International Journal of Astrobiology 2 (3): 203-211 (2003) Impresso no Reino Unido DOI: 10,1017 / S1473550403001551 f 2003 203

Cambridge University Press

Filogenia de Opisthokonta ea evolução da

multicelularidade e complexidade na fungos e
Metazoa

Mo'nica Medina 1,5 *, Allen G. Collins 2,3, John W. Taylor 4, James W. Valentine 3,
Jere H. Lipps 3, Linda Amaral-Zettler 1 e Mitchell L. Sogin 1
1 Josephine Bay Paul Centro de Biologia Comparada Molecular e Evolução, Marine Biological Laboratory, 7 MBL Street, Woods Hole, MA 02543, EUA

2 ITZ, Ecology & Evolution, Tieraerztliche Hochschule Hannover, Bu¨nteweg 17d, 30559 Hannover, Alemanha
3 Departamento de Integrative Biology and Museu de Paleontologia, Universidade da Califórnia, Berkeley, CA 94720, EUA
4 Departamento de Plant and Microbial Biology, Universidade da Califórnia, Berkeley, CA 94720, EUA
5 DOE Joint Genome Institute, 2800 Mitchell Drive, Walnut Creek, CA 94598, EUA

Abstrato : Enquanto a vida eucariótica início deve ter sido unicelular, formas de vida multicelulares evoluíram várias vezes a partir de
ancestrais protistan em diversas linhagens eucarióticas. As origens do multicelularidade são de especial interesse porque eles exigem
transições evolutivas para o aumento dos níveis de complexidade. Geramos novos dados da sequência do gene da subunidade grande
nuclear ribossómica de DNA (LSU ADNr) e o gene SSU rDNA de vários protistas opisthokonta unicelular - uma ameba nucleariida ( Nuclearia
simplex) e quatro choano fl agellates ( Codosiga gracilis, Choanoeca perplexa, choanojuncta Proterospongia e Stephanoeca diplocostata) para
fornecer a base para relacionamentos reexaminar entre várias linhagens unicelulares e seus familiares multicelulares (animais e fungos).
Nossos dados indicam que: (1) choano fl agellates são um monofilético em vez de um assemblage paraphyletic que deu independentemente
origem a animais e fungos como sugerido por alguns autores e (2) a fi amebas perder nucleariida são o grupo irmão propensos a fungos.
Também revisamos informações publicadas a respeito da origem de multicelularidade nas opisthokonta.

Receberam 1 Abril de 2003, aceitou julho 2003 10

Palavras-chave : Choanoflagellata, fungos, Mesomycetozoea, Metazoa, multicelularidade, nuclearia, Opisthokonta.

Introdução análise filogenética que inclui novas sequências de genes ribossomais nucleares a
partir de uma ameba nucleariida e quatro espécies de choano fl agellates.
Transições de unicelular para organismos multicelulares são certamente os
principais eventos na evolução da vida na Terra, permitindo divisões de
trabalho que levaram a aumentos sequenciais de complexidade de
diversidade opisthokonta
desenvolvimento. árvores molecular mostram que a transição de eucariotas
Uma variedade de análises filogenéticas com base em comparações de famílias
unicelulares para multicelularidade ocorreu várias vezes em linhagens distintas.
de genes di ff erent mostram que os fungos são especi fi camente relacionada
Estas análises também fornecem um quadro para a identificação e
com animais para a exclusão de plantas verdes, alveolata, e Stramenopiles
cronometrando os caminhos evolutivos e inovações que levaram à origem das
muitas linhagens protistas separadas (Baldauf & Palmer 1993; Wainwright et al. 1993).
linhagens multicelulares ea geração posterior de complexidade do
Além disso, várias linhagens protistan podem ter divergido perto do ramo entre
desenvolvimento (Wainright et al. 1993; CavalierSmith 1998). técnicas
animais e fungos. A maioria destes relacionamentos hipotetizadas são baseados
genómicas, cada vez mais, estão a clarificar as bases moleculares de redes de
em subunidade pequena nuclear do ADN ribossomal (ADNr SSU) (Ragan et al. 1996;
genes reguladores responsáveis ​pela erentiation célula di ff e padronização, e
Atkins et al. 2000; Amaral-Zettler et al. 2001), mas alguns também são baseados em
que estão subjacentes aumenta em complexidade. No entanto, a abordagem
seqüências codificantes de proteínas (King & Carroll 2001; Snell et al. 2001; Lang et
genómico é inerentemente comparativa, e apenas em combinação com a
al. 2002) (veja a seção de discussão). O clado que compreende metazoários,
filogenética que irá atingir todo o seu potencial. Para ajudar a fornecer uma
fúngica e taxa protistan, e que é exclusiva de outros taxa multicelular (por
filogenia mais robusto para as origens da multicelularidade no Opisthokonta,
exemplo, plantas, algas e vermelho e castanho), é agora conhecido como
que inclui o Metazoa, fungos, Choano fl agellata e Mesomycetozoea,
Opisthokonta (CavalierSmith 1987, 1998). Dois synapomorphies presentes na
realizamos uma
maioria dos taxa opisthokonta são a presença de cristas mitocondriais na fl e uma
uni posteriormente fl agellate estado meis (CavalierSmith 1987, 1998).

