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Questionario-Biogenetica
Questionario-Biogenetica
funcionais e
repeties de 2 a 5 pb
STR (Pequenas repeties em tandem)
CA, AT e GC mais comuns (CA)n, onde n = 2 a 10
mais frequente das repeties
genoma humano 50 mil a 100 mil blocos (CA)n polimrficos
teste de paternidade datiloscopia do DNA (DNA Fingerprinting)
de DNA que podem se mover no genoma e por isso so a principal fonte de mutaes
espontneas e com isso, grandes regies no codificantes fazem com que esses
elementos no se expressem.
Dez a 15 por cento do DNA humano so compostos pelos transposons Alu e Line-1. O
grande nmero desses elementos, no genoma, propicia ampla oportunidade para
recombinao homloga desigual, ocasionando delees ou duplicaes gnicas e
mesmo alteraes mais complexas do material gentico.
b a
A- cidos fosfrico
B- Adenina
C- Ribosa
(trifosfato de adenosina)
encontrada no RNA pois possui o grupo OH na extremidade da ribosa , formando o
acido ribonucleico.
21. Desenhe uma fita de RNA composta por 3 nucleotdeos, nomeia a ligao
entre os nucleotdeos e indique a polaridade da molcula.
timina e citosina com guanina. Assim, as duas cadeias que constituem um segmento
de DNA, so complementares entre si: onde em uma cadeia existir uma timina, na
outra existir uma adenina, e onde em uma existir uma guanina, na outra existir uma
citosina.Alm disso, o modelo prediz que as duas cadeias polinucleotdicas so
antiparalelas, ou seja, elas tem polaridades opostas. As ligaes fosfodiester esto
orientadas no sentido 3 => 5, ou seja, do carbono 3 de um nucleotdeo ao carbono 5
do nucleotdeo adjacente, enquanto que na fita complementar a orientao inversa,
do carbono 5 ao 3 (5 => 3).
Forma
Mais larga
Intermediria
Mais estreita
Dimetro da hlice
25,5 A
23,7 A
18,4 A
Sentido da toro
Dextrorsa
Dextrorsa
Sinistrorsa
11
10,4
12
Sulco Maior
Estreito e muito
profundo
Largo e profundo
Achatado
Sulco Menor
Muito largo e
raso
Estreito e bem
profundo
Muito estreito e
profundo
- B-DNA: Tem a dupla hlice mais longa e mais fina. Para completar uma volta na
hlice so necessrios 10 pares de bases.
- A-DNA: Tem a forma mais curta e mais grossa. Para completar uma volta na hlice
so necessrios 11 pares de bases.
Em soluo, geralmente o DNA assume a conformao B. Quando h pouca
gua disponvel para interagir com a dupla hlice, o DNA assume a conformao ADNA. Existe uma terceira forma de DNA que difere das duas anteriores, pois seu
sentido de rotao para a esquerda, este tipo de DNA chamado de Z-DNA. Esta
conformao mais alongada e mais fina do que o B-DNA. Para completar uma volta
na hlice so necessrios 12 pares de bases. O DNA, em soluo com altas
concentraes de ctions, assume a conformao Z-DNA.
26. A molcula de DNA tem polaridade 5-3 e formada por duas fitas
antiparalelas. Ao acar liga-se um grupo fosfato no carbono na posio 5.
Um nucleotdeo como parte integrante de um cido nuclico tem um nico
grupo fosfato, sendo, portanto um nucleotdeo monofosfato. Qual a
extremidade onde monmeros so adicionados?
Os cidos nucleicos podem estar organizados em cadeia simples ou dupla de
nucletidos, unidos atravs da pentose de um e o grupo fosfato de outro: quando uma
cadeia est em formao, cada novo nucletido liga-se seu grupo fosfato ao carbono
3 da pentose do ltimo nucletido da cadeia. Assim, sempre que um nucletido
apresenta o seu carbono 3 livre pode ligar-se a outro. Por este motivo, as cadeias
polinucleotdicas de DNA ou RNA crescem sempre no sentido 5 - 3.
FUNOOOO?????
Como a fita de DNA formada pelo pareamento de duas fitas simples, cada
uma delas pode atuar como molde para determinar a sequencia de
m
nucleotdeos da sua fita complementar pelo pareamento das bases do DNA.
Desse modo, a molcula de DNA de fita dupla precisamente
copiada.Portanto, a complementaridade da fita molde importante para que a
replicao ocorra com exatido, gerando duas molculas de DNA idnticas e
sem mutaes.
a
b
c
d
e
40. Esquematize uma forquilha de replicao e indique qual fita de DNA ser
usada como molde para a sntese contnua e para a sntese descontnua das
fitas filhas CADERNO.
