Reviso Qumica Geral

Tabela Peridica Eletronegatividade Ligaes qumicas: covalente e inica Ressonncia Polaridade de molculas Interaes moleculares: pontes de hidrognio Interaes moleculares: dipolo-dipolo induzido Interaes moleculares: foras de London Micelas, bicamadas lipdicas e membranas

Tabela Peridica
1A 2A ns1 ns2 3A ns2np1
Dmitry Mendeleyev (1840)

4A 5A 6A 7A

ns2np6 ?

Eletronegatividade

Tendncia de um elemento de atrair eltrons para seu ncleo.

F Cl O N C H Na Fr 4,0 3,5 3,0 2,5 2,1 2,0 0,4 0,0

Metais Lig. Inicas Lig. Covalentes

No-metais Metal + -metal doao definitiva de e-metal + -metal compartilhamento de e-

Ligaes covalentes

Lig.simples C-C ~ 154 pm Lig. dupla C=C ~132 pm

Ressonncia

Polaridade
xx

H Cl
cido clordrico (cido muritico)

(momento dipolo, m)

x x Cl x xx

H Cl
m

Par eletrnico compartilhado

HCl(aq.) H+(aq.) + Cl-(aq.)

Substncias polares interagem melhor com substncias polares Substncias apolares interagem melhor com substncias apolares Os semelhantes se atrem !

Polaridade
(molculas orgnicas)

Polaridade
(molculas orgnicas & geometria molecular)

Interaes Moleculares: Pontes de hidrognio

Tipo de interao/ligao Ligao covalente O-H Ponte de hidrognio O-H
ponte de hidrognio

Energia 460 kJ/mol 20 kJ/mol

Distncia O-H 0,096 nm 0,26-0,32 nm

ponte de hidrognio

Interaes Moleculares: Pontes de hidrognio

gelo d = 0,5 g/mL arranjos hexagonais estveis

gelo
gua pura lquida d = 1,0 g/mL clusters de vida-curta

Interaes Moleculares:
Pontes de hidrognio no DNA

Dupla hlice DNA (1952)

Interaes Moleculares: dipolo-dipolo induzido

Caractersticas termodinmicas: Formao de clatratos; Requer reorganizao das molculas de gua em torno da substncia apolar; Termodinmicamente desfavorvel; Entropia positiva: substancial aumento do grau de ordem do sistema (DSo < 0); Agragados: separao espontnea das fases lipoflica e aquosa. Ganho energtico alto pela reduo da estrutura de clatratos.
Volume de leo: 10 x 1 mL 1 x 10 mL Superfcie de contato: 48 cm2 22 cm2

espontneo

Interaes Moleculares:
Interaes de London (dipolo induzido-dipolo induzido)

molculas apolares

Interaes de London: fracas (~ 7 kJ/mol); maior distncia entre os tomos; transientes; entre molculas apolares

Molculas anfiflicas
Micelas e bicamadas lipdicas e membranas

Equilbrio cido-base
cidos e bases de Arrhenius (Brnsted, Lewis) Fora de cidos e bases cidos fracos e pKa pH Curva de titulao de cidos fortes e cidos fracos Curva de titulao de bases fracas Solues tampo Correlaes biolgicas

Teoria cido-base de Arrhenius

cidos: substncias qumicas que liberam ctons H+ em soluo aquosa Bases: substncias qumicas que liberam nions OH- em soluo aquosa Os conceitos cido-base das Teorias de Brnsted e Lewis envolvem pares eletrnicos. Fora de cidos e bases: grande capacidade de dissociao em sol. aquosa

HCl(aq.)
100 mols

H+(aq.) + Cl-(aq.) a = 92%

grau de dissociao

Svante Arrhenius Prmio Nobel de Qumica - 1903

cidos fortes: HNO3, H2SO4, HClO4,etc. Bases fortes: NaOH, KOH, Ca(OH)2,etc.

