UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS

PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA

E RECURSOS NATURAIS

luana.carolina_rocha@yahoo.com.br
 A bioquímica é a ciência que descreve em termos
moleculares as estruturas, os mecanismos e os
processos químicos compartilhados por todos os
organismos e estabelece princípios de organização
que são a base da vida em todas as suas diversas
formas, princípios esses referidos como a lógica
molecular da vida.
Fundamentos celulares
 Estruturas:
 Membrana plasmática;
 Citoplasma – citosol + organelas ;
 Núcleo, nucleóide;
 Membrana plasmática:
define o contorno da
célula. Formada por
moléculas de lipídios e
proteínas.
 Citoplasma: volume interno
envolto pela membrana.

 Composto por uma solução

aquosa citosol e uma
grande variedade de
partículas em suspensão.
 Núcleo: armazena o
conjunto completo de
genes presentes no DNA é
armazenado.
 Todos os organismos
vivos se incluem em três
grandes grupos;

 Bactérias: solo, água de

superfície, organismos;
E. coli.

 Arquebactérias:
ambientes extremos,
fontes termais.

 Eukarya: organismos
eucariotos;
 FOTOTRÓFICOS QUIMIOTRÓFICOS
 Capta a luz solar;  Oxidação do
combustível químico;

LITOTRÓFICOS ORGANOTRÓFICOS
• Bactérias sulfurosas; • A maioria das
• Bactérias Bactérias;
hidrogeniônicas; • Todos os eucariotos
não fototrópicos;
 Descrição
 Habitante inofensivo do
intestino;

 Cerca de 2µm de comprimento;

 Podem viver isoladamente ou

formar agregados celulares;

membrana externa
protetora membrana plasmática
interna Camada de
peptidioglicanos
 Membrana citoplasmática
 Bactérias Gram-positivas retém
o corante de Gram devido à
diferença estrutural;

 Cianobactérias possuem um
extenso sistema de membranas;

membrana externa
protetora membrana plasmática
interna Camada de
peptidioglicanos
Envelope celular: membrana +
camadas externas.
Envelope celular: membrana +
camadas externas.

Bactéria gram-negativa
pt.wikipedia.org
 Citoplasma:
•15000 ribossomos;
•1000 tipos diferentes de enzimas;
•1000 compostos orgânicos como
metabólitos e cofatores;

http://www.ucmp.berkeley.edu/bacteria/bacteriamm.html
 Nucleóide e plasmídio:

•molécula única de DNA circular no

nucleóide;
• plasmídio: seguimentos
circulares de DNA presentes no
citoplasma;

http://www.ucmp.berkeley.edu/bacteria/bacteriamm.html
Dimensões Estrutura

 5-10µm de diâmetro;  Núcleo maior e

 Volume mil vezes individualizado;
maior que o de uma  Organelas envoltas por
bactéria membranas;
 Funções específicas;
 Estrutura

 Movimento de um sistema de
endomembranas para outro;

 Proteínas recebem
‘’endereçamentos celulares’;

 Superfície celular, lisossomos

ou vesículas secretoras;
  Homogeinização –
rompimento da célula;
Fracionamento subcelular de
tecidos
a) separação das organelas em
diferentes velocidades;

b) solução isopínica: densidade

aumenta do topo para o
fundo;
Estrutura
• Rede de filamentos
proteicos que atravessam
a célula eucariótica em
várias direções; Filamentos de actina

Função Tipos de filamentos

citoplasmáticos:
• Conferir estrutura e
organização ao citoplasma e
forma à célula;  Filamentos de actina;
• Filamentos de actina e  Microtúbulos;
microtúbulos também
auxiliam na produção de  Filamentos
movimentos nas organelas intermediários;
e na célula inteira;
Estrutura e Dinamismo
• Dinamismo: constante
desmontagem em suas
subunidades e remontagem;

• Localização na célula não é fixa, www.photoree.com

podendo mudar durante as fases
do ciclo celular;

• Na célula há constante
movimento de substâncias e
vesículas reguladas;

• As interações entre o
citoesqueleto e as organelas são
resversíveis e sujeitas à
regulação em resposta a vários
sinais intra e extracelulares;

image.bloodline.net
 Hierarquia da estrutura
organizacional celular;

