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Semana 02BC 2023v1
Semana 02BC 2023v1
2023-2024
CONFIDENTIAL 2023
AULA-03 (1h)
27/09/2023
Célula, a unidade básica
da vida
CONFIDENTIAL 2023
Armando Cristóvão
Célula típica de um procarionte
citoesqueleto
Pili: estruturas de adesão
Ligação na superfície de alguns procariotas
Nucleóide: região onde está
O DNA da célula (não está
Envolvido por uma membrana)
Membrana Plasmática: membrana
Ribossomas: organelos que
Que envolve o citoplasma
sintetizam as proteínas
(a) Bactéria típica Flagelo: organelo de (b) Secção fina através de uma
Em forma de bastonete Locomoção de bactéria Bacillus coagulans
algumas bactérias (TEM)
CONFIDENTIAL 2023
https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.06.057
Membranas e parede
Bacteria Archaea
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Cada organismo procarionte é constituído por uma única célula.
CONFIDENTIAL 2023
https://www.mdpi.com/materials/materials-11-01086/article_deploy/html/images/materials-11-01086-g001-550.jpg
Estruturas internas
Algumas células
procarióticas possuem
membranas especializadas
CONFIDENTIAL 2023
Resultam de invaginações da
membrana plasmática
Desempenham funções
metabólicas
Material genético
Cromossoma procarióta
Anel de DNA (cromossoma circular)
Apenas uma cópia de cada gene
1000 – 2000 genes
Poucas proteínas associadas ao cromossoma Erro muito comum dizer que não
Plasmídeos tem proteínas associadas
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Pequenos anéis de DNA (DNA circular)
Poucos genes
Replicação independente
wikipedia
Organização cromossoma -Evitar erro
Anos 90 -->2010
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DOI:10.1038/nrmicro2261
NAPs
Transferência plasmídeos – pili ou fímbria
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https://www.statnews.com/wp-content/uploads/2018/02/Draft-1-1024x576.jpg
Transferência de genes
VERTICAL
CONFIDENTIAL 2023
https://www2.le.ac.uk/projects/vgec/
schoolsandcolleges/Microbial
%20Sciences/mutation-and-gene-
tranfer/dna-transfer
Ao contrário do cromossoma os
plasmídeos podem não ser
distribuídos uniformemente
Transferência de genes (apenas plasmídeos??)
HORIZONTAL
CONFIDENTIAL 2023
https://www.differencebetween.com/wp-
content/uploads/2017/05/Difference-
Between-Vertical-and-Horizontal-Gene-
Transfer-2.png
Transferência de genes (só procariontes??)
CONFIDENTIAL 2023
https://doi.org/10.1016/j.tig.2020.08.006
Procoriontes não armazenam?-Inclusões
Ocorrem no
Citoplasma ou periplasma
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
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CONFIDENTIAL 2023
https://slideplayer.com/slide/12711690/76/images/37/
Figure+3.26+Archaeal+hami+Hamus+Grappling+hook+Prickles+37.jpg
LOCOMOÇÃO Flagelos / vesículas gás
Porquê vesículas de gás?
CONFIDENTIAL 2023
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Flagelo
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Permite movimento controlado?
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averissimo
Extremófilas: amantes de ambientes extremos
Termófilas extremas
Thermus aquaticus - Bacteria
50-80ºC
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Taq polimerase PCR
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-15ºC
Eukarya ; alga
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Archaea
Archaea
Halófilas extremas
●
Halobacterium noricense - Archaea
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●
20-25% NaCl
Osmolaridade (NaCl)
Estas são bactéria Esta é Archaea
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Conseguem produzir Precisam de oxigénio
Não têm enzimas pois não conseguem
ATP por respiração Precisam de oxigénio
para usar oxigénio Conseguem produzir
ou fermentação na produzir ATP por
que é tóxico. Ficam ATP por respiração pois não produzem
presença ou ausência respiração ou
no local onde a ou fermentação na ATP sem oxigénio.
de oxigénio. Ficam fermentação na
Oxigénio “não é
concentração é mais
mais no cimo pois ausência de oxigénio. ausência de
baixa tóxico”.
predomina respiração. Mas oxigénio é tóxico. oxigénio. Oxigénio
“não é tóxico.”
Extremófilas - amantes de ambientes extremos
Metanogénicas
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●
Methanococcus voltae - Archaea
● Utilizam CO2 para oxidar o H2
●
Libertam metano
● Vivem em ambientes sem O2
Eucariontes
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Características marcantes dos Eucariontes?
Eucariontes
(animais, plantas,
fungos, e protistas)
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Núcleo
envolvido por uma
membrana em cada
célula
http://www.brooklyn.edu/bc/ahp/MBG/MBG3/CB.ProkaryoteCell.GIF
Características marcantes dos Eucariontes?