HCl

H2 O

HCl + H + Cl-

a > 50%

cidos fracos
cidos fracos: dissociam pouco em sol. aquosa (a < 5%)
cido c.lctico c.frmico c.actico HCN c.carbnico (H2CO3) c.fosfrico (H3PO4) Ka 1,4.10-4 1,8.10-4 1,8.10-5 4,0.10-10 K1= 4,3.10-7 K2= 5,6.10-11 K1= 7,5.10-3 K2 = 6,2.10-8 K3= 2,2.10-13 pKa 3,9 3,8 4,8 9,4 6,4 10,3 2,1 7,2 12,7
H O H3C C C OH OH

pKa = -log Ka

Ka = [H+].[A-] [HA]
H O H3C C C O OH

+ H+

c.lctico
H2CO3

lactato

H2CO3(aq.)

H+(aq.) + HCO3-(aq.) H+(aq.) + CO32-(aq.)

c.carbnico HCO 3 (aq.)

O HO P OH OH

H3PO4(aq.)
H2PO4-(aq.) HPO42-(aq.)

H+(aq.) + H2PO4-(aq.)
H+(aq.) + HPO42-(aq.) H+(aq.) + PO43-(aq.)

c.fosfrico

Reao de neutralizao & Equilbrio inico da gua

Concentrao de uma soluo de HCl?

Reao de neutralizao: Estequiomtrica na proporo 1:1 entre ons H+ e OH- com grande constante de equilbrio.

HCl

Volume definido (40 mL p.e.) Soluo de NaOH conc. definida (0,1 M) Medir volume de NaOH utilizado (40 mL p.e.)

H+(aq.) + OH-(aq.)

H2O(aq.)

Equilbrio inico da H2O: Dissociao natural da gua (em meio aquoso).

H2O(aq.)

H+(aq.) + OH-(aq.)
Titulao MH+.VH+ = MOH-.VOH-

Kw25oC = 1,0.10-14 = [H+].[OH-]

Titulao de cido forte:

40 mL soluo cida HCl (conc. desconhecida)

Ponto de equivalncia

adicionado

Comparao de curvas de titulao de um cido forte e um fraco (40 mL cada)

A- + H2O

HA + OHFenolftalena muda de cor neste intervalo de pH

Ponto de equivalncia do cido fraco Ponto de equivalncia do cido forte

Metilorange muda de cor neste intervalo de pH

adicionado

Comparao de curvas de titulao de cidos fracos (40 mL cada)

Ponto de equivalncia do cido fraco Ka = 10-8

A- + H2O

HA + OH-

Ponto de equivalncia do cido forte (pH = 7)

cido forte adicionado

cidos/bases conjugadas de relevncia biolgica

pH e solues/fluidos conhecidos

pH

Faixa fisiolgica de sobrevivncia! (pH 7,0 7,7)

CIDO

cido
0

pH: Grandeza que expressa a acidez de uma soluo. pH = -log [H+]

Soluo neutra: Soluo cida: [H+] = [OH-] Kw = 1,0.10-14 pH 7 = [H+] > [OH-] pH < 7 [H+] < [OH-] > 7 pH

NEUTRO

Soluo bsica:

BSICO

14

bsico

Soluo tampo
Soluo tampo: Soluo composta por um cido fraco (ou base fraca) e sua base conjugada em concentraes relativamente altas. Esta soluo resiste a variaes de pH mesmo com adies de ons H+ ou OH- (at o limite da capacidade tamponante). A maioria dos fluidos corporais e meios fisiolgicos apresentam capacidade tamponante. Eficincia: [pKa 1; pKa + 1]

pH = pKa + log10 [A-] [HA]

Sistema tampo sanguneo

CO2 + H2O H2CO3

pH local e plasmtico

Soluo tampo
Soluo tampo: Soluo composta por um cido fraco (ou base fraca) e sua base conjugada em concentraes relativamente altas. Esta soluo resiste a variaes de pH mesmo com adies de ons H+ ou OH- (at o limite da capacidade tamponante). A maioria dos fluidos corporais e meios fisiolgicos apresentam capacidade tamponante. Eficincia: [pKa 1; pKa + 1]

cimbra (uma das hipteses)

Fontes de energia para cl.musculares:

1. 2. 3.

