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DIFERENÇA ENTRE

GENÔMICA,
TRANSCRIPTÔMICA,
PROTEÔMICA E
EPIGENÉTICA E
DIFERENTES APLICAÇÕES

Discentes: Aline de Carvalho, Heloíza Borges, Radarani Cano


Disciplina: Biologia Molecular
Genômica, Transcriptômica e Proteômica = Ciências
Ômicas

Ômica/Ômics: neologismo da língua inglesa, refere-se ao estudo da


biologia que termina em omica, genômica, transcriptômica, proteômica e
metabolômica;
Representa o total de RNAs transcritos, de proteínas, metabólitos e lipídeos
de um organismo;
Objetiva caracterizar moléculas que traduzem em estrutura e dinâmica no
organismo. É uma ferramenta poderosa no entendimento do organismo de
forma ampla.

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Genômica, Transcriptômica e Proteômica = Ciências
Ômicas

A genômica, ciência que estuda o genoma de uma espécie a partir da obtenção da


sua sequência, com o objetivo de entender a sua estrutura, organização e função.

A transcriptômica, que analisa as moléculas de RNA; refere-se ao conjunto completo


de transcritos (RNAs mensageiros, RNAs ribossômicos, RNAs transportadores e os
microRNAs) de um dado organismo, órgão, tecido ou linhagem celular.

A proteômica que estuda as proteínas formadas pela expressão gênica; estuda a


distribuição, a abundância, as modificações, as interações e as funções de uma ou de
um grupo de proteínas, ou do conjunto de proteínas em uma célula ou organismo.

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Histórico das Ciências Ômicas

Hans Winkler (Botânico alemão, 1920) cunhou o termo "Genoma“. Juntou palavras,
gene e cromossoma = genoma. Porém a palavra “genômica” apareceu nos anos
80, amplamente usada nos anos 90;
Watson e Crick, Franklin (Biólogos EUA/UK, 1953) – estrutura do DNA dupla hélice;
Frederick Sanger (Bioquímico EUA, 1975) - primeiro sequenciamento genômico. O
genoma é a parte fundamental de muitas ômicas;
Kary Mullis (Bioquímico EUA, 1983) – Desenvolvimento PCR
Mark Shena (Bioquímico EUA, 1985) – Desenvolvimento Microarray

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Histórico das Ciências Ômicas Frederick Sanger (Bioquímico EUA, 1975)

Desenvolveu um método para o


sequenciamento genômico. O genoma é a
parte fundamental de muitas ômicas;
Sequenciamento de Sanger é capaz de
sequenciar somente um DNA molde por vez,
Processo feito manualmente demorou 4
Através desse sequenciamento se obteve anos para o sequenciamentode um virus

avanços tecnológicos capazes de fazer


sequenciamento em grande escala e o
garantiu um prêmio Nobel
Projeto genoma humano (2003)
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Projeto Genoma humano 1990-2003

John Craig Venter bioquímico que


liderou uma empresa privada
Esteve como linha de frente na pesquisa do Celera Genomics Corporation

sequenciamento do genoma
O Projeto Genoma Humano só terminou oficialmente
em abril de 2003, 50 anos após a descoberta seminal
da estrutura molecular do DNA
Foi descoberto que o genoma humano possui 3,2
bilhões de nucleotídeos e que a sequência deles é
99,9% igual entre todas as pessoas.

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O código genético, interpretado
Projeto Genoma humano 1990-2003
adequadamente por vários softwares,
oferece informações valiosas sobre a
Possibilidade de descobrir doenças genéticas atravez de estrutura do organismo.

diagnósticos ao verificar alguma alteração. Ex: é possível


detectar alterações genômicas no próprio tumor, a fim de
definir o tratamento a partir disso.
A criação de medicamentos e vacinas. Os cientistas
conseguem mapear o genoma de um vírus.
forneceu informações da estrutura genômica e contribuiu
com a evolução humana. Essas descobertas são
fundamentais para a medicina personalizada e
impactaram a biologia, medicina e pesquisa genética.
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Disponível online, qualquer um
pode ter acesso. E até agora foi
descoberto que cerca de 99.8-
99.9 do genoma de todos os
seres humanos é idêntico.

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O genoma humano foi catalogado
em páginas físicas, cada livro
representando um cromossomo,
localizado no museu de Ciências
da Inglaterra.
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DNA e RNA

São ácidos nucléicos, encontrados em


todas as células.
Esses estão envolvidos na transmissão de
caracteres hereditários e na produção de
proteínas.

https://www.sobiologia.com.br/conteudos/quimica_vida/quimica15.php
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Proteínas

São moléculas orgânicas de estrutura


complexa e Massa Molecular elevada. São
sintetizadas pelos organismos vivos
através de ligações peptídicas covalentes
entre aminoácidos.
Funções: Enzimas, anticorpos, componentes
estruturais.

https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php

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Genômica – Histórico

1977 – Técnica de sequenciamento de DNA – Método de Sanger;


1991 – Projeto Genoma Humano;
1995 – Primeiro genoma sequenciado (Haemophylus influenzae);
2001 – Primeiro rascunho do Genoma Humano;
2003 – Conclusão do sequenciamento do Genoma Humano;
2009 – Mais de 1000 genomas bacterianos sequenciados.

