Genes procariotos:

Compostos por bactérias e arqueas. Organismos unicelular e sem organelas.

Material compactado- Nucleoide sem nenhuma separação por membranas.

Um gene é um segmento de DNA que inclui a informação necessária e suficiente

para a síntese de um produto mRNA ou RNAs.

O gene procarioto é formado por um sítio regulador proximal, sítio regulador

distal local onde ocorre a ligação de proteínas que ativam ou reprimem. E uma região
reguladora a jusante. Esta presente um promotor, uma sequencia que indica o local de
ligação da RNA polimerase, a região codificadora e o sítio de termino de transcrição,
onde a RNA polimerase se dissocia.

Colinearidade: exata correspondência entre a sequencia de DNA representada

pelos códons e a sequencia polipeptídica. 3n- 1A.

O tamanho dos genes é de acordo com a região codificadora, e não há introns.

Homologia: Geralmente considerada com 30% de similaridade. Ocorre a partir de

diferentes processos evolutivos como duplicação seguida de divergência, TGH e
especiação.

A duplicação da região cromossômica geram cópias idênticas do segmento com a

mesma função do produto gênico. A outra cópia pode divergir dando origem ao gene
semelhante e pode ter função diferente. Parálogo.

Ortológos: sequência similar, produtos similares, com função variável em cada

espécie. Homologo em espécies diferentes, derivado do processo de especiação.

Xenólogos: mediada por TGH e gera genes ortólogos. Ou a partir de elementos

genéticos moveis.

O genoma procarioto varia de 150 kb a 13000 kb. Mesmo na mesma espécie pode
variar até 1 Mb. DNA dupla fita.
 Em arqueas e bactérias há um cromossomo único- DNA de dupla fita circular
covalentemente fechada. Poucas exceções apresentam 1 ou mais moléculas ou lineares.

Apresentam Cromossomos: a maior parte do material genético e contém genes

essenciais ao seu metabolismo.

Plasmídeos: DNA menores limitado número de genes. Elementos de resistência,

transferência.

Replicons: Unidades de replicação (organização) que se replicam a partir de uma

única origem em bactérias. Em arqueas mais de uma unidade. A densidade genica varia.
Em bactérias 1 gene a cada 1 kb.

Unidades estruturais:

Motivos: sequencias curtas de 2 a dezenas de pb. Dispersas ou agrupadas e

podem formar repetições. Ex. Sítios Chi importantes para recombinação genética.

Motivos KOPS: Reconhecidos por DNA-translocase- Mecanismo de separação de

cromossomos na replicação.

Repetições: Regiões curtas 10 pb, cerca de 2% do genoma. Distribuídos

aleatoriamente ou em tandem (lado a lado). Ex: Chi e KOPS e repetições CRISPR.
Componentes do sistema de defesa viral, sequencias palindrômicas.

Genes: maior parte do genoma, necessários a sobrevivência. Genoma central é

composto por 65% e genoma dispensável cerca de 35%.

Genes em apenas uma cópia- Duplicação são eliminados. Alto número de genes
parálogos ou ortólogos.

Operons: Unidade funcional: duas ou mais regiões codificadoras ocupam

posições adjacentes, coorientadas e é controlada por uma mesma região reguladora.
Geralmente estão relacionados. Ex. enzimas de uma mesma via

mRNA policistrônico: derivado de co-transcrição. Esse processo otimiza a

maquinaria reguladora da célula e é coordenada. Ocupa menos espaço.
 Domínios: regiões externas definidas por interações com proteínas cromatídicas
e por superenrolamento de DNA. Importantes para facilitar o controle da expressão.

Ilhas genômicas: segmentos de DNA que diferem do restante do genoma. Alto

conteúdo GC, padrões de sintenia e orientação genica. Associados a elementos
genéticos móveis e a TGH. São genes não essenciais e podem ter vantagem adaptativa.
Como ilhas de patogenicidade. Toxinas.

Genes eucarióticos:

Estrutura semelhante a de procariotos: diferencia em regiões reguladoras que são

mais extensas e em maior número, possui reguladores distais mais distantes da região
codificadora.

Introns: são sequencias que interrompem a região transcrita e dividem os éxons.

São removidas para dar origem ao RNA maduro.

RNAs não codificadores são reguladores da expressão.

Constituem famílias multigenicas- genes similares, estrutura e função. A

expressão é regulada de acordo com o estágio de desenvolvimento do tecido.

Genomas nucleares: tamanho muito menor do que em procariotos. Em geral

quanto maior o genoma maior a complexidade anatômica e funcional

DNA nuclear eucarioto- cromossomo com DNA linear. Geralmente diploide ou

poliploide. Múltiplos replicons em tandem com várias origem de replicação. Plasmídeos
nucleares em alguns organismos.

H.sapiens 25% do genoma são genes e 1% éxons. A densidade genica depende do

numero de sequencia intergenicas. 1 gene a cada 120 kb.

Um mesmo gene pode dar origem a diversas proteínas diferentes por usarem
diferentes códons de iniciação e splicing alternativo, aumentando a complexidade do
genoma eucariótico. Também possuem genes com múltiplas cópias que codificam
diferentes tipos de RNA.

Sequencias intergenicas: são sequencias que não estão vinculadas a nenhum

gene e são maiores do que sequencias genicas.

Eucariotos também apresentam um grande numero de sequencias curtas e

repetidas. DNA satélite ou microssatélite. São sítios que foram duplicados durante
eventos de transposição pela iserção do elemento genético móvel. Funções diversas
como alteram o nível de expressão, manutenção de sequencias.

Elementos transponíveis: sequencias de DNA localizados em regiões

intergenicas que se integram no lócus genômica.

- Transposons- Mobilizados por intermediários de DNA.

- Retrotransposons- maior número. Podem mobilizarem a si ou outras sequencias.

Long terminal repeat (LTR)- são virais.

Sem LTR – longos (LINEs) ou curtos (SINEs).

LINEs: codificam no mínimo uma transcriptase reversa ou uma endonuclease.

Abundante em mamíferos.

SINEs: originários de transcrição reversa e da integração entre sequencias

transcritas pela RNApolII.

Os elementos podem alterar o padrão de expressão de genes ou dar origem a

novos genes. Modificar proteínas expressas.

Organização do genoma:

Operon: Transcrição individual de um mRNA monocistronico. Agrupamentos de

genes funcionalmente relacionaodos. Ex genes da globina.

Regulação espacial e temporal de acordo com a necessidade ou variabilidade.

 Ou agrupamento de genes coexpressos: Não relacionados ou expressos em
determinada ocasião. Ex. divisão mitótica e apresentam o mesmo padrão de expressão.