ATP,glicose local fosfocreatina glicose no metab. anaerbio (prevalece at ~ 60 s)

H O H3C C C O OH

pH = pKa + log10

[A-]
[HA]

H O H3C C C OH OH

+ H+

variaes no pH local afetam a estrutura das protenas da fibra muscular impedindo o correto alinhamento dela durante a con- pH trao muscular dor !!!

lactato

Aminocidos
Aminocidos: Componentes bsicos das protenas e peptdios. Possuem essencialmente dois grupos funcionais: um a-amino e um grupo a-carboxlico. Em meio fisiolgico apresenta-se na forma zwitterinica (molcula que pode acumular carga positiva e negativa simulta/e).
cadeia lateral

pH 7,4

H O R C C O + NH3
a

acarboxlico

Cadeia lateral: Poro da molcula de um aminocido que confere as caractersticas fsico-qumicas deste quando livre ou mesmo inserido na estrutura proteica. Contm funes orgnicas que conferem ao aminocido caractersticas cidas, bsicas ou neutras (conforme o grupo presente). Em protenas, s existem enantimeros levgiros (L-aa) Valores de pKa: a-NH2 ~ 8,5-10,0 a-COOH ~ 2,0
em pH < pKa em pH > pKa prevalece forma protonada (com H+)
prevalece forma desprotonada

a-amino

(sem H+)

Aminocidos: isomeria ptica

espelho

carbono assimtrico (4 ligantes )

Dextrgiro D-alanina

Levgiro L-alanina

Aminocidos apolares
H H C COO + NH3
Glicina (Gly)
-

H3C H3C

H CH C COO NH3
Valina (Val)
+

H3C CH CH2 H3C

H C COO NH3
+

Leucina (Leu)

H H3C C COO + NH3

Alanina (Ala)

H3C CH2

CH3 H CH C COO + NH3

H CH2 C COO + NH3

Fenilalanina (Phe)
-

Isoleucina (Ile)

H CH2 C COO + NH3 N H

Triptofano (Trp)
-

COO NH2+ H
Prolina (Pro)

H H3C S CH2 CH2 C COO + NH3

Metionina (Met)
-

Aminocidos polares neutros

H C COO + NH3 H C COO + NH3 O H H2N C CH2 CH2 C COO + NH3
Glutamina (Gln)

HS CH2
pKa = 8,3

HO

CH2
Tirosina (Tyr)

Cistena (Cys)

HO CH2

H C COO + NH3

OH H H3C CH C COO + NH3

Treonina (Thr)

O H H2N C CH2 C COO + NH3

Asparagina (Asn)

Serina (Ser)

Aminocidos polares
cidos
pKa = 4,3
-

Bsicos
+

pKa = 10,8

H
-

H
-

H3N CH2 CH2 CH2 CH2 C COO + NH3

OOC CH2 CH2 C COO + NH3

c. glutmico (Glu)

Lisina (Lys)

pKa = 4,0
-

H
-

a NH2 H H2N C NH CH2 CH2 CH2 C COO + NH3 Arginina (Arg)

pK = 12,5

OOC CH2 C COO + NH3

c. asprtico (Asp)

pKa = 6,0 +HN

NH CH2

Histidina (His)

H C COO + NH3

Aminocidos modificados
H3N H H3C NH (CH2)4 C COO
+ NH3 +

COO CH CH2)3

H3N

NH3 (CH2)2 CH

CH

(CH2)2 N
+

OOC CH2)4

COO

6-N-Metil-lisina

Desmosina

H HSe CH2 C NH3 COO

+ -

H3N HO
+

CH COO

Selenocistena

COO H

4-hidroxiprolina

pKa
aminocidos
HA H+ + ApKa = -log Ka Ka = [H+].[A-] [HA]

pK1 = 1,82

pK1 = 6,04

pK1 = 9,17

Curvas de titulao do aminocido alanina (Ala)

