gua, pH e Tampo

1. O que significa pH de uma soluo e como pode ser

determinado?
O potencial hidrogeninico reflete a concentrao de ons H+ ou
H3O+ na soluo. Pode ser calculado pela frmula: pH= - log [H+].
Assim, quanto menor o valor do pH, mais cida a soluo.

2. Cite os valores de pH de trs solues aquosas

presentes no corpo humano.
Suco gstrico: pH 2, aproximadamente
Sangue: pH 7,4, aproximadamente
Saliva: pH 6,7, aproximadamente

3. Explique Ka e pKa e relacione com cidos fracos e

fortes.
O Ka a constante de equilbrio de um cido, que pode ser
determinada pela frmula: Ka =[ X+] [Y-] / [XY]. O pKa o
logartmo negativo do Ka, ou seja: pKa = - log Ka. Assim sendo,
quanto maior o Ka, menor ser o valor do pKa e como Ka a
constante cida, por deduo sabe-se que quanto mais forte o
cido, maior o Ka e menor o pKa.

4. Conceitue sistema tampo, descreva sua constituio e

seu funcionamento.
Sistema tampo um sistema aquoso que resiste s variaes de
pH quando quantidades relativamente pequenas de cido ou base
so adicionadas soluo. Este sistema constitui-se por um cido
fraco e sua base conjugada (p. ex. cido actico e acetato) em
concentraes aproximadamente iguais. O funcionamento ocorre
pelo equilbrio de duas reaes reversveis, em que o cido fraco
serve como doador de prtons (H+) para neutralizar OH+ de uma
base adicionada e sua base conjugada serve como aceptor de
prtons para neutralizar os H+ de um cido adicionado.

5. Defina tampes biolgicos, cite um dos principais

tampes no organismo humano e seu local de atuao.
Tampes biolgicos so sistemas existentes no organismo, que
resistem s mudanas de pH, com objetivo de manter o pH
fisiolgico ideal dos compartimentos, visto que isso necessrio
para suas reaes qumicas e seu adequado funcionamento. Um
dos principais tampes o sistema H2CO3 e seu conjugado HCO3-,
que est presente no sangue humano.

6.

Quais fatores determinam a eficincia de um tampo?

Um fator a concentrao do cido e de sua base conjugada, j

que quanto maior forem suas concentraes, maior ser a
quantidade de H+ ou OH- que sero capazes de neutralizar. Outro
fator importante seu valor de pKa, pois os tampes so
eficientes apenas em determinada faixa de pH e sua mxima
eficincia coincide com seu pKa.

7. Cite os constituintes dos tampes fosfato e

bicarbonato e descreva de que forma mantido o pH
quando ocorre a adio de cido ou base soluo.
O tampo fosfato, que tem pK de 6,7-7,2, constitudo pelo par
HPO42-/H2PO4- e mantm o pH neutralizando os H+ do cido
adicionado pela reao com HPO42- (aceptor de prtons), formando
H2PO4-, ou neutralizando os OH- da base pela doao de um prton
do H2PO4-, formando H2O e HPO42-. O tampo bicarbonato, que
tem um pK de 6,1, constitudo pelo par H2CO3/HCO3- e mantm o
pH neutralizando os H+ do cido adicionado pela reao com o
HCO3- (aceptor de prtons), formando o H2CO3, ou neutralizando os
OH- da base pela doao de um prton do H2CO3, formando H2O e
HCO3-.

Aminocidos, peptdeos, protenas (estrutura e

funo) e enzimas

1. Descreva a estrutura de um aminocido em sua forma

predominante em pH neutro, cido e
bsico.
R

Em pH neutro predomina a forma zwitterion do aminocido

NH3+ C COO-

R
H

Em pH cido, o a.a. um doador de prtons

NH3+ C

COOH

Em pH bsico, o a.a. um aceptor de prtons

NH2 C COO-

2. Explique como ocorre a formao de uma ligao

peptdica, desenhe a ligao peptdica.
A ligao peptdica ocorre entre o grupo amino de um a.a. e o
grupo carboxlico de outro a.a., com desidratao.
3.

O que so oligopeptdeos e polipeptdeos?

Peptdeos so formados pela juno de diversos a.a., atravs de

ligaes peptdicas. So considerados oligopeptdeos os que
contm poucos resduos de a.a., at 30, e polipeptdeos os que
contm milhares de a.a. (geralmente so chamados polipeptdeos
os que tm peso at 10.000 daltons, acima disso geralmente so
chamados protenas).