* Autor correspondente. endereço atual: Joint Genome Institute, 2800 Mitchell Drive, Walnut
Creek, CA 94598, EUA. e-mail: m_medina@lbl.gov
204 M. Medina et al.
Apesar do ancestralidade comum sugerido pelos dados moleculares, o
nidade uma ffi de animais com um determinado subtipo opistokhont tem sido
elusiva. Muitas linhagens opistokhont distintos variam muito na história de vida,
morfologia externa e os personagens ultra-estruturais. Dentro do Opisthokonta,
os fungos são os que mostra mais diverso não fl agellate e fl agellate formas
(por vezes com zoósporos que pode mover-se como amebas (Sparrow 1960)),
bem como morfologias unicelulares e multicelulares. As outras linhagens chave
dentro do Opisthokonta são o Mesomycetozoea (Mendoza et al. 2001), também
conhecido como o 'gotejamentos' (Ragan et al. 1996), Icthyosporea
(descuidado-Smith, 1998), e mesomycetozoea (Herr et al.
1999). Estes são um grupo de protistas principalmente parasitas que infectam
diversos tecidos em vários hospedeiros animais, incluindo seres humanos
(revisto em Mendoza et al. 2002). O Choano fl agellata são cosmopolitas
organismos uni fl agellate de vida livre que podem ser tanto solitários ou coloniais
e eles compartilham muitos personagens com esponjas (ver Nielsen 2001), e, por
extensão, para Metazoa. Corallochytrium limacisporum, uma vida livre, mas
protista não fl agellate que habita águas de recifes tropicais, assemelha
thrausochytrids (Labyrinthulomycota, Stramenopila), mas é mais estreitamente
relacionado com choano agellates fl do que a qualquer Stramenopila, fungos ou
Metazoa (Cavalier-Smith & Allsopp 1996). vibrans ministeria, outro protista
agellate não fl, cai dentro do Opisthokonta em árvores filogenéticas com base em
dados do SSU (descuidado-Smith, 2000). Mais recentemente, Amaral-Zettler et al.
( 2001) propôs que o livre-vivendo fi amebas nucleariida perder são membros da
Opisthokonta. Estes autores sugeriram que os membros deste gênero, nuclearia,
não eram susceptíveis de ser monofiletico, porque um symbiont caracol eucariota
unicelular tinha sido colocada provisoriamente no género. No entanto, este
organismo recentemente foi transferido para um novo gênero como Capsaspora
owczarzaki ( Hertel et al. 2002), e foi demonstrado ser um membro da
Mesomycetozoea pelo uso de sequências ribossomais mais longos (Hertel et al. 2002). com um ABI Prism 377 DNA Sequencer (Perkin Elmer Instruments, Norwalk,
Os marcadores moleculares
Porque synapomorphies morfológicas que unem as diferentes linhagens
opisthokonta unicelulares e multicelulares são di ffi culto para identificar, caracteres
moleculares, particularmente sequências de SSU e um conjunto de dados de
sequências de crescimento de comprimento completo de ADN largesubunit
ribossomal (LSU), são usados ​para inferir relações opisthokonta. Enquanto as
sequências SSU não forneceram resolução ciente ffi su para as divergências mais
profundas dentro Opisthokonta, a amostragem taxon é de longe o melhor
disponível. Aqui nós apresentamos novas evidências SSU para quatro choano fl
Foram realizados testes razão de probabilidade aninhados (LRT), usando
agellates ( Codosiga gracilis, Choanoeca perplexa, choanojuncta Proterospongia e Stephanoeca
diplocostata) e novos dados LSU para uma ameba nucleariida para testar duas
hipóteses di ff erent relativas relações entre protistas opisthokonta unicelulares e
os seus homólogos multicelulares: (1) Os fungos e animais surgiram de forma
independente a partir de dois di ff erent choano fl agellate linhagens render este
paraphyletic grupo taxonómico (descuidado-Smith, 1987). Apenas alguns choano
sequências fl agellate estavam disponíveis publicamente para testar rigorosamente
esta hipótese. Neste artigo desafiar esta hipótese com quatro novas seqüências do
ff erent três di choano fl agellate
famílias: Acanthoecidae, Codonosigidae e Salpingoecidae (ver Tabela 2 mais
tarde). (2) Embora os dados apresentados por SSU Amaral-Zettler et al. ( 2001)
sugeriu que as amebas nucleariida são taxa opisthokonta, sua análise
filogenética precisa deixou a colocação destes táxons não resolvidas. Aqui
apresentamos dados LSU de nuclearia simplex em uma tentativa de melhorar a
nossa understandingof este importante protistas groupof.
materiais e métodos
novas seqüências
Nós extraído ADN a partir de Nuclearia simplex ( CCAP 1552/4) utilizando o kit
de isolamento de Puregene de acordo com as instruções do fabricante.
Utilizou-se o F63m primers e 28S-amp desenvolvido pela Medina et al. ( 2001)
para amplificar e a sequência de aproximadamente quatro kb do gene de rRNA
LSU. Foi realizada ADN ampli fi cações por reacção de cadeia longa com
polimerase (PCR) (94 X C 5 min, 94 X C 30 s, 45 X C 1 min, 65 X C 12 min r 30, 72
X C 10 min). A enzima utilizada foi uma combinação de rTth (Perkin Elmer) e
respiradouro polimerases (NEB). Depois de A-cauda com a Taq polimerase, o
produto de PCR foi clonado num vector TOPO (Invitrogen). Um único clone foi
sequenciado em ambas as direcções em um aparelho LiCor 4200L (LiCor,
Lincoln, Nebraska). Para a análise combinada, obtivemos as restantes
sequências de SSU e LSU do GenBank (Tabela 1). Choano fl agellate ADN
genómico foi isolado a partir de células congelada ( X 80 X C) As amostras de
quatro espécies (Tabela 1) por pulverizando-o em DNAzol reagente
(Chomczynski et al. 1997), seguido por centrifugação e precipitação com etanol.
Nós Ampli fi cou as sequências completas para SSU usando eucariótica-especí
fi cos iniciadores (Medlin et al.
1988) através de PCR (94 X C 2 min, 94 X C 10 s, 38-48 X C 1 min, 72 X C 3 min r 30).
Os produtos de PCR foram sequenciados directamente em ambas as direcções,
Connecticut).
As análises filogenéticas
Alinhamentos para ambas as moléculas foram re definida por olho utilizando um editor
de alinhamento de múltiplas sequências. Nós codificado estrutura secundária em
alinhamento, a identificação de hastes, loops e protuberâncias, e regiões excluídos
manualmente de alinhamento ambígua a partir do conjunto de dados final. O
alinhamento fi nal de ambos os genes usados ​na análise conjunta inclui caracteres
3872, 2317 a partir de LSU e 1555 SSU alinhamentos, respectivamente. A fi nal
alinhamento SSU inclui 1674 caracteres.
Modeltest versão 3.0 (Posada & Crandall 1998), a fim de determinar o modelo
de evolução sequência para a qual era mais provável que os dados. O LRT
implementado em Modeltest 3,0 indicaram que o modelo que melhor fi
enquadrados o conjunto de dados combinado era uma TRN + I + C ( Tamura-Nei
+ + invariantes gama). A proporção dos sítios assumido invariáveis ​foi 0,3369,
e o parâmetro de forma (alfa) foi 0,5681. O melhor modelo escolhido por
Modeltest para o conjunto de dados SSU foi GTR + I + C ( -Tempo geral
reversível + + invariantes gama). A proporção dos sítios assumido invariáveis
​foi 0,2942, e o parâmetro de forma ( a) foi 0,6026.
 evolução multicelular opisthokonta 205