CONFIDENTIAL 2023
Permite a especialização de células para
formar tecidos e órgãos
https://schoolbag.info/biology/living/31.html
Citoplasma = organelos + citosol
Citoplasma
Material fora do núcleo e
dentro da membrana
plasmática
Consiste em todos os
CONFIDENTIAL 2023
organelos e substância semi-
citosol
fluída -
Citosol é na maioria água,
http://www.puc.edu/Faculty/Gilbert_Muth/art0063.jpg
Citoplasma, citosol, protoplasma (eucariontes)
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Células de eucariontes - Animais
CONFIDENTIAL 2023
Adesão celular e reconhecimento (ANIMAIS)
junções
Apertadas
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Desmossomos
junções
comunicantes
Células de eucariontes - Plantas
CONFIDENTIAL 2023
Células de eucariontes (Parte 4)
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Ribossomas
70 S ou 80S Svedberg - uma
medida da velocidade
de sedimentação por
centrifugação
CONFIDENTIAL 2023
Type Size Large Small
subunit subunit
CONFIDENTIAL 2023
– DNA circular
– Ribossomas 70S
– Eucariontes
– DNA está envolvido por membrana
– Compartimentos separados por membranas, com
organelos distintos.
– DNA linear
– Ribossomas 80S
http://www.brooklyn.edu/bc/ahp/MBG/MBG3/CB.ProkaryoteCell.GIF
Será mesmo
CONFIDENTIAL 2023
assim?
Todos procariontes têm parede celular?
CONFIDENTIAL 2023
https://onlinelibrary.wiley.com/cms/asset/3249b52d-e022-4f48-
ae36-d2b1c9335e93/mmi13305-fig-0007-m.jpg
https://egtheory.files.wordpress.com/2012/07/karrsanghvi_etal2012figure1a.png
Class - Planctomycetia
Ordem - Planctomycetales
Família - Planctomycetaceae
CONFIDENTIAL 2023
Gemmata
obscuriglobus
CONFIDENTIAL 2023
Santarella-Mellwig R, Franke J, Jaedicke A, Gorjanacz M, et al. (2010) The Compartmentalized Bacteria of the Planctomycetes-
Verrucomicrobia-Chlamydiae Superphylum Have Membrane Coat-Like Proteins. PLoS Biol 8(1): e1000281.
doi:10.1371/journal.pbio.1000281
http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.1000281
E todos os Eukarya têm mitocôndrias?
(1965).BBRC,doi:10.1016/0006-291x(65)90949-6
CONFIDENTIAL 2023
Nature Chemical Biology 8, 527–535 (2012) doi:10.1038/nchembio.975
Neocallimastix frontalis
http://dx.doi.org/10.1111/j.1574-6968.1997.tb12656.x
E todos os animais têm mitocôndrias?
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Ordem: Nanaloricida
Família: Nanaloricidae
Género Spinoloricus
Cloroplastos só em plantas?
Hatena, (protista)
CONFIDENTIAL 2023
Kleptoplasty = Cleptoplastia?
Só as plantas têm cloroplastos?sim, mas..
Gastrópodes nudibrânquios
Elysia viridis
Elysiella pusilla
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https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/6a/Elysiella_pusilla.jpg
https://doris.ffessm.fr/var/doris/storage/images/images/deux-rhinophores-
21952/188625-1-fre-FR/elysia_viridis-jpc41_image1200.jpg
Kleptoplasty = Cleptoplastia?
Só os procariontes têm ribossomas 70S?
E só os procariontes têm DNA circular?
CONFIDENTIAL 2023
Vírus
CONFIDENTIAL 2023
Armando Cristóvão
E como ficamos com os vírus?
CONFIDENTIAL 2023
E os vírus?
CONFIDENTIAL 2023
Em primeiro como é a sua organização?
Vírus
Parasita intracelular
Constituição:
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Material genético (DNA ou RNA e para
complicar mais de cadeia simples ou dupla)
Capsídeo proteíco
Proteínas virais
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Formas
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Organização dos vírus- Baltimore
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1962
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Vivo ou não-vivo?
Estrutura celular
Elevada organização
celular ou molecular
Metabolismo
consumo, transformação e armazenamento de energia
CONFIDENTIAL 2023
Adaptação
novos ambientes ou novas situações
Regulação
Do ambiente interno para manter um estado constante
Resposta a estímulos
capacidade de avaliar as propriedades do ambiente que a rodeia e de agir em
resposta a determinadas condições.
Reprodução
capacidade de gerar entidades semelhantes a si própria.
https://www.scientificamerican.com/article/are-viruses-alive-2004/
2016
CONFIDENTIAL 2023
10.1016/j.shpsc.2016.02.016
Vale a pena discutir?
unlike the discussions of “aliveness” of viruses, the replicator paradigm is constructive in that it provides the
conceptual framework for theoretical and experimental study of the interactions within the replicator
community that are among the key drivers of all evolution.
CONFIDENTIAL 2023
All life that is currently known centers around
DNA or RNA molecules, replicating carriers of
genetic information which all share
fundamentally the same chemical structure.
To conclude, we believe that the replicator paradigm is truly central to biology as both a conceptual
framework and a research programme. Among other major issues, it settles the status of viruses in
the biological world.
Taxonomia vírus
CONFIDENTIAL 2023
Parte da taxonomia proposta para vírus
CONFIDENTIAL 2023
Há vírus que ainda não encaixam neste sistema
AS CÉLULAS?
