Expresso gnica o processo pelo qual a informao hereditria contida em um gene, tal como a sequncia de DNA, processada em um produto

to gnico funcional, tal como protenas ou RNA. Vrios passos no processo de expresso gnica podem ser modulados, incluindo a transcrio do mRNA e a modificao ps-traducional de uma protena. A regulao gnica d clula controle sobre sua estrutura e funo e a base para a diferenciao celular, morfognese e para a versatilidade e adaptabilidade de qualquer organismo. A regulao gnica pode tambm servir como substrato para mudanas evolutivas, dado que o controle do timing, localizao e quantidades de expresso gnica podem ter um efeito profundo nas funes (aes) do gene num organismo. A regulao gentica em geral refere-se ao controle da sntese de um transcrito gnico e seu produto proteico.

Viso geral
Apesar de um produto de um gene poder ser um ARN ou uma protena, a maioria dos mecanismos conhecidos regula a expresso de genes produtores de protenas. Qualquer passo da expresso de um gene pode ser modulada, da transcrio ADN-ARN at modificao pstranslacional de uma protena. A regulao gentica d clula o controle sobre a sua estrutura e funo, e a base da diferenciao celular, da morfognese e da versatilidade e adaptabilidade de qualquer organismo. As propriedades biolgicas de cada clula so amplamente determinada pelas protenas ativas expressas nela. Esta constelao de protenas expressas determina grande parte da arquitetura celular, suas interaes com seu ambiente e muitas outras propriedades fisiolgicas. Entretanto, em qualquer momento na histria da vida de uma clula, so expressas apenas uma pequena quantidade de RNA e protena codificadas em seu genoma. Em momentos diferentes, o perfil de produtos gnicos expressos pode diferir marcantemente, tanto com relao a que protenas so expressas quanto a em nveis. A regulao desenvolveu-se para permitir que uma clula enfrente as variaes em um tipo particular de circunstncia tal como disponibilidade de nutrientes, invaso de agentes infecciosos, mudana de temperatura ou outros estresses, e mudanas no estado de desenvolvimento da clula. Assim, algumas molculas regulatrias, tipicamente protena, devem ter um domnio sensor que interage com fatores apropriados no ambiente celular, de modo que seu papel regulador possa responder s necessidades da clula em um determinado momento.

[editar] Regulao em procariontes e eucariontes

Embora os procariontes e eucariontes tenham muitos dos mecanismos de regulao gnica em comum, existem algumas diferenas fundamentais na lgica subjacente. Ambas usam protenas regulatrias que se ligam perto da regio codificante de protenas para modular o nvel de transcrio. Entretanto, como os genomas eucariticos so maiores e sua gama de propriedades maior, inevitavelmente sua regulao mais complexa, requerendo mais tipos de protenas regulatrias e mais tipos de interaes com as regies regulatrias adjacentes. A diferena mais

importante que o DNA eucaritico compactado em nucleossomos, formando a cromatina, enquanto o DNA procaritico no tem nucleossomos.Nos eucariontes, a estrutura da cromatina dinmica e um ingrediente essencial na regulao gnica.

[editar] Procaritica
A respeito da simplicidade de sua forma, as bactrias tm uma necessidade fundamental de regular a expresso de seus genes. Um dos principais motivos que elas so oportunistas nutricionais. Considere como uma bactria obtm muitos compostos importantes, tais com aucares, aminocidos e nucleotdeos, necessrios ao metabolismo. As bactrias nadam em um mar de nutrientes potenciais. Elas podem obter estes compostos do ambiente ou produzir-los por vias enzimticas. A sntese de enzimas necessria para estas vias gasta energia e recursos celulares. Assim, tendo escolha, as bactrias iro produzir enzimas necessrias para iro obter compostos do ambiente. Para serem econmicas, elas iro produzir estes compostos apenas quando no houver outra opo. Em outras palavras, quando estes compostos no esto disponveis em seu ambiente local. As bactrias desenvolveram sistemas regulatrios que acoplam a expresso dos produtos gnicos a sistemas de sensores que detectam o composto relevante em um ambiente local da bactria. A regulao de enzimas que tomam parte no metabolismo de acar podem ser oxidadas para dar energia ou podem ser usadas como blocos estruturais para uma grande gama de compostos orgnicos. Entretanto existem muitos tipos diferentes de acar que as bactrias podem usar, incluindo a lactose, glicose, galactose e xilitol. Primeiro, necessria uma protena diferente importante para permitir que cada um destes acares entre na clula. Alm disso, necessrio um conjunto diferente de enzimas para processar cada m dos acares. Se uma clula produz simultaneamente todas as enzimas que ela possivelmente possa precisar, ela gastaria muito mais energia e materiais do que obteria pela degradao das prospectivas fontes de carbono.

