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PERCEPÇÃO INOVADORA
DOI: 10.18609/cgti.2021.126
www.insights.bio
937
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES
No 21st Century Cures Act, o Congresso dos 4.Investigue os recursos e selecione os sistemas de
Estados Unidos também reconheceu a importância da contagem de células apropriados, onde o sistema
regulatória de produtos de terapia genética e celular[ desempenho do ensaio (ou seja, precisão, faixa,
contagem de células” e “ISO 20391-2:2019 contagem de células para terapias celulares e gênicas
Biotecnologia – Contagem de células – Parte 2: Projeto são amplas devido a uma ampla gama de tipos de
experimental e análise estatística para quantificar o amostras biológicas com várias formulações e etapas
desempenho do método de contagem”, que podem de bioprocessamento, que são complexas, dinâmicas
servir de orientação para pesquisadores que e heterogêneas. Como atualmente não há materiais
trabalham na área de imunoterapia e terapia celular de referência para células vivas de mamíferos que
adotiva, onde ambas exigem medições de contagem sejam certificados para concentração celular, o
de células robustas e de alta qualidade para produtos parâmetro de precisão descrito na Diretriz Tripartida
Derivado dos conceitos gerais descritos na Parte 1 Analíticos: Texto e Metodologia Q2 (R1) não pode ser
do Padrão de Contagem de Células ISO, propomos 6 prontamente aplicado, aumentando assim o desafio e
fatores-chave que podem fornecer orientação sobre a dificuldade de validar a precisão da contagem de
Portanto, os padrões de contagem de células ISO podem propriedade de qualquer método de contagem de
servir como uma ferramenta valiosa para avaliar e células, e qualquer desvio da proporcionalidade
selecionar métodos de contagem de células adequados indicaria um erro sistemático ou não sistemático,
para o propósito, a fim de aumentar a confiança nos resultando em perda de precisão da medição. Para
resultados da contagem de células. avaliar mais diretamente o desvio sistemático da
proporcionalidade, que é um indicador de perda de
precisão, oPIé calculado ajustando um modelo
proporcional aos dados da série de diluição e, em
DESENVOLVIMENTO DO seguida, resumindo os resíduos com base nos dados
PROTOCOLO
suavizados, reduzindo assim a influência da variação
Empregamos a orientação da ISO 20391 – aleatória na avaliação da proporcionalidade[17].
2:2019 Biotecnologia – Contagem de Existem várias abordagens para calcularPI, onde
células – Parte 2 e utilizamos informações algunsPIas métricas podem ser mais relevantes com
do ICH Q2 (R1) para desenvolver um base na necessidade de adequação ao propósito do
protocolo apropriado para avaliar o método de contagem de células. Algumas métricas
desempenho de métodos de contagem de penalizam mais os valores discrepantes, enquanto
células selecionados. O documento de outras pesam os erros uniformemente nas diluições
orientação ICH Q2 (R1) apresenta vários ou permitem mais contribuições por concentrações de
parâmetros para a validação de métodos células mais altas. Neste trabalho, utilizamos oPI
analíticos, como robustez, linearidade, modelo publicado anteriormente do Instituto Nacional
faixa de detecção, limites de detecção de Padrões e Tecnologia (NIST)[17]. Deve-se notar que
(LOD), limites de quantificação (LOQ), as fontes de erro sistemático que são proporcionais à
precisão (repetibilidade, precisão diluição da amostra não serão detectadas com esta
intermediária, reprodutibilidade) , e abordagem. Por exemplo, se os detritos forem
precisão. É importante observar que, como misturados com a suspensão de células e falsamente
não há material de referência para identificados como células, a concentração de células
fornecer um valor de referência para a e detritos seria reduzida proporcionalmente com a
concentração celular, a avaliação do diluição, e as falsas contagens não afetariam a
parâmetro de precisão precisa ser avaliada proporcionalidade. A fim de demonstrar o uso
indiretamente por métodos comparativos adequado dos experimentos propostos, esses
ortogonais.2) e proporcionalidade. protocolos foram testados usando vários sistemas de
Utilizando o documento ISO Cell Counting citometria de imagem da Nexcelom Bioscience LLC.