 Aminoácidos formam
proteínas;

 Monossacarídeos formam
os carboidratos maiores;

aminoácido
 Nucleotídeos formam as
moléculas de DNA;
 As subunidades dessas
moléculas são ligadas
covalentemente;
 Enquanto complexos
supramoleculares são
unidos por ligações mais
fracas;

Celulose

www.scielo.oces.mctes.pt
 Monômeros de
proteínas e ácidos
nucleicos;
1) Defina Bioquímica.
2) Cite e explique as principais estruturas da célula.
3) Dê o diâmetro das células animais e dos
microrganismos.
4) Descreva dos três domínios da vida: Bacteria,
Archea e Eukarya.
5) Diferencie os organismos de acordo com seu
habitat e a forma de obtenção de energia.
6) Descreva a Escherichia coli.
7) Diferencia a célula animal e a célula vegetal.
8) Explique a função do citoesqueleto.
Diferencie a função dos diferentes filamentos.
9) Cite as principais macromoléculas e seus
monômeros.
10) O que deve ser observado quando se
realiza um estudo in vitro.
•Principais elementos encontrados nos seres vivos.
•A composição da matéria viva é impressionantemente
diferente do mundo inanimado;
•Lavoisier (1743-1794) – mundo animal, mundo vegetal
e mundo mineral;
•Similaridade química entre a oxidação da glicose em células musculares e
em leveduras (a queima da glicose envolve os mesmos 10 intermediários
químicos e
As mesmas 10 enzimas);
•Os quatro elementos químicos (H,O,N,C) mais abundantes no organismo
vivo
Constituem 99% da massa das células;
Unidade bioquímica: todos os seres vivos participam dos mesmos processos
e intermediários químicos.
•Elementos mais leves, capazes de formar eficientemente de uma a quatro
Ligações;
•Elementos mais fracos formam as ligações mais fortes;
•Elementos-traço, fração minúscula do peso do corpo mas essenciais.
Hemoglobina- ferro=0,3% da massa total;
 Carbono constitui mais da c
metade do peso seco das
células;

 Pode formar ligações simples

com o átomo de hidrogênio e
ligações simples e duplas
com os átomos de oxigênio e
nitrogênio;

 Átomo de carbono pode

formar ligações simples com
até quatro átomos de
carbono;

 Podem compartilhar de dois

a três pares de elétrons
formando ligações duplas e
triplas;
 As quatro ligações simples
do átomo de carbono
podem ser representadas
como os quatro vértices de
um tetraedro;

 Ângulo de aprox. 109,5º

entre duas ligações;

 Rotação livre em torno de

cada ligação simples;

 Ligação dupla é mais curta

e rígida, rotação limitada
em torno de seu eixo;
 Estrutura do aminoácido alanina

 Átomos de carbono
podem formar cadeias
lineares, ramificadas e Cadeia linear
estruturas cíclicas;

 Versatilidade do carbono;

 Forma moléculas com

diversidade de tamanhos,
formas e composição;
 O átomo de hidrogênio
pode ser substituído por
uma grande variedade de
grupos funcionais
formando várias famílias
de compostos orgânicos;

 Cada qual com suas

características químicas e
de reação;

 Algumas biomoléculas
são polifuncionais;
 álcool amina éster
aldeído tioéster
amida
cetona éter
Ácido guanidina anidrido
carboxílico

metil imidazol Anidrido misto

etil sulfidrila
dissulfeto fosforaldeído

fenil
fosforila
Acetil-coenzima A
 Coleção de biomoléculas no
citosol das células inclui
aminoácidos comuns,
nucleotídeos, açúcares e
seus derivados fosforilados;

 As moléculas são polares e

solúveis em água;

 Estão aprisionadas no
interior das células porque
a membrana plasmática é
impermeável a elas;

 Metaboloma: conjunto de
moléculas em uma dada
célula;
 Existem biomoléculas
pequenas, específicas para
certos tipos de células ou
organismos;

 Metabólitos secundários:
moléculas pequenas que
exercem papéis específicos
para a vida da planta.

