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ESTIMATIVA DO ÍNDICE DE ÁREA FOLIAR DE COPAS DE ÁRVORES

INDIVIDUAIS DERIVADO DE DADOS LIDAR COM IMAGENS


MULTISPECTRAIS DE ALTÍSSIMA RESOLUÇÃO
Vinícius Bizzo Lopes1 , Matheus Pinheiro Ferreira2
1
Departamento de Engenharia de Defesa, Instituto Militar de Engenharia – IME, Praça Gen. Tibúrcio 80, 22290-270 Rio de
Janeiro, RJ, Brazil, vinicius.lopes@ime.eb.br, 2 Departamento de Engenharia Cartográfica, Instituto Militar de Engenharia –
IME, Praça Gen. Tibúrcio 80, 22290-270 Rio de Janeiro, RJ, Brazil, matheus@ime.eb.br

RESUMO 1. INTRODUÇÃO

A vegetação urbana fornece serviços ecossistêmicos


essenciais como redução da temperatura e sequestro de
carbono. A provisão de serviços ecossistêmicos é uma As árvores urbanas possuem funções ecossistêmicas
função das características do dossel, como o índice de área importantes como: diminuição do efeito das ilhas de
foliar (IAF). Tradicionalmente o IAF é extraído de forma calor, absorção de carbono, regulação do microclima
onerosa e destrutiva, mas com o avanço do sensoriamento local e mitigação da poluição do ar [1, 2]. O crescimento
remoto (SR) pode ser feita de forma rápida e espacialmente desordenado das cidades acarreta muitas vezes em supressão
explícita. Sensores Light detection and ranging (LiDAR) de árvores urbanas, com isso, os serviços ecossistêmicos
a bordo de veículos aéreos não tripulados (VANTs) têm fornecidos por essas árvores são comprometidos. Além disso,
sido utilizados para obter o IAF. Porém, as aquisições de características funcionais das árvores estão relacionadas à
dados de VANTs geralmente cobrem pequenas áreas (≤ 30 provisão de serviços ecossistêmicos [3].
ha), limitando a análise em larga escala. Neste trabalho,
investigamos a possibilidade de extrapolar o IAF obtidos Entre as características funcionais se destaca o índice de
por VANTs de copas de árvores individuais para imagens área foliar (LAI, do inglês leaf area index) que representa
de satélite de altíssima resolução. Os resultados mostram relação entre a área foliar e a área do terreno, sendo medida
que um modelo linear pode recuperar o IAF usando apenas de m2 /m2 . O LAI pode ser ser estimado de forma direta
bandas multiespectrais de satélites de altíssima resolução e indireta. A forma direta consiste na medição da área da
(R²=0,7246). todas as folhas de um indivíduo arbóreo, sendo extremamente
oneroso. Investigações anteriores mostram a capacidade de
Palavras chave – extrapolação, machine learning, imagens estimar o LAI de forma indireta utilizando dados LiDAR [4].
multiespectrais, copas individuais, índice de área foliar. Sensores LiDAR emitem e registram o retorno de milhares
de pulsos laser, fornecendo informações sobre a estrutura
tridimensional da vegetação.

