RESUMO 1 – LIVRO BIOLOGIA MOLECULAR
ESTRUTURA E FUNÇÃO DO DNA
 DNA: molécula que carrega a
informação hereditária. As informações
podem ser transmitidas de forma
hereditária.
 O DNA consiste em duas cadeias
de nucleotídeos complementares.
 As cadeias são antiparalelas
entre sí e são unidas por ligações de
hidrogênio.
 São compostos de açucares com
cinco carbonos, aos quais um ou mais
grupos fosfato estão ligados, e uma base
contendo nitrogênio.
 No DNA, o açúcar é uma
desoxirribose ligada a um único grupo
fosfato.
 A cadeia principal é formada por
alternância entre açúcar-fosfato-
açucar-fosfato.
 A cadeia principal de açúcar-
fosfato encontra-se na região externa e
as bases estão voltadas para o interior
da dupla – hélice.
 As bases são complementares e
se pareiam em: A-T, A-U (RNA) e G-C.
 Os membros de cada par de
bases somente encaixam-se na dupla –
hélice se as duas fitas estiverem na
posição antiparalela.
MECANISMO PARA HEREDITARIEDADE
 Cada fita de DNA contém
sequencia de nucleotídeos que é
exatamente complementar a sequência
de nucleotídeos da fita associada,
podendo atuar como monte para
síntese de uma nova fita.
 Os genes contem instruções para
produzir proteínas.
 Genoma: Conteúdo total da
informação de um organismo, codifica
todas as moléculas de RNA e proteínas.
O genoma humano inclui
aproximadamente 21mil genes que
codificam proteínas, os quais, por meio
de splicing, erigiram um numero maior
ainda de proteínas.
 Em eucariotos o DNA é limitado
ao núcleo celular.
CROMOSSOMOS
 Única e enorme molécula de
DNA linear juntamente com proteínas
que enovelam e empacotam a fina fita
de DNA em uma estrutura mais
compacta.
 O complexo que engloba DNA e
as proteínas associadas é chamado de
cromatina.
 A representação dos 46
cromossomos mitóticos é chamada de
cariótipo humano.
 Os cromossomos carregam os
genes (segmento de DNA que contém as
instruções para produção de proteína).
 Os genes são formados por
éxons e íntrons, além de sequências de
DNA regulador.
 As sequencias de DNA regulador
são responsáveis por assegurar que
cada gene será ativado e desativado no
devido tempo.
 Cada molécula de DNA que
forma um cromossomo linear deve
conter um centrômero, dois telômeros e
origens de replicação.
 Origem de replicação: local em
que a duplicação do DNA é iniciada.
 Os cromossomos eucarióticos
contem muitas origens de replicação
para assegurar que os cromossomos
sejam replicados.
NUCLEOSSOMOS
 Cromatina: proteínas (histonas
ou não) associadas ao DNA nuclear.
 Nucleossomos: DNA enrolado
em um núcleo de histonas.
 O nucleossomo é composto por
um cerne octamérico de proteínas
histonas ao redor das quais se enrola a
dupla-hélice de DNA.
 Os nucleossomos são
compactados com o auxílio da histona
h1 em arranjos quase regulares,
formando uma fibra de cromatina.
 Os complexos de remodelagem
colaboram com as chaperonas de
histonas e permitem que os cernes
nucleossômicos sejam reposicionados,
reconstituídos a partir de diferentes
histonas ou completamente removidos
para expor o DNA neles enrolado.
CROMATINA
 Pode apresentar-se altamente
