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- Rede de Regulação Gênica: É uma coleção de segmentos de DNA de uma célula, os quais,
interagem indiretamente entre si (através de seus RNAs o seus produtos proteicos) e com outras
substâncias na célula, governando os níveis de expressão de mRNAs e proteínas.
- Em organismos unicelulares, células respondem a estímulos externos, ajustando o metabolismo do
organismos unicelular para tirar o melhor proveito do meio.
- Organismos multicelulares:
• células após divisão celular, possuem o mesmo conteúdo genético, mas não necessariamente o
mesmo conjunto de genes ativos
• Estas diferenças são desencadeadas por um cascata de sinais externos e/ou internos que vão
ativar ou desativar a expressão de um gene
- Mecanismo de Regulação hormonal: Regulação da expressão de um gene pelo receptor de
hormônio esteroide
- Sinais de transdução: é quando um estímulo/sinal, externo à célula, ativa um receptor de superfície
de membrana. Esta ativação induz uma modificação na parte voltada para o citosol do receptor
desencadeando um sinal em resposta a este estímulo
- Regulação gênica: são mecanismos usados por uma célula para controlar a quantidade que será
sintetizado de cada gene
• Função da regulação gênica:
- Sintetizar genes individuais somente quando necessários
-Modular a síntese de genes
-Evitar interações proteicas desnecessárias
-Gerenciar a diferenciação celular
- Entre a estruturação do genoma, o início da transcrição e o produto final de gene existem diversas
etapas onde regulação é possível
- A transcrição é principal etapa onde regulação é mais intensa.
- Em eucariotos regulação ocorre antes mesmo da transcrição: Mecanismos de metilação e
Condensação do DNA
- A regulação Pode ser classificada em dois tipos básicos:
• Constitutiva: É a transcrição e tradução de um gene de forma contínua e não regulada. Exemplos
são os genes de que são necessários em qualquer estágio da vida celular, como os genes
ribossomais e do ciclo metabólico básico.
• Modulada: É aquela onde um gene não é necessário em todas etapas da vida celular e assim
devem ser desligados ou induzidos a expressar, no momento mais adequado, o seu produto. Por
exemplo, genes que induzem cada etapa do ciclo celular, ou desenvolvimento embrionário.
- Processos regulatórios no DNA podem atuar como:
Elementos de atuação em cis: São sequências de nucleotídeos que regulam genes imediatamente
adjacentes a estas, não afetando genes em outros cromossomos
- Elementos no DNA afetam regulam a transcrição
- Transcritos com mRNA afetam processamento do mRNA, turnover e tradução
• Fatores de atuação em trans: São moléculas que se difundem, normalmente proteínas ou RNAs,
que regulam a expressão de genes com os quais entram em contato
- Fatores trans que regulam a transcrição são denominados fatores de transcrição.
- Modos de Regulação:
• Regulação positiva: ativador
• Regulação negativa: repressor
Proteína ativadora CAP – Proteína Catabólica Ativadora (“Catabolic Activator Protein”) ou CRP
Proteína Receptora de AMP cíclico (“cAMP Receptor Protein”)
Localizado no cromossoma bacteriano não necessariamente próximo
- Regulação pela Proteína Repressora:
• Indução da expressão
• Regulação alostérica
- Funcionamento do ciclo:
• Na presença de glicose e lactose há uma expressão basal.
• Na ausência de lactose a transcrição é reprimida
• Na presença de lactose o operon é ativado e o repressor é inativado e a transcrição inicia-se
- O Operador do Operon Lactose: Operador lac é formado por uma sequência de 21 nucleotídeos
que formam um repetição invertida com 20 nucleotídeos
• Exemplo Repressão/Ativação:
Detalhamento da região controladora do operon lac
O operador lac está situado na área coberta pela RNApol.
Se o Repressor está posicionado no operador a RNA pol. não tem como se ligar ao DNA para
transcrever
- Operon do Triptofano:
• Operon contém 5 genes necessários para síntese de Triptofano
• Além dos 5 genes contém o gene trpL que tem papel regulatório; trpR que não faz parte do operon
mas tem papel de sintetizar a proteína repressora;
• É ativado somente na falta do amino ácido triptofano
• O elemento regulador é o próprio triptofano
• Atua como um co-repressor
- Atenuador do Operon do Triptofano:
• O fato da disponibilidade do promotor à RNApol permite o início da transcrição. Nem toda
transcrição alcança o primeiro gene do operon
• Existe um 2º mecanismo de regulação: A Atenuação
• Regiões 3 e 4 formam um terminador (grampo com alça) seguidos de poli-U : Sequência líder e
Peptídeo líder
OBS: Quando a tradução não se acopla a transcrição, possível somente em bactérias pois não
possuem um envoltório nuclear, a região 1 de complementa a região 2 e a 3 com a 4. Isto termina a
transcrição na sequência poli-U.