[editar] Base de regulao transcricional procaritica

So necessrios dois tipos de interaes DNA-protena para uma transcrio regulada. Ambas ocorrem perto do stio no qual comea a transcrio do gene. Uma desta interaes DNA-protena determina onde comea a transcrio. O DNA que participa desta interao um segmento de DNA chamado de promotor, e a protena que se liga este stio a RNA polimerase. Quando a RNA polimerase liga-se ao DNA do promotor, a transcrio pode se iniciar algumas bases distantes do stio promotor. Cada gene deve ter um promotor ou ele no poder ser transcrito. O outro tipo de interao DNA-protena decide se a transcrio iniciada pelo promotor ir ocorrer. OS segmentos de DNA prximos ao promotor servem como stios de ligao para protenas regulatrias chamadas ativadores e repressores. Nas bactrias, a maioria destes stio alvo no DNA como um pr-requisito necessrio para comear a transcrio. Tais casos so s vezes chamados de regulao positiva, pois a presena da protena ligada necessria para a transcrio. Para outros genes , uma protena repressora deve ser impedida de se ligar a seu stio alvo como um pr-requisito necessrio para que comece a transcrio. Tais casos so s vezes

chamados de regulao negativa, pois a ausncia de repressor ligado permite que comece a transcrio. Como os ativadores e repressores regulam a transcrio? Em geral, uma protena ativadora ligada ao DNA ajuda fisicamente a ligao da RNA polimerase possa comear a transcrever. Uma protena repressora ligada ao DNA atua tipicamente seja interferindo fisicamente na ligao da RNA polimerase a seu promotor (bloqueando o incio da transcrio) ou impedindo o movimento da RNA polimerase ao longo da cadeia do DNA (bloqueando a transcrio).
Os genes devem conter dois tipos de stios de ligao para permitir a transcrio regulada. Primeiro, os stios de ligao para a RNA polimerase devem estar presentes. Segundo, os stios de ligao para as protenas ativadora ou repressora podem estar presentes na vizinhana do promotor.

Tanto as protenas ativadora e repressora devem ser capazes de reconhecer quando as condies ambientais so apropriadas por suas aes e agir de acordo. Assim, para que as protenas ativadora ou repressora faam seu trabalho, cada uma deve ser capaz de existir em dois estados: um que pode se ligar a seu DNA alvo e outro que no pode. O estado de ligao deve ser apropriado ao conjunto de condies fisiolgicas presentes na clula e seu ambiente. Para muitas protenas regulatrias, a ligao do DNA feita pela interao de dois stios diferentes na estrutura tridimensional da protena. Uma stio o domnio de ligao ao DNA. O outro stio, o stio alostrico, atua como um interruptor funcional que controla o domnio de ligao do DNA de dois modos: funcional ou no funcional. O stio alostrico interage com pequenas molculas chamadas efetores alostrico. No metabolismo de lactose, o acar lactose um efetor alostrico. Um efetor alostrico liga-se ao stio ao stio alostrico da protena regulatria de tal modo que muda a estrutura do domnio de ligao ao DNA. Alguma protena ativadoras ou repressoras devem se ligar a seus efetores alostricos antes que possam se ligar ao DNA. Outras podem se ligar ao DNA apenas na ausncia de seus efetores alostricos.
Os efetores alostricos controlam a habilidade das protenas ativadoras ou repressora em se ligar a seus stios alvo no DNA.

