Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução
2. Módulo I. Dinâmica mutacional e
modelos de substituição
3. Módulo II. Reconstrução de árvores
filogenéticas
4. Módulo III. Inferência em árvores
filogenéticas
1
 Introdução

1. Sistemática biológica
2. Preservação e destruição da informação
3. Padrão e processo

Objetivo: Compreender que a sistemática

biológica é uma ciência histórica,
comparativa e inferencial.

2
Introdução

Systematics is the branch of evolutionary

biology that aims to recover the
genealogical relationships underlying
organic diversity.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações
genealógicas subjacentes à diversidade
orgânica.

Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

3
1. Sistemática biológica
Introdução

A sistemática é o ramo da biologia

evolutiva cujo objetivo é recuperar as
relações genealógicas subjacentes à
diversidade orgânica.

Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

4
1. Sistemática biológica
 5
Arhat Abzhanov
Introdução

Diversidade

Espaço Tempo
6
1. Sistemática biológica
Introdução
Espaço
Tempo

Descendência com modificação

7
1. Sistemática biológica
Introdução

Espaço

Tempo

Descendência com modificação

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo

objetivo é recuperar as relações genealógicas
subjacentes à diversidade orgânica

8
1. Sistemática biológica
Introdução

G. scandens

G. conirostris C. olivacea

G. magnirostris C. heliobates

Ancestral comum

C. pallida
G. fortis

C. crassirostris C. parvulus

C. pauper

9
1. Sistemática biológica
Introdução

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações
genealógicas subjacentes à diversidade
orgânica.

Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

10
1. Sistemática biológica
 Introdução

G. scandens C. parvulus C. pauper C. pallida

G. fortis

G. fuliginosa G. conirostris C. crassirostris C. heliobates C. olivacea T. obscura

G. magnirostris

11
1. Sistemática biológica
 Introdução

1. Sistemática biológica 9

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

12
Introdução

Preservação − destruição da informação

13
2. Preservação e destruição da informação
Introdução

A G

C T

14
2. Preservação e destruição da informação
 População ancestral

Sequência ancestral

População descendente T C População descendente

Sequências
descendentes
15
 Sequência ancestral
A
C
T
G
A
A
C
G
T
A
A
C
G
C
A A
C C — A
T T
G G
Sequência A — T — G A Sequência
A A
descendente 1 C — G C descendente 2
G G
T T — C
A A
A — G A
C C
G G
C C — T — C
A A
C ∗ A
T T
G G
G ∗ A
A A
G ∗ C Sequências
G G
T ∗ C observadas
A A
G ∗ A
C C
G G 16
C C
Introdução

A G

C T

Preservação − destruição da informação

17
2. Preservação e destruição da informação
 Introdução

1. Sistemática biológica 9

2. Preservação e destruição da informação 9

3. Padrão e processo

18
Tempo Espaço

19
Introdução

+sobre processos→
Dados de distribuição Suposições
Padrão filogenético
de caracteres

20
3. Padrão e processo
Introdução

+sobre processos→
Dados de distribuição Suposições
Padrão filogenético
de caracteres

Dados de distribuição
+
Métodos de
→ Padrão filogenético
de caracteres inferência

21
3. Padrão e processo
 A sistemática biológica é
uma ciência

Histórica Comparativa Inferencial

22
Introdução

Evolução (não-observável) Matriz de caracteres alinhados Análise filogenética

DADOS DE
SEQUÊNCIAS
CAAT G

CGACTTG

CCACATG

23
3. Padrão e processo
 Introdução

1. Sistemática biológica 9

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo 9

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 Introdução à Sistemática Molecular
Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução 9
2. Módulo I. Dinâmica mutacional e
modelos de substituição
3. Módulo II. Reconstrução de árvores
filogenéticas
4. Módulo III. Inferência em árvores
filogenéticas
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