condensada (heterocromatina) e forma
menos condensada (eucromatina)
 Quando regiões da eucromatina
são convertidas ao estado de
heterocromatina, seus genes
geralmente são desligados.
MECANISMOS DE REPLICAÇÃO DO DNA
 Maquinaria de replicação
 Uso de um dna molde, processo
pelo qual a sequência de nucleotídeos
de uma fita é copiada em uma
sequência complementar de DNA.
 Esse processo exige a separação
de hélice de DNA em duas.
 Essa separação expõe os grupos
doador e aceptor das ligações de
hidrogênio em cada base do DNA.
FORQUILHA DE REPLICAÇÃO
 A forquilha é assimétrica
 Cada fita atua como um molde
para a formação de uma fita nova.
 Semiconservativa: Cada uma das
duas células filhas resultantes da divisão
celular herda uma nova dupla-hélice de
DNA formada por uma fita original e
uma fita nova.
  A região de replicação ativa é
chamada de forquilha de replicação.
 Na forquilha, um complexo
multienzimático que contém a DNA-
polimerase sintetiza o DNA das duas
fitas novas
 As DNA-polimerase nas
forquilhas de replicação somente
podem sintetizar na direção 5’3’.
 A fita-filha de DNA sintetizada
continuamente é denominada fita-líder,
ou fita contínua. Sua síntese precede
levemente a síntese da fita-filha
sintetizada de modo descontínuo,
conhecida como fita retardada, ou fita
descontínua. Na fita retardada, a
direção da polimerização dos
nucleotídeos é oposta à direção do
crescimento da cadeia de DNA.
A síntese dessa fita pelo mecanismo
descontínuo e “ao contrário” significa
que apenas o tipo de DNA-polimerase 5’
para 3’ é utilizado na replicação de DNA.
 Fragmentos de Okazaki:
segmentos transitórios com 1000 a 2000
nucleotídeos.
CORREÇÃO EXONUCLEOLÍTICA PELA
DNA POLIMERASE DURANTE A
REPLICAÇÃO DO DNA
 A porção da DNA-polimerase
que remove o nucleotídeo incorreto é
um componente especializado de uma
grande classe de enzimas, conhecidas
como exonucleases, que clivam
nucleotídeos, um a um, a partir de uma
das extremidades de polinucleotídeos.
 O nucleotídeo correto tem uma
maior afinidade pela polimerase em
movimento em comparação ao
incorreto, porque o pareamento correto
é energeticamente mais favorável
 Nucleotídeos pareados de forma
incorreta são mais difíceis de serem
adicionados e, portanto, difundem-se
mais prontamente no meio, antes que a
polimerase possa adicioná-los de modo
errado
 Se o nucleotídeo errado é
covalentemente adicionado a cadeia
crescente, a próxima reação de correção
será a correção exonucleolítica.
 O pareamento incorreto de
nucleotídeos na extremidade 3’ -OH da
fita iniciadora não serve como molde
eficiente porque a polimerase tem
dificuldade em alongar a fita.
 A exonuclease de correção de
erro 3’-5’ remove qualquer nucleotídeo
não pareado ou mal pareado na
extremidade do iniciador, continuando
até que um número suficiente de
nucleotídeos tenha sido removido, e daí
regenerar uma extremidade terminal 3’-
OH corretamente pareada capaz de
iniciar a síntese de DNA.
autocorreção, que remove seus
próprios erros de polimerização
conforme se desloca pelo DNA.
 Apenas a replicação do DNA na
direção 5’-3’ permite correção eficiente
dos erros.