 Conferem à planta seus

aromas característicos e
compostos como morfina,
quinina, nicotina e cafeína;
importantes efeitos
fisiológicos nos seres
humanos;
 Polímeros com peso
molecular acima de
5000 que são
montadas a partir de
precursores simples;

 Polímeros mais curtos

são denominados
Oligômeros;

 macromoléculas feitas
de monômeros cujos
pesos moleculares são
500 ou menos;
 As macromoléculas podem
ainda sofrer processamentos
adicionais que resultam em
complexos
supramoleculares;

 Associação de duas ou mais

espécies químicas mantidas
por unidas por forças
intermoleculares; Ex: ligações
de hidrogênio, interações
doador-aceptor, ou ligações
iônicas;

 Os cromossomos
representam um complexo
supramolecular formado de
DNA associado a proteínas;
 Proteínas: polímeros
longos de
aminoácidos,
constituem a maior
fração da célula(além
da água);

 Atividade catalítica
funcionando como
enzimas;
 Proteínas:
 Elementos estruturais,
receptores de sinais;

 Transportadores;

 As mais versáteis das

biomoléculas;

 Proteoma: o conjunto
de proteínas em
funcionamento em
uma célula;
 Ácidos nucleicos: DNA e
RNA são polímeros de
nucleotídeos;

 Armazenam e
transmitem a informação
genética;

 Algumas moléculas de
RNA também apresentam
função estrutural e
catalítica em alguns
complexos
supramoleculares;
 Polissacarídeos: são
polímeros de açúcares
simples como a glicose;

 Três funções principais:

 Reservatórios de
combustível de alto
conteúdo energético;

 Componentes estruturais
rígidos da parede celular
em plantas e bactérias;

 Elementos de
reconhecimento
extracelular;
 Lipídeos: derivados de
hidrocarbonetos
insolúveis em água;

 Servem como
componentes estruturais
das membranas;

 Depósitos de
combustível;

 Pigmentos e sinais
celulares;
 Proteínas, polinucleotídeos
e polissacarídeos
apresentam um grande
número de subunidades
monoméricas acarretando
em alto peso molecular;

 Na faixa de 5000 e mais de

1 milhão para proteínas, e
vários bilhões para ácidos
nucleicos;
 Macromoléculas
informacionais: dadas a suas
sequências características e
subunidades ricas em
informação, proteínas e
ácidos nucléicos são
chamados de macromoléculas
informacionais;
A sequência de bases
nitrogenadas no DNA fornece a
informação para a elaboração
de um RNA e por fim de uma
proteína.
 Estereoquímica: arranjo
tridimensional dos átomos de
uma biomolécula;

 Representações de
biomoléculas:
a) Fórmula estrutural em
perspectiva
b) Modelo bola e bastão
c) Modelo de volume atômico

 As interações entre
biomoléculas são
invariavelmente
estereoespecíficas;
Modelo bola e bastão: Modelo volume
 Requerem configurações mostra o ângulo e o atômico: cada átomo é
específicas nas interações comprimento das representado pelo seu
moleculares; ligações. raio de van der Waals.
 Configuração: ordem pela
qual diferentes
substituintes ligados a um
átomo central, estabelecem
ligações covalentes. Pode
ser alterada somente
mediante a quebra de
ligações covalentes; 2,2,4-trimetilpentano

 Conformação: disposição
dos átomos no espaço que
pode ser mudada por
rotação em torno de
ligações simples, sem
quebrar ligações
covalentes;

Alanina
 Estereoquímica: arranjo
tridimensional dos átomos
de uma biomolécula;

 Os compostos de carbono
normalmente existem como
estereoisômeros;

 Moléculas nas quais a

ordem das ligações é a
mesma mas a relação
espacial dos átomos é
diferente;

 Estereoisômeros não
podem ser interconvertidos
sem quebrar
temporariamente uma ou
mais ligações covalentes;
Isomeria Plana Isomeria geométrica
 Isômeros geométricos:
diferem quanto ao arranjo
de seus grupos
substituintes com respeito
a dupla ligação;

 Cis: grupos ficam do

mesmo lado de ligações
duplas;

 Trans: grupos em lados

opostos;

 um sítio de ligação que é

complementar a uma
dessas moléculas não será
complementar a outra;
 Centro quiral: um átomo
de carbono com quatro
substituintes diferentes é
considerado assimétrico e
é chamado de centro
quiral.

