ESTRUTURA DE ÁCIDOS

NUCLEICOS
Nucleotídeos:São moléculas
Estruturas de DNA, RNA e proteínas formadas pela união de um açúcar
• Estrutura de Nucleotídeos (pentose), uma base nitrogenada e um
• Ligação fosfodiéster grupo fosfato.
• Estrutura de DNA Os Ácidos Nucléicos (DNA e RNA)
• Desnaturação de DNA são formados por cadeias de
• Estrutura de mRNA, tRNA e rRNA nucleotídeos (polinucleotídeos).
• Estrutura de proteínas

Constituintes moleculares das células

• água, íons
• carboidratos
• lipídios
• proteínas
• ácidos nucleicos

Macromoléculas
DNA: ácido desoxirribonucleico
Unidade estrutural do DNA:
Desoxirribonucleotídeos:
fosfato, desoxirribose e base
Bases nitrogenadas:
purinas: Adenina e Guanina Ligação fosfodiéster em DNA e RNA
pirimidinas: Citosina e Timina é entre Carbono 5’ e Carbono 3’ das
riboses 5’→3
RNA: ácido ribonucleico Ligação fosfodiéster: ligação covalente
Unidade estrutural do RNA: entre extremidade OH do C3’ e dNTP
Ribonucleotídeos: fosfato, ribose e
base Bases nitrogenadas: purinas:
Adenina e Guanina pirimidinas:
Citosina e Uracila
As moléculas de DNA tem composição
distinta de bases
• A composição de bases do DNA
varia de uma espécie a outra.
• O DNA isolado de diferentes tecidos
do mesmo organismo tem a mesma
composição.
• A composição do DNA de um
organismo não varia com a idade,
estado nutricional ou mudanças
ambientais.
• Proporção A = T e C = G
Estrutura em dupla hélice do DNA
• Duas cadeias de DNA em hélice em
sentido antiparalelo.
As fitas antiparalelas do DNA são
complementares
•Esqueleto hidrofílico de fosfato e
açúcar no exterior em contato com
meio aquoso.
•As bases nitrogenadas no interior da
hélice, pareadas no mesmo plano.
Pareamento das bases
complementares na dupla fita do DNA
C e G: 3 ligações de Hidrogênio
T e A: 2 ligações de Hidrogênio
Fitas complementares de DNA
A partir da sequência de uma das fitas
de DNA, é possível conhecer a
sequência da fita complementar, de
forma que a representação é feita
apenas com uma delas.
Notação do DNA no sentido 5’ 3’
DNA está compactado no
cromossomo de eucariotos
A subtorção é uma propriedade da
estrutura terciária do DNA
Alterações estruturais da dupla hélice
de DNA
• A dupla hélice de DNA é altamente
estável
• Desnaturação: Perda de
conformação
• Desnaturação: Separação das fitas
• Anelamento: Formação de ligãções
de H entre duas fitas
Desnaturação de DNA
DNA isolado em solução aquosa
desnatura a pH extremos ou altas
temperaturas (>80°C).
Tm: melting point
Temperatura de dissociação depende:
• do pH
• da força iônica da solução
• do tamanho do fragmento de DNA
• da composição de DNA
Anelamento de DNA
A desnaturação é reversível pelo
retorno a pH neutro e diminuição de
temperatura.

Hibridização de DNA
DNA isolados de duas espécies foram
desnaturados, misturados e mantidos
a 65°C por algumas horas. Ocorreu
formação de DNA dupla fita híbrido.

Estrutura de RNA
• RNA mensageiro: mRNA
Fita simples.
Sequência complementar a fita molde
de DNA.

• RNA transportador: tRNA

• RNA ribossômico: rRNA

• As subunidades ribossômicas são
identificadas pelo valor de Svedberg
(S).
• 5S, 16S, 70S...
• S é o coeficiente de sedimentação
em centrifugação.
GENOMAS Estrutura geral do Genoma de E. coli
A origem eo término da replicação são
O que diferencia as células de um mostrados como linhas verdes, com
organismo? setas azuis indicando os replichores 1
A expressão dos seus genes e 2. Uma escala indica as
coordenadas em pares de bases. A
distribuição dos genes é representada
em dois anéis externos: As caixas
laranja são genes localizados na
cadeia apresentada, e as caixas
amarelas são genes na cadeia oposta.
As setas vermelhas mostram a
localização e direção da transcrição
dos genes rRNA, e os genes tRNA
O que significa genoma?
são mostrados como setas verdes.
Genoma é o conteúdo total de DNA de
uma célula.
Além do cromossomo, as bactérias
contém plasmídios
Comparação de células procarióticas e
eucarióticas
Genoma de eucariotos
• Genoma de um organismo eucarioto
consiste no genoma nuclear (onde
está a maioria dos genes) e genoma
das organelas (mitocôndiras e
plastídios).
• Mitocôndrias e cloroplastos são
Conteúdo de DNA, cromossomos e
derivados de procariotos
genes de alguns genomas
endosimbiontes ancestrais.