Standard Parte 2, identificamos vários parâmetros- (Lawrence, MA).
chave que podem avaliar rápida e suficientemente o
desempenho dos métodos de contagem de células[
17,18]. Neste trabalho, vamos nos concentrar em um
2.Determine quais valores do viés e LoA são tumor ou tecido são tipicamente usadas. Além disso, as
Um número maior de medições pareadas demonstrado usando linhas de células CHO-S e Jurkat
pode reduzir as incertezas do viés e do LoA, fluorescentemente coradas com laranja de acridina e
por exemplo, o intervalo de confiança do viés um corante nuclear verde. Dois sistemas de contagem
pesquisadores devem determinar a precisão Throughput Cell Counter (Cellaca MX) e o Celigo Image
medições pareadas de acordo – sugerimos Contagem de células ISO Parte 2 exige que os
ponto de partida. Finalmente, é possível que pipetagem para a integridade da diluição para
concentração celular. Nesse caso, o viés e o Aqui, realizamos uma pré-avaliação de erro de
LoA obtidos para todo o grupo de dados pipetagem, que não será descrita neste protocolo.
mais estreita de concentrações. Pode ser útil experimento, a fim de evitar desvios na concentração
as células Jurkat e CHO utilizadas neste trabalho cuidadosamente misturados para garantir a
foram previamente testadas e não apresentaram homogeneidade antes que as porções sejam tomadas
tendências perceptíveis(Figura Complementar 1). para medição com cada método de contagem de
O experimento de diluição consiste em uma células. As medições devem ser feitas com o mínimo
série de concentração de 6 pontos dos tipos de de atraso entre elas, simultaneamente, se possível. Se
células-alvo, onde cada concentração é produzida o experimento descrito acima for realizado com os
independentemente a partir do estoque original mesmos tubos de células usando ambos os métodos
(em vez das outras diluições) para reduzir a ao mesmo tempo, a análise de Bland-Altman pode ser
propagação do erro de diluição que pode afetar a realizada com os dados resultantes. Se desejado,
proporcionalidade. A série de diluição deve intervalos de confiança mais estreitos no viés
abranger o intervalo de concentração típico das calculado ou menos incerteza nos limites de
amostras de células-alvo para avaliar o concordância podem ser obtidos complementando os
desempenho do método de contagem de células dados com mais amostras. As concentrações que
no intervalo especificado. abrangem o intervalo de concentração selecionado
Três amostras replicadas são geradas por devem ser representadas aproximadamente
concentração e cada amostra replicada é igualmente nas amostras usadas.
medida 4 vezes por método de contagem de
células para que cada método forneça um total
de 12 medições por concentração e um total de
EXPERIÊNCIA NECESSÁRIA PARA
72 medições em uma série de concentração de
6 pontos. As medições são usadas para calcular
IMPLEMENTAR O PROTOCOLO
o coeficiente de determinação (R2), precisão Em geral, a experiência necessária para implementar a
(repetibilidade – Coeficiente de Variação, CV) e avaliação de desempenho do método de contagem de
índice de proporcionalidade (PI) para cada células é o treinamento adequado por um usuário
método de contagem de células. É importante experiente na operação dos sistemas de contagem de
notar que as células Jurkat e CHO testadas células. Além disso, os usuários devem ser treinados na
foram coradas com laranja de acridina e corante preparação de amostras para garantir um desempenho
Verde Nuclear para medir apenas a consistente das etapas de diluição, amostragem e
concentração celular total neste trabalho. coloração do processo de contagem de células.