H H 2A
+

H3C C COOH + NH3 pK1 = 2,34 H H3C C COO NH3

+

HA

pI = ponto isoeltrico

pK2 = 9,69 H H3C C COO NH2

mols de OH- adicionados adicionado
-

Ponto isoeltrico (pI):

Valor de pH no qual a carga efetiva do aa = 0

pH pH==12 4 9
H2N-

O -C-ONH2

pH 6,0

Ligaes peptdicas
H O a-COOH + H3N C C O + R1
aa1

Ligao peptdica

H O + H3N C C O a-NH3+ R2 aa2

H2 O
+

H O

H O
-

H3N C C N C C O dipeptdio R1 H R2

Lig. peptdica: Estabilizada por ressonncia o que impe restries quanto a rotao livre de tomos em torno da ligao peptdica. Comprimento das ligaes: C-N 0,149 nm C=N 0,127 nm CN (lig.pept.) 0,133 nm ngulos: C (C;O) 120,5o C(N;O) 123,5o C(C;N) 116o

H C N O
-

C N O

H C N O

Ressonncia
H

C N C O

Peptdios
H O H O + H3N C C N C C O CH3 CH2 H CH2 CH2 COO

H
+

O
-

H O H CH2 SH

H
-

H3N C CH2 CH2 C N C C N C COO COO H H

L-aspartilfenilalanina-metil ster (aspartame)

L-g-glutamil-cisteinil-glicina (glutationa)

dipeptdio

tripeptdio

Ligaes dissulfeto (pontes S-S)

Ligaes dissulfeto (pontes S-S): Formadas por oxidao dos grupos tiis (ou sulfidrilas) de duas cistenas (Cys) da mesma ou de diferentes cadeias polipeptdicas. So essenciais para determinar a correta estrutura terciria de protenas e, assim, permitir suas funes biolgicas associadas.
H O C C CH2 SH Cys + SH CH2 C C H O
1) uria 2) beta-mercaptoetanol (bHSEtOH)

N H

H O N C C H CH2 S S H CH2 N C C H O

forma desnaturada enzima inativa forma nativa enzima ativa 1) + O2 2) remover uria pontes S-S se formam aleatoriamente 1) remover uria 2) + O2

H N

1) bHSEtOH 2) + O2

Cys

forma desnaturada enzima inativa

forma nativa enzima ativa

Peptdios

aa apolar

aa apolar

Oxitocina: secretada pela neurohipfise; estimula contraes uterinas SS +H N-Gly-Leu-Pro-Cys-Asn-Gln-Ile-Tyr-Cys-COO3 Vasopressina: secretada pela neurohipfise; estimula reabsoro de gua pelos rins e sinaliza para o aumento da presso sangnea SS +H N-Gly-Arg-Pro-Cys-Asn-Gln-Phe-Tyr-Cys-COO3
aa bsico aa apolar

Peptdios: insulina bovina

Insulina: Hormnio pancretico responsvel pela sinalizao para absoro de glicose nas clulas de mamferos (famlia protenas GLUT). Possui 51 aminocidos e formada, em sua forma ativa, pela eliminao do peptdio C (33 resduos) da estrutura da pr-insulina.
SS +H N-Gly-Ile-Val-Gly-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Glu-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn-COO3 S S S S +H N-Phe-Val-Gln-His-Leu-Cys-GlySerHisLeuValGluAlaLeuTyrLeuValCys-Gly-Glu-Arg-Gly 3
1 2 57 3 58 4 59 5 60 6 55 56 18
Peptdio C

