GENÔMICA,
organismo que está codificada em seu DNA
TRANSCRIPTÔMICA E
METABOLÔMICA
PROJETO GENOMA HUMANO
Iniciou em 1990
2000
 Genoma da bactéria Xylella
fastidiosa é sequenciada por
pesquisadores paulistas
Metabólitos → Metabolômica
Fenótipo:
 Conjunto de todas as
características observáveis
 São influenciadas tanto por seu
genótipo quanto pelo ambiente
Diferentes estímulos podem afetar
diretamente o transcriptoma (RNA), o
proteoma (proteínas) e o metaboloma
(metabólitos)
Genoma:
Toda informação hereditária de um
(ou em alguns vírus no RNA)
Inclui tanto os genes como as sequências
não codificadoras
Transcriptoma:
Conjunto completo de transcritos (RNAs
mensageiros, RNAs ribossômicos, RNAs
transportadores e os microRNAs) de um
dado organismo, órgão, tecido ou linhagem
celular
É o reflexo direto da expressão dos genes
Proteoma:
Conjunto de todas as proteínas em uma
célula, organela, fluído biológico, tecido ou
organismo em um dado momento
Metaboloma:
Conjunto de todos os metabólitos em uma
célula, fluído biológico, tecido ou
organismo
GENÔMICA
Estudo dos genes de um organismo bem
como das suas funções e interações
 Interação entre locus e alelos dos
genomas
 Ex: teste de paternidade,
identificação de doenças e
características produtivas
Estuda efeitos como heterose, pleiotropia e
epistasia
*Heterose = filhos provenientes de cruzamento  Enzimas
de raças diferentes apresentam melhores  Anticorpos
desempenhos  Componentes estruturais
*Pleiotropia = conjunto de múltiplos efeitos de
um gene. Acontece quando um único gene
controla diversas características do fenótipo METABÓLITOS
*Epistasia = é um tipo de interação gênica em
Intermediários (substratos e cofatores) e
que os alelos de um gene inibem a
produtos do metabolismo
manifestação dos alelos de outro gene
Exemplo: carboidratos, alcoois,
aminoácidos, ácidos orgânicos e lipídios
TRANSCRIPTÔMICA
É o total de transcrições realizadas em um
órgão ou em uma célula em particular

Muita variação

 Estado fisiológico, estímulos físicos,

químicos, biológicos ou doenças

Expressão gênica comparativa (diferencial)

Interesse especial em doenças como câncer

MÉTODO CLÁSSICO de estudar Genoma
Ferramenta para fertilização in vitro, e Transcriptôma
clonagem etc

Preparo de biblioteca genômica

DNA e RNA
 Coleção de clones de DNA
Ácidos nucleicos representando o genoma de um
organismo
Transmite caracteres hereditários

Produção de proteínas
Preparo de biblioteca de cDNA

 Coleção de clones com insertos de

PROTEÍNAS DNA complementar (cDNA),
Moléculas orgânicas de estrutura complexa sintetizados a partir de moléculas
e massa molecular elevada de mRNA de uma célula

Sintetizados pelos organismos vivos através

de ligações peptídicas covalentes entre MÉTODO MAIS ATUAL
aminoácidos

Sequenciamento do Genoma Completo

 Funções:
  DNA total do organismo 1) Extração de mRNA

2) Síntese de cDNA

Sequenciamento de cDNA 3) Ligação em vetores

 Segmentos de DNA complementar 4) Inserção em bactérias

sintetizados a partir de molécula de
5) Multiplicação (clones)
mRNA de uma célula

CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECAS
GENÔMICAS
Etapas:

1) Extração de DNA

2) Fragmentação do DNA

3) Ligação em vetores

4) Inserção em bactérias

5) Multiplicação (clones)

cDNA
SEQUENCIAMENTO DO GENOMA
 DNA sintetizado a partir do mRNA COMPLETO
usando a enzima transcriptase
reversa
 DNA complementar ao mRNA Etapas:

1) Extração de DNA

2) Fragmentação do DNA

3) Preparação da biblioteca

4) Sequenciamento

CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECAS DE
cDNA
Etapas:
 TECNOLOGIAS PARA O
SEQUENCIAMENTO DE DNA
Tecnologias de primeira geração:

Método Maxam & Gilbert

 1977
 Método de degradação química

Método Sanger

 1977
 Método enzimático, dideoxi ou de
SEQUENCIAMENTO DE cDNA
término da cadeia
 Síntese enzimática de uma fita
complementar de DNA, cujo
1) Extração de mRNA
crescimento é interrompido pela
2) Síntese de cDNA adição de um dideoxinucleotídeo
(ddNTP)
3) Preparação da biblioteca

4) Sequenciamento
ETAPAS DO SEQUENCIAMENTO DE DNA
Primeira Geração

Preparo do DNA → Reação de

sequenciamento → Eletroforese capilar →
Análise computacional

GENÔMICA NUTRICIONAL

NUTRIGENÔMICA

 Estuda a influência dos nutrientes

sobre a estrutura e a expressão do
genoma
METAGENÔMICA
 Como a nutrição pode influenciar
Metagenoma as vias metabólicas e o controle
homeostático
Genoma coletivo da microbiota total
encontrada em um determinado habitat
Aumento da razão lisina: calorias, L-
carnitina e fibras
EPIGENÔMICA Trata da influência da variação genética na
resposta de fármacos em pacientes

Correlaciona a expressão do gene ou

Epigenética
 Expressão de microRNAs
 Modificação de histonas
 Metilação de ilhas CpG
polimorfismos de nucleotídeo único com a
eficácia e/ou toxicidade de uma substância
Tratamento individualizado

 Seleção de drogas terapêuticas

Conceito dos quatro "Rs" substituída por seleção de
 Recebidos (received): nutrição e pacientes nos quais uma
outros fatores ambientais determinada droga seria eficaz
 Gravados (recorded): no
"epigenoma"
 Lembrados (remembered): por
várias gerações de células
 Revelados (revealed): através de
alterações na expressão gênica,
função celular e até mesmo na
saúde

NUTRIGENÉTICA
Estuda os efeitos da variabilidade genética
sobre a interação entre dieta e fenótipo

O que gera variabilidade genética?

 Indels (inserções/deleções)
 Inversões
 Translocações
 Variação no número de cópias
(CNVs)
 Regiões repetitivas em tandem
(mini/microssatélites)
 Mutações
 Polimorfismos de nucleotídeo
único (SNP)

FARMACOGENÔMICA
Pesquisas e testes clínicos de drogas