 Uma molécula com

apenas um carbono quiral
pode ter dois
estereoisômeros;

 Quando dois ou mais

carbonos quirais estão
presentes então podem
existir 2n
estereoisômeros;
 os grupos substituintes
podem ser rearranjados
em duas diferentes
formas, gerando
estereoisômeros com
propriedades distintas;

 Somente um dos
estereoisômeros é
biologicamente ativo;
 Enantiômeros:
estereoisômeros que
são a imagem
especular um do
outro;
Enantiômeros

 Diastereoisômeros:
pares de
estereoisômeros que
não são as imagens
especulares um do
outro;
diastereoisômeros
 Os enantiômeros têm
propriedades quase
idênticas, mas
diferem quanto a
interação com a luz Enantiômeros
polarizada;

 Em duas soluções
separadas, dois
enantiômeros giram
o plano da luz
polarizada em
direções opostas;
diastereoisômeros
 Dar o nome e
representar a
estrutura de cada
biomolécula;

 Compostos com mais

de um centro quiral –
nomenclatura RS;

 A cada grupo
funcional ligado ao
carbono quiral é
designada uma
ordem de prioridade;
 Configuração R: se
a prioridade dos 3
outros grupos
cresce no sentido
horário;

 Configuração S: se
cresce no sentido
anti-horário;
 Cada carbono
quiral é designado
como R ou S;

 A inclusão destas
designações no
nome do
composto fornece
descrições
inequívocas da
estereoquímica de
cada centro quiral;
 Capacidade de distinguir
estereoisômeros;

 A estrutura tridimensional de
biomoléculas grandes e
pequenas é de máxima
importância nas suas
interações biológicas;

 Reagente-enzima; hormônio e
receptor na superfície da
célula, antígeno e anticorpo;

 Se o sítio de ligação de uma

proteína é complementar a
um isômero do composto
quiral, então ele não será
complementar ao outro
isômero;

 Células vivas produzem

somente uma forma quiral de
uma dada biomolécula;
1) Quais os elementos químicos comumente
encontrados nos seres vivos?
2) Descreva o átomo de carbono quanto ao
número de ligações e esquematize um átomo
de carbono formando quatro ligações.
3) Explique por que o átomo de carbono pode
formar uma grande variedade de biomoléculas.
4) Dê o grupo funcional encontrado em: alcoóis,
aminas, aldeídos, cetonas e ácidos carboxílicos.
5) Explique o que seria metaboloma da célula, e
descreva quais as principais moléculas
encontradas no interior das células.
6) O que são os metabólitos secundários das plantas.

7) Descreva a função de cada uma das macromoléculas:

proteínas, ácidos nucleicos, polissacarídeos, lipídeos. Cite
os monômeros de cada uma.

8) Diferencie configuração e conformação.

9) Represente o aminoácido alanina na fórmula estrutural

plana, no modelo esfera e vareta e no modelo do volume
atômico.

10) Defina e represente um centro quiral.

11) Defina isomeria plana e cite exemplos.

12) Defina isômero geométrico e cite exemplos.

13) Diferencie estereoisômeros e diestereoisômeros.

1) O que é unidade bioquímica?
2) Esquematize um átomo de carbono fazendo 4
ligações, mostre os ângulos entre as ligações.
3) O que são complexos supramoleculares?
4) Dê um exemplo de um complexo
supramolecular.
5) Cite 4 funções que uma proteína pode assumir.
6) O que é estereoquímica?
7) Diferencie configuração e conformação.
8) Por que enantiômeros mesmo tendo química
similar assumem papéis biológicos diferentes?
9) O que é um carbono quiral?
10) Defina estereoespecificidade.
 As reações de síntese que
ocorrem dentro da célula
exigem entrada de energia;

 Assim como o armazenamento

e a expressão de informação;

 As conversões de energia www.liv-arcoiris.pt

celular podem ser estudadas no
contexto das leis da
termodinêmica;

 Um dos objetivos da bioquímica

é compreender em termos
químicos e quantitativos, os
meios pelos quais a energia é
extraída, canalizada e
consumida nas células vivas;

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 As moléculas presentes
nos seres vivos diferem
em tipo e concentração
em comparação ao
meio;
 As moléculas e íons contidos
nos organismos vivos diferem
em tipo e concentração das
moléculas presentes no meio
circundante;

