Fundamentos da Bioquímica ​ @livsmartina

Conceito determinados íons e moléculas; ​proteínas

O estudo da bioquímica mostra como o receptoras transmitem sinais para o interior
conjunto de moléculas inanimadas que da célula; e ​enzimas de membrana participam
constituem os organismos vivos interagem em algumas rotas de reações.
para manter e perpetuar a vida exclusivamente ➪Como os lipídeos individuais e as proteínas
pelas leis físicas e químicas que regem o da membrana não estão covalentemente
universo inanimado. ligados, toda a estrutura é
extraordinariamente flexível​, permitindo
A Lógica Molecular da Vida mudanças na forma e no tamanho da célula.
A bioquímica descreve em termos moleculares Qual a vantagem? Com esta flexibilidade a
as estruturas, os mecanismos e os processos célula consegue passar por qualquer
químicos compartilhados por todos os obstáculo, até mesmo entre duas células.
organismos e estabelece princípios de ➪O crescimento e a divisão celular (fissão)
organização que são a base da vida. ocorre sem perda da integridade da membrana.

Fundamentos Celulares Citoplasma

Membrana Plasmática
➪Define o contorno da célula, separando seu
conteúdo do ambiente.
➪Ela é composta por moléculas de lipídeos e
proteínas que formam uma ​barreira fina​,
resistente, flexível e hidrofóbica ao redor da
célula.
➪A membrana é uma barreira para a
passagem livre de íons inorgânicos e para a
maioria de outros compostos carregados ou
polares.
➪​Proteínas de transporte na membrana
plasmática permitem a passagem
É composto por uma solução aquosa, o citosol​,
e uma grande variedade de partículas em
suspensão com funções específicas. Esses
componentes particulados (organelas envoltas
por membrana) se sedimentam quando o
citoplasma é centrifugado a 150.000 g, pois
as organelas são mais pesadas que o citosol. O
que sobra como fluido sobrenadante é o
citosol, solução aquosa altamente concentrada
rica ​em água, ​proteínas dissolvidas, eletrólitos,
glicose, compostos lipídicos e demais
substâncias.
de
_________________________
➪Os microrganismos sem membrana nuclear,
antes classificados como procariontes são
agora reconhecidos como pertencentes a dois
grupos muito distintos: ​Bacteria​ e ​Archaea​.
_________________________
Dimensões Celulares
O limite superior de tamanho celular
provavelmente é determinado pela taxa de
difusão das moléculas de soluto nos sistemas
aquosos, ou seja, a velocidade de difusão de
moléculas no volume celular.
Quanto maior a célula menor sua taxa de
difusão, devido a isso as células são muito
pequenas.
Três grupos distintos de vida
➪​Eukarya
Todos os organismos eucariontes formam o
grupo; evoluíram a partir do mesmo ramo que
deu origem a Archaea; por isso, os eucariontes
são mais proximamente relacionados às
archaeas do que às bactérias.
➪​Bacteria
As bactérias habitam o solo, as águas
superficiais e os tecidos de organismos vivos
ou em decomposição.
➪​Archaea
•​Muitas das arqueias, reconhecidas na década
de 1980 por Carl Woese como um grupo
distinto, habitam ambientes extremos – lagos
de sais, fontes termais, pântanos altamente
ácidos e profundezas do oceano.
•​As evidências disponíveis sugerem que
Bacteria e Archaea divergiram cedo na
evolução.
•​As células de bactérias e de arqueias contêm
citosol, nucleoide e plasmídeos, todos contidos
dentro de um envelope celular.
Subgrupos em Bacteria e Archea:
➪​Aeróbios​: Com suprimento abundante de
oxigênio, alguns organismos obtêm energia
pela transferência de elétrons das moléculas
de combustível para o oxigênio dentro da
célula.
➪​Anaeróbios​: Praticamente desprovidos de
oxigênio, obtêm energia pela transferência de
elétrons para nitrato (formando N2 ), sulfato
(formando H2S) ou CO2 (formando CH4 ).
Muitos organismos que evoluíram em
ambientes anaeróbios são anaeróbios
obrigatórios: morrem quando expostos ao
oxigênio. Outros são anaeróbios facultativos,
capazes de viver com ou sem oxigênio.