Para comparação de desempenho entre dois
métodos de contagem de células, o método de Bland-
Altman é aplicado. Como a medição de
proporcionalidade, os resultados da comparação são
LIMITAÇÕES
válidos apenas para o uso pretendido dos métodos A precisão é um dos parâmetros mais críticos para
específicos (tipo de célula, tipo de ensaio, a validação de um método analítico, no entanto,
instrumentos exatos, etc.) e apenas para a faixa de não pode ser aplicada diretamente à maioria dos
concentrações de células incluídas no teste. Portanto, métodos de contagem de células. Uma vez que
é vital definir primeiro os métodos exatos, as existem padrões de referência de células vivas
condições de teste e a faixa de concentrações de limitados, é um desafio avaliar a precisão de um
células sobre as quais a comparação é desejada. Para método de contagem de células. Portanto, a
obter resultados mais precisos, a análise de Bland- proporcionalidade é um parâmetro alternativo
Altman deve incluir o maior número possível de para avaliar a precisão em relação à fração de
medições, abrangendo as fontes de variação diluição, que serve como controle interno, além de
esperadas para a operação normal do método de utilizar métodos ortogonais para comparação.
contagem de células, como operadores múltiplos, Deve-se reconhecer que R2os valores calculados
lotes de reagentes e frascos de cultura de células. em uma faixa de concentrações são fortemente
Cada ponto no gráfico de Bland-Altman é obtido dependentes da faixa escolhida. Uma gama maior
usando ambos os métodos de contagem de células de dados lineares resulta em um R2
para medir uma única amostra. A amostra deve ser valor mais próximo de 1. Se a comparação entre R2
valores devem ser tentados, é importante que o f Solução de coloração ViaStain™ AOPI (AOPI,
intervalo para os dois cálculos seja o mesmo. Além Nexcelom Bioscience, CS2-0106-5mL)
disso, deve-se notar que o índice de f Solução de coloração ViaStain™ AO (AO,
proporcionalidade aqui definido não é normalizado
Nexcelom Bioscience, CS2-0108-5mL)
para o número de frações de diluição e o número
de réplicas biológicas por fração de diluição. É
f ViaStain™ Total Cell Nuclear Green
de Contagem de Células
f Pipetas sorológicas 5 mL, 10 mL, 25 mL (USA para a concentração correta antes da coloração em 1:1
Scientific, nº 1075-0110, nº 1071-0810, com as células.
nº 1072-5410)
for aberta, clique no botão 'Import' e selecione calcule a proporção de células para novos
o perfil da placa para a placa Cellaca 12 × 2. meios necessários para atingir uma
PROCEDIMENTO
12.Coloque o balão passado de volta no agitador de
Manutenção de células CHO-S
placa dentro da incubadora de 8% de
2
CO a 37°C.
suspensão homogênea de células no frasco T-75. 15.Aqueça o meio de cultura de células Jurkat a
37 ° C por 15 min na incubadora ou em
banho-maria a 37 ° C por 5 min antes da
4.Remova 200 µ l de células do frasco T-75 e transfira
passagem.
para um microtubo de 1,5 mL antes que as células
Wipe.
superior e inferior e coloque o slide em um 31.Aspire a mistura de células e AOPI para cima e
uma câmara no slide de contagem de células. Spectrum e conte as células coradas para gerar
CHO-S e Jurkat.
22.Medir a concentração celular e
viabilidade. a.Diminua a concentração por diluição em
meio celular.
23.Com base na concentração medida,
calcule a proporção de células para novos b.Aumente a concentração por
meios necessários para atingir uma centrifugação e ressuspenda em
concentração de 2 × 105células/mL. meio celular.
24.Remova o volume celular calculado do frasco e 35.Repita as etapas 28–33 para garantir que a
substitua por uma quantidade apropriada de concentração seja ajustada para ~5 × 106células/
cultura de células, 5 min para contagem de células e CRÍTICO:Sob a orientação da ISO Cell Counting
fFIGURA 1
Preparação de amostras de células e diagrama do processo de medição.
Sequência do procedimento da esquerda para a direita:(1)Colete sua amostra de células-alvo e prepare diferentes concentrações com frações de diluição específicas
usando mídia celular.(2)Repita este processo para gerar 3 réplicas para cada fração de diluição.(3)Rotule cada tubo em ordem aleatória de 1 a 18.(4)Prepare e meça
cada tubo 4 vezes com cada método de contagem de células selecionado.(5)Analise as imagens com cada método de contagem de células para gerar resultados de
contagem de células.(6)Utilize os resultados da contagem de células para gerar o índice de proporcionalidade (PI), coeficiente de variação (CV) e coeficiente de
determinação (R2).
