Universidade Federal de Pelotas

CDTec - Graduação em Biotecnologia

Disciplina de Biologia Molecular

Genes e Genomas
Procarióticos
Priscila M. M. de Leon
Dra., Médica Veterinária
Profa, PNDP Biotecnologia/UFPel
 Revisando...
 Diferenças entre Procariotos x Eucariotos

 Estrutura do DNA

 Base nitrogenadada + pentose  Nucleosídeo

 Base nitrogenada + pentose + fosfato  Nucleotídeo

 Polímero de nucleotídeos  Ácido Nucleico

 Supertorção

 Desnaturação x Renaturação

 Compactação de DNA procarioto

Carl Woese, 1990: seres vivos celulares são divididos em 3 domínios

Sistemas de classificação recentes

Prokarya Prokarya: organismos unicelulares que não
possuem organelas , chamados de Procariotos.

Diferenças genéticas e
bioquímicas
 ARCHAEA x BACTERIA

X
Constituição da parede celular: arquea – polissacarídeos e proteínas
bactérias - peptideoglicanos

Organização e funcionamento gênico: arquea – mais semelhante eucariotos

bactérias - distintas

Ambiente: arquea – condições extremas e outras

RNA –ribossomal
bactérias diversos e novos habitats
 O QUE É UM GENE?

• Segmento do DNA que inclui toda sequência

nucleotídica necessária e suficiente para a
síntese de um polipeptídeo (proteína) ou de uma
molécula de RNA estável.
 Estrutura Básica de um GENE

• REGIÃO CODIFICADORA: sequencia nucleotídica

que codifica seu produto (proteína);

• SEQUENCIAS REGULADORAS: sequencias que

flanqueiam regulando sua expressão;
 Expressão de um GENE

• Expressão de um Gene inclui:

• Sua transcrição em um mRNA

• Tradução do transcrito em um cadeia polipeptídica

* Genes que codificam tRNAs e rRNAs são transcitos e não traduzidos

 Orientação de um GENE
• A transcrição, processo de síntese de RNA, progride no sentido 5’ para 3’;
• FITA CODIFICADORA (5’-3’) – sequencia estará representada no RNA
• FITA MOLDE (3’-5’) – serve de molde para a síntese de RNA
 RNA transcrito → complementar a fita molde, orientação 5’ – 3’

3’
Fita Codificadora

RNA transcrito:
Complementar a
5’
fita molde
3’  igual a fita
codificadora

Fita Molde
5’
Estrutura Básica de um Gene Procariótico

• Promotor: sítio de ligação da RNA Polimerase

• Terminador: sequência nucleotídica que determina o
desligamento da RNA Polimerase
• RBS: sítio de ligação do ribossomo
• UTR: regiões 5’ e 3’ não traduzidas (untranslated region)
 Estrutura Básica de um Gene Procariótico
Sequencias reguladoras da transcrição em procariotos:
• Promotor: sítio no DNA onde a RNA Polimerase se liga
• situado na região flanqueadora 5’
• a montante da região codificadora
•* RNA
RNApolimerase
polimerase é é
a enzima responsável
a enzima pela transcrição
responsável do gene do gene
pela transcrição
• Terminador: sequência nucleotídica que determina o desligamento da
RNA Polimerase da fita molde e o término da transcrição
• situada na região flanqueadora 3’
• a jusante da região codificadora;
 Características de um Gene Procariótico

• Colinearidade: característica típica de genes procariotos;

– Exata correspondência entre a sequencia nulceotídica da região
codificadora do gene (DNA) e a sequencia de aminoácidos da
cadeia polipeptídica/rRNa/tRNA;
– Cada códon de três nulceotídeos codifica para um aminoácido.

N de aminoácidos = 3N de pares de base

COLINEARIDADE DOS GENES E SEUS
PRODUTOS PROTÉICOS
 ESTRUTURA DE UM GENE DE
EUCARIOTO

Promotor Região Codificadora Sítio de PoliA

DNA

hnRNA Intron
AAAAAAAAAA
RNA

Exon
mRNA

AAAAAAAAAA
 Tamanho de um Gene Procariótico

• Tamanho de um gene → vinculado ao número e a extensão das

sequencias nulceotídicas que compõem as regiões reguladoras
e a extensão da região codificadora;
 Menor variação em Procariotos comparado a Eucariotos

TAMANHO = Regiões reguladoras + Região codificadora (tamanho do produto)

5-10% → ~20 pb 95—90% →~100 – 10.000 pb

Exemplo:
Escherichia coli
• Tamanho médio das Regiões Codificadoras: 951pb – 317 aa
• Total de genes: 4.300
• Região Codificadora mais longa: 7.149pb – 2.383 aa
• 381 genes com menos de 300pb – 100 aa
 Homologia entre Genes Procarióticos
• Homologia: similaridades observadas entre sequencias nulceotidicas
em muitos genes Procariotos;
• Genes que possuem ao menos 30% de identidade em suas
sequencias ao longo de pelo menos 60% de sua extensão
– Decorrente de processos evolutivos
– Origem evolutiva comum = sequencias nulceotídicas homólogas (parcial ou total)

• GENES PARÁLOGOS: decorrente de duplicação de uma região

cromossômica gerando dois genes homólogos;
• PSEUDOGENE: cópia gerada na duplicação que perde sua
funcionalidade;
• ORTÓLOGOS: quando a homologia entre dois genes é um evento de
especiação (surgimento de nova espécie);
• XENÓLOGOS: genes ortólogos adquiridos por eventos de transferência
gênica horizontal (Conjugação/Transformação/transdução)
Homologia entre Genes Procarióticos

30% de identidade ao longo

de 60% de sua seqüência
 O QUE É GENOMA?