 Os organismos são diferentes

na sua composição se
comparados ao seu meio e
mantém uma composição
quase constante ao atingir a www.shutterstock.com
maturidade; Uma bactéria no solo possui
composição diferente em
relação ao seu meio.
 As moléculas de hemoglobina presentes
no organismo e as moléculas de glicose
estão sendo convertidas em CO2 e água;

 Pequenas moléculas e complexos

supramoleculares são continuamente
sintetizados e degradados em reações
químicas que envolvem um constante
fluxo de massa e energia;

 As taxas de síntese ou ingestão desses

compostos contrabalançam a taxa de
degradação, consumo ou conversão em
outro produto;

 A constância da concentração é resultado

de um estado estacionário dinâmico, fora
do equilíbrio;
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 Investimento constante de energia;
 Um organismo é um sistema
aberto pois troca tanto
matéria quanto energia com Tipo de Sistema Características
seu meio;
Não troca matéria
 Os organismos obtêm energia Isolado e nem energia
do meio de duas formas:1) com seu meio.
pela oxidação de
combustíveis químicos, 2) Troca energia
absorvem energia da luz Fechado
mas não matéria.
solar;
Troca energia e
 Princípio da conversão de Aberto matéria com seu
energia: as células contém meio.
sofisticados processos
conversores de energia;

 Exemplo: conversão de
energia química em energia
mecânica;
Ruptura da água libera elétrons para
redução do CO2 e a liberação de
oxigênio para a atmosfera

6 CO2 + 6 H2O C6H12O6 + 6 O2

Fotossíntese

Oxidação de produtos ricos em

energia passam os elétrons para o
O2 para formar água, CO2 e outros
produtos finais.
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O + energia

Respiração celular
 Autótrofos e heterótrofos
participam do ciclo global de O2
e CO2 tornando interdependentes
esses dois grupos de
organismos;

 Fluxo de elétrons de uma

molécula a outra na célula é
equivalente ao fluxo de elétrons
em um circuito elétrico;

 Todas as reações envolvidas no

fluxo de elétrons são reações de
oxidação e redução;

 Um reagente é oxidado (perda de

elétrons) e outro é reduzido
(ganho de elétrons);

 Toda oxidação é acompanhada

de redução, na qual um grupo
que recebe elétrons adquire os
elétrons removidos pela
oxidação.
 DNA, RNA e proteínas são
moléculas de informação;

 Além de usar energia química

para formar ligações
covalentes entre essas
subunidades, as células
necessitam investir energia
para ordenar as subunidades
na sequência correta;
 A variação da energia livre ΔG: variação de
energia durante as reações químicas;

 Variação da entalpia ΔH: expressa o número e o

tipo das ligações;

 Variação da entropia ΔS: descreve a variação da

aleatoriedade do sistema;

 T: temperatura absoluta em Kelvin (K);

ΔG = ΔH - T ΔS
 ΔG = ΔH - T ΔS

 ΔH é negativa para uma reação que libera energia;

 Um processo tende a ocorrer espontaneamente se ΔG for

negativo - se energia livre é liberada no processo;

 Proteínas e ácidos nucleicos possuem energia de formação

positiva – necessitam de energia para serem sintetizados;

 As células acoplam reações consumidoras de energia –

endergônicas, com reações que liberam energia-
exergônicas;
 A fonte usual de energia livre em reações
biológicas acopladas é a energia liberada pela
quebra das ligações presentes no trifosfato de
adenosina;

 Quando as duas reações estão acopladas então a

soma ΔG1 e ΔG2 é negativa- a reação libera
energia;

Aminoácidos proteínas ΔG1 positiva (endergônica)

ATP ADP + P ΔG2 negativa (exergônica)

 Bioenergética: estudo da
transformação de
energia em sistemas
vivos;

 Mecanismo acopla
objeto em queda a outro
menor;

 Quanto maior a elevação

do objeto grande maior
a quantidade de energia
a ser liberada;
 Em sistemas fechados as
reações químicas
ocorrem
espontâneamente até
que o equilíbrio seja
alcançado;

 Quando um sistema está

em equilíbrio, a taxa de
formação dos produtos
se iguala exatamente à
taxa que os produtos
são convertidos em
reagentes;
 Reação exergônica:
ΔG negativo,
produtos possuem
menos energia que
os reagentes;