ABSTRACT Recentemente, sensores LiDAR tem sido fabricados para


VANTs, o que permitiu uma maior flexibilização da aquisição
de dados. Entretanto, levantamento por VANTs normalmente
Urban vegetation provides essential ecosystem services such cobrem pequenas áreas (≤ 30 ha) devido a limitações no
as surface temperature reduction and carbon sequestration. tempo de voo. Portanto, torna-se necessário investigar
Ecosystem services provision is a function of canopy maneiras de se extrapolar para grandes tratos as informações
traits such as the leaf area index (LAI). LAI retrievals are derivadas de VANTs, de forma a se fornecer uma visão
traditionally performed in a destructive and costly way. sinóptica acerca de característica da vegetação como o LAI.
With the advancement of remote sensing (SR), LAI can be
estimated in a spatially explicit and fast manner. Light Esta pesquisa visa testar abordagens de extrapolação
detection and ranging (LiDAR) sensors onboard unoccupied do LAI de copas de árvores individuais derivado de um
aerial vehicles (UAVs) have been used to retrieve LAI. levantamento LiDAR baseado em VANT, utilizando imagens
However, UAV data acquisitions usually cover small areas de altíssima resolução (ground sample distance (GSD) ≤
(≤ 30 ha), which limits broad scale analysis. In this work, 0.5 m. Existe um grande desafio para coleta de dados via
we investigate the possibility of upscaling UAV-based LAI VANT em grandes tratos (> 30ha) devido a questões técnicas
retrievals of individual tree crowns (ITCs) to very-high inerentes ao próprio equipamento (por exemplo: a duração
resolution satellite images. We show that, using a linear da bateria do VANT). Com isso, esse estudo tem como
model, one can retrieve LAI using only VHR multispectral motivação desenvolver um método de extrapolação do LAI
bands (R²=0.7246). a partir dos dados coletados por VANT em pequenas áreas
e posteriormente estimar esse LAI para grandes regiões com
Key words – Upscalling, machine learning, multispectral isso é possível especializar o LAI e realizar o monitoramento
images, canopy, leaf area index. dessas áreas de forma recorrente.

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2. MATERIAL E MÉTODOS

2.1. Área de estudo e base de dados de copas de árvores


individuais

A área de estudo deste trabalho é o Jardim Botânico (JBRJ)


localizado na zona sul do município do Rio de Janeiro (lat:
22º58’12.98"S, long: 43º13’30.82"O - SIRGAS2000). O
JBRJ possui aproximadamente 54 hectares, com diversas
espécies arbóreas. Foi realizado o delineamento de 100
copas de árvores individuais do JBRJ tendo como base
em uma imagem VHR, conforme mostra a Fig. 1. A
imagem VHR utilizada no delineamento foi a PLEIADES,
cuja características serão apresentadas a seguir no item 2.2.2.

Figure 2: DJI Matrice 600 Pro equipado com o sensor LiDAR


Velodyne Puck.

2.2.2. Imagens de satélite


Uma imagem PLEIADES foi coletada no dia 07 de Março
de 2022 (no dia do levantamento LiDAR) e realizado o
procedimento de pansharpening utilizando o software ENVI
a partir do algoritmo Gram-Schmidt [5] para a cena ficar