O tamanho de um genoma pode ser

expresso em número de pares de
bases nitrogenadas ou em massa
(picograma)
Tamanho do genoma
• O tamanho do genoma pode ser
determinado por sequenciamento do
DNA ou por citometria de fluxo.

O genoma nuclear de plantas

apresenta regiões de DNA com
sequências repetitivas

A transposição de segmentos de DNA

pode causar mutações quando
inseridos em regiões que codificam
uma proteína ou em sequencias
regulatórias.
REPLICAÇÃO Divisão celular de procariotos
O cromossomo bacteriano se encontra
• Conceito de Replicação de DNA intensamente compactado em um
• Estrutura do cromossomo em nucleoide. É mais dinâmico e com
bactérias uma estrutura mais irregular que a
• Características da Replicação cromatina dos eucariotos, refletindo o
• Direção da Síntese de DNA ciclo celular mais curto e intensa
• DNA polimerase atividade metabólica bacteriana.
• Degradação do DNA por nucleases
• Função das DNA polimerases de E. Síntese de DNA a partir de uma fita
coli molde de DNA.
• Principais proteínas envolvidas na
replicação Replicação do DNA é
• Fases da replicação em procariotos semiconservativa
• Replicação em eucariotos

Replicação do DNA
• A habilidade das células de manter
um alto grau de ordem em um A replicação começa em uma origem
universo caótico depende da e ocorre em duas direções.
duplicação acurada de uma vasta
quantidade de informação genética
carregada na forma química do DNA.

Reparo e Mutação
• Enquanto que a sobrevivência de
curto prazo de uma célula depende da
prevenção de mudanças no seu DNA,
A síntese de DNA ocorre na direção
• A sobrevivência a longo prazo de
5’→ 3’ .
uma espécie requer que a sequência
A síntese de DNA é semi-descontínua.
de DNA seja variável (mutável) em
A extensão da fita de DNA ocorre no
muitas gerações.
sentido 5’→3’
DNA é sintetizado por DNA • DNA polimerase III, 1970s, enzima
polimerases principal da replicação.
• DNA polimerase só inicia a • DNA polimerase IV e V, 1999, reparo
replicação a partir de uma de DNA.
extremidade 3’OH livre de um iniciador
(primer) de DNA ou RNA. DNA POLIMERASE I
• Desempenha funções de reparo de
A replicação é muito precisa DNA e remoção de iniciadores de
• A replicação ocorre com alto grau de RNA durante a replicação.
fidelidade. Atividade exonuclease 5’→3’.
• Quando um erro de incorporação
ocorre, os nucleotídeos são removidos DNA POLIMERASE III
por atividade exonuclease e • Principal enzima da replicação. •
substituídos, em um processo de Enzima complexa composta de 14
revisão (proof reading). subunidades.
• Um erro ocorre para 109 Duas subunidade b
nucleotídeos copiados.
É necessário para a replicação:
DNA é degradado por nucleases • enzima DNA polimerase
• DNases • DNA molde fita simples
• As células contém diversas e • Fragmento dupla fita já existente com
diferentes nucleases. 3'-OH livre (iniciador ou primer)
• Exonuclease: Degradam DNA pela • dNTP (dATP, dCTP, dGTP, dTTP)
extremidade 3’ ou 5’. • Mg2+
• Endonuclease: Degradam DNA no
interior da molécula de DNA. É necessário para a replicação 20
diferentes enzimas e proteínas :
E. coli contém no mínimo 5 DNA • Helicase: separa as duas fitas de
polimerases distintas DNA.
• DNA polimerase I, 1955, revisão e • Topoisomerase: cliva a ligação
reparo de DNA. fosfodiéster para diminuir o
• DNA polimerases II , 1970s, reparo superenovelamento.
de DNA. • Proteínas ligantes de DNA:
estabilizam as fitas simples de DNA.
• Primase: sintetiza RNA iniciador.
• DNA ligase: faz a ligação fosfodiéster
em uma brecha da dupla fita.
Replicação do cromossomo de E.coli
3 fases:
• Início, • Elongação, • Término.
Replicação: Elongação
• Síntese da fita contínua
• Síntese da fita descontínua
Priming: DNA primase sintetiza RNA
iniciador

Início da Replicação ori C

Origem de replicação
• Sequência de DNA de 245 pb
Fita contínua (leading strand) e fita
altamente conservada entre origens
descontínua (lagging strand)
de replicação de diversas bactérias.
• 9 proteínas participam da fase de
início.
• Tipicamente cromossomo bacteriano
apresenta uma única origem de
replicação.
 Fragmentos iniciadores de RNA são
removidos pela atividade exonuclease
5’→3’ da DNA polimerase I

Síntese da fita descontínua

DNA ligase fecha as brechas entre os

fragmentos de Okazaki

Síntese da fita descontínua

• Fragmentos iniciadores (primers) de
RNA são removidos pela atividade
exonuclease 5’→3’ da DNA
polimerase I.
• DNA ligase fecha as brechas entre
os fragmentos de Okazaki.

Síntese da fita descontínua