MOLÉCULAS DE INICIADORES DE RNA

NA FITA RETARDADA - PRIMASE

 Na fita líder apenas um iniciador

é necessário para o início da replicação
 No lado descontínuo da
forquilha cada vez que a DNA
polimerase completa um pequeno
fragmento de Okazaki ela deve iniciar a
síntese de um fragmento
completamente novo em um sítio mais
adiante na fita molde.
 DNA primase: Ela utiliza os
ribonucleosídeos trifosfato para
sintetizar pequenos iniciadores de RNA
na fita retardada.
 A síntese de cada fragmento de
Okazaki termina quando a DNA-
polimerase encontra o iniciador de RNA
ligado à extremidade 5’ do fragmento
anterior. Para produzir uma cadeia
contínua de DNA a partir de vários
fragmentos na fita retardada, um
sistema especial de reparo atua
rapidamente para retirar o iniciador de
RNA e substituí-lo por DNA.

DNA LIGASE

 Liga a extremidade 3’ do novo

fragmento de DNA a extremidade 5’ do
fragmento anterior, completando o
processo
 Essa enzima religa uma ligação
fosfodiéster clivada.
 A DNA polimerase, dessa forma,
atua como uma enzima de
  A DNA ligase utiliza uma
molécula de ATP para ativar a
extremidade 5’ na quebra antes da
formação da nova ligação.
DNA HELICASES E PROTEÍNAS
LIGADORAS DE DNA DE FITA SIMPLES
 Para que a replicação ocorra, é
necessário abrir a dupla hélice de DNA à
frente da forquilha, de modo a obter uma
fita molde
 A dupla hélice, no entanto, é
estável e suas bases pareadas são unidas
fortemente.
 A DNA helicase separa as fitas.
 A dupla-hélice é desfeita à
medida que a helicase passa pelo DNA de
fita simples, liberando o pequeno
fragmento de DNA em uma reação que
requer a presença da proteína helicase e
de ATP. O movimento sequencial rápido
da helicase é promovido pela hidrólise de
ATP
 As proteínas ligadoras de fita
simples de DNA (SSB), também
denominadas como as proteínas
desestabilizadoras de hélices, ligam-se
fortemente e de maneira cooperativa
para expor fitas de DNA sem encobrir
suas bases.
 Essas proteínas são incapazes de
abrir diretamente uma longa hélice de
DNA, mas auxiliam as helicases,
estabilizando a conformação distorcida e
de fita simples.
  Elas cobrem e estendem as
regiões de DNA de fita simples, que
ocorrem a todo momento no molde da
fita retardada, e evitam a formação de
pequenos grampos que formam-se
rapidamente no DNA de fita simples.
 Se não forem removidos, esses
grampos de hélices podem impedir a
síntese de DNA catalisada pela DNA-
polimerase.
 A PCNA atua como uma cinta
deslizante, mantendo a polimerase
firmemente associada ao DNA enquanto
está em movimento, mas a libera tão
logo a polimerase encontra uma região
de DNA de dupla fita.
 A PCNA forma um grande anel ao
redor da hélice de DNA

CINTA DESLIZANTE

 Mantém a DNA polimerase em

movimento sobre o DNA
 A DNA polimerase sintetiza
apenas um pequeno segmento de
nucleotídeos e logo se dissociam do
DNA molde.
 A rápida dissociação permite que
a DNA polimerase que terminou um
fragmento de Okazaki na fita retardada
seja reciclada rapidamente e possa
iniciar o próximo
 Essa rápida dissociação,
entretanto, dificulta a síntese de longas  A DNA-polimerase sobre o
fitas, necessitando de uma proteína molde da fita retardada também utiliza
acessória (PCNA). a cinta, porém cada vez que a
polimerase alcança a extremidade 5’ do
fragmento de Okazaki anterior, a
polimerase libera-se da cinta e dissocia-
se do molde. Essa molécula de
polimerase então se associa a uma nova
cinta montada sobre o iniciador de RNA
do próximo fragmento de Okazaki.

DNA – TOPOISOMERASES

 Evitam o emaranhamento do
DNA durante a replicação
 Alivia a torção existente nas
fitas.
 Nuclease reversível que se liga
covalentemente a um fosfato da cadeia
principal do DNA, clivando uma ligação
fosfodiéster na fita de DNA.
 Um tipo de topoisomerase,
chamado de topoisomerase I, produz
uma clivagem temporária na fita
simples; essa quebra na cadeia permite
que as duas porções da hélice de DNA,
formadas dos dois lados da quebra,
girem livremente uma em relação à
outra, usando a ligação fosfodiéster na
fita oposta à quebra como ponto de
suporte para a rotação.
 Qualquer tensão na hélice de
DNA irá ditar a rotação na direção que
alivia essa tensão. Como resultado, a
replicação pode ocorrer com a rotação
de pequenos segmentos da hélice – a
porção logo à frente da forquilha. Como
a ligação covalente que une a proteína
DNA-topoisomerase ao fosfato do DNA
mantém a energia da clivagem da
ligação fosfodiéster, a religação é rápida
e não requer fornecimento adicional de
energia
 primase, que catalisam a polimerização
dos nucleosídeos trifosfato; as DNA-
helicases e as proteínas ligadoras de
DNA de fita simples (SSB), que auxiliam
na abertura da dupla-hélice para
permitir que as fitas sejam copiadas; a
DNA-ligase e uma enzima que degrada
os iniciadores de RNA, para ligar os
fragmentos descontínuos de DNA
formados na fita retardada, e as DNA-
topoisomerases, que aliviam a tensão
causada pelo enrolamento helicoidal e
os problemas de emaranhamento do
DNA.

