Respostas do Estudo dirigido de genética - (2 reais pra
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1º)Descreva sucintamente o mecanismo de Metilação do DNA e sua
importância na regulação gênica em eucariotos- É um processo epigenético que envolve a adição de grupos metil à cadeia de DNA, a metilação ocorre quando um grupo metil é adicionado ao carbono 5 da citosina, transformando-a em Guanina. Desempenha um papel essencial na regulação gênica em eucariotos, influenciando a expressão dos genes e contribuindo para a estabilidade e plasticidade do genoma.
2º) Descreva sucintamente o mecanismo de microRNA e sua
importância na regulação gênica em eucariotos- Diferentemente da metilação do DNA, os miRNA inativam genes sem alterar a estrutura do DNA. O miRNA quando incorporado ao complexo RISC, procura por sequências complementares em moléculas de mRNA alvo, quando o miRNA encontra um mRNA alvo com complementaridade, ele induz a supressão da expressão gênica através de diferentes mecanismos, como inibição da tradução do mRNA ou degradação do mRNA.
3º) Explique por que no genoma humanos há menos genes,
aproximadamente 32.000 genes, que proteínas, aproximadamente 100.000 proteínas?- Durante o processamento do RNA, os genes podem sofrer splicing alternativo, que é um mecanismo pelo qual diferentes combinações de éxons podem ser unidos, resultando em múltiplas variantes de RNA mensageiro (mRNA) a partir de um único gene. Isso permite a produção de proteínas diferentes a partir de um único gene. Algumas proteínas podem desempenhar múltiplas funções em diferentes contextos celulares. Portanto, uma única proteína pode estar envolvida em várias vias metabólicas ou processos biológicos, ampliando a funcionalidade do genoma humano. A regulação da expressão gênica é complexa e envolve uma rede intricada de fatores de transcrição, modificadores epigenéticos e mecanismos de regulação pós-transcricional, como os miRNAs mencionados anteriormente. Esses mecanismos regulatórios permitem uma ampla gama de respostas adaptativas e ajustes finos na expressão gênica sem a necessidade de um gene individual para cada proteína específica. 4º) Conceitue alelo, SNP, desnaturação do DNA, renaturação do DNA, curva de Melting, primers, dNTPs, Transcriptase reversa, Taq Polimerase, Vetores, inserto, operon Lac. Alelo: Um alelo é uma das diferentes formas de um gene. Pode haver diferentes alelos de um gene em um indivíduo ou em uma população, que podem resultar em variações nas características hereditárias.
SNP: (Polimorfismo de Nucleotídeo Único): É uma variação genética comum que
ocorre quando uma única base do DNA difere entre os indivíduos. SNPs são usados em estudos genéticos para identificar associações com doenças ou características específicas.
Desnaturação do DNA: A desnaturação do DNA refere-se ao processo no qual as
duas cadeias de DNA de uma dupla hélice se separam, interrompendo as pontes de hidrogênio entre as bases nitrogenadas. Isso ocorre sob condições de alta temperatura ou exposição a produtos químicos, levando à separação das fitas de DNA.
Renaturação do DNA: A renaturação do DNA ocorre quando as fitas de DNA
previamente desnaturadas se reconectam e se reassociam para formar uma dupla hélice novamente. Esse processo pode ocorrer quando as condições são reduzidas de temperatura ou removidos os fatores que causaram a desnaturação.
Curva de Melting: também conhecida como curva de desnaturação, é um gráfico
que representa a variação da absorbância ou fluorescência do DNA ao longo de uma faixa de temperatura. A curva de melting mostra a temperatura na qual metade do DNA está desnaturado e pode fornecer informações sobre a estabilidade e a composição do DNA.