4. Classifique os aminocidos de acordo com suas

cadeias.
- Apolares: so os a.a. cujo grupo R um hidrocarboneto ou
hidrofbico, como alanina, valina, leucina e isoleucina;
- Aromticos: so os a.a. cujo grupo R contm um anel
aromtico, como fenilalanina, tirosina e triptofano;
- Polares: so os a.a cujo grupo R hidroflico, mas no
carregado, como serina, cistena, asparagina, glutamina e
treonina;
- Positivas (bsicas): so os a.a. cujo grupo R tem carga positiva
em pH 7, como lisina, arginina e histidina;
- Negativas (cidas): so os a.a. cujo grupo R tem carga negativa
em pH 7, como aspartato e glutamato.

5.

Escreva uma frase usando os seguintes termos:

- ligao peptdica: A ligao peptdica ocorre por uma reao

de condensao, com a perda de gua, muito comum nas clulas
vivas.
- extremidade carboxlica: A extremidade carboxlica
determina o final da cadeia polipeptdica.
-cadeia polipeptdica: Em uma cadeia polipeptdica de 1000 a.a.
h 999 ligaes peptdicas.
-cadeia lateral: So as cadeias laterais que definem a natureza
qumica do a.a..
-extremidade amnica: A extremidade amnica determina o
incio da cadeia polipeptdica.

-estrutura secundria: Uma protena pode formar uma

estrutura secundaria do tipo -hlice ou do tipo -pregueada.

6. Pesquise e escreva como formada uma ponte

dissulfeto e cite a importncia deste tipo de ligao no
enovelamento de protenas.
A ponte dissulfeto formada por oxidao entre dois resduos de
cistena, formando a cistina. Estes resduos de cistena podem
estar em cadeias polipeptdicas diferentes ou na mesma.

7. Conceitue, cite exemplos e descreva a funo de

protenas presentes no organismo humano.
Protenas so cadeias polipeptdicas que formam estruturas
espaciais secundrias, tercirias e quaternrias bem definidas e
caractersticas, tendo funo a partir da estrutura terciria.
- Hemoglobina: responsvel pelo transporte de O2 no sangue
- Tripsina e pepsina: so enzimas relacionadas digesto
- Insulina e glucagon: so hormnios que regulam a concentrao
de glicose no sangue

8. Descreva as caractersticas dos diferentes nveis e

estrutura em protenas.
A estrutura primria da protena refere-se a simples seqncia
linear de a.a., especfica da protena, tendo um grupo amino livre
em uma extremidade e um grupo carboxlico livre na outra. A
estrutura secundria espacial e ocorre pelos ngulos de rotao
das ligaes covalentes do polipeptdeo, sendo que as formas
hlice e pregueada so as mais comuns (mais estveis
termodinamicamente). A estrutura terciria deve-se ao
dobramento final da cadeia polipeptdica pelas interaes no
covalentes entre os carbonos laterais. A estrutura quaternria
descreve a associao de duas ou mais cadeias polipeptdicas,
para compor assim uma protena funcional oligomrica.

9.

Dar exemplos de aminocidos que apresentam:

- um grupo amino e dois grupos carboxlicos: aspartato e

glutamato
-um grupo carboxlico e dois grupos aminos: arginina e
histidina
-calcular o ponto isoeltrico de cada um deste tipo de
aminocido:
- aspartato: pI 2,77 ((pK1+pKR)/2=pI, (1,88+3,65)/2=2,77);
- glutamato: pI 3,22 ((pK1+pKR)/2=PI, (2,19+4,25)/2=3,22);
- arginina: pI 10.76 ((pK2+pKR)/2=PI, (9,04+12,48)/2=10,76);
- histidina: pI 7,59((pK2+pKR)/2=PI, (9,17+6)/2=7,59);

10. Escrever as formas inicas predominantes da glicina

(pK1= 2,35; pK2=9,78) e suas cargas lquidas em pH=1,
pH=2,35, pH=7, pH=9,78 e pH=12. Calcular o pI.
Em pH 1 sua carga lquida +1, em pH 2,35 sua carga lquida 0,
em pH 7 sua carga lquida 0, em pH 9,78 sua carga lquida -1 e
em pH 12 sua carga lquida -1. Seu PI
6,01((2,35+9,78)/2=6,01)).

11. Definir protenas globulares e fibrosas. Cite exemplos.

Protenas globulares so enoveladas, com formato
aproximadamente esfrico e geralmente solveis, como exemplo
a hemoglobina. Protenas fibrosas so filamentosas, com cadeias
polipeptdicas muito longas, geralmente insolveis e de funo
estrutural, como exemplo o colgeno.

