sensores utilizados no sistema automtico de aquisio possuem
dispositivo controlador de registro e converso de dados (CTR) que dispem de porta para transferncia de dados baseada no padro RS232C. O CTR de condutividade eltrica foi integrado
I-ECU atravs de sua porta RS232C, porm o CTR de ndice de vegetao foi integrado I-ECU
atravs de interface CAN, tendo em vista a aplicao de mais de um sensor na mesma operao
de mapeamento em campo (rede CAN permite diversos ns conectados I-ECU).
Na Figura 3 observa-se que a I-ECU comunica-se atravs do barramento ISO11783 com VT,
TECU e TC. O VT especificado na Parte 6 da norma uma ECU com tela grfica que promove
a interface entre a mquina (trator e implemento) e o operador (ser humano), e fica localizada
na cabine de operao da mquina agrcola. Quando um implemento Isobus conectado em um
trator Isobus, uma ECU de implemento qualificada como Mestre do Grupo de ECU (Working
Set Master) fica responsvel por interconectar todos os dispositivos do implemento e demais
ECUs relacionadas com uma aplicao agrcola ao VT atravs de um arquivo padro denominado Object Pool (OP), transmitido do implemento (I-ECU) para o trator (VT) pela rede. O
Object Pool um arquivo binrio que contm a descrio de um conjunto de objetos definidos
pela norma (mscaras, botes, variveis, indicadores grficos, figuras etc) que so exibidos no
VT para representar graficamente as funes e parmetros da ECU do implemento responsvel
pelo comando da aplicao agrcola. O protocolo de tratamento da interface grfica organizado
de maneira orientada a objeto (object-oriented). As informaes das ECUs conectadas ao barramento so mostradas na tela fsica do VT e so definidas pelo elementos data mask (mscara de
225
226
sistemas computacionais externos mquina agrcola. Essa ECU responsvel por gerenciar
o controle de tarefas pr-determinadas, sendo que as tarefas so prescritas previamente, e so
transmitidas para o trator no formato de arquivo XML (Extensible Markup Language). Para que
as tarefas possam ser realizadas, um implemento Isobus compatvel deve enviar as caractersticas
de seus dispositivos ao TC utilizando um arquivo denominado Device Description Object Pool
(DDOP), tambm no formato XML. Essa ECU no possui um tela grfica e por isso pode apresentar as tarefas e as funes relacionadas no VT.
dados), alarm mask (mscara de alarme) e soft-key masks (mscaras soft-key). Os dados dessas
mscaras esto contidos em objetos de definies que em conjunto compem o Object Pool.
A Tecu especificada na Parte 9 uma Unidade de Interconexo de Rede (Network Interconnection
Unit - NIU). As NIUs podem ser do tipo Repeater (Repetidor), Brige (Ponte), Router (Roteador)
ou Gateway (Portal), com funes semelhantes s funes destes elementos nas redes de computadores pessoais convencionais. A Tecu , portanto, uma NIU com funes especiais e faz a
interconexo do Barramento do Trator com o Barramento de Implemento. O Barramento do
Trator a sub-rede onde podem estar conectadas ECU para parmetros veiculares associados, por
exemplo, com o motor e com a transmisso. O outro tipo a sub-rede principal de implementos,
denominada Barramento de Implemento, onde podem estar conectadas ECUs para parmetros
relacionados com aplicaes agrcolas, como, por exemplo, plantio ou pulverizao. A Tecu deve
inicializar no barramento do implemento do mesmo modo que qualquer outra ECU na rede, e o
seu acesso ao VT idntico ao de qualquer outro implemento e dispositivo, porm existem trs
classe possveis de Tecu quanto s funes: Classe 1, Classe 2 e Classe 3.
A Tecu Classe 1 possui uma interface simples com suporte para rede e fornece principalmente
medies internas do trator com as mesma informaes definidas na norma ISO 11786, mais
antiga que a ISO11783, comum em alguns tratores. Alm disso, suporta o gerenciamento de
energia, armazenamento do idioma de parmetros especficos e permite o controle da iluminao
do trator. A Tecu Classe 2 possui as funes de uma Tecu Classe 1 e tem funes adicionais com
dados, tais como: hora e data, distncia e direo baseados no solo e roda, informaes da tomada de potencia mecnica (PTO), todas as mensagens da iluminao do implemento e estados de
vlvulas auxiliares. Isto permite um controle mais sofisticado do implemento e uma estratgia de
segurana. A Tecu Classe 3 a mais completa e possui as funes das Tecu Classe 1 e Classe 2 e,
alm disso, esta categoria de Tecu aceita comandos do barramento do implemento. Em particular,
os comandos bsicos para engate traseiro, desacoplamento da potncia e o processamento do
controle de vlvulas auxiliares. Portanto, o implemento est hbil a controlar a potncia desejada
na fonte e a posio do engate.
O TC especificado na Parte 10 uma ECU especial responsvel pelo envio, recebimento e armazenamento de dados de processos agrcolas, e, alm disso, contm a interface de dados para
A interpretao da enorme quantidade de dados coletados, a compreenso das causas da variabilidade e a proposta de estratgias slidas para a gesto de sistemas agropecurios e agroindustriais
tm demandado sistemas de informao especficos para a agropecuria, que possam melhorar
as estratgias de manejo da lavoura e animal, contribuir com a gesto do agronegcio, viabilizar
a regulamentao governamental e padronizar os processos que viabilizam a rastreabilidade e a
certificao de produtos agropecurios. Em particular para a AP, dentre as diversas abordagens
existentes relacionadas ao tema, comum encontrar citaes referentes coleta massiva de
dados, sistemas georreferenciados, gerao de mapas e aplicao de insumos taxa varivel.
Entretanto, essas operaes quando realizadas de forma isoladas, ou sem um gerenciamento
adequado, no providenciam ganhos efetivos ou, geram informaes desencontradas.
O projeto, desenvolvimento e implantao de um sistema de informao de gesto agrcola ou
FMIS para processos de produo agrcola deve contemplar vrias entradas de dados, originadas
de diferentes equipamentos em diferentes formatos, incluindo formatos que atendam norma
ISO11783. Alm disso, principalmente no contexto da AP, necessrio oferecer suporte ao gerenciamento de informaes geogrficas e capacidade de processamento de modelos biolgicos,
capazes de relacionar parmetros descritivos com informaes de solo, atributos biolgicos
dos cultivos e parmetros climatolgicos. Diante desse panorama, confrontando os requisitos
mnimos de sistemas automao e os requisitos funcionais de processos comuns das prticas
de AP com as mensagens definidas na norma ISO11783, determina-se o grupo de mensagens
explicitados na Tabela 1.
Tabela 1. Grupo de mensagens com informaes comunicadas entre um sistema automatizado embarcado
e um FMIS.
Tipo de servio
Operao
trator-implemento
Dados automotivos
Operao trator
Diagnstico de
sistemas
Documento da norma
Parmetro
ISO11783-7
Navegao, tomada de potncia, engates traseiro e
dianteiro, superviso e controle processos, comando de
atuadores do implemento e leitura sensores do
implemento.
ISO11783-8
Motor, transmisso, freios, caixa de marcha e sistema
de combustvel
ISO11783-9
Sistema hidrulico do implemento, tomada de potncia,
gerenciamento de potncia e navegao (velocidade e
distncia baseado nas rodas e solo).
ISO11783-12
Protocolos para diagntico e identificao de ECUs,
verso de softwares e certificao.
227
Figura 4. Arquitetura de integrao entre um sistema embarcado ISO11783 e um FMIS: elementos, interfaces e fluxo de dados.
228
229
230
aplicao, ou seja, acompanhar parmetros de execuo de cada tarefa, como, por exemplo, valores efetivamente aplicados de insumos, valores de sementes efetivamente plantadas, registros
de falhas em atuadores, entre outros.
Num sentido mais amplo, no h um limite fsico do nmero de elementos de automao que
podem ser implantados em uma mquina agrcola, seja de sensores, atuadores ou controladores, e
sendo assim, desde que tais elementos sejam devidamente integrados estrutura, como prescreve
a norma ISO11783, o nmero de parmetros, variveis, comandos ou informaes comunicadas
com o sistema de gesto est limitado necessidade ou criatividade da engenharia dos sistemas
agrcolas.
4 Consideraes nais
5 Referncias
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DOI:10.1002/rob.20282.
A multidisciplinaridade envolvida no setor agrcola atual faz com que diversos mtodos, baseados em distintas reas da cincia, sejam desenvolvidos visando a uma mesma aplicao. Da
mesma forma, uma determinada tecnologia no fica restrita a melhorar uma nica prtica, mas
empregada em mltiplas situaes, auxiliando no processo como um todo. Devido ao processo
contnuo de evoluo das reas que envolvem ou interagem com a instrumentao eletrnica,
automao e robtica, tais como, microeletrnica, sensores, computadores, telecomunicaes,
tecnologia da informao e da comunicao, o potencial de inovaes foi ainda muito pouco
explorado.
CHEEIN, A. F; STEINER, G; PAINA, G. P.; CARELLI, R. Optimized EIF-SLAM algorithm for precision agriculture
mapping based on systems detection. Computers and Electronics in Agriculture, New York, v. 78, n. 2, p. 195-207,
Sept. 2011. DOI:10.1016/j.compag.2011.07.007.
Dentre as tecnologias que apresentam forte presso de demanda mecanizao e automao para
a agropecuria, o foco ainda pelo aumento da produtividade atravs da melhora ou da viabilizao de processos tais como: medidas massivas de propriedades fsicas e qumicas do solo;
acompanhamento da produo vegetal e volume de biomassa; medio e acompanhamento de
disponibilidade de gua; identificao e monitoramento de pragas (doenas, plantas invasoras,
insetos), e identificao e monitoramento da sade e nutrio animal. As tecnologias que tem
sido adaptadas, desenvolvidas e exploradas na agricultura para atender a essas demandas, seja
atravs do sensoriamento local ou remoto ou para a aplicao, carecem de modelos de referncia
e padronizao, primeiramente, para viabilizar aquisio, comunicao, integrao e manipulao de dados identificados ou georreferenciados, e, posteriormente, viabilizar a transformao
desses dados em informaes que relacionem variveis ou parmetros diversos, como, por exemplo, dados de solo, atributos biolgicos dos cultivos e parmetros climatolgicos, para suporte
tomada de deciso.
GRIEPENTROG, H. W.; DHRING, J. C. L.; PARAFOROS, D. S. Robots for field operations with comprehensive
multilayer control. KI - Knstliche Intelligen, Heidelberg, v. 27, n. 4, p. 325-333, June, 2013. DOI 10.1007/s13218013-0266-z
A pesquisa e o desenvolvimento de tais modelos de referncia e padres apresentam carter multidisciplinar e necessitam da promoo de agrupamento de competncias e habilidades nos temas
e reas com interfaces comuns para gerao e integrao de novos conhecimentos e informaes.
Alm disso, se h um grande espao para melhoria e insero de tecnologias, existe um outro
gargalo no momento que a formao de profissionais qualificados para pesquisa, desenvolvimento e aplicao dessas tecnologias. Essa qualificao deve ser orientada tanto ao nvel tcnico
como ao nvel acadmico, e deve ser promovida tanto por instituies pblicas como privadas.
Dessa forma, essas duas vertentes, criao de tecnologia e desenvolvimento, competncias e
habilidades, so fundamentais para o fortalecimento e a sustentabilidade da agropecuria e do
agronegcio no Brasil.
DONG, F.; HEINEMANN, W.; KASPER, R. Development of a row guidance system for an autonomous robot for
white asparagus harvesting. Computers and Electronics in Agriculture, New York, v. 79, n. 2, p. 216-225, Nov.
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231
232
Fotos: Neide Makiko Furukawa/Luciana Alvim Santos Romani/ Michel Eduardo Beleza Yamagishi
Parte
Captulo
235
Gesto da informao e
do conhecimento
12
1 Introduo
Toda sociedade humana, argumenta Aranha Filho (1995), diante de seu patrimnio tecnolgico
e cultural, desenvolve necessariamente uma classe fundamental de tecnologias das quais no
se pode prescindir - so as chamadas tecnologias de conhecimento ou tecnologias cognitivas.
Tais tecnologias tanto trazem as marcas quanto tambm demarcam o carter de uma cultura,
e - diferentemente daquelas de cunho prtico e utilitrio (tecnologias, ferramentas e mtodos
voltados transformao da natureza) -, compem uma classe especial de tecnologias que
visam gesto de conhecimentos produzidos por uma sociedade, ou seja, dedicam-se a gerir
a sua memria coletiva. Na sociedade contempornea, as tecnologias que exercem a funo
social de tecer um novo padro de gesto do conhecimento so as tecnologias da informao e
comunicao (TIC).
As TIC se consolidam no ciberespao que se configura como uma nova forma de organizao
social. O surgimento desta nova ordem social foi proporcionado pela evoluo dos computadores individuais e pelo advento da rede internet que ofereceu s pessoas a possibilidade de se
conectarem entre si, mesmo estando geograficamente distantes. Ciberespao , pois, um espao
comunicacional hbrido, composto por diversas mdias1 onde todo e qualquer signo pode ser
socialmente produzido, significado e sentido (SANTOS; OKADA, 2003).
Esta realidade fornece pista para a compreenso do porqu rede a metfora escolhida para
representao do todo social (ARANHA FILHO, 1995). Na rede, aqui entendida como fluxo
informacional estabelecido pelas pessoas conectadas por meio da internet, as tecnologias de
conhecimento so os meios pelos quais informao e conhecimento circulam livremente. Rede
espao topogrfico, caminho, movimento, atividade que une as pessoas umas s outras, levando-as a mergulhar, navegar, pular entre as informaes que lhes interessam. Pode-se afirmar que o
conceito de rede hoje uma espcie de chave-mestra que vincula trs nveis de significao - a
do ser, a da dinmica da interao coletiva e a do sistema complexo. Rede meta-ligao porque
O conceito de mdia, neste contexto, est sendo adotado como qualquer meio que favorece e concretiza o processo de
comunicao produzido pelas pessoas. Entende-se que a mdia possibilita a anlise no s das questes da linguagem
e das estratgias de construo de produtos culturais, mas tambm a compreenso da forma como as pessoas produzem
os processos de comunicao e informao quando usam os meios miditicos.
236
ao mesmo tempo o vnculo de um elemento com um todo, o vnculo entre diversos estados
de um todo e o vnculo da estrutura de um todo com o funcionamento de um outro. (MUSSO,
2004, p. 32-33).
Em rede, ligados e passando pelas informaes, por entre as diversas mdias digitais, reconfigura-se a forma de ser e agir no mundo. Aranha Filho (1995) argumenta que, o que se passa na rede
no pode ser entendido unicamente como informao - pacotes de dgitos binrios sequenciais;
deve haver tambm a concepo de que, por trs da troca de informaes, h um lao implcito
de entendimento, uma apropriao, uma forma peculiar de interpret-las. A rede internet nos deu
mais que acesso s informaes, mostrando a sua vocao relacional entre pessoas e entre pessoas e instituies. Assim, pode-se dizer que o que circula na rede mais que informaes so
atos de linguagem, so processos implcitos de aprendizagens, so formas de construo coletiva
de conhecimento.
Diante dessa realidade, instituies pblicas de pesquisa, desenvolvimento e inovao (PD&I),
como a Embrapa, tm pela frente o desafio de encontrar novas formas de materializar a informao e o conhecimento que circulam pelas suas redes de pesquisa, pelas suas relaes interinstitucionais e pelas suas interaes com os diversos segmentos de pblicos. Do ponto de vista
organizacional, estratgico despender esforos para buscar diversas possibilidades e solues
de identificar, gerir, disseminar e transferir as informaes e conhecimentos produzidos na
Embrapa. Entende-se que esta estratgia contribui para que a Empresa promova um debate em
torno de novas racionalidades para pensar as demandas sociais do setor agropecurio brasileiro.
Isto tanto assegura o diferencial competitivo da Embrapa neste segmento quanto contribui para
evidenciar o Brasil no cenrio internacional como um dos principais players da produo de
alimentos. Neste ponto reside a importncia deste captulo, cujo objetivo registrar como a
Embrapa Informtica Agropecuria estuda, identifica, concebe e articula solues de tecnologia
de informao (TI) para gerir as informaes e os conhecimentos que so produzidos nos diversos nveis organizacionais da Empresa.
A Embrapa Informtica Agropecuria desenvolve pesquisas e aplicaes nos contextos da gesto
de dados (GD), gesto da informao (GI) e gesto de conhecimento (GC). Atua, ainda, na gerao de metodologias e solues web para organizar, tratar, recuperar e comunicar para a sociedade as informaes e conhecimentos gerados na e pela Empresa. Dentre as principais reas
de estudo que contribuem para essa linha de pesquisa, encontram-se as de gesto e representao
do conhecimento, ontologias, processamento de linguagem natural, terminologias, construo de
espaos digitais e de contedo hipermiditicos.
O captulo est dividido em seis sees, alm desta introduo. Na segunda seo, apresentado
um embasamento conceitual que contextualiza a GI e a GC no mbito das necessidades organizacionais da Embrapa, destacando como a Embrapa Informtica Agropecuria contribui para
atend-las. Na seo trs, discute-se como dados, informao e conhecimento so concebidos e
como se alinham aos processos de GD, GI e GC da Embrapa. Nesta seo, ainda, argumenta-se
sobre a necessidade de se pensar dados, informao e conhecimento a partir de uma abordagem
sistmica e holstica, para alm da viso dualista e reducionista, quase sempre predominante
nos processos tecnolgicos em curso na Empresa. Nas sees quatro e cinco, so apresentadas
e discutidas as metodologias e tecnologias voltadas interoperabilidade semntica, bem como
para a criao e transformao de espaos digitais, adequando-os ao ambiente virtual de intensa
mobilidade social e tecnolgica, em curso na sociedade atual. Assim, nas sees quatro e cinco
aborda-se um fenmeno atual de grande impacto sociocultural e econmico, alm de tecnolgico, cuja centralidade reside nas pessoas. Nessas sees, ainda, as tecnologias mveis, em especial, os dispositivos como os telefones celulares, smartphones e tablets - enquanto instrumentos
preponderantes de transformao socioeconmica e cultural - so colocados de forma crtica,
para que se apresentem como soluo de incluso social, e no como simples aparatos tecnolgicos com fins de adoo para alavancar e propagar o consumo acrtico de informao e conhecimento. Cabe salientar que as metodologias apresentadas nas sees quatro e cinco no so as
nicas propostas de solues de TI desenvolvidas pela Embrapa Informtica Agropecuria, no
escopo da sua competncia. Entretanto, a escolha recaiu sobre aquelas metodologias que melhor
se assentam no trip conceptivo que orienta a busca de entendimento transversal entre tecnologias, processos e pessoas. Esta trade representa o fio condutor rumo s tecnologias do conhecimento social, como menciona Aranha Filho (1995). E, porque tambm somente a partir de um
entendimento indissocivel sobre estes trs constructos que se torna possvel pavimentar as vias
seguras e sustentveis que levaro a Embrapa a compreender e gerir ativos to estratgicos como
a informao e o conhecimento. Por fim, a seo seis dedica-se discusso dos principais resultados e concluses em termos de ganhos com a atuao da Embrapa Informtica Agropecuria na
busca de solues de TI para a GD, GI e GC para a Embrapa. A seo sete arrola as referncias
bibliogrficas utilizadas para embasar a construo do captulo.
237
238
ou frente a mudanas do comportamento epidemiolgico de doenas ou das dinmicas populacionais de pragas e patgenos, entre inmeros outros. Nesse contexto, a transversalidade da informao e do conhecimento se consolida e determina que os processos de GI e GC na Embrapa
adquiram importncia estratgica, visando garantia no apenas do seu compromisso social, mas
tambm, o apoio contnuo ao desenvolvimento, competitividade e sustentabilidade institucionais. Informao e conhecimento esto diretamente ligados aos processos de tomada de deciso
e, dessa forma, por meio dos fluxos informacionais estabelecidos nos processos corporativos,
suportam todo o processo da gesto organizacional, do mesmo modo que o sangue ou a seiva
sustentam os organismos vivos.
Recorrentemente, nos ltimos anos, no mbito do processo de planejamento estratgico da
Embrapa Informtica Agropecuria, a anlise do ambiente externo tem apontado como tendncias ou demandas de aplicaes da computao e das tecnologias de informao (TI) para a
agropecuria as questes relacionadas com melhorias e empoderamento dos processos de GI e
GC. Nesse contexto ressaltam-se, por exemplo:
- Aumento na adoo de TI para obteno, anlise, disseminao e visualizao de dados, informaes e conhecimento pelo setor agropecurio.
- Aumento da demanda por solues tecnolgicas para resoluo de problemas complexos na
agropecuria que requerem equipes interdisciplinares, multi-institucionais e transnacionais.
- Aumento da oferta de dados pblicos em conformidade com polticas oficiais de dados abertos.
- Incremento na utilizao de inteligncia computacional em aplicaes do domnio agropecurio.
- Uso crescente de novos canais de comunicao e novas formas de apresentao de contedo,
acompanhando a evoluo da linguagem (Web 2.0 e Web 3.0).
- Aumento da oferta de arquiteturas para o desenvolvimento de sistemas de armazenamento de
dados distribudos, heterogneos, em grande volume e com alta frequncia de gerao.
Dessa forma, a Embrapa Informtica Agropecuria vem concebendo e executando estratgias
computacionais que visam a aproximar e alinhar emergentes TI s demandas do setor agropecurio, cada vez mais complexas, por dados e informao de PD&I. Uma das abordagens perseguidas nesse itinerrio se refere s questes de organizao, armazenamento, processamento
e disseminao de crescentes volumes de dados. Nesse contexto tcnico-cientfico, emergem
alternativas que somente podero ser aplicadas como soluo operacional se estiverem baseadas
em conceitos, infraestrutura e suporte computacionais de alto desempenho como, por exemplo,
e-Science, Big Data, Linked Data, Open Linked Data, Web Semntica, Cloud Computing, e atenderem a requisitos, tais como: interoperabilidade entre sistemas de informao, interatividade
e ambientes virtuais tecnolgicos para trabalho colaborativo intermediado por mdias sociais,
mobilidade para acesso via dispositivos mveis, em especial, celulares e tablets.
