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TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

PERCEPÇÃO INOVADORA

Aplicação prática da avaliação e


comparação do desempenho do
método de contagem de células
derivadas dos Padrões ISO de
Contagem de Células Parte 1 e 2
Yongyang Huang, Jordan Bell, Dmitry Kuksin, Sumona Sarkar,
Laura T Pierce, David Newton, Jean Qiu e Leo Li-Ying Chan

O aumento da utilização de células na biofabricação e como produtos terapêuticos na última década


levou ao desenvolvimento e publicação de dois padrões ISO de contagem de células, ISO 20391 – 1:2018 e
ISO 20391 – 2:2019 para fornecer orientação sobre os princípios gerais relacionados à célula contagem e
estabelecer uma abordagem para avaliar a qualidade dos métodos de contagem de células. Neste
trabalho, demonstramos a implementação prática do protocolo experimental descrito na ISO Cell
Counting Standard Parte 2 e uma análise comparativa de Bland-Altman para avaliar o desempenho e
comparação dos métodos de contagem de células. Comparamos dois tipos de células, dois instrumentos
de citometria de imagem e duas manchas fluorescentes, calculando a precisão, coeficiente de
determinação (R2) e um índice de proporcionalidade (PI) para avaliar o desempenho do método de
contagem de células. Além disso, os resultados da contagem de células são comparados diretamente
para avaliar o viés entre dois métodos de contagem de células. O protocolo é adequado para avaliar e
comparar o desempenho de vários métodos de contagem de células para selecionar ensaios a jusante.

Informações sobre terapia celular e genética2021; 7(9), 937–960

DOI: 10.18609/cgti.2021.126

www.insights.bio
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TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

INTRODUÇÃO e melhorar a qualidade das medições de


contagem de células:
Na última década, as terapias celulares e genéticas
1.Determinar o uso pretendido do resultado da contagem de
melhoraram drasticamente sua eficácia e se
células (por exemplo, contagem de células para
tornaram peças essenciais no tratamento do
normalização de bioensaios, dosagem de terapia
câncer.[1,2]. Com a aprovação de duas terapias de
celular, digestão pós-tumoral para análise de
células T do receptor de antígeno quimérico (CAR)
transcriptoma baseada em célula única, processamento
pela Food and Drug Administration (FDA) dos EUA
de tecido de camundongo para ensaios de
em 2017, o número de estudos clínicos e testes em
citotoxicidade ou isolamento de PBMCs humanos para
novos e inovadores produtos de terapia celular
análise de imunofenotipagem, etc)
também aumentou.[3–5]. Normalmente, as terapias
celulares requerem modificação genética das 2.Investigue para entender a composição da amostra
células imunes (ou seja, células T, células NK) celular (por exemplo, vários tipos de células, restos
coletadas de pacientes, expansão da cultura e de partículas, impurezas químicas e meio de
reintrodução dos produtos finais nos pacientes. suspensão), bem como as aparências morfológicas
Portanto, é fundamental fornecer contagem das células sob microscopia
celular precisa para a administração de dosagens
3.Entenda os princípios do ensaio e selecione o ensaio de
adequadas, o que pode levar à ineficácia ou induzir
contagem de células apropriado, como contagem de
respostas autoimunes indesejadas em pacientes
células totais, vivas e mortas, viabilidade ou análise de
submetidos a tratamentos terapêuticos.[6–8].
população celular

No 21st Century Cures Act, o Congresso dos 4.Investigue os recursos e selecione os sistemas de

Estados Unidos também reconheceu a importância da contagem de células apropriados, onde o sistema

padronização para simplificar o desenvolvimento, consiste em reagentes, consumíveis, instrumentos

garantia de qualidade e facilitar a aprovação e algoritmos de software, bem como critérios de

regulatória de produtos de terapia genética e celular[ desempenho do ensaio (ou seja, precisão, faixa,

9]. No workshop “Synergizing Efforts in Standards linearidade, etc.)

Development for Cellular Therapies and Regenerative


5.Trate cada método de contagem de células como um
Medicine Products” realizado pela FDA em 31 de
processo completo, incluindo amostragem, diluição e
março de 2014, a contagem de células e a garantia de
coloração, que são essenciais para a preparação
medição de viabilidade foram identificadas como
adequada da amostra
oportunidades para o desenvolvimento de padrões[
6.Forneça treinamento contínuo ao operador, a fim de
10,11]. Desde então, a ISO publicou dois padrões de
garantir resultados consistentes de contagem de
contagem de células, “ISO 20391-1:2018
células
Biotechnology – Cell Counting
– Parte 1: Orientação geral sobre métodos de Percebe-se também que as necessidades de

contagem de células” e “ISO 20391-2:2019 contagem de células para terapias celulares e gênicas

Biotecnologia – Contagem de células – Parte 2: Projeto são amplas devido a uma ampla gama de tipos de

experimental e análise estatística para quantificar o amostras biológicas com várias formulações e etapas

desempenho do método de contagem”, que podem de bioprocessamento, que são complexas, dinâmicas

servir de orientação para pesquisadores que e heterogêneas. Como atualmente não há materiais

trabalham na área de imunoterapia e terapia celular de referência para células vivas de mamíferos que

adotiva, onde ambas exigem medições de contagem sejam certificados para concentração celular, o

de células robustas e de alta qualidade para produtos parâmetro de precisão descrito na Diretriz Tripartida

biológicos e celulares[12,13]. Harmonizada ICH – Validação de Procedimentos

Derivado dos conceitos gerais descritos na Parte 1 Analíticos: Texto e Metodologia Q2 (R1) não pode ser

do Padrão de Contagem de Células ISO, propomos 6 prontamente aplicado, aumentando assim o desafio e

fatores-chave que podem fornecer orientação sobre a dificuldade de validar a precisão da contagem de

seleção de métodos de contagem de células células[14–16].