SÍNTESE

 A replicação do DNA ocorre em

uma estrutura em forma de Y, chamada
de forquilha de replicação. Uma enzima
DNA-polimerase autocorretiva catalisa a
polimerização de nucleotídeos na
direção 5’-3’, copiando uma fita-molde
de DNA com extraordinária fidelidade.
Como as duas fitas da dupla-hélice de
DNA são antiparalelas, essa síntese de
DNA 5’-3’ só pode ser realizada
continuamente em uma das fitas da
forquilha de replicação (fita-líder).
 Na fita retardada, pequenos
fragmentos de DNA são sintetizados de
trás para frente. Uma vez que a DNA-
polimerase autocorretiva não pode
iniciar uma nova cadeia, esses
fragmentos da fita retardada são
iniciados por pequenas moléculas de
RNA, que subsequentemente são
removidas e substituídas por DNA.
 A replicação do DNA necessita da
cooperação de várias proteínas,
incluindo a DNA-polimerase e a DNA-
  Muitas dessas proteínas
associam-se entre si na forquilha de
replicação, formando uma “maquinaria
de replicação” altamente eficiente, em
que as atividades e os movimentos
espaciais dos componentes individuais
são coordenados.

ORIGEM DE REPLICAÇÃO

 Para iniciar a síntese de DNA, a

dupla hélice deve ser aberta e as duas
fitas separadas para expor as bases não
pareadas.
 É um processo iniciado por
proteínas iniciadoras que se ligam à fita
dupla de DNA e separam as duas
ligações, rompendo as ligações de
hidrogênio entre as bases.
 As origens de replicação são as
posições onde a hélice inicialmente é
aberta.
 O par de base A-T é unido por
menos ligações de hidrogênio do que o
par G-C. Segmentos de DNA ricos em A-
T são relativamente mais fáceis de
serem separados.
 Os cromossomos bacterianos
geralmente têm uma única origem de
replicação do DNA.
 Os cromossomos eucariotos têm
múltiplas origens.
 Múltiplas origens permite uma
replicação rápida e é uma reserva de
segurança caso a origem principal falhe. REPARO DO DNA
 Criam uma folha de replicação à
medida que se deslocam em direções  Sem o reparo do DNA, as lesões
opostas, distanciando-se do ponto de espontâneas rapidamente modificariam
origem comum, parando apenas as sequências de DNA.
quando se encontram cabeça a cabeça,  A estrutura de dupla-hélice do
ou quando chegam à extremidade do DNA é perfeitamente adequada para o
cromossomo. reparo, pois possui duas cópias
separadas de toda a informação
genética – uma em cada fita. Portanto,
quando uma das fitas é danificada, a fita
complementar possui uma cópia intacta
da mesma informação, sendo
normalmente usada para restaurar a
sequência nucleotídica correta na fita
danificada.
 Uma lesão no DNA pode ser
removida por mais de uma via.
REPARO POR EXCISÃO DE BASES
 Catalisa a remoção hidrolítica,
remove a base do açúcar.
 A enzima uracila DNA-glicosilase
remove uma citosina acidentalmente
desaminada no DNA. Após a atuação
dessa glicosilase (ou outra glicosilase
que reconheça um tipo diferente de
lesão), a porção de açúcar-fosfato do
resíduo que sofreu perda da base é
clivada do DNA pela ação sequencial da
