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Fazendo Funcionar
Para esta atividade, utilizaremos o simulador NEURON, disponível em https://www.neuron.yale.
edu/. Na aba Download desta página, você encontrará instruções de instalação para seu sistema
operacional.
Salve todos os arquivos anexados a esta atividade (estão no Moodle, no mesmo lugar onde você
encontrou este PDF) em algum diretório em seu computador. Trabalharemos com o arquivo
membrana_passiva.hoc. Para carregá-lo no simulador:
• no Windows, duplo clique deve funcionar (se o NEURON tiver sido instalado corretamente).
• no Linux e no OSX, abra um terminal, navegue até o diretório no qual você salvou os arquivos,
e digite nrngui atividade_mebrana.hoc
Devem aparecer 7 janelas em seu monitor (parecido com a figura abaixo):
• NEURON Main Menu
• Run Control
• Graph[0] (potencial de membrana)
• Graph[1] (corrente através da membrana)
• IClamp[0] at soma(0.5) (primeiro eletrodo para injeção de corrente)
• IClamp[1] at soma(0.5) (segundo eletrodo para injeção de corrente)
• Soma(0-1) Parameters (parâmetros da membrana)
Também aparecerá uma janela tipo linha de comando (com título nrniv ou sh). Dependendo da
resolução do seu monitor, talvez você tenha de reposicionar as janelas para para conseguir enxergá-las melhor.
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Explorando o Modelo
Ao seguir este roteiro, tenha em mente a ideia de que simulações no computador não são culinária,
nem laboratório de eletrofisiologia.
Aqui, nada vai explodir, estragar ou desaparecer se você fuçar, modificar ou errar algo. Sempre
é possível reverter à versão original do modelo, livre de quaisquer problemas eventualmente
introduzidos. Basta fechar o simulador e recomeçar!
Entendendo o Simulador
O arquivo utilizado define um modelo para um segmento cilíndrico de membrana com 10 µm de
comprimento, 10 2
π µm de diâmetro e área total de 100 µm .
• Faça um desenho deste segmento de membrana, e explique de onde sai este valor para a área
total.
A membrana contém também uma condutância passiva, cujo potencial de reversão é −70 mV e a
densidade de condutância é 1 × 10−4 S cm−2 . Note que estes valores podem ser alterados na janela
Soma(0-1) Parameters.
Vamos agora explorar o que é possível fazer com o modelo, simulando um experimento de current
clamp (injeção de um pulso de corrente na célula, através de um eletrodo). Os parâmetros da injeção
podem ser controlados da janela IClamp[0] at soma(0.5). Atenção: pode ser necessário apertar
Enter após digitar um novo valor (outra forma é usar o mouse, apertando os botões ▼). Você
▲
Para explorar
• Dada a tabela 1 abaixo — já preenchida com parâmetros usados na simulação do modelo —
complete a tabela 2, prestando atenção às unidades de cada parâmetro. O que significa cada
um destes parâmetros?
Tabela 1: Valores padrão para os parâmetros da membrana no simulador. Todos estes valores
podem ser alterados diretamente da linha de comando (janela nrniv), ou da janela Soma(0-1)
Parameters.
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parâmetro significado valor
Am área total da membrana ???
G condutância da membrana ???
Rm resistência da membrana ???
Cm capacitância da membrana ???
Vr potencial de repouso ???
τm constante temporal da membrana ???