Tabela 1. Lista de espécies utilizadas na análise combinada, números classi taxonómicos actuais fi cação e de adesão; novas seqüências são apresentados em negrito

SSU LSU

taxa outgroup
Oryza sativa Viridiplantae X00755 M11585
Funaria hygrometrica Viridiplantae X80212 X99331
micans Prorocentrum Alveolata, Dinophyceae M14649 X16108
Toxoplasma gondii Alveolados, Apicomplexa M97703 X75430
Ochromonas Danica Stramenopile, Chrysophyceae M32704 Y07977
Skeletonema pseudocostatum Stramenopile, Bacillariophyta M54988 Y11512

protistas opisthokonta
Ichthyophonus Mesomycetozoean U25637 AY026370
brevicolis Monosiga ATCC 50154 Choano fl agellida AF100940 AY026374
Salpingoeca infusionum ATCC 50559 Choano fl agellida AF100941 AY026380
nuclearia simplex CCAP (1552/4) Nucleariidae AF349566 AY148095

fungos
Cândida albicans Ascomycota X53497 X70659
Saccharomyces cerevisiae Ascomycota J01355 M27607
Tricholoma matsutake Basidiomycota U62538 U62964
Mucor racemosus Zygomycota AJ271061 AJ271061
Blastocladiella emersonii Chytridiomycota M54937 X90411

animais
brexilis fi Mycale Porifera AF100946 AY026376
Leucosolenia sp. Porifera, Calcarea AF100945 AY026372
Antipathes galapagensis Cnidaria AF100943 AY026365
Hydra circumcincta Cnidaria AF358080 AY026371
pleurobrachia bachei Ctenophora AF293677 AY026378
Beroe ovata Ctenophora AF293694 AY026369