endonuclease AP e de uma
fosfodiesterase. (Essas mesmas enzimas
iniciam diretamente o reparo de sítios
depurinados). O intervalo de um único
nucleotídeo é, por sua vez, preenchido
pela DNA-polimerase e pela DNA-ligase.
O resultado final é que a base U
acidentalmente criada por desaminação
foi restaurada a C.
 A endonuclease AP é chamada
assim porque reconhece qualquer sítio
na hélice de DNA que contenha um
açúcar desoxirribose com ausência da
base; esses sítios podem surgir pela
perda de uma purina (sítios apurínicos)
ou pela perda de uma pirimidina (sítios
apirimidínicos).
REPARO POR EXCISÃO DE
NUCLEOTÍDEOS
 Após a detecção de uma lesão
como um dímero de pirimidina por um
complexo multienzimático ocorre uma
clivagem em cada lado da lesão, e uma
DNA-helicase associada remove todo o
segmento de fita danificada.
 Uma vez reconhecida a lesão,
uma helicase é recrutada para
desenrolar a duplex de DNA localmente.
A seguir, a nuclease de excisão entra e
cliva nos dois lados da lesão, produzindo
um intervalo de cerca de 30
nucleotídeos.
 Dímero de pirimidina: Composto
orgânico formado por duas bases
pirimidínicas sucessivas e próximas
numa sequencia de DNA unidas por uma
ligação covalente.
QUEBRAS NA FITA
 Quebras na fita: tipo de lesão no
DNA perigosa quando ocorre nas duas
fitas da dupla hélice, uma vez que não
sobra uma fita molde intacta para o
reparo.
 As quebras na fita podem
ocorrer por radiação ionizante, erros na
replicação, agentes oxidantes e alguns
metabólicos produzidos pela célula
 Se não corrigida, pode ocorrer
degradação dos cromossomos em
fragmentos menores e a perda de genes
na divisão celular.
 Para tratar esse tipo de lesão
existem dois mecanismos distintos.
 O mecanismo de ligação de
extremidades não homólogas faz com
que as extremidades da quebra são
simplesmente justapostas e religadas,
geralmente com a perda de
nucleotídeos no sítio da ligação.
 A ligação de extremidades não
homólogas altera a sequência de DNA
original quando corrige um
cromossomo quebrado.
 A degradação inicial das
extremidades da quebra é importante
porque os nucleotídeos no local da
quebra inicial geralmente foram
danificados e não podem ser ligados.
 A ligação de extremidades não
homólogas normalmente ocorre antes
das células duplicarem seu DNA.
 Um tipo mais preciso de reparo
de quebras na fita dupla ocorre no DNA
recém sintetizado. O DNA é reparado
usando a cromátide irmã como molde.
 A recombinação homóloga
somente é usada durante e logo após a
replicação de DNA (fases S e G2),
quando as cromátides irmãs estão
disponíveis como moldes.
 incluindo o splicing do RNA, antes que se
permita sua saída do núcleo e sua
tradução em proteína.
 Para alguns genes, o RNA é o
produto final. Alguns se enovelam em
estruturas tridimensionais precisas que
desempenham funções estruturais e
catalíticas na célula.
 Os genes, no organismo, são
constituídos por uma longa sequência
de éxons curtos e íntrons longos que se
alternam.