41. Todas as DNA polimerases conhecidas, alm de sua atividade polimerase,
tem capacidade de editorao (proofreading). Que tipo de atividade
enzimtica responsvel pela editorao? Qual sua contribuio para a
fidelidade do processo de replicao.
Editorao a capacidade de corrigir a leitura. A atividade exonuclesica 35 a
responsvel pela editorao. Essa atividade aumenta a fidelidade da leitura e evita
erros.
42. Quais as polimerases que atuam no processo de replicao e descreva em
que fase cada uma delas atua.
DNA Polimerase I Atua em conjunto com a primase, retira os primers e preenche as
lacunas; DNA Polimerase III Atua na sntese da nova fita.
entre
telomerase
cncer, e
telomerase
Existe relao nos dois casos. No caso do envelhecimento- a presena dessa enzima
diminui o envelhecimento celular, existem estudos que dizem ser possvel reverter
casos de atrofia de tecidos, induzindo a sntese de telomerase. Mas tambm devemos
considerar que a quando se estimula a sntese de telomerase se inativa um gene
supressor tumoral podendo levar a formao de tumores cancergenos.
51.Proponha uma forma de sntese de DNA em tubo de ensaio (in vitro) usando
alguns dos componentes do processo de replicao que voc julgue essencial
para tal fim. PESSOAL
Transcrio
52.O que so fatores de transcrio? O que so os fatores de transcrio
basais?
Fatores de transcrio so protenas que se ligam ao DNA de clulas eucariticas
para permitir que haja uma ligao entre a enzima RNA-polimerase e o DNA,
permitindo assim a transcrio e a futura traduo.
A fita molde a fita do DNA que serve de molde para a adio dos ribonucleotdeos do
RNA que est sendo sintetizado. A maquinaria de transcrio reconhece a seqncia
da fita molde e monta o RNA por complentaridade de bases. Como o RNA deve ser
montado no sentido 5-3, a fita molde ser lida no sentido 3-5.
Fita codificadora a que possui seqncia idntica ao do RNA sintetizado, com a
exceo de ao invs de uracilas, possui timinas. lida no mesmo sentido da sntese
do RNA, ou seja, 5-3. Exemplo:
No que os genes se encontram apenas em uma das fitas. O que acontece que
para que ocorra a transcrio de uma cadeia gentica em RNAm s necessria uma
delas.
65.Os componentes do complexo de transcrio basal ocorrem em todas as
clulas? Justifique.
?????????
66.Qual a modificao crtica da RNA polimerase para que se inicie a
transcrio?
Para que se inicie a transcrio, necessrio que a RNA polimerase se ligue ao
stio promotor. Assim, promove a abertura da dupla hlice do DNA e se move sob a
sequncia do gene, dando origem ao RNA.
67.Para que um "enhancer" funcione, critico que ele esteja a uma distncia
correta e em fase com o promotor? Ele funciona se invertido? Um promotor
funciona corretamente se invertido (o gene controlado transcrito)?
No, enhancers funcionam mesmo localizados em diferentes posies em relao
ao promotor, e em eucariotos, tm funo mesmo a longas distncias.
(FALTA RESPONDER SE O STIO PROMOTOR FUNCIONA SE INVERTIDO.
ACREDITO QUE NO, POIS O STIO ATIVO DE CADA ENZIMA BEM
ESPECFICO).
68.Defina processamento de RNA, sua funo e indique se ocorre em
procariotos ou eucariotos ou ambos.
O processamento do RNA ocorre tanto em procariotos quanto em eucariotos, embora
o processo seja no seja exatamente igual. A transcrio consiste na sntese do RNA,
a qual feita a partir de uma fita molde de DNA e tem como funo a codificao de
diversos aminocidos e, consequentemente, protenas, que so vitais aos seres.
(*Transcrio o processamento da fita de RNA a partir da fita de DNA molde)
(*A transcrio em eucariontes bem mais complexa que em procariontes. Nos
eucariontes a transcrio ocorre no ncleo, enquanto a traduo ocorre no citoplasma.
J nos procariontes tal separao celular no existe, sendo os dois processos muito
bem acoplados no espao. A separao temporal e espacial desses dois processos
nos eucariontes permite a eles uma melhor regulao da expresso gnica).
69.O que cap, onde ocorre e qual sua funo?
CAP um nucleotdeo 7-metilguanilato unido por uma ligao 5-5 ao nucleotdeo
inicial da cadeia de RNAm (assim no sobra extremidade 5 livre na cadeia de RNAm,
e sim duas extremidades 3 livres). CAP apresenta papel importante na iniciao da
sntese de protena, alm de proteger o transcrito de RNA nascente da degradao.
Traduo
74.Porque o cdigo gentico formado por trincas? Quantos aminocidos so
especificados pelo cdigo gentico? Quantas sequncias de aminocidos so
possveis em um polipeptdeo de 146 aminocidos?