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PERCEPÇÃO INOVADORA

Portanto, os padrões de contagem de células ISO podem propriedade de qualquer método de contagem de
servir como uma ferramenta valiosa para avaliar e células, e qualquer desvio da proporcionalidade
selecionar métodos de contagem de células adequados indicaria um erro sistemático ou não sistemático,
para o propósito, a fim de aumentar a confiança nos resultando em perda de precisão da medição. Para
resultados da contagem de células. avaliar mais diretamente o desvio sistemático da
proporcionalidade, que é um indicador de perda de
precisão, oPIé calculado ajustando um modelo
proporcional aos dados da série de diluição e, em
DESENVOLVIMENTO DO seguida, resumindo os resíduos com base nos dados
PROTOCOLO
suavizados, reduzindo assim a influência da variação
Empregamos a orientação da ISO 20391 – aleatória na avaliação da proporcionalidade[17].
2:2019 Biotecnologia – Contagem de Existem várias abordagens para calcularPI, onde
células – Parte 2 e utilizamos informações algunsPIas métricas podem ser mais relevantes com
do ICH Q2 (R1) para desenvolver um base na necessidade de adequação ao propósito do
protocolo apropriado para avaliar o método de contagem de células. Algumas métricas
desempenho de métodos de contagem de penalizam mais os valores discrepantes, enquanto
células selecionados. O documento de outras pesam os erros uniformemente nas diluições
orientação ICH Q2 (R1) apresenta vários ou permitem mais contribuições por concentrações de
parâmetros para a validação de métodos células mais altas. Neste trabalho, utilizamos oPI
analíticos, como robustez, linearidade, modelo publicado anteriormente do Instituto Nacional
faixa de detecção, limites de detecção de Padrões e Tecnologia (NIST)[17]. Deve-se notar que
(LOD), limites de quantificação (LOQ), as fontes de erro sistemático que são proporcionais à
precisão (repetibilidade, precisão diluição da amostra não serão detectadas com esta
intermediária, reprodutibilidade) , e abordagem. Por exemplo, se os detritos forem
precisão. É importante observar que, como misturados com a suspensão de células e falsamente
não há material de referência para identificados como células, a concentração de células
fornecer um valor de referência para a e detritos seria reduzida proporcionalmente com a
concentração celular, a avaliação do diluição, e as falsas contagens não afetariam a
parâmetro de precisão precisa ser avaliada proporcionalidade. A fim de demonstrar o uso
indiretamente por métodos comparativos adequado dos experimentos propostos, esses
ortogonais.2) e proporcionalidade. protocolos foram testados usando vários sistemas de
Utilizando o documento ISO Cell Counting citometria de imagem da Nexcelom Bioscience LLC.
Standard Parte 2, identificamos vários parâmetros- (Lawrence, MA).
chave que podem avaliar rápida e suficientemente o
desempenho dos métodos de contagem de células[
17,18]. Neste trabalho, vamos nos concentrar em um

protocolo experimental derivado do Padrão ISO de


MÉTODO DE ANÁLISE COMPARATIVA
Contagem de Células Parte 2, que avalia o coeficiente
DE BLAND-ALTMAN
de determinação (R2
valor), precisão (repetibilidade – coeficiente de variação Métodos de análise comparativa podem ser
[CV]) e índice de proporcionalidade (PI) de um método de empregados para comparar o desempenho de
contagem de células. O índice de proporcionalidade é uma diferentes métodos de contagem de células.
métrica introduzida na Parte 2 do Padrão de Contagem de Embora a falta de material de referência impeça
Células ISO que quantifica o grau em que um método de a medição direta da precisão da contagem de
contagem de células está em conformidade com o células, a comparação de métodos ortogonais
princípio da proporcionalidade, onde se espera que as pode servir como uma alternativa viável. Muitas
contagens de células aumentem proporcionalmente com vezes também é desejável determinar o quanto
a diluição. O princípio da proporcionalidade é os resultados de um método irão concordar
fundamental com outro, como quando um instrumento é

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


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TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

atualizado depois de muitos anos no entre os dois métodos. No entanto, quando as


laboratório. Um método útil é a construção de medições de muitas amostras são calculadas,
um gráfico de diferenças médias de Tukey, um viés – mesmo que leve – pode se tornar
também conhecido como gráfico de Bland- claro. O viés pode ser interpretado como um
Altman.[20–22]. A análise de Bland-Altman método medindo maior ou menor do que outro
resulta no cálculo de um viés (com intervalo de em média, embora a diferença entre os
confiança correspondente) entre dois métodos, métodos ao medir uma única amostra possa
indicando qual método conta mais alto ou mais variar amplamente.
baixo em média e quanto. A análise também Os limites de concordância descrevem
fornece uma estimativa de quão bem os dois quão amplamente essas diferenças podem
métodos devem concordar para uma única variar. Quando adicionado e subtraído do
amostra. Aqui, modificamos o projeto viés, o LoA define um intervalo dentro do
experimental da série de diluição descrito no qual se espera encontrar a diferença entre as
documento ISO Cell Counting Standard Parte 2 medições de dois métodos de uma única
para coletar dados apropriados para uma amostra. Neste protocolo, usamos os limites
análise de Bland-Altman, ao mesmo tempo em de concordância que se aproximam de um
que atendemos aos requisitos de padrões para intervalo de confiança de 95% (1,96 × desvios
calcular CV, R2, ePI. padrão) para uma distribuição normal. Esta é
Normalmente, os gráficos de Bland-Altman uma aproximação suficiente para nossos
consistem em diferenças absolutas entre duas propósitos e tamanho de amostra de 72
medições plotadas contra sua média. No caso da medições. Se menos medições forem
contagem de células, a variância não é constante para adquiridas, intervalos de confiança
diferentes concentrações, mas geralmente é calculados a partir da distribuição t
proporcional ao número de células contadas[17]. Para apropriada (em vez da distribuição Normal)
que a análise de Bland-Altman seja útil em tal são recomendados. Se as diferenças
aplicação, os dados podem ser transformados para percentuais entre os resultados dos dois
atingir uma variância aproximadamente constante em métodos seguirem uma distribuição normal,
uma faixa de concentrações. Neste protocolo, usamos podemos esperar que 95% das diferenças
diferenças percentuais em vez de diferenças absolutas caiam dentro de um LoA do valor do viés. Na
para obter uma variância mais uniforme. realidade,[23]. Se for necessário mais rigor
O método de análise de Bland-Altman produz estatístico, podem ser aplicados testes de
três métricas de comparação: normalidade e os intervalos de confiança
podem ser calculados com mais precisão[24].
1.O viés entre dois métodos, que é a média
Dependendo da variação observada entre
das diferenças.
amostras em relação à variação entre
2.Os limites de concordância (LoA), que são medições replicadas de cada amostra, pode
um múltiplo do desvio padrão das ser útil incluir termos de efeitos aleatórios
diferenças. normalmente incluídos na análise de
3.O intervalo de confiança (CI) do viés, que é experimentos hierárquicos. Neste trabalho,
um múltiplo do erro padrão da média das não nos preocupamos com a variação
diferenças. amostra a amostra nos experimentos
propostos.
O viés descreve a diferença média entre os O intervalo de confiança do viés fornece a
resultados de medição obtidos por meio dos incerteza aproximada para o valor do viés
dois métodos. Devido à variação biológica nas calculado e sugere uma faixa dentro da qual o
amostras e à variabilidade no processo de verdadeiro valor do viés entre os dois métodos
medição para ambos os métodos, é impossível de contagem de células provavelmente será
prever exatamente o quanto a medição de encontrado. Ao contrário do LoA, esse intervalo
qualquer amostra individual será diferente de confiança se estreita com um aumento

