Prof. Dr.

Carlos Alberto de Almeida Gadelha

Aminocidos
J aneiro de 2013
Universidade Federal da Paraba
Departamento de Biologia Molecular
Disciplina de Bioqumica Estrutural
Introduo
Os aminocidos so o alfabeto pela qual est escrita a
linguagem da estrutura protica.
Aminocidos
Peptdios
Protenas
Conceito
So compostos de dupla funo, uma
funo amina e uma funo carboxlica, ambas
ligadas a um mesmo carbono , ao qual tambm
se ligam um tomo de hidrognio e um grupo R
ou cadeia lateral. Tem como frmula geral:

H
3
N - C - H
COO
-
R
- C -
Carbono
COO
-
Grupo carboxila

H
3
N
Grupo amino
R
Radical ou cadeia lateral
H
Assimetria do carbono
Estereoqumica
Estereoqumica
Todos os aminocidos padres, exceto a glicina, tm um
tomo de carbono assimtrico, sendo um centro quiral;
e por isso mesmo, estas biomolculas podem ocupar
imagens especulares no superponveis. Estas duas
formas so chamadas ismeros ticos, enantimeros ou
estereoismeros.
Aminocidos
Molculas
assimtricas
Oticamente
ativas
Molculas no sobreponveis = imagens especulares
Fisica e quimicamente indistingveis
Giram o plano de luz polarizada em direes opostas
Estereoqumica
Isomeria
Estereoqumica
Isomeria
Estrutura dos
Aminocidos
Comparada
Estrutura do
Gliceraldedo
Conveno de Fisher (1891)
OH C H
CHO
CH
2
OH
H C OH
CHO
CH
2
OH
L-Gliceraldedo D-Gliceraldedo
Estereoqumica
Isomeria
OH C H
CHO
CH
2
OH
L- Gliceraldedo
NH
3
+
C H
COO
-
Radical
L-Aminocido
Estereoqumica
Isomeria