[editar] Um primeiro exame do circuito regulador lac

O trabalho de Franois Jacob e Jacques Monod nos anos 1950 mostrou como o metabolismo da lactose regulada geneticamente. Examinemos o sistema sob duas condies: a presena e a ausncia de lactose. As caractersticas para a regulao de lac incluem genes codificantes de protenas de ligao ao DNA. [editar] Genes estruturais lac O metabolismo da lactose requer duas enzimas: uma permease para transportar lactose para a clula e a -galatosidase para quebrar a molcula de lactose produzindo glicose e galactose. As estruturas da -galatosidase e protena permease so codificadas por duas sequncias adjacentes, Z, e Y, respectivamente. Uma terceira sequncia contnua codifica uma enzima adicional, chamada transacetilase, que no necessria para o metabolismo da lactose. Chamaremos Z, Y

e A de genes estruturais, em outras palavras, segmentos que codificam a estrutura da protena, e julgaremos esta designao posteriormente. A regulao da produo deste mRNA coordena a sntese de todas as trs enzimas. Isto , so produzidas todas ou nenhuma.
Se os genes codificantes de protenas constituem uma nica unidade de transcrio, a expresso de todos estes genes ser regulada coordenadamente.

[editar] Componentes regulatrios do sistema lac Os principais componentes regulatrios do sistema metablico da lactose incluem a protena regulatria da transcrio e dois stios de ancoragem, um stio para a protena regulatria e outro stio par a RNA polimerase. 1. O gene para o repressor Lac. Um quarto gene, o gene I, codifica a protena repressora Lac, assim chamada porque bloqueia a expresso dos genes Z,Y e A. O gene I fica mapeado perto dos genes Z,Ye A, mas esta proximidade no parece ser importante para seu funcionamento. 2. O stio promotor lac. O promotor (P) o stio no DNA ao qual se liga a RNA polimerase para iniciar a transcrio dos genes estruturais lac (Z,Y e A). 3. O stio operador lac. O operador (O) o stio no DNA no qual se liga o repressor Lac. Ele est situado entre o promotor e o gene Z perto do ponto no qual comea a transcrio do mRNA multignico. [editar] A induo do sistema lac Os segmentos P, O, Z,Y e A constituem juntos um peron, definido como um segmento de DNA que codifica um mRNA multignico bem como um promotor adjacente comum e uma reguladora. O gene lacI, codificante do repressor Lac, no considerado parte do prprio peron lac, mas a interao do repressor lacI e o stio operador lac crucial para a regulao apropriada do peron lac. O repressor Lac tem um stio de ligao ao DNA que pode reconhecer a sequncia do DNA do operador e um stio alostrico que se liga a lactose ou anlogos de lactose que so experimentalmente teis. O repressor ir se ligar apenas ao stio no DNA perto dos genes que ele est controlando, e no a outros stios distribudos pelo cromossomo. Ligando-se ao operador, o repressor impede a transcrio pela RNA polimerase que se ligou ao stio promotor adjacente.

[editar] Descoberta do sistema do sistema lac de controle negativo

Para estudar a regulao gnica, idealmente precisamos de trs coisas: uma dosagem bioqumica que nos permita dosar a quantidade de mRNA ou de protena expressa, ou ambos, condies confiveis nas quais as diferenas nos nveis de expresso ocorrem em um gentipo tipo selvagem, e mutaes que perturbam os nveis de expresso. [editar] Genes controlados juntos [editar] Mutaes polares

Ver artigo principal: Mutao polar

[editar] Represso catablica do peron lac: controle positivo

O sistema lac existente, que, por um longo processo evolutivo, foi selecionado para operar de modo timo para eficincia energtica da clula bacteriana, duas condies ambientais tinham que ser satisfeitas para que as enzimas metablicas sejam expressas. Uma condio que a lactose deve estar presente no ambiente.Esta condio faz sentido, pois ela seria ineficiente para a clula produzir as enzimas para o metabolismo de lactose se no houvesse substrato para ser metabolizado. A outra condio que a glicose no pode estar presente no ambiente da clula. Como a clula pode captar mais energia da degradao de glicose do que ela pode da degradao de outros acares, mais eficiente para a clula usar glicose do que a lactose. Assim foram desenvolvidos mecanismos que evitam que a clula produza as enzimas para o metabolismo de lactose quando a lactose e glicose esto juntas. A represso da transio dos genes do metabolismo de lactose na presena de glicose um exemplo de represso catablica. A transcrio das protenas necessrias para o metabolismo de muitos acares diferentes similarmente reprimida na presena de glicose.

