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Etapas da reao
Desnaturao: 94C 96C Separa a dupla fita do molde de DNA em duas fitas simples
Pareamento: 37C 65C Primers ligam-se em locais especficos do DNA molde Extenso: 72C DNA polimerase usa os dNTPs adicionando-os a nova fita de acordo com a regra de pareamento polimerizao. .
http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/pcr/
SYBR Green
O SYBR Green se liga entre a fita dupla de DNA e emite uma fluorescncia verde. Vantagens x Desvantagens No comeo da amplificao, as molculas no ligadas do SYBR Green apresentam fluorescncia fraca. Aps o reconhecimento dos primers, algumas molculas do SYBR Green podem ligar-se na dupla fita previamente formada. Durante a polimerizao as molculas do SYBR Green se ligam ao DNA sintetizado. Assim, a reao monitorada continuamente e um aumento da fluorescncia observado em tempo real.
TaqMan
Durante a PCR em tempo real a TaqMan hibridiza com a sequncia da fita simples de DNA complementar alvo para amplificao. No processo da amplificao a TaqMan degradada devido atividade exonuclease 5 -> 3 da DNA polimerase, separando o quencher da molcula fluorescente durante a extenso, resultando no aumento da intensidade da fluorescncia.
Aplicao
Amplificar sequncias de DNA especficas; Produtos de PCR podem ser clonados; Produtos de PCR podem ser diretamente sequenciados; Deteco de mutaes; Medicina forense; Teste de paternidade;
Arqueologia.