40.Pipete 84 µl de amostra de células CHO-S ou amostra mista 1:1. Após esta etapa,
fMESA 2
Mapa da placa Cellaca para amostras de células em diferentes DFs.
Placa 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0
Placa 2
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0
Placa 3
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0
1.0) nos poços de carregamento restantes na Aquisição e análise de imagens para cada
1ª placa Cellaca MX, seguindo o mapa da método de contagem de células
placa mostrado abaixo. Após esta etapa, a 1ª
placa Cellaca MX é preparada(Mesa 2). Tempo: O escaneamento e a análise são de 6 minutos
por placa para o Cellaca MX e de 5 a 10 minutos por
placa para o Celigo.
a.Randomize as Etapas 46–48, se aplicável. Isso é
49.Repita os passos 45–48 para a 2ª e 3ª células coradas com Nuclear Green, aumente o tempo
para minimizar o intervalo de tempo entre a contar células no campo claro Cellaca MX
50.Repita as etapas 36–49 e tinga com 120 µL de 54.Transfira a 1ª placa Cellaca MX para o Celigo.
com o método A (Cellaca MX) de um número podem ser estimadas por concentrações médias
total denreplicar medições para a amostra i sob a suposição de uma distribuição quase-Poisson
ai
com o método A (Cellaca MX) para a fração de valores previstos das concentrações médias até que
[4]
médias
[6]
12
[11] , onde N é o
68.Aplique o método de Bland-Altman para número de amostras (para amostras pareadas,
comparar o desempenho entre dois métodos réplicas não pareadas, ou seja, para cada
de contagem de células. amostra, diferentes réplicas são medidas com
cada método).
69.Utilizamos um aplicativo de software
desenvolvido internamente derivado do
[12] , onde N é o
padrão de contagem de células ISO Parte 2 e
número total de medições repetidas (para amostras
método comparativo de Bland-Altman para
emparelhadas com réplicas emparelhadas, ou seja,
calcular automaticamente o coeficiente de
para cada amostra, as mesmas réplicas são medidas
determinação, precisão, parâmetros do índice
usando ambos os métodos).
de proporcionalidade, bem como os
parâmetros de análise de Bland-Altman (bias, 72.Calcule o LoA multiplicando 1,96 pela média das
LoA, o IC do viés). diferenças percentuais determinadas na etapa
70 usandoEquação 13ou 14.LoA é definido como
o intervalo de confiança unilateral de 95% para
Método comparativo de Bland-Altman: uma única amostra.
cálculo de dados
[13]
Tempo: ~ 30 min para analisar e plotar os dados de
comparação Bland-Altman para uma linha celular e
uma mancha.
[9] , ondexé a
eu
amostra onde N é o número total de medições
média dada por replicadas (amostras pareadas, replicações
não pareadas).
a.Se as mediçõesMeMda
Ar
replicação
Bir
r
são pareados, calcule a diferença 73.Calcule o IC do viés usandoEquação 15.
percentualYentre a medição
ir
M
adquirido com oaimétodo
r
Aea
mediçãoM adquirida com o [15] , onde N é o número
Bir
medições replicadas (se ambas as amostras para ajustar a concentração da amostra de células, se
1.Etapa 1–26, manutenção de células CHO-S e Jurkat: determinação e o índice de proporcionalidade podem
20–30 min para passagem das células e medição ser calculados via análise de regressão.Figura 3mostra
fTABELA 3
Tabela de solução de problemas.