12. Esquematizar os tipos de ligaes que mantm a

estrutura terciria de uma protena indicando os
aminocidos que podem participar dessas ligaes.

A estrutura terciria decorre da formao de pontes dissulfeto

(entre duas cistenas), pontes de hidrognio, interaes
hidrofbicas e interaes inicas.

13. O que estrutura quaternria. Cite exemplos.

Este tipo de estrutura ocorre pela formao de uma protena
multicadeias, cujas estruturas tm associao no covalente. Por
exemplo, temos a hemoglobina, formada por duas subunidades
e duas subunidades .

14. O que ponto isoeltrico de uma protena? Como ele

pode ser determinado?
o ponto de pH em que o nmero de cargas positivas se equivale
ao nmero de cargas negativas, ou seja, pH em que a protena
apresenta o mesmo nmero de grupos carboxlicos desprotonados
e grupos amino protonados.

15. Definir desnaturao de uma protena e descrever o

efeito do pH e temperatura sobre a estrutura das
protenas.
Desnaturao a perda da estrutura nativa secundria, terciria
e/ou quaternria (no necessariamente da primria) resultando
em perda da funo. Protenas submetidas a alteraes de pH
e/ou temperatura podem perder a estabilidade das interaes no
covalentes que mantm sua estrutura.

16. Cite 3 exemplos de protenas com funo no

enzimtica.
Hemoglobina, insulina e colgeno.

17. Quanto estrutura da hemoglobina conceitue:

- as subunidades e como se associam: forma-se pela

associao de duas subunidades e duas subunidades ,
associadas de forma no covalente
- mudanas estruturais durante a oxigenao e
desoxigenao: quando desoxigenada, a hemoglobina
encontra-se em um estado T, que menos favorvel a ligao
com o O2 do que com o bifosfogliceto, quando o primeiro O2 ligase hemoglobina, esta muda seu estado conformacional para o
estado R, no qual afinidade pelo O2 muito maior que pelo
bifosfoglicertao.
- stio de ligao com oxignio: cada uma das quatro
subunidades da hemoglobina possui um grupo prosttico heme,
que contm uma protoporfirina IX com um Fe+2, ao qual se liga o
O2.
- o que estabiliza a ligao do oxignio molecular com o
grupo Heme: as mudanas conformacionais, de T para R, e a
interao com a histidina distal.

18. O que cooperatividade. Cite um exemplo.

Cooperatividade a influncia que a unio de um ligante a um
protmero tem sobre a unio de um ligante a outro protmero em
uma protena oligomrica. Como exemplo, temos a ligao do
primeiro O2 hemoglobina, que coopera positivamente para a
ligao dos demais O2 as demais subunidades.

19. Descrever o efeito do BPG sobre a oxigenao da

hemoglobina, qual o papel do mesmo no organismo?
O BPG uma substncia presente no sangue que tem maior
afinidade do que o O2 pela desoxihemoglobina. Assim, quando a
hemoglobina encontra-se no estado T liga-se ao BPG e quando
est no estado R liga-se preferencialmente ao O2. O papel do BPG
reduzir a afinidade da hemoglobina pelo O2 e aumentar sua
liberao nos tecidos, onde a presso de O2 baixa.

20. O que efeito Bohr? Qual a sua importncia

fisiolgica?

 um fenmeno relacionado com o aumento do carter cido

quando a hemoglobina est ligada ao O2 e aumento do carter
bsico causado pela desoxigenao, favorecendo a liberao do
O2 e a ligao da desoxihemoglobina aos H+ no tecido e a
liberao dos H+ e ligao do O2 nos pulmes, favorecendo o
controle do pH.

21. Qual o papel das Histidinas para o efeito Bohr? Por

qu?
Elas podem assumir diferentes valores de pKa, dependendo do
estado da hemoglobina, assumindo pKa menor na forma R e maior
na forma T, contribuindo com 50% dos H+ que podem ser
liberados.

22. Qual o papel dos aminocidos carregados

negativamente para o efeito Bohr? Por qu?
Outros grupos cidos da hemoglobina contribuem com o H+
adicional, devido a quedas anlogas em seus valores de pKa na
mudana de conformao de T para R.

23. Comparar a hemoglobina fetal (HbF) e hemoglobina de

adultos (HbA) quanto a estrutura e afinidade por oxignio.
Estruturalmente a HbF e a HbA diferenciam-se porque a HbF
formada por duas cadeias e duas cadeias , enquanto a HbA
formada por duas cadeias e duas cadeias . A HbF adaptada
ao ambiente do feto e obtm O2 do sangue da me, que mais
pobre em O2 do que a atmosfera, assim sua afinidade pelo O2
deve ser maior do que a afinidade da HbA.