GI e GC so alvos constantes de demandas, interesses e motivaes, visando ao desenvolvimento, validao e implantao de TI para facilitar e empoderar processos de organizao,
engenharia e gesto da informao e do conhecimento gerados ou utilizados na Embrapa. Para
apoiar esses processos cada vez mais exigentes de inovao e evoluo, a Embrapa Informtica
Agropecuria tem adotado alguns referenciais tericos que viabilizam trabalhar a integrao e
239
240
Cincia da Complexidade o estudo cientfico dos sistemas complexos, ou seja, sistemas compostos de inmeros
elementos que interagem entre si e que produzem um comportamento global que no pode ser facilmente explicado
considerando somente as interaes entre os seus componentes individuais. Em outras palavras, a propriedade do sistema como um todo no o resultado da soma das propriedades de cada um de seus componentes. Sistemas complexos
incluem redes sociais, ecossistemas, crebros, cidades, mercados, negcios etc.
base conceitual, consiste na ponderao de que se a sabedoria tomada como uma verdade
inquestionvel e irrefutvel pode ser que no seja alcanada se, eventualmente, os dados que a
sustentam no forem corretos ou verdadeiros!
Apesar disso, o conceito da hierarquia Dado-Informao-Conhecimento-Sabedoria geralmente,
e quase inconsistentemente, transferido diretamente para as lgicas que suportam a concepo
e construo dos processos organizacionais de GI e GC, reproduzindo-se, de forma mais ou
menos automtica, o pensamento linear ou reducionista de que um determinado sistema seja o
resultado puro e simples da soma das propriedades dos elementos que o compe. Nas discusses
atuais, no mbito da Cincia da Organizao, essa lgica excluiria os sistemas complexos, em
que a relao entre causa e efeito no totalmente linear, ou seja, a propriedade emergente de um
determinado sistema no resulta apenas da reunio das propriedades de seus componentes, mas
sim da dinmica de inter-relaes entre eles, incluindo as relaes de incerteza, aleatoriedade e
imprevisibilidade.
Na tentativa de ajustar essa situao, prope-se a representao apontada na Figura 2. Nota-se
que, nessa nova proposio conceitual, deliberadamente, prefere-se alinhar, com base na lgica
da agregao de valor cognitivo, a trajetria dado-informao-conhecimento em um circuito
circular, continuamente retroalimentado em detrimento de suas convencionais representaes
hierrquica-piramidal ou linear-progressiva.
A partir dessa conceitualizao, o alinhamento entre os processos de GD, GI e GC fica operacionalmente facilitado, permitindo um mapeamento das atividades, estruturas e tecnologias
especficas e pertinentes a cada processo, alm de mapear como cada um desses elementos se
241
242
Figura 2. Relao entre dado, informao e conhecimento compondo um circuito circular, contnuo e
retroalimentado.
reorganiza em arranjos sucessivos, conforme proposto na relao contnua, circular e retroalimentada entre dados, informao e conhecimento (Figura 3).
(Figura 4). Na complementao desse pretendido alinhamento de processos devem ainda ser
agregadas orientaes de ordem corporativa (polticas, diretrizes, normas e regulamentos internos empresa) e referenciais originrios de instncias governamentais, como a Lei de Acesso
Informao (Lei n 12.257/2011) (BRASIL, 2011), a Poltica Nacional de Arquivos Pblicos e
Privados (Lei n 8.159/1991) (BRASIL, 1991), a Lei da Propriedade Industrial (Lei n 9.279/96)
(BRASIL, 1996), a Lei n 10.196/01, que altera a Lei da Propriedade Industrial (BRASIL, 2001),
assim como com a Lei de Direitos Autorais (Lei n 9.610) (BRASIL, 1998), entre outros marcos
legais. Como corolrio dessa sistematizao, uma proposta de governana deve determinar e institucionalizar os princpios, estruturas, processos, culturas, papis e responsabilidades relativos a
dados, informao e conhecimento no contexto organizacional.
Figura 4. Reposicionamento da GD, GI e GC em relao a mecanismos corporativos estruturantes: governana, polticas, normas e regulamentaes.
Alm dos aspectos expostos anteriormente ainda h que se admitir que as instituies, dentre
as quais a Embrapa, podem ser consideradas como sistemas complexos que, ao mesmo tempo,
so componentes de outros sistemas complexos (sociais, econmicos e cientficos) e contm
subsistemas tambm complexos (epistemologia do conhecimento, estruturas e processos organizacionais, relaes sociais etc.). Isto impacta diretamente os processos de modelagem
computacional de sistemas, porque ainda frequente a tendncia em focar apenas o pensamento
reducionista. Esquemas de categorizao ou classificao em uso, que embasam as arquiteturas
computacionais de banco de dados e outros sistemas de informao, valorizam mais as relaes
hierrquicas entre conceitos, em detrimento de relaes multidimensionais (de equivalncia e/ou
de associao), que podem agregar valor semntico e, portanto, mais significado aos dados, alm
de serem potencialmente ricas para a modelagem de sistemas complexos, como o agropecurio,
caracterizado pelo elevado grau de multi, inter e transdisciplinaridade, englobando informaes
de mltiplas naturezas.
Figura 3. Alinhamento dos processos de GD, GI e GC, com base na agregao de valor cognitivo e considerando as solues tecnolgicas de suporte.
A GI na Embrapa, por quatro dcadas, tem sido predominantemente focada na informao bibliogrfica e documentria. Entretanto, mais recentemente, inciativas para integrao e significao
243
244
Sob a denominao de SOC (SOUZA et al., 2010; ZENG, 2008) so reunidos modelos conceituais que conseguem explicitar o conhecimento por meio de representaes e codificaes textuais
e diagramticas. Ao proporem formalizao e conceituao coletiva dos objetos do mundo real,
facilitam o mapeamento e o compartilhamento de concepes e informaes e, portanto, podem
ser empregados nos processos de GI e GC e como ferramentas de suporte ao processo decisrio.
Os referenciais tericos e metodolgicos dos SOC podem ser recuperados e aplicados sob duas
perspectivas: reuso de modelos j existentes e construo de novos modelos conceituais.
Identifica-se, ento, a constante tenso entre o pensamento linear, analtico e reducionista, que
analisa e recorta, partindo do todo para o especfico e o pensamento sistmico e holstico que, inversamente, analisa e sintetiza a partir do especfico em direo recomposio do todo. Diante
desse conflito, a soluo parece ser a busca do equilbrio entre essas duas foras antagnicas, que
articuladas entre si contribuem para uma melhor representao do mundo real, ao mesmo tempo
em que nenhuma delas isoladamente constitui uma abordagem suficiente. No espao entre essas
duas possibilidades, interpe-se o pensamento complexo. Nele, mais que a identificao de cada
elemento componente dos sistemas e muito alm do resultado de uma simples soma, valoriza-se
a dinamicidade das relaes entre eles.
Operacionalmente, do ponto de vista da computao, a soluo vem da adoo de modelos conceituais de organizao do conhecimento que permitam cognio o livre trnsito desde as partes
at o todo e vice-versa. Modelos que permitam ao mximo a construo de inter-relaes e as
valorizem tanto quanto cada um dos componentes do sistema, pois exatamente no desenho das
relaes entre conceitos ou entidades do mundo real que se consegue incorporar as qualidades
inerentes aos sistemas complexos: aleatoriedade, incerteza e imprevisibilidade.
Diante desse cenrio e da necessidade constante de fazer evoluir o trabalho de organizao e
engenharia de dados, informao e conhecimento no contexto geral da Embrapa, a Embrapa
Informtica Agropecuria optou pelo desenvolvimento de abordagens contemporneas e globalmente alinhadas, visando interoperabilidade entre sistemas de informao e a interatividade
(comunicao interpessoal mediada pelas TI), incorporando nos processos de GD, GI e GC inovaes para garantir continuamente o acesso e uso dos seus contedos informacionais. Algumas
das recentes propostas de desenvolvimento e aplicao de TI para empoderamento dos processos
de GD, GI e GC agropecurios so relatadas a seguir.
245
Figura 5. Etapas conceituais (A) e metodolgicas (B) para concepo e construo de SOC agropecurio.
246
Nos SOC estrutural e funcionalmente mais evoludos (tesauros, redes semnticas e ontologias)
consegue-se valorizar tanto as relaes como as entidades (objetos, conceitos) que compem em
conjunto uma certa unidade de conhecimento. Essa nova viso tem contribudo para representaes mais completas da complexidade do mundo real, seja ele natural, antropizado ou mesmo
o ambiente organizacional de uma empresa. Na verdade, esse tipo de modelo conceitual facilita
a construo de propostas de representao do mundo real de forma ontolgica, evoluindo da
forma convencional que o compartimentaliza ou decompe (reducionismo), posteriormente o recompe (holismo) e, mais recentemente, se prepara para inter-relacionar multidimensionalmente
seus elementos (complexidade). Os modelos conceituais assim concebidos e desenvolvidos
alinham-se tendncia de concepo e construo de SOC que se preocupam em representar
sistemas complexos (OHLY, 2012) e, portanto, muito oportunos para a realidade informacional
que envolve a Embrapa. Alm disso, esse tipo de abordagem visa a fornecer condies para que
a Embrapa insira seus contedos informacionais no contexto da Web Semntica, a chamada
Web 3.0, uma tendncia de evoluo tecnolgica da internet, na qual a informao digital ganha
significado, os computadores ganham inteligncia e os contedos se tornam mais pragmticos e
eficazes em termos de fornecer as informaes mais precisa e eficazmente, aproximando-as mais
do processo que as converte em conhecimento.
Do ponto de vista especfico da organizao do conhecimento, os SOC podem continuar evoluindo para integrar ou agregar funcionalidades ainda mais operacionais como, por exemplo,
glossrios, sistemas de categorizao ou de classificao, taxonomias (cientficas, de websites),
tesauros, ontologias, compondo um conjunto de recursos para organizar e representar os avanos
do conhecimento sobre a agropecuria brasileira e tropical, objeto de trabalho da Embrapa. Mais
que isso, no que tange ao desenvolvimento institucional, a utilizao dos SOC proporciona maior
visibilidade do conhecimento produzido e disseminado pela Empresa, pois outras instituies de
pesquisa tambm tratam seus contedos informacionais por meio desses recursos, os quais vm
se tornando cada vez mais formalizados e construdos sob padres internacionais.
SOC so sistemas que, elaborados a partir da lgica das linguagens naturais humanas, conseguem explicitar o conhecimento intangvel, codificando-o em terminologias e, assim,
constituindo-se em ferramentas para representar o conjunto informacional de um domnio
especfico. Alm disso, esses sistemas so passveis de ser traduzidos em linguagens computacionais (RDF, SKOS, OWL), possibilitando que o conhecimento humano possa ser lido e entendido por mquinas. Com essa vantagem tecnolgica adicional, os contedos informacionais
podem ser tratados com o objetivo de integr-los e relacion-los a outros contedos digitais,
247
248
de pesquisa tambm contribui para permitir que as redes de pesquisa e interaes estabelecidas
pela Embrapa para interagir com seus diversos pblicos sejam concebidas como canais de promoo e de divulgao de informaes e conhecimentos para a sociedade.
Nesse sentido, investimentos esto sendo despendidos pela Embrapa na criao de solues de
TI que possibilitem s pessoas - a partir da interao entre elas e das interaes entre elas e as
mdias digitais -, criarem novas interpretaes sobre os dados, as informaes e os conhecimentos gerados pela Empresa, para serem dispostos em ambientes web. Admite-se que esta uma
das alternativas viveis para criar na Embrapa um espao de aprendizagem organizacional que
privilegie o coletivo, a cooperao e a perspectiva processual e contnua da colaborao que dar
suporte criao de uma cultura organizacional voltada para a coaprendizagem.
O conceito de coaprendizagem enfatiza a existncia de uma relao mtua decorrente da interao entre as pessoas e quando esta interao capaz de permitir que elas mudem o comportamento que possuem diante de uma determinada situao. um conceito de grande pertinncia
para a Embrapa que tem nas informaes e conhecimentos os insumos bsicos para a produo
de novos conhecimentos, sendo estes tambm, os produtos finais por ela gerados. Desenvolver
solues de TI para ampliar a cognio de seus pesquisadores, para criar uma inteligncia
coletiva interna para considerar o saber favorece a criao de um diferencial competitivo na
Embrapa.
Na Embrapa Informtica Agropecuria, as metodologias e tecnologias so estudadas no apenas como um instrumento ou ferramenta que possuem um fim nico, mas tambm como meios
potenciais por onde perpassam significaes, sentidos, policompreenses e aprendizagens. Por
isso, cabe dizer que as metodologias e tecnologias para organizar espaos digitais web mveis
so tambm metodologias da inteligncia coletiva e das coaprendizagens. Este entendimento
amplia o grau de importncia que elas oferecem para o segmento agropecurio brasileiro, j que
potencializa a construo de conhecimentos coletivos, o compartilhamento de informaes e a
interoperabilidade, especialmente, como o caso das solues propostas no tocante ao design
de espaos e contedos digitais centrados ou no na aprendizagem colaborativa e social em rede
(OKADA; OKADA, 2007, 2011; SOUZA, 2013).
Na Embrapa Informtica Agropecuria, portanto, so construdos modelos conceituais de organizao de espaos digitais web no contexto da mobilidade, voltados ao processo de transferncia
de tecnologia na Empresa, com foco na comunicao e disseminao de informaes e tecnologias para o segmento agropecurio brasileiro. A constituio desses espaos digitais essencial
materializao de aes de comunicao para apoiar o processo de transferncia de tecnologia,
em quaisquer ambientes, canais/meios. Aqui, cabe definir meios de comunicao como aqueles
que servem [] a uma relao de comunicao na qual sero investidas operaes de produo
e recepo, e acrescentar que [] a ideia de meio de comunicao deve satisfazer um critrio
que se refere ao acesso plural das mensagens disponveis no meio. (BARICHELLO; SCHEID,
2007, p. 4).
Ambientes comunicacionais mediados por tecnologias digitais, em especial as da Web 2.0,
tornam-se imprescindveis para a fluidez das relaes de natureza dialgica e colaborativa.
Nesses ambientes os indivduos so considerados atores, j que podem exercer de forma ativa e
simultnea diferentes papis, como: emissor, receptor, produtor e coprodutor de contedos. Em
tais espaos de comunicao miditica digital, os contedos de informao devem ser articula-
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250
dos e integrados, para que facilitem a apropriao e a aprendizagem por parte dos interlocutores
interessados.
Esta lgica comunicacional insere-se na perspectiva de pensar as tecnologias digitais no como
meros canais de informao, mas como vias facilitadoras da compreenso da realidade, porque
so capazes de permitir s pessoas a possibilidade de construrem novas formas de entender o
real. Sodr (2002) fala da tendncia da sociedade contempornea de virtualizar ou de telerrealizar
as relaes humanas a partir do entendimento de comunicao enquanto processo informacional,
que se faz e se refaz por meio da tecnointerao, ou seja, de uma interao que se desenvolve
no mbito das mdias digitais virtuais.
Na Embrapa, atualmente, esto sendo reformuladas as prticas de produo e organizao de
contedos em espaos digitais, em razo:
1) Do uso intensivo de tecnologias, em especial, dos dispositivos mveis, que permitem s pessoas deslocarem-se atravs de territrios informacionais5.
2) Do predomnio e uso simultneo de vrias mdias pelas pessoas.
3) Da necessidade de ajuste das linguagens hbridas a cada tipo de mdia digital, especialmente
quando se quer promover a disseminao de informaes e a transferncia de tecnologias de
forma que os indivduos possam apreend-los, mudando seu comportamento com vistas
adoo de novas prticas rurais (SOUZA, 2013).
Torres e Souza (2011) assinalam que contedos comunicacionais voltados s necessidades de
disseminar e transferir tecnologia devem conter elementos atrativos e aglutinadores dos interesses dos pblicos-alvo, de modo a favorecer a interlocuo entre as pessoas e a Embrapa. Esta
forma de organizar os contedos que os tornam objetos sociais (WELLER, 2008) porque, alm
de servirem de ponto de partida para a promoo das interaes que ocorrem entre as pessoas em
espaos midiatizados, tambm comunicam, informam e mobilizam nas pessoas vrios processos
cognitivos, instigando-as a se interessarem por outros contedos e a compreend-los (TORRES
et al., 2013).
Nesse cenrio inseriu-se a determinao da Embrapa Informtica Agropecuria de propor um
modelo de organizao de espaos digitais para abarcar as lgicas dos processos de criao,
circulao e apropriao de contedos web no contexto da mobilidade, de modo a assegurar uma
identidade espontnea destes por parte dos indivduos (partcipes), que tanto podero produzi-los, quanto acess-los via desktop ou dispositivos mveis. O modelo ora apresentado (Figura
6) tem a finalidade de orientar a produo de contedos web para incrementar as aes de disseminao de informaes e de transferncia de tecnologia na Embrapa. Est fundamentado em
aspectos da representao do fenmeno da midiatizao elaborada por Vern (1997).
O termo midiatizao apareceu no incio da dcada de 1990, em funo da acelerada evoluo
tecnolgica e das demandas sociais, as quais tem levado as pessoas a aspirarem novas formas de
comunicao (STASIAK, 2013). Com base neste fenmeno, Vern (1997) prope um esquema
no qual se identificaram trs fluxos que compem a midiatizao. Estes fluxos se distinguem
por propiciarem a complementaridade entre emissor e receptor, a horizontalidade na troca de
mensagens e a presena do feedback.
5
reas de controle de fluxo de informaes que ocorre entre o ciberespao e o espao urbano e/ou rural.
Para Fausto Neto (2007), as tecnologias digitais agem nas relaes institucionais como meios-pulso, como consolidadoras de um novo tipo de real que se liga produo de sentido atravs
de meios sociotcnicos. Por isto, a midiatizao vista como estratgia lgica de aproximar
as empresas de seus pblicos, podendo ser considerada no apenas um meio/canal de comunicao, mas, sobretudo uma fora organizativa capaz de atravessar todas as prticas sociais. Nesse
sentido, no esquema traado por Vron (1997) os processos comunicacionais no so entendidos
como sendo lineares de causa e efeito e sim como sendo circuitos de feedback.
De maneira anloga, o modelo de organizao de espaos digitais desenvolvido pela Embrapa
Informtica Agropecuria enfatiza trs dimenses importantes que se complementam e dialogam
horizontalmente; so elas: dimenso institucional, dimenso ambincia miditica e dimenso
social. A dimenso institucional, que representa o conjunto de aes comunicacionais que
precisam ser estruturadas para disponibilizar os contedos digitais organizados dentro de uma
metodologia especfica (SOUZA, 2013; TORRES; SOUZA, 2011). Basicamente, a organizao
dos contedos deve contemplar trs eixos: tcnico, discursivo e tecnolgico. No eixo tcnico,
trata-se de desenvolver uma arquitetura pedaggica que favorea, de um lado, a compreenso do
contedo a ser disseminado e, de outro, a apropriao deles de forma que os indivduos que os
acessem possam apreend-los (SOUZA, 2013). Para que isto ocorra dever ser composta uma
equipe tcnica interdisciplinar formada por profissionais de vrias reas do conhecimento como
pedagogia, comunicao, engenharia da computao, cincia da informao, pesquisadores
especialistas do domnio do conhecimento etc. Esta equipe se responsabilizar por identificar,
reunir, analisar, selecionar e organizar, de forma complementar e interdisciplinar, as informaes
tcnico-cientficas6 produzidas pela Embrapa que serviro para construir a arquitetura pedaggi6
Entendidas como o conjunto de informaes e contedos de carter formal e explcito em algum documento interno
e/ou externo produzido pelos diversos pesquisadores da Embrapa no mbito dos vrios domnios de conhecimentos,
reas temticas e de atuao profissional que representam os resultados de pesquisas e/ou de desenvolvimento de
produtos, processos, metodologias e/ou servios.
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ca dos contedos a serem disseminados e/ou transferidos para a sociedade. O eixo discursivo
aquele que trata de desenvolver o tratamento lingustico do contedo que foi organizado na arquitetura pedaggica realizada pelo eixo tcnico (SOUZA, 2013). Neste eixo, ainda, estruturam-se
as linguagens que devero ser adotadas em cada tipo de mdia na qual o contedo ser aportado.
Sabe-se que cada mdia suporta um tipo de linguagem e cada indivduo tem um estilo de aprendizagem prprio. Assim, este eixo explora o potencial comunicacional de cada uma das mdias a
serem adotadas, verificando o que oferecem e como os contedos podem ser ajustados s possibilidades tecnolgicas que cada uma delas insere. Efetuar o tratamento da linguagem discursiva
de forma a conciliar o que cada mdia possibilita em termos de recursos permite que se ampliem
as chances de os contedos serem assimilados pelos indivduos. Por fim, no eixo tecnolgico
criada a infraestrutura tecnolgica que apoiar a organizao dos contedos nas diversas mdias
e a estruturao destas mdias na dimenso da ambincia miditica. um eixo no qual se desenvolvem os aportes tecnolgicos de hardware e software ou aplicativos que permitiro que as
interaes digitais sejam realizadas de forma gil, segura e interoperacional.
A segunda dimenso do modelo organizacional refere-se criao de um espao para a promoo
da ambincia miditica. Este espao refere-se a um ambiente virtual, composto por vrias mdias
digitais, que suportar os contedos organizados na dimenso institucional. Este ambiente ser
integrado por um conjunto de ferramentas tecnolgicas da Web 2.0 tendo a funo de alavancar
o desenvolvimento das interaes entre os indivduos e de permitir que criem novas formas de
relao com os contedos. Esta dimenso dever impulsionar a formao de redes sociais interativas, horizontais e colaborativas, servindo de instrumento para a disseminao de informaes
e a transferncia de tecnologias. A bidirecionalidade comunicativa, tipo de comunicao de
muitos para muitos, uma das caractersticas da plataforma web. Esta plataforma permite a
incorporao de ferramentas de colaborao e relacionamento interpessoal (FaceBook, Bebo,
YouTube, MySpace, etc.), bem como a criao de blogs, wikis, compartilhamento de fotos,
vdeos e lista de favoritos. Alm disto, possibilita a justaposio de aplicativos para formar a
base para um ambiente virtual dinmico e interativo no qual os indivduos aprendem coletiva e
colaborativamente (WHEELER; BOULOS, 2007). Paralelamente, esses so espaos novos de
visibilidade e de interao, nos quais os indivduos tm a chance de colocarem em debate questes de seu interesse, as quais, com frequncia, dizem respeito sua relao com as instituies.