[editar] Controle duplo, positivo e negativo: o peron de arabinose

Como o sistema lac, o controle procaritico da transcrio em geral no puramente positivo negativo. Ele parece misturar e ajustar aspectos diferentes de regulao positiva e negativa de modo diferentes. A regulao do peron de arabinose fornece um exemplo no qual uma nica protena de ligao ao DNA atua como ou um repressor ou um ativador. Os genes estruturais (araB, araA, araD) codificante as enzimas metablicas que degradam o acar arabinose. Os trs genes transcritos em uma nica unidade como um nico mRNA. A transcrio ativada em aral, a regio iniciadora, que contm tanto um stio operador quanto um promotor. O gene araC, que fica prximo, codifica uma protena ativadora. Quando ligada arabinose, esta protena ativa a transcrio do peron ara, talvez ajudando a RNA polimerase a se ligar ao promotor. Em adio, o mesmo sistema de represso catablica CAP-cAMP que regula a expresso do peron ara. C O I Gene Stios Controlador controladores B A D

Genes estruturais

Na presena da arabinose, tanto o complexo CAP-cAMP quanto o complexo AraC-arabinose deve ligar regio operadora de araI de modo a que RNA polimerase se ligue ao promotor e transcreve o peron ara. Na ausncia de arabiose, a protena AraC adota uma conformao diferente e reprime o peron ara ligando-se tanto a araI quanto a uma segunda regio operadora, araO, formando assim uma ala que impede a transcrio. Assim, a protena AraC tem duas

conformaes, uma que atua como um ativador e outra que atua como um repressor. As duas conformaes, dependendo de se o efetor alostrico arabinose tiver se ligado protena, diferem em suas habilidades de ligao a um stio alvo especfico na regio araO do peron.

[editar] Vias metablicas

O controle coordenado de genes em bactrias e bacterifagos muito generalizado. A maioria das funes coordenadas dos genes em procariontes atua por meio de mecanismos de peron. Em muitas vias que produzem molculas essenciais a partir de blocos estruturais inorgnicos simples, os genes que codificam enzimas so organizados em peron, completados com mRNA multignicos. Alm disso, nos casos em que a sequncia de atividade cataltica conhecida, h uma marcante congruncia entre a sequncia dos genes de peron no cromossomo e a sequncia na qual qual seus produtos atuam na via metablica. Esta congruncia bem ilustrada pela organizao do peron de triptofano em E. coli. No geral, os temas na regulao gnica procaritica so similares, embora existam variaes especficas em cada sistema. Vale a pena refletir sobre como a existncia de perons afeta nossa definio de um gene. At agora, vimos o gene sob perspectiva eucaritica como uma sequncia de DNA capaz de produzir um transcrito no tempo e local desenvolvimentalmente correto. Entretanto esta viso iguala um peron a um gene, porque a unidade transcrita. O que ento seriam as regies que codificam protenas tais como Z, Y, A? De fato no h resposta para esta pergunta. Palavras isoladas na linguagem humana nunca descrevem adequadamente a disposio das variantes de um tema encontradas na natureza.
Nos procariontes, os genes que codificam enzimas que esto nas mesmas vias metablicas so em geral organizadas em perons.