24. Dar um exemplo de uma hemoglobina anormal

indicando a alterao que a mesma apresenta.
A hemoglobina falciforme (HbS) formada por um erro na
formao da protena da cadeia , ocorrendo a troca de apenas
um a.a. da cadeia (o glutamato substitudo pela valina na
posio 6 da cadeia ).

25. A forma de calcular o pI de uma aminocido, um

oligopeptdeo e uma protena a mesma? Explique.
No. Pois em um a.a. basta fazer a mdia entre pK1 e pK2, nos
oligopeptdeos esse procedimento j torna-se mais complexo pelo
grande nmero de resduos e no preciso pela possvel alterao
nos valores de pK aps as ligaes peptdicas, por fim nas
protenas o simples clculo no possvel pelos mesmos motivos
dos oligopeptdeos e pela ocorrncia das interaes entre os a.a.
ao longo da formao das estruturas secundria, terciria e
quaternria.

26. Um peptdeo A apresenta a sequncia especificada

abaixo. Calcule a carga lquida deste peptdeo e responda:
se este oligopeptdeo fosse submetido ao uma eletroforese
no desnaturante, para que plo ele migraria, positivo ou
negativo? Por qu?
Extremidade-amino-histina-cidoglutmico-glicina-asparagina-valina-fenilalaninaprolina-extremidade carboxlica.

A carga lquida deste oligopeptdeo 0 (histidina +, Ac.

glutmico -) e por ser neutro no se desloca na eletroforese.

27. Definir enzima, substrato e stio ativo.

Enzima um catalisador biolgico, substrato o reagente que se
liga enzima e que formar o produto aps a reao e stio ativo
o local da enzima ao qual se liga o substrato especfico.

28. Descrever o mecanismo da ao enzimtica

A enzima, que um catalisador, tem funo de diminuir a energia
de ativao de uma reao qumica dentro de um organismo vivo
e assim aumentar a velocidade desta reao. Para isso, ela possui
um stio ativo, onde um substrato especfico ir se ligar e
consequentemente haver a formao do produto.

29. Comparar o efeito da presena de uma enzima e do

aumento da temperatura sobre os parmetros da reao.
H trs maneiras de aumentar a velocidade de uma reao:
aumentar a concentrao dos reagentes; aumentar a temperatura
da reao; adicionar um catalisador (enzima). No entanto, se o
aumento da temperatura for excessivo, pode desnaturar a enzima
protica e prejudicar a reao.

30. Alistar as vantagens das enzimas em relao a

catalisadores no enzimticos.
Diminuem a energia de ativao, so muito especficas com
relao ao substrato, so sintetizadas pelas prprias clulas e
podem ter sua concentrao e atividade moduladas.

31. Fazer o grfico da velocidade de uma reao

catalisada enzimaticamente, em funo da concentrao
do substrato. Descrever os fatores que afetam a
velocidade da reao.
A velocidade da reao afetada pela concentrao do substrato
disponvel.

32. Definir estado de transio, energia de ativao e

energia de ligao.
A energia de ativao a energia necessria para levar os
reagentes ao estado de transio, que um estado reativo,
intermedirio entre os reagentes e os produtos. Energia de ligao
a energia necessria para quebrar uma determinada ligao
qumica.

33. Definir constante de Michaelis-Menten (Km), mostrar a

relao entre o seu valor e a afinidade da enzima pelo seu
substrato.
A constante de Michaelis-Menten reflete a concentrao de
substrato necessria para que a velocidade da reao esteja a

50% de seu mximo. Esta constante tambm prediz a afinidade

da enzima pelo seu substrato, assim quanto menos o valor do Km,
maio a afinidade da enzima pelo substrato. A equao de
Michaelis-Menten Vo = Vmx [S] / Km + [S]

34. Descrever a transformao de Lineweaver-Burk e pare

que serve.
Lineweaver-Burk transformaram a equao de Michaelis-Menten
invertendo-a, assim obtiveram um grfico linear (uma reta) em
vez da hiprbole retangular. Desta forma o valor da Vmx e de Km
podem ser obtidos com maior preciso.