(BARICHELLO; SHEID, 2007, p. 7).
O desenvolvimento de um ambiente virtual fundamentado neste tipo de arquitetura multifuncional e participativa contribui tambm para que os indivduos modifiquem suas pautas de
comportamento. Neste sentido, pode-se dizer que esta dimenso oferece oportunidades para que
as pessoas (re)signifiquem as formas de interao e convivncia e os contedos organizados,
dando-lhes chances de aprenderem (TORRES et al., 2010).
A ltima dimenso do modelo de organizao de espaos digitais a social. Nela, esto representados todos os atores sociais que tm interesse nas informaes e tecnologias desenvolvidas
pela Embrapa. Ainda que estes atores tenham natureza jurdica e representem uma comunidade
especfica (por exemplo, uma instituio), no mbito do modelo apresentado so intitulados de
indivduos para que seja evidenciado o carter de sujeitos ativos algum que tem domnio sobre sua ao e que se insere em complexas relaes sociais propiciadoras de novas racionalidades
(VERN, 1997). Na dimenso social, ainda, desenvolve-se o processo de interao entre os indivduos e a Embrapa, representado na Figura 6 pelas setas de duplo sentido. Neste processo am-
6 Resultados e concluses
Neste captulo so discutidas as solues de TI desenvolvidas pela Embrapa Informtica
Agropecuria para a gesto de recursos e sistemas de dados, informao e conhecimento produzidos na e pela Empresa. Nesta reflexo resgata-se a matriz conceptiva norteadora dos estudos
e pesquisas, que se ancora nas inter-relaes pessoais mediadas pelas tecnologias digitais, aqui
entendidas como instrumentos que lhes do nova dimenso capacidade de produzir, desenvolver, ampliar, combinar e recombinar informaes e conhecimentos, com vistas a criar novas
interpretaes sobre a realidade da agropecuria brasileira.
Duas solues de natureza metodolgica e tecnolgica foram apontadas como representativas.
A primeira delas a denominada Metodologias e tecnologias para interoperabilidade semntica, que direciona para aes voltadas aos aspectos da interoperabilidade semntica, reunindo
modelos conceituais que explicam o conhecimento por meio de representaes e codificaes
textuais e diagramticas. Parte-se de uma conceitualizao de objetos extrada do mundo real,
o que facilita o mapeamento e o compartilhamento de novas significaes e informaes,
podendo, por esta razo, ser empregados nos processos de GI e GC, em suporte ao processo
decisrio. Tal soluo denota relevante contribuio para a Embrapa que, doravante, pode-se
dizer detentora de um aparato metodolgico e tecnolgico para analisar, tratar, combinar e
recombinar volumes de informaes sob o prisma do tratamento semntico e da cognio, o
que certamente contribuir para promover o avano cientfico na rea de TI e de GC. Por fim,
as metodologias e tecnologias para interoperabilidade semntica tambm ganham importncia
para a Embrapa, em razo dos benefcios que podem gerar em decorrncia da sua aplicao
prtica, considerando-se que so:
- Solues adequadas sua realidade porque promovem o direcionamento de contedos de informao ao acesso aberto, alinhando-se a uma tendncia global em C&T.
253
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Captulo
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Desenvolvimento de
simuladores na
agropecuria
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1 Introduo
Simuladores computacionais so softwares que fazem uso de modelos matemticos e algoritmos
para representar um sistema (NUTARO, 2011). A simulao, por sua intrnseca associao com
a modelagem matemtica, frequentemente designada modelagem e simulao (M&S). As
finalidades da aplicao de M&S so diversas e incluem:
a) Gerao, formalizao e avaliao do conhecimento cientfico, particularmente em sistemas
complexos.
b) Apoio ao processo decisrio e resoluo de problemas gerenciais.
c) Educao e treinamento.
d) Transferncia de tecnologia.
Apesar de suas origens na matemtica aplicada e na computao, o estudo e aplicao da M&S
tem se tornado fundamental nas cincias sociais, humanas, biolgicas e da sade.
Um dos grandes atrativos de simuladores est em prover um ambiente virtual que permite interagir com representaes de sistemas, naturais ou artificiais sem as limitaes do mundo real.
Na realidade, estamos restritos por espao e tempo e na instrumentao disponvel para impor
determinados tratamentos e mensurar respostas. Alm disso, altos custos e riscos, questes ticas
e ambientais, frequentemente, inviabilizam a experimentao em muitas situaes. A utilidade
da virtualizao evidenciada pelo funcionamento da nossa prpria mente. De acordo com
Pezzulo et al. (2013), nosso crebro constantemente simula nossas interaes com o meio antes
de desencadear aes conscientes.
Do ponto de vista cientfico e tecnolgico, a M&S tambm tem sido apontada como instrumento
de excelncia para estudar sistemas naturais e para apoiar a elaborao de projetos e a gesto de
sistemas artificiais, por permitir considerar simultaneamente intrincadas interaes entre componentes e processos em um sistema e formalizar a lgica associada emergncia de propriedade
e fenmenos (JOHNSON et al., 2013; KEATING, 2008).
Na agropecuria h crescente aplicao de simuladores em diversas reas, tais como: desenvolvimento e produo de plantas e de animais (JONES et al., 2003; OLTJEN, 1986), apoio tomada
de decises gerenciais (BARIONI et al., 2010; FREER et al., 1997), dinmica de pragas, doenas
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tes (drivers) de sua dinmica. Durante a modelagem conceitual deve haver, todavia, a escolha de
um paradigma para a modelagem, que ir guiar os passos seguintes do processo de modelagem
e de codificao do simulador. Vrios paradigmas podem ser utilizados. Na agricultura h uma
tendncia para a aplicao do paradigma de dinmica de sistemas contnuos, por meio de sistemas deterministas de equaes diferenciais ou de diferenas. Entretanto, outros paradigmas,
como simulao orientada a eventos discretos (BARIONI et al., 1999), simulaes baseadas em
indivduos, simulao estocstica, e simulao-otimizao so tambm utilizados. A escolha de
um paradigma e a rea de origem dos profissionais envolvidos no trabalho de modelagem e simulao direciona fortemente a metodologia de modelagem e codificao e os artefatos utilizados.
O passo seguinte a formalizao matemtica e algortmica a partir do modelo conceitual e da
codificao. Esses passos sero tratados mais detalhadamente ao longo do captulo.
Zeigler et al. (2000) fazem uma til distino entre modelos e simuladores (Figura 1). Eles
conceituam modelos como especificaes (conjunto de instrues) e simuladores como os
programas responsveis por gerar o comportamento especificado em um computador. Modelos
matemticos podem, portanto, ser armazenados como arquivos contendo informaes estticas e
independentes do programa que os executa. Um modelo pode, por essa abordagem, ser executado
por mais de um simulador e o simulador pode executar diferentes modelos.
2 Conceitos bsicos
Nutaro (2011) distingue trs componentes bsicos em softwares de simulao computacional:
1) O modelo matemtico.
2) O simulador.
3) A interface de entrada e sada.
O modelo matemtico uma representao, utilizando linguagem e conceitos matemticos,
das relaes e interaes relevantes do sistema para o propsito para o qual o modelo se destina. Zeigler et al. (2000) utiliza o termo sistema-fonte para definir o sistema real que estamos
modelando. O processo de desenvolvimento do modelo matemtico a partir do sistema-fonte
normalmente denominado modelagem ou modelao.
O processo de modelagem se inicia pelo julgamento, de certo modo arbitrrio ou emprico, de
quais so a fronteira e os aspectos relevantes do sistema-fonte a serem reproduzidos. A fronteira
do sistema define as variveis, processos e inter-relaes endgenos ao modelo. A fronteira
tambm o ponto de partida para identificarmos variveis exgenas que so fatores determinantes
do comportamento do sistema, tambm denominados em ingls drivers, os quais devero fazer
parte das entradas para a simulao, mas no sero afetados por ela.
O modelo conceitual usado, sequencialmente, para definir, a partir do conhecimento terico
existente, como ser representado o estado do sistema e quais os processos e fatores determinan-
Comparison between three different approaches to implement a system dynamic model: an assessment by a multidisciplinary team, de autoria de M. C. Freua, L. G. Barioni, R. Vilamiu, F. R. T. A. Dias a ser editado pela Embrapa
Informtica Agropecuria, 2014.
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por vrias equipes e em vrias situaes tende a contribuir para sua robustez e confiabilidade.
necessrio, entretanto, verificar a adequao de um simulador ao problema e dados disponveis.
Algumas das principais verificaes so:
1. O simulador possui as variveis de sada (resultados) necessrias para a soluo almejada?
2. Os dados requeridos para executar o simulador, i.e., os valores das variveis de entrada, existem ou podem ser gerados com o custo e em tempo adequados?
3. A acurcia do simulador satisfatria para o propsito do trabalho ou pode ser melhorada sem
alteraes estruturais?
4. A infraestrutura computacional disponvel suficiente para os resultados no tempo exigido?
Sempre que a resposta a uma dessas questes for negativa, justifica-se o trabalho de modelagem
e desenvolvimento de um novo simulador.
Muitos simuladores utilizam interfaces tradicionais, do tipo desktop, tais como a dos softwares
DSSAT (JONES et al., 2003), Grazplan (FREER et al., 1997) e Invernada (BARIONI et al.,
2010). Em outras oportunidades so utilizadas interfaces com sistemas de informao geogrfica
(PRIYA; SHIBASAKI, 2001), softwares estatsticos (BEN TOUHAMI et al., 2013), gerenciadores de processamento paralelo, sistemas de workflow (LUDSCHER, 2006), entre outros.
Em razo de simuladores serem mais precisos medida que aumenta o nmero de iteraes nos
algoritmos de integrao numrica, esses so frequentemente vidos por capacidade de processamento. Frequentemente a aplicao de simuladores demanda computao de alto desempenho,
envolvendo processamento paralelo em muitos processadores arranjados em clusters, grids ou
nuvens.
H ainda pouca explorao, na agricultura, de uso de interfaces avanadas como as encontradas
em outras reas de aplicao, tais como jogos educativos ou simuladores com atuadores mecnicos. Alm disso, um simulador pode ser cliente de outro simulador na forma de pipeline. A
Embrapa informtica Agropecuria tambm desenvolve um prottipo de jogo digital baseado em
um simulador de sistemas de produo de bovinos (em fase de elaborao)2.
Desenvolvimento de um jogo educativo baseado em um simulador de sistema de produo de bovinos de corte (Resumos), de autoria de Jair Bortolucci Junior e Adauto Mancini a ser editado pela Embrapa Informtica
Agropecuria, 2014.
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Figura 3. Exemplo do acoplamento em estruturas hierrquicas. Detalhes sobre portas, conexes e hierarquias so apresentados no corpo do texto.
permite o desenvolvimento de simuladores orientados a objetos e sua compilao como bibliotecas de vnculo dinmico (MANCINI et al., 2013).
O paradigma de simulao orientada a objetos usado nessa ferramenta est alinhado com a maioria dos arcabouos de simulao utilizados atualmente como, por exemplo, JDEVS (FILIPPI;
BISGAMBIGLIA, 2003); VLE (QUESNEL et al., 2007) e SimPy3. A linguagem escolhida foi
C++, que oferece ampla versatilidade e eficincia do cdigo e que possui compiladores para
praticamente todos os sistemas operacionais atuais, alm de ser suportada por diversos ambientes
integrados de desenvolvimento gratuitos como Eclipse, NetBeans, Code::Blocks e Qt.
Os principais requisitos para a construo do arcabouo foram modularidade, suporte hierarquia na estruturao de modelos, padronizao de cdigo e reso de modelos componentes.
Outros requisitos levantados pela equipe de desenvolvimento foram:
- Suporte simulao contnua e hbrida.
Olhando por essa perspectiva, Rotmans (2009) afirma que o maior desafio est, na atualidade,
na combinao ou acoplamento dos modelos de forma a gerar solues para as diferentes demandas por simulao. Seguindo filosofia similar, na Embrapa Informtica Agropecuria tem-se
trabalhado no desenvolvimento de componentes de software que facilitem a especificao de
modelos componentes, a implementao do simulador, a execuo de simulaes e os processos
de avaliao e calibrao dos modelos.
- Especificao textual padronizada dos modelos para facilitar a interao com especialistas de
domnio no programadores.
O arcabouo (ou framework, do termo em ingls) de simulao MaCSim o componente de software central para implementao de simuladores do Laboratrio de Matemtica Computacional
da Embrapa Informtica Agropecuria. um arcabouo de simulao para implementao que
- Cdigo de baixa complexidade para facilitar seu entendimento por alunos de graduao.
- Separao do cdigo de controle da simulao do cdigo para desenvolvimento de modelos.
- Interface simples para facilitar a comunicao entre a aplicao cliente e o simulador.
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mesmo protocolo com o simulador, de modo que desenvolvedores precisaro aprend-lo apenas
uma vez e no ser necessrio conhecimento detalhado sobre o cdigo do simulador. Estimao
de parmetros, avaliao de modelo, simulaes estocsticas, tambm so beneficiadas por se ter
o simulador compilado como uma biblioteca e usado por uma aplicao cliente.
O arcabouo foi concebido para que a aplicao cliente se encarregue do armazenamento de dados. Esta abordagem difere daquela descrita por Bolte (1998), em que o armazenamento de dados
feito pelo software simulador. O desacoplamento dos componentes simuladores do servio de
armazenamento de dados prov flexibilidade, pois a aplicao cliente pode armazenar as sadas
do modo mais adequado para atender sua demanda de anlise (memria, arquivo texto ou banco
de dados). Tambm melhora a eficincia porque evita armazenamento desnecessrio dos dados
de cada iterao gravando-os em disco a cada instante, por exemplo.
O MacSim no possui interface grfica para modelagem ou para a execuo da simulao. Assim,
para pblicos sem treinamento em programao, seu uso para modelagem e simulao depende
de ferramentas para prototipao e execuo dos modelos desenvolvidos nesse framework.
Para facilitar a prototipao de modelos, desenvolveu-se uma planilha eletrnica, programada
em Visual Basic para Aplicativos, que permite a especificao de modelos componentes (SILVA;
BARIONI, 2013). A planilha suporta modelos estticos e sistemas de equaes diferenciais ordinrias. Essa ferramenta permite especificar, documentar, simular e gerar cdigo dos modelos em
C++ para o framework MaCSim e em linguagem R para prototipao mais avanada.
Conforme ilustrado na Figura 4, o framework de simulao necessita de uma interface para execuo de simulaes, estudo de cenrios, calibrao de modelos, entre outras funcionalidades. A
Embrapa Informtica Agropecuria desenvolveu, ento, uma interface em linguagem R, denominada MaCSimR, para execuo das bibliotecas de vnculo dinmico contendo os simuladores.
O MaCSimR permite:
- Acoplar os modelos, incluindo sua estrutura hierrquica, a partir de modelos componentes
disponveis na biblioteca do simulador.
O mesmo simulador pode ser usado para diferentes propsitos, atendendo aplicaes clientes
distintas (executadas independentemente) e dados da simulao podem ser armazenados de diferentes modos. Por exemplo, um simulador de uma fazenda pode ser usado para uma simulao
determinstica e pontual em um sistema de suporte deciso, mas tambm para uma simulao
em grade para uma rea geogrfica mais abrangente e cenrios de mudana climtica de longo
prazo.
A separao do simulador dos outros componentes de software pode resultar em trabalho mais
eficiente e especializado conduzido paralelamente por equipes dedicadas. Neste contexto, componentes de software, que no sejam o simulador propriamente, podem ser desenvolvidos por
instituies parceiras. Um protocolo de comunicao padro, definido pelo arcabouo, facilita o
desenvolvimento e minimiza erros, uma vez que chamadas entre os componentes da aplicao
cliente e o simulador no precisam ser redesenhadas para cada uso especfico das aplicaes
clientes. A produtividade tambm pode ser aumentada, porque cada aplicao poder usar o
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Embora simulaes continuem sendo feitas a partir de populaes, o uso de sensores que coletam
informaes fenotpicas em tempo real, aliados parametrizao de modelos com informao
genmica, tem trazido tona a possibilidade de simulao baseada em indivduos e do uso de
simuladores diretamente no melhoramento gentico e na gesto de sistemas de produo de
plantas e animais.
4 Perspectivas
Determinar as possveis trajetrias de desenvolvimento e aplicao de simuladores na agropecuria brasileira para o futuro pode ser feito a partir de diferentes fontes de informao, dentre
elas:
a) Os simuladores, arcabouos de simulao e as formas de gerao e organizao de dados para
M&S na agropecuria, j desenvolvidos ou em desenvolvimento, bem como as metodologias
de desenvolvimento empregadas.
b) A aplicao de simulao computacional em outras indstrias em que a simulao vem sendo
aplicada h mais tempo, como na engenharia mecnica e mecatrnica, na climatologia, na
neurocincia e na indstria de entretenimento.
c) As projees de evoluo de reas relacionadas aos principais gargalos para o desenvolvimento de simuladores, tais como a formao de equipes multidisciplinares, a organizao de
dados, o desenvolvimento de software e a infraestrutura de hardware para suportar as simulaes.
Temas como segurana alimentar, mitigao e adaptao s mudanas climticas e comrcio
internacional tm sido os maiores demandantes de simuladores mais complexos. Nesses temas
h tendncia de trabalhar-se com maior nmero de nveis de agregao em simuladores na
agropecuria, tornando frequente a busca por conexes entre observaes na escala de parcela,
processos biofsicos e da produo na escala da fazenda e consequncias nos mbitos regional,
nacional ou global. Alm disso, esses simuladores trabalham com abrangncia temporal mais
ampla e buscam prever os impactos de intervenes, tais como polticas pblicas. Assim esses
temas tm requerido simulaes com abrangncia de espao e tempo muito mais amplas, gerando demanda por processamento milhares e, por vezes, milhes de vezes maiores que aquela
demanda para a simulao de processos em simuladores de sistemas produtivos do incio do
milnio.
Em resposta s novas demandas e expanso da aplicao da simulao na agropecuria, h
atualmente forte tendncia para o desenvolvimento de simuladores a partir de ferramentas que
permitam alto desempenho computacional e reso de modelos na forma de solues de simulao a partir do acoplamento de modelos componentes (BERGEZ et al., 2013).
Em outras indstrias, aplicaes importantes da simulao incluem o controle otimizado de sistemas, em interveno automtica por meios eletromecnicos e no treinamento de pessoas, reas
ainda incipientes na agropecuria. Alm disso, em outras reas h integrao mais consistente
com outras tcnicas computacionais, tais como aquelas ligadas inteligncia computacional,
otimizao (i.e. simulao-otimizao) e robtica. Observa-se que tanto a agricultura quanto a
zootecnia de preciso caminham no sentido das demais indstrias mais intimamente ligadas
engenharia.
O uso de simuladores para treinamento de pessoas tambm parece ser bastante promissor nessa
rea que tem sido negligenciada na agropecuria. O treinamento por meio de jogos nos quais simuladores realistas so utilizados de forma iterativa pode promover experincia importante para
gerenciar problemas de sistemas produtivos em situaes de risco climtico e de preos. Alm
disso, tal abordagem poder tambm facilitar o ensino pela possibilidade de representar conceitos
relacionados aos feedbacks que ocorrem em sistemas produtivos.
O desenvolvimento de simuladores agropecurios no Brasil parece ainda sofrer pela presena de
vrios gargalos, particularmente associados falta de integrao entre equipes de modelagem
matemtica, desenvolvimento de software e especialistas de domnio com pesquisa de campo
em rede para o desenvolvimento de simuladores. Essa dificuldade na integrao das equipes
esbarra, via de regra, na falta de formao e treinamento de profissionais de cincias agrrias e
pela carncia de profissionais de cincias exatas com interesse em aplicaes agropecurias em
detrimento de outras indstrias.
A Embrapa Informtica Agropecuria tem investido, recentemente, na gerao de ferramentas
visando ao uso por profissionais com formao em cincias agrrias. O desenvolvimento dessas
ferramentas tem ocorrido em conjunto com treinamento desses profissionais e a formao de redes de pesquisa. Tal iniciativa almeja dar suporte aos novos desafios de simulao na agricultura,
por meio de uma viso holstica e integrada, que parte da gerao do dado at a soluo de um
problema de pesquisa auxiliado pelo desenvolvimento de um simulador.
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Captulo
273
Minerao de dados:
conceitos e um estudo de caso
sobre certicao racial de ovinos
14
1 Introduo
1.1 Descoberta de conhecimento em banco de dados
Nos ltimos anos, observa-se que uma grande quantidade de dados cresce de forma acelerada em
diversos campos de conhecimento, fato que dificulta a sua interpretao, pois o volume destes
dados maior que o poder de interpret-los. Desta forma, surgiu a necessidade do desenvolvimento de ferramentas e tcnicas automatizadas para minimizar esta situao, as quais pudessem
auxiliar o analista a transformar os dados em conhecimento (HAN et al., 2011).
Grande parte dessas tcnicas e ferramentas podem ser encontradas no processo de Descoberta
de Conhecimento em Bases de Dados, da sigla em ingls Knowledge Discovery in Databases
(KDD). Segundo Fayyad et al. (1996), a descoberta de conhecimento em bancos de dados definida como um processo no trivial que busca identificar padres novos, potencialmente teis,
vlidos e compreensveis, com o objetivo de melhorar o entendimento de um problema ou um
procedimento de tomada de deciso.
O processo KDD se originou da interseco de vrias reas de pesquisa, tais como aprendizado
de mquina, reconhecimento de padres, estatstica, banco de dados, visualizao de dados, inteligncia artificial e computao de alto desempenho (FAYYAD et al., 1996). Por este motivo, as
tcnicas existentes no KDD no devem ser consideradas substitutas de outras formas de anlise,
como Online analytical processing (Olap), mas, sim, uma forma de se aperfeioar os resultados
obtidos por meio das exploraes realizadas pelas ferramentas atuais (REZENDE et al., 2003).