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PERCEPÇÃO INOVADORA

número de amostras medidas. Se o intervalo de APLICAÇÕES DO MÉTODO


confiança de 95% for maior do que o valor absoluto do
Os protocolos de comparação e avaliação de desempenho
viés (ou seja, o IC coloca o valor 0 entre os colchetes),
do método de contagem de células podem ser aplicados
a comparação do método não demonstrou um viés
em pesquisas, desenvolvimento de métodos analíticos,
estatisticamente significativo entre os dois métodos
desenvolvimento de processos e ensaios pré-clínicos ou
(em nível de significância α = 0,05). Com amostras
clínicos. Além disso, o método pode ser aplicado a uma
suficientes, mesmo um viés muito leve pode ser
infinidade de campos de pesquisa que requerem o uso de
medido com confiança. Um leve viés geralmente é
células, como terapia celular e gênica, imuno-oncologia e
insignificante em comparação com a variação da
imunoterapia, desenvolvimento de linha celular e
amostra. Os pesquisadores devem considerar como
produção de produtos biológicos, virologia e doenças
uma contagem de células está sendo usada para
infecciosas, medicina regenerativa, toxicologia, alimentos
determinar os níveis aceitáveis de viés em seu caso.
ciência e até energia renovável. A qualidade dos

resultados da contagem de células é crítica para uma


Antes de prosseguir com a análise comparativa de
ampla gama de tipos de células usadas nos campos de
Bland-Altman para contagem de células, os
pesquisa mencionados acima. Esses tipos de células
pesquisadores devem:
podem incluir células primárias, como sangue total
1.Determine a faixa de valores de concentração
humano ou de camundongo, sangue do cordão umbilical,
celular para a qual a comparação entre os dois
aspirado de medula óssea, tecido adiposo, hepatócitos,
métodos é desejada;
PBMCs, amostra de leucaférese, plaquetas, Digestões de

2.Determine quais valores do viés e LoA são tumor ou tecido são tipicamente usadas. Além disso, as

aceitáveis para sua aplicação, células de bactérias e leveduras são frequentemente

usadas para gerar produtos biológicos ou para a


3.Selecione amostras de células que sejam
produção de bebidas.
representativas da população para a qual a
comparação é desejada e o intervalo
determinado na etapa 1; e
DESIGN EXPERIMENTAL
4.Meça cada amostra usando os diferentes
métodos de contagem de células, tomando A avaliação de desempenho do método de contagem
cuidado para que a amostra não mude entre de células aqui proposta consiste em um experimento
as medições (atraso mínimo entre as de diluição em série e análise comparativa para
medições, mistura adequada, etc.)[25]. múltiplos métodos. O projeto experimental é

Um número maior de medições pareadas demonstrado usando linhas de células CHO-S e Jurkat

pode reduzir as incertezas do viés e do LoA, fluorescentemente coradas com laranja de acridina e

por exemplo, o intervalo de confiança do viés um corante nuclear verde. Dois sistemas de contagem

diminui com mais medições. Os de células são comparados: o Cellaca MX High-

pesquisadores devem determinar a precisão Throughput Cell Counter (Cellaca MX) e o Celigo Image

necessária e aumentar o número de Cytometer (Celigo). É importante observar que a

medições pareadas de acordo – sugerimos Contagem de células ISO Parte 2 exige que os

um mínimo de 20 medições pareadas como usuários avaliem as contribuições dos erros de

ponto de partida. Finalmente, é possível que pipetagem para a integridade da diluição para

o viés ou a variação variem com a estabelecer a confiança na diluição e na amostragem.

concentração celular. Nesse caso, o viés e o Aqui, realizamos uma pré-avaliação de erro de

LoA obtidos para todo o grupo de dados pipetagem, que não será descrita neste protocolo.

podem não ser representativos de como os Também é importante investigar a estabilidade da

dois métodos se comparam em uma faixa amostra de células-alvo antes de conduzir o

mais estreita de concentrações. Pode ser útil experimento, a fim de evitar desvios na concentração

realizar análises de Bland-Altman em e viabilidade durante o período de tempo do ensaio. A

subconjuntos menores de dados. estabilidade de

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TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