35. Definir inibidor competitivo e no competitivo, dar

exemplos.
Inibidor no competitivo liga-se a um stio diferente do stio de
ligao do substrato. A inibio no revertida pelo aumento da
concentrao de substrato, ele comporta-se como se estivesse
removendo a enzima da soluo, resultando na diminuio do
Vmx. Como exemplo: metais pesados.
Inibidor competitivo um inibidor cuja ao pode ser revertida
pelo aumento nas quantidades de substrato. So estruturalmente
semelhantes ao substrato e ligam-se ao stio de ligao ao
substrato, competindo assim com o substrato pela enzima. Uma
vez ligado a enzima no pode converter o inibidor em produto.
Como exemplo: na reao de succinato desidrogenase, malonato
estruturalmente semelhante ao succinato e um inibidor
competitivo.

36. Citar exemplos de inibidores competitivos utilizados

como agentes teraputicos.
O AZT inibe a transcriptase reversa necessria para a replicao
do HIV. A sulfanilamida um agente antibacteriano porque
compete com o cido p-aminobenzico, que necessrio para o
crescimento bacteriano.

37. Descrever sobre anlogos de substratos e como

podem ser empregados como quimioterpicos.
Anlogos de substratos so estruturalmente semelhantes ao
substrato, assim agem como inibidores competitivos. Por
exemplo: o fluoruoracil um anlogo da timina em que o metil
ligado ao anel substitudo pela fluorina. O desoxinucleotdeo
deste composto um inibidor irreversvel da timidilato sintetase.

38. Fazer o grfico 1/Vo x 1/[S] sem inibidor, na presena

de inibidor competitivo e na presena de inibidor no
competitivo. Descreva as caractersticas de cada um deles.
O ponto em que a reta intercepta o eixo y neste grfico construdo a partir
da equao de Lineweaver-Burk permite calcular com preciso o valor do Km. A
inclinao da reta reflete a afinidade da enzima pelo substrato, sendo que quanto
mais inclinada (menor valor de Km), maior a afinidade.

Na presena de inibidor competitivo ocorre alterao da afinidade da enzima pelo

substrato, assim surge o chamado Km aparente. A Vmx permanece alterada.

A presena de um inibidor no competitivo altera tanto a Vmx quanto o valor do Km.

39. Definir cofator. Dar exemplos de cofatores inorgnicos

e orgnicos.
Cofatores so molculas orgnicas ou inorgnicas pequenas que
uma apoenzima (parte protica de uma enzima sem quaisquer
cofatores ou grupos prostticos, que podem ser requeridos para
que a enzima seja funcional) requer para sua atividade. Por
exemplo, na lisina oxidase o cobre est fracamente ligado, mas
necessrio para que a enzima seja ativa. Exemplos inorgnicos:
ons metlicos (K+, Fe2+, Mg2+). Exemplos orgnicos: denominados
de coenzimas, como as vitaminas.

40. Descrever os mecanismos principais de regulao da

atividade enzimtica. Cite exemplos.
A regulao da atividade enzimtica pode ser feita pela
retroalimentao, regulao alostrica e modificao covalente,

em que a enzima pode ser estimulada ou inibida pela ao dos

mesmos.

41. Caracterizar enzimas alostricas. Definir stio ou

centro alostrico, e regulador (ou efetuador) positivo e
negativo.
Enzimas alostricas so aquelas que tm um stio adicional para
responder aos moduladores, diferente do stio ativo. Um stio
alostrico uma regio singular da enzima, completamente
diferente do stio de ligao ao substrato. Os ligantes que podem
se ligar ao stio alostrico so chamados de moduladores
alostricos. Moduladores alostricos positivos aumentam a
afinidade da enzima pelo substrato ou por outro ligante. O inverso
verdadeiro para moduladores alostricos negativos. O stio
alostrico em que o efetor positivo liga-se referido como um
stio ativador. O efetor negativo liga-se a um stio inibidor.

42. Definir o grfico Vo X [S] de uma reao catalisada por

uma enzima alostrica e compare com o grfico de uma
enzima Michaeliana.
Neste grfico, a curva central representa uma reao Michaeliana. A curva superior
representa a presena de um modulador positivo e a inferior de um modulador
negativo. Um modulador negativo pode produzir uma curva de saturao pelo
substrato mais sigmoidal.

43. Definir regulao alostrica por modificao covalente.

Exemplificar.
Algumas enzimas tm sua atividade regulada por modificaes
covalentes, pela ligao de grupos, como por exemplo fosfato,
adenosina, monofosfato, uridila monofosfato, adenosina difosfato
ribose e grupos metila. Esses grupos geralmente so ligados
covalentemente e removidos da enzima reguladora por outras
enzimas.