08/03/2021

Células procariontes Células eucariontes

Envoltório nuclear Ausente Presente

DNA Desnudo Combinado com proteínas
GENES E GENOMA Cromossomas Únicos Múltiplos

PROCARIÓTICO Nucléolos
Divisão
Ausentes
Fusão binária
Presentes
Mitose e meiose
Biologia Molecular Ribossomas 70S* (50S + 30S) 80S (60S + 40S)
Endomembranas Ausentes Presentes
Mitocôndrias Ausentes Presentes
Cloroplastos Ausentes Presentes em células vegetais
Parede celular Não celulósica Celulósica em células vegetais
Exocitose e endocitose Ausentes Presentes
Citoesqueleto Ausente Presente

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Introdução
• Clados de Wöese-

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GENOMA DE Methanococcus jannaschi

Introdução
• Apesar da sem elhanç a e simplicidade entre Bact éria s e Arc ha e, os
pr ocari ot os e m geral sã o or ga ni sm os mai s het er ogê ne os do pont o  Arqueobactéria isolada de solo da base de um vulcão
de vi sta de sua s c onsti tuiç ões ge nética s do que or ga ni sm os
submarino a 2.600 m de profundidade.
eucarióticos,  Cresce a 85 graus centígrados em pressão de mais de 200
• Grande diversidade genética; plasticidade. atmosferas e na ausência de oxigênio.
• Primeiro genoma sequenciado: Bactéria Haemophilus influenzae em
 Assim como outras arqueobactérias, apresenta sistema de
1995.
processamento de informação similar ao de eucariotos
• O segundo foi de uma espécie do clado Archae: Methanocaldococcus
jannaschii em 1996.

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Comparação- organização genica

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Genoma de E.coli Organização gênica em Procariotos

• Diferentes modalidades de DNA-

• Cromossomos- possuem todos os genes para funcionamento da

célula- genes Housekeeping

• Plasmídeos- DNA extracromossomais

• Transposons- elementos genéticos móveis

• Bacteriófagos - vírus de bactérias

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Cromossomo
Organização gênica em Procariotos procariótico

TRANSPOSONS BACTERIOFAGO PLASMÍDIO Estrutura co mp acta-

nucleóide-
Cro matin a: Inte ração
com p rote ínas (não
histon as c o mo e m
eucariotos) e RNAs

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Genes Procarióticos- Estrutura Básica

Cada gene é constituído de:
(E está orientado de 5’- 3’)

• Uma região codificadora:

O QUE É UM GENE?
Pode s er de finid o c omo: segme nto de DN A
que in clui tod as as se quên ci as nu cleotídi c as
neces s ári as e su fi cientes p ara a síntes e de
pelo m eno s, u m p rodut o co rres pon dente,
que, pode se r um RN Am a se r t radu zido em
uma cadeia de proteína.
• Sequências reguladoras que flanqueiam a região codificadora
• Região montante- Upstream- da região codificante
• Região Jusante- Downstream- da região codificante
• Promotores- região do DNA onde se ligam as RNA polimerases para
transcrição
• Terminadore s- região downstrea m

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Upstream
Downstream
Colineariedade/ tamanho
• COL INEARIEDA DE : E xata c orr espondê ncia e nt re o gene e a
sequência de aminoácidos da proteína
• Considera ndo que a cada códon- 3 bases- 1 aminoácido:
• par a uma pr ot eína com n ami noáci do é nece ssária uma re giã o
codificadora com 3n pares de bases.
• Par a uma pr ot eí na c om 13 6aa t ere mos um ge ne c om 408pb e m
procariotos.
• TAM A NHO: tam anho de um gene e stá vinc ula do a o núm er o e à
extensão da sequências de nucleotídicas (codificadora/re gula dora)
• Ex: E. col i tam anho m é dio das re gi õe s c odifica dora s- 971 pb-
equiv ale nt e a pr oxima dame nt e 3 05 ami noáci dos a o fi nal da sínte se
da proteína.

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Colineariedade Homologia entre genes procarióticos

HOMOLOGIA : similaridades total ou parcial evidentes
nas sequências de seus genes:
• Homologias decorrem de processos evolutivos como:

• Duplicação seguida de divergência;

• Transferência gênica horizontal;

• Especiação.

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Homologia entre genes procarióticos

• Ge ne s Par ál ogos: sequênci a homologa e ntr e dois ge ne s ( no m esm o
ge noma) re sulta do da duplic açã o de um a r egi ã o x do cr om ossom o-
ger a cópi a idê ntica- se gui da de pr e ssão seleti va- O pr odut o d o
gene é relacionado mas, não idêntico na funcionalidade.

• Pse udogene s- pel a pr essã o sele tiva o ge ne duplic ado (a nt e s

parálogo) se torna “não funcional”- perda da funcionalidade.

• Ge ne s Ort ól ogos- em ge noma s de espécie s disti nt as ( anc e stra l

com um) se quê ncia s e pr odut os similar e s- qua nt o mai or o númer o
de genes ortólogos entre duas espécies, maior grau de parentesco

• Ge ne s Xenól ogos- ge ne s or tólogos i nduzi dos por tr ansf erê nci a

horizontal- plamídeos

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Genomas procarióticos- tamanho

•Tamanho do genoma:
•Variam de tamanho dentro de uma ampla faixa
•150.000 pb a 13.000.000 pb.
•O tamanho dos genomas de espécies de um
mesmo filo pode variar em até 10 vezes.
•Conceito de genoma mínimo: o menor genoma
capaz de abrigar o número mínimo necessário
de genes para sobrevivência de uma forma de
vida celular.