as células Jurkat e CHO utilizadas neste trabalho cuidadosamente misturados para garantir a
foram previamente testadas e não apresentaram homogeneidade antes que as porções sejam tomadas
tendências perceptíveis(Figura Complementar 1). para medição com cada método de contagem de
O experimento de diluição consiste em uma células. As medições devem ser feitas com o mínimo
série de concentração de 6 pontos dos tipos de de atraso entre elas, simultaneamente, se possível. Se
células-alvo, onde cada concentração é produzida o experimento descrito acima for realizado com os
independentemente a partir do estoque original mesmos tubos de células usando ambos os métodos
(em vez das outras diluições) para reduzir a ao mesmo tempo, a análise de Bland-Altman pode ser
propagação do erro de diluição que pode afetar a realizada com os dados resultantes. Se desejado,
proporcionalidade. A série de diluição deve intervalos de confiança mais estreitos no viés
abranger o intervalo de concentração típico das calculado ou menos incerteza nos limites de
amostras de células-alvo para avaliar o concordância podem ser obtidos complementando os
desempenho do método de contagem de células dados com mais amostras. As concentrações que
no intervalo especificado. abrangem o intervalo de concentração selecionado
Três amostras replicadas são geradas por devem ser representadas aproximadamente
concentração e cada amostra replicada é igualmente nas amostras usadas.
medida 4 vezes por método de contagem de
células para que cada método forneça um total
de 12 medições por concentração e um total de
EXPERIÊNCIA NECESSÁRIA PARA
72 medições em uma série de concentração de
6 pontos. As medições são usadas para calcular
IMPLEMENTAR O PROTOCOLO
o coeficiente de determinação (R2), precisão Em geral, a experiência necessária para implementar a
(repetibilidade – Coeficiente de Variação, CV) e avaliação de desempenho do método de contagem de
índice de proporcionalidade (PI) para cada células é o treinamento adequado por um usuário
método de contagem de células. É importante experiente na operação dos sistemas de contagem de
notar que as células Jurkat e CHO testadas células. Além disso, os usuários devem ser treinados na
foram coradas com laranja de acridina e corante preparação de amostras para garantir um desempenho
Verde Nuclear para medir apenas a consistente das etapas de diluição, amostragem e
concentração celular total neste trabalho. coloração do processo de contagem de células.
Para comparação de desempenho entre dois
métodos de contagem de células, o método de Bland-
Altman é aplicado. Como a medição de
proporcionalidade, os resultados da comparação são
LIMITAÇÕES
válidos apenas para o uso pretendido dos métodos A precisão é um dos parâmetros mais críticos para
específicos (tipo de célula, tipo de ensaio, a validação de um método analítico, no entanto,
instrumentos exatos, etc.) e apenas para a faixa de não pode ser aplicada diretamente à maioria dos
concentrações de células incluídas no teste. Portanto, métodos de contagem de células. Uma vez que
é vital definir primeiro os métodos exatos, as existem padrões de referência de células vivas
condições de teste e a faixa de concentrações de limitados, é um desafio avaliar a precisão de um
células sobre as quais a comparação é desejada. Para método de contagem de células. Portanto, a
obter resultados mais precisos, a análise de Bland- proporcionalidade é um parâmetro alternativo
Altman deve incluir o maior número possível de para avaliar a precisão em relação à fração de
medições, abrangendo as fontes de variação diluição, que serve como controle interno, além de
esperadas para a operação normal do método de utilizar métodos ortogonais para comparação.
contagem de células, como operadores múltiplos, Deve-se reconhecer que R2os valores calculados
lotes de reagentes e frascos de cultura de células. em uma faixa de concentrações são fortemente
Cada ponto no gráfico de Bland-Altman é obtido dependentes da faixa escolhida. Uma gama maior
usando ambos os métodos de contagem de células de dados lineares resulta em um R2
para medir uma única amostra. A amostra deve ser valor mais próximo de 1. Se a comparação entre R2

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PERCEPÇÃO INOVADORA

valores devem ser tentados, é importante que o f Solução de coloração ViaStain™ AOPI (AOPI,
intervalo para os dois cálculos seja o mesmo. Além Nexcelom Bioscience, CS2-0106-5mL)
disso, deve-se notar que o índice de f Solução de coloração ViaStain™ AO (AO,
proporcionalidade aqui definido não é normalizado
Nexcelom Bioscience, CS2-0108-5mL)
para o número de frações de diluição e o número
de réplicas biológicas por fração de diluição. É
f ViaStain™ Total Cell Nuclear Green

necessário que o mesmo desenho experimental (Nuclear Green, Nexcelom Bioscience,

seja usado sePIdeve ser significativamente CS1-V0008-1)

comparado entre os métodos.

Outros reagentes e produtos químicos

MATERIAIS f Pó de solução salina tamponada com fosfato

(PBS) (Sigma-Aldrich, nº P38135)


Materiais de documentação
f Água HyClone™, grau de cultura celular (livre de
f ISO 20391-1:2018 Biotecnologia - Contagem de
endotoxina) (GE Health, nº SH3052903)
Células - Parte 1: Orientação Geral sobre Métodos

de Contagem de Células

f ISO 20391-2:2019 Biotecnologia - Contagem de Equipamento


Células - Parte 2: Projeto Experimental e Análise

Estatística para Quantificar o Desempenho do


f Capa de cultura de tecidos (Forma Scientific,

Método de Contagem ClassII A/B3 BSC)

f Incubadora de cultura celular (Thermo, Forma 370)

f Balanceiro de placa (Boekel, RockerII 260350)


Materiais biológicos
f Pipetador automático (Fisherbrand™ Pipet
f Linha celular de ovário de hamster chinês (CHO- Controller, #FB14955202)
S) (Gibco, nº 11619012)
f Pipetadores manuais (P10, P100, P1000)
f Jurkat, linha celular Clone E6-1 (ATCC, (VWR, 1-10UL, 10-100UL, 100-1000UL)
TIB-152™)
f Centrífuga (Eppendorf, 2702)

f Espectro do celômetro e computador

Meio de crescimento e suplementos portátil operacional (Spectrum, Nexcelom


Bioscience)
f Meio CD CHO (1X) (Gibco, nº 10743011)
f Cellaca MX Contador de células automatizado
f GlutaMAX-1 (100X) (Gibco, nº 35050061) de alto rendimento e laptop operacional, faixa

f Suplemento HT (100X) (Gibco, nº 11067030) de concentração de 1 x 105- 1 x 107células/mL