Usamos PAUP * 4.0 (Swo ff ord 2000) para a maioria das análises
filogenéticas. Foi realizado de probabilidade máxima (ML),
mínimo-evolução (ME) e pesquisas máximo-parcimónia (MP). Para mim e
MP, realizamos pesquisas heurísticos, com 1000 repetições de adição
gradual aleatória e TBR ramo troca. Para ML, realizamos pesquisas
heurísticos, com cinco repetições de adição gradual aleatória e TBR ramo
troca. Para estimar o suporte ramo realizamos 100 pseudoreplicates de
bootstrap para ML (apenas os dados combinados) e 1000
pseudoreplicates para ME e MP.
Além disso, nós produzimos árvores filogenéticas de inferência Bayesiana
usando MrBayes 2,0 (Huelsenbeck & Ronquist 2001). Foi realizada exploratório
cadeia de Markov de Monte Carlo (MCMC) é executado, começando com árvores
aleatórios e um GTR + I + C
(Tempo geral reversível + + invariantes gama) modelo de evolução. Subsequentemente,
que correu a cadeia MCMC aquecida para 500 000 gerações, as quais foram recolhidas
amostras a cada 10 actualizações. Foram descartados 10 000 ciclos como burn-in antes
de estimar probabilidades posteriores conjuntas. Submetemos matrizes de dados e
árvores resultantes para o banco de dados TreeBase sob número de apresentação
SN1520.
No geral, nossas análises O forte apoio ff er para o monofiletismo dos
opisthokonta mas ao mesmo tempo descrevem independente animais e
clades fúngicas. Em ambas as árvores, mesomycetozoeans e choano fl
agellates formar o grupo irmã para animais, mas o suporte para esse
relacionamento potencial é baixa. O Estado de nuclearia como o grupo
irmão Fungos é bem suportado na análise conjunta, enquanto que na
análise o SSU nuclearia taxa são basal ao animal / choano fl agellate /
grupo mesomycetozoean, todos os quais são irmã para fungos, mas o
suporte é inexistente. A relação entre mesomycetozoeans e choano
agellates fl irá requerer uma maior exploração. Nossos dados sugerem que
estas duas linhagens formar um grupo monofilético, mas com o apoio de
bootstrap fraco. Além disso, a colocação de
Corallochytrium e ministeria, Permanece incerto, em parte por causa da falta
de uma sequcia de LSU. Nossa análise SSU com muitas espécies mais
choano fl agellate e mesomycetozoean também sugere que choano
existente agellates fl são monofiléticos.
Relações dentro dos grupos

As análises combinadas apoiar monophyly do Choano fl agellata, embora esta

Resultados
As relações entre os principais grupos
A Fig. 1 mostra a árvore filogenética óptima mL utilizando um conjunto de sequências
de SSU e LSU enquanto a Fig dados combinado. 2 (ver também o Quadro 2) é uma
análise semelhante para apenas as sequências de SSU. Ambas as árvores mostram
valores de apoio para os nós de acordo com vários métodos filogenéticos di ff erent.
inferência filogenética não incluem um acanthoecid choano fl agellate.
Amostragem de seqüências SSU a partir de choano fl espécies agellate ainda
é escassa, mas as nossas sequências adicionais permitir algumas
observações relativas às relações dentro do grupo coroa. Acanthocoepsis,
Diaphanoeca e Stephanoeca formar um clado robustamente suportado (Fig. 2).
Encontramos as seqüências de SSU de Proterosponga choanojuncta e Choanoeca
perplexa ser idêntico.
206 M. Medina et al.

Figura 1. análise filogenética opisthokonta de SSU mais LSU rDNA. Melhor árvore obtida pelo ML. A primeira três valores acima ramos correspondem a inicializar os valores de ML, MP e
ME, respectivamente. O quarto valor corresponde a probabilidades posteriores a partir da análise Bayesiana (um único valor de 100 indica mesmo suporte em todas as análises).
organismos unicelulares são encaixotados. A distância evolutiva é representado pela barra de escala. Ver Tabela 1 para nome da espécie completa. o nuclearia simplex estirpe
sequenciada neste estudo é efectivamente a mesma que a estirpe marcada N. s.WB em Hertel et al. ( 2002) (correção feita por esse autor como uma comunicação pessoal). o N. simplex

estirpe, CCAP (1552/4), sequenciado neste estudo é a estirpe Heidelberg.

Os membros do grupo protistan fi edMesomycetozoea recém identi foi dividido
em duas ordens monofiléticos distintos, com base em dados do SSU e traços da
história de vida (Mendoza et al.
2002). A nossa análise da SSU (Fig. 2) também se recupera os mesmos dois grupos com
alta suporte.
O monophyly de fungos é bem suportado por todos os métodos de
avaliação de suporte na análise combinada e por as probabilidades
posteriores Bayesian na análise SSU. Tanto o SSU e análises combinadas
apoiar o / Basydiomycota relação grupo irmã Ascomycota, bem como a sua
monophyly (Fig. 2). Embora nossos dados SSU não resolverem as relações
fúngicas basais, nossos resultados são congruentes com outras análises
filogenéticas (Nagahama et al. 1995; James
et al. 2000), que mostrou que os primeiros divergentes clados fúngicas foram
linhagens de Chytridiomycota e Zygomycota, e que nenhum dos dois grupos foi
monofiletico.
O monofiletismo de Metazoa também é bem suportado por nossas análises
eo padrão de ramificação nesta parte das árvores está de acordo com
phylogenies ribossômicas publicadas para esse grupo (Collins 1998; Medina et
al. 2001).
se as células são nu (Codonosigidae), coberto com uma teca
(Salpingoecidae) ou rodeado por uma lorica silicioso (Acanthoecidae). Dos
12 gêneros em Acanthoecidae; temos seqüências para as espécies em três
deles ( Acanthocoepsis, Diaphanoeca e Stephanoeca). Estes três espécies
formam um clado robustamente suportado (Fig. 1), o que sugere que estas
espécies compartilham uma lorica porque tinham um antepassado
lorica-rolamento. A posse de um theca, no entanto, não parecem ter
filogenética significância ao nível desta análise. As duas espécies de
amostra (thecate Salpingoeca infusionum
e Choanoeca perplexa) estão em clados separados, e pode possuir este
personagem através da convergência. Este resultado não é surpreendente, por
exemplo, Leadbeater (1983) observou que uma espécie de choano nu fl agellate (o
colonial Proterosponga choanojuncta) contém uma fase em seu ciclo de vida que é
indistinguível daquela numa espie de rolamento da teca (a sedentário unicelular Choanoeca
perplexa). As nossas sequências de SSU de estas duas espécies são idênticos,
indicando que eles são ou muito intimamente relacionadas ou que são di fases ff
erent no ciclo de vida de uma única espécie, como se depreende por observações
de Leadbeater. Por fim, uma sequência de SSU disponível, recuperado de uma
amostra ambiental de picoplâncton (Moon-van der Staay et al. 2001), parece
representar um fantasma choano fl agellate que está mais estreitamente

