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Uma das principais críticas diz respeito à dependência excessiva da indústria farmacêutica em
relação à síntese química de compostos. A busca por novas moléculas e a otimização de
processos de produção muitas vezes privilegiam a eficiência e a lucratividade em detrimento
da segurança e da saúde dos consumidores. Essa abordagem pode levar a medicamentos que
apresentam efeitos colaterais indesejados ou que não atendem adequadamente às
necessidades dos pacientes.
Por fim, é importante ressaltar que a Química Orgânica na indústria farmacêutica não é isenta
de críticas éticas. A utilização de animais em testes de toxicidade e a manipulação genética de
organismos vivos levantam questões sobre o bem-estar animal e a segurança dos
consumidores.