H
3
N- C - H
COOH
R
H - C -

H
3
N
COOH
R
L-aminocido D-aminocido
Estereoqumica
Ocorrncia dos ismeros

H
3
N- C - H
COOH
R
L-aminocido
Protenas
encontradas em
humanos
H - C - NH
3

COOH
R
D-aminocido
Alguns antibiticos e
em peptdios presentes
em bactrias
Polarmetro o aparelho tico, que permite identificar se uma substncia
possui poder rotatrio e saber se dextrgira ou levgira.
'
1 - Lmpada com filamento de sdio;
2 - Tubo cilndrico;
3 - Nicol polarizador - polariza a luz natural monocromtica, emitida pela lmpada de sdio;
4 - Pequeno tubo cilndrico transparente, que contm a soluo diluda da substncia a ser analisada;
5 - Nicol analisador - capta a luz polarizada, que atravessou o tubo cilndrico contendo a soluo em anlise;
6 - Disco graduado fixado ao Nicol analisador, que permite a leitura do ngulo do desvio da luz polarizada se
for o caso;
7 - Olho do observador.
De 1 a 7 - eixo de propagao da luz.
OBS.: Tanto o Nicol polarizador como o Nicol analisador so constitudos de dois cristais de carbonato de
clcio, conhecidos por espato de Islndia, e esto colados por uma resina chamada de blsamo do Canad.
Polarmetro
Polarmetro o aparelho tico, que permite identificar se uma substncia
possui poder rotatrio e saber se dextrgira ou levgira.
'
1 - Lmpada com filamento de sdio;
2 - Tubo cilndrico;
3 - Nicol polarizador - polariza a luz natural monocromtica, emitida pela lmpada de sdio;
4 - Pequeno tubo cilndrico transparente, que contm a soluo diluda da substncia a ser analisada;
5 - Nicol analisador - capta a luz polarizada, que atravessou o tubo cilndrico contendo a soluo em anlise;
6 - Disco graduado fixado ao Nicol analisador, que permite a leitura do ngulo do desvio da luz polarizada se
for o caso;
7 - Olho do observador.
De 1 a 7 - eixo de propagao da luz.
OBS.: Tanto o Nicol polarizador como o Nicol analisador so constitudos de dois cristais de carbonato de
clcio, conhecidos por espato de Islndia, e esto colados por uma resina chamada de blsamo do Canad.
Polarmetro
Como funciona um polarmetro ?
1- Coloca-se o pequeno tubo cilndrico (4), contendo a soluo diluda da
substncia a ser analisada, no interior do polarmetro.
2 - A lmpada de sdio (1) acesa e pela fenda emerge luz natural monocromtica
(amarela), que incide sobre o Nicol polarizador (3). A luz natural aquela que vibra
transversalmente em todas as direes, perpendiculares a um eixo de propagao.
3 - Ao atravessar o Nicol polarizador, a luz emergente, polarizada, que vibra num
nico plano de vibrao, atravessa o pequeno tubo cilndrico transparente com a
soluo diluda da substncia em anlise.
4 - A luz polarizada, que emerge da soluo, atravessa o Nicol analisador e incide
no olho do observador.
5 - Se a luz polarizada ao incidir no olho do observador no mudar a rotao do
disco graduado, isto , manter-se em 0, a substncia analisada inativa por no
apresentar as condies para a ocorrncia da isomeria tica (assimetria molecular)
ou trata-se de um ismero tico inativo (racmico ou meso).
6 - Se para a luz polarizada incidir no olho do observador for necessrio girar o
disco graduado para a direita ou para a esquerda, a substncia oticamente ativa:
dextrgira (desvio para a direita) ou levgira (desvio para a esquerda).
Polarmetros
Ampla Faixa de Aplicaes Industriais Refinarias de acar, Pesquisa
universitria, Sabores e Fragrncias, leos essenciais, Identificao e
caracterizao de produtos qumicos, Concentrao de acar e Pureza em
alimentos, etc.
Estereoqumica
Princpios da Isomeria tica
- Uma substncia cuja frmula estrutural espacial assimtrica admite isomeria
tica.
- Sempre que existir uma substncia que desvia a luz polarizada de um certo
ngulo + (dextrgira), haver na natureza um ismero tico que desvia a luz
polarizada de um certo ngulo - (levgira), desde que ambas sejam analisadas
sob as seguintes condies:
- mesma temperatura;
- dissolvidas no mesmo solvente;
- com o mesmo comprimento de onda (luz amarela de sdio).
OBSERVE NA FIGURA ABAIXO UMA ANIMAO DO FUNCIONAMENTO DO POLARMETRO.
Abreviaturas
Aminocido Trs letras Uma letra
Alanina Ala A
Arginina Arg R
Asparagina Asn N
Asparato Asp D
Cistena Cys C
Fenilalanina Phe F
Glutamato Glu E
Glutamina Gln Q
Glicina Gly G
Histidina His H
Isoleucina Ile I
Leucina Leu L
Lisina Lys K
Metionina Met M
Prolina Pro P
Serina Ser S
Treonina Thr T
Triptofano Trp W
Tirosina Tyr Y
Valina Val V
Abreviaturas dos aminocidos
20 L-Aas
Todas as
protenas
sntese
20! = 2,4 x 10
18
molculas diferentes
A B C
B C A
A C B
C
A B
A
B C
A B C
O papel que os aminocidos
desempenham nas protenas est
relacionado s propriedades
qumicas dos radicais