Calibração do instrumento fCertifique-se de que ambos os instrumentos estejam bem calibrados e os dados
os parâmetros de aquisição e análise são otimizados antes do
uso.
e desvio padrão do viés entre Cellaca MX e células alvo e soluções de coloração é mostrado emTabela
Celigo são mostrados emTabela 6. Um viés de ~ 7. Os vieses de concentração são -2–6% para os métodos
-1,5% (n = 72 medições replicadas) indica que a de contagem de células pareadas nessas quatro contagens
fFIGURA 2
Resultados da contagem de células para (a) concentrações médias e (b) CV agrupado de séries de concentração de 6 pontos de células Jurkat coradas com AO.
As concentrações médias e os valores de CV medidos por Cellaca MX e Celigo foram altamente comparáveis em cada fração de diluição. É claro que, à medida que a concentração
diminui, o CV combinado aumenta, provavelmente devido ao ruído de Poisson (erro aleatório) em concentrações mais baixas.
métodos. Como cada combinação de mancha apresentados aqui estão na faixa esperada da
de célula foi tratada independentemente, os qualidade da medição de contagem de células.
resultados não foram combinados e a taxa de O Padrão de Contagem de Células ISO Parte 2
descoberta falsa (FDR) ou a taxa de erro familiar permite que pesquisadores de terapia genética e
(FWER) não foram calculadas. No geral, celular conduzam experimentos para avaliar e
realizamos vários experimentos práticos comparar a qualidade dos processos de medição
seguindo o Padrão ISO de Contagem de Células de contagem de células. Nesta aplicação prática da
Parte 2 com Celigo e Cellaca MX, e os resultados norma, demonstramos a avaliação
fTABELA 4
Concentração média calculada e CV agrupado para cada fração de diluição usando o Padrão de
Contagem de Células ISO Parte 2.
fFIGURA 3
Ajuste de regressão linear da série de concentração de 6 pontos em função das frações de diluição
(DFs), que mostra a distribuição das medições de concentração para Cellaca MX e Celigo em cada
fração de diluição.
da Cellaca MX e Celigo usando células também devem ser avaliados para estender os
Jurkat e CHO adaptadas às comunidades resultados do estudo a processos de medição
de bioprocessamento e terapia celular. semelhantes.
Os usuários do Padrão ISO de Contagem
de Células Parte 2 podem utilizar o
protocolo para avaliar um ou mais
métodos de contagem de células. Para a
PERGUNTAS FREQUENTES
avaliação de um método, pode-se 1. Podemos reduzir o número de
realizar experimentos para estabelecer amostras e medições replicadas?
uma linha de base para cada um dos a.Sim, até certo ponto; o desenho
parâmetros de qualidade, onde esta experimental mínimo recomendado
linha de base pode ser monitorada consiste em pelo menos 4 frações de
posteriormente com diferentes diluição alvo, 3 amostras replicadas e
operadores, instrumentos, processos, 3 medições replicadas.
etc. Para comparação de métodos de
b.Indicadores de qualidade de projetos
contagem de células, os parâmetros de
experimentais que não atendem a esses
qualidade podem ser comparados por
recomendações devem ser interpretadas
meio de análise bootstrap ou estudos
com cautela e podem exigir
replicados, e a diferença ou viés entre os
estudos adicionais para avaliar adequadamente a
métodos pode ser determinada usando a
proporcionalidade e precisão.
análise comparativa de Bland-Altman.
fFIGURA 4
Comparação do R2ePIvalores entre Cellaca MX e Celigo. o R2ePIos valores são altamente
comparáveis.
c.Por exemplo, se um projeto experimental a.Deve ser adequado para a faixa típica de
tiver apenas 2 medições replicadas, a concentrações de células que você
avaliação do CV diretamente desse projeto pretende avaliar para o seu tipo de célula.
experimental e a análise estatística podem
3.Devemos verificar os pipetadores?
não ser apropriadas,
no entanto, a avaliação da proporcionalidade a.Sempre use pipetas calibradas
amostras e/ou menos frações de diluição c.A ISO 20391-2 também sugere uma
pode ser conduzido para abordar mais abordagem para gerar diluição medida
diretamente a precisão do método. frações, onde a massa de solução pipetada
durante a geração das frações é usada para
fFIGURA 5
Gráfico de Bland-Altman entre os métodos de contagem de células Cellaca MX e Celigo.