com 50 cm de resolução espacial. A cena que foi utilizada
Figure 1: Local do aerolevantamento no Jardim Botânico do no estudo possui 4 bandas espectrais sendo elas: azul (430
Rio de Janeiro. As copas de árvores individuais utilizadas no
- 550 nm), verde (490 - 610 nm), vermelho (600 - 720
trabalho estão destacadas em vermelho.
nm), infravermelho próximo 1 (750 - 950 nm). A imagem
Primeiramente foi feito a o delineamento das copas das foi disponibilizada com a correção atmosférica, ou seja, em
árvores (Fig. 1) vetorizando as mesmas a partir de um reflectância de superfície.
software livre de geoprocessamento (QGIS). A imagem de Uma imagem WorldView-2 (WV-2) foi coletada no dia 08
satélite (PLEIADES) foi carregada no QGIS e a partir disso, de Março de 2022 (um dia após o levantamento LiDAR). A
de forma manual, foram sendo identificadas copas de árvores cena possui 50cm de resolução espacial e 8 bandas espectrais
individuais do JBRJ e delineadas em um arquivo shapefile de sendo elas: coastal (400 - 450 nm), azul (450 - 510 nm),
polígono utilizando o QGIS. Após o delineamento das copas, verde (510 - 580 nm), amarelo (585 - 625 nm), vermelho
foram extraídos os pixels do interior de cada polígono para (655 - 680 nm), red edge (705 - 745 nm), infravermelho
montar uma tabela com esses dados. Divide-se a tabela em próximo 1 (770 - 895 nm), infravermelho próximo 2 (860
treinamento e teste, utilizando a proporção de 80% para treino - 1040 nm). A imagem foi disponibilizada com a correção
do modelo e 20% para teste do mesmo. atmosférica, ou seja, em reflectância de superfície. Tanto
as imagens PLEIADES quando a WV-2 foram obtidas em
condições atmosféricas livre de nuvens.
2.2. Dados de sensoriamento remoto
2.3. Processamento LiDAR e estimativa do LAI
2.2.1. Levantamento LiDAR
O processamento LiDAR visa a partir do aerolevantamento
Os dados LiDAR foram coletados pelo sensor Velodyne Puck gerar um arquivo único *.las com toda a nuvem de pontos
acoplado ao UAV MAtrice 600 Pro da empresa DJI. Para para, posteriormente, ser realizada a remoção dos ruídos.
a estabilização do sensor durante o aerolevantamento foi Primeiramente, com a nuvem de pontos, foi estimada
utilizado o gimbal de três eixos Ronin-M da DJI e para a distribuição angular das folhas (LAD, do inglês leaf
a coleta de coordenadas foi utilizado o GNSS APX-15 da angle distribution), utilizando a equação de MacArthurHorn
Applanix também acoplado ao VANT e uma base GNSS (Equação 1) [6], onde Dz é a resolução vertical, K é um
Smart Target da Trimble para realizar o pós-processamento coeficiente e pulsos.in e pulsos.out é a quantidade de pulsos
dos dados coletados pelo APX-15. que entram e passam por voxel (unidade de volume do dossel).
O levantamento LiDAR ocorreu no dia 07 de Março de
2022. A área possui aproximadamente 20 ha, o voo foi 1 1
realizado a uma altura de 64 m e com velocidade aproximada LADi = ln(pulsos.ini /pulsos.outi ) × × (1)
Dz K
de 7m/s. A nuvem de pontos obtida possui aproximadamente
400 pontos/m2 A equação de MacArthurHorn também assume que a