H
3
N- C - H
COO
-
R
Apolares - radicais hidrofbicos (9)
Polares- radicais no ionizveis (6)
Polares - radicais ionizados negativamente (2)
Polares- radicais ionizados positivamente (3)
Classificao dos Aminocidos
Alanina/Ala
Glicina/Gli
Valina/Val
Leucina/Leu
Isoleucina/Ile
Prolina/Pro
Fenilalanina/Phe
Metionina/Met
Triptofano/Trp
Aminocidos com radicais hidrofbicos
Aminocidos
H - C -
COO
-
NH
3
+
Alanina
CH
3
H - C -
COO
-
H
Glicina
NH
3
+
H - C -
COO
-
NH
3
+
Valina
CH
3
CH
3
CH
H - C -
COO
-
NH
3
+
CH
3
CH
3
CH
2
- CH
Leucina
H - C -
COO
-
NH
3
+
Isoleucina
CH
2
- CH
3
CH
3
CH
H C -
COO
-
NH
3
+
Fenilalanina
CH
2
-
H - C -
COO
-
NH
3
+
N
H
CH
2
-
Triptofano
(CH
2
)
2
- S - CH
3
COO
-
NH
3
+
Metionina
H-C -
CH - COO
-
H
H
2
C
N
CH
2
H
2
C
Prolina
Serina/Ser
Treonina/Thr
Tirosina/Tyr
Cistena/Cys
Glutamina
Asparagina
Aminocidos com radicais polares
no ionizveis
Aminocidos
H - C - NH
3
+
COO
-
CH
2
-
OH
Serina
H - C - NH
3
+
COO
-
CH - OH
CH
3
Treonina
H-C -
COO
-
NH
3
+
Tirosina
OH
CH
2
-
H - C - NH
3
+
COO
-
CH
2
- SH
Cistena
Glutamina
H- C -
COO
-
NH
3
+
(CH
2
)
2
- C - O
NH
2
Asparagina
H - C -
COO
-
NH
3
+
CH
2
- C - O
NH
2
Glutamato/Glu
Aspartato/Asp
Aminocidos com radicais ionizados
carregados negativamente
Aminocidos
Glutamato
H- C -
COO
-
NH
3
+
(CH
2
)
2
- COOH
Aspartato
H - C -
COO
-
NH
3
+
CH
2
- COOH
Lisina/Lys
Histidina/His
Arginina/Arg
Aminocidos com radicais ionizados
carregados positivamente
Aminocidos
H - C -
COO
-
NH
3
+
Lisina
(CH
2
)
4
- NH
2
H - C-
COO
-
NH
3
+
Histidina
N NH
CH
2
-
COO
-
NH
3
+
- (CH
2
)
3
- NH - C - NH
2
NH
Arginina
H - C
Protenas
Aminocidos
Prof. Dr. Carlos Alberto de Almeida Gadelha
Protdios - Aminocidos
Aminocidos
Carter anftero
Dissociao dos aminocidos
Ponto isoeltrico
Apresentam pelo menos um grupo
carboxlico e um grupo amino
Aminocidos tm como frmula geral

H
3
N - C - H
COOH
R
Aminocidos
Anftero
Anftero. [do gr.amphteros, um e outro.]
Adj. 1. Que rene em si duas qualidades
opostas. 2. Qum. Que ora reage como cido,
ora como base.
Os aminocidos so anflitos:
Carter Anftero
H
2
N - C - H
COO
-
R
H
+
+
H
3
N- C - H
COOH
R
+
+
H
3
N- C - H
COOH
R
OH
-
H
2
N - C - H
COO
-
R
+
Esta propriedade mostra que a
dissociao dos grupos amino e
carboxlico varia, dependendo da
variao do pH do meio.
Carter Anftero
Um aminocido em soluo aquosa
H- C - NH
2
COO
R
Dissociao dos Aminocidos
H
3

H
+
H
+
H
+
H
+
H
+
pH=1
Dissociao dos Aminocidos
Um aminocido em soluo aquosa
H- C - NH
COO
R
H
OH
-
OH
-
OH
-
OH
-
-
H
gua
pH=9
3

