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JOEL NERES DE SOUZA – PSE/UFAM 2020
INTRODUÇÃO
A células deve manter um alto grau de organização em um
ambiente desfavorável A replicação do DNA deve ocorrer antes de a célula produzir duas células-filhas geneticamente iguais. A replicação ocorre na fase S do ciclo celular A manutenção da ordem também requer a vigilância contínua e o reparo dessa informação genética, devido a danos por compostos químicos e radiação oriundos do ambiente, por acidentes térmicos e por moléculas reativas. A primeira enzima que polimeriza nucleotídeos, a DNA- polimerase, foi descoberta em 1957. MANUTENÇÃO DAS SEQUÊNCIAS DE DNA O crescimento da fita nascente é no sentido 5’→ 3’
As taxas de mutação são extremamente baixas
Raramente os processos de manutenção do DNA celular falham, resultando em uma alteração permanente no DNA. Tal alteração é chamada de mutação A taxa de mutação, de aproximadamente 1 nucleotídeo alterado por 1010 nucleotídeos cada vez que o DNA é replicado O dano pode ser causado por clivagem espontânea das ligações químicas do DNA, por agentes ambientais como radiações A forquilha de replicação possui uma estrutura assimétrica “Y”. ultravioleta e ionizante, e pela reação com substâncias A fita-filha de DNA sintetizada continuamente é denominada fita- genotóxicas, que são subprodutos do metabolismo celular normal líder, ou fita contínua. ou que ocorrem no ambiente. A síntese de uma fita-filha, chamada de fita-líder, pode proceder As células de um animal ou planta com reprodução sexual são de continuamente a partir de um único iniciador de RNA dois tipos: células germinativas e células somáticas. Sua síntese precede levemente a síntese da fita-filha sintetizada As células germinativas transmitem a informação genética do de modo descontínuo, conhecida como fita retardada, ou fita progenitor aos seus descendentes; descontínua. As células somáticas formam o corpo do organismo Os fragmentos de Okazaki são polimerizados apenas na cadeia de direção 5’→3’ na fita descontinua e são unidos após sua síntese(DNA-ligase), formando longas cadeias de DNA.
Tendo as helicases separado o DNA parental em uma origem,
uma RNA- polimerase especializada chamada primase forma um pequeno iniciador complementar às fitas-molde separadas.
A sequência do genoma humano (aproximadamente 3,2 × 109
pares de nucleotídeos) permanece inalterada ou altera-se apenas por alguns poucos nucleotídeos a cada vez que uma célula humana típica se divide. A maioria dos seres humanos transmita instruções genéticas precisas de uma geração a outra e também evita que as alterações nas células somáticas originem um câncer.
TODA REPLICAÇÃO DE DNA OCORRE DE MODO
SEMICONSERVATIVO
Replicação semiconservativa, porque cada fita original de
nucleotídeos permanece intacta (conservada), apesar de não se combinar mais com a mesma molécula; a molécula original de DNA tem sua metade (semi) conservada durante a replicação. Impresso por Márcia Luana, E-mail marciaperfeito@hotmail.com para uso pessoal e privado. Este material pode ser protegido por direitos autorais e não pode ser reproduzido ou repassado para terceiros. 19/12/2023, 11:42:00
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A replicação do DNA necessita da cooperação de várias
proteínas A DNA-polimerase e a DNA-primase, que catalisam a polimerização dos nucleosídeos trifosfato; As DNA-helicases que auxiliam na abertura da dupla-hélice para permitir que as fitas sejam copiadas Proteínas ligadoras (SSB) auxiliam as helicases, estabilizando a conformação distorcida e de fita simples, e evitam a formação de pequenos grampos que formam-se rapidamente no DNA de fita simples A DNA-ligase é uma enzima que degrada os iniciadores de RNA, para ligar os fragmentos descontínuos de DNA formados na fita retardada, As DNA-topoisomerases, que aliviam a tensão causada pelo enrolamento helicoidal e os problemas de emaranhamento do DNA. Muitas dessas proteínas associam-se entre si na forquilha de replicação, formando uma “maquinaria de replicação” altamente eficiente, em que as atividades e os movimentos espaciais dos componentes individuais são coordenados.
INÍCIO DA REPLICAÇÃO DO DNA EM EUCARIOTOS
Em resumo, cada forquilha de replicação ativa requer cinco
componentes básicos:
A helicase para desenrolar o DNA.
As proteínas ligadoras de fita única para proteger as fitas de nucleotídios e evitar a formação de estruturas secundárias. A topoisomerase girase para remover a fita à frente da forquilha de replicação. A primase para sintetizar primers com um grupo 3′-OH no início de cada fragmento de DNA. A DNA polimerase para sintetizar a fita líder e fita tardia de nucleotídios.