20 minocidos so codificados pelo cdigo gentico.
*
75.O que se entende por cdigo gentico degenerado e descreva usando os
cdons que codificam para a leucina (Leu) como exemplo.
Significa que um mesmo aa pode ser codificado por cdons diferentes variao
da
3
base
(exceto
met
e
trip)
LEU: CUU, CUC, CUA, CUG
5GCUAUGGCAAAACUGUGGGUACGCACUUAGGCAAUUCCUAAAAAAAAAAAAA3
a.Que tipo de RNA esse?
RNA mensageiro
b.Circule onde se inicia a sntese das protenas e risque onde esta termina.
Circule AUG e grife UAG)
c.D a seqncia de aa resultante de sua traduo e diga se um dipeptdeo, um
peptdeo ou uma protena.
A
traduo
se
inicia
em
met
(AUG)
e
termina
em
UAG.
Observao da tabela de aminocidos, s colocar os nomes encontrados de acordo
com as trincas de base.
A sequncia um polipeptdeo.
d.Quais as caractersticas que permitem sua classificao?
A sequncia possui 8 aminocidos (octapeptdeos, seguindo a nomenclatura)
e.Qual o sentido em que traduzido?
5------3
77.Cite 3 diferenas entre os ribossomos eucariticos, procariticos e
mitocondriais.
Ribossomo: maquinaria cataltica complexa feita a partir de mais de 50 protenas
diferentes (protenas ribossomais) e diversas molculas de RNAs ribossomais
(rRNAs).
Os ribossomos eucariticos e procariticos so muito similares tanto em forma quanto
em funo. Ambos so compostos de uma subunidade grande e uma pequena que se
encaixam para formar um ribossomo completo. Os ribossomos mitocondriais so
comparveis aos ribossomos procariticos em tamanho e sensibilidade a antibiticos,
entretanto, os valores de sedimentao s varia nos diferentes filos.
Os ribossomos eucariticos so maiores e mais complexos, possuindo quatro
molculas de rRNA, enquanto os procariticos possuem apenas trs molculas de
rRNA. Os ribossomos bacterianos operam mais rapidamente que ribossomos
eucariticos. Ribossomos eucariticos necessitam de um quepe na extremidade 5
enquanto os procariticos iniciam a transcrio nos stios de ligao ao ribossomo, os
quais podem estar localizados em qualquer ponto ao longo de uma molcula de
mRNA, o que permite que as bactrias sintetizam mais de um tipo de protena a partir
de uma nica molcula de mRNA. A subunidade menor dos ribossomos eucariticos
a 40S e dos procariticos a 30S
78.Qual o nmero de cdons gerados a partir dos 4 nucleotdeos presentes na
molcula de mRNA? Quantos so codificantes? Qual a funo dos que no so
codificantes?
So gerados 64 cdons, que codificam apenas 20 aminocidos diferentes. Alguns
tripletes de nucleotdeos nunca so usados, ou o cdigo redundante e alguns
aminocidos so determinados por mais de um triplete.
89.Ao encontrar um cdon sem sentido o que ocorre com a sntese proteica?
Qual o papel dos fatores de terminao?
O sinal para terminao dado por um cdon sem sentido (UAG, UAA) que entra no
stio A. Os fatores de terminao libertam a cadeia polipeptdica e retiram o ltimo
tRNA do stio P. O ribossomo fica livre para iniciar outra sntese. Na outra extremidade,
medida que o mRNA tambm vai ficando livre, ele pode se associar a outro(s)
ribossomo(s), formando uma estrutura alongada muito comum, que so os chamados
polirribossomos. Esses polirribossomos aparecem normalmente na sntese de
protenas de cadeia muito longa, onde so sintetizadas vrias molculas da protena
ao mesmo tempo.
CONFIRMAR!!!!!
93.O que significa universalidade do cdigo gentico?
Diz-se que o cdigo gentico universal, porque os cdons possuem o mesmo
significado em quase todos os organismos. (Os mesmos cdons de um aminocido
nas bactrias corresponde a este nos mamferos).
94.O que significa no ambigidade do cdigo gentico?
No existe ambigidade no cdigo gentico, porque um mesmo cdon no
codificar dois aminocidos diferentes ao mesmo tempo.
5-CGATCGACCTAGATGGATTCGATCGATTCGGAGCTAGGCTAGTCTAACTGATCG3
a) Transcreva a molcula de RNA correspondente a este gene
b) Circule o cdon onde comea a sntese da protena (cdon de iniciao)
c) Sublinhe o cdon de iniciao (note que este cdon deve estar na mesma
fase de leitura usada para a sntese da protena)
d) Traduza a seqncia do RNA em protena
Formao complementar
http://www.dnalc.org/resources/
http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/
http://www.johnkyrk.com/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/