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CENTRO UNIVERSITARIO JORGE AMADO

CURSO DE GRADUAÇÃO BIOMEDICINA

ILSI DE OLIVEIRA BRITO MOURA


SABRINA MENEZES DIAS

Produto desenvolvido na disciplina de


Biologia Molecular.

Relatório de aula prática, como requisito


parcial para obtenção da aprovação na
disciplina no Curso de Biomedicina do
Centro Universitário Jorge Amado –
UNIJORGE.

Professor Orientador (a): Marcos Leal.

CAMAÇARI – BA

2024
AULA 03

Tema: Análise Computacional.

A análise computacional na biomedicina interpreta dados genômicos, proteômicos e


clínicos, identificando padrões associados a condições médicas. Isso inclui a busca por
marcadores genéticos, análise de expressão gênica, identificação de vias metabólicas e previsão
de resposta a tratamentos. Além disso, processa grandes conjuntos de dados clínicos para
extrair informações relevantes para diagnóstico, prognóstico e terapias personalizadas. Essa
abordagem é essencial para avançar na compreensão das doenças e no desenvolvimento de
novas estratégias terapêuticas na biomedicina.

INTRODUÇÃO AO GENOMA

O sequenciamento de um gene envolve a determinação da ordem exata das bases


nitrogenadas que compõem o DNA desse gene. Esse processo é essencial para compreender a
estrutura genética, identificar mutações, estudar variações genéticas e entender as bases
moleculares de doenças genéticas.

Ele é necessário para compreender as bases genéticas de doenças, identificar mutações


relevantes para diagnóstico e tratamento, estudar variações genéticas em populações e
contribuir para o avanço da medicina personalizada. Essa técnica é fundamental para a pesquisa
biomédica e para a prática clínica, fornecendo informações valiosas sobre a saúde e as
condições médicas dos pacientes.
O significado clínico do sequenciamento de um gene está na capacidade de identificar
mutações ou variantes genéticas associadas a doenças hereditárias, câncer e outras condições
médicas. Isso permite diagnósticos mais precisos, prognósticos mais informados e o
desenvolvimento de terapias personalizadas com base no perfil genético do indivíduo.

PRIMER
Um primer é um pequeno fragmento de DNA ou RNA que serve como ponto de partida
para a síntese de novas cadeias complementares durante a reação em cadeia da polimerase
(PCR) ou outras técnicas de amplificação de DNA. Os primers são projetados para se ligarem
especificamente à região alvo do gene que se deseja amplificar ou sequenciar.
Os primers desempenham um papel fundamental na amplificação e sequenciamento de
genes. Eles são projetados para serem complementares a sequências específicas de DNA que
flanqueiam a região alvo do gene. Durante a reação em cadeia da polimerase (PCR), os primers
se ligam à região alvo e fornecem um ponto de partida para a replicação do DNA, resultando
na amplificação da sequência desejada. A especificidade dos primers é crucial, pois determina
qual região do DNA será amplificada, garantindo que apenas o gene de interesse seja replicado.
Essa capacidade de direcionar a amplificação para regiões específicas do genoma é
fundamental para a análise precisa de genes e suas variantes, contribuindo significativamente
para a compreensão das bases genéticas de doenças e condições médicas.

CRITÉRIOS MINIMOS PARA O DESENHO DE PRIMERS INCLUEM

1. Tamanho: Geralmente, os primers têm entre 18 e 22 pares de bases. Tamanhos


menores podem comprometer a especificidade, enquanto tamanhos maiores podem dificultar a
ligação aos locais-alvo.

2. Conteúdo de GC: A porcentagem de pares de bases guanina-citosina (GC) nos


primers é importante, pois afeta a estabilidade e especificidade da ligação. Geralmente, uma
porcentagem de GC entre 40% e 60% é considerada ideal.

3. Especificidade: Os primers devem ser projetados para se ligarem especificamente à


região alvo do gene, evitando regiões repetitivas ou homólogas em outros locais do genoma.

O tamanho dos primers pode afetar o resultado da amplificação e sequenciamento.


Primer muito grandes podem ter dificuldade em se ligar especificamente à região alvo,
enquanto primer muito pequenos podem apresentar menor estabilidade e especificidade.
RAZÃO ENTRE G-C

A razão entre G-C nos primers influencia diretamente a temperatura de fusão (Tm) do primer,
que é a temperatura na qual metade das cópias do primer está hibridizada ao DNA alvo. A Tm
é crucial para determinar as condições ideais de amplificação por PCR.