As aplicaes das tcnicas esto presentes em praticamente todos os setores do conhecimento
humano. Na rea de negcios, por exemplo, utilizam-se tcnicas em deteco de fraudes em cartes, na criao de perfis de clientes de acordo com suas compras, entre outros. Na agricultura,
podem ser utilizadas, em previso de geadas, sistemas de alerta para a ferrugem do cafeeiro,
sistemas de alerta para a ferrugem asitica da soja, etc. Na medicina, pode-se identificar terapias
mdicas de sucesso para diversas doenas. Na bioinformtica, para se buscar padres em sequncias de DNA, entre muitas outras possibilidades.
Segundo Fayyad et al. (1996), o processo de KDD interativo e iterativo, alm de envolver vrios passos, exibidos na Figura 1, com muitas decises sendo feitas pelo especialista do domnio
dos dados.
274
Na etapa de minerao de dados propriamente dita deve ser feita a escolha da tarefa a ser empregada, assim como a definio do algoritmo. Esta escolha deve ser baseada nos objetivos que se
deseja atingir com a soluo a ser encontrada. As possveis tarefas de um algoritmo para se extrair
padres podem ser agrupadas em preditivas e descritivas (HAN et al., 2011), como ilustradas na
Figura 2.
Figura 2. Tarefas de Minerao de Dados.
Fonte: adaptado de Rezende et al., 2003.
Minerao de
Dados
Tarefas
preditivas
Tarefas
descritivas
Classificao
Regresso
Associao
Clusterizao
As tarefas preditivas tm como objetivo principal a construo de modelos que possam predizer a
classe de um novo evento a partir de exemplos ou experincias passadas com respostas j conhecidas. As tarefas descritivas procuram identificar padres intrnsecos a um conjunto de dados que
no possui uma classe determinada. A escolha de uma ou mais tarefas ir depender do problema
a ser solucionado. As tarefas tradicionais de minerao de dados representadas na Figura 2 so
brevemente descritas a seguir.
- Classificao: consiste na predio do valor de um atributo alvo do tipo discreto ou categrico
por meio da construo de modelos e regras a partir de um conjunto de exemplos pr-classificados corretamente, para posterior classificao de exemplos novos e desconhecidos (HAN et
al., 2011). O grande desafio para os algoritmos de classificao gerar modelos que possuam
boa capacidade de generalizao, ou seja, que estejam aptos a predizer, com alta taxa de acerto,
os rtulos das classes para registros que no foram utilizados durante a construo do modelo
(TAN et al., 2005).
- Regresso: tcnica estatstica muito empregada para se realizar predies (HILL et al., 2003).
Essas predies procuram encontrar tendncias de variaes no conjunto de dados analisado
em funo dos atributos existentes. Possui um conceito semelhante classificao, porm se
aplica na predio de um valor alvo do tipo contnuo.
- Associao: determinam o quanto a presena de um certo conjunto de atributos nos exemplos
de uma base de dados implica na presena de algum outro conjunto de atributos nos mesmos
exemplos (AGRAWAL; SRIKANT, 1994). As regras de associao podem ser apresentadas
no formato l r, onde l e r so, respectivamente, o lado esquerdo (Left Hand Side) e o lado
direito (Right Hand Side), tal que l r = , de forma que representam conjuntos distintos de
atributos. Basicamente, essas regras definem a relao existente entre l e r, demonstrando o
quanto a presena de l implica a presena de r.
- Agrupamento (clusterizao): uma tarefa descritiva que procura identificar agrupamentos
(clusters) finitos de objetos similares entre si e dissimilares entre os grupos no conjunto de
275
276
Compreenso
do domnio
novos questionamentos que levam a aes mais especficas. As setas internas ilustram as relaes
entre as fases, que indicam que a sequncia entre elas no rgida, sendo comum haver a necessidade de voltar ou avanar entre as fases.
A seguir, encontra-se uma breve descrio de cada fase do processo:
- Compreenso do domnio: compreender os objetivos e requisitos do projeto e transformar
esse conhecimento em um problema de minerao de dados. Definir um plano preliminar para
atingir esses objetivos.
- Entendimento dos dados: inicia-se com uma coleo de dados inicial e prossegue com atividades de explorao de dados, para se familiarizar, identificar problemas de qualidade, fazer
as primeiras hipteses e identificar possveis subconjuntos que possam abrigar informaes
ocultas sobre esses dados.
- Preparao dos dados: a fase de preparao dos dados contempla todas as atividades necessrias para a construo do conjunto de dados final, no qual sero aplicadas as tcnicas de
modelagem. As atividades incluem, por exemplo, limpeza de dados, seleo e transformao
de atributos, entre outras.
- Modelagem: nessa fase so escolhidas e aplicadas as tcnicas de minerao de dados, e seus
parmetros so calibrados. Diversas tcnicas podem ser aplicadas ao mesmo problema, embora
cada tcnica necessite de formatos especficos e necessite voltar para a fase de preparao de
dados.
- Avaliao: nesse estgio, tem-se o modelo (ou modelos) com boa qualidade. Os resultados
so comparados e interpretados conforme a rea de aplicao. importante reavaliar todas as
etapas do processo para se ter a certeza de que o modelo atende s necessidades e aos objetivos
do projeto.
- Distribuio: a criao de modelos geralmente no finaliza um projeto. O conhecimento obtido
deve ser documentado, organizado e apresentado para os usurios, para que estes possam saber
quais aes devem ser realizadas para aproveitar os modelos criados.
Entendimento
dos dados
Preparao
dos dados
2 Estudo de caso
2.1 Modelagem para certificao racial de ovinos
Distribuio
Modelagem
Avaliao
O Brasil possui diversas raas de ovinos que foram desenvolvidas a partir de raas trazidas pelos
colonizadores portugueses, logo aps o descobrimento. Ao longo desses quase cinco sculos,
essas raas foram submetidas seleo natural em diversos ambientes, a ponto de desenvolverem
caractersticas de adaptao s diversas condies ambientais brasileiras. Essas raas passaram
a ser conhecidas como crioulas ou localmente adaptadas. A maioria dessas raas encontra-se
ameaada de extino, principalmente devido a cruzamentos indiscriminados com animais de
raas exticas que passaram a ser importadas a partir do final do sculo XIX (MARIANTE et
al., 2009).
As raas localmente adaptadas, apesar de no possurem o mesmo potencial produtivo das raas
exticas melhoradas, constituem uma importante fonte de informaes que pode levar descoberta de genes envolvidos com determinadas caractersticas adaptativas, tais como resistncia a
277
278
diversas doenas e parasitas. Essas caractersticas permitem que os animais destas raas sejam
mais adaptados que ovinos de outras raas (inclusive de raas exticas melhoradas) a regies de
ambientes mais hostis. Essas informaes fornecem um caminho muito interessante para futuras
investigaes, principalmente no entendimento da base gentica envolvida na adaptao a estes
ambientes (GOUVEIA, 2013).
Para evitar a perda deste importante e insubstituvel material gentico, a Empresa Brasileira de
Pesquisa Agropecuria (Embrapa) decidiu incluir as raas localmente adaptadas no seu Programa
de Pesquisa em Recursos Genticos. Atualmente, a conservao dos recursos genticos animais
realizada em bancos de germoplasma, que podem ser compostos de pequenos rebanhos de
animais de uma raa que ficam submetidos seleo natural (in situ), ou de material gentico
congelado, como smen, embries e ovcitos (ex situ). Diversas raas localmente adaptadas
esto presentes nestes bancos, sendo que as que possuem maior destaque nacional so as raas
Crioula, Morada Nova e Santa Ins.
A seleo dos ovinos de uma determinada raa para compor estes bancos realizada por meio
de critrios tradicionais, tais como a avaliao de caractersticas morfolgicas e produtivas.
Entretanto, essa avaliao est sujeita a falhas, pois alguns animais cruzados mantm caractersticas semelhantes quelas dos animais locais. Com isto, identificar se os animais depositados no
banco so ou no pertencentes a uma raa uma tarefa que exige muita cautela.
Para auxiliar na busca de solues para este tipo de problema, o emprego de tecnologias
advindas das reas da gentica e da computao fundamental para atingir resultados mais
precisos e confiveis. Nos ltimos anos, houve um aumento na utilizao de tecnologias que
empregam anlise do deoxyribonucleic acid (DNA) na rea animal, sendo que as que fazem
uso de marcadores moleculares baseados em polimorfismos de DNA se destacam entre as
mais importantes.
Dentre os tipos de marcadores moleculares existentes, os do tipo Single Nucleotide Polymorphism
(SNP) mostraram ser mais efetivos no auxlio da certificao racial de animais domsticos
(PANT et al., 2012; SASAZAKI et al., 2011; SUEKAWA et al., 2010). Os marcadores SNP
constituem uma variao que ocorre em apenas um nico nucleotdeo da cadeia de bases nitrogenadas (Adenina, Citosina, Timina e Guanina) do DNA, afetando ou no o fentipo alvo entre
os membros de uma espcie em estudo. Atualmente, as novas tecnologias para gerao destes
dados moleculares fornecem metodologias que so capazes de genotipar de dezenas at centenas
de milhares de marcadores SNP em microarranjos (microarrays) de DNA de alta densidade em
um nico ensaio.
Desta forma, selecionar os marcadores mais informativos para a identificao racial de um ovino torna-se um problema desafiador. Uma das formas de se realizar esta seleo por meio de
um processo de minerao de dados, cujo objetivo encontrar padres e tendncias em grandes
volumes de dados (HAN et al., 2011). Esse processo permite identificar e estudar o conjunto
dos principais marcadores SNP. Para tanto, deve-se utilizar tcnicas especficas que combinem
seleo de atributos (ou variveis) e gerao de modelos preditivos. Estas tcnicas devem ser capazes de gerar modelos que classifiquem novos exemplos a partir de experincias acumuladas em
problemas anteriores e de lidar com problemas em que o nmero de atributos (p) muito maior
que o nmero de observaes (n) (). De acordo com James et al. (2013), a combinao dessas
tcnicas contribuem para eliminao de atributos redundantes e no-informativos, simplificam o
279
SNP 1
AA
GA
GA
...
72 animais
280
SNP 2
AG
AG
GG
...
SNP 3
AG
AG
AG
...
SNP 4
AG
GG
GG
...
SNP 5
AG
GG
AG
...
SNP 6
CC
AC
CC
...
...
AC
AC
CC
...
Raa
Crioula
Morada Nova
Santa Ins
...
49.034 SNP
Figura 4. Formato do conjunto de dados de marcadores SNP das trs raas em estudo.
Fase 3 - Preparao dos dados: Na etapa de preparao dos dados, realizou-se uma verificao
quanto existncia de amostras idnticas dentro do conjunto de dados e de marcadores SNP
que tivessem um valor nico de gentipo para todas as raas. Aps a verificao, constatou-se
que no existiam amostras idnticas. Entretanto, existiam 384 marcadores SNP com valor nico
para todas as raas, os quais foram removidos do conjunto de dados final.
Random Forest uma tcnica de classificao e regresso desenvolvida por Breiman (2001), que
consiste num conjunto de rvores de deciso combinadas para solucionar problemas de classificao. Cada rvore de deciso construda utilizando uma amostra aleatria inicial dos dados
e, a cada diviso desses dados, um subconjunto aleatrio de m atributos utilizado para escolha
dos atributos mais informativos. No final, Random Forest gera uma lista dos atributos mais
importantes no desenvolvimento da floresta, que so determinados pela importncia acumulada
do atributo nas divises dos ns de cada rvore da floresta (JAMES et al., 2013). Os principais
passos do algoritmo Random Forest podem ser vistos na Figura 5.
yi = +
j=1
xij j + ei = + Xi + ei
(1)
Sendo = (1, 2, ..., p)T, a estimativa Lasso para problemas de classificao definida pela
funo de mxima verossimilhana penalizada descrita na Equao 2:
^
^ )
l(,
1
=
n
i=1
j=1
j=1
Sujeito restrio
j=1
|j | t para t 0,
xij j
)]
(2)
De uma forma geral, uma rvore de deciso um modelo grfico representado por ns e ramos,
onde os ns intermedirios, ou decisrios, representam os testes de atributos (variveis independentes), enquanto que os ramos representam os resultados desses testes. O n localizado no topo
da rvore representa seu incio e denominado n-raiz. J o n externo, que no possui um n
descendente, localizado na extremidade inferior, denominado folha ou terminal, e representa
o valor de predio do atributo-meta ou classe (HAN et al., 2011). Para evitar overfitting, foi
utilizada a abordagem Random Forest que, em geral, lida melhor com o problema de sobreajuste
nos modelos (MEGETO et al., 2014).
A ideia principal da tcnica Boosting transformar mltiplos classificadores ruins em um nico
muito bom (FREUND; SCHAPIRE, 1999). Os mtodos desta abordagem funcionam aplicando-se sequencialmente um algoritmo de classificao a verses reponderadas do conjunto de dados
de treinamento, dando maior peso aos registros classificados erroneamente no passo anterior. O
algoritmo que mostra a execuo bsica da tcnica Boosting descrito na Figura 6.
Para aplicao das tcnicas de modelagem, escolheu-se o software R (verso 3.0.1). O pacote
instalado para o algoritmo Lasso foi o glmnet (FRIEDMAN et al., 2010), para Random Forest
foi instalado o pacote randomForest (LIAW; WIENER, 2002) e, para Boosting, foi instalado o
algoritmo gbm (RIDGEWAY, 2013). Alm destes, instalou-se o pacote caret (KUHN, 2013),
utilizado para a escolha dos melhores valores para alguns parmetros de cada tcnica aplicada.
281
282
Para avaliar o desempenho dos modelos, dividiu-se o conjunto de dados inicial em duas partes
disjuntas, sendo que uma parte constitui o conjunto de treinamento e outra o conjunto de teste.
As tcnicas utilizaram dois tipos de particionamento dos dados: validao cruzada e bootstrap.
Na validao cruzada, os dados so particionados em k sub-conjuntos de tamanhos aproximadamente iguais, e o indutor treinado e testado k vezes. Para cada uma das vezes, o indutor testado
com uma das parties e treinado com o restante. O bootstrap consiste em gerar os conjuntos de
treinamento e teste a partir de uma amostragem randmica dos dados, repetindo esse processo de
classificao por vrias vezes. A cada ciclo, as amostragens so selecionadas com reposio, isto
, um mesmo exemplo poder aparecer mais de uma vez no mesmo sub-conjunto.
Os modelos foram analisados por meio dos valores da acurcia e do coeficiente Kappa. A acurcia, ou taxa de acerto, fornece a porcentagem de observaes que foram classificadas corretamente pelo classificador, enquanto o Kappa (COHEN, 1960) mede o grau de concordncia
entre as classes preditas e observadas, deduzindo o nmero esperado de acertos (utilizando uma
classificao ao acaso) do nmero real de acertos do classificador (WITTEN et al., 2011).
Figura 6. Algoritmo bsico do algoritmo Boosting.
Fonte: James et al. (2013).
Foram realizados vrios experimentos utilizando cada uma das tcnicas, procurando obter modelos que fornecessem os melhores resultados em termos de acurcia e menor nmero de marcadores selecionados. Para tanto, antes da utilizao do pacote caret, os principais parmetros de
cada uma das tcnicas foram ajustados diversas vezes para atingir tal objetivo.
Lasso foi a primeira tcnica a ser aplicada, e o nico parmetro testado foi o intervalo de possveis valores para o coeficiente de penalizao (lambda). O nmero padro deste intervalo de
100 valores possveis (FRIEDMAN et al., 2010; JAMES et al., 2013), obtidos separadamente
pelo algoritmo Lasso, via validao cruzada, sobre os dados analisados. Aps a aplicao da
tcnica Lasso, utilizou-se Random Forest para a busca dos marcadores SNP mais relevantes,
associados a cada uma das raas. Os parmetros avaliados para Random Forest foram o nmero
de rvores a serem construdas e o nmero de atributos selecionados para determinar o split em
cada n das rvores. Com a construo desta floresta, foi possvel determinar os marcadores
mais importantes para o modelo (do atributo mais importante ao menos relevante). Assim como
Random Forest, Boosting foi utilizado para fornecer um modelo com a listagem dos marcadores
mais importantes na identificao das raas. O nico parmetro testado para Boosting foi o nmero de classificadores a serem desenvolvidos para o modelo final. Os classificadores construdos pela tcnica Boosting foram baseados em rvores de deciso, as quais foram construdas em
distribuies reponderadas dos dados.
Aps a obteno dos modelos e dos conjuntos de marcadores mais importantes para identificao
das raas, foi realizada uma anlise da frequncia allica de cada um desses marcadores, a fim
de verificar o quanto um alelo estava presente em uma raa e ausente em outras duas. Por fim,
foi selecionado um subconjunto menor de marcadores SNP com maior potencial de identificao
das trs raas pesquisadas.
Fase 5 - Avaliao: nesta etapa do processo, os modelos j foram desenvolvidos. Antes de passar
a fase final de desenvolvimento dos modelos finais, importante revisar todos os passos executados, para verificar se os objetivos foram alcanados. No fim dessa etapa, uma deciso a respeito
do uso dos resultados da anlise deve ser tomada.
283
284
Tabela 1. Frequncias allicas dos marcadores SNP selecionados pelo algoritmo LASSO para a raa
Crioula.
SNP
Cromossomo
OARX_121724022.1
OARX_29830880.1
OARX_78903642.1
s56924.1
OAR1_268303279_X.1
X
X
X
X
1
Posio
121724022
29830880
78903642
53358543
268303280
Alelos*
[C/A]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
Frequncia allica**
Crioula Morada Nova
0.98
0.02
0.80
0.00
0.95
0.07
0.98
0.13
0.78
0.07
Santa Ins
0.05
0.05
0.09
0.15
0.09
Cromossomo
Posio
Alelos*
s05480.1
OAR1_187375309_X.1
OAR1_194627962.1
DU373896_534.1
s32131.1
s06182.1
OAR6_39029427.1
OAR9_39924477.1
OAR10_33338187.1
OAR17_22334380.1
OAR17_8472049.1
OAR20_45964534.1
X
1
1
3
4
5
6
9
10
17
17
20
52592630
187375310
194627962
139464759
22382506
30787155
39029427
39924477
33338187
22334380
8472049
45964534
[G/A]
[A/G]
[G/A]
[A/C]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[A/C]
[A/G]
[G/A]
[A/G]
[G/A]
Frequncia allica**
Morada Nova Crioula Santa Ins
0.93
0.15
0.22
0.86
0.02
0.31
0.73
0.00
0.02
0.82
0.35
0.15
0.98
0.32
0.42
0.93
0.15
0.31
0.84
0.17
0.11
0.95
0.17
0.33
0.90
0.22
0.28
0.79
0.19
0.13
0.95
0.22
0.37
0.75
0.00
0.15
Tabela 3. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Lasso para a raa Santa
Ins.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OARX_53305527.1
OAR2_145195113.1
OAR2_242658985.1
s20468.1
OAR3_153703374.1
OAR3_165050963.1
s16949.1
OAR5_93120389.1
OAR7_21409209.1
OAR7_94733688.1
s11241.1
s59000.1
X
2
2
2
3
3
3
5
7
7
7
18
53305527
145195113
242658985
56248983
153703374
165050963
164901721
93120389
21409209
94733688
30741909
45393237
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[G/A]
[G/A]
[G/A]
[C/A]
[A/G]
Frequncia allica**
Santa Ins Crioula Morada Nova
0.72
0.00
0.09
0.74
0.04
0.38
0.85
0.17
0.29
0.76
0.15
0.00
0.76
0.41
0.13
0.80
0.02
0.07
0.89
0.15
0.18
0.89
0.19
0.38
0.61
0.02
0.11
0.98
0.37
0.59
0.81
0.35
0.34
0.87
0.30
0.38
285
286
Tabela 4. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Random Forest para a
raa Crioula.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OARX_121724022.1
OARX_29830880.1
OARX_78903642.1
s56924.1
OAR1_23724877.1
OAR2_212548956.1
OAR2_55853730.1
OAR11_18815864.1
s71482.1
OAR15_45152619.1
OAR16_39888776.1
s25195.1
s30024.1
X
X
X
X
1
2
2
11
14
15
16
25
25
121724022
29830880
78903642
53358543
23724877
212548956
55853730
18815864
41937578
45152619
39888776
7203123
7165805
[C/A]
[A/G]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[G/A]
[A/C]
[A/G]
[G/A]
[G/A]
[A/G]
[G/A]
[C/A]
Frequncia allica**
Crioula Morada Nova
0.98
0.02
0.80
0.00
0.95
0.07
0.98
0.13
0.50
0.00
0.80
0.04
0.85
0.00
0.93
0.34
0.91
0.18
0.76
0.02
0.89
0.11
0.93
0.02
0.91
0.02
Santa Ins
0.05
0.05
0.09
0.15
0.04
0.18
0.07
0.22
0.50
0.02
0.15
0.30
0.28
Do conjunto de 13 marcadores identificados por Random Forest para a raa Crioula, quatro tambm foram identificados por LASSO (OARX_121724022.1, OARX_29830880.1 e
OARX_78903642.1, s56924.1). Os dois SNP do cromossomo 25 esto em posies prximas e
com frequncia acima de 90% dentro da raa, surgindo como bons separadores raciais. De forma
geral, os SNP fornecidos por Random Forest se mostraram importantes na identificao da raa
Crioula.
Na Tabela 5, os SNP com predominncia na raa Morada Nova so listados.
Tabela 5. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Random Forest para a
raa Morada Nova.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OAR1_194627962.1
OAR2_54691204.1
OAR18_65638912.1
1
2
18
194627962
54691204
65638912
[G/A]
[G/A]
[G/A]
Frequncia allica**
Morada Nova Crioula Santa Ins
0.73
0.00
0.02
0.57
0.04
0.00
1.00
0.56
0.41
O algoritmo Random Forest indicou trs marcadores importantes para a raa Morada Nova.
Como destaque, observa-se os marcadores OAR1_194627962.1, indicado tambm pelo modelo
Lasso, e OAR2_54691204.1, com frequncia acima de 50% na Morada Nova e praticamente ausente nas outras duas raas. O marcador OAR18_65638912.1 se destaca com frequncia de 100%
na raa Morada Nova, apesar de sua frequncia em outras duas raas ter ficado entre 40% e 60%.
Na Tabela 6 pode-se observar os SNP com alta frequncia na raa Santa Ins.