11

20

PI R
I

Phe

-OOC-Ala-Lys-Pro-Thr-Tyr-Phe

Absoro de glicose

Peptdios: insulina bovina

Insulina: Hormnio pancretico responsvel pela sinalizao para absoro de glicose nas clulas de mamferos (famlia protenas GLUT). Possui 51 aminocidos e formada, em sua forma ativa, pela eliminao do peptdio C (33 resduos) da estrutura da pr-insulina.
S S S S +H N-Gly-Ile-Val-Gly-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Glu-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn-COO3 S S SS S S +H N-Phe-Val-Gln-His-Leu-Cys-GlySerHisLeuValGluAlaLeuTyrLeuValCys-Gly-Glu-Arg-Gly 3
1 2 3 4 5 6 18 1 2 3 4 5 6 7 11 20

Phe

i
R

-OOC-Ala-Lys-Pro-Thr-Tyr-Phe

Estrutura secundria de protenas

plano grupo amida b-pregueada (antiparalela) b-pregueada (paralela) colgeno a-hlice (esquerda) a-carbono a-hlice (direita)

cadeia lateral

plano grupo amida

a-hlice

0,54 nm
entre o grupo NHde uma lig.peptdica e o grupo C=O do 4o. seguinte aa

pontes de H entre os grupos C=O e NH- das ligaes peptdicas estabilizam a estrutura em hlice Passo: 3,6 aminocidos ~ 0,54 nm Pontes de H prximas de orientao linear

Folhas b-pregueadas (antiparalelas)

1,05 nm

pontes de H entre os grupos C=O e NH- das Ligaes peptdicas estabilizam a estrutura em Hlice Estrutura termodinamicamente muito estvel pois as pontes de H adquirem orientao linear

Folhas b-pregueadas (paralelas)

1,00 nm

pontes de H entre os grupos C=O e NH- das ligaes peptdicas estabilizam a estrutura em hlice. Estrutura termodinamicamente menos estvel pois as pontes de H no possuem orientao linear

R2

b-turns (cotovelos)
Cotovelo Tipo I

O C N O C H

Ca H

C a R1

A presena de Pro tambm induz a quebra de estruturas secundrias em protenas. Ex. mioglobina

Cotovelo Tipo II

Nmero cotovelos protena

Fita b 1

Fita b 2 Fita em b 1 Fita em b 2 Fita em b 1 Fita b2

Nmero de resduos no cotovelo

Estrutura terciria de protenas

ptes.H entre cadeias laterais
Folhas pregueadas Interaes hidrofbicas Atraes eletrostticas a-hlice

ptes.H

ptes.H entre gru pos peptdicos Interaes hidrofbicas ptes.H ptes.H entre cadeias laterais e grupos peptdicos

ptes.S-S

Estrutura quaternria de protenas

Zn2+

hexmero insulina hemoglobina [Zn2+]

Modelagem molecular de protenas (LMLS)

Ribulose-1,5-bifosfato DNA ligase imunoglobulina mioglobina Carboxilase/Oxidase

Protenas estruturais: Responsveis pela estabilidade mecnica e arquitetura celular e tissular. Tubulinas, colgeno, e histonas so alguns exemplos. Protenas de transporte: Responsveis pela absoro ou remoo de metablitos do espao intra-celular e tambm pelo transporte de outras substncias no organismos como um todo. Aquaporinas, Carnitina-aciltransferase e hemoglobina so alguns exemplos. Protenas de defesa ou proteo: Responsveis pela defesa do organismo contra agentes patognicos e substncias estranhas. Imunoglobulinas e fibrinognio so alguns exemplos. Protenas regulatrias e de controle homeosttico: Molculas sinalizadoras, captadoras de sinais celulares (receptores) e de regulao de expresso gnica. Ex: insulina, receptores b-adrenrgicos e protena CAP (catabolite activator protein). Protenas catalticas: Enzimas. Responsveis pelo controle de cerca de 99,9% das reaes qumicas que ocorrem no ambiente intracelular (alm do controle integrado dos processos metablicos). Protenas de movimentao e estoque energtico: Miosina, actina. Ovoalbumina, casena do leite.