 Reação endergônica:
ΔG positivo,
necessitam de
injeção de energia;
 Reação endergônica:
 Uma reação
exergônica pode ser
acoplada a uma Glicose + Pi Glicose-6-fosfato
reação endergônica;

Reação exergônica:

ATP ADP + P

Acoplamento:

Glicose + ATP Glicose-6-fosfato + ADP

 Biocatalisadores,
aumentam bastante a
velocidade das reações
químicas sem serem
consumidas no
processo;

 Energia de ativação: a
diferença de energia
entre o reagente no
seu estado
fundamental e em seu
produto;
 Metabolismo: rede de rotas catalisadas por
enzimas;

 Anabolismo: iniciam com moléculas

precursoras pequenas e convertem-nas
progressivamente em moléculas maiores;

 Catabolismo: degradam nutrientes orgânicos

em produtos finais simples;
 O acréscimo da concentração de um produto inibe a atividade catalítica
da primeira enzima da rota de um complexo de enzimas;

 Se a célula produzir mais leucina do que necessita, o acréscimo de sua

concentração inibe a atividade catalítica da primeira enzima da rota;
1) O que é estado estacionário dinâmico?
2) Explique por que os organismos são
considerados sistemas abertos?
3) O que é Bioenergética?
4) Defina reação exergônica.
5) Defina reação endergônica.
6) Defina metabolismo.
7) O que são enzimas?
8) Explique o que é a retroalimentação inibitória.
9) O que representa a fórmula da variação de
energia livre?
10) Cite um exemplo de acoplamento de reações
químicas.
 A informação genética é codificada nos 4 tipos de
desoxirribonucleotídeos de DNA;

 A hélice dupla do DNA contém um molde interno

para sua própria replicação e reparo;

 A sequência linear de aminoácidos em uma proteína,

que está codificada no DNA pelo gene daquela
proteína, produz a estrutura tridimensional específica
daquela proteína;

 Macromoléculas individuais com afinidade específica

tem a capacidade de se auto-organizar em
complexos supra-moleculares;
 Polímero que possui
instruções para formar A sequência de bases
todos os outros nitrogenadas no DNA
componentes celulares e fornece a informação
provê o molde para
produção de moléculas de para a elaboração de
DNA idênticas a serem um RNA e por fim de
distribuídas aos uma proteína.
descendentes por ocasião
da divisão celular;

 A perpetuação de uma
espécie requer que sua
informação genética seja
mantida de modo estável,
expressa com exatidão na
forma de produtos dos
genes e reproduzida com o
mínimo de erros;
 A capacidade dos seres
vivos em preservar o
material genético e
duplicá-lo resulta da
complementaridade
entre as duas fitas de
DNA;

 Cada nucleotídeo
pareia-se
especificamente com
outro complementar na
fita oposta;
 Uma sequência linear
de DNA codifica a
produção de uma
proteína com sequência
linear;

 Posteriormente a
proteína se dobra em
uma forma
tridimensional
determinada pela
sequência de
aminoácidos;
 3 condições:

 Enovelamento do DNA
em cromossomos;

 Desenvolvimento de
estruturas envoltas por
membrana;

 Desenvolvimento de
estruturas capazes de
realizar fotossíntese e
respiração celular;
 Associações endossimbióticas que se tornaram
permanentes;
 Mutação: alteração permanente no DNA passada aos descendentes, base
da teoria Darwiniana;

 Teoria da evolução: compartimento envolto por membrana contendo

RNA autorreplicante;

 Formação dos componentes celulares nas condições primitivas;

 Os papéis catalíticos e genéticos exercidos pelos primeiros genomas de

RNA foram ao longo do tempo sendo realizados por proteínas e DNA;

 Teoria da endossimbiose: demonstra como as células adquiriram a

capacidade de promover fotossíntese e fosforilação oxidativa;

 Filogenia: o conhecimento das sequências completas de nucleotídeos

dos genomas de organismos e tentativa de encontrar parentesco;
 Formação dos componentes celulares nas
condições primitivas;
 Resolver lista de exercícios do capítulo 1 –
Fundamentos de Bioquímica (Parte 4);