Primers: Os primers são pequenos fragmentos de DNA sintetizados que fornecem
uma sequência inicial complementar ao local de interesse no DNA durante a amplificação por reação em cadeia da polimerase (PCR) ou em outras técnicas de amplificação de DNA. Eles atuam como iniciadores para a síntese do novo DNA complementar.
dNTPs: São os blocos de construção utilizados na síntese do DNA. São moléculas
que contêm uma base nitrogenada (A, T, C ou G), uma pentose desoxirribose e três grupos fosfato. Os dNTPs são incorporados à nova cadeia de DNA durante a replicação ou amplificação. Transcriptase Reversa: É uma enzima utilizada para converter o RNA em DNA complementar (cDNA). A transcriptase reversa é amplamente utilizada em técnicas como a reação em cadeia da transcriptase reversa (RT-PCR) para a detecção e amplificação de RNA.
Taq Polimerase: É uma enzima de DNA polimerase termoestável isolada da bactéria
Thermus aquaticus. A Taq polimerase é amplamente utilizada na PCR, pois pode suportar as altas temperaturas necessárias para a desnaturação do DNA durante o ciclo de amplificação.
Vetores: São moléculas de DNA usadas para transportar e replicar fragmentos de
DNA em células hospedeiras, como bactérias ou células eucarióticas. Os vetores são amplamente utilizados em técnicas de clonagem e engenharia genética.
Inserto: Refere-se ao fragmento de DNA que é inserido em um vetor durante o
processo de clonagem. O inserto pode conter um gene específico, uma sequência regulatória ou qualquer outra sequência de interesse.
Operon Lac: É um exemplo clássico de um operon em bactérias, que consiste em
um conjunto de genes relacionados envolvidos na metabolização do lactose. O operon Lac inclui genes como o gene da lactose permease, beta-galactosidase e um gene regulatório chamado gene lacI. Ele ilustra o conceito de regulação gênica em resposta a um substrato específico, no caso, a lactose.
5º) Conceitue a tecnologia do DNA recombinante- Envolve a manipulação e
combinação de diferentes segmentos de DNA de fontes diferentes para criar novas moléculas de DNA. Essa técnica permite a introdução de genes específicos em organismos, transferindo características desejáveis de uma espécie para outra. ● O primeiro passo é isolar o gene de interesse a partir de uma fonte doador de DNA. Um vetor de clonagem é um veículo de transporte de DNA usado para inserir o gene de interesse. ● Geralmente, o vetor é um plasmídeo bacteriano modificado que pode ser replicado em uma célula hospedeira, como uma bactéria. ● Enzimas de restrição são usadas para cortar o vetor de clonagem e o gene de interesse em locais específicos. As extremidades cortadas são complementares, permitindo a união das duas moléculas de DNA. ● O gene de interesse é ligado ao vetor de clonagem usando a enzima ligase, que une as extremidades cortadas do vetor e do gene, formando uma molécula de DNA recombinante. ● A molécula recombinante é então introduzida em uma célula hospedeira, geralmente uma bactéria, por meio de um processo chamado transformação. As células hospedeiras são capazes de replicar o vetor recombinante, resultando na produção de múltiplas cópias do gene de interesse.
6º) Descreva sucintamente como proceder para produção de insulina a
partir da tecnologia do DNA recombinante. ● O gene da insulina é isolado a partir de células produtoras de insulina, como as células beta do pâncreas de um organismo doador. ● O gene da insulina é clonado, ou seja, amplificado usando a técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) ou outras técnicas de amplificação de DNA. ● Um vetor de clonagem é preparado para receber o gene da insulina. Geralmente, um plasmídeo bacteriano é usado como vetor. ● O gene da insulina é ligado ao vetor de clonagem usando enzimas de restrição e a enzima ligase. As extremidades do gene e do vetor são complementares, permitindo sua união. ● A molécula recombinante contendo o gene da insulina é introduzida em bactérias, como Escherichia coli, por meio de um processo chamado transformação. ● As bactérias hospedeiras são capazes de replicar o vetor recombinante contendo o gene da insulina. ● As bactérias transformadas começam a produzir insulina recombinante à medida que replicam o vetor recombinante contendo o gene da insulina. A insulina recombinante purificada é formulada em medicamentos para o tratamento da diabetes.