Tabela 6. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Random Forest para a
raa Santa Ins.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OARX_53305527.1
s61697.1
OAR1_175474366.1
s03528.1
s20468.1
OAR3_164788310.1
OAR3_165050963.1
OAR3_195698523.1
s16949.1
s69653.1
OAR9_76802154.1
X
1
1
2
3
3
3
3
3
9
53305527
175474366
28583773
56248983
164788310
165050963
195698523
164901721
164951744
76802154
[A/G]
[C/A]
[G/A]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[G/A]
[A/G]
Frequncia allica**
Santa Ins Crioula Morada Nova
0.72
0.00
0.09
0.68
0.06
0.04
0.55
0.24
0.00
0.92
0.43
0.23
0.76
0.15
0.00
0.89
0.22
0.18
0.80
0.02
0.07
0.66
0.15
0.04
0.89
0.15
0.18
0.90
0.08
0.36
0.96
0.32
0.50
Para a raa Santa Ins, 11 marcadores foram selecionados com altas frequncias allicas. Destes,
quatro estavam presentes no modelo fornecido pelo algoritmo LASSO (OARX_53305527.1,
s20468.1, OAR3_165050963.1 e s16949.1). Um dado interessante que cinco marcadores so originados do cromossomo trs (OAR3_164788310.1, OAR3_165050963.1, OAR3_195698523.1,
s16949.1 e s69653.1). O marcador s61697.1 tambm se destaca com alta frequncia na raa
Santa Ins e com frequncias abaixo de 7% na raa Crioula e Morada Nova.
Para treinamento e teste, foram desenvolvidas e combinadas 1.000 rvores utilizando as amostras
bootstrap. O comit de classificadores que formaram a floresta obteve uma acurcia de 99% e
Kappa de 0,98. Em relao ao desempenho, o modelo Random Forest foi gerado em duas horas
e 44 minutos, ou seja, um tempo que pode ser considerado aceitvel levando-se em considerao
o elevado nmero de atributos do conjunto de dados.
Na aplicao da tcnica Boosting, o nico parmetro testado foi o nmero de classificadores
(neste caso, rvores de deciso) a serem construdos. Avaliou-se modelos desenvolvidos com totais entre 1.000 e 10.000 rvores, sendo que o melhor resultado, em termos de acurcia e Kappa,
ocorreu com 1.000 rvores, nmero fornecido pelo pacote caret. Selecionou-se os 20 melhores
marcadores, pois os SNP a partir desta posio pouco contribuam (menos que 1%) para o modelo. Entre os 20 marcadores ordenados por Boosting, seis estavam presentes nos modelos Lasso e
Random Forest, dois estavam somente em Lasso e sete somente no modelo Random Forest. Com
isto, Boosting selecionou apenas cinco marcadores diferentes das tcnicas anteriores. Na Tabela
7 esto descritos os SNP predominantes na raa Crioula e suas frequncias.
Na lista de marcadores importantes para a raa Crioula, dois deles (OARX_121724022.1 e
s56924.1) foram indicados nos dois modelos anteriores, e outros dois (OAR2_55853730.1
e OAR15_45152619.1) foram selecionados no modelo Random Forest, demonstrando o
alto potencial destes marcadores. Os marcadores indicados apenas no modelo Boosting
(OAR4_51441757.1, OAR6_110447914.1 e s30024.1) tambm mostraram ser potenciais discriminantes de raas.
287
288
Tabela 7. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Boosting para a raa
Crioula.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OARX_121724022.1
s56924.1
OAR2_55853730.1
OAR4_51441757.1
OAR6_110447914.1
OAR15_45152619.1
s30024.1
X
X
2
4
6
15
25
121724022
53358543
55853730
51441757
110447914
45152619
7165805
[C/A]
[A/G]
[A/C]
[A/G]
[G/A]
[G/A]
[C/A]
Frequncia allica**
Crioula Morada Nova
0.98
0.02
0.98
0.13
0.85
0.00
0.91
0.25
0.67
0.04
0.76
0.02
0.91
0.02
Santa Ins
0.05
0.15
0.07
0.16
0.02
0.02
0.28
A Tabela 8 traz uma listagem dos marcadores com predominncia na raa Morada Nova.
Tabela 8. Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Boosting para a raa
Morada Nova.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OAR1_194627962.1
s32131.1
s06182.1
s10365.1
1
4
5
10
194627962
22382506
30787155
21720029
[G/A]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
Frequncia allica**
Morada Nova Crioula Santa Ins
0.73
0.00
0.02
0.98
0.32
0.42
0.93
0.15
0.31
0.45
0.00
0.00
O algoritmo Boosting separou cinco marcadores com maior frequncia em Morada Nova,
sendo um deles (OAR1_194627962.1) presente nos dois modelos anteriores e dois (s32131.1,
s06182.1) no modelo LASSO. O marcador OAR1_194627962.1 possui frequncia de apenas
2% na Santa Ins e ausente na Crioula, resultado que o confirma como um bom discriminante de
raas. Os marcadores s32131.1 e s06182.1 surgem com frequncia acima de 90% nos animais
Morada Nova, o que tambm demonstra o bom potencial destes SNP.
A Tabela 9 apresenta os marcadores associados a raa Santa Ins.
Dentre os marcadores fornecidos pelo modelo Boosting para a raa Santa Ins, destacam-se trs
deles (OARX_53305527.1, s20468.1, OAR3_165050963.1) tambm selecionados pelas tcnicas
Lasso e Random Forest. Alm disso, dois SNP (s39114.1, OAR9_40217510.1) foram selecionados exclusivamente por Boosting. De forma geral, a maioria dos marcadores selecionados para a
raa Santa Ins apresenta alta frequncia de alelo. Destaque para os trs SNP tambm indicados
pelos dois modelos anteriores, atestando seu potencial de identificao da raa Santa Ins.
Para realizao de treinamento e teste, o algoritmo Boosting foi executado por meio de validao cruzada em 10 subconjuntos de dados, sendo que o modelo final foi obtido por meio da
mdia dos 10 subconjuntos. A acurcia e o Kappa obtidos pelo modelo, com a combinao dos
classificadores ajustados, foi de 100% e 1, respectivamente. Observando esses resultados, pode-
Tabela 9: Frequncias allicas dos marcadores SNP, selecionados pelo algoritmo Boosting para a raa
Santa Ins.
SNP
Cromossomo
Posio
Alelos*
OARX_53305527.1
s61697.1
s03528.1
s20468.1
OAR3_164788310.1
OAR3_165050963.1
s39114.1
s69653.1
OAR9_40217510.1
X
1
2
3
3
3
3
9
53305527
28583773
56248983
164788310
165050963
232410568
164951744
40217510
[A/G]
[C/A]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[A/G]
[A/G]
[G/A]
[C/A]
Frequncia allica**
Santa Ins Crioula Morada Nova
0.72
0.00
0.09
0.68
0.06
0.04
0.92
0.43
0.23
0.76
0.15
0.00
0.89
0.22
0.18
0.80
0.02
0.07
0.59
0.08
0.07
0.90
0.08
0.36
0.54
0.08
0.02
-se acreditar que h indcios de overfitting, porm os parmetros ajustados para a execuo do
algoritmo foram obtidos pelo caret de forma a evitar um super-ajuste do modelo. O tempo de
execuo do algoritmo Boosting foi o menor entre os trs modelos, sendo finalizado em uma hora
e nove minutos. Este bom desempenho tambm foi obtido no trabalho de Gonzlez-Recio et al.
(2010), que utilizou o algoritmo L2-Boosting em dois conjuntos de marcadores SNP (de touros e
frangos), obtendo alta preciso nas predies com um tempo computacional relativamente curto.
Com o desenvolvimento dos trs modelos e a seleo dos principais marcadores para identificao das raas, foi realizada uma anlise daqueles SNP que convergiam em dois ou trs
modelos. A interseco dos modelos envolvendo a raa Crioula mostra que os marcadores
OARX_121724022.1 e o s56924.1 foram selecionados nos trs modelos, demonstrando alta relevncia na identificao da raa Crioula. O marcador OARX_ 121724022.1, em especial, possui
uma frequncia de 98%, ou seja, demonstra ser um SNP com alto potencial de identificao da
raa.
A interseco presente nos trs modelos, relativa raa Morada Nova, exibe o marcador
OAR1_194627962.1 com frequncia de 73% para a raa Morada Nova e frequncias praticamente nulas nas outras raas, o que caracteriza esse SNP como bom discriminante da raa. Os
modelos Lasso e Boosting selecionaram os SNP s32131.1 e o s06182.1, os quais possuem frequncias acima de 90% na raa Morada Nova, colocando-os tambm como altamente relevantes
para a raa.
Em relao raa Santa Ins, a interseco mostra que, nos trs modelos, h a presena de trs
SNP (OARX_53305527.1, s20468.1 e OAR3_165050963.1) que apresentam frequncias acima
de 70% em ovinos Santa Ins e abaixo de 10% em outras raas, confirmando alta capacidade
na discriminao racial. Entre os marcadores obtidos por Random Forest e Boosting, destaca-se
o s61697.1, com frequncia de 68%, posicionando-o como um potencial identificador da raa.
Considerando apenas os marcadores selecionados por dois e trs modelos, um total de 18 marcadores demonstra ter grande potencial na identificao das raas estudadas. Esse nmero de
marcadores prximo aos resultados de trabalhos relacionados identificao racial em bovinos,
289
290
como em Suekawa et al. (2010), onde foram encontrados cinco marcadores por meio de anlise
de frequncia allica capaz de distinguir gados japoneses e americanos. Por sua vez, Sasazaki et
al. (2011) desenvolveram um modelo no qual foram selecionados 11 SNP importantes para gados
provenientes de rebanhos dos Estados Unidos.
2.4 Consideraes finais
A avaliao dos modelos com aplicao das trs tcnicas de minerao de dados escolhidas
revelou resultados promissores para a seleo dos marcadores SNP mais informativos, que identificam as raas estudadas. Em particular, os modelos gerados pelas tcnicas Lasso e Boosting
obtiveram resultados melhores, em termos de acurcia e Kappa, em comparao com o modelo
Random Forest. Considerando que o conjunto de dados utilizado possui um elevado nmero de
atributos, as tcnicas utilizadas reduziram o nmero de SNP para menos de 0,2%. Na interseco
dos marcadores que compem os modelos, foram encontrados 18 SNP com maior potencial de
identificao das raas, indicando que realmente os marcadores selecionados possuem alta correlao com a raa associada. Os modelos desenvolvidos podem ser utilizados na certificao racial
de animais j depositados em bancos de germoplasma e de novos animais a serem inclusos nestes
bancos, assim como podero ser utilizados por diversos segmentos ligados ovinocultura, como
por exemplo, associaes de criadores interessadas em certificar seus animais, e pelo Ministrio
da Agricultura, Pecuria e Abastecimento(Mapa), no controle de animais registrados que apresentam alelos de outras raas, possibilitando a reclassificao desses animais. Adicionalmente,
a metodologia proposta poder ser extendida para toda e qualquer espcie animal de produo.
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Captulo
293
Mtodos, procedimentos e
tcnicas utilizadas na
construo de AgroTIC
15
1 Introduo
Com o afloramento do mtodo cientfico no sculo 16 ficou evidente que a humanidade teria
enormes benefcios se tratasse os problemas agrcolas com um procedimento formal e replicvel.
Iniciou-se ento um ciclo que perdura at o presente, no qual muito se avanou no conhecimento
sobre cultivo de plantas e criao de animais, alm do domnio dos mais variados microrganismos em diversos processos relacionados agricultura e alimentao.
A cincia desempenhou um papel fundamental e extremamente relevante para que a humanidade
alcanasse o estgio de desenvolvimento em que se encontra nas cincias agrcolas; e atualmente
h projetos de pesquisa que permeiam absolutamente todos os pontos de interesse no que diz respeito s questes agropecurias. Apenas para citar alguns exemplos, sem a mnima inteno de
exaurir toda a lista de reas de atuao, pode-se mencionar projetos no estudo de solos; fisiologia
de plantas e animais; nutrio animal e vegetal; gentica e melhoramento de microrganismos,
animal e vegetal; seleo genmica; rastreabilidade; monitoramento por satlite e veculo areo
no tripulado (VANTs) aplicados agricultura; modelagem agroambiental, impactos da agricultura no clima e impactos da mudana climtica na agricultura.
O que todos estes projetos tm em comum o fato de se basearem sempre no mtodo cientfico
para estabelecer os seus resultados. Mtodo este que compreende um conjunto de passos que
ajudam a formular, corrigir e evoluir teorias sobre observaes e problemas de interesse.
Atualmente, o mtodo cientfico tem sofrido uma revoluo em funo do uso massivo da
tecnologia da informao (TI) nas mais diversas etapas. A etapa de experimentao, por exemplo, tem usado intensivamente a TI para a gerao de dados e informaes acerca de eventos
sob estudo em vrias circunstncias. Com a criao de equipamentos eletrnicos e softwares
especializados em capturar dados, tm-se gerado vultuosos volumes de dados para posterior
anlise e obteno de resultados em vrias reas do conhecimento. Em diversas situaes estes
repositrios so referenciados como big data. A quantidade de dados gerados tamanha que
torna impossvel a anlise dos mesmos sem o uso de processamento computacional intenso, e
novamente componentes da tecnologia da informao aparecem associados a outra etapa do
processo cientfico, tornando a TI essencial para o avano de uma ampla gama de reas do
conhecimento humano.
294
sistemas de armazenamento especializados que podem atingir petabytes2 de capacidade. Na segunda categoria encontram-se os clusters e grids3, que permitem a ampliao dos seus recursos
com a adio de novos ns, ou seja, novas mquinas. O custo por processador ou por unidade
de memria mais expressivo nas mquinas escalveis verticalmente, porm existem problemas que somente so bem equacionados em arquiteturas deste tipo. Na Embrapa Informtica
Agropecuria tem-se uma infraestrutura baseada nas duas arquiteturas.
Outro ponto vital relacionado ao tema infraestrutura computacional diz respeito forma como os
recursos so alocados aos usurios. Na atualidade, a computao em nuvem apresenta uma abordagem bastante prtica para esta questo, o que tem motivado as organizaes a investirem esforos e recursos financeiros nesta rea. Um dos projetos da Embrapa Informtica Agropecuria
tem investigado o uso desta tecnologia aplicada aos problemas relacionados infraestrutura que
surgem comumente nas pesquisas agropecurias.
neste ponto que se torna indispensvel uma infraestrutura computacional adequada para fazer
frente aos diversos grandes desafios que se apresentam atualmente no mbito das pesquisas que
permeiam o campo da agricultura. Para evidenciar esta demanda, pode-se citar dois casos, dentre
vrios outros, em atividades de projetos na Embrapa Informtica Agropecuria. No primeiro,
um projeto para sequenciamento do Bos Indicus (popularmente conhecido como Nelore), uma
espcie com alto interesse comercial, gerando um volume de dados inicial da ordem de 1,5TB
(um e meio terabytes). Durante a execuo do projeto atingiu-se um patamar de 15TB de dados
intermedirios, tendo utilizado na fase crucial de montagem do genoma 500GB de memria
RAM e 96 threads de processamento por um perodo de 3 dias consecutivos. O segundo caso
est relacionado com o processamento e anlise de sries temporais para avaliao de modelos
em mudanas climticas. Um projeto nesta linha de ao estima a necessidade de armazenamento
temporrio de 100TB para a execuo de suas atividades.
Estes exemplos evidenciam a necessidade efetiva do uso de solues computacionais de alto-desempenho nas atividades de pesquisas agrcolas atualmente. Sendo assim, segue-se uma discusso sobre as principais infraestruturas computacionais utilizadas para suporte aos diversos
projetos de pesquisa realizados na Embrapa Informtica Agropecuria.
Terabytes: unidade de medida de volume de dados em um sistema computacional. Segundo o sistema internacional de
medidas equivale a 1012 bytes (caracteres).
Para atender s demandas por processamento com boa capacidade de memria, tem-se um grid
computacional com a maioria dos ns de processamento possuindo quantidade mediana de
memria e alguns poucos ns especiais, com grande volume. Assim, a capacidade de processamento pode ser expandida horizontalmente com a adio de novos ns simples. J a capacidade de memria disponvel para a soluo de um mesmo problema pode ser expandida com
a adio de ns especiais com alta capacidade de memria. Atualmente, o grid computacional
em questo conta com oito ns para processamento e dois ns para controle e gerncia do
ambiente. Dos ns exclusivos para processamento, dois tm 1TB e 2TB de memria RAM e,
respectivamente, 48 e 128 ncleos hiper-threading para processamento. Esta ltima mquina
pode escalar at 2048 ncleos e 64TB de memria RAM, constituindo um exemplo expressivo
de escalabilidade vertical. Os demais ns tm 512GB de memria RAM e 64 ncleos para
processamento cada.
2
Cluster e Grids se referem a conjunto de computadores que trabalham juntos na soluo de um problema. Usa-se o
termo cluster para conjuntos fisicamente prximos e normalmente homogneos e grids para conjunto de clusters.
295
296
sistema operacional Linux, uma vez que a maioria das ferramentas de bioinformtica disponveis
executam nesta plataforma.
O acesso do usurio ocorre via login remoto (ssh - secure shell), quando o mesmo necessita
executar comandos shell no ambiente; ou via interface web, quando utiliza a ferramenta Galaxy
para executar pipelines de anlises. Independentemente dos meios de interao do usurio com
o sistema, vital que a mesma ocorra de forma transparente, sem a obrigatoriedade de se saber
muitos detalhes para se utilizar adequadamente o ambiente. Neste sentido, muito importante
em ambientes de processamento cientfico o uso de sistemas de gerenciamento de recursos
(Distributed Resource Manager System -DRMS), os quais controlam o escalonamento automtico das tarefas (jobs) nas mquinas e gerenciam sua execuo e resultados. Estes sistemas criam
uma abstrao do ambiente baseada no conceito de filas de execuo. Desta forma, os usurios
passam a trabalhar com filas com caractersticas especficas, nas quais podem submeter seus
trabalhos. A seleo das mquinas, e o instante em que estes trabalhos iniciaro sua execuo,
ficar a cargo do DRMS determinar.
Em resumo, a infraestrutura apresentada atende atualmente s necessidades de processamento
de dados biolgicos da Embrapa, e tem a possibilidade de expandir-se de forma bastante efetiva.
A capacidade de armazenamento pode ser ampliada, tanto adicionando-se novos mdulos ao
storage j existente quanto adicionando-se novos storages ao ambiente. A capacidade de processamento pode ser ampliada com a adio de novos ns, e a capacidade de tratar problemas que
exijam grandes quantidades de memria RAM pode ser ampliada com a adio de ns especiais,
que tenham a memria necessria disponvel.
2.2 Clusters Hadoop
O Hadoop (BORTHAKUR, 2007; LAM, 2011) um arcabouo livre de software, mantido pela
Apache, voltado para processamento distribudo de grandes quantidades de dados. Alm de
ser altamente escalvel, permitindo a computao distribuda em milhares de computadores, o
arcabouo implementa tolerncia a falhas no nvel da aplicao, provendo servios de alta disponibilidade. Dentre os diversos componentes do arcabouo, destaca-se sua implementao do
modelo de programao MapReduce (DEAN, 2008), originalmente proposto pela Google, para
processamento e gerao de grandes quantidades de dados.
O ambiente integrado por duas redes, uma baseada na tecnologia 10 GbE para o trfego de
dados a serem processados e outra, baseada na tecnologia Gigabit Ethernet4, para a gerncia do
ambiente, por onde trafegam apenas dados de controle dos sistemas. Este grau de conectividade
importante para que o sistema tenha escalabilidade horizontal. Todos os servidores rodam o
10 GbE e Gigabit Ethernet so ambas tecnologias para comunicao em rede de computadores. A diferena principal
entre ambas est no fato da primeira possibilitar velocidades de 10 Gbps e a segunda, 1 Gbps.
O MapReduce aplica a tcnica de dividir para conquistar, no qual o problema dividido em problemas menores e processados separadamente, de forma distribuda, nas mquinas do cluster.
Neste modelo de programao, a computao realizada em termos de dois tipos de tarefas maps
(mapeadores) e reducers (redutores). As tarefas de mapeamento so responsveis por executar a
computao sobre fraes dos dados de entradas (splits) e geram resultados intermedirios. Cada
split processado por uma instncia do mapeador. Os resultados dos mapeadores so consolidados pelos redutores, que agregam os resultados intermedirios e geram o resultado final.
O formato dos splits variam conforme a natureza dos dados de entrada. Um split pode ser, por
exemplo, uma quantidade especfica de linhas de um arquivo muito grande, uma quantidade fixa
de bytes ou um arquivo inteiro, quando os dados de entrada so uma grande coleo de arquivos.
O software que implementa o MapReduce (ex. Hadoop) cuida do escalonamento das tarefas,
ou seja, paraleliza automaticamente a computao dos mapeadores e redutores nas mquinas do
cluster. As tarefas so monitoradas e, no caso de falhas, so reexecutadas de forma transparente
297
298
ao usurio. Estas caractersticas facilitam o desenvolvimento das aplicaes, pois os programadores no precisam se preocupar com aspectos de escalonamento e tolerncia a falhas.
No Laboratrio de Modelagem Agroambiental (LMA) da Embrapa Informtica Agropecuria,
o Hadoop MapReduce utilizado na simulao de cenrios agrcolas futuros (NAKAI, 2013).
Estas simulaes so realizadas por meio de uma metodologia de zoneamento de risco climtico
utilizando dados de projees climticas.
A metodologia de zoneamento utilizada baseada no clculo do balano hdrico, que requer
parmetros, como: coeficiente das culturas, capacidade de armazenamento de gua do solo,
evapotranspirao e sries temporais de chuva. Utiliza-se um modelo baseado em balano
hdrico chamado Bipzon (ASSAD, 1986; FOSTER, 1984; VAKSMANN, 2000) que calcula o
ndice de Satisfao da Necessidade de gua (Isna) para cada coordenada desejada. Este ndice
utilizado pelos especialistas para determinar os cenrios agrcolas com base no risco climtico.
Atualmente, os cenrios agrcolas futuros so simulados com base em dados histricos de milhares de estaes climticas e dados de modelos de projeo climtica.