[editar] Eucaritica
Na superfcie, a transcrio e sua regulao tm muitas caractersticas que so comuns tanto a procariontes quanto eucariontes. Como os genes procariticos, a maioria dos genes eucariticos so controlados ao nvel transcricional so muitos similares aos encontrados em bactrias. Por exemplo, os eucariontes tambm so baseados em protenas regulatrias de ao trans que se ligam a sequncias alvo regulatrias de ao cis na molcula de DNA. Como nos genes procariticos, estas protenas regulatrias determinam o nvel de transcrio de um gene. Entretanto a regulao de genes eucariticos uma rea muito ativa de pesquisa, e os cientistas continuam a descobrir novos mecanismos. Algumas diferenas: 1. Em procariontes, todos os genes so transcritos em RNA pela mesma RNA polimerase, enquanto trs RNA polimerases funcionam nos eucariontes. A RNA polimerase II. 2. Os transcritos de RNA so amplamente processados durante a transcrio em eucariontes. As pontas 5' e 3' so modificadas e os ntrons so removidos. 3. A RNA polimerase II muito maior e mais complexa do que sua contraparte procaritica.

[editar] Viso geral

Os eucariontes tipicamente tm dezenas de milhares de genes, uma ou duas de ordens de magnitudes a mais do que a mdia dos procariontes. Alm disso, os padres de expresso de genes eucariticos podem se extraordinariamente complexos. Isto , pode haver uma grande variao em quando um gene ativado (transcrito) ou no (no transcrito) e como muitos transcritos precisam ser feitos. Por exemplo, um gene pode ser transcrito apenas durante o incio do desenvolvimento e outro apenas na presena de uma infeco viral. Finalmente, a grande maioria dos genes em uma clula eucaritica est desligada em qualquer momento. Com base apenas nestas consideraes, a regulao gnica eucaritica pode ser capaz de: 1. desligar a expresso da maioria dos genes no genoma. 2. gerar milhares de padres de expresso gnica com um nmero limitado de protenas reguladoras. Veremos que foi desenvolvido mecanismos complexos e engenhosos para garantir que a maioria dos genes em uma clula eucaritica no so transcritos (chamados silenciados). Antes de considerar o silenciamento transcricional, voltaremos a nossa ateno para a segunda pergunta: Como os genes eucariticos so capazes de exibir um nmero enorme e diversidade de padres de expresso? A chave para gerar tantos padres dupla. Primeira, quando ligado ao prprio promotor, o grande complexo RNA polimerase II pode catalisar a transcrio apenas em um nvel muito baixo (basal). Por este motivo, o complexo RNA polimerase II tambm chamado de aparelho aparelho basal de transcrio. Em contraste, a transcrio ativada, em taxas mais altas, requer a ligao de protenas regulatrias chamadas de fatores de transcrio, ou ativadores, aos elementos de ao cis no DNA ao redor do gene. O segundo componente importante para gerar muitos padres diversos de expresso gnica a modularidade e cooperatividade: padres complexos requerem muitos stios de ligao para diferentes protenas regulatrias que interajam umas com as outras e com o aparelho basal de transcrio. Este componente da diversidade de expresso gnica chamado de interao combinatria porque diferentes combinaes de fatores de transcritos podem apresentar interaes nicas que resultam em padres distintos de expresso gnica. Para acomodar todos estes stios de ligao para todos estes fatores de transcritos so em geral maiores que o prprio gene. O segundo componente importante para gerar muitos padres diversos de expresso gnica chamado de interao combinatria porque diferentes combinaes de fatores de transcrio podem apresentar interao nicas que resultam em padres distintos de expresso gnica. Para acomodar todos estes stios de ligao para todos estes fatores de transcrio, as regies regulatrias de muitos genes eucariticos so em geral maiores que o prprio gene.

[editar] Elementos regulatrios de ao cis

Para que a RNA polimerase II transcreve DNA em RNA na velocidade mxima, vrios elementos regulatrios de ao cis devem agir cooperativamente podemos distinguir trs classes de elementos com bases em suas localizaes relativas: 1. perto do stio de incio de transcrio est o promotor, a regio que se liga RNA polimerase II ao promotor;

2. perto do promotor esto as sequncias de ao cis proximais ao promotor que se ligam a protenas que por sua vez ajudam a ligao da RNA polimerase II seu promotor; 3. elementos adicionais de sequncias de ao cis podem agir a uma distncia considervel, e estes elemento, que agir a uma distncia considervel, e estes elementos, que so independentes de distncia, so chamados de acentuadorese silenciadores. Em geral, um elemento acentuador ou silenciador ir atuar apenas em um ou alguns tipos de clulas em um eucariontes multicelular. Os promotores,elementos proximais do promotor, e elementos independentes de distancias para a ligao de diferentes protenas de ao trans de ligao ao DNA.