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distribuição das folhas no voxel é aleatória. Após calculado o 2m e 3m), depois se obteve a média desses valores de r² para
LAD, é possível obter o LAI a partir da somatório dos LAD cada resolução. Com isso é possível obter a média dos valores
(Equação 2). de r2 e o valor do desvio padrão para cada estimativa de LAI.
n
X
LAD (2) 3. RESULTADOS E DISCUSSÃO
1
Após isso, foi obtido uma imagem com o LAI da região. Com as imagens PLEIADES se obteve r2 médio de 0,22856
O LAI foi calculado com voxels de 50cm para compatibilizar para o GSD =0,5 m e 0,13780 de desvio padrão. Conforme
com a resolução espacial das imagens de satélite utilizadas foi realizada a reamostragem dos pixels para 1m, 2m e 3m os
neste estudo. resultados de r2 foram aumentando, conforme pode ser visto
na Tabela 1.
2.4. Modelo de regressão linear Com as imagens do WV-2 se obteve r2 e desvio padrão de
0,22406 e 0,14463, respectivamente para a resolução de 0,5
Algumas técnicas estatísticas são utilizadas para transformar
m. Após a reamostragem dos pixels se observa resultados
a composição espectral em características biofísicas [7].
mais satisfatórios até a resolução de 3 metros, como média de
Modelos estatísticos de regressão são comumente utilizados
r2 de 0,37395, 0,62465 e 0,66761 para os pixels de 1,0 m, 2,0
para modelar dados a partir de variáveis dependentes e
m e 3,0 m, respectivamente. Esses resultados mostram que
independentes. No caso deste trabalho o LAI obtido com
conforme o tamanho do pixel aumenta, também aumentam os
o aerolevantamento LiDAR será utilizado para modelar as
valores r2 , conforme pode ser visto na Tabela 2.
variáveis independentes de um modelo linear (LM) para
posteriormente o modelo ser correlacionado com os valores
Resolução (m) Média r² Desv. Pad. r²
de reflectância das bandas dos satélites PLEIADES e WV-2.
0,5 0,22856 0,13780
Um estudo também utilizou dados LiDAR e imagens WV-2
1,0 0,42350 0,14465
para estimar o LAI [8], o autor estimou o LAI de uma floresta
em Ontário (Canadá) a partir de dados LiDAR, índices de 2,0 0,67230 0,09881
vegetação e fotografias hemisféricas utilizando um modelo 3,0 0,72465 0,09411
de regressão linear múltipla, obtendo um r² = 0,79 em um
Table 1: Tabela com os resultados médios de r² e desvio padrão
dos exemplos apresentados. Outro estudo também estimou do modelo linear aplicado nas imagens PLEIADES.
o LAI e a porcentagem de cobertura do dossel partir de
dados LiDAR e imagens de satélite (QuickBird) [9] também Resolução (m) Média r² Desv. Pad. r²
utilizando modelos de regressão linear e obteve o maior 0,5 0,22406 0,14463
r²=0,86. 1,0 0,37395 0,15095
O modelo linear que será utilizado neste trabalho irá gerar 2,0 0,62465 0,11405
os parâmetros independentes da equação 3 para o caso das 3,0 0,66761 0,10307
imagens PLEIADES e da equação 4 para as imagens WV-2.
Table 2: Tabela com os resultados médios de r² e desvio padrão
.
do modelo linear aplicado nas imagens WV-2.
LAI = β0 +β1 BLU E+β2 RED+β3 GREEN +β4 N IR+ε
(3) O GSD = 0,5m é o valor tanto das imagens PLEIADES
e WV-2 quanto para a resolução do LAI gerado a partir
do LiDAR e se nota uma média de r² de 0,22 para a
LAI =β0 + β1 COAST AL + β2 BLU E + β3 GREEN extrapolação do LAI em ambas as imagens. Como o
+ β4 Y ELLOW + β5 RED + β6 REDE DGE registro (georreferenciamento) das imagens multiespectrais
+ β7 N IR1 + β8 N IR2 + ε em relação ao LAI gerado pelo LiDAR é fator crucial, esse
(4) valor de r² mostra que existe certo deslocamento entre as
Os parâmetros independentes serão obtidos pelo imagens, fazendo com que os pixels das copas das árvores nas
modelo linear a partir dos dados LAI que foram imagens multiespectrais e no LAI não estejam sobrepostos.
coletados em campo pelo LiDAR acoplado no VANT Com a progressiva reamostragem do tamanho dos pixels
(β0 , β1 , β2 , β3 , β4 , β5 , β6 , β7 , β8 ). Já os parâmetros esse problema vai sendo atenuado, visto que conforme a
dependentes serão as bandas das imagens de satélite dimensão do pixel vai aumenta, os pixels da feições (nesse
multiespectrais. caso, os pixels das copas das árvores) vão se sobrepondo
Com o objetivo de testar a influência da resolução espacial em ambas as imagens (PLEIADES e WV-2, corrigindo
nas estimativas do LAI, as imagens originais (GSD=0,5m) possíveis problemas de deslocamento entre elas), resultando
foram reamostradas para 1m, 2m e 3m utilizando um em melhores valores de r². Logo, com a reamostragem dos
interpolador por vizinho mais próximo. Esse interpolador foi pixels se garante a sobreposição das feições (no caso, as copas
escolhido por modificar menos os valores dos pixels. das árvores) nas imagens multiespectrais e no LAI gerado
Para testar a capacidade de generalização do modelo foram pelo LiDAR. Por isso, observa-se o aumento dos valores
treinados 1000 modelos lineares, escolhendo-se diferentes médios de r² de 0,22 na resolução original para r² = 0,72 nas
copas de treinamento e teste para cada valor a as imagens imagens PLEIADES e r²= 0,66 para as imagens WV-2 (para
originais (GSD=0,5m) e para as imagens reamostradas (1m, um pixel de 3m).