A Figura 2 ilustra como o MapReduce utilizado na simulao de cenrio agrcolas (NAKAI,
2013). Em um primeiro momento, dados climticos so divididos em splits de forma que
cada split contenha os dados de uma estao climatolgica. O Hadoop cria uma instncia de
mapeador para cada split. O mapeador implementa o modelo Bipzon para calcular o valor do
Isna correspondente a uma estao para todos os decndios do ano. Todos esses Isnas o agregados pelo redutor, que gera um arquivo contendo os Isnas de todas as estaes por decndio.
Posteriormente, esses arquivos sero espacializados para criao dos mapas dos cenrios agrcolas decendiais.
Ou seja, a computao em nuvem pode ser entendida como uma nova maneira de provisionar
recursos computacionais. Seu uso no gerenciamento de infraestrutura altera, diretamente, o
modo at ento utilizado para realizao de atividades de gerncia de tecnologia da informao.
O controle no uso de ativos computacionais, provisionamento de infraestrutura de hardware
(processamento e armazenamento), criao e liberao de servios, gerenciamento de mquinas
virtuais e capacidade de aumentar ou diminuir recursos computacionais, tudo sob demanda, so
algumas dessas atividades cuja gerncia torna-se extremamente verstil. Esta versatilidade significa otimizao no tempo do processo cientfico.
Alm disso, existem outras variveis envolvidas no uso de nuvens computacionais, principalmente quando utilizada no suporte ao desenvolvimento de pesquisa cientfica. Atividades de
pesquisa envolvem detalhes como propriedade intelectual, sigilo de informaes, armazenamento de dados sensveis, dentre outros relacionados. A maior parte da utilizao de nuvens computacionais dentro de um mercado de venda de servios, por terceiros, impactando diretamente
nesses detalhes. Neste contexto, torna-se mais compreensvel as duas vertentes de nuvens computacionais mais utilizadas: nuvens pblicas e nuvens privadas. Nuvens pblicas so ofertas de
servios sob demanda por empresas, capazes de hospedar infraestrutura computacional, dados e
at mesmo software. J as nuvens privadas so estruturas semelhantes, com os mesmos objetivos,
porm estabelecida dentro das prprias instituies que faro uso das mesmas. Alm da versatilidade, tem-se o controle total sobre os ativos computacionais, e, principalmente, sobre os dados
trabalhados, o que muito importante em processos cientficos.
Existem atualmente alguns pacotes de software que permitem a implementao de ambientes de
nuvem, tanto para armazenamento quanto para processamento. O OpenStack o mais difundido,
sendo um conjunto de softwares, de cdigo aberto, que permite a criao de uma nuvem para
processamento e armazenamento. Uma vez estabelecida, esta nuvem cria um ambiente virtual
para pesquisadores executarem seus processos que necessitem de recursos computacionais.
Neste contexto, as nuvens tm desempenhado o papel de aproximar a tecnologia da informao
299
300
3 Consideraes nais
No restam dvidas de que a tecnologia da informao tem impactado e impactar positivamente o processo cientfico. Sendo assim, o papel da infraestrutura computacional empregada
nos projetos de pesquisa torna-se relevante, o que exige uma ateno especial das organizaes
com relao infraestrutura disponibilizada. As discusses de aplicaes, mtodos e tcnicas
apresentados neste livro mostram a necessidade de uma infraestrutura computacional moderna e
adaptvel aos mais diversos cenrios.
4 Referncias
ASSAD, E. D. Simulation de lirrigation et du drainage pour les cultures pluviales de riz et de mas en sols de
bas-fonds braslia. Montpellier: IRAT, 1986. 10 p. IRAT. Memories et Travaux, 13.
BORTHAKUR. D. The Hadoop Distributed File System: architecture and design. [S. l.]: The Apache Software
Foundation, 2007. 14 p. Disponvel em: <http://hadoop.apache.org/common/docs/r0.18.0/hdfs_design.pdf>. Acesso
em: 18 out 2013.
DEAN, J.; GHEMAWAT S.; Mapreduce: simplified data processing on large clusters, Commununications of the
ACM, v. 51, n. 1, p. 107-113, 2008.
FOSTER, F. Simulation du bilan hydrique des cultures pluviales. prsentation et utilisation du logiciel BIP.
Montpellier: IRAT-CIRAD, 1984. 63 p.
HEY, T.; TANSLEY, S.; TOLLE, K. (Org.). O quarto paradigma: descobertas cientficas na era da eScience. So
Paulo: Oficina de textos, 2011. 263 p. il.
LAM, C. Hadoop in action. Stamford: Manning, 2011. 312 p. il.
NAKAI, A. M. Otimizando o Hadoop MapReduce para tarefas pequenas: um estudo envolvendo simulaes de
cenrios agrcolas. Campinas: Embrapa Informtica Agropecuria, 2013. 5 p. (Embrapa Informtica Agropecuria.
Comunicado tcnico, 115).
THE NATIONAL INSTITUTE OF STANDARDS AND TECHNOLOGY. NIST Cloud Computing Program. 2010.
Disponvel em: <http://www.nist.gov/itl/cloud/>. Acesso em: 1 out. 2014.
VAKSMANN, M. Le modle bipode: Logiciel. Bamako: IRAT, 1990.
301
Parte
VI
Captulo
305
Mercado de AgroTIC e
transferncia de tecnologia
16
1 Introduo
A chamada revoluo das tecnologias de informao e comunicao (TIC), ocorrida na dcada
90 e descrita por diversos autores sob vrias nomenclaturas (ATKINSON, 2004; PEREZ, 2009),
tm levado a uma macia disseminao destas tecnologias na maioria dos setores econmicos e
na vida privada dos indivduos, representando uma importante mudana de paradigma que afetou
muitos processos de cunho social e econmico.
Apesar do potencial de contribuio que as inovaes em TIC podem ter para aumentar a eficincia de processos, bem como a quantidade, a qualidade e a insero dos produtos agropecurios
no mercado, alguns aspectos vm limitando sua adoo no setor, como: limitaes de crdito
e investimento, falta de infraestrutura de telecomunicaes em reas com baixa densidade demogrfica, bem como de informao ou habilidades e competncias para uso, e baixo nvel de
escolaridade de pequenos agricultores e da agricultura familiar.
Mesmo com estas limitaes, as TIC esto cada vez mais presentes no setor agropecurio,
representadas pelo segmento de AgroTIC (descrito na prxima seo). Estas tecnologias tm
sido cada vez mais encontradas no campo, representadas por aplicaes baseadas em: software
embarcado, redes de sensores para monitoramento de diversos aspectos da produo, sistemas de
alerta de eventos climticos ou de manifestaes de doenas, sistemas de informao geogrfica
e GPS (Global Positioning Systems, em ingls), aplicaes de sensoriamento remoto, modelos de
simulao e sistemas de suporte deciso, sistemas web e aplicativos para dispositivos mveis,
entre outras.
Mesmo que a insero destas tecnologias no setor agropecurio tenha sido mais lenta, se comparada a outros segmentos da economia, como a indstria e o setor financeiro e bancrio, verifica-se
um movimento de desenvolvimento e adoo de aplicaes de TIC motivado pela necessidade
de aumentar a eficincia das atividades e processos desenvolvidos por organizaes do setor
agropecurio e pela - ainda lenta - disponibilizao de infraestrutura de redes e Internet no setor
rural do Brasil, mas que vem aumentando dia a dia.
Identificando tal necessidade e o potencial de aplicao destas tecnologias a diversas reas da
agropecuria, empresas atuando no setor de TIC passaram a interessar-se por este mercado, considerando seu potencial de expanso (ZAMBALDE et al., 2011). Os centros de pesquisa e uni-
306
e rede de sensores locais pra monitoramento da produo e controle de processos como mapeamento de solos, monitoramento de doenas e de variveis meteorolgicas e irrigao inteligente;
atividades de sensoriamento remoto (a fim de obter mais dados sobre a produo e aspectos
ambientais e climticos), minerao de dados e big data (a fim de organizar e armazenar estes
dados, visando lidar com a complexidade e gerao de informaes e conhecimentos para uso
do setor); desenvolvimento de modelos de inteligncia computacional e simulao para emisso
de alertas e suporte deciso agropecuria; uso de Sistemas de Informao Geogrfica e GPS
para apoio deciso agropecuria, bem como sistemas de informao e gesto do conhecimento
implementados em aplicaes web e mobile.
2.1 Categorias de TIC e seus mercados no Brasil
A Organizao de Cooperao e Desenvolvimento Econmicos (OCDE) (ORGANIZAO
DE COOPERAO E DESENVOLVIMENTO ECONMICOS, 2005) divide os produtos de
TIC em quatro grandes categorias: equipamentos de informtica (hardware); equipamentos de
telecomunicao; componentes eletrnicos e produtos de software. Nesta perspectiva, o mercado de TIC refere-se ao conjunto de valores pagos por empresas, residncias, rgos pblicos,
instituies educacionais, entre outras, aos fornecedores dessas quatro grandes categorias de
produtos de TIC.
A seguir so detalhados os segmentos do mercado de TIC por tipos de produto gerado:
- Equipamentos de informtica (hardware): servidores, computadores pessoais (PCs, no acrnimo em ingls), estaes de trabalho, equipamentos de comunicao de dados e perifricos,
tais como unidades centrais de processamento (CPUs, no acrnimo em ingls), dispositivos de
armazenagem, impressoras, bem como sistemas operacionais vendidos com o equipamento e
equipamentos de comunicao de dados.
- Software: programas de computador e suas customizaes; sistemas e aplicativos.
- Servios de TI: tanto os prestados por empresa contratada como por equipe interna divididos nas categorias: consultorias, capacitaes, servios de implementao, processamento e
suporte de informtica. Inclui tambm oramento interno para operao de estrutura de TI,
atividades internas de customizao de software e outras despesas internas envolvendo TI.
- Telecomunicaes: equipamentos para redes pblicas e privadas e prestao de servios,
como telefonia fixa e mvel e servios de televiso a cabo.
De acordo com estudo da Associao Brasileira das Empresas de Software (2014), o setor de
TIC, que inclui hardware, software e servios, representa 2,74 % sobre o Produto Interno Bruto
(PIB) brasileiro e 3% do total de investimentos em TI no mundo, movimentando em 2013 U$
61,6 bilhes de dlares.
Deste valor, U$ 10,7 bilhes vieram do mercado de software e U$ 14,4 bilhes do mercado de
servios, e a soma destes dois segmentos j superou 40% do mercado total de TI, indicando que
o Brasil integra o grupo de economia que privilegia o desenvolvimento de solues e sistemas.
Ainda segundo estudos da Associao Brasileira das Empresas de Software (2014), os segmentos
de software e de servios, conjuntamente, tiveram, em 2013, um crescimento de 10,1%, superando os demais setores da economia brasileira, tambm acima do crescimento do PIB que foi
em torno de 2,3%.
307
308
A Indstria Brasileira de Software e Servios (IBSS), caracterizada por Duarte (2012), formada
por empresas de natureza pblica ou privada divididas em:
- Indstria de software, que atua em desenvolvimento e licenciamento de software (sob encomenda, customizvel ou no).
- Indstria de servios de TI, responsvel por atividades de consultoria, suporte tcnico, manuteno e outros servios em TI. Esses servios dividem-se em tratamento de dados, provedores
de servios de aplicao e de hospedagem na internet, portais, provedores de contedo e outros
servios de informao na internet e reparao e manuteno de computadores e de equipamentos perifricos e de comunicao.
Esta definio do escopo da IBSS foi delineada pela Associao para Promoo da Excelncia
do Software Brasileiro (Softex) com base na Classificao Nacional de Atividades Econmicas
(CNAE) verso 2.0, desenvolvida sob a coordenao do Instituto Brasileiro de Geografia e
Estatstica (IBGE). Por meio dos critrios da CNAE, as empresas da IBSS foram classificadas
pela principal atividade, geradora da maior fonte de receita.
A pesquisa da Softex, descrita por Duarte (2012), classificou as empresas da IBSS pela atividade
correspondente a sua maior fonte de receitas, e os resultados so apresentados na Tabela 1.
Tabela 1. Nmero de empresas da IBSS com 20 ou mais pessoas ocupadas em 2009, classificadas por
sua fonte principal de receitas.
Atividade principal
Desenvolvimento e licenciamento de software customizvel
Reparao e manuteno de computadores e de equipamentos perifricos
Tratamento de dados, provedores de servios de aplicao e de hospedagem na Internet
Desenvolvimento de software sob encomenda
Suporte tcnico, manuteno e outros servios em TI
Consultoria em TI
Desenvolvimento e licenciamento de software no customizvel
Reparao e manuteno de equipamentos de comunicao
Portais, provedores de contedo e outros servios de informao na Internet
Total de empresas com mais de 20 pessoas ocupadas em 2009
Qtde
489
410
341
295
270
202
174
87
41
2.309
%
21,18
17,76
14,77
12,78
11,69
8,75
7,54
3,77
1,78
Estima-se, pela pesquisa da Softex, que existam, em 2012, 73 mil empresas atuando na IBSS.
Se o crescimento verificado no perodo apurado for mantido, em 2014 o nmero deve passar
para a ordem de 80 mil empresas. Em relao distribuio das empresas segundo o seu porte,
temos que 95% delas possuem at 19 pessoas ocupadas e menos de 1% contam com 100 ou mais
pessoas ocupadas.
A pesquisa indica que grande parte do contingente de empresas da IBSS possui at quatro funcionrios, sendo que muitas destas eram formadas por apenas um scio, sem necessidade de uma
estrutura empresarial formal para seu funcionamento. As anlises efetuadas na pesquisa indicam
que isto ocorre em virtude da predominncia de uma forma de contratao de mo de obra fora
do regime de trabalho da Consolidao das Leis Trabalhistas (CLT), por meio do que o mercado
considera como contratao de pessoa jurdica.
Segundo Duarte (2012), estima-se que existam 11 mil empresas da IBSS na faixa de 5 ou mais
pessoas ocupadas. Da mesma forma, a pesquisa da Associao Brasileira das Empresas de
Software (2014) identificou 11.232 empresas atuando no setor de software e servios em 2013,
sendo que quase a metade dedicadas distribuio e comercializao. Desse total, 24,1% atuam
no desenvolvimento e produo, 49,8% dedicam-se comercializao e distribuio e 26,1%
prestando servios. Analisando o porte das empresas dedicadas ao Desenvolvimento e Produo,
tem-se que 43,9% so microempresas, 49,6% so categorizadas como pequenas empresas, 5,2%
podem ser consideradas mdias empresas e apenas 1,3% so grandes empresas.
Verifica-se que 54% das empresas com mais de 20 pessoas ocupadas esto classificadas em trs
atividades principais (DUARTE, 2012): desenvolvimento e licenciamento de software customizvel; reparao e manuteno de computadores e de equipamentos perifricos e tratamento de
dados, provedores de servios de aplicao e de hospedagem na internet.
Em 2013, o faturamento do setor de software e servios associados atingiu o patamar de US$
25,9 bilhes, representando um crescimento de 10,1 % em relao a 2012. Deste total, o faturamento do segmento de software foi de US$ 10,9 bilhes, uma elevao de 13,5% em relao
ao ano anterior. Evidencia-se uma tendncia de crescimento do mercado brasileiro de software
e servios entre 2004 e 2014, em geral (ASSOCIAO BRASILEIRA DAS EMPRESAS DE
SOFTWARE, 2014).
No caso da Indstria de Software, destacam-se os segmentos de produo local e produo local
para exportao, somando 23,3% da receita. No que se refere aos servios de TI, destacam-se as
receitas de consultoria em sistemas e processos, os servios de outsourcing (terceirizao, em
portugus) e as atividades de suporte e manuteno de software, totalizando 67,6% da receita
de servios.
Apesar da tendncia de crescimento do mercado de TI e em especial da indstria de software
e servios, verifica-se que o setor agropecurio um tmido consumidor de software no Brasil,
como pode ser visto na Tabela 2, com valores do mercado comprador por setor econmico.
Os setores financeiro, de telecomunicaes e a indstria representam quase 71% do mercado
comprador de software no Brasil. A agroindstria responsvel por apenas 2,2 % das compras
deste mercado (ASSOCIAO BRASILEIRA DAS EMPRESAS DE SOFTWARE, 2014).
Tabela 2. Segmentao do mercado domstico comprador de software.
Setor econmico
comprador domstico
Finanas
Servios e Telecomunicaes
Indstria
Governo
Comrcio
Outros
leo e gs
Agroindstria
Total
Volume
(Milhes de US dlares)
3204
2970
2451
1061
973
703
530
265
12.157
Participao
percentual
26,40
24,40
20,20
8,70
8,00
5,80
4,30
2,20
309
310
311
312
No caso do Brasil, segundo Pellanda (2010), o tpico da comunicao mvel vem crescendo em
complexidade medida que penetra em diferentes culturas e classes sociais, com grande impacto
em diferentes camadas econmicas. Mesmo caracterizando-se por um pas com extremas diferenas sociais, o Brasil uma das naes a adotar, de forma mais intensa, novas tecnologias e a
cultura digital.
No campo da telefonia celular, dados de 2010 apontam a existncia de 140 milhes de aparelhos
ativos, sendo 81% deste nmero comercializado em planos pr-pagos, cujo modelo de pagamento responsvel pela grande popularizao da comunicao wireless no pas. A comunicao
mvel est transformando atividades econmicas e sociais ao permitir que vrias funes da
economia formal e informal sejam realizadas por celular. Atividades de profissionais freelancers, por exemplo, como manicures, encanadores, vendedores passam a ter escritrios mveis.
Adicionalmente, uma grande parcela da populao brasileira no possui ainda acesso a telefones
fixos devido inexistncia de infraestrutura em reas rurais ou de favelas, por exemplo. Neste
aspecto, a tecnologia sem fio transpe esse problema, caracterizando-se como um instrumento
de incluso digital e social. No setor agropecurio, os aparelhos celulares vem ajudando a levar informao e conhecimento para produtores de pases em desenvolvimento como a ndia e
alguns pases da frica. Os equipamentos mveis, mais baratos do que computadores de mesa,
so mais fceis de usar e podem ser transportados para outros locais, conforme a convenincia,
tornando-se mais acessveis para as populaes locais e podendo se tornar um importante instrumento para tomada de deciso. Os celulares possuem um grande potencial de atuar no sentido
de aumentar a qualidade de vida de populaes rurais ao prover acesso informao, servios e
produtos. Entre as informaes mais buscadas esto a previso e o estado do tempo.
2.3 Gerao de software para o setor agropecurio: atores e histrico
Em relao s empresas privadas atuando no segmento de software agropecurio, um estudo realizado entre 2008 e 2010 sobre o mercado brasileiro de software para o agronegcio identificou
180 empresas privadas atuando neste setor (MENDES et al., 2011).
Destas, 162 empresas concordaram em participar da pesquisa acima mencionada, que apontou
uma concentrao geogrfica (85,8%) no eixo Sul-Sudeste. Estas empresas esto distribudas em
65 municpios brasileiros. Utilizando as classes definidas pelo Sebrae para o porte das empresas, foi identificado que 95,8% das empresas so microempresas (57,4%) ou de pequeno porte
(38,3%). Das 162 empresas, 70% foram fundadas antes de 2000. A pesquisa indicou que elas
trabalham com o desenvolvimento de 337 softwares prprios e 65 desenvolvidos por outras empresas. Estes softwares enquadram-se nas categorias de administrao/gerenciamento, manejo
animal, cultivo vegetal e controle de processo e/ou de atividades rurais (MENDES et al., 2011).
No que tange atuao e papel dos Institutos Pblicos de Pesquisa e Universidades, de acordo
com Zambalde et al. (2011), os estudos para a aplicao de Tecnologia de Informao (TI) no
agronegcio brasileiro iniciaram-se com: a criao do Centro de Informtica (Ciagri) em 1984,
vinculado Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) da Universidade de So
Paulo (USP), em Piracicaba, SP; a criao da Embrapa Instrumentao Agropecuria em 1984,
em So Carlos, SP e a criao da Embrapa Informtica Agropecuria em 1985, em Campinas, SP.
Nota-se que o Ciagri, embora tenha atribuies relativas execuo de projetos e da poltica de
TI na Universidade, buscou capacitar sua equipe em desenvolvimento de aplicaes e uso de
microcomputadores na agricultura.
313
314
- O mecanismo pelo qual o ativo ser transferido, a fim de permitir a transferncia e us-lo de
forma adequada e eficaz.
- O objetivo da transferncia, em relao ao cedente, bem como ao cessionrio (que podem ter
diferentes agendas).
- Os canais, intrumentos e modos de transferncia, como o licenciamento, acordos de cooperao, joint ventures, start-ups etc.
O processo de transferncia de tecnologia refere-se, em geral, a um ato comercial formalizado
juridicamente atravs de dispositivos contratuais que visam:
- Transmitir bens imateriais (criaes, segredos de negcio ou software) protegidas por instrumentos de propriedade intelectual (ex. patentes e registro de software), e / ou;
- Transferir conhecimento tecnolgico (know-how).
Institutos de Pesquisa Pblicos (IPPs) podem gerar vrios tipos de resultados, a partir de atividades de pesquisas desenvolvidas conforme descrito por Drucker e Goldstein (2007): novos conhecimentos; desenvolvimento do capital humano; know-how, tecnologias e prottipos; ativos de
propriedade intelectual (patentes, marcas, programas de computador registrados); infraestrutura
de conhecimentos que estimula a formao de clusters ou economias de aglomerao; e contribuies para o desenvolvimento econmico, social e cultural regional. Entre estes resultados destacam-se as tecnologias e prottipos baseados em tecnologias de informao e comunicao (TIC).
Este captulo analisa o contexto de processos de transferncia de tecnologias geradas por IPPs
brasileiros, considerando o caso da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria (Embrapa),
com foco para a Embrapa Informtica Agropecuria e a gerao de AgroTIC.
A Embrapa uma empresa pblica de pesquisa agropecuria vinculada ao Governo Federal
do Brasil. A Embrapa tem a misso de viabilizar solues de pesquisa, desenvolvimento e
inovao para a sustentabilidade da agricultura, em benefcio da sociedade brasileira (2014).
A empresa, fundada em 1973, uma organizao em rede, formada por 47 centros de pesquisa
e de servios distribudos por todo o Pas. A Empresa tem tambm vrios laboratrios e escritrios comerciais no exterior, como Estados Unidos, Panam, Venezuela, e tambm na frica,
sia e Europa.
