Universidade Federal do Rio de Janeiro

Ciências Biológicas – Modalidade Médica

Genética Básica e Biologia Molecular
Professora: Wanda
Nome: Bruna Pereira de Lima, DRE: 120066116

Estudo dirigido- BMW 119-2020

1. Qual a importância de regulação da expressão gênica para os procariotos?
2. Em que etapas a expressão da maioria dos genes bacterianos é regulada?
3. O início da transcrição em bactérias depende da interação de um “complexo proteico” com sequências
no DNA. Explique em detalhes:
a. Onde encontram-se estas sequências no DNA.
b. Quais suas características.
c. Qual é o “complexo proteico” envolvido no processo e como ele interage com o DNA.
4. Na bactéria Escherichia coli a RNA polimerase (cerne) pode se ligar a diversos fatores “Sigma” para
iniciar a transcrição gênica. Com base nesta informação responda:
a. Qual a forma da holoenzima da RNAP envolvida na transcrição da maioria dos genes da
bactéria?
b. Todos os genes transcritos por esta holoenzima da RNAP são transcritos na mesma taxa?
Explique
c. Em condições de estresse e fome a Escherichia coli expressa alguns genes cujos promotores
não são dependentes da RNAP-Sigma70. Explique como estes genes são transcritos.
d. Quando submetida a altas temperaturas, E. coli expressa genes que de proteínas para
adaptação nesta condição. Explique.
5. Proteínas com funções de repressão ou ativação afetam a expressão gênica de alguns genes
bacterianos no início da transcrição. Explique.
6. Estas proteínas têm atividade afetada por interação com pequenas moléculas (efetores). Explique.
7. Definir “sistemas de dois componentes” (SDC).
8. Como se dá a ativação da expressão de genes por um SDC?
9. Em que condições e como atua o sistema PhoR/PhoB na regulação de genes em Escherichia coli?
10. De exemplos de outros tipos de genes que são ativados por SDC em bactérias.
Estudo Dirigido - Respostas

1- Para garantir a economia na produção de proteínas, já que o custo para síntese de uma proteína é
muito alto de 300 aminoácidos, logo essa economia será importante para a fisiologia celular.

2- A expressão da maioria dos genes das bactérias vão ser regulados na etapa de transcrição onde o gene
é transcrito dando origem ao RNA, se a bactéria não precisa de uma determinada proteína, então esse
gene vai ser transcrito em baixas quantidades.

3- A) Em uma sequência promotora, nos seus dois elementos um na posição – 10 e o outro na posição
- 35.

B) É um processo mediado pela interação de proteínas com o DNA, no qual a maioria dos genes
bacterianos tem a expressão regulada, esse processo controla quando e com que frequência o gene será
transcrito

C) O complexo protéico é a RNA polimerase que vai interagir se ligando a um sítio específico do
DNA.

4- A) A holoenzima da RNAP é formada por 6 subunidades, duas alfas, duas betas e uma ω que juntas
vão formar a cerne da enzima e possui também uma subunidade sigma que pode variar. As duas betas
juntas formam o sítio ativo que vai catalisar a síntese do RNA, as alfas são necessárias para a
montagem da estrutura e podem interagir com o DNA e com proteínas reguladoras também, a ω
possui uma função estrutural e o sigma é responsável por reconhecer sequências promotoras no DNA
que vai depender do tipo do sigma.

B) Não, pois a taxa de transcrição de um gene depende da interação entre as sequências do promotor e
a enzima.

C) Através do sigma 38/S que regula a expressão de genes quando a bactéria está deficiente de
nutrientes ou em condição de estresse.

D) Essa adaptação ocorre devido ao sigma 32/H responsável por regular a expressão de genes de
choque térmico, fazendo com que uma parte do cerne se ligue ao sigma 32/H que vai se ligar a
promotores de genes que vão dar origem a proteínas que ajudarão as bactérias a sobreviver a
condições de choque térmico.

5- Os ativadores e repressores são proteínas que se ligam ao promotor ou próximo a ele que vão afetar a
taxa de transcrição, os repressores vão reprimir e os ativadores vão ativar a taxa de transcrição de
 alguns genes que não participam de vias essenciais na vida da bactéria, então essas proteínas vão
reduzir ou aumentar a taxa de transcrição a partir do promotor.

6- O efetor é uma molécula que pode se ligar ou desligar do repressor ou ativador causando uma
alteração conformacional e afetando suas atividades, a interação do repressor ativo com o efetor, causa
a inativação do repressor e a interação do efetor com o ativador ativo causa a inativação do ativador.

7- Sistemas de dois componentes (SDC) é um sistema que também participa da regulação da expressão
de genes, formado por duas proteínas, chamadas proteína sensora e proteína reguladora de reposta,
cuja função é de sentir (sensora) ou responder (reguladora de resposta) a maioria dos estímulos do
meio ambiente. Cada SDC sente e responde a um sinal específico, mas seu mecanismo de ação é
bastante conservado.

8- Uma proteína chamada reguladora de resposta que faz parte do SDC, possui um domínio regulador
que irá se ligar a sequência de DNA fazendo a ativação da expressão de genes como reposta ao sinal
que foi recebido pelo domínio da proteína sensora que monitora a situação do meio externo.

9- O sistema PhoR/PhoB atua quando as bactérias estão em condições de limitação de fosfato inorgânico
(Pi) que é um elemento importante para síntese de proteínas, logo esse sistema de proteínas PhoR
(sensora) e PhoB (reguladora de resposta) se torna ativo fazendo a transcrição de genes que vão ajudar
a bactéria a sobreviver nessa nova condição de baixas concentrações de fosfato inorgânico.

10- Os genes OmpF e OmpC que são duas porinas de Escherichia coli.