Protenas globulares
a-hlices:
> incidncia: Glu, Met, Ala < incidncia: Gly, Pro, Tyr

b-pregueadas:
> incidncia: Val, Ile, Tyr, Phe, Trp < incidncia: Glu, Asp, Pro

b-turns (cotovelos):
> incidncia: Pro, Gly, Asn, Ser < incidncia: Ile, Val, Leu

Escorbuto e as grandes navegaes

Colgeno

4-hidrxiprolina e 5-hidrxilisina so essenciais para formao da hlice tripla do colgeno. Enzimas HIDROXILASES so dependentes de ascorbato como cofator !

a-queratina
>% Ala, Leu, Ile, Val, Met e Phe (aa apolares) Coeso das microfibrilas depende de pontes S-S entre cistenas. Por exemplo: nos chifres de rinocerontes, a % pontes S-S chega a 18%.

Protenas complexas
Lipoprotenas:
Miristoil (C14), Palmitoil (C16), Farnesil (C15) ou geranil (C20) protenas; ncoras GPI (glysolylated phosphatidyl inositol).
HO Gal Gal Gal Gal M NAcG I O
-

O CH2 O P O M M O
-

CH2

NH

Glicoprotenas:
Glicoclix de clulas eucariticas; imunoglobulinas. protenas de reconhecimento.

Prot mioglobina
COO CH2 CH2 CH3
-

Fosfoprotenas:
Glicognio fosforilase (forma ativa/inativa); MAPK, MAPKK, etc. Responsveis por processos de sinalizao intracelular.

Hemeprotenas:
Possuem grupo heme como grupo prosttico. Hemoglobina, mioglobina, catalase, citocromo P450, etc.
CH2 O C O O C

P COO OH O CH2 CH2CH2 O

CH
H3C

Flavoprotenas:
Proetnas que dependem de riboflavina (vit. B2) como constituinte bsico de coenzimas/grupo prosttico.

N N

Fe2+

N CH3

HC CH2 CH3 CH

Metaloprotenas:
[Zn2+] lcool desidrogenase; [Fe2+] ferritin; [Mo] nitrogenases.

Grupo heme

ncora GPI

CH2

Estrutura terciria de protenas

ptes.H entre cadeias laterais
Folhas pregueadas Interaes hidrofbicas Atraes eletrostticas a-hlice

ptes.H

ptes.H entre gru pos peptdicos Interaes hidrofbicas ptes.H ptes.H entre cadeias laterais e grupos peptdicos

ptes.S-S

Desnaturao de protenas
Agentes qumicos

Agentes qumicos desnaturantes

O H2N C NH2
-S-S-EtOH

uria 6M
HOEt-S-SHOEt-S-S-S-S-EtOH

HO CH2 CH2 SH

-S-S-EtOH

b-mercaptoetanol
O O S O O ][Na
+

-S-S-EtOH

Protena forma nativa

Dodecilsulfato de sdio (SDS)

Desnaturao de protenas
Agentes qumicos: uria 6 M

Lys

Lys

CH2)n

+ Uria 6MH

CH2)n N H O N H H

Gln
C N H CH2 H CH2 H
H

CH2 CH2 C O
H N H

Gln

O H2N C NH2

uria

O H2N C

Desnaturao de protenas
Agentes fsico-qumicos
pepsina Temp. tima pH timo pH timo

Atividade enzimtica

lisozima

a-amilase

Atividade enzimtica

Anlise de protenas
Eletroforese em gel de poliacrilamida com SDS (SDS-PAGE)

SDS
H3C (CH2)n O

O S O O Na
+

~ 39 kDa

Anlise de protenas
Focalizao isoeltrica
pI protenas: Valor de pH onde a carga efetiva geral se aproxima de zero. Qto. > a proporo de resduos Asp, Glu: < pI Qto. > a proporo de resduos Lys,His,Arg: > pI Protena Pepsina Ovoalbumina Soro albumina humana b-lactoglobulina Hemoglobina Mioglobina Citocromo c Lisozima pI ~1,0 4,6 4,9 5,2 6,8 7,0 10,7 11,0 MW
(cadeias)

64.500 (4) 16.890 (1) 13.000 (1)

Anlise de protenas
Eletroforese bidimensional