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Genômica

Ciência que estuda o genoma, conjunto de genes de um organismo de diferentes


espécies a partir do seu sequenciamento completo, com objetivo de entender a
sua estrutura, organização e função.

Genômica estrutural Genômica funcional

Determina a sequência de
nucleotídeos de um genoma. estuda Analisa a relação e interação dos
a organização e estrutura dos genes, genes, proteínas e certas
refere-se aos dados do características fenotípicas e
sequenciamento do DNA;
efeitos biológicos, utilizando o
método transcriptoma.

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Transcriptômica

Transcriptôma refere-se ao conjunto completo de transcritos (RNAs mensageiros, RNAs


ribossômicos, RNAs transportadores e os microRNAs) de um dado organismo, órgão,
tecido ou linhagem celular.

Para estudar o transcriptôma os pesquisadores


utilizam métodos de análise em grande escala
como:
SAGE (análise serial da expressão gênica);
Microarrays (microarranjos de cDNA);
RNA-seq

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https://www.todamateria.com.br/sintese-proteica/
SAGE (análise serial da expressão gênica)

SAGE (analise serial da expressão genica)


baseia-se no isolamento de segmentos de
sequencias únicas de cada transcrito, isto
é, sequenciamento de pequenas
sequencias identificadoras.
Esta técnica gera etiquetas (tags) de
cDNA que são ligadas e sequenciadas
para, em seguida, serem analisadas e
anotadas.

Fluxo das atividades experimental em SAGE


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Microarray

Esta técnica utiliza os princípios de


hibridação que permite a detecção de
sequências específicas de RNA, em
uma determinada célula ou tecido,
utilizando sequências complementares
as de interesse.

https://genomika.einstein.br/microarray/
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RNA-seq

RNA-Seq envolve sequenciamento de cDNA


(DNA complementar), obtidos a partir da
ação da enzima transcriptase reversa sobre
RNAs mensageiros, utilizando tecnologias de
sequenciamento com alto rendimento;
Permite medição dos níveis de transcritos e
determinar a estrutura funcional dos genes;
Útil para descobrir novas transcrições,
https://microbenotes.com/rna-sequencing-principle-steps-types-uses/
identificação de mutação.

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Aplicações

Bactéria Xanthomonasa xonopodi spv. citri: identificaram expressão diferencial

envolvidos em virulência e patogenicidade;

Microalga Dunaliella tertiolecta: identificaram enzimas-chaves e vias metabólicas

visando obtenção de biocombustíveis.

Fungos entomopatogênicos Metarhizium anisopliae e Metarhizium acridium:

identificaram genes envolvidos no reconhecimento de vias metabólicas do

hospedeiro e diferenciação do patógeno

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Proteômica

Mesófilo celulósico Clostridium phytofermentans: identificaram 2567 proteínas (65% do

proteoma) e um modelo de fermentação de celulose;

Bactéria Streptomyces: identificaram componentes e dinâmicas descaracterizadas

anteriormente nas redes celulares;

Penicillium chrysogenum: produção de penicilina nos Microcorpos ;

Chlamydomonas reinhardtii: identificaram 996 proteínas como plataforma de proteínas

Recombinantes .

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Transcriptôma: Sinais hormonais, estresse
ambiental, agentes patogênicos ou
mudanças nutricionais.
As mudanças no transcriptôma têm
impacto direto no proteoma, uma vez que os
mRNAs são traduzidos em proteínas.
Metaboloma: Quando há mudanças nas
condições de nutrientes, os processos
metabólicos são ajustados.

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EPIGENÉTICA

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O que é epigenética?

É o estudo das alterações na expressão do gene que podem ser


herdadas por mitose ou meiose e que não envolvem mudança na
sequência de nucleotídeos do DNA, sendo potencialmente
reversíveis.

Alteração na EXPRESSÃO dos genes e não na SEQUÊNCIA de DNA

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Mecanismos Epigenéticos

Marcam sequências específicas do DNA que devem


ser transcritos pela maquinaria de uma
determinada célula, marcas essas que são
diferentes para cada momento e ambiente
específico.