(Nexcelom Bioscience)
f RPMI Medium 1640 (1X) (Gibco,
# 11875093)
f Celigo Image Cytometer e computador de
mesa operacional (Nexcelom Bioscience)
f Soro Fetal Bovino (FBS) (Acesso,
# A19023)

f Solução Antibiótica Antimicótica (100X)


Instrumentos descartáveis
(Sigma-Aldrich, #A5955-100ML)
f T-75 cm2frasco (USA Scientific, CC7682-48)

f Tubo de centrífuga de 15 mL (Greiner Bio,


Reagentes de coloração fluorescente 188271)

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


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TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

f Pipetas sorológicas 5 mL, 10 mL, 25 mL (USA para a concentração correta antes da coloração em 1:1
Scientific, nº 1075-0110, nº 1071-0810, com as células.
nº 1072-5410)

f Pontas de pipeta (P10 e P1000) (VWR,


7320561, 83007-380) Solução de coloração ViaStain™ AO

f Pontas de pipeta (P200) (USA Scientific,


A solução de coloração de laranja de acridina (AO)
11111210)
já está preparada para a concentração correta
f Microtubos 1,5 mL (VWR, 89000028) antes da coloração 1:1 com as células.

f Microtubos 0,5 mL (CellTreat, 229440)

f Lâminas de contagem de células (Nexcelom


Solução de coloração ViaStain™ Total Cell
Bioscience, CHT4-SD100-002)
Nuclear Green
f Cellaca MX Placas de contador de células

automatizadas de alto rendimento (placas Cellaca


Prepare uma solução de coloração 2X (10 µM)

MX, Nexcelom Bioscience, CHM24-A100-001)


misturando PBS e a solução estoque Nuclear
Green a 5 mM. Pipete 10 mL de PBS em um
tubo de centrífuga de 15 mL e adicione 20 µL da
solução estoque Total Cell Nuclear Green. Feche
CONFIGURAÇÃO DO REAGENTE
o tubo de centrífuga de 15 mL e inverta 10X
Solução salina tamponada com para misturar a solução de coloração antes de
fosfato (PBS) usar.

Prepare a solução de PBS misturando 5 L de


H2O com 1 pacote de PBS em pó para gerar
CONFIGURAÇÃO DO EQUIPAMENTO
uma solução de 0,01 M PBS a pH 7,4 com
NaCl a 0,138 M e KCl a 0,0027 M. Espectro do celômetro

Conecte o Cellometer Spectrum ao laptop em


operação por meio do cabo USB e conecte o
Meio de cultura de células CHO-S
cabo de alimentação. Ligue o instrumento na
Prepare o meio CHO-S (500 mL) com o parte de trás e, em seguida, abra o software
meio CD CHO (1X) e complemente com de análise Cellometer Spectrum. No software
5 mL do GlutaMAX-1 (100X) e 5 mL do Cellometer Spectrum, selecione o tipo de
Suplemento HT (100X). ensaio padrão “AOPI Viability Assay_S5” para
contagem de células.

Meio de cultura de células Jurkat


Contador de células automatizado de
Prepare o meio Jurkat (500 mL) com o alto rendimento Cellaca™ MX
meio RPMI 1640 (1X) e complemente
com 10% FBS (50 mL) e 5 mL da solução Conecte o Cellaca MX ao computador laptop
antibiótica antimicótica (100X). operacional por meio do cabo USB e conecte
o cabo de alimentação. Ligue o instrumento
na parte de trás e abra o software de análise
Cellaca MX. No software Cellaca MX (v1.2),
Solução de coloração ViaStain™ AOPI
selecione o tipo de ensaio padrão
A solução de coloração de laranja de acridina “MX04.0_AOPI_LiveDead” para contagem de
(AO) e iodeto de propídio (PI) já está preparada células.

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PERCEPÇÃO INOVADORA

celigo®Imagem Citômetro 8.Insira a lâmina de contagem de células no


Spectrum e selecione “AOPI Viability
Ligue o Celigo na parte frontal e abra o software Assay_S5”.
de análise Celigo. Navegue para o canto
9.Medir a concentração celular e
superior direito e clique em 'Administration' e,
viabilidade.
em seguida, selecione 'Manage Plate Profiles'.
Depois que a janela “Plate Profile Management” 10.Com base na concentração medida,

for aberta, clique no botão 'Import' e selecione calcule a proporção de células para novos

o perfil da placa para a placa Cellaca 12 × 2. meios necessários para atingir uma

Retorne à tela inicial para aquisição e análise de concentração de 2 × 105células/mL.

imagens. 11.Remova o volume celular calculado do frasco e


substitua por uma quantidade apropriada de
meio de cultura de células CHO-S aquecido.

PROCEDIMENTO
12.Coloque o balão passado de volta no agitador de
Manutenção de células CHO-S
placa dentro da incubadora de 8% de
2
CO a 37°C.

Tempo: 20 – 30 min para passar as


células e medir sua concentração e 13.Monitore o crescimento das células diariamente e continue
viabilidade. a passagem conforme necessário (geralmente 3 vezes

1.Passe as células CHO-S quando estiverem entre 2 por semana).

a 4 × 106células/mL. Permitir que as células


cresçam acima dessa concentração pode
diminuir a divisão celular, bem como diminuir a
Manutenção de células Jurkat
viabilidade devido a nutrientes insuficientes no
meio. Tempo: 20–30 min para passagem das células e
2.Aqueça o meio de cultura de células CHO-S a medição de sua concentração e viabilidade.
37 ° C por 15 min na incubadora ou em 14.Passe pelas células Jurkat quando estiverem entre 1
banho-maria a 37 ° C por 5 min antes da a 2 × 106células/mL. Permitir que as células
passagem. cresçam acima dessa concentração pode diminuir

a divisão celular, bem como diminuir a viabilidade


3.Sob o gabinete de biossegurança, use uma pipeta de 10
devido a nutrientes insuficientes no meio.
mL, pipete para cima e para baixo pelo menos 10 vezes

para quebrar os aglomerados de células e criar uma

suspensão homogênea de células no frasco T-75. 15.Aqueça o meio de cultura de células Jurkat a
37 ° C por 15 min na incubadora ou em
banho-maria a 37 ° C por 5 min antes da
4.Remova 200 µ l de células do frasco T-75 e transfira
passagem.
para um microtubo de 1,5 mL antes que as células

tenham a chance de se estabelecer. 16.Sob o gabinete de biossegurança, use uma pipeta de 10

mL, pipete para cima e para baixo pelo menos 10 vezes


5.Obtenha uma lâmina de contagem de células CHT4-
para quebrar os aglomerados de células e criar uma
SD100 e retire o filme plástico protetor na parte
suspensão homogênea de células no frasco T-75.
superior e inferior e coloque a lâmina em um Kim-

Wipe.

