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Tutorial ImageJ PDF
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Tutorial: Abrindo Vídeos e Medindo Comprimentos no ImageJ
1. Introdução
O ImageJ é um software livre (freeware)
que pode ser obtido gratuitamente no site
http://rsb.info.nih.gov/ij/. Esse software é
usado para análise de imagens, tanto de
fotos quanto de vídeos. Possui várias
ferramentas que podem ter utilidade em
diversas áreas de conhecimento.
O programa apresenta duas janelas de
trabalho mostradas na figura 1 a seguir: a
barra de ferramentas e o painel de
imagens. Na primeira, apresenta as
ferramentas disponibilizadas pelo
programa e informações sobre a imagem
analisada. Na segunda, é exibida a
imagem a ser analisada. Essa segunda Figura 1- Interface em duas janelas: a barra de ferramentas (superior)
janela só aparece quando um arquivo está e a janela de imagens.
aberto.
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A seqüência File>Open abre apenas fotos. Caso tente abrir um vídeo, apenas o primeiro frame do vídeo será aberto.
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3. Obtendo informações sobre as Imagens
No ImageJ, a imagem aberta na janela de imagens é
analisada como se estivesse sobre um plano cartesiano
formado, obviamente, por um eixo horizontal e outro
vertical (respectivamente, chamados de eixos X e Y). A
origem desse sistema de coordenadas está no canto
superior esquerdo da janela de imagens. As
coordenadas de um ponto específico da imagem podem
ser obtidas levando o cursor do mouse até esse ponto.
Essas coordenadas apareceram na parte inferior da
barra de ferramentas (veja figura 4).
No caso de um vídeo, surge também, na parte inferior da
barra de ferramentas, uma coordenada denominada Z.
Ela identifica, indiretamente, o quadro ou frame do vídeo
que corresponde a imagem exposta na janela de
imagem. A identificação direta desse frame é facilmente
obtida mediante a consulta ano primeiro número exibido Figura 3- Lista de formatos de arquivos que podem ser
na parte superior da janela de imagem (veja, novamente, importados e analisados pelo software ImageJ.
a figura 4). Assim, no exemplo apresentado na figura 4,
o número 13/127 indica que a janela de imagens exibe o
frame de número 13 de um vídeo composto por 127
frames.
5. Configurando a escala de
medidas de comprimento
O programa ImageJ permite a medida de
comprimentos, áreas, intensidade de
cores e uma série de outras informações
que podem estar disponíveis na imagem.
Para realizar medidas de comprimento,
precisamos fornecer ao programa uma
distância real que faz parte da imagem a
ser trabalhada.
O exemplo de imagem apresentada na
figura 5 traz uma régua vermelha situada
sobre a mesa de madeira que aparece na
Figura 5- Resultado da ampliação da janela de imagem
parte inferior da imagem. Essa régua
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vermelha, capaz de medir até 50,00 cm, possui um comprimento total de 50,50 cm. Para calibrar a
ferramenta de medida do ImageJ a partir da informação acerca do comprimento total da régua que aparece
na imagem a ser analisada, é necessário selecionar a função Straight Line Selection (seleção de linha reta,
em inglês), mediante um clique sobre o quinto botão retangular, contado da esquerda para a direita, que
compõe a barra de ferramentas (veja a figura 6).
Após acionar essa função, você irá usar o mouse para estender uma linha amarela sobre o objeto que
aparece na imagem cujo comprimento é conhecido. No caso do exemplo que estamos a desenvolver, esse
objeto é a régua vermelha. Para criar essa linha amarela sobre a imagem da régua você deve: (i) clicar com
o botão esquerdo do mouse em cima de uma das extremidades da imagem da régua; (ii) arrastar o cursor
do mouse sobre a imagem da régua, mantendo o botão esquerdo pressionado; (iii) soltar o botão do mouse
assim que o cursor atingir a outra extremidade e observar o surgimento da linha amarela (veja figura 7).
Se a linha ficar mais comprida ou mais curta do que deveria, basta posicionar o cursos do mouse sobre uma
de suas extremidades. Nessas circunstâncias, o cursor se transformará no ícone de uma mão com o dedo
indicador estendido. Clique no botão esquerdo do mouse e arraste a extremidade da linha amarela até ela
atingir a posição adequada.
Figura 7- Linha amarela criada pela função Straight Line Selection sobre a imagem da régua vermelha.
Figura 13- Janela de resultados aberta com 7 resultados apresentados. Se você achar necessário excluir algum dado da
tabela, selecione-o, clique com o botão direito do mouse e escolha Clear (Limpar, em inglês).
A análise da figura 13 mostra que a janela de Resultados exibe apenas 3 colunas. Isso se deve à
configuração que fizemos no item 8 deste tutorial. A coluna File da tabela de resultados apresenta o número
da medida na ordem em que ela foi feita. Assim, a tabela da figura 13 apresenta 7 medidas. A coluna Angle
(Ângulo, em inglês) da tabela de resultados mostra o ângulo da linha amarela usada na medida de
comprimentos, em relação à direção horizontal. Para realizar boas medidas, é importante que o valor do
ângulo mostrado na segunda coluna seja pequeno ou, de preferência, igual a zero. Isso indica que a linha
amarela foi posicionada exatamente sobre a direção horizontal. Por fim, a coluna Length (Comprimento, em
inglês), que aparece na tabela de resultados, apresenta os valores da distância percorrida pelo objeto.
Esses valores são dados em centímetros como decorrência da configuração que fizemos no item 5 deste
tutorial.