INÍCIO E TÉRMINO DA REPLICAÇÃO DO DNA NOS
CROMOSSOMOS
A síntese de DNA inicia na origem de replicação
Esse mecanismo assegura que cada origem de replicação seja
ativada apenas uma vez por ciclo celular. A replicação de DNA é iniciado por proteínas iniciadoras Uma origem de replicação pode ser utilizada apenas se um especiais que se ligam à fita dupla de DNA e separam as duas complexo pré-replicativo for formado na fase G1. ligações, rompendo as ligações de hidrogênio entre as bases. No início da fase S, cinases especializadas fosforilam Mcm, Os segmentos de DNA ricos em pares de bases A-T são ativando-o, e ORC, inativando-o. relativamente mais fáceis de serem separados, e essas regiões Um novo complexo pré-replicativo não pode ser formado na de DNA ricas em pares A-T estão normalmente presentes nas origem, até a célula ter progredido à próxima fase G1, quando o origens de replicação. ORC ligado será defosforilado. Em cromossomos eucarióticos podem haver múltiplas origens de As helicases Mcm de eucariotos movem-se ao longo do molde da replicação fita-líder, Impresso por Márcia Luana, E-mail marciaperfeito@hotmail.com para uso pessoal e privado. Este material pode ser protegido por direitos autorais e não pode ser reproduzido ou repassado para terceiros. 19/12/2023, 11:42:00
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Enquanto a helicase bacteriana move-se ao longo do molde da REPARO DO DNA fita retardada À medida que as forquilhas iniciam seu movimento, o ORC é deslocado e novos ORCs são rapidamente ligados às origens recém-replicadas.
A TELOMERASE REPLICA AS EXTREMIDADES DOS
CROMOSSOMOS A telomerase faz a inserção de sequências nucleotídicas especiais nas extremidades dos cromossomos, incorporadas em estruturas denominadas telômeros Em humanos, a sequência da unidade de repetição é GGGTTA, sendo repetida aproximadamente mil vezes em cada telômeros A telomerase se assemelha às transcriptases reversas, proteínas que sintetizam DNA usando um molde de RNA
Dano ao DNA é inevitável e surge de várias formas.
O dano pode ser causado por clivagem espontânea das ligações químicas do DNA, por agentes ambientais como radiações ultravioleta e ionizante, e pela reação com substâncias genotóxicas, que são subprodutos do metabolismo celular normal ou que ocorrem no ambiente. Uma alteração na sequência normal do DNA, chamada de mutação. A primeira linha de defesa para a prevenção de mutações é a própria DNA-polimerase. Às vezes, quando as DNA-polimerases replicativas progridem ao longo do DNA-molde, um nucleotídeo errado é adicionado à extremidade 3' crescente da fita-filha.
A telomerase é um grande complexo proteína-RNA. A dupla-hélice de DNA é corrigida imediatamente
O RNA (em azul) contém a sequência-molde para a síntese das novas repetições de DNA telomérico. Depurinação e desaminação. Essas reações são duas das A reação de síntese é realizada pelo domínio da transcriptase reações químicas espontâneas mais frequentes que produzem reversa da proteína (em verde). sérias lesões no DNA da célula. Uma transcriptase reversa é uma forma especial de polimerase A depurinação pode remover a guanina e a adenina do DNA. que utiliza um molde de RNA para produzir uma fita de DNA; O principal tipo de reação de desaminação converte a citosina em Uma telomerase carrega seu próprio molde de RNA. uracila, mas a desaminação também pode ocorrer em outras A telomerase também possui vários outros domínios proteicos bases. necessários à ligação da enzima às extremidades dos Essas reações ocorrem na dupla-hélice de DNA cromossomos.