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Mecanismos epigenéticos

1. Metilação do DNA; 2. RNAs não codificantes; 3. Modificações de histonas

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Metilção do DNA

Adição de agrupamento metila na posição 5 da


citosina
Regula o silenciamento gênico, impressão de genes,
o desenvolvimento embrionário e a estabilidade
cromossômica
Ação bloqueadora da transcrição

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Modificação de histonas

As histonas são responsáveis pela


compactação da fita de DNA, e suas
modificações podem alterar a forma como
ocorre essa condensação, permitindo que os
genes daquela região sejam transcritos ou não.

ACETILAÇÃO DAS HISTONAS: descompactação


da cromatina, permitindo a expressão do gene
naquela região.

METILAÇÃO DAS HISTONAS: cromatina


compactada. Impede a transcrição.
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RNA não codificante
Epigenética: Aplicações

Biomarcadores moleculares: Algumas alterações


epigenéticas, como a metilação de DNA, podem ser
utilizadas como biomarcadores moleculares de
doenças. Exemplo: Câncer - a hipometilação (pouca
metilação) do DNA e algumas metilações pontuais
são associadas a maior expressão de oncogenes e
incidência de câncer de próstata, respectivamente.

Agricultura: As modificações epigenéticas também


podem ser usadas para melhorar a resistência de
uma planta a pragas ou estresse, ampliar sua
adaptação a condições adversas,como calor e
seca, e aumentar o teor de nutrientes.

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Fatores ambientais nos padrões epigenéticos

Poluição, radiação, alimentação, fumo, alterações hormonais, diversas doenças,


traumas , etc.

As marcas epigenéticas
não são fixas e podem
ser modificadas.

Podemos evitar: fazendo


exercíco físico, boa
alimentação, escolha de
vida mais saudáveis. Imagem: http://sitn.hms.harvard.edu

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Conclusões

As ciências ômicas referem-se a diferentes


01 abordagens de estudo de moléculas biológicas em
grande escala

As principais ciências "ômicas" incluem a genômica, a


02 transcriptômica, a proteômica e a metabolômica.

O avanço tecnológico favoreceu para análises mais


03 precisas e rápidas, impulsionando descobertas
significativas, contribuindo para o avanços em diversas
áreas como medicina, biotecnologia e meio ambiente. 30
Conclusões

A principal diferença entre as ciências ômicas, como genômica, transcriptômica,


04 proteômica reside no foco específico das moléculas biológicas que cada uma
estuda. Cada abordagem oferece uma perspectiva única para entender os
diferentes aspectos dos sistemas biológicos em larga escala.

A epigenética regula a expressão gênica do DNA e histonas com marcas


05 químicas.

Os mecanismos epigenéticos permitem que os genes sejam ligados ou desligados


06 em resposta a fatores ambientais como a dieta, o stress ou a poluição do ar, por
exemplo.

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Conclusões

Modificações epigenéticas são potencialmente reversíveis, uma vez que não há


07 mudança na sequência dos nucleotídeos do DNA. Portanto, as marcas
epigenéticas não são fixas e podem ser modificadas

A compreensão das alterações epigenéticas pode ser útil para diferentes setores:
08 saúde humana e animal (prevenção, diagnóstico, prognóstico e tratamento de
doenças), agricultura, genética, entre outros

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Referências

GELELETE, B Thainá. APLICAÇÃO DAS CIÊNCIAS ÔMICAS. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE BRASÍLIA, .


Disponível em: https://repositorio.uniceub.br/jspui/bitstream/prefix/15058/1/Trabalho

GOLDBERG, Aaron D.; ALLIS, C. David; BERNSTEIN, Emily. Epigenetics: A Landscape Takes Shape. Cell,
New York, v. 128, n. 4, p. 635-638, fev. 2007. Disponível em:
(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867407001869). Acesso em: 27 jan. 2024.

LEITE, Michel Lopes; COSTA, Fabricio F.. Epigenômica, epigenética e câncer. Rev Pan-Amaz Saude,
Ananindeua , v. 8, n. 4, p. 23-25, dez. 2017 . Disponível em <http://scielo.iec.gov.br/scielo.php?
script=sci_arttext&pid=S2176-62232017000400006&lng=pt&nrm=iso>. acessos em 29 jan. 2024.
http://dx.doi.org/10.5123/s2176-62232017000400006.

RIVAS, Maria Prates; TEIXEIRA, Anne Caroline Barbosa; KREPISCHI, Ana Cristina Victorino1. Epigenética:
conceito, mecanismos e impacto em doenças humanas. Genética na Escola, v. 14, n. 1, p. 14-23, 201923.
Disponível em: (https://www.geneticanaescola.com.br/revista/index.php/revista/article/view/100). Acesso
em: 27 jan. 2024.
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"Em algum lugar, alguma coisa incrível está

esperando para ser descoberta.”

-Carl Sagan

Obrigada!

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