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Genomas procarióticos- tamanho Organização do cromossomo procariótico

• Todos os genomas procarióticos são de DNA fita dupla- um único
cromossomo • Organizados em cromossomos- ordem de centenas ou milhares de
• Essa universalida de não se estende para outros aspectos: como quilobase s- com genes essenciais
forma, quantidade de DNA e tipo de organização. • Extracromossomai s: Moléculas menores de DNA- plasmídeos ou
• A maioria das espécies de bactérias e arqueas têm seu DNA Circular megaplasmíde os- dezenas a poucas centenas de quilobases
covalentemente fechado • Proporção:
• 1.000pb = 1kb
• 10.000.000 (dez milhões)pb= 1 Mb
• Em Archaea a amostragem de genomas é menor- presença de um
cromossomo circular fita dupla.

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Replicons
• Organização dos cromossomos em réplicons que pode diferir entre
Bactérias e Archaea
• CONCEITO:
• Replicons são unidades de replicação- onde se aloca uma região de
origem da replicação.
• Em bactéria cada cromossomo possui somente uma origem de
replicação
• Em Archae há espécies que possuem um cromossomo com uma
duas ou três origens de replicação- dois/três replicons
• Em eucariotos um cromossomo possui centenas a milhares de
origens de replicação- Traço evolutivo????

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Motivos
• São sequências nucleotídicas curtas, em geral de dois
até algumas dezenas de pb de extensão.
• Podem estar agrupadas ou dispersas no genoma.
• Ex: os Sítios Chi – sítios preferenciais de
recombinação em E.coli
5’-GCTGGTGG-3’
Repetições
• Sequências repetitivas também estão presentes em procariotos
(2%) porém em menor quantidade do que em eucariotos (50%)
• Unidades curtas com menos de 10pb
• Estão presentes diferentes famílias de sequência s repetitivas que
podem estar distribuídos de maneira aleatória ou em Tandem
• A presença de muitas famílias de sequência repetitivas em genomas
de procariotos é explicada pela atividade de elementos genéticos
móveis.

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Genes procariotos
• Num genoma de qualquer sp há um repertório de
genes que deve suprir todos os produtos gênicos
necessários à sobrevivência do organismo.
• Pangenoma - re pe rt óri o gênic o t otal de uma det ermi na da
espécie, ou
“o conj unt o de gene s c om partil ha dos por todos os i sola dos,
linhagens da espécie ou seja GENOMA CENTRAL.”

• O ge ne s pre se nt e s em al gum a s linha ge ns ma s, não em t odas sã o

denominados- GENOMA DISPENSÁVEL-
Ex: genes de resistência- e genes para hospedeir os específicos.

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Genes procariotos Óperons- conceito

• A maioria dos genes está presente em apenas uma
cópia-
• baixo grau de redundância gênica-
• Os raros casos são os genes que sintetizam RNAr-
onde há um número maior de genes- 15 em bactérias
e 4 em archea.
• Estratégia é elevar os níveis de transcrição.
• Unidade funcional do genoma, na qual duas ou mais regiões
codificadoras de um produto gênico (ptas ou RNAs) ocupam
posições adjacentes, estão co-orientadas e têm a sua
transcrição controlada por um mesmo conjunto de
sequências reguladoras.
• Óperons que codificam produtos funcionalmente relacionados/
• ou seja óperons que codificam diferentes enzimas que fazem
parte da mesma rota metabólica.

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Óperons Óperons
• Diferentes regiões codificadoras de um óperon são CO-
TRANSCRITAS- em um único produto de RNA-
Promotor Região Codificadora Terminador
• Por isso que o RNA é chamado POLICISTRÔNICO-
• Essa estratégia representa uma otimização da maquinaria
reguladora da célula- expressão coordenada ao mesmo
tempo e nos mesmos níveis.
Promotor Terminador
• REGIÕES INTERCISTRÔNICA- extensão de sequências
entre as regiões codificadoras adjacentes de um óperon
OPERON

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Estrutura de um operon

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Dinâmica evolutiva dos genomas procarióticos
Plasticidade genômica: capacidade de possuir
dispositivos para gerar var iantes genotípicas e
fenotípicas com potencial adaptativo.
Ação dos processos evolutivos sobre o genoma dos
procariotos:
1- processos inovadores
2- processos que determinam perda de sequência
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1- Duplicação seguida de divergência
•Uma segunda cópia de uma dada região
genômica é gerada e os pares de genes
duplicados podem divergir pelo acúmulo
diferencial de mutações ao longo do
tempo.
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Processos Inovadores
• Processos que levam ao surgimento de novas
sequências ou novas combinações de sequências pré-
existentes
✓ Aumenta a complexidade de um genoma
procariótico
Para que isso ocorra há três mecanismos:
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2- Transferência gênica horizontal
• Novas sequências são incorporadas ao genoma de uma dada
espécie por mediação de elementos genético móveis-
• Transposons/ plasmídeos/ bacteriófagos
• Surgimento do MOBILOMA- repertório genético composto
por genes que foram ganhos por inserção via elementos
genéticos moveis extracelulares ou mesmo intracelulares.
• A dinâmica do MOBILOMA é força fundamental para evolução
dos procariotos
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Processos que determinam a perda de

3- Fusão de replicons
•É uma união covalente e estável a longo
prazo de dois replicons originalmente
independentes-
sequências gênicas
• Redução da complexidade dos genomas
• Diminuição do tamanho do genoma
• Perda da variabilidade
Três processos envolvidos:
1- seleção purificadora: elimina de uma população
variantes genéticas não adaptativas.
2- simplificação genômica: perda de sequências não
funcionais- (seqs intervenientes e repetitivas)
3- degradação genômica: contração- perda / deriva
genética (pop pequenas)/ baixa frequência de
recombinação

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