17.Remova 200 µ l de células do frasco T-75 e transfira


6.Misture 20 µl de amostra de células CHO-S e 20 µl de
para um microtubo de 1,5 mL antes que as células
AOPI em um microtubo de 0,5 mL.
tenham a chance de se estabelecer.
7.Pipete 20 µ l de amostra de células coradas em
18.Obtenha uma lâmina de contagem de células CHT4-
uma câmara no slide de contagem de células.
SD100, retire o filme plástico protetor na

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


945
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

superior e inferior e coloque o slide em um 31.Aspire a mistura de células e AOPI para cima e

Kim-Wipe. para baixo pelo menos 5 vezes.

19.Misture 20 µl de amostra de células Jurkat e 20 µl 32.Pipete 20 µ l das células coradas em uma


de AOPI em um microtubo de 0,5 mL. câmara no slide de contagem de células.

20.Pipete 20 µ l de amostra de células coradas em 33.Insira a lâmina de contagem de células no

uma câmara no slide de contagem de células. Spectrum e conte as células coradas para gerar

contagem de células e viabilidade.


21.Insira a lâmina de contagem de células no
Spectrum e selecione “AOPI Viability 34.Ajuste a concentração da amostra da célula de

Assay_S5”. estoque para ~ 5 × 106células/mL para células

CHO-S e Jurkat.
22.Medir a concentração celular e
viabilidade. a.Diminua a concentração por diluição em
meio celular.
23.Com base na concentração medida,
calcule a proporção de células para novos b.Aumente a concentração por
meios necessários para atingir uma centrifugação e ressuspenda em
concentração de 2 × 105células/mL. meio celular.

24.Remova o volume celular calculado do frasco e 35.Repita as etapas 28–33 para garantir que a

substitua por uma quantidade apropriada de concentração seja ajustada para ~5 × 106células/

meio de cultura de células Jurkat aquecido. mL.

25.Coloque o balão passado de volta dentro da


Preparação de amostra e preparação de
incubadora
2
de 5% CO a 37 ° C.
contagem de células para avaliação e
26.Monitore o crescimento das células diariamente e continue
comparação de desempenho de métodos de
a passagem conforme necessário (geralmente 3 vezes
contagem de células
por semana).

Tempo: 15–30 min com uma única pipeta manual


para preparação da amostra. 15–20 min para
incubação de amostras de células misturadas com
Preparação de amostras de estoque de células a partir de
Nuclear Green(Figura 1). ~10 min por placa Cellaca
cultura de células
MX com uma única pipeta manual para preparação

Tempo: 15 min para coletar as células dos frascos de de contagem de células.

cultura de células, 5 min para contagem de células e CRÍTICO:Sob a orientação da ISO Cell Counting

análise de viabilidade e 10 min para ajustar a Parte 2, é necessário um experimento inicial de

concentração da amostra de células, se necessário. validação da precisão do volume de pipetagem


usando os pipetadores experimentais para
27.Colete um estoque de amostra de células CHO-S e
aumentar a confiança na amostragem. Essa
Jurkat separadamente em um tubo de 15 mL de
validação pode ser realizada com uma balança de
cultura de células seguindo técnicas assépticas.
laboratório sensível e bem calibrada e um fluido de
28.Obtenha uma lâmina de contagem de células CHT4- densidade conhecida, mas o procedimento não
SD100, retire o filme plástico protetor na parte será descrito neste protocolo. Dilua diretamente as
superior e inferior e coloque a lâmina em um Kim- células para gerar amostras de diluição
Wipe. independentes em vez de diluição em série para

29.Pipete 20 µ l da amostra de células usando um reduzir a propagação de erros de pipetagem que

pipetador P100 em um microtubo de 0,5 mL. podem afetar a proporcionalidade.

30.Pipetar 20 µL de AOPI e adicionar ao 36.Obtenha as amostras preparadas de


microtubo de 0,5 mL. células CHO-S e células Jurkat no mais alto

946 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

fFIGURA 1
Preparação de amostras de células e diagrama do processo de medição.

Sequência do procedimento da esquerda para a direita:(1)Colete sua amostra de células-alvo e prepare diferentes concentrações com frações de diluição específicas
usando mídia celular.(2)Repita este processo para gerar 3 réplicas para cada fração de diluição.(3)Rotule cada tubo em ordem aleatória de 1 a 18.(4)Prepare e meça
cada tubo 4 vezes com cada método de contagem de células selecionado.(5)Analise as imagens com cada método de contagem de células para gerar resultados de
contagem de células.(6)Utilize os resultados da contagem de células para gerar o índice de proporcionalidade (PI), coeficiente de variação (CV) e coeficiente de
determinação (R2).

concentração para o uso pretendido e 41.Pipete 60 µl de amostra de célula estoque


faixa (~ 5 × 106células/mL). CHO-S ou Jurkat no 4º microtubo e adicione
60 µl de PBS para a amostra de 0,5 DF.
37.Prepare outras amostras do estoque de amostras
42.Pipete 36 µl de amostra de célula estoque CHO-S
de células CHO-S e Jurkat em 0,1, 0,3, 0,5, 0,7,
ou Jurkat no 5º microtubo e adicione 84 µl de
0,9 e 1,0 frações de diluição (DFs)
PBS para a amostra 0,3 DF.
independentemente(Tabela 1).
a.Prepare amostras replicadas com PBS ou meio 43.Pipete 12 µl de amostra de célula estoque
de cultura celular. CHO-S ou Jurkat no 6º microtubo e adicione
108 µl de PBS para a amostra 0,1 DF.
38.Pipete 120 µl de amostra de células stock CHO-
S ou Jurkat para o 1º microtubo para a 44.Repita as etapas 38–43 mais duas vezes para gerar

amostra 1.0 DF. um total de 3 amostras replicadas em cada DF,


onde um total de 18 tubos de amostras de
39.Pipete 108 µl de amostra de célula estoque CHO- células são gerados.
S ou Jurkat no segundo microtubo e adicione 12
45.Pipete 120 µl de solução de coloração AO no 1º
µl de PBS para a amostra 0,9 DF.
microtubo de cada amostra DF para fazer uma