Fontes de Energia
➪​Fototróficos​: Luz solar
➪​Quimiotróficos​: Oxidação de um
combustível químico
Os fototróficos e os quimiotróficos podem ser
subdivididos ainda mais
➪​Autotróficos​: Os que podem sintetizar _________________________
todas as suas biomoléculas diretamente do Métodos para separar as organelas do citosol
CO2. e elas entre si​: Christian de Duve e George
➪​Heterotróficos​: Os que requerem Palade desenvolveram o método onde células
nutrientes orgânicos previamente formados ou tecidos em solução são suavemente
por outros organismos. rompidos por cisalhamento físico. Esse
tratamento rompe a membrana plasmática, mas
Organelas deixa intacta a maioria das organelas. O
➪​Mitocôndria​: O sítio da maior parte das homogeneizado é então centrifugado;
reações extratoras de energia da célula. organelas como núcleo, mitocôndria e
Contêm enzimas oxidativas. lisossomos diferem em tamanho e por isso
➪​Retículo endoplasmático e Aparelho de sedimentam em velocidades diferentes.
Golgi​: Desempenham papéis centrais na ➪Quanto maior a velocidade de
síntese e processamento de lipídeos e centrifugação, menor o tamanho da organela.
proteínas de membrana. _________________________
➪​Peroxissomos​: Onde ácidos graxos de
cadeia bem longa são oxidados. Citoesqueleto
➪​Lisossomos​: Preenchidos com enzimas ➪A microscopia de fluorescência revela
digestivas para degradar os restos celulares vários tipos de ​filamentos proteicos
não necessários. Contêm enzimas atravessando a célula eucariótica em várias
degradativas. direções, formando uma ​rede tridimensional
Em Células Vegetais: interligada.
➪​Vacúolos​: Acumulam grandes quantidades ➪As organelas se movem pelo citoplasma ao
de ácidos orgânicos; longo de filamentos proteicos, e seu
➪​Cloroplastos​: Nos quais a luz solar realiza a movimento é impulsionado por proteínas
síntese de ATP no processo. Contêm motoras dependentes de energia.
pigmentos fotossintéticos. ➪O sistema de ​endomembranas segrega
No citoplasma de muitas células estão processos metabólicos específicos e provê
presentes também grânulos ou gotículas superfícies sobre as quais ocorrem reações
contendo nutrientes armazenados, como amido catalisadas por enzimas. A ​exocitose e a
e gordura. endocitose​, mecanismos de transporte, para
fora e para dentro da célula, respectivamente.
 informacionais, alguns oligossacarídeos
também podem ser.
_________________________
Estudos in vitro podem omitir interações
importantes entre moléculas​: Os Estrutura
componentes “interferentes” eliminados na ➪A configuração molecular pode ser alterada
purificação podem ser cruciais para a função somente mediante quebra de ligações
biológica ou para a regulação da molécula covalentes. Para um átomo de carbono com
purificada. quatro substituintes diferentes (carbono
_________________________ quiral), os grupos substituintes podem ser
arranjados em duas diferentes formas,
Fundamentos Químicos gerando estereoisômeros com propriedades
➪99% da Massa das Células: C, H, O, e N. distintas. ➪Somente um dos estereoisômeros
Carbono é biologicamente ativo.
➪Biomoléculas são compostos de carbono ➪​Estereoisômeros​: Moléculas com as
com uma grande variedade de grupos mesmas ligações químicas e mesma fórmula
funcionais; O Carbono pode produzi-las molecular, mas com diferentes configurações.
devido a sua versatilidade de ligação. ➪Pode acontecer do organismo não
➪Contribui com mais da metade do peso seco reconhecer um estereoisômero.
das células ➪A conformação molecular é a disposição dos
Macromoléculas átomos no espaço que pode ser mudada por
➪Proteínas e ácidos nucleicos são polímeros rotação em torno de ligações simples, sem
lineares feitos de subunidades monoméricas quebrar ligações covalentes.
simples; suas sequências contêm as
informações que fornecem a cada molécula sua Estereoquímica
estrutura tridimensional e suas funções ➪Quando biomoléculas interagem, o “encaixe”
biológicas. entre elas tem de ser estereoquimicamente
➪Dadas as sequências características de correto, a estrutura tridimensional de
suas subunidades, ricas em informação, as biomoléculas é de máxima importância nas suas
proteínas e os ácidos nucleicos são muitas interações biológicas.
vezes referidos como macromoléculas ➪​Estereoespecificidade​: A capacidade de
distinguir entre estereoisômeros, é uma
propriedade das enzimas e de outras
proteínas, sendo um aspecto característico da
lógica molecular das células vivas.