CONFIDENTIAL 2023
O microscópio:uma janela para as células
Ocular
lens
Objective lens
Specimen
Condenser lens
Light source
Como ultrapassar as limitações
Como observar células vivas / aumentar contraste?
Campo
brilhante
Contraste de
interferência
Moléculas – o clássico
https://thumbs.dreamstime.com/b/compact-bone-micrograph-light-microscopy-tissue-
hematoxylin-eosin-staining-magnification-science-research-79645269.jpg
Como ultrapassar as limitações
CONFIDENTIAL 2023
Normal Confocal
CONFIDENTIAL 2023
Estudar moléculas próximas– FRET
Fluorescence ressonance energy transfer (FRET)
CONFIDENTIAL 2023
http://www.mdpi.com/molecules/molecules-17-04047/article_deploy/html/images/molecules-17-04047-g023-1024.png
Moléculas localização– FRET
Fluorescence ressonance energy transfer (FRET)
CONFIDENTIAL 2023
https://www.microscopyu.com/applications/fret/basics-of-fret-microscopy
O que podemos produzir?
CONFIDENTIAL 2023
Aequorea victoria
Como produzir estas proteínas?
CONFIDENTIAL 2023
SPLIT FAST
CONFIDENTIAL 2023
https://doi.org/10.1038/s41467-019-10855-0
Problemas fluorescência
Photobleaching
CONFIDENTIAL 2023
https://micro.magnet.fsu.edu/primer/java/fluorescence/photobleaching/
photobleaching é mau?
Membrana plasmática e difusão - FRAP
CONFIDENTIAL 2023
Fluorescent
Recovery
After
Photobleaching
Single
Particle
Technique
microscopy
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Essential
Cell Biology
CONFIDENTIAL 2023 FOURTH EDITION
Chapter 2
Chemical Components of Cells
CONFIDENTIAL 2023
Qualo constituinte maioritário de
um Organismo ?
CONFIDENTIAL
HO
2023
2
Vantagens água - solvente
Soluções Suspensões
CONFIDENTIAL 2023
Composição aprox. (por massa) bactéria
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Hidratos de Carbono mais complexos
CONFIDENTIAL 2023
Para que servem os Hidratos de carbono?
CONFIDENTIAL 2023
Hidratos de Carbono - Funções
CONFIDENTIAL 2023
LÍPIDOS
CONFIDENTIAL 2023
Ácidos gordos – saturados vs insaturados
Insaturados =
Gorduras vegetais
CONFIDENTIAL 2023
Saturados=Gorduras animais
Representações de ác gordos
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C18:1 D9
triglicerídeos
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Estrutura de um fosfolípido
CONFIDENTIAL 2023
HORMONAS
Outros lípidos
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wikipedia
ÁCIDOS NUCLEICOS
CONFIDENTIAL 2023
Dogma biologia molecular
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DNA
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
BASE Ribonucleósido Desoxirribonucleósido
Adenina Adenosina Desoxiadenosina
Guanina Guanosina Desoxiguanosina
Uracilo Uridina
Citosina Citidina Desoxiuridina
Timina Timina ribonucleósido (muito Desoxitimidina
raro)
Que molécula é esta?
CONFIDENTIAL 2023 3 2
1
5
4
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Essential
Cell Biology
CONFIDENTIAL 2023 FOURTH EDITION
Chapter 4
Protein Structure and Function
http://cnx.org/resources/dd07e14d3e27fe2a7ef27c417bab74ec
Enrolamento
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Nº de aminoácidos / volta
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Ponte de
enxofre
dissulfurada
dissulfeto
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
proteínas) sempre funcionais?
Proteínas: Ativar/Desativar
Sinalização
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Diferente de fosforilação!!!!
Figure 4-39 Essential Cell Biology (© Garland Science 2010)
Proteínas motoras
CONFIDENTIAL 2023
Essential
Cell Biology
CONFIDENTIAL 2023 FOURTH EDITION
Chapter 3
Energy, Catalysis, and Biosynthesis
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
Que biomoléculas são fundamentais nestes processos?
O que fazem
CONFIDENTIAL 2023
Proteínas - enzimas
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
EC 1.4 Acting on the CH-NH2 group of donors
EC 1.5 Acting on the CH-NH group of donors
EC 1.6 Acting on NADH or NADPH
EC 1.7 Acting on other nitrogenous compounds as donors
EC 1.8 Acting on a sulfur group of donors
EC 1.9 Acting on a heme group of donors
EC 1.10 Acting on diphenols and related substances as donors
EC 1.11 Acting on a peroxide as acceptor
EC 1.12 Acting on hydrogen as donor
EC 1.13 Acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases)
EC 1.14 Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
Energia Livre
CONFIDENTIAL 2023
CONFIDENTIAL 2023
“Free energy or Gibbs free energy G, is the energy available in a system to do useful work...”
https://www.sciencedirect.com/topics/earth-and-planetary-sciences/free-energy
Como a célula ultrapassa
CONFIDENTIAL 2023
reações que têm
∆G >0?
CONFIDENTIAL 2023