ANÁLISE DA ESTRUTURA

MORFOLÓGICA DE PARTÍCULAS
EM MICROSCOPIAS NO IMAGEJ
Prof. José Gedael Fagundes Júnior

1° Semestre 2015
 TUTORIAL IMAGEJ

DOWNLOAD E HELP
Pode se fazer o download do programa acessando o
site abaixo. O ImageJ tem versões disponíveis para 32 e 64
bits.

http://imagej.nih.gov/ij/index.html

Dicas e instruções da utilização do programa também

estão disponíveis no site.

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IMAGEJ
O ImageJ é um software que faz análises e
processamentos de imagens tais como:
 Calcular a área de uma imagem ou seleção;
 Medir distâncias e ângulos;
 Manipulação das propriedades da imagem (brilho,
contraste, cores, etc);
 Edição de imagens, etc.

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ABRINDO UMA IMAGEM

1. Na barra de comandos clique em Files/Open:

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ABRINDO UMA IMAGEM

2. Escolha o diretório onde a imagem se encontra.

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ABRINDO UMA IMAGEM

3. A imagem será exibida em uma nova janela:

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ABRINDO UMA IMAGEM

Ao abrir o imageJ, o
programa assume a
calibração padrão em
pixels:

Tamanho da imagem :
1024 x 768 pixels

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CALIBRANDO O IMAGEJ
Para calibrar o ImageJ
é necessário que a
imagem tenha uma
escala de referência ou
algum detalhe onde se
conheça as dimensões
reais:

Escala de
Referência

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CALIBRANDO O IMAGEJ
1. Após exibir a imagem, na barra de comandos clique no
ícone de zoom :

Botão direito do mouse: reduz o zoom;

Botão esquerdo do mouse: aumenta o zoom.

Ajuste o zoom de maneira que a escala de referência ocupe

toda a janela.

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CALIBRANDO O IMAGEJ

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CALIBRANDO O IMAGEJ
2. Agora selecione o comando Straight Line e desenhe
uma linha sobre a escala de referência:

Ao traçar a linha
pressione SHIFT.

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CALIBRANDO O IMAGEJ
3. Clique em Analyse/Set Scale:

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CALIBRANDO O IMAGEJ
4. Uma janela Set Scale é exibida:

 Distance in pixels: é o comprimento

da escala de referência em pixels;
 Knowm distance: comprimento da
escala de referência na unidade
adotada (μm);
 Unit of length: unidade adotada:
milímetros (mm), micrometros
(um),etc.

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CALIBRANDO O IMAGEJ
5. Complete os campos da Set Scale e clique em OK:

 Knowm distance: 30
 Unit of length: um (referente a µm)

Atenção: Caso tenha outras imagens com

a mesma escala de referência, marque a
opção GLOBAL, assim as próximas
imagens já estarão calibradas.

AO FECHAR O PROGRAMA AS
CALIBRAÇÕES SÃO PERDIDAS!!!

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CALIBRANDO O IMAGEJ
6. Após ser feito a calibração, a parte superior da imagem
exibe as dimensões reais:

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APLICANDO THRESHOLD
1. Agora abra a imagem com o mesmo tamanho, porém
sem a escala de referência: File/Open/.......

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APLICANDO THRESHOLD
2. Clique em Image/Adjust/Threshold (Shift+Ctrl+T):
Os tons escuros da imagem ficarão na cor vermelha.

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APLICANDO THRESHOLD
3. Se necessário ajuste o Threshold e então clique em
Apply e feche a janela.

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APLICANDO THRESHOLD
4. A imagem assumirá tons pretos e brancos:

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ANÁLISES DE PARTICULAS
Após ter ajustado a imagem em tons de preto e branco,
pode-se partir para a análise das partículas:
1. Na barra de comandos do ImageJ clique em
Analyze/Analyze Particles;

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ANÁLISES DE PARTICULAS
2. A janela Analyze Particles é será exibida:

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ANÁLISES DE PARTICULAS
Comandos da Janela Analyze Particles

 Size: Partículas com tamanhos iguais ou inferiores ao valor

estipulado neste campo serão ignoradas;
 Circularity: Indica o quanto próximo de uma circunferência
a particula está. Varia entre 0 e 1. Quanto mais próximo de
1 a circularidade se encontra mais arredondada é a
partícula:
A
C  4  2
P
• A = área da partícula;
• P = perímetro da particula;

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ANÁLISES DE PARTICULAS
Comandos da Janela Analyze Particles:

 Show: comando que apresenta uma série de opções em

que o ImageJ irá exibir a imagem após a análise:

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ANÁLISES DE PARTICULAS
Comandos da Janela Analyze Particles:

 Display Results: As medições de cada partícula serão

exibidas no Results Table.
 Clear Results: Medições feitas anteriormente exibidas no
Results Table serão apagadas;
 Summarize: Os parâmetros de exibição selecionados em
Set Measurements (Analyse/Set Measurements) serão
exibidos em uma planilha adicional;
 Exclude on Edges: As partículas em contato com os
contornos da imagem ou seleção serão excluídas;
 Include Holes: Vazios existentes no interior das partículas
serão incluídos.
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ANÁLISES DE PARTICULAS
3. Preencha a Janela Analyze Particles no seguinte modo:
 Size: digite 5 µm;
 Show: Selecione a opção Outline;
 Marque as opções Display Results e Summarize e clique
em OK.

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ANÁLISES DE PARTICULAS
4. Três novas janelas serão exibidas:

 Drawing: Imagem conforme a opção definida no campo

Show da janela Analyze Particles;
 Results Table: Planilha com as medidas das partículas;
 Summary: Planilha com os valores médios;

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ANÁLISES DE PARTICULAS
4.1. Drawing:

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ANÁLISES DE PARTICULAS
4.1. Results Table:

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ANÁLISES DE PARTICULAS
4.1. Summary Table:

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

Observe na imagem utilizada como exemplo, as partículas

que estão em contato, o ImageJ considerou como sendo
uma única partícula, a seguir os passos para fazer a
segmentação das áreas a ser medidas.

Imagem Original Threshold Show: Outlines

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

1. Se necessário repita os procedimentos de calibração do

ImageJ e aplique o Threshold na imagem (Slides 1 ao 20 ).

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

2. Na Barra de comandos do ImageJ clique em

Process/Binary/Watershed.

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

3. As partículas serão desmembrada conforme imagem

abaixo:

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

4. Na barra de comandos do ImageJ clique em

Analyze/Analyze Particles;

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS

4. Selecione os parâmetros na Janela Analyze Particles e

clique OK:

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS
5. As janelas Table Results, Summary e Drawing serão
exibidas:

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SEGMENTANDO AS PARTÍCULAS
Imagem Original Threshold Show: Outlines
Partículas não
segmentadas
segmentadas
Partículas

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Para maiores informações:

1. HEALTH, N. I. O. M. Research Services Branch. ImageJ.

Disponivel em: <http://imagej.nih.gov/ij/index.html>.
Acesso em: 29 Janeiro 2015.
2. ImageJ User Guide;

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