 É o conjunto de genes de um
organismo
 Genomas Procarióticos
• Variam de tamanho entre: 150.000 pb (150kb) a 13.000.000 (13Mb)
– Bactérias: 2 a 5 Mb
• Espécies de um mesmo filo podem variar em até 10 vezes
– Arqueas: 2 Mb
• Variação entre espécies de um mesmo filo é mais restrita

* Tamanho do Genoma de Procariotos é potencialmente plástico (variando

ao longo da evolução)
• Genoma Mínimo: menor genoma capaz de abrigar o número
necessários de genes para a sobrevivência de um ser celular
• deve pertencer a um organismo procariótico
• Espécies de vida livre → ambientes variáveis , portanto necessitam de
um maior número de genes
 Buchnera aphidicola: 422 kb - 362 proteínas
 C. rudii: 159kb
 Sulcia muelleri: 245kb
Tamanho
 Cromossomos Procarióticos
• Genomas Procarióticos são constituidos por DNA de fita dupla
• Maioria dos procariotos possuem um ÚNICO CROMOSSOMO
 Molécula de DNA de fita dupla CIRCULAR covalentemente fechada
• Espécies com GENOMA MULTIMOLECULAR:
 Moléculas de DNA maiores → Genes ESSENCIAIS → CROMOSSOMOS
 Moléculas de DNA menores → PLASMÍDEOS
* Plasmídeos são considerados como parte do genoma

 Replicons – Unidades de Replicação

 Aspecto estrutural que define genomas Procariotos x Eucariotos
 Organização dos cromossomos em unidades de replicação
 Segmentos cromossômicos que replicam a partir de uma origem de replicação
 Cromossomo Bacteriano possui uma origem de replicação → 1 REPLICON
 Arqueas uma, duas ou três origens de replicação → 1, 2 ou 3 REPLICONS
Replicação Procarióticos
 Densidade Genica Procariotos
• Genomas Procariotos apresentam alta densidade genica
– Fatores que contribuem:
• Tamanho reduzido do genoma;
• Extensão das regiões codificadoras e reguladoras ;
• Número de genes por genoma;
• Extensão das regiões intergênicas (2-5 pb a 100pb)

DENSIDADE GÊNICA:
0,9 A 1,1 genes a cada 1.000pb
Aproximadamente 1 gene/1 kb
Bactérias: 0,9 gene/1 kb
Arqueas: tendem a ser mais compactos – 1,1 gene/ 1 kb
 Densidade Genica Procariotos
Uso de quase todo o genoma na codificação e na regulação
 Densidade Genica Procariotos
Uso de quase todo o genoma na codificação e na regulação

 Uma cópia de cada gene

 Várias cópias apenas do rDNA (DNA que codifica para o
rRNA)
 Sobreposição de genes
 Unidades Organizacional de Genomas Procariotos
• Motivos – sequencias nucleotídicas curtas que são unidades formadoras
de repetição, podem estar dispersas ou agrupadas no genoma, com função
estrutural ou de recombinação gênica;
• Repetição – sequencias repetidas; abundantes em eucariotos (50%) e
também presente em procariotos (2%); em geral menos de 10kb;
aleatórias ou em arranjos em tandem;
• Genes – repertório de genes para suprir sobrevivência do organismo; 20-
35% dos genes linhagem-específicos;
• Óperon – unidade funcional do genoma, onde duas ou mais regiões
codificadoras ocupam posições adjacentes e são controladas por uma
mesma região reguladora;
• Domínios e Macrodomínios – regiões extensas definidas por interações
entre proteínas cromatínicas e por superenrolamento
• Ilhas Gênicas – segmentos do genoma que diferem do restante, variam de
10 a 200 kb; como conteúdo de CG; asso ciadas a elementos genéticos
móveis como bacteriófagos – Ilhas de patogenicidade
 OPERON
• Os produtos de um OPERON podem ser funcionalmente
relacionados;
• Otimização da maquinaria reguladora da célula;
• Economia de espaço na DNA;
• Organização em operon presente em Arqueas e Bactérias
• As diferentes regiões codificadoras presentes em um mesmo operon
são COTRANSCRITAS em um mesmo RNA - POLICISTRÔNICO
– Cístron – equivalente a um gene
– Região Intercistrônica – sequencia entre regiões codificadoras

E. Coli k12 – 700 óperons, com 3 a 4 sequencias codoficadoras/óperon

 OPERON

~100 pb 2 a 5 pb

Promotor Regiões Codificadoras Terminador

OPERON
Ilhas genômicas
 Conteúdo G+C
• Fração de nucleotídeos Guanina e Citosina que apresenta o genoma;
• Que é complementar ao conteúdo de Guanina e Timina

GC (%) = (G+C) x 100

A+T+C+G

• Em procariotos varia de 22,5% a 72,1%

• Variável de acordo ao ambiente e tamanho do genoma

Sequencias de origem de replicação e

promotoras das transcrição  menos GC
 Orientação e localização de genes em
relação à origem e ao sentido da replicação

Tendência gênica da fita - muitos genes coorientados no sentido da replicação

 Dinâmica evolutiva dos genomas
procarióticos

Altamente proliferativos

Variabilidade genética
Expostos a condições
ambientais variáveis

Rápida evolução

Plasticidade genômica

Sintenia tende a diminuir de forma proporcional ao grau de

divergência evolutiva entre as espécies
 Processos evolutivos
Procariotos possuem diversos mecanismos moleculares que
proporciona a variabilidade genética

• Duplicação seguida de divergência

Processos inovadores • Transferência gênica horizontal
• Fusão de replicons

Introduzem inovações no genoma, como aquisição

de nova sequencia ou reorganização estrutural

• Seleção purificadora
Processos que • Simplificação genômica
determinam perdas • Degradação genômica

Processos que levam a preda de sequencias