 A progressão ordenada do ciclo

celular é suspensa se uma lesão no DNA
for detectada, e reinicia somente após
sua correção. Dessa forma, nas células
de mamíferos, a presença de DNA
danificado pode bloquear a progressão
da fase G1 para a fase S, retardar a fase
S, uma vez que já tenha sido iniciada, e
bloquear a transição da fase G2 para a
fase M. Esses atrasos auxiliam o reparo
do DNA, fornecendo o tempo necessário
para que a correção seja completada.  Como muitas cópias idênticas de
DO DNA AO RNA RNA podem ser produzidas a partir do
mesmo gene, e como cada molécula de
 O DNA genômica utiliza o RNA RNA pode promover a síntese de várias
como intermediário para a síntese de moléculas idênticas de proteína, as
proteínas. células podem, quando necessário,
 Quando a célula requer uma sintetizar uma grande quantidade de
proteína, a sequencia de nucleotídeos proteína a partir de um simples gene. No
da região apropriada de uma molécula entanto, genes podem ser transcritos e
de DNA extremamente longa em um traduzidos em taxas diferentes,
cromossomo é copiada sob a forma de permitindo que a célula sintetize
RNA (processo de transcrição) enormes quantidades de certas
 Transcritos de RNA em células proteínas e mínimas quantidades de
eucarióticas são submetidos a uma série outras.
de etapas de processamento no núcleo,
 RNA
 São fitas simples.
 Cópia de um segmento
específico da sequência de nucleotídeos
do DNA, sob a forma de uma sequência
de nucleotídeos de RNA.
 Processo denominado
transcrição.
 Os nucleotídeos de RNA são
ribonucleotídeos, contendo o açúcar
ribose
 Contém a base uracila em vez da
timina.
 O processo de transcrição do
DNA se inicia com a abertura e a
desespiralização de uma pequena
porção da dupla hélice de DNA, o que
expõe as bases em cada fita.
 A sequência de nucleotídeos de
cadeia de RNA é determinada pelo
pareamento de bases complementares
entre os nucleotídeos a serem
incorporados e o DNA molde.
RNA POLIMERASE E TIPOS DE RNA
 As enzimas que realizam a
transcrição são denominadas RNA
polimerase, elas catalisam a formação
de ligações fosfodiéster que conectam
os nucleotídeos entre si, formando uma
cadeia linear.
 A RNA-polimerase se desloca
passo a passo sobre o DNA,
desespiralizando a dupla-hélice à frente
do sítio ativo de polimerização e
expondo, dessa forma, uma nova região
da fita-molde para o pareamento de
bases complementares. Dessa maneira,
a cadeia de RNA em formação é
estendida, nucleotídeo a nucleotídeo,
na direção de 5’ para 3
 Asim como na replicação do
DNA, a hidrólise de ligações altamente
energéticas fornece a energia
necessária para promover a reação
 As moléculas de RNA que são
copiadas a partir de genes são
chamadas de RNA mensageiro, se
codificam proteínas, ou apenas RNAs, os
RNAs não codificadores de proteínas.
 Os RNAs nucleares promovem
splicing (excisão de introns) do pré-
mRNA para formar mRNA.
 RNA ribossômico formam a
porção central dos ribossomos e
catalisam a síntese proteica.
 RNA transportador formam os
adaptadores que selecionam
aminoácidos e os colocam no local
adequado nos ribossomos para serem
incorporados em proteínas.
 Cada segmento de DNA
transcrito é denominado unidade de
transcrição.
SPLICING DO RNA
 Tanto as sequências de íntrons
quanto as de éxons são transcritas em
RNA. As sequências dos íntrons são
removidas do RNA recentemente
sintetizado por meio de um processo
denominado splicing de RNA.
DO RNA A PROTEÍNA
 Os mRNA são utilizados como
intermediários na via de síntese de
proteínas.
 Uma sequência de mRNA é
decodificada em conjuntos de três
nucleotídeos.
 A conversão da informação de
RNA para proteína representa uma
tradução da informação para outra
linguagem que utiliza símbolos de terminação é encontrado, o
diferentes. ribossomo libera a proteína finalizada e
 A sequência de nucleotídeos de suas duas subunidades separam-se
um gene, por intermédio do mRNA, é novamente.
traduzida na sequência de aminoácidos
de uma proteína, aplicando-se as regras
conhecidas como código genético.
 Cada grupo de três nucleotídeos
consecutivos no RNA é denominado
códon, e cada códon especifica um
aminoácido ou determina a finalização
do processo de tradução.
tRNA

 As moléculas de RNAt
transportam aminoácidos para os
códons do mRNA.
 Anticódon: um conjunto de três
nucleotídeos consecutivos que pareiam
com o códon complementar em uma
molécula de mRNA.
 O tRNA possui um sítio onde o
aminoácido correspondente ao códon
liga-se.
 Vários códons determinam um
único aminoácido.
 A síntese proteica é realizada nos
ribossomos (proteínas e rRNA)
 Quando a síntese de proteínas
não está ativa, as duas subunidades do
ribossomo estão separadas. Elas se
associam a uma molécula de mRNA,
normalmente próximo à sua
extremidade 5’, para iniciar a síntese de
uma proteína. O mRNA é, então, puxado
através do ribossomo, três nucleotídeos
de cada vez. Conforme seus códons
penetram no ribossomo, a sequência de
nucleotídeos do mRNA é traduzida em
uma sequência de aminoácidos, usando
os tRNAs como adaptadores para
adicionar cada aminoácido na sequência
correta na extremidade crescente da
cadeia polipeptídica. Quando um códon