40.Pipete 84 µl de amostra de células CHO-S ou amostra mista 1:1. Após esta etapa,

Jurkat no terceiro microtubo e adicione 36 µl de um total de 240 µL de amostra de células é

PBS para a amostra de 0,7 DF. preparado no 1º microtubo em cada DF.

fTABELA 1 46.Inverta o microtubo 0,1 DF 10 vezes para

garantir uma mistura uniforme.


Frações de diluição e preparação dos volumes
correspondentes para amostra de células e PBS. 47.Transfira 50 µl do microtubo misto de 0,1 DF

DF Volume celular (µL) Volume de PBS (µL)


para o poço de carregamento A1 na 1ª placa

1,0 120 0 Cellaca MX. Repita a transferência mais 3


0,9 108 12 vezes para os poços de carga A2 – A4 da 1ª
0,7 84 36 placa Cellaca MX.
0,5 60 60
48.Repita a Etapa 46–47 para os primeiros
0,3 36 84
microtubos dos DFs restantes (0,3, 0,5, 0,7, 0,9 e
0,1 12 108

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


947
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

fMESA 2
Mapa da placa Cellaca para amostras de células em diferentes DFs.

Placa 1

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0
Placa 2

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0
Placa 3

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,5 0,5 0,5 0,5
B 0,7 0,7 0,7 0,7 0,9 0,9 0,9 0,9 1,0 1,0 1,0 1,0

1.0) nos poços de carregamento restantes na Aquisição e análise de imagens para cada
1ª placa Cellaca MX, seguindo o mapa da método de contagem de células
placa mostrado abaixo. Após esta etapa, a 1ª
placa Cellaca MX é preparada(Mesa 2). Tempo: O escaneamento e a análise são de 6 minutos
por placa para o Cellaca MX e de 5 a 10 minutos por
placa para o Celigo.
a.Randomize as Etapas 46–48, se aplicável. Isso é

sugerido pelo padrão ISO de contagem de 51.Carregue a 1ª placa Cellaca MX no

células, parte 2, a fim de minimizar os efeitos Cellaca MX após a preparação.

sistemáticos de dependência do tempo no 52.Selecione o tipo de ensaio padrão


índice de proporcionalidade e outras métricas “MX04.0_AOPI_LiveDead” para contagem de células no
da qualidade do processo de medição de software Cellaca MX para amostras de células coradas
contagem de células. com solução de coloração AO. Para amostras de

49.Repita os passos 45–48 para a 2ª e 3ª células coradas com Nuclear Green, aumente o tempo

amostras replicadas em diferentes DFs para de exposição FL1 em 50–100%. Verifique a

preparar as 2ª e 3ª placas Cellaca MX. intensidade fluorescente das células manchadas de

verde nuclear nas imagens de visualização antes da


a.Prepare cada placa Cellaca MX imediatamente
aquisição da imagem.
antes da aquisição da imagem, em vez de
preparar todas as placas Cellaca MX no início, 53.Use os parâmetros de análise padrão para

para minimizar o intervalo de tempo entre a contar células no campo claro Cellaca MX

preparação da amostra e a aquisição da capturado e imagens fluorescentes FL1.

imagem. Exporte os dados de concentração.

50.Repita as etapas 36–49 e tinga com 120 µL de 54.Transfira a 1ª placa Cellaca MX para o Celigo.

Nuclear Green. Selecione o perfil da placa para as placas Cellaca

MX. Use a configuração de experimento padrão


a.Incube as amostras de células coradas com verde
para aquisição e análise de imagens. Exporte as
nuclear por 15 a 20 minutos em temperatura
contagens totais de células das imagens de
ambiente. O tempo de incubação pode ser
fluorescência capturadas.
reduzido a 37 °C.
55.Repita 51–54 para a 2ª e 3ª placas Cellaca
MX.

948 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

Avaliação de desempenho do método de 63.Repita 57–62 para calcular a concentração

contagem de células médiaM,o desvio Bk


padrão combinado da
concentração σ e o CV combinado
Bk
adquirido
Tempo: ~ 30 min para calcular e analisar os com o método B (Celigo) paraDF.
parâmetros para avaliação de desempenho para k

uma linha celular e uma mancha.


64.Use concentrações médias (M,M)deaitodasBi as
56.Calcule a concentração de células usando as amostras em 6 DFs diferentes para gerar uma série
contagens totais de células dos dados de concentração para Cellaca MX e Celigo. Realize
exportados da Celigo e multiplique por um um ajuste proporcional com a série de concentração
fator de 1383,979, que é a taxa de conversão para cada método usando o modelo de mínimos
baseada no volume contado e no fator de quadrados reponderados iterativamente (IRLS).
diluição da coloração com AO e Nuclear Green. Defina os pesos dos mínimos quadrados

57.Calcular a concentração médiaM adquirida proporcionais ao recíproco das variações, que


ai

com o método A (Cellaca MX) de um número podem ser estimadas por concentrações médias

total denreplicar medições para a amostra i sob a suposição de uma distribuição quase-Poisson
ai

usandoEquação 1. de que as variações das concentrações celulares são

proporcionais às suas respectivas concentrações

médias (var= φM),onde φ é um escalar estimado a


[1] , ondeMé Ar
o
partir dos dados experimentais que se anula
ai
concentração adquirida com o método A para
quando
ai
usado na ponderação de cada termo dos
amostraeudurante a medição replicadar.
mínimos quadrados[17]. Execute novamente o