7º) Descreva o vetor pUC-18 explicando a função de cada região do
referido vetor- O vetor pUC-18 é um plasmídeo amplamente utilizado em estudos de biologia molecular e clonagem de DNA. ● Origem de replicação (ori): A região de origem de replicação é responsável por iniciar a replicação do plasmídeo dentro da célula hospedeira. ● Gene de resistência a antibiótico (amp): O pUC-18 contém o gene amp, que confere resistência à ampicilina, um antibiótico comumente usado para selecionar células transformadas com o plasmídeo. As células hospedeiras que não possuem o plasmídeo serão mortas na presença de ampicilina, enquanto as células que receberam o plasmídeo resistirão ao antibiótico. ● Sítios de restrição múltiplos (polylinker): O polylinker, também conhecido como sítio de clonagem múltipla, é uma região onde estão presentes diversos sítios de restrição. Esses sítios de restrição são sequências de DNA reconhecidas por enzimas de restrição, que podem ser usadas para cortar o plasmídeo e inserir fragmentos de DNA. ● Promotor lacZ: O vetor pUC-18 possui um promotor do operon lacZ, que é responsável pela transcrição do gene lacZ. Esse promotor pode ser utilizado para controlar a expressão de genes inseridos no plasmídeo. ● Gene lacZ: O gene lacZ codifica a enzima beta-galactosidase, que é frequentemente utilizada como um marcador para identificar células transformadas com o plasmídeo. A enzima beta-galactosidase é capaz de clivar substratos específicos, produzindo um produto visível, como a mudança de cor do meio de cultura. ● Terminador: A região de terminação é responsável por sinalizar o final da transcrição do gene lacZ. Ela garante que a enzima beta-galactosidase seja produzida em níveis apropriados.
8º) Explique os fundamentos dos resultados observados em protocolo
da tecnologia do DNA recombinante: a) Após aplicação do método de DNA recombinante foram visualizadas apenas colônias de bactéria de cor branca. A visualização de colônias de bactéria de cor branca após a aplicação do método de DNA recombinante pode estar relacionada a uma clonagem bem-sucedida do gene de interesse no vetor, mas a expressão desse gene não ocorreu. A coloração branca pode indicar que a enzima beta-galactosidase não está sendo produzida ou está inativa. Isso pode ocorrer se o gene de interesse estiver inserido de forma incorreta no vetor, se houver mutações no gene lacZ ou se houver problemas na regulação da expressão gênica.
b) Após aplicação do método de DNA recombinante foram visualizadas
apenas colônias de bactéria de cor azul. A visualização de colônias de bactéria de cor azul após a aplicação do método de DNA recombinante indica uma clonagem bem-sucedida do gene de interesse no vetor e a expressão funcional do gene lacZ, que codifica a enzima beta-galactosidase. A coloração azul é um resultado comum quando a enzima está ativa e capaz de clivar o substrato específico, produzindo um produto visível. Portanto, as colônias de cor azul indicam que o gene de interesse foi corretamente inserido no vetor e está sendo expresso nas células bacterianas transformadas.
9º) O que a reação em cadeia da polimerase (PCR) e qual o seu
fundamento? - A reação em cadeia da polimerase (PCR) é uma técnica que permite a produção de milhões de cópias de um fragmento de DNA em um curto período de tempo. O fundamento da PCR baseia-se em um ciclo repetitivo de aquecimento e resfriamento da reação contendo o DNA alvo, primers específicos, nucleotídeos e uma enzima chamada DNA polimerase. O processo é divido em 3 fases cíclicas, Desnaturação, anelamento dos primers e extensão. 10º) Descreva os componentes da PCR explicando a função de cada componente. ● DNA alvo: É o fragmento de DNA que se deseja amplificar. Pode ser obtido a partir de uma amostra biológica, como sangue, tecido ou cultura de células. ● Primers: São pequenos fragmentos de DNA sintetizados em laboratório que se ligam especificamente às sequências de interesse no DNA alvo. Os primers delimitam a região que será amplificada durante a PCR. ● Nucleotídeos (dNTPs): São os blocos de construção do DNA, compostos por adenina (A), citosina (C), guanina (G) e timina (T). Durante a PCR, os dNTPs são adicionados à reação para que a DNA polimerase possa sintetizar novas cadeias de DNA complementares ao DNA alvo. ● DNA polimerase: É uma enzima responsável pela síntese do DNA. Na PCR, a enzima mais comumente utilizada é a DNA polimerase Taq, que é termoestável e resistente ao calor, permitindo que ela funcione em altas temperaturas. ● Solução tampão: É uma solução que mantém o pH estável e fornece as condições ideais para a atividade da DNA polimerase. Também contém íons necessários para a estabilidade da enzima e para o anelamento dos primers ao DNA alvo. ● MgCl2: O íon magnésio (Mg2+) é essencial para a atividade da DNA polimerase, pois atua como um cofator. A concentração adequada de Mg2+ na reação é importante para garantir a eficiência da PCR. ● Água: A água é adicionada para completar o volume da reação e fornecer o ambiente aquoso necessário para as reações químicas ocorrerem.