Discussão relacionado com Salpinoeca infusionum

Choano fl agellate hipótese

Os estudos tradicionais à base de morfológicas reconhecem três famílias de do que para qualquer outra espécie da amostra. Descuidado-Smith (1987) propôs
Choano fl agellata (Leadbeater 1983), de acordo com a que duas linhagens di ff erent de choano fl agellates
 evolução multicelular opisthokonta 207

Figura 2. análise filogenética opisthokonta de SSU rDNA. Melhor árvore obtida pelo ML. Os primeiros dois valores acima ramos correspondem a inicializar os valores de PM e ME
respectivamente. O terceiro valor corresponde a probabilidades posteriores a partir da análise Bayesiana (um único valor de 100 indica mesmo suporte em todas as análises). organismos
unicelulares são encaixotados. distância evolutiva é representado pela barra de escala. Ver Tabela 2 para nomes de espécies completas. * Mucor pode crescer como um fermento e Icthyophonus faz
filamentos e esporângios.

deu origem a animais de forma independente e fungos. Ele sugeriu que a
codosigid choano fl agellate deu origem a animais, enquanto fungos poderiam
ter evoluído a partir de um salpingoecid choano fl agellate. Esta hipótese é
contrariada pela nossa evidência molecular. Codonosigid (p.ex. Monosiga
brevicolis)
e salpingoecid (p.ex. Salpingoeca infusionum) linhagens estão incluídos em um
clado bem suportado distinto de ambos os fungos ou animais, tanto no
alguns taxa opisthokonta (Baldauf & Palmer 1993; Baldauf & Doolittle 1997;
King & Carroll 2001; Snell et al. 2001; Lang
et al. 2002) apoiou uma relação filogenética próxima entre animais e fungos
para a exclusão de plantas, embora apenas alguns estudos incluíram
qualquer um dos protistas opisthokonta (King & Carroll 2001; Snell et al. 2001;
Lang et al.
2002). Os dados a partir dos genes que codificam a proteína EF-2, uma e

combinadas e analisa SSU. No entanto, grupo haste extinto choano agellates fl
não estejam impedidos como os antepassados ​de metazoários.
filogenia opisthokonta geral e evolução de caracteres
As relações entre uma constelação de grupos bastante diferentes dentro do
Opisthokonta não ter sido fi clari ed pelo gene SSU. Além dos genes
ribossomais nucleares, genes codificadores de proteínas nucleares e
mitocondriais estudado em
b- tubulinas, e actina (King & Carroll 2001), bem como a partir do gene de
hsp70 (Snell et al. 2001) indicaram que choano agellates fl fazem parte do
clado opisthokonta, e, possivelmente, o grupo irmã para animais. King &
Carroll (2001) também relataram um receptor tirosina-quinase (RTK),
semelhante aos RTKs metazoários, que estão amplamente envolvidas em vias
de desenvolvimento. Seja ou não outras linhagens opisthokonta protistan
também têm RTKs é desconhecida. Uma análise abrangente (Lang et al. 2002)
de 11 proteínas mitocondriais conservadas de muitos protestos, incluindo tanto
uma choano fl agellate
208 M. Medina et al.

Mesa 2. Lista de espécies, números taxonômicos atuais classi fi cação e adesão Mesa 2 ( cont.)
para a análise SSU; novas seqüências são apresentados em negrito
Acesso SSU.
Não.