O foco deste trabalho a anlise dos processos de transferncia de AgroTIC promovidos pela
Embrapa Informtica Agropecuria, unidade de pesquisa temtica da Embrapa. Sua misso
viabilizar solues de pesquisa, desenvolvimento e inovao em tecnologia da informao para
a sustentabilidade da agricultura em benefcio da sociedade brasileira.
Manimala e Thomas (2012) identificaram seis elementos essenciais sobre o processo de transferncia de tecnologia internacional, que podem ser aplicadas a processos de transferncia em
geral:
A Unidade possui 110 empregados, sendo 65% deles vinculados a nove grupos de pesquisa,
atuando nas reas de: bioinformtica aplicada, biologia computacional, organizao da informao, software livre, geotecnologias, inteligncia computacional, novas tecnologias, modelagem
agroambiental e matemtica computacional.
- Um cedente, a entidade que possui um ativo de conhecimento e quer transferi-la para outra
entidade.
O estudo de caso enfoca vrios tipos de tecnologias e modelos de transferncia visando atender
a diferentes segmentos de clientes.
- Um cessionrio (receptor da tecnologia), a entidade que deseja esse ativo, a fim de empreg-lo
e convert-lo em benefcios.
315
que promovem a adoo e utilizao de seus resultados de pesquisa por vrios segmentos da
sociedade brasileira.
Dentre vrios pblicos de interesse da Embrapa, destacam-se: agentes da extenso rural; cooperativas e associaes de produtores; agricultores e pecuaristas de diversos portes, com destaque
para a agricultura familiar; empresas privadas atuando junto ao agronegcio, como fornecedores
de insumos e sementes, processadores de alimentos, entre outras; institutos de pesquisa, universidades e estudantes.
Buscando fortalecer o processo de transferncia de tecnologias, a Embrapa, corporativamente,
definiu trs grandes categorias de resultados de pesquisa a fim de organizar e gerir seu portflio
de solues tecnolgicas. Conforme descrito em Embrapa (2014a,b) as categorias so:
- Processos - so metodologias, processos agroindustriais e prticas agropecurias.
- Servios - so solues tecnolgicas no materiais, como anlises e levantamentos, consultorias, mapeamentos, zoneamentos, monitoramento, servios Web, sistemas de produo,
treinamentos e capacitaes.
- Produtos - so as solues tecnolgicas estruturadas fisicamente que a Embrapa oferece ao
mercado ou sociedade em geral. As categorias de produtos so: agente de controle biolgico,
agrotxico, alimento, animal, bebida, bioproduto/formulaes/congneres, corante, cultivar,
embrio, estirpe/cepa fertilizante/corretivo, implemento, inoculante, linhagem, mquina/equipamento, medicamento, microrganismo, multimdia, produto biotecnolgico, rao, smen,
software, vacina.
No que se refere s AgroTIC geradas pela Embrapa, temos como produtos os equipamentos eletrnicos, instrumentos e os softwares e, como servios, os servios web. Estes constam de websites que disponibilizam, na internet, resultados de pesquisas na forma de relatrios, publicaes,
informaes e dados para uso gratuito de vrios pblicos de interesse da Empresa.
A partir do movimento de acelerao da adoo de TIC no meio rural nos anos 2000, a Embrapa
vem intensificando a utilizao deste tipo de tecnologia como instrumento para transferncia
de tecnologia e de conhecimento, seja pela divulgao de resultados de pesquisa, documentos
e publicaes via internet, seja pela disponibilizao de servios web e pelo licenciamento de
software para apoio a diversas atividades agropecurias.
Considera-se que, com a grande disseminao de smartphones entre a populao em geral e tambm entre os produtores agrcolas, os aplicativos mveis tem um grande potencial de consolidao como instrumentos efetivos de apoio gesto agrcola, oferecendo funcionalidades simples
para ajudar o produtor a gerenciar suas atividades. Ao oferecer informaes meteorolgicas,
calculadores para suplementao de dieta bovina ou regulagem de equipamentos via reconhecimento de imagens e padres, entende-se que este tipo de instrumento pode apoiar a deciso
do produtor de uma forma simples, gil e mvel (sem a necessidade de acessar um computador
desktop, por exemplo) em qualquer local da propriedade, algumas vezes sem necessidade de
conexo com a Internet.
Este trabalho apresenta, a seguir, alguns casos de transferncia e disponibilizao de produtos
de software e servios web gerados pela Embrapa Informtica Agropecuria e seus parceiros.
Uma relao completa das tecnologias disponibilizadas pela Embrapa Informtica Agropecuria
pode ser encontrada no Anexo I desta obra.
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317
das por ponto (localizao no mapa) e realizar medies (comprimento e rea no mapa). Por meio
desta funcionalidade, o usurio tem acesso a todos os mapas temticos gerados pelo Agritempo
diariamente em formato geotiff, que permite que sejam usados localmente em outros softwares
GIS. Alm disso, o sistema disponibiliza shapes com contornos regionais, estaduais, municipais,
por biomas, dentre outros. O WebGIS tambm permite a impresso de um relatrio com o mapa
gerado aps as definies de diferentes camadas e alteraes realizadas pelos usurios.
O sistema Agritempo consiste em uma importante inovao de produto e de processo no campo
da agrometeorologia. A principal inovao de processo oferecida por esta tecnologia refere-se
automao de tarefas para a gerao das informaes agrometeorolgicas, permitida pelo uso de
TIC, tornando o sistema totalmente automtico e independente de ao humana. Todo o processo de recebimento de dados, sua incorporao na base de dados, a construo de mapas, ocorre
automaticamente, utilizando-se de vrias ferramentas construdas pela equipe e por softwares
livres especficos, sendo realizado pelo sistema sem a interveno humana. Isto proporciona
maior rapidez e preciso e oferece mais qualidade prpria base de dados uma vez que o sistema
efetua automaticamente alguns testes nas variveis coletadas.
A gratuidade configura-se como uma inovao de mercado tendo em vista que muitas instituies
disponibilizam dados e informaes agrometeorolgicas mediante pagamento.
A customizao dos produtos meteorolgicos para agricultura outra novidade, tendo em vista
que antes de 2002 havia poucos websites que ofereciam produtos especficos para este pblico
(como mapas de previso e monitoramento do tempo como informaes relativas a risco de geadas por cultura, deficincia hdrica, necessidade de irrigao, condies de colheita, entre outras),
e atualmente poucos o fazem gratuitamente.
Uma ao que vem sendo associada ao processo de disseminao do uso de sistemas web na
Embrapa Informtica Agropecuria a capacitao de multiplicadores, entendidos como indivduos formadores de opinio, que tem potencial para repassar os conhecimentos aprendidos sobre
o uso da ferramenta.
No caso do sistema Agritempo 2.0 esto previstas atividades de capacitao de multiplicadores
nas cinco regies do Pas com a promoo de programas de treinamento sobre a tecnologia, alm
de aes comunicao mercadolgica com a divulgao em feiras e disponibilizao de vdeos
na internet.
3.1.1.2 Ageitec
A Agncia Embrapa de Informao Tecnolgica (Ageitec) um repositrio de informaes
tecnolgicas validadas da Embrapa e de seus parceiros, organizadas de forma hierrquica numa
estrutura ramificada denominada rvore do conhecimento (EMBRAPA, 2014b).
As rvores do conhecimento contm informaes validadas sobre todas as etapas da cadeia produtiva dos produtos (cultivo e criao) e sobre os temas diversos. Nos primeiros nveis da hierarquia esto os conhecimentos mais genricos e, nos nveis mais profundos, os mais especficos.
A Ageitec apresenta diferentes tipos de rvore do conhecimento, dependendo da natureza do
contedo. As categorias dividem-se em: cadeias produtivas agropecurias, cadeias produtivas
florestais, de temas agroecolgicos e de temas bsicos.
No caso das cadeias produtivas agropecurias, cada rvore do conhecimento estrutura-se em trs
eixos: pr-produo, produo e ps-produo.
O usurio pode acessar a informao de trs maneiras: em rvore hiperblica (apresentao grfica da rvore do conhecimento), navegao em hipertexto ou pela utilizao de servio de busca
(SILVA; OLIVEIRA, 2012).
A Figura 2 apresenta a interface de
navegao em rvore hiperblica,
representando visualmente a rvore
do conhecimento.
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320
auxiliar o produtor em diversas etapas do plantio da cultura, atuando desde a escolha da semente
at a colheita.
O WebAgritec constitudo por um sistema web de planejamento, previso e monitoramento da
produo agrcola que rene informaes sobre as seguintes culturas: arroz, feijo, milho, soja
e trigo.
Ao utilizar o sistema, o usurio do WebAgritec poder obter informaes sobre:
- A poca mais adequada para efetuar o plantio.
- A cultivar mais apropriada para seus propsitos.
- A indicao de calagem e adubao para cada cultura.
- As previses e tendncias das condies climticas antes, durante e depois da safra.
- As doenas e deficincias nutricionais que porventura possam aparecer no decorrer da safra.
- O monitoramento da safra com estimativa de produtividade.
- O acompanhamento da safra via agenda da propriedade.
Em funo do tipo de contedo e da linguagem utilizada, para acessar a plataforma necessrio
possuir formao tcnica ou experincia prtica no setor agropecurio.
Assim, dentre os perfis de pblicos pretendidos para o sistema tm-se: engenheiros agrnomos
e tcnicos agropecurios que trabalham com assistncia tcnica ou extenso rural, seja como
consultores e autnomos; empresas de extenso rural pblicas e privadas; tcnicos vinculados
a associaes de produtores, cooperativas ou sindicatos rurais; empresas privadas, empresas de
crdito ou seguro agrcola e produtores rurais.
A plataforma computacional do WebAgritec organiza contedos e informaes sobre vrias reas
do conhecimento com base nos resultados de projetos de Pesquisa e Desenvolvimento (P&D)
desenvolvidos pela Embrapa e a partir de demandas de vrios setores da agropecuria, conforme
apresentado na Figura 3.
O sistema possui oito mdulos que orientam o usurio desde o planejamento da cultura at a
colheita. So eles: Cultivares, Zoneamento, Adubao, Previso, Monitoramento, Diagnstico e
Multimdia e a funcionalidade Agenda.
O modelo de transferncia do sistema WebAgritec est sendo definido. Atualmente est em fase
de negociao junto a atores do setor privado.
3.1.2 Software executvel para desktop
3.1.2.1 Invernada
O Invernada um sistema de apoio ao planejamento de produo de bovinos de corte
(INVERNADA, 2014). Foi desenvolvido pela Embrapa Informtica Agropecuria em parceria
com empresas privadas do agronegcio.
A tecnologia capaz de prever, por meio de modelos estatsticos, o balano hdrico do solo,
crescimento e composio fracional da pastagem, pastejo, seletivo, ingesto de matria seca,
alm de configurar dietas a partir da biblioteca de alimentos do sistema Invernada para melhorar
o desempenho do animal e otimizar a formulao de dietas, seja por meio de custo mnimo da
matria seca, por lucro mximo e por mnimo custo dirio de alimentao.
O sistema incorpora uma srie de bibliotecas de dados, modelos matemticos de processos biolgicos, otimizadores numricos lineares e no-lineares, e ferramentas auxiliares que permitem
anlises do sistema de produo. A ferramenta permite a realizao de anlises adicionais, permitindo a exportao de dados para planilhas eletrnicas no formato Excel e csv (valores separados
por vrgulas) que podem ser importados por outras planilhas eletrnicas, pacotes estatsticos e
outros softwares.
As anlises efetuadas pelo sistema so: simulao e prognstico de desempenho; comparao do
efeito de mudanas gerenciais e adoo de tecnologias e otimizao.
As funcionalidades de simulao e prognstico de desempenho incorporam o conhecimento
cientfico em modelos estatsticos e modelos de processos dinmicos (dinmica de sistemas)
que permitem representar o resultado dos processos envolvidos na produo animal, gerando
tecnologias de apoio tomada de decises. Os modelos utilizados so: balano hdrico do
solo, crescimento e composio fracional da pastagem (folha, haste e material morto), pastejo
seletivo, ingesto de matria seca (considerando efeito substitutivo de pastagem-suplemento),
crescimento e composio corporal dos animais. Vrios prognsticos podem ser realizados,
como: crescimento dos animais, crescimento da pastagem, estoques de forragem, fluxo de caixa
e retorno econmico.
A funcionalidade de comparao do efeito de mudanas gerenciais e adoo de tecnologias estima, por meio de modelos matemticos, o efeito de mudanas realizadas em diversas variveis
do controle gerencial sobre o desempenho bioeconmico do sistema de produo, podendo considerar inclusive efeitos do clima.
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A funo otimizao incorpora diversos otimizadores para apoio tomada de deciso em sistemas de produo de bovinos de corte, entre eles: formulao de dietas de custo mnimo da
matria seca; formulao de dietas de lucro mximo (mnimo custo de produo) e formulao
de dietas de mnimo custo dirio de alimentao.
Considerando que as espcies estudadas pela Embrapa tm sido alvo de seleo artificial para alguns poucos fentipos de interesse visando ganho de produtividade, pode-se supor que os genes
sob evidncia de seleo positiva nessas espcies sero, possivelmente, associados a fentipos
de produtividade.
O programa consiste em um software executvel que pode ser utilizado em computadores pessoais como desktops e notebooks. disponibilizado gratuitamente para download mediante um
cadastro mnimo de dados (nome, e-mail, profisso, estado, cidade).
Nesse contexto, a busca por genes sob evidncia de seleo positiva em genomas de espcies de
interesse da Embrapa constitui uma importante ferramenta para indicar possveis genes associados a um maior ganho de produo nessas espcies. No entanto, muitos passos para a deteco de
seleo positiva so computacionalmente custosos. Uma estratgia para contornar este problema
a implementao de programas paralelizados, uma vez que a deteco de seleo positiva em
cada grupo de homlogos independe das buscas realizadas em outros grupos.
323
O software Gotas foi desenvolvido neste contexto, objetivando o auxlio aos agricultores para
que estes possam calibrar devidamente os bicos de pulverizao e obter parmetros adequados
de disposio de agrotxicos nos alvos desejados.
Desenvolvido pela Embrapa Meio Ambiente (Jaguarina, SP) e pela Embrapa Informtica
Agropecuria (Campinas, SP), o Gotas de um sistema disponibilizado gratuitamente e busca
atingir o produtor de forma mais direta, contribuindo para uma atividade agrcola mais sustentvel.
Entre as funcionalidades incorporadas nesta verso, destacam-se uma ferramenta para recortar
determinada rea da amostra selecionada; possibilidade de salvar o experimento em formato
compatvel para uso dos resultados em planilha de clculo; recursos para salvar e recuperar o
experimento inteiro, com todas as imagens das amostras analisadas; e uma ferramenta para eliminar as amostras indesejadas.
A calibrao de deposio de gotas de pulverizao importante tanto para a aplicao de produtos qumicos como para produtos biolgicos.
A verso mobile do sistema foi desenvolvida para o sistema operacional Android, sistema livre
utilizado pela plataforma Google Play (GOOGLE PLAY, 2014).
3.1.5 Sistemas de apoio gesto
da pesquisa agropecuria
3.1.5.1 Sistema Ainfo
O sistema Ainfo, desenvolvido em
1991 pela Embrapa Informtica
Agropecuria, possui funcionalidades para captura, gerenciamento e
recuperao da informao, disponibilizando toda produo cientfica
e o acervo documental tcnico-cientfico adquirido pela Embrapa.
O Menu principal do sistema Ainfo
est apresentado na Figura 5.
A verso web do Ainfo foi lanada em 2009 e consolidou todas as bases locais das bibliotecas
em uma plataforma nica e integrada, que possui mais de 97 mil publicaes digitais de 44
Unidades. A tecnologia, atualmente na verso 6, vem sendo utilizada por diversas instituies
brasileiras como a Empresa de Pesquisa Agropecuria e Extenso Rural de Santa Catarina
(Epagri), Empresa de Pesquisa Agropecuria de Minas Gerais (Epamig), Empresa Baiana de
Desenvolvimento Agrcola (EBDA), dentre outras.
Em mbito internacional, o Instituto Nacional de Investigacin Agropecuaria (Inia), do Uruguai,
firmou um acordo de cooperao tcnica internacional com a Embrapa Informtica Agropecuria
para implementar o software e disponibilizar o servio de gesto do acervo documental internamente ao Inia.
Este acordo tem por objetivo fortalecer o intercmbio tcnico-cientfico entre os dois pases por
meio do intercmbio de tecnologia, conhecimentos e dados. Alm da implantao do Ainfo,
o acordo prev o apoio na integrao da base de dados do Inia com outros sistemas, alm de
capacitao tcnica na implementao e uso do sistema Ainfo. Alm disso, o Inia Uruguai disponibilizar o acesso aos metadados de publicaes do seu acervo documental relativo pesquisa
agropecuria do Uruguai, estimado em 40 mil itens, para a plataforma computacional do Sistema
Aberto e Integrado de Informao em Agricultura - Sabiia, mantido pela Embrapa.
O modelo de transferncia da tecnologia Ainfo ao Inia Uruguai foi como software proprietrio,
disponibilizado mediante um contrato de licena de uso. O contrato previu o fornecimento do
cdigo-fonte aberto ao Inia, mediante clusula de confidencialidade, a fim de possibilitar aes
de customizao e adaptao da tecnologia.
324
4 Consideraes nais
Este trabalho apresenta um panorama do mercado brasileiro de AgroTIC, com nfase no segmento de software agropecurio. Diversos atores participam como ofertantes deste mercado, como
empresas privadas, Institutos Pblicos de Pesquisa (IPPs) e universidades.
O captulo apresenta um estudo de caso da Embrapa Informtica Agropecuria enquanto geradora de produtos de software destinados ao mercado agropecurio. Foram apresentados elementos
conceituais associados aos processos de transferncia de tecnologia em IPPs bem como a categorizao de resultados de pesquisa empregada pela Embrapa e a descrio de algumas tecnologias
e modelos de disponibilizao.
No que se refere aos modelos de transferncia de produtos de software gerados por IPPs, ressalta-se a necessidade de buscar maior variedade de alternativas de disponibilizao e modelos de
licenciamento, considerando as necessidades de diferentes pblicos-alvo, de forma a propiciar
sua utilizao por agentes do mercado, desde empresas privadas at setores governamentais,
como ministrios e empresas de extenso rural.
Quanto s tendncias tecnolgicas das AgroTIC, destaca-se o potencial de crescimento dos
aplicativos mveis como instrumento de disseminao de conhecimentos e tecnologias agropecurias, considerando a grande disseminao dos smartphones e sua ampla utilizao pelos
indivduos, seja em mbito pessoal ou profissional.
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326
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327
328
a verso mais atual da sute de programas e da base de dados STING, um conjunto de softwares
de base web para visualizao e anlise abrangente de estruturas macromoleculares.
Site com informaes sobre os sistemas produtivos de diversas culturas (arroz, feijo, milho,
cana etc) e sobre temas relacionados agropecuria nacional (meio ambiente, agronegcio do
leite, sunos etc).
Agritempo
www.agritempo.gov.br
Sistema de Monitoramento Agrometeorolgico. Site de informaes agrometeorolgicas com
cobertura para todo o territrio brasileiro, atualizado diariamente.
AgroLivre
https://repositorio.agrolivre.gov.br/
Repositrio de softwares com temticas diversas, cujo objetivo aumentar a oferta de software
para o domnio agropecurio por meio do incentivo e apoio a projetos de software no setor.
Ainfo verso 6
www.ainfo.cnptia.embrapa.br
O Ainfo um sistema informatizado para gesto de acervos impressos e digitais de bibliotecas,
incluindo todas as fases do fluxo de tratamento da informao.
Alice
www.embrapa.br/alice
O Repositrio Acesso Livre Informao Cientfica da Embrapa (Alice) um servio coordenado pela Embrapa Informao Tecnolgica que rene, organiza, armazena, preserva e dissemina,
na ntegra, informaes cientficas produzidas por pesquisadores da Embrapa.
rvore Hiperblica
https://repositorio.agrolivre.gov.br/
Envolve ferramentas computacionais para criao, edio e navegao na web de rvores hiperblicas, conhecidas como hipereditor e hipernavegador. Refere-se a uma ferramenta de estruturao e visualizao de informaes organizadas de forma hierrquica.
BDPA
www.embrapa.br/bdpa
A Base de Dados da Pesquisa Agropecuria (BDPA) um portal de busca para acesso ao acervo
das bibliotecas de todos os centros de pesquisa da Embrapa e os documentos digitais gerados
pela Empresa.
Diagnose Virtual
www.diagnose2.cnptia.embrapa.br/diagnose
Sistema de suporte deciso que fornece diagnstico de doenas para as culturas de feijo, trigo,
arroz, milho e soja.
e-Inventrio
Sistema composto por um software e dispositivos eletrnicos (RFID e antena), conectados a um
netbook, que permite o controle eficiente do patrimnio em ambientes internos, diminuindo a
interferncia humana para verificao e localizao de bens.
Gotas
https://repositorio.agrolivre.gov.br/
Sistema de Anlise de Deposio de Agrotxicos e um programa de computador que auxilia a
calibrar a deposio de pulverizaes dos produtos fitossanitrios. O sistema possibilita a anlise
da distribuio de gotas no processo de pulverizao e apresenta uma srie de parmetros para
que o agricultor decida sobre a melhor combinao de bicos de pulverizao, consumo de calda,
velocidade de aplicao, entre outros fatores, que permitiro aplicar adequadamente a deposio
no alvo desejado.
Infoteca-e
www.infoteca.cnptia.embrapa.br
Site que disponibiliza informaes na ntegra de publicaes, programas de TV e de rdio produzidos pela Embrapa.
Invernada
www.invernada.cnptia.embrapa.br
Sistema que possibilita simular e comparar opes de manejo em pecuria de corte por meio de
cenrios, como: pastejo exclusivo, pastejo com suplementao ou confinamento. Alm disso,
formula dietas com vrias opes de otimizao.
Planeja
www.planeja.cnptia.embrapa.br
A partir do levantamento de informaes agrcolas e socioeconmicas, por meio do preenchimento de formulrio de campo prprio para cada Unidade de Produo Agrcola (UPA) do municpio,
possibilita a anlise integrada dos dados, subsidiando a tomada de deciso de gestores municipais.