11º) Qual o fundamento do método PCR-SSPC?- É uma variação da reação
em cadeia da polimerase (PCR) que é usada para detectar polimorfismos de conformação de uma única fita de DNA. Esses polimorfismos podem estar relacionados a mutações ou variações genéticas que afetam a estrutura do DNA. O fundamentado do método PCR-SSCP baseia-se na detecção de diferenças na conformação das fitas de DNA devido a variações em sua sequência. No entanto, é importante notar que a interpretação dos padrões de migração no gel pode ser subjetiva e requer uma análise cuidadosa para identificar corretamente os polimorfismos de interesse.
12º) Qual o fundamento do método PCR-RFLP?- Uma técnica que combina
a reação em cadeia da polimerase (PCR) com o polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP). Ele é usado para detectar variações genéticas em sequências de DNA específicas que resultam em padrões de restrição diferentes. O fundamentado do método PCR-RFLP baseia-se na amplificação do DNA alvo por meio da PCR e, em seguida, na digestão desse fragmento amplificado por uma enzima de restrição específica. No entanto, é importante considerar que nem todos os polimorfismos podem ser detectados por PCR-RFLP, uma vez que dependem da presença de sítios de restrição específicos na sequência do DNA.
13º) Qual o fundamento do método Neste-PCR?- É uma variação da reação
em cadeia da polimerase (PCR) que aumenta a sensibilidade e especificidade da amplificação de um alvo de DNA específico. O fundamentado do método Nested PCR envolve a realização de duas rodadas consecutivas de amplificação do DNA alvo.
14º) Qual o fundamento do método PCR-Multiplex?- É uma variação da
reação em cadeia da polimerase (PCR) que permite amplificar simultaneamente múltiplos alvos de DNA em uma única reação. O fundamentado do método PCR-Multiplex envolve o uso de múltiplos pares de primers específicos, cada um direcionado a um alvo de interesse distinto.
15º) Qual o fundamento do método RT-PCR? - É uma técnica utilizada para
amplificar sequências de RNA específicas por meio da conversão do RNA em cDNA (DNA complementar) por uma enzima chamada transcriptase reversa. O fundamentado do método RT-PCR envolve duas etapas principais: a transcrição reversa (RT) e a reação em cadeia da polimerase (PCR).
16º) Descreva o método de PCR-Real Time ou PCR-Quantitativo
(qPCR)- Também conhecido como PCR em Tempo Real quantitativo (qPCR), é uma técnica que permite a amplificação e a quantificação em tempo real do DNA ou RNA alvo durante a reação de PCR. Diferente da PCR convencional, onde a detecção dos produtos amplificados ocorre após a conclusão da reação, a qPCR permite a monitorização em tempo real do acúmulo de produtos amplificados durante cada ciclo de amplificação. O fundamentado do método de PCR em Tempo Real envolve o uso de sondas ou corantes fluorescentes que se ligam especificamente aos produtos amplificados, gerando um sinal de fluorescência proporcional à quantidade de DNA ou RNA presente na reação.