[editar] O promotor e os elementos proximais ao promotor

Boxe rico em GC mRNA GGGCGGCCAATTATA -200pb ~100pb -30pb |_____________________| |_______| Elementos proximais Promotor do promotor

No boxe o esquema do promotor e elementos de sequncia proximal ao promotor. Como j mencionado, a ligao da RNA polimerase a este promotor no produz uma transcrio eficiente por si s. A transcrio acentuada de algum modo quando os fatores de transcrio ligam-se aos elementos proximais ao promotor (tambm chamados elementos antecedentes ao promotor ou UPE) que so encontrados dentro de 100 a 200 pb do stio de incio da transcrio. Um destes UPE o CCAAT boxe, e geralmente outro um segmento rico em GC mais antecedente. Os fatores de transcrio que se ligam aos elementos proximais ao promotor so expressos constitutivamente, em todas as clulas em todos os tempos, de modo que eles podem ativar a transcrio em todos os tipos de clulas. As mutaes nestes stios podem ter um efeito marcante na transcrio, demonstrando como eles so importantes .

[editar] Papel da cromatina

Neste ponto voc deve estar pensando que os mecanismos de regulao eucaritica parecem muito similares procaritica. H menos de uma dcada, muitos cientistas tambm pensavam que a regulao eucaritica era uma verso complicada do que havia descoberto em procariontes, exceto em que havia mais protenas reguladoras ligadas a mais elementos de ao cis para gerar um nmero maior de padres diversos de expresso gnica. Na ltima dcada, esta viso mudou acentuadamente, medida que os cientistas comearam a considerar o efeito de organizao do DNA genmico em eucariontes. O DNA dos procariontes est essencialmente "nu", tornando-o prontamente acessvel RNA polimerase. Por outro lado, os cromossomos eucariticos so organizados em cromatina, que composta de DNA e protena (principalmente histonas). A unidade bsica da cromatina o nucleossomo, contendo cerca de 150 pb de DNA enrolado duas voltas ao redor de um octmero de histomas. O octmero de histomas composto de duas subunidades cada uma com quatro histonas: histona 2A, 2B, 3, e 4.

Os nucleossomos podem se associar em estruturas de maior ordem que condensam ainda mais DNA. A cromatina altamente condensada chamada de heterocromatina, e a cromatina menos condensada chamada de eucromatina. A condensao de cromatina tambm muda no curso do ciclo celular. A cromatina das clulas que entram em mitose torna-se altamente condensada medida que os cromossomos se alinham na preparao para a diviso celular. Apos a diviso celular, as regies que formam a heterocromatina permanecem condensada especialmente ao redor dos centrmeros e telmeros enquanto as regies que formam a eucromatina tornam-se menos condensados. Os geneticistas suspeitaram de um papel limitado para influncia da estrutura da cromatina na regulao gnica no incio da histria da gentica. Naquela poca foi observado que o DNA heterocromtico continha poucos genes, enquanto a eucromatina era rica em genes. Mas o que a heterocromatna seno genes? A maior parte do genoma eucaritico composto de sequncia repetidas que no fazem protenas ou RNA estrutural, s vezes chamado de DNA sucata. Assim, os nucleossomos densamente compactados da heterocromatina foram ditos formando um estrutura "fechada" que era inacessvel a protenas reguladoras e inspitas a atividade gnica. J a eucromatina, com seus nucleossomos mais espaados, foi proposta como tendo uma estrutura "aberta" que permite a transcrio. A existncia de regies abertas e fechadas de cromatina tambm foi sugerida como o motivo para a diferena de 100 a 1000 vezes nas frequncias de recombinao na eucromatina comparada a heterocromatina. A eucromatina, com sua conformao mais aberta, foi suposta como sendo acessvel s protenas necessrias para a recombinao do DNA. Note que, nestes casos, a cromatina tem um papel passivo: as regies do genoma so ou abertas ou fechadas, e transcrio e recombinao so amplamente restritas a regies de cromatina aberta. Entretanto as observaes de trs fenmenos comeam a mudar esta viso. Estes fenmenos demostraram que cromatina eucaritica podia ser alterada e, mais importante, que os genes ativos nestas regies podiam ficar inativos. Os trs fenmenos so a inativao do X, imprinting e variegao do efeito de posio. [editar] Inativao do X Ver artigo principal: Inativao do cromossomo X [editar] Imprinting Ver artigo principal: Imprinting genmico [editar] Variegao Ver artigo principal: Variegao