Acesso SSU.
Monoblepharis insignis Chytridiomycota AF164333
Não. Blastocladiella emersonii Chytridiomycota M54937
Chytridium confervae Chytridiomycota M59758
taxa outgroup
Coprinus cinereus Basydiomycota M92991
lobophora Chlorella Viridiplantae X63504
Schizophyllum commune Basydiomycota X54865
Chlamydomonas reinhardtii Viridiplantae M32703
toruloides Rhodosporidium Basydiomycota D12806
mínimo Prorocentrum alveolar Y16238
Toxoplasma gondii alveolar L37415 ameba nucleariida
Ochromonas CCMP584 Stramenopile U42381 nuclearia moebiusi CCAP (1552/3) Nucleariidae AF349565
Skeletonema pseudocostatum Stramenopile X85393 nuclearia simplex CCAP (1552/4) Nucleariidae AF349566
nuclearia delicatula CCAP (1552/1) Nucleariidae AF349563
Choano fl agellates
Sphaeroeca volvox Codonosigidae Z34900
Proterospongia choanojuncta Codonosigidae AY149896
ATCC 50455
e uma mesomycetozoean coloca estas duas linhagens em um agrupamento
Codosiga gracilis ATCC 50454 Codonosigidae AY149897 monofilético que contém o Metazoa, com o choano fl agellates fortemente
brevicolis Monosiga ATCC 50154 Codonosigidae AF100940 apoiado como o grupo irmã para metazoários eo mesomycetozoean como a
Choanoeca perplexa ATCC 50453 Salpingoecidae AY149898
linhagem mais basal neste clade. Embora a nossa análise filogenética teve fraco
Salpingoeca infusórios Salpingoecidae AF100941
suporte para alguns nós fundamentais, no geral é consistente com os dados
ATCC 50559
Stephanoeca diplocostata Acanthoecidae AY149899
mitocondriais (Lang et al. 2002). Nossos dados, portanto, adicionar suporte para a
ATCC 50456 inferência de que multicelularidade evoluído duas vezes no Opisthokonta, uma
Diaphanoeca grandis ATCC 50111 Acanthoecidae L10824 vez que nos animais e novamente na Fungos.
Acanthoecopsis ungiculata Acanthoecidae L10823
ATCC 50073
Eucariota OLI11041 clone AJ402325
Embora a evidência morfológica é bastante indicativo e em parte de
sedis INSERTA opisthokonta
acordo com os dados moleculares (neste estudo, e Lang et al. 2002), os dois
limacisporum Corallochytrium L42528
synapomorphies utilizados para designar o Opisthokonta (fl em cristas
Mesomycetozoea
tapetis Pseudoperkinsus Dermocystida AF192386
mitocondriais e a presença de um fl agellum posterior) são caracteres
rossette agente de Dermocystida L29455 filogenéticas lábeis que reverteram para um estado ancestral em algumas
salmão Chinook linhagens. Exemplos são a presença de cristas mitocondriais na tubular Ichthyophonus
Dermocystidium salmonis Dermocystida U21337
( Ragan et al. 1996) - um mesemycetozoean - e cristas mitocondriais
Dermocystidium sp. Dermocystida U21336
discoidal no amebas nucleariida (Amaral-Zettler et al. 2001). Além disso, os
Rhinosporidium seeberi Dermocystida AF118851
Amoebidium parasiticum Ichthyphonida AF274751
nucleariida e os mesomycetozoeans icthyophonid não produzem células fl
Amoebidium parasiticum Ichthyphonida Y19155 agellated mas as células ameba-like. Assim, no momento não há nenhuma
Ichthyophonus Ichthyphonida U25637 synapomorphy ultra claro que é conservada durante todo o clade. A
haeckelii Psorospermium Ichthyphonida U33180
ausência de um synapomorphy morfológica universalmente diagnóstico de
Anurofeca richardsi Ichthyphonida AF070445
Opisthokonta não é surpreendente, dada a idade avançada ea diversidade
Sphaeroforma artica Ichthyphonida Y16260
* Capsaspora owczarzaki AF349564
do clade. Nós provavelmente terão que depender, por conseguinte, dados
ATCC 30864 de sequência e os dados bioquímicos (por exemplo, redes de genes), para
animais identificar caracteres de diagnóstico apropriados para este grupo
Leucosolenia sp. Porifera AF100945 eucariótica. Por exemplo, a descoberta de um gene de fusão entre o
Suberites fi cus Porifera AF100947 di-hidrofolato redutase (DHFR) e timidilato-sintase (TS) em representantes
Rhabdocalyptus dawsoni Porifera AF100949
de grandes linhagens eucarióticas para a exclusão dos taxa opisthokonta
Antiphathes galapagensis Cnidaria AF100943
actualmente amostrados (animais, fungos e limacisporum Corallochytrium) o
Nanomia bijuga Cnidaria AF358071
Chironex fl eckeri Cnidaria AF358104 ff ers evidência adicional para o seu monophyly (Stechmann &
rubra Nausithoe Cnidaria AF358095 Cavalier-Smith, 2002). Estes genes são também traduzida separadamente
adherens Trichoplax Placozoa L10828 em eubactérias, um facto que foi utilizado para colocar a raiz eucariótica
Fugiens Charistephane Ctenophora AF358113
entre opisthokonta e o restante do domínio eucariótica (Stechmann &
Ptychodera bahamensis Hemichordata AF236802
descuidado-Smith 2002; Simpson & Roger 2002). Embora a tradução de
Phoronis hippocrepia Phoronida AF202112
caudatus Priapulus Sipuncula AF025927 DHFR separada e TS representa um estado ancestral e a amostragem
fungos taxon é ainda limitada, esta característica genómico exemplifica o tipo de
Saccharomyces cerevisiae Ascomycota M27607 informações que se tornarão
crassa Neurospora Ascomycota X04971
Basidiobulus ranarum Zygomycota D29946
Conidiobulus coronatus Zygomycota D29947
Piptocephalis corymbifera Zygomycota AB016023
Mucor mucedo Zygomycota X89434
mosseae Glomus Zygomycota Z14007