Tipo mais comum de dímero de timina. Esse tipo de lesão
ocorre no DNA de células expostas à radiação ultravioleta (como a luz do sol). Um dímero semelhante também pode ser formado entre duas bases pirimídicas quaisquer (C ou T) presentes no DNA. Uma nuclease especializada remove a extremidade 5’ de um telômero formando uma saliência na extremidade de fita simples. Essa extremidade – associada às repetições GGGTTA nos telômeros – atrai um grupo de proteínas que formam um tipo de “tampa” cromossômica protetora conhecida como shelterina. A shelterina “esconde” os telômeros dos detectores de lesões celulares que monitoram o DNA continuamente. Impresso por Márcia Luana, E-mail marciaperfeito@hotmail.com para uso pessoal e privado. Este material pode ser protegido por direitos autorais e não pode ser reproduzido ou repassado para terceiros. 19/12/2023, 11:42:00
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VIAS DE REPARO DE LESÃO NO DNA RECOMBINAÇÃO HOMÓLOGA As duas vias diferem na maneira pela qual a lesão é removida do Um dos mecanismos de reparo de DNA, consiste em um grupo DNA. diverso de reações conhecidas como recombinação homóloga A primeira via → reparo por excisão de bases, envolve uma Função → troca de fitas do DNA entre um par de sequências de bateria de enzimas denominadas DNA-glicosilases, cada uma DNA de duplex homólogos, isto é, segmentos de dupla-hélice capaz de reconhecer um tipo específico de base alterada no DNA com sequências nucleotídicas semelhantes ou idênticas. e de catalisar sua remoção hidrolítica. Esse tipo de recombinação possui características comum entres as células É dirigida pelas interações de pareamento de bases do DNA O pareamento não precisa ser perfeito, mas deve ser muito próximo para que ocorra a recombinação homóloga
A RECOMBINAÇÃO HOMÓLOGA É DIRIGIDA PELAS
INTERAÇÕES DE PAREAMENTO DE BASES DO DNA O princípio da recombinação homóloga é que ela ocorre apenas entre dois duplex de DNA com extensas regiões de sequências similares (homologia). A recombinação homóloga pode reparar corretamente as quebras na fita dupla de DNA
A segunda principal via → reparo por excisão de nucleotídeos.
Esse mecanismo pode corrigir uma lesão causada por praticamente qualquer alteração volumosa na estrutura da dupla- hélice de DNA.
O duplex de DNA quebrado e o duplex-molde realizam uma
“dança das fitas”, de modo que uma das fitas danificadas utiliza uma fita complementar do duplex intacto para o reparo. Primeiro, as extremidades do DNA danificado são removidas, ou “recortadas” por nucleases produzindo uma extremidade de fita simples 3’. A próxima etapa é a troca de fitas (também chamada de invasão de fitas), em que uma das extremidades 3’ da molécula de DNA quebrada abre caminho até o duplex-molde e busca a sequência homóloga pelo pareamento de bases. Uma vez estabelecido o pareamento entre as bases, uma DNA- polimerase com alta precisão alonga a fita invasora usando a informação fornecida pela molécula-molde não danificada, corrigindo o DNA danificado. As últimas etapas – deslocamento da fita, síntese adicional do reparo e ligação – regeneram as duas hélices duplas de DNA originais e completam o processo de reparo.
A TROCA DE FITAS É REALIZADA PELA PROTEÍNA RECA/RAD51
RecA em Procariotos (E. coli) e Rad51 em praticamente todos os
eucariotos. A recombinação homóloga é essencial para a meiose Impresso por Márcia Luana, E-mail marciaperfeito@hotmail.com para uso pessoal e privado. Este material pode ser protegido por direitos autorais e não pode ser reproduzido ou repassado para terceiros. 19/12/2023, 11:42:00
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Recombinação homóloga durante a meiose produz o Junções de Holliday são formadas durante a meiose entrecruzamento e a conversão gênica, resultando em cromossomos híbridos contendo informação dos dois homólogos, As junções podem adotar múltiplas conformações, e um conjunto materno e paterno de proteínas de recombinação especiais liga-se a ela, estabilizando o isômero simétrico aberto. As proteínas especializadas que se ligam às junções de Holliday catalisam uma reação chamada migração da ramificação
A RECOMBINAÇÃO HOMÓLOGA NORMALMENTE
RESULTA EM CONVERSÃO GÊNICA Em organismos de reprodução sexuada, uma lei fundamental da A RECOMBINAÇÃO MEIÓTICA INICIA COM UMA genética é – exceto pelo DNA mitocondrial, que é herdado QUEBRA PROGRAMADA DE FITA DUPLA apenas por herança materna – cada genitor dá uma contribuição genética igual para sua progênie.
A proteína Spo11, específica de meiose, e o complexo Mre11
quebram o duplex de DNA e processam as extremidades, a recombinação homóloga pode ocorrer por duas vias alternativas. Uma (lado direito da figura) assemelha-se muito à reação de reparo de quebras de fita dupla e resulta em cromossomos que foram “corrigidos”, mas nas quais não ocorreu o entrecruzamento. A outra (lado esquerdo, com as quebras das fitas indicadas por setas em azul) segue pela junção de Holliday dupla e produz dois cromossomos entrecruzados. Durante a meiose, a recombinação homóloga ocorre entre os cromossomos materno e paterno homólogos, quando estão unidos firmemente