[editar] Remodelagem da cromatina

O imprinting, inativao do X, e a variegao do efeito de posio demostraram que a expresso gnica pode ser reduzida ou silenciada sem mudar a sequncia de DNA do gene. Alm disso, a existncia deste fenmeno significa que a organizao do nucleossomo dinmica, ela pode

responder a mudanas no metabolismo celular ou programas de desenvolvimento condensado e descondensado e, deste modo contribuir para ligar e desligar genes. Nossa compreenso da estrutura da cromatina e seu efeito na expresso gnica continuamente evoluindo medida que novos achados no laboratrio levam a modificaes dos conceitos e definies existentes. Por exemplo, embora exista uma clara diferena entre eucromatina e heterocromatina constitutiva (as regies genmicas extremamente condensadas perto dos centrmeros e telmeros), o estado exato da cromatina necessrio para silenciar os genes no estar totalmente claro. Quando um gene silenciado, a eucromatina torna-se heterocromatina? Provavelmente no. Na verdade provavelmente exitem muitos estados estgios intermedirio de condensao de cromatina e a heterocromatina constitutiva. O termo heterocromatina facultativa tem sido usado para descrever as regies eucromticas que podem uma estrutura mais condensada de cromatina. Aqui ns iremos usar o termo cromatina silenciosa para descrever estas regies dinmicas da eucromatina no estado condensado que leva ao silenciamento gnico. Podemos imaginar vrios modos de alterar a estrutura da cromatina. Por exemplo, um mecanismo pode ser simplesmente mover os nucleossomos ao longo do DNA. Nos anos 1980 foram desenvolvidos tcnicas bioqumicas que permitiram aos pesquisadores determinar a posio dos nucleossomos no e ao redor dos genes. Nestes estudos, a cromatina foi isolada do tecido onde estava e comparada com a cromatina do tecido onde o mesmo gene estava desligado. O resultado para a maioria dos genes analisados foi que as posies do nucleossomo mudaram, especificamente em suas regies regulatrias. Assim, os nucleossomos so dinmicos: suas posies podem mudar durante a vida de um organismo. A transcrio pode ser reprimida quando o TATA boxe e as sequncias flanqueadoras esto enroladas em um nucleossomo e incapazes de se ligar ao complexo da RNA polimerase II. Ativao da transcrio iria requerer que o nucleossomo bloqueador fosse removido ou movido para outro local. Esta mudana na posio do nucleossomo tornou-se conhecida como remodelagem da cromatina. Uma vez que a remodelagem da cromatina seja conhecida como sendo uma parte integral da expresso gnico eucaritica, a corrida foi para determinar o(s) mecanismo(s) subjacente(s) e as protenas reguladoras responsveis. [editar] Triagens genticas protenas de remodelagem A anlise gentica do organismo modelo levedura foi essencial na dissecao dos componentes da regulao gnica eucaritica. Como um organismo unicelular eucaritico com um tempo de gerao muito curto, a levedura ideal para o isolamento e anlise de mutantes.
[editar] Histonas e remodelagem da cromatina

Os complexos proteicos tais como SWI-SNF que remodelam a cromatina reposicionando os nucleossomos constituem uma parte da maquinaria necessria para mudar a organizao da cromatina. [editar] A depleo de histonas em leveduras altera a expresso gnica Ver artigo principal: Histonas

Em adio a seus outros atributos como um organismo gentico modelo, as leveduras tm apenas duas cpias cada dos genes que codificam o cerne de histonas, tornando-os adequados para anlise mutacional. J os eucariontes superiores podem ter centenas de cpias dos genes de histona

