Seleção natural

Utilizando o programa Populus foi possível realizar a simulação de seleção natural e

interações. No caso, a figura 1 descreve os valores padrão de adaptabilidade, coeficiente
de seleção, condições iniciais sendo a ala A com 6 valores iniciais diferentes. Os valores da
figura 1 foram plotados no gráfico de dispersão de generations em função de Allelic
frequency.

Figura 1 : simulação

Os parâmetros foram alterados para expressar simulações com diferentes valores em

Fitness alterando Waa, WAa e WAA , tais valores dizem a respeito dos valores de 3
genótipos AA, Aa e aa . A seguir estão as simulações respectivas de :

a) Vantagem do Dominante: WAA = WAa > Waa:

b) Vantagem do Dominante, com dominância incompleta: WAA > WAa > Waa:
c) Vantagem do Recessivo: Waa > WAA = WAa:

d) Vantagem do Heterozigoto, com semelhança entre Homozigotos: WAa > WAA = Waa:

e) Vantagem do Heterozigoto, com diferença entre Homozigotos: WAa > WAA ≠ Waa:

f) Desvantagem do Heterozigoto, com semelhança entre Homozigotos: WAa < WAA = Waa:
Alterando os valores dos parâmetros h e s encontra-se a figura abaixo:

Conclui-se que quando existe vantagem do dominante, existe um decréscimo da

frequência genotípica dos alelos aa e aumento da frequencia P. Ao contrário disso,
quando a vantagem está nos alelos heterozigotos Aa existe um aumento e
diminuição de P nos gráficos de acordo com as generations (t), sendo que existe
uma tendência dos valores se aproximarem e convergirem em um valor de P ao
longo de t . Com a vantagem do alelo recessivo aa , nota-se que os valores de
frequência alélica P diminuem. Quando há desvantagem dos alelos heterozigotos,
os valores de P tendem a aumentar e diminuir até surgir o ponto de constância para
todos, ou seja, a heterozigosidade diminui e aumenta a frequência de homozigotos.
A simulação de seleção e mutação possui o gráfico dispersão p x t com os valores
padrão como mostra a figura a seguir :

Alterando os valores de s , coeficiente de seleção e h grau de dominância de A

encontram-se as respectivas simulações :

a) s=0,6 e µ = 1 . e ^-6

b) s=0,6 e µ = 1 . e ^-3

c) s=0,6 e µ = 1 . e ^-1
d) s=0,2 e µ = 1 . e ^-6

e) s=0,2 e µ = 1 . e ^-3

f) s=0,2 e µ = 1 . e ^-1
Conclui-se que mantendo os valores de s e alterando os valores de µ , os valores
de seleção e mutação q (frequência de equilíbrio ) tendem a aumentar , enquanto
que os valores de P frequência alélica diminuem para chegar na reta constante. Em
suma, no caso de s = 0,6 e s = 0,2 constantes , nota-se que os valores de
frequência de equilíbrio ( q) aumentam conforme aumentam os valores de µ .

Simulando a deriva e seleção pelo programa Populus, manter-se os valores padrão

como mostra a figura a seguir :

Depois altera-se os parâmetros de valores de adaptabilidade W e valores de N

população como mostra as figuras a seguir :
Analisando as figuras nota-se que aumentando o tamanho de população N os
gráficos tendem a apresentar menos variações nos valores de P , por exemplo na
população de 500 tais variações de P são menores, quase não havendo pico no
gráfico de Drift and selection , além disso, nota-se que os valores de t aumentar em
populações maiores o que comprova que o aumento da população demanda mais
tempo para fixar os alelos. Além disso, se analisar os gráficos da população nota-se
que alterados os valores de WAa, Waa e WAA demonstram que valores de maior
adaptabilidade de a , tendem ao gráfico de P tendendo a 0 e se A adapta, tende a 1
.

Deriva genética
Utilizando as simulações do programa Populus foi possível analisar a deriva
genética. No caso dos valores padrão de Runtime = 3N; Permit Selfing = off;
Population Size (N) =8; Number of Loci = 6; Set frequencies collectively = on; Initial
Frequency (p) = 0.5 , encontra-se a figura abaixo.

Pela simulação nota-se que o gráfico de dispersão está descrito como frequências
alélicas (P) em função de gerações (t). A partir disso, foi realizado simulação com os
respectivos números de população e frequência inicial :

a) Population Size (N) = 8; Initial Frequency (p) = 0.2:

b) Population Size (N) = 8; Initial Frequency (p) = 0.7;

c) Population Size (N) = 50; Initial Frequency (p) = 0.5:

d) Population Size (N) = 50; Initial Frequency (p) = 0.2;

e) Population Size (N) = 50; Initial Frequency (p) = 0.7;

f) Population Size (N) = 500; Initial Frequency (p) = 0.5;

g) Population Size (N) = 500; Initial Frequency (p) = 0.2;

h) Population Size (N) = 500; Initial Frequency (p) = 0.7.

Conclui-se que mantendo o tamanho populacional e alterando os valores de

frequência inicial (para) , os valores de frequência alélica (P) tendem a apresentar
maiores variações, ou seja, formam mais picos confirme aumenta os valores de
frequência inicial. Além disso, analisando o aumento do tamanho da população,
nota-se que os valores de P , frequência alélica , tendem apresentar maiores
variações em cada linha. Isso também demonstra que existe uma fixação maior em
população com menos população sendo que aumenta o número de gerações em
população maiores.

Além disso, foi realizado simulações em 3D generations, com valores de N e

frequência inicial p como mostra a seguir :

a) Population Size (N) = 10, e a frequência inicial p = 0.5:

b) Population Size (N) = 10, e a frequência inicial p = 0.2:

c) Population Size (N) = 10, e a frequência inicial p = 0.7;

d) Population Size (N) = 30, e a frequência inicial p = 0.5:

e) Population Size (N) = 30, e a frequência inicial p = 0.2;

f) Population Size (N) = 30, e a frequência inicial p = 0.7:

Conclui-se que a frequência de estado aumenta com o aumento da frequência
inicial, sendo que aparece um pico apenas nos valores de frequência inicial = 0,7 . A
frequência do gráfico em 3D , aumenta conforme aumenta os valores de frequência
inicial, isso significa que a frequência aumenta inicial aumentada demanda
aumentar o número de gerações . A deriva genética aleatória é o acúmulo de
mudanças nas proporções de alelos nas populações ao longo de gerações, um dos
pesquisadores sobre o tema Peter buri realizou experimentos em que documentou a
deriva genética em populações de Drosophila de olhos brancos e vermelhos, ele
demonstrou que as populações pequenas de forma mais rápida assim como ocorre
na simulação, em que aumentando o número da população aumenta o número de
gerações sendo o tempo maior.