As diferenças percentuais calculadas mostram uma tendência crescente à medida que a concentração aumenta.
fTABELA 6
Resultados da análise comparativa de Bland-Altman entre Cellaca MX e Celigo.
fTABELA 7
Tabela de resumo da avaliação de desempenho de contagem de células e resultados de comparação.
cv cv viés de preconceito
faixa faixa
(%) (%)
Jurkat Nuclear 0,998 3,8% para 0,30 0,997 3,7% para 0,37 3,4% - 6,0% 2,3% Y
verde 6,1% 7,4% para para
12,8% 4,5%
Jurkat AO 0,997 2,2% para 0,44 0,997 1,8% para 0,42 - 1,5% - 6,9% - 2,1% Y
7,5% 7,6% para 3,9% para
- 0,8%
CHO Nuclear 0,998 3,4% para 0,40 0,999 2,7% para 0,35 5,6% - 3,4% 4,5% Y
verde 5,8% 6,8% para para
14,6% 6,7%
CHO AO 0,998 2,7% para 0,44 0,996 2,7% para 0,35 5,1% - 2,4% 4,2% Y
7,0% 6,4% para para
12,5% 5,9%
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Contribuições:Leo Li-Ying Chan e Jean Qiu conceberam o estudo e o projeto experimental. Dmitry Kuksin realizou a cultura celular e forneceu as
células Jurkat e CHO-S para a experimentação. Jordan Bell e Yongyang Huang desenvolveram um aplicativo de software para os parâmetros da Parte
II dos Padrões de Contagem de Células ISO e o método de análise Bland-Altman. Yongyang Huang conduziu experimentos de comparação e avaliação
de desempenho do método de contagem de células. Sumona Sarkar e Laura T Pierce contribuíram para o desenvolvimento da padronização da
contagem de células, da qual este protocolo foi derivado. David Newton contribuiu para o desenvolvimento e descrição da análise estatística. Leo Li-
Ying Chan, Yongyang Huang, Jordan Bell, Sumona Sarkar e Laura T Pierce escreveram o manuscrito.
Reconhecimentos:Os autores gostariam de agradecer a Pauline N. Mitchell por fornecer a obra de arte do diagrama do processo de medição e
preparação de amostras Cell.
Divulgação e potenciais conflitos de interesse:Yongyang Huang, Jordan Bell, Dmitry Kuksin, Jean Qiu e Leo Li-Ying Chan declaram interesses
conflitantes. A aplicação da avaliação e comparação do desempenho do método de contagem de células empregou sistemas de contagem de células
e reagentes da Nexcelom Bioscience LLC.
Isenção de responsabilidade de direitos autorais do NIST:Contribuição oficial do Instituto Nacional de Normalização e Tecnologia; não está sujeito a direitos autorais nos
Estados Unidos.
Isenção de responsabilidade do produto comercial do NIST:Certos equipamentos, instrumentos ou materiais comerciais são identificados neste
trabalho para especificar o procedimento experimental adequadamente. Tal identificação não pretende implicar recomendação ou endosso pelo
Instituto Nacional de Padrões e Tecnologia, nem pretende implicar que os materiais ou equipamentos identificados sejam necessariamente os
melhores disponíveis para o efeito.
Declaração de financiamento:Os autores não receberam nenhum apoio financeiro para a pesquisa, autoria e/ou publicação deste artigo.
Direito autoral:Publicado por Cell and Gene Therapy Insights sob Creative Commons License Deed CC BY NC ND 4.0, que permite a qualquer pessoa
copiar, distribuir e transmitir o artigo, desde que devidamente atribuído da maneira especificada abaixo. Sem uso comercial sem permissão.
Atribuição:Copyright © 2021 Nexcelom Bioscience. Publicado por Cell and Gene Therapy Insights sob Creative Commons License Deed CC
BY NC ND 4.0.
Enviado para revisão por pares:2 de julho de 2021;Manuscrito revisado recebido:19 de agosto de 2021;Data de publicação:15 de setembro de 2021.