[editar] O gene de -interferon revisado

Por simplificao, o promotor de -interferon foi mostrado sem os nucleossomos de modo a enfocar as interaes cooperativas e sinrgicas entre os fatores de transcrio. Hoje sabemos que o acentuassomo livre se nucleossomo mas circundado por dosi nucleossomos, chamados nuc I e nuc II. Um deles, nuc II, est estrategicamente posicionado no TATA boxe e stio de incio da transcrio. Conforme j foi discutido, os fatores de transcrio interagem para formar um stio de ligao de afinidade pelo coativador, CBP. Entretanto a ligao de GCN5 hoje conhecida como de fato precendedo a ligao de CBP. Como j dissemos, GCN5codifaca a atividade de histona acetilase, que acetila as histonas em nuc II. Esta acetilao seguida do recrutamento do coativador CBP, holoenzima de RNA pol II, e o complexo de remodelamento da cromatina SWISNF agora posicionada para descolar o nucleossomo 37 pb do TATA boxe, tornando a TATA boxe acessvel protena de ligao a TATA e permitindo que a transcrio seja iniciada.

[editar] A herana de estados da cromatina

A herana epigentica agora pode ser definida operacionalmente como a herana dos domnios da cromatina de uma gerao celular para a seguinte. O que esta herana significa que durante a replicao do DNA, tanto a sequncia do DNA e a estrutura da cromatina so fielmente passadas adiante para a prxima gerao celular. Entretanto, ao contrario da sequncia de DNA, a estrutura da cromatina pode mudar no curso do ciclo celular quando, por exemplo, os fatores de transcrio modificam o cdigo de histona, causando mudanas locais na posio do nucleossomo. O replissomo no s copia os filamentos parentais como tambm desmonta os nucleossomos nos filamentos parental como no filho. Isto tido como sendo feito pela distribuio aleatria das histonas antigas de nucleossomo existncia para os filamentos filhos e o encaminhamento de novas histonas para o replissomo. Deste modo, as histonas antigas com suas caudas modificadas e histonas novas com caudas no modificadas so montadas em nucleossomo que se tornam associadas a ambos os filamentos filhos. O cdigo levado pelas histonas antigas mais provavelmente guia a modificao de novas histonas e a reconstituio de estrutura local de cromatina que existia antes de sntese de DNA e a mitose.

[editar] Variegao do efeito de posio revisitada

Lembremos que o fentipo variegado de cor de olho em Drosophila foi demostrado como sendo devido a rearranjos cromossmicos que movem o gene white em seguida para o DNA heterocromtico. Evidentemente, a heterocromatina pode se espalhar para regies eucromticas adjacentes e silenciar a expresso do gene white. Para descobrir que as protenas podem estar implicadas no espalhamento da heterocromatina, os geneticistas isolaram mutaes em um segundo stio que ou suprimiam ou acentuavam o padro variegado. Os supressores de variegao [chamados Su(var)] so genes que, quando mutados, reduzem o espalhamento da heterocromatina,significando que o produto tipo selvagem destes genes , necessrio para o

espalhamento. Dentre mais de 50 produtos gnicos de Drosophilaidentificados por estas triagens estava a protena-I de heterocromatina (HP-1), que tinha sido previamente encontrada associada aos telmeros e centrmeros heterocromticos. Assim, faz sentido que uma mutao no gene HP-1 se apresente como um alelo Su(var), porque a protena de algum modo necessria para manter a heterocromatina. Protenas similares a HP-1 foram isoladas em diversos txons, sugerindo a conservao de uma importante funo eucaritica.

[editar] Estgios regulados

De seguida, uma lista dos estgios onde a expresso gentica regulada:

Modificaes qumicas e estruturais do ADN ou da cromatina Transcrio Modificao ps-transcricional Transporte de ARN Degradao de ARN Modificao ps-translacional

[editar] Bibliografia

Introduo gentica, Riffiths, Wessler, Lewontin, Gesbart, suzuki, Miller, 8 Edio, Guanabara Koogan, 2006.