cada vez mais valioso no reconhecimento de grupos que compartilham um ancestral comum.
Evolução da complexidade em fungos
Dentro do Fungos, multicelularidade linear simples de hifas ocorre em todas as
grandes clades (veja abaixo), mas apenas Ascomycota e exibição
Basidomycota dois mais complexo e multicelularidade tridimensional na forma
de corpos de frutificação sporeproducing sexual. Em ambos os grupos, a
James Clark-1868; Fjerdingstad 1961; Laval 1971; Leadbeater 1985). Outras
inversão para as formas de vida unicelulares ter ocorrido, por exemplo, Saccharomyces
células metazoários pode ter estruturas de colarinho-like, mas eles não se
e muitas outras leveduras relacionadas no saccharomycotina (Ascomycota) ou albidus
Cryptococcus e espécies relacionadas no clado hymenomycete de
Basidiomycota (de Hoog
flagelar cria uma corrente fl devido distância do vértice da célula, puxando
et al. 2000, p. 130). Leveduras na taphrinomycotina do Ascomycota, Schizosaccharomyces
sp. e Pneumocystis carinii, pode representar reversões à vida unicelular, dada
a presença naquele clade de neolecta sp. com, estruturas multicelulares
sexuais macroscópicas (Landvik et al. 1993). O agellum única fl posterior e
forte motilidade natação de Blastocladiales, Monoblepharidales e zoósporos
Neocallimastigales (Sparrow 1960), bem como os seus movimentos
amebóides, são características compartilhadas com os animais, choano fl
agellates, Mesomycetozoea e amebas, fornecendo um argumento forte que o
último ancestral comum de esses grupos foi aquática e tinha esses atributos.
Juntos, a conta Chytridiomycota e Zygomycota para não mais do que 2% de
espécies de fungos, levantando a possibilidade de que corpos de frutificação
multicelulares eram uma vantagem que permitiu Ascomycota e Basidiomycota
a tornar-se muito mais numerosos. Dentro Ascomycota e Basidiomycota, nem
todos os clados têm corpos de frutificação multicelulares mas os clados que
seguintes modos muito diferentes de vida.
fazer (pezizomycotina em Ascomycota (e taphrinomycotina, mas apenas em neolecta
sp.), em Hymenomycetes Basidiomycota) são mais do que speciose irmão
clados faltam os corpos de frutificação multicelulares (saccharomycotina em
Ascomycota, ustilaginomycetes e Urediniomycetes em Basidiomycota). No
entanto, estruturas reprodutivas multicelulares são grandes e mais propensos a
ser visto por biólogos, que provavelmente influencia a contagem desses
organismos, uma possibilidade que poderia ser testada por pesquisas
completas de biodiversidade. Em Opisthokonta, o multicelularidade simples,
linear de hifas é encontrado em Mesomycetozoea e fungos, mas se ele surgiu
independentemente em cada ou era um caráter ancestral perdido em choano
agellates fl e Metazoa é desconhecida. As hifas dos fungos mais antiga
divergentes, Blastocladiales, erentiation mostra di ff entre segmentos de hifas
na produção de mitótico e esporângios meiótica ou gametangia, melhor
documentado no Allomyces macrogynus ( Emerson 1941). No entanto, o
multicelularidade que permite a mais extensa erentiation di ff da função é
reservada para corpos de frutificação sexuais do clade pezizomycotina de
Ascomycota ou clade Hymenomycetes de Basidiomycota. Aqui, interruptores
simples que especificam a produção de um esporângio em vez de uma hifa
vegetativa não pode explicar os muitos tecidos di ff erent de em cada um dos
principais órgãos de um cogumelo, coordenação vez complexa do
desenvolvimento por muitos produtos de genes deve ser invocado (Wessels &
Meinhardt 1994 ; Kamada
2002).
evolução multicelular opisthokonta 209
Evolução da complexidade animais
O fl agellata linhagem Choano tem uma morfologia celular, que é muito
semelhante àquelas em Porifera. A estrutura agellar microvillar- fl da choano fl
agellate colar é único entre opisthokonta protistan, e não ocorre em outros
grupos fl agellate (Karpov 2000). Apenas entre coanócito esponja são células
colarinho similares encontrados. Esta característica morfológica partilhado
sugere uma relação estreita entre choano agellates fl e esponjas (por exemplo,
assemelham choano fl agellate células. As coleiras são utilizados de forma
semelhante na alimentação em ambos choano fl agellates e esponjas, e,
portanto, não são funcionais, bem como semelhanças morfológicas. actividade
assim a água e os itens de alimentos em suspensão para a gola, em que as
partículas podem ser presos e ingerido. A homologia da choano fl agellate
célula com coanócito esponja é compatível com os phylogenies DNA
ribossomal e fortemente concorda com os dados mitocondriais (Lang et al.
2002).
Em contraste com choano agellates fl, mesomycetozoeans coroa fazer
modelos pobres para antepassados ​metazoários. Se mesomycetozoeans são
mais basal dentro Opisthokonta que são choano fl agellates, então tronco
mesomycetozoeans provavelmente incluía de vida livre, fl agellated formas a
partir do qual ambos os grupos coroa ea coroa choano fl agellates desceram,