Fundamentos Físicos ➪O sistema nunca atinge o equilíbrio,
Energia entretanto, é possível um ​estado estacionário
Células vivas são sistemas abertos, que devido a velocidade de formação da substância
trocam matéria e energia com o meio externo, ser igual a velocidade de seu consumo.
extraindo e canalizando energia para
manter-se no estado estacionário dinâmico Enzimas
longe do equilíbrio. ➪Muitas reações celulares ocorrem a
Energia Livre de Gibbs velocidades apropriadas somente porque as
➪A tendência de uma reação química em enzimas estão presentes para catalisá-las. A
prosseguir em direção ao equilíbrio pode ser atividade catalítica das enzimas nas células é
expressa como função da energia livre, ​Δ​G, regulada.
que tem dois componentes: a variação da ➪A modificação das ligações existentes para
entalpia, ​Δ​H, e a variação da entropia, ​Δ​S. criar um ​estado de transição que tem energia
Essas variáveis estão relacionadas pela livre maior que a dos reagentes ou produtos.
equação ​ΔG=ΔH–TΔS. ➪O ponto mais alto no diagrama da
➪Quando o ​Δ​G de uma reação é negativo, a coordenada de reação representa o ​estado de
reação é ​exergônica e tende a caminhar para transição​, e a diferença de energia entre o
sua conclusão; quando ​Δ​G é positivo, a reagente no seu estado fundamental e em seu
reação é ​endergônica e tende a ir na direção estado de transição consiste na ​energia de
oposta. ativação​.
➪As reações que convertem ATP em Pi e ➪As enzimas atuam em parte pela
ADP ou em AMP e PPi são altamente estabilização do estado de transição,
exergônicas. reduzindo a energia de ativação, ​Δ​G ‡ , e
➪A variação da energia livre padrão, ​Δ​G°, é aumentando a velocidade de reação em várias
uma constante física relacionada à constante ordens de grandeza.
de equilíbrio pela equação ​ΔG°=–RT In Keq. Metabolismo
K é dado por: ➪O conjunto de redes de rotas catalisadas
por enzimas, tanto as catabólicas quanto as
anabólicas, constituem o metabolismo celular.
➪Metabolismo é a soma de muitas sequências
de reações interconectadas que
interconvertem ​metabólitos celulares​. O
metabolismo é regulado para obter equilíbrio e ➪A vida surgiu há cerca de 3,5 bilhões de
economia. anos, mais provavelmente com a formação de
➪Cada sequência é regulada para suprir o que um compartimento fechado por membrana
a célula precisa em um dado momento e para contendo uma ​molécula de RNA
gastar energia somente quando necessário. autorreplicante​.
➪Os papéis catalíticos e genéticos exercidos
Fundamentos Evolutivos pelos primeiros genomas de RNA foram ao
➪Stanley L. Miller simulou a terra prebiótica longo do tempo sendo realizados por proteínas
e suas condições e conseguiu criar e DNA, respectivamente.
biomoléculas de forma espontânea, em ➪Células eucarióticas adquiriram a
especial, aminoácidos. capacidade de promover a ​fotossíntese e a
➪Ocasionalmente, ​mutações herdadas geram fosforilação oxidativa a partir de bactérias
organismos mais bem adaptados para endossimbióticas. Em organismos
sobreviver e, com a reprodução em um dado multicelulares, alguns tipos de células
nicho ecológico, os seus ​descendentes passam diferenciadas se especializaram em uma ou
a predominar na população desse nicho. O mais funções essenciais para a sobrevivência
grande número de ​genes compartilhados por do organismo.
todos os seres vivos explica suas semelhanças
fundamentais.