CEN5789 – Genômica e Bioinformática

CRONOGRAMA
Semana Teoria Prática
Introdução a disciplina e Bancos de
1 dados biológicos e Ferramentas básicas
de bioinformática
Introdução no sistema operacional
Genômica: fluxo de informação na
LINUX, programação em shell
2 célula, estrutura de genomas, estratégias
(bash), alinhamento pareado de
de sequenciamento de genomas
sequências, BLAST
Alinhamento de sequências (pareado e
3 múltiplo): algoritmos exatos e
heurísticos
Estratégias para a montagem de
genomas de novo e guiado por
4
referencia, diferencias, vantagens, tipos Montagem de genomas. Avaliação de
de dados. Avaliação de montagens. montagens, Anotação de genomas
Anotação estrutural e funcional de
5
genomas
Bancos de dados de genes ortólogos,
6 Pangenoma e Genômica comparativa identificação de genes ortólogos e
parálogos.
Transcriptômica: anotação genomas,
7 análise de expressão diferencial de
genes, redes de co-expressão Análise de dados de transcriptómica e
Composição de microbiomas: analise introdução a linguagem R
8
taxonômico
9 Metagenômica
10 Apresentação de projeto semestral