- Atenuação do Operon do Triptofano:
• Existe a possibilidade da formação de 2 grampos de DNA (regiões 1 e 2; 3 e 4)
•Síntese de um peptídeo líder contendo dois códons seguidos para trp na falta de trp gera uma
limitação, impedindo a progressão do ribossomo e permitindo a formação de um grampo entre
regiões 2 e 3
● Controle da Transcrição
● RNA maduro
● Controle de Tradução
● Controle de degradação
- Regulação em Eucariotos:
● Alguns elementos controlam o ponto de início e outros quando deve ser o início
- Promotores:
● promotores podem ser um ou muitos cada um com uma proteína específica e para um gene
- Intensificadores/Silenciadores:
● Algumas proteínas reguladoras são comuns entre células diferentes e outros são específicos
● A taxa de expressão é controlada pela interação de proteínas com controle positivo e negativo
● Domínios: são regiões numa proteína que tem função específica. Ex.: domínio com afinidade ao
DNA; sítio de ligação de uma molécula efetora
● Motivos: quando um domínio ou uma parte dele tem uma estrutura muito similar em muitas
proteínas
- Domínios proteicos: é uma parte conservada de uma dada sequência proteica e (estrutura) terciária
que pode evoluir, funcionar e existir indepen-dentemente do resto da proteína
- DNA Imprinting: H19 e Igf2. O primeiro somente está ativo no cromossomo herdado da mãe e o
segundo no cromossomo herdado do pai
- Motivos Proteicos:
● são estruturas supersecundárias, que também estão presentes numa variedade de outras
moléculas.
● Há a formação de pontes de hidrogênio entre o hélice e as bases e também pode haver interação
entre amino ácidos com carga “+” e a fita de DNA (açúcar-fosfato-açúcar)
- Alguns Domínios de Ligação com DNA:
● Proteínas Hélice-volta-hélice
● Proteínas Hélice-laço-hélice
Também forma uma estrutura em forma de tesoura, só que é um monômero, que interage com o
sulco profundo do DNA
Forma junto com zíper de Leucina um conjunto de proteínas denominadas proteínas básicas de
zíper
Formado por duas estruturas proteicas em alfa-hélice unidas pelo meio formando uma
espécie de tesoura.
Esta estrutura interage com o sulco profundo do DNA
● Domínios de Ligação contendo Zinco
Incluem uma série de estruturas diferente que contém Zinco, ex.: Dedo de Zinco (TFIIIa),
Aglomerado de Zinco (cluster de zinco)
Podem ter mais de uma destas estruturas por proteínas
● Proteínas com Homeodomínio: são fatores de transcrição que compartilham uma estrutura
proteica que se liga à molécula de DNA.
- Ativadores:
● Ao contrário das bactérias eles não sobre põe o promotor para impedir a ligação da RNA pol
● Outros tipos de proteínas, os isoladores, por outro lado impedem que o intensificador se
alinhe com qualquer outra região promotora
● Não estão necessariamente localizados próximo a um gene (até 100kb de distância de uma
gene)
- Isoladores: é um segmento de DNA que funciona como limite entre dois genes. O isolante
“protege”, “isola” um gene do reflexo da ação de genes vizinho
- Locus Control Group – LCR: Um grupo agregado de genes que controla um agregado (cluster) de
genes Ex.: genes da ß globina. Não se sabe como funciona
- Sinal por Transdução: É a ativação da transcrição por meio de pequenas moléculas que
desencadeiam uma série de sinais que terminam por induzir a transcrição dos respectivos mRNA
- Silenciamento de Genes:
● Por metilação:
● Por deacetilação
- DNA Imprinting:
- Epigenética: é o estudo da variação do trato celular e fisiológicos que não são causados por
modificações na sequência de DNA.
• Exemplos de mecanismos que produzem modificações no DNA, sem modificar sua sequência são
a metilação do DNA ou acetilação de histonas. Ambas alteram como genes são expressos sem
modificar sua sequência
- Regulação Epigenética: Quando uma regulação é herdada ou seja é passada de uma geração para
seguinte
- Regulação Durante Síntese de RNA:
● Após a formação do complexo de iniciação a RNApolII esta inicia a síntese e para após ~100
pb.
● A RNApolII está presa pelo domínio do terminal “C”, o qual após fosforilação libera a enzima
para continuar a síntese
- Regulação por “Splicing” Alternativo:
REGULAÇÃO GÊNICA A NÍVEL DE CROMATINA
- Regulação na Cromatina:
- Classificação
• Eucromatina: Forma de cromatina menos compactada. Possui uma grande concentração de genes
normalmente, mas nem sempre, sendo transcritos. Forma de cromatina encontrada tanto em
eucariotos como em procariotos
• Heterocromatina Forma de DNA empacotada firmemente (de forma mais condensada).
Classificada em duas formas, constitutiva e facultativa. Histológicamente diferenciada pela
intensidade de coloração (hetero + escura; eu + clara). Contém DNA satélite e genes que estão
reprimidos à diversos níveis. É duplicada na fase tardia S. Existe somente em eucariotos. Telômeros
e centrômeros e corpúsculo de barr no (cromossomo X)
Constitutiva: Região próxima ao centrômero ou ao telômero. Genes contidos nestas regiões possui
uma expressão muito fraca
Facultativa: Regiões compactadas que variam de tipo celular. O que é compactado numa célula
pode não ser num tipo diferente. Estas regiões normalmente tem haver com a morfogênese ou
diferenciação celular
OBS:
- A composição de nucleotídeos numa sequência de DNA influencia a afinidade do nucleossomo
pelo DNA
- A maioria das proteínas interagem melhor com DNA livre
- O acesso a região depende da liberação pelo nucleossomo e a posição na região que interage com
nucleossomo
- Remodelagem da Cromátide
– Deslizamento
– Transferência
– Remodelação
– Deslizamento
– Transferência
– Remodelação
● CPR faz modificações nas histonas outras proteínas com afinidade ao DNA se ligam
● Estas por sua vez recrutam proteínas que vão acetilar os terminais N- das histonas