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Os valores das médias de r² para o sensor WV-2 foram #248486/2019 e #259727/2021. MPF agradece o apoio
menores do que para o sensor PLEIADES. Essa diferença do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e
pode ser explicada devido ao deslocamento entre as copas das Tecnológico (CNPq), processo n. 306345/2020-0.
árvores nas imagens dos dois sensores em relação ao LAI,
visto que o delineamento das copas das árvores foi feito na 6. REFERENCES
imagem PLEIADES.
Estudos com abordagens semelhantes, conforme citado no [1] Rudolf S De Groot, Matthew A Wilson, and Roelof MJ
item 2.4, obtiveram resultados semelhantes de r². O maior Boumans. A typology for the classification, description
r² obtido no estudo elaborado por [9] foi 0,86, combinando and valuation of ecosystem functions, goods and services.
dados LiDAR com NDVI e variáveis de modelos de alturas Ecological economics, 41(3):393–408, 2002.
dos dosséis. O outro estudo, que foi elaborado por [8], obteve [2] Francisco J Escobedo, Timm Kroeger, and John E Wagner.
Urban forests and pollution mitigation: Analyzing ecosystem
em um modelo combinado de dados LiDAR com NDVI um
services and disservices. Environmental pollution, 159(8-
r² de 0,79 em um dos casos apresentado. 9):2078–2087, 2011.
O maior valor de r² obtido para o estudo proposto foi
de 0,72465, um valor abaixo dos valores encontrados nos [3] Samson Roeland, Marco Moretti, Jorge Humberto Amorim,
Cristina Branquinho, Silvano Fares, Federico Morelli, Ülo
outros trabalhos, esse fato pode ser explicado devido aos
Niinemets, Elena Paoletti, Pedro Pinho, Gregorio Sgrigna, et al.
outros estudos utilizarem índices de vegetação para auxiliar Towards an integrative approach to evaluate the environmental
na estimativa do LAI. ecosystem services provided by urban forest. Journal of Forestry
A avaliação da qualidade dos dados estimados (ou seja, não Research, 30(6):1981–1996, 2019.
determinísticos) foi feita pelo r2 , que é um valor que possui
[4] Kai Wang, Steven E Franklin, Xulin Guo, and Marc Cattet.
incertezas inerentes associados ao modelo, que são mostradas Remote sensing of ecology, biodiversity and conservation: a
aqui nesse estudo pelo desvio padrão. Em todos os resultados review from the perspective of remote sensing specialists.
se obtiveram valores de incerteza (desvio padrão) baixos. Sensors, 10(11):9647–9667, 2010.
[5] Bruno Aiazzi, Stefano Baronti, Franco Lotti, and Massimo
4. CONCLUSÃO Selva. A comparison between global and context-adaptive
pansharpening of multispectral images. IEEE Geoscience and
A extrapolação (uma estimativa utilizando uma regressão Remote Sensing Letters, 6(2):302–306, 2009.
linear) dos dados LAI gerados pelo LiDAR utilizando as [6] Blaise Tymen, Grégoire Vincent, Elodie A Courtois, Julien
imagens de satélite multiespectrais resultou no maior valor Heurtebize, Jean Dauzat, Isabelle Marechaux, and Jérôme
de r2 0,72465 com 0,09411 de desvio padrão para o pixel Chave. Quantifying micro-environmental variation in tropical
de 3m. Isso significa que a equação do modelo linear está rainforest understory at landscape scale by combining airborne
bem ajustada (ou seja, um modelo preciso e exato, pois tem lidar scanning and a sensor network. Annals of Forest Science,
r2 alto e desvio padrão baixo), podendo ser utilizada para 74(2):1–13, 2017.
estimar o LAI em grandes tratos (> 30 ha), sendo uma [7] Jinru Xue and Baofeng Su. Significant remote sensing
opção não destrutiva, menos onerosa e de logística mais vegetation indices: A review of developments and applications.
simples para os gestores públicos que gerenciam florestas, por Journal of sensors, 2017, 2017.
exemplo. Com isso é possível utilizar esse modelo linear de [8] Graham Pope and Paul Treitz. Leaf area index (lai) estimation in
obtenção de LAI na região do JBRJ e seus arredores, não se boreal mixedwood forest of ontario, canada using light detection
limitando apenas a área do aerolevantamento. Isso gera maior and ranging (lidar) and worldview-2 imagery. Remote sensing,
celeridade na estimativa de informações importantes para a 5(10):5040–5063, 2013.
floresta urbana. Este trabalho também abre oportunidades [9] Alicia MR Griffin, Sorin C Popescu, Kaiguang Zhao, et al.
de pesquisa principalmente utilizando outros parâmetros além Using lidar and normalized difference vegetation index to
do LAI para a elaboração dos modelos de regressão ou até o remotely determine lai and percent canopy cover. Proceedings
uso de imagens hiperespectrais. of SilviLaser, 2008:8th, 2008.

5. AGRADECIMENTOS

Este trabalho é financiado pela Fundação de Amparo à


Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ), processos

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