TEMPERATURA DE METILAÇÃO

A temperatura de metilação refere-se à temperatura na qual ocorre a desnaturação do


DNA metilado durante a PCR. A metilação do DNA pode afetar a eficiência da amplificação,
e controlar a temperatura de metilação pode ser importante para garantir que o DNA metilado
seja adequadamente amplificado em experimentos que visam estudar padrões de metilação do
DNA.

RESULTADO

Em aula foi dado a n´s alunos a tarefa de escolher uma temática para se trabalhar, a
nossa dupla escolheu Covid-19 para o sequenciamento de um primer. Depois de feito deveriaos
escolher entre os resultados um que se enquadrasse para de utilizado.
Depois do sequenciamento escolhemos o primer pair 5, ele atende todas as
características necessárias, seu tamanho é o menor referente aos outros e está com a razão de
C e G adequada.

ATIVIDADE PASSADA EM AULA

1. Indique três finalidades empregadas na produção de um primers e identificação de


genomas.

Biotecnologia: Na produção de medicamentos, a biologia molecular é usada para criar


proteínas terapêuticas, como a insulina recombinante.

Medicina Forense: Amostras de DNA são analisadas para resolver crimes e estabelecer
vínculos familiares.

A detecção de DNA envolve diversos métodos, cada um com suas aplicações


específicas. Aqui estão alguns dos principais:
Reação em Cadeia da Polimerase (PCR): Amplifica regiões específicas do DNA,
permitindo a detecção de sequências-alvo. É amplamente usado em diagnósticos, pesquisa e
testes forenses.

Eletroforese em Gel: Separa fragmentos de DNA com base no tamanho, permitindo a


análise de mutações, polimorfismos e marcadores genéticos.

Sequenciamento de DNA: Determina a ordem exata das bases nitrogenadas no DNA.


Métodos como o sequenciamento de Sanger e o sequenciamento de próxima geração (NGS)
são essenciais para estudos genômicos e diagnósticos.

2. O que são mutações pontuais e quais mecanismos de correção empregadas pelas


nossas células?

As técnicas quantitativas de detecção, como a PCR quantitativa em tempo real (PCR) e


a PCR digital, são utilizadas quando é necessário determinar a quantidade exata de DNA
presente em uma amostra. Essas técnicas são especialmente úteis em diversas situações:

Diagnóstico de doenças infecciosas, Estudos de expressão gênica, Análise de bi


marcadores, Controle de qualidade em biotecnologia.

A detecção de DNA e a detecção de DNA viral envolvem métodos semelhantes, uma


vez que o DNA viral é um tipo específico de DNA. No entanto, há algumas distinções
metodológicas importantes a serem consideradas. Especificidade do alvo, Controles positivos
e negativos, Sensibilidade, Variação genética.
REFERÊNCIAS BIBLIOGRAFICAS

DA CONCEIÇÃO, Nicole Argenta. Eletroforese de DNA. Disponível em:


<https://liaaq.ccb.ufsc.br/files/2013/10/Aula-2-Eletroforese-e-primers.pdf>. Acesso
em:15/03/2024.

KHAN ACADEMY. Mecanismo molecular do DNA. Disponível em:


<https://pt.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-regulation/a/molecular-
mechanism-of-dna-repication>. Acesso em: 15/03/2024.

CATANHO, Marcos, DE MIRANDA, Antônio Basílio, DEGRAVE, Wim. Comparando


genomas: bancos de dados e ferramentas computacionais para a análise comparativa de
genomas procarióticos. Disponível em:
<https://bvssp.icict.fiocruz.br/lildbi/docsonline/gt.php?id=1228>. Acesso em: 18/03/2024.

SCIELO. Epigenética, cuidados maternais e vulnerabilidade ao estresse: conceitos básicos e


aplicações. Disponível em:
<https://www.scielo.br/j/prc/a/QMHpWX7qr5sMh46H9Q97LkF/>. Acesso em: 18/03/2024.

UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA. Estrutura do DNA. Disponível em:


<https://geneticacomportamento.ufsc.br/biologiamolecular/estrutura-do-dna/>. Acesso em:
18/03/2024.

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