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Classificao de microrganismos

Resumo II - Microbiologia Tortora Taxonomia a cincia de classificao dos organismos, com o objetivo de mostrar as relaes entre os organismos. A taxonomia tambm fornece uma maneira de identificar organismos.

O estudo das relaes filogenticas


Filogenia a histria evolutiva de um grupo de organismos. A hierarquia taxonmica mostra as relaes evolutivas ou filogenticas entre os organismos. As bactrias foram separadas no Reino Procaryotae em 1968. Os organismos vivos foram divididos em cinco reinos em 1969.

Os trs domnios Atualmente os organismos vivos so classificados em trs domnios. Um domnio pode ser dividido em reinos. Nesse sistema, plantas, animais, fungos e protistas pertencem ao Domnio Eucarya. As bactrias (com peptdeo-glicana) formam um segundo domnio (Bacteria). As arquiobactrias (com paredes celulares incomuns) so colocadas no Domnio Archea. A hierarquia filogentica Os organismos so agrupados em taxa de acordo com suas relaes filogenticas (de um ancestral comum). Algumas das informaes para relaes eucariticas so obtidas a partir de registros fsseis. As relaes procariticas so determinadas atravs do sequenciamento do rRNA.

Classificao de organismos
Nomenclatura cientfica De acordo com a nomenclatura cientfica, a cada organismo est designado dois nomes, ou binmio: um gnero e um epteto especfico ou espcie. As regras para a designao de nomes para bactrias so estabelecidas pelo Comit Internacional de Bacteriologia Sistemtica. As regras para denominar os fungos e as algas so encontradas no Cdigo Internacional de Nomenclatura Zoolgica. A hierarquia taxonmica Uma espcie eucaritica um grupo de organismos que se cruzam entre si, mas no cruzam com indivduos de outra espcie.

As espcies similares so agrupadas em um gnero; os gneros similares so agrupados em uma famlia; famlias, em uma ordem; ordens, um uma classe; classes, em uma diviso ou filo; filos, em um reino; e reinos, em um domnio. Classificao de procariotos O Bergey's Manual of Systematic Bacteriology a referncia padro na classificao bacteriana. Um grupo de bactrias derivadas de uma nica clula denominada linhagem. As linhagens intimamente relacionadas constituem uma espcie bacteriana. Classificao de eucariotos Os organismos eucariticos podem ser classificados no Reino Fungi, Plantae ou Animalia. Os protistas so, na sua maioria, organismos unicelulares; esses organismos esto sendo atualmente distribudos nos reinos. Os fungos so qumio-heterotrficos com capacidade de absoro que se desenvolvem a partir de esporos. Os foto-autotrficos multi-celulares so colocados no Reino Plantae. Os heterotrficos multi-celulares com capacidade de ingesto so classificados como Animalia. Classificao de vrus Os vrus no esto colocados em um reino. Eles no so compostos de clulas e no podem se desenvolver sem uma clula hospedeira. Uma espcie viral uma populao de vrus com caractersticas similares que ocupa um nicho ecolgico especfico.

Mtodos para classificao e identificao de microrganismos


O Bergey's Manual of Determinative Bacteriology o padro de referncia para a identificao laboratorial de bactrias. As caractersticas morfolgicas so teis na identificao de microrganismos, especialmente quando complementadas com diferentes tcnicas de colorao. A presena de vrias enzimas, como determinado por meio de testes bioqumicos, usada na identificao de microrganismos. Os testes sorolgicos, envolvendo as reaes de microrganismos com anticorpos especficos, so teis na determinao da identidade de linhagens e espcies, bem como as relaes entre organismos. ELISA e Western Blotting so exemplos de testes sorolgicos. Fago-tipagem a identificao de espcies e linhagem bacterianas pela determinao de sua sensibilidade a fagos. Os perfis de cidos graxos podem ser usados para identificar alguns microrganismos. A citometria de fluxo mede caractersticas fsicas e qumicas das clulas. A porcentagem de pares de GC nos cidos nucleicos das clulas pode ser utilizada na classificao de organismos. O nmero e o tamanho de fragmentos de DNA, ou fingerprinting de DNA, produzidos pelas enzimas de restrio so utilizadas para determinar semelhanas genticas. A sequncia de bases no RNA ribossomal pode ser utilizada na classificao de organismos.

A reao em cadeia da polimerase (PCR) pode ser utilizada para detectar pequenas quantidades de DNA microbiano nas amostras. As fitas simples de DNA, ou de DNA e RNA, de organismos relacionados iro formar pontes de hidrognio e consequentemente molculas de dupla fita; essa ligao denominada hibridizao de cidos nucleicos. Southern Blotting, sondas de DNA e chips de DNA so exemplos de tcnicas de hibridizao. As chaves dicotmicas so utilizadas na identificao de microrganismos. Os cladogramas mostram relaes filogenticas entre organismos.