A via adaptativa que levou a partir choano fl agellates para as esponjas
multicelulares pode ter envolvido na organização de tipos de células erent di ff. células
Choano fl agellate, com apenas um único centro organizador dos microtúbulos, não
pode suportar um agellum fl e gerar um eixo ao mesmo tempo (Margulis 1981). A fim
de dividir, as células devem reabsorver o agellum fl. Há, portanto, duas fases
celulares morfológicas, uma para as células em divisão e um para células 'adultos'.
Em agellates choano fl coloniais, ambas as fases do ciclo celular podem estar
presentes no interior da colónia, ao mesmo tempo e as fases pode ser modelado, em
alguns casos, com divisão de células dentro de uma camada de células agellar fl.
Buss (1987) sugeriu que estas fases celulares prefigurado di ff erentiated tipos de
células que evoluiram no prazo de metazoários no início.
Um caminho plausível para um choano colonial fl agellate para se tornar
realmente multicelular é para uma das fases do ciclo celular para se tornar uma
célula estaminal, reproduzindo-se, bem como dando origem à morfologia celular
outro. As células morfologicamente distintas são então di ff tipos de células
erentiated. Como as morfologias de ambas as fases são codificados dentro do
choano fl agellate genoma, a mudança de fase da célula para tipo de célula tem
de envolver, a captura de sinais ambientais ou fisiológicas os sinais reguladores
que medeiam as cytoarchitectures erent di ff, e incorporando-os em um
repertório de desenvolvimento (Valentine, em pressione). Tal captura equivale a
estabelecer o tipo de processo de desenvolvimento que está associado com
multicelularidade. A cooptação de genes e de vias de desenvolvimento tem
claramente ocorreu entre principais taxa, tais como filos e as classes, por cis evolução
regulamentar
210 M. Medina et al.
(Por exemplo Lowe & Wray 1997 para equinodermes, Akam et al. 1988 por
artrópodes, e veja Carroll et al. 2001; Wilkins, 2002). Uma variedade de mecanismos
detalhados poderia ser responsável por esse recrutamento gene, e, actualmente,
nenhuma evidência indica que exatamente poderia ter acontecido durante o choano
fl transição agellate-esponja postulada. Em vista dos eventos evolutivos
subsequentes dentro metazoários, homeobox genes podem estar envolvidos.
conclusões
Multicelularidade pode ser uma estratégia de adaptação para o aumento do tamanho
do corpo (por exemplo, Cox & Bonner 2001). Certamente, é multicelularidade
homoplástico entre diversos clados, talvez tantos quanto 24 (Buss 1987). No entanto,
os grandes reinos multicelulares pertence a um clado que inclui Opisthokonta e
Chlorobiota e inovações em mecanismos moleculares pode ter permitido o
surgimento de verdadeiras multicelularidade em planos corporais complexos (ver
Stiller & Hall 2002). As reduções de tamanho e complexidade dentro clados
multicelulares também são bem conhecidos. O estado unicelular exemplificada por
alguns fungos que têm parentes próximos multicelulares (por exemplo, Saccharomyces)
pode mais facilmente ser interpretada como uma fi simpli secundário cação. SIMPLI fi
cações, embora não completamente reverter para um estado singlecelled, poderá
também contribuir para os planos de corpo simples encontrados em vários grupos de
metazoários, geralmente parasitas (por exemplo, Myxozoa, Orthonecta, Rhombozoa
e o nematomorpha um tanto mais complexo).
À medida que novos genomas estão sendo concluídas para diversos membros
do clade opisthokonta, uma abordagem comparativa será essencial para abordar
estas questões. Estudos comparativos dos processos de desenvolvimento e
fisiolicas que levam a multicelularidade, bem como aqueles que conduzem à
diminuição do número de tipos de células, irá, assim, proporcionar perspectivas
sobre a evolução de ambos complexidade e simplicidade. Informações sobre
regulação gênica em todo ontogenia está rapidamente se acumulando e está sendo
sintetizado (ver Carroll et al. 2001; Davidson 2001; Wilkins, 2002). Vai ser de grande
interesse para aprender o que são as características únicas que caracterizam
Opisthokonta e que foram implicados na evolução dos inúmeros aumentos de
complexidade encontrados dentro desse clado.
Agradecimentos
Somos gratos a J. Silberman pelos comentários úteis sobre aspectos erent
di ff de evolução opisthokonta e filogenia. Esta pesquisa foi apoiada por
GM32964 concessão NIH, pela concessão NSF EAR-9814845, e pelo
Instituto NASAAstrobiology, a adesão NCC2-1054. JT foi apoiado pela
NSF Biologia Sistemática e bolsas NIH NIAID. Parte deste trabalho foi
realizado sob os auspícios do Departamento de Energia, O ffi ce de
Investigação Biológica e Ambiental dos EUA, pela Universidade da
Califórnia, Lawrence Berkeley National Laboratory sob contrato não
DE-AC0376SF00098. Esta é UC Berkeley Museu de Paleontologia número
contribuição 1804.
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