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Potion
https://code.google.com/p/potion-darwin
Software para a busca de grupos de genes homlogos sob evidncia de seleo positiva. O software est disponvel na plataforma Google Code: http://code.google.com
Navpro
O Navpro sistema para processamento e gerao automtica de produtos de imagens geradas
por satlites da srie NOAA (National Oceanic and Atmosferic Administration). Estes produtos
so divulgados no site do sistema Agritempo por Estado da Federao.
Sabiia
www.embrapa.br/sabiia
O Sistema Aberto e Integrado de Informao em Agricultura (Sabiia) um servio, coordenado
pela Embrapa Informao Tecnolgica, que possibilita o acesso a textos completos de publicaes cientficas sobre agropecuria, disponveis em diversas instituies nacionais e internacionais.
Sisla
www.sisla.imasul.ms.gov.br
O Sistema Interativo de Suporte ao Licenciamento Ambiental (Sisla) um sistema de informao
geogrfica para a web com emisso de relatrio do entorno de um determinado empreendimento
sobre as variveis limitantes, como: declividade, reas protegidas e reas indgenas.
WebAgritec
Sistema web que oferece servios com aplicao regionalizada, como diagnsticos e alertas de
pragas e doenas, dados sobre clima, condies de solo e estimativas de produo. As informaes podem ser geradas em forma de relatrios, mapas, grficos e tabelas, em linguagem acessvel, apoiando a tomada de decises por seus usurios. A tecnologia ainda no est disponvel
para acesso externo.
Captulo
331
17
1 Introduo
O uso das Tecnologias da Informao e Comunicao (TIC) uma realidade em todos os setores
e ramos de atividades, tanto em nvel operacional como estratgico. Na agricultura, como no
poderia deixar de ser, as TIC vm ganhando territrio cada vez maior. Com a popularizao da
internet, o uso das TIC foi potencializado em diversos campos. O entendimento desta evoluo
e suas tendncias possibilitam a identificao das oportunidades e dos desafios que esto por vir
na Era Digital. O setor agrcola tem buscado formas de assimilar a constante inovao destas
tecnologias e garantir o aproveitamento das contribuies oferecidas por elas.
Na rea tecnolgica, as TIC, inicialmente, aplicadas execuo de procedimentos rotineiros,
veem-se diante do crescente desafio de proporcionar, aos tomadores de deciso, a apresentao
de informaes confiveis e atualizadas alm de contribuir para automatizao dos processos
envolvidos no desenvolvimento agrcola. Por meio do trabalho colaborativo, profissionais distantes geograficamente trabalham em equipe. As TIC favorecem a tendncia de que as fronteiras
se tornem cada vez menos demarcadas, em relao ao seu meio ambiente, e as equipes trabalhem
em parceria gerando novos conhecimentos e competncias. Seu grande potencial reside na sua
transversalidade, podendo agregar valor e benefcio para as diversas reas de negcios, mercado,
agricultura e meio ambiente.
Algumas das inovaes mais recentes prometem alavancar as pesquisas na agricultura. A convergncia das reas de Nanocincia, Biotecnologia, Tecnologia da Informao e Cincia Cognitiva
(NBIC), ir propiciar um grande salto qualitativo na forma como o mundo da agricultura pode
ser transformado. A evoluo da abordagem de sistemas, matemtica e computao em conjunto
com o trabalho em reas NBIC permitir, pela primeira vez, compreender o mundo natural e a
cognio em termos de sistemas complexos e hierrquicos. Aplicado tanto para problemas especficos de pesquisa quanto para a organizao geral da empresa de pesquisa, essa abordagem de
sistemas complexos fornece conscincia holstica e oportunidades de integrao, a fim de obter
o mximo de sinergia ao longo das principais direes do progresso (KIM et al., 2012).
As prximas sees apresentam alguns campos que vm recebendo a ateno da comunidade
de pesquisa e prometem promover uma nova revoluo no campo agrcola e na rea de TIC. A
seo 2 apresenta uma reviso dos trabalhos e conceitos que vm sendo desenvolvidos na rea da
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tao). Esse mapa composto pelos recursos ou medidas obtidas a partir do ambiente (deteco)
e as informaes sobre a localizao da unidade de servio para orientao e ao. A deteco
a aquisio de informaes diretamente do ambiente agrcola. Esta informao usada na fase
de mapeamento do meio ambiente para orientar o processo de navegao (orientao) ou para
executar uma determinada ao (por exemplo, a deteco de plantas daninhas ou aplicao de
agrotxicos). Finalmente, a fase de ao representa a forma como a unidade de servio interage
com o campo agrcola. Tal ao pode ser realizada na base de um processo de orientao (por
exemplo, a colheita ou a semeadura), de deteco (por exemplo, remoo de ervas daninhas), ou
de mapeamento (por exemplo, aplicao de agroqumicos com base nas informaes anteriormente adquiridas).
Para incorporar a capacidade de agricultura de preciso autnoma, alguns problemas ainda
devem ser contornados. As ferramentas desenvolvidas no campo robtico podem ser usadas
como solues propostas para estes problemas e para melhorar o processo agrcola. No entanto,
o objetivo da robtica agrcola no apenas a aplicao de tecnologias robticas no campo da
agricultura, mas tambm usar os desafios agrcolas para desenvolver novas tcnicas e sistemas.
Algumas questes ainda permanecem em aberto nesta rea e requerem um maior investimento
em pesquisa. Uma delas se refere ao servio de interao das mquinas com trabalhadores do
campo, ou seja, como as mquinas iro atuar no campo, cumprindo sua tarefa e, ao mesmo tempo, detectando os trabalhadores presentes no campo, permitindo trabalhar cooperativamente com
eles e mantendo-os em segurana. Outra questo se refere s manobras das mquinas autnomas
nos campos. Neste caso, as habilidades de navegao, localizao, orientao e manobras de giro
exigem estratgias especficas que esto diretamente relacionadas com a disposio do ambiente
e os recursos do veculo. Neste sentido, deve haver uma adaptao mquina-campo. Por fim, um
outro ponto em aberto refere-se ao planejamento das tarefas, ou seja, a definio da sequncia de
execuo das tarefas. Esta questo est intimamente relacionada com a versatilidade da unidade
de servio e consiste em ter uma arquitetura hierrquica com base nas prioridades e gerenciamento de tarefas. O sistema deve ser capaz de gerir os recursos disponveis a fim de otimizar as
tarefas agrcolas que devem ser executadas. (AUAT CHEEIN; CARELLI, 2013).
Para a soluo destas questes, algumas reas de pesquisa a serem aprofundadas se referem a
estudos de interao homem-rob, o trabalho cooperativo e colaborativo, sistemas de controle,
viso computacional, inteligncia artificial, sistema de posicionamento global, sensoriamento
remoto, entre outras. Alm disso, existem os problemas relacionados com as caractersticas dos
campos agrcolas pois, por exemplo, as habilidades necessrias para as mquinas autnomas
executarem tarefas de colheita em uma plantao de caf so diferentes daquelas referentes
colheita de soja. Por outro lado, existe uma preocupao relacionada ao uso excessivo de trnsito
de maquinrio nos campos agrcolas podendo provocar a compactao do solo, que impede a
obteno de oxignio e de gua que flui atravs dele (HARRIS, 2013).
Nesta linha de veculos autnomos, a empresa John Deere desenvolveu um prottipo de um trator
automtico que usa sinais de satlite para seguir rotas pr-programadas sem condutor humano.
A empresa Kinze Manufacturing tambm utiliza uma abordagem similar para a sua soluo de
mquina autnoma. A conduo autnoma no campo considerada mais fcil do que na estrada,
devido o ambiente ser mais previsvel, no existindo pedestres em trnsito e nem outros veculos
circulando na mesma via (BAUCKHAGE et al., 2012).
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A robtica na agricultura de preciso foca mais nos campos, no cuidado e na manipulao da rea
das plantas e de seu entorno. Entretanto, existem pesquisas centradas nas razes das plantas que, embora invisveis, carregam grande inteligncia, coletando informaes sobre as propriedades fsicas
e composio qumica do solo, utilizando esta informao para decidir em que direo iro continuar crescendo. Aliado a isto, podem perfurar o solo empregando apenas uma frao da energia
consumida pelas brocas artificiais alm de serem consideradas sistemas altamente eficientes para
explorao subterrnea. Olhando para este aspecto, j existem pesquisas para desenvolver dispositivos robticos que se comportem como as razes das plantas sendo seu objetivo construir robs
que possam monitorar a poluio do solo, deteco de minerais e, principalmente, a deteco de
gua possibilitando uma melhor gesto dos reservatrios subterrneos (ROBOT PLANTS..., 2013).
linear. O rob curva-se esquerda se sente a presena de uma planta a sua frente e, em seguida,
dirige-se para a direita, ao perceber uma outra planta. Como resultado, o rob acha o seu caminho
entre as diversas linhas de plantio. Para fazer curvas no final de uma linha, sensores detectam
quando ela acaba e sinalizam para que o rob vire. Quando estes robs adquirirem uma grande
capacidade de movimentao nos campos, eles podem ser programados e equipados para exercer
funes como a deteco de doenas, de ervas daninhas, de insetos, de amostragem do solo ou
mesmo aplicao de pesticidas ou fertilizantes, de forma precisa.
Pelo que foi apresentado pode-se verificar que a rea de agricultura de preciso tem dado bastante
ateno na robtica agrcola no sentido de desenvolver mquinas e equipamentos agrcolas, com
eletrnica embarcada e dispositivos robticos, que permitam sua atuao da forma mais autnoma possvel. Uma outra linha de pesquisa reside na construo de robs de aspecto humanoide
que possam desempenhar funes associadas aos seres humanos.
A viabilidade prtica destes robs, no auxlio das atividades agrcolas, depender da combinao
de trs fatores: robs agrcolas, sistemas inteligentes e rede de sensores sem fio, espalhados no
campo para monitorar a plantao e avaliar a sua vitalidade. Estes sensores devem ser capazes
de coletar informaes sobre o ambiente e a planta, a fim de tomar algum tipo de deciso em
funo dos parmetros de entrada (ALISSON, 2014). Desta forma, vislumbra-se a possibilidade de uso de robs em quase todas as fases de cultura, praticamente sem interveno humana.
Implementaes de pequena escala j esto no horizonte. Este tipo de aplicao estar vivel
cientificamente em 2023 e financeiramente factvel por volta de 2026 (ZAPPA, 2014).
Robs autnomos que podem atuar em locais perigosos para os humanos, pilotar veculos ou
assumir o controle da direo em situaes de emergncia j so realidade. Universidades brasileiras j desenvolvem robs que comandam dispositivos com o pensamento, especialmente
para uso na medicina. Por meio de sensores de um eletroencefalograma aparelho que mede a
atividade cerebral possvel captar os pensamentos dos usurios que so traduzidos por um
software, o qual interpreta os dados obtidos e os transformam em comandos executados por
robs conectados internet. Especialistas entendem que o aprendizado das mquinas apresenta
caractersticas similares ao dos humanos. Entretanto, construir robs to inteligentes quanto
pessoas um dos principais desafios que motivam profissionais da robtica. Trata-se de algo
extremamente complexo e envolve conhecimentos cientficos sobre os fundamentos da cognio
humana (RODRIGUES, 2014).
Enquanto as experincias se concentram em atribuir capacidades humanas aos robs, permitindo que sejam capazes de executar funes associadas a pessoas, seja no campo ou em outras
reas de atuao, por outro lado existem estudos e experimentos que incorporam elementos
robticos nos seres humanos. So os chamados cyborgs ou trans-humanos. O termo cyborg
literalmente significa organismo ciberntico, ou seja, um ser composto tanto da parte orgnica
quanto da parte mecnica. Tradicionalmente, os cyborgs so tratados nas histrias de fico
cientfica. Atualmente, por meio da medicina moderna e, em particular, da prottica, o termo
tem sido utilizado para se referir a alguns seres humanos que aps procedimentos mdicos
complexos se submeteram a experimentos de implantes robticos em funo de necessidades
mdicas. Entretanto, alguns usam esta tecnologia para estender sua capacidade de percepo
(LANXON, 2014; SOLON, 2014).
Implantes cibernticos cerebrais, junto com Inteligncia Artificial (IA) e Realidade Aumentada
(RA) podem ser integrados no cotidiano das pessoas e alterar seu comportamento pessoal. Da
mesma forma que a pesquisa do Google e Wikipedia mudaram a forma de buscar e de se lembrar
da informao, a IA e a RA poderiam alterar a forma de pensar e interagir. Seguindo o modelo
do Google Glass, a IA de um implante neural pode ajudar a analisar rostos, em uma festa, por
exemplo, e determinar aqueles socialmente mais relevantes para o usurio. Usando RA projetada
em um implante tico, a IA destaca cada pessoa em sua linha de viso e, quando o usurio se
aproximar, pode fornecer um dossi de seus principais interesses e tipo de personalidade. Pode-se
aplicar este nvel de acesso informao a qualquer atividade, quer se trate de grelhar um bife
ou a realizao de um transplante de corao. A IA com a sobreposio da RA podem melhorar
radicalmente a habilidade e capacidade humana em exercer suas atividades (MUNKITTRICK,
2011). Este tipo de tecnologia permitir que seres humanos recuperem capacidades perdidas,
por meio de acidentes, ou habilidades inexistentes, em funo de desordens ocorridas em sua
concepo, tornando-os aptos a desenvolver funes em vrias reas de aplicao.
A Universidade de Illinois, por exemplo, desenvolveu uma gerao de vrios robs autnomos que se movem nas linhas de plantio com o objetivo, em longo prazo, de assumir algumas
das funes atualmente desempenhadas por equipamentos de grande porte. A ideia colocar
alguns robs no campo, que se comunicam uns com os outros, para manejo e coleta de dados
(PETERSON, 2014). Outra caracterstica interessante a futura capacidade de troca de informao entre os robs que, espelhando-se no comportamento das abelhas que saem em busca do
nctar e voltam para compartilhar a informao, podem encontrar plantas daninhas e comunicar
esta localizao a outros robs para que eles possam atuar de forma conjunta.
Os robs podem ser equipados com sensores ultrassnicos e sensores infravermelhos de deteco de movimento permitindo manobras dentro da linha de cultura, usando uma abordagem no
A humanizao dos robs, ou a robotizao humana, trar inmeras possibilidades futuras visando o aumento da habilidade de lidar com o mundo. Questes de tica certamente iro surgir para
orientar os avanos tecnolgicos e suas implicaes nesta rea.
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3 Nanotecnologia
A natureza tem testemunhado a evoluo dos sistemas adaptativos complexos e extremamente
inteligentes na conduo dos processos biolgicos encontrados na vida cotidiana. Por exemplo,
uma clula pode fundir processos genticos, ricos em informao, com sensores em escala nanomtrica e atuadores, tornando-se um sistema molecular autnomo eficiente. Estes processos
bsicos que ocorrem no nvel molecular inspiram uma nova abordagem de engenharia: a fuso
de biotecnologia (BT), nanotecnologia (NT) e tecnologia da informao (TI). A NT permitiu a
produo de novos materiais e dispositivos em escala molecular. Avanos biotecnolgicos tm
permitido aos cientistas manipular fisicamente vias genticas ou estirpes de engenharia de protenas. A informtica serviu como catalisador para organizar e compreender o vasto conhecimento
do ponto de vista do sistema. A fuso de BT, NT e TI culminar em arquiteturas de sistemas que
podem apresentar caractersticas dos sistemas biolgicos (HO; CHEN, 2007).
O campo da nanotecnologia tem gerado grande interesse nos ltimos anos por causa de seu
impacto sobre diferentes reas, como produtos qumicos, eletrnicos, agricultura, medicina, farmacutica e indstria espacial. As nanopartculas so grupos de tomos na gama de tamanho de
1-100 nm (1 nm = 10-9 m). Estas nanopartculas possuem propriedades fsicas, qumicas, pticas
e mecnicas bem definidas. Um dos objetivos da nanotecnologia ser capaz de projetar, construir
e controlar nanosistemas, adaptando-os s necessidades especificadas.
Com relao s aplicaes agrcolas, a Embrapa e seus parceiros possuem um extenso trabalho
na rea de nanotecnologia. Na edio nmero 6 da Revista XXI Cincia para a Vida, vrias
reas de estudo e aplicaes de nanotecnologia na agricultura so descritas no artigo publicado
por Reynol e Freire (2014).
A nanobiotecnologia um novo campo de pesquisa que tem o potencial de revolucionar ambas,
a nanotecnologia e a biotecnologia. Entre as possibilidades idealizadas esto as aplicaes mdicas e veterinrias. Um dos usos concebidos a restaurao de funes fisiolgicas danificadas
onde as funes naturais passam a ser exercidas por nanomquinas. Por exemplo, as clulas
pancreticas podem ser substitudas por nanofbricas capazes de reiniciar a produo endgena
de insulina. Um conjunto diferente de possibilidades seria a substituio de organismos vivos,
como as bactrias, na produo de drogas e enzimas, por nanofbricas versteis e eficientes
(BUCCI et al., 2014).
Um aspecto importante da nanotecnologia est relacionado com a concepo de mtodos experimentais para a sntese de nanopartculas de diferentes composies qumica, tamanho, forma e
dispersividade. Biossntese de nanopartculas metlicas, utilizando plantas, encontra-se como um
dos ramos de pesquisa atualmente. A maioria dos organismos multicelulares possuem a capacidade de sintetizar nanopartculas quer intracelularmente, quer extracelularmente. No entanto, ao
contrrio dos mtodos qumicos e fsicos, o percurso biolgico produz nanopartculas de metais
no-txicos, e tambm eficaz em termos de custos. Assim, a sntese de nanopartculas metlicas
utilizando plantas est surgindo como um ramo importante da nanobiotecnologia. Uma grande
variedade de plantas e partes de plantas, incluindo folhas, caule, casca e enzimas de plantas demonstraram a sntese bem sucedida de nanopartculas metlicas. Mais importante ainda, a partir
do ponto de vista da comercializao, a planta um sistema biolgico no patognico o que a
torna vantajosa para a sntese de nanopartculas metlicas. (RAI; YADAV, 2013).
O impacto da nanotecnologia na tecnologia da informao gira em torno da utilizao de nanomateriais para criar componentes menores, mais rpidos, com mais memria e mais eficientes
para uso em computadores e em uma escala cada vez menor. Nessa escala, os novos nanomateriais possuem propriedades no observadas no nvel micro, que permitem o desenvolvimento de
novos dispositivos e aplicaes.
A International Business Machines (IBM), por exemplo, est investindo significativamente
em reas de pesquisa como a nanoeletrnica, fotnica de silcio de carbono, novas tecnologias
de memria e arquiteturas que suportam computao quntica e computao cognitiva. Nos
computadores atuais utiliza-se os transistores de silcio fabricados com a tecnologia CMOS
(complementary metaloxidesemiconductor). Estes transistores esto se tornando cada vez
menores aproximando-se da nanoescala. Devido natureza do silcio, e s leis da fsica, eles
esto se aproximando de um ponto de limitao fsica. Novas tecnologias sero necessrias
para viabilizar o prximo passo na construo de computadores. Alternativas potenciais incluem novos materiais como grafeno, nanotubos de carbono e nanofotnicos de silcio (IBM
CORPORATION, 2014).
O grafeno carbono puro, sob a forma de uma folha de espessura atmica. Trata-se de um excelente condutor de calor e eletricidade, e tambm notavelmente forte e flexvel. Os eltrons
podem se mover no grafeno cerca de dez vezes mais rpido do que em materiais semicondutores
comumente usados, tais como silcio e germnio silcio. Ele um nanomaterial que tem sido
recentemente referido como o silcio do sculo 21. As propriedades pticas e eletrnicas nicas
deste nanomaterial vo permitir o desenvolvimento de uma nova gerao de dispositivos eletrnicos, por exemplo, nanotransistores, nanomemrias, nanobaterias, nano transceptores e nanoantenas que vo abrir as portas para ultracomunicaes de banda larga entre os nanodispositivos
(JORNET; AKYILDIZ, 2012).
Os nanotubos de carbono (NTC) so cilindros tubulares de tomos de carbono que possuem
propriedades mecnicas, eltricas, trmicas, pticas e qumicas extraordinrias. Estas estruturas
exibem 200 vezes a fora e 5 vezes a elasticidade do ao; 5 vezes a condutividade eltrica e 15
vezes a condutividade trmica do cobre; e, aproximadamente a metade da densidade do alumnio. Como um produto base de carbono, os NTC no apresentam os problemas de degradao
ambiental ou fsicos, comuns aos metais de maneira geral, como a expanso e contrao trmica,
corroso e sensibilidade radiao (NANOCOMP TECHNOLOGIES, 2014). Os nanotubos de
carbono podem formar o ncleo de um dispositivo de transistor que ir funcionar de um modo
semelhante ao transistor de silcio corrente, mas com melhor desempenho. Eles podem ser usados
para substituir os transistores em chips de computadores de alto desempenho e telefones inteligentes ultrarrpidos. Transistores de nanotubos de carbono podem funcionar como excelentes
interruptores em dimenses moleculares de menos de dez nanmetros. Os estudos de circuitos
eletrnicos sugerem uma melhora de cinco a dez vezes em seu desempenho em comparao com
os circuitos de silcio tradicionais (IBM CORPORATION, 2014).
Os nanofotnicos de silcio utilizam pulsos de luz para a comunicao, em vez dos fios de cobre
tradicionais. Eles proporcionam uma super rodovia para transmisso de grandes volumes de dados entre chips de computador em servidores, em grandes datacenters e em supercomputadores,
aliviando, assim, as limitaes de trfego de dados. A tecnologia de nanofotnico de silcio fornece respostas para os desafios de Big Data por possibilitar a conexo de grandes sistemas numa
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distncia de alguns centmetros ou alguns quilmetros, permitindo mover terabytes de dados por
meio de pulsos de luz atravs de fibras pticas (IBM CORPORATION, 2014)
O estudo e a utilizao destas nanotecnologias esto permitindo o desenvolvimento de uma nova
gerao de computadores com a quebra do paradigma da forma como se imagina a computao
atualmente. Os avanos de pesquisa exploratria iro levar a descobertas de chips de computador
menores, mais rpidos e mais poderosos, possibilitando a nova era da computao incluindo a
computao pervasiva, computao quntica, a computao neurosinptica e a computao neuromrfica, conforme abordado nas demais sees deste captulo.