2
H
pH=2
De forma geral, ao fazer a titulao de um Aa
com uma base, iniciando-se em pH=1 observa-
se que o pH da soluo aumenta at
aproximadamente pH=2 quando o grupamento
COOH comea a liberar ons H
+
para o meio,
formando gua.
H- C - NH
3
+
COO
-
R
COOH
R
H- C - NH
3
+
+ OH
-
pK
1
Dissociao dos Aminocidos
H
2
O
on dipolar
COO
-
R
H-C-NH
3
+
+ OH
-
H-C-NH
2
COO
-
R
pK
2
Continuando a adio de base o pH ir
progressivamente se elevando at que o grupo NH
3
+
tenha condies de liberar seu on H
+
, o que ocorre
prximo ao pH 9 .
Dissociao dos Aminocidos
H
2
O
on dipolar
Dissociao dos Aminocidos
COO
-
CH
3
H-C-NH
3
+
H-C-NH
2
COO
-
CH
3
COOH
CH
3
H- C - NH
3
+
pK
1
pK
2
Regio de
tamponamento
devida ao
grupo -COOH
Regio de
tamponamento
devida ao
grupo -NH
2
Base- capta prtons do meio
cido -doa prtons para o meio
+
H
3
N- C -H
COOH
R
+
H
3
N- C- H
COO
-
R
H
2
N- C- H
COO
-
R
Forma
Isoeltrica
pK
1
pK
2
A+
A-
Aminocido
Monoaminomonocarboxlico
Curva de dissociao da Glicina
Dissociao dos Aminocidos
Quando o aminocido apresenta
mais de um grupo ionizvel no
radical, este aminocido possui
mais um pK, o pK
R
.
Aminocido
Monoaminodicarboxlico
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COOH
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COO
-
COOH
CH
2
COOH
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COO
-
H
2
N-CH
Forma
Isoeltrica
pK
1
pK
R
pK
2
A+ A- A--
COOH
CH
2
NH
3
+
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
NH
2
H
2
N-CH
Forma
Isoeltrica
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
NH
3
+
pK
1
pK
2
pK
R
A++ A+ A-
H
2
N-CH
COO
-
CH
2
NH
3
+
Aminocido
Diaminomonocarboxlico
pKa dos aminocidos
+
H
3
N- C -H
COOH
R
+
H
3
N- C -H
COO
-
R
H
2
N- C -H
COO
-
R
on Dipolar
A
pI
on Positivo
A+
pH < 7
on Negativo
A-
pH > 7
Ponto Isoeltrico
o pH no qual a molcula do
aminocido apresenta igual n
o
de
cargas positivas e negativas
Encontra-se eletricamente neutro
on dipolar ou zwitterion
Ponto Isoeltrico
O clculo do pI baseia-se nas formas
de dissociao do aminocido
utilizando os pK
s
anterior e posterior
forma isoeltrica do aminocido.
Clculo do pI
Aminocido Monoaminomonocarboxlico
pI = pK
1
+ pK
2
2
Clculo do pI
+
H
3
N- C -H
COOH
R
+
H
3
N- C- H
COO
-
R
H
2
N- C- H
COO
-
R
Forma
Isoeltrica
pK
1
pK
2
A+
A-
Aminocido Monoaminomonocarboxlico
pI = pK
1
+ pK
2
2
Glicina
pK
1
=2,3
pK
2
=9,8
pI = 2,3 + 9,8
2
pI=6,05
Aminocido Monoaminodicarboxlico
pI = pK
1
+ pK
R
2
Clculo do pI
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COOH
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COO
-
COOH
CH
2
COOH
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
COO
-
H
2
N-CH
Forma
Isoeltrica
pK
1
pK
R pK
2
A+
A- A--
Aminocido Monoaminodicarboxlico
pI = pK
1
+ pK
R
2
pI = 1,9 + 3,9
2
Aspartato
pK
1
=1,9
Pk
R
=3,9
pI=2,9
Aminocido Diaminomonocarboxlico
pI = pK
2
+ pK
R
2
Clculo do pI
COOH
CH
2
NH
3
+
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
NH
2
H
2
N-CH
Forma
Isoeltrica
+
H
3
N-CH
COO
-
CH
2
NH
3
+
pK
1
pK
2
pK
R
A++ A+ A-
H
2
N-CH
COO
-
CH
2
NH
3
+
Aminocido Diaminomonocarboxlico
pI = pK
2
+ pK
R
2
pI = 9,3 + 6,0
2
pI=7,6
Histidina
pK
2
=9,3
pK
R
=6,0
Aminocidos cidos
Grupamentos presentes na cadeia lateral que se
encontram ionizados no pH fisiolgico
H- C -
COOH
NH
2
(CH
2
)
2
- COOH
Glutamato -carboxila
H - C -
COOH
NH
2
CH
2
- COOH
Aspartato -carboxila
Aminocidos Bsicos
Grupamentos presentes na cadeias laterais que se encontram
ionizados no pH fisiolgico
H - C -
COOH
NH
2
(CH
2
)
4
- NH
2
Lisina -amino
H - C-
COO
H
NH
2
N NH
CH
2
-
- (CH
2
)
3
- NH - C - NH
2
COOH
NH
2 NH
H - C
Histidina imidazol
Arginina guanidnio