58.Calcular a concentração médiaM adquirido ajuste do modelo atualizando os pesos usando


Ak

com o método A (Cellaca MX) para a fração de valores previstos das concentrações médias até que

diluição k (DF)usandoEquação 2. o ajuste proporcional seja otimizado. Gere uma lista


k
de valores previstos de concentrações médias (
[2]

59.Calcular a variância da concentraçãovar ai


) do IRLS
adquirida com o método A (Cellaca MX) de um
modelo.
número total denreplicar
ai
medições para a
amostra i usandoEquação 3. 65.Determine o coeficiente de determinação (R2
value) do modelo IRLS para o método A
[3] (Cellaca MX) usandoEquação 7[26,27]. Use o
mesmo método para determinar o R2
60.Calcular a variância combinada de
valor para o método B (Celigo).
concentraçãovaradquirida
AK
com o método A
(Cellaca MX) paraDFusandoEquação 4.
k [7]

[4]

61.Calcule o desvio padrão combinado da


concentração σ adquirida
Ak
com o método A
(Cellaca MX) paraDFusandoEquação
k
5.
66.Realize um ajuste com a série de concentração

para cada método (Cellaca MX, Celigo) usando


[5]
um modelo polinomial de ordem superior como
62.Calcular o CV agrupado,cvadquirida
Ak
com o um modelo flexível. Defina a ordem do
método A (Cellaca MX) paraDFusando
k
a polinômio como o número de DFs menos 1. Gere
equaçãoEquação 6. uma lista de valores previstos de concentrações

médias
[6]

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


949
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

replicar r da amostra i usando o


( ) de
Equação 10.
modelo polinomial.

67.Determine o índice de proporcionalidade (PI) [10] , onde X éir o


com base na soma suavizada de resíduos média amostral dada por
escalonados absolutos
A
(PISAbsSRA, PISAbsSR) para
Cellaca MX e Celigo usandoEquação 8 após
71.Calcule o viés do método A para o método B (Viés
publicação anterior[17,18],
)calculando a média
AB
Yvalores usandoEquação
eu
11

[8] ou calculando a médiaY valores usandoEquação


ir

12

[11] , onde N é o
68.Aplique o método de Bland-Altman para número de amostras (para amostras pareadas,
comparar o desempenho entre dois métodos réplicas não pareadas, ou seja, para cada
de contagem de células. amostra, diferentes réplicas são medidas com

cada método).
69.Utilizamos um aplicativo de software
desenvolvido internamente derivado do
[12] , onde N é o
padrão de contagem de células ISO Parte 2 e
número total de medições repetidas (para amostras
método comparativo de Bland-Altman para
emparelhadas com réplicas emparelhadas, ou seja,
calcular automaticamente o coeficiente de
para cada amostra, as mesmas réplicas são medidas
determinação, precisão, parâmetros do índice
usando ambos os métodos).
de proporcionalidade, bem como os
parâmetros de análise de Bland-Altman (bias, 72.Calcule o LoA multiplicando 1,96 pela média das
LoA, o IC do viés). diferenças percentuais determinadas na etapa
70 usandoEquação 13ou 14.LoA é definido como
o intervalo de confiança unilateral de 95% para
Método comparativo de Bland-Altman: uma única amostra.
cálculo de dados
[13]
Tempo: ~ 30 min para analisar e plotar os dados de
comparação Bland-Altman para uma linha celular e
uma mancha.

70.Calcule a diferença percentualY entre a onde N é o número de amostras (amostras


eu

mediçãoMadquirido com o método Aea pareadas, réplicas não pareadas).


ai

mediçãoM adquirido com o método B Bi

para cada amostra i usando oEquação 9, [14]


somente se as amostras forem pareadas
entre os métodos A e B.

[9] , ondexé a
eu
amostra onde N é o número total de medições
média dada por replicadas (amostras pareadas, replicações
não pareadas).
a.Se as mediçõesMeMda
Ar
replicação
Bir
r
são pareados, calcule a diferença 73.Calcule o IC do viés usandoEquação 15.
percentualYentre a medição
ir
M
adquirido com oaimétodo
r
Aea
mediçãoM adquirida com o [15] , onde N é o número
Bir

método B para cada de amostras (para amostras pareadas sem


réplicas pareadas) ou o número total de

950 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

medições replicadas (se ambas as amostras para ajustar a concentração da amostra de células, se

e réplicas forem pareadas). necessário.

3.Etapas 36–50, preparação de amostra e preparação de

contagem de células para avaliação e comparação de


Método comparativo de Bland- desempenho de métodos de contagem de células:
Altman: representação gráfica 15–30 min com uma única pipeta manual para

preparação de amostra, 15–20 min para incubação


74.Plote um único ponto no diagrama de Bland-
de amostras de células misturadas com Nuclear
Altman para cada amostra, comx(média
eu
Green e ~ 10 min por placa Cellaca MX para
amostral) no eixo horizontal eY(diferença
eu
preparação de contagem de células.
percentual) no eixo vertical.

75.Trace uma linha horizontal que cruza o eixo


vertical no valor deViéscalculado AB
na etapa 71. 4.Etapa 51–55, aquisição e análise de imagens: 6
min por placa para o Cellaca MX e 5–10 min
por placa para o Celigo.
76.Trace duas linhas horizontais adicionais que
cruzam o eixo vertical nos valores de 5.Etapa 56–78, avaliação de desempenho e análise de

ViésAB + LOAeViés–LOA , onde o comparação Bland-Altman: 1 h por linha celular


AB

LoA é calculado conforme descrito na etapa 72. por solução de coloração.

Essas linhas definem uma faixa de valores para a

diferença percentual esperada entre os dois

métodos para uma única amostra. RESULTADOS ANTECIPADOS &


77.Plote duas linhas horizontais adicionais nos DISCUSSÃO
valoresViés+
AB
IC Viés
eViés–ICAB
.Esse Viés Duas linhagens de células (CHO-S, Jurkat), dois
O intervalo fornece uma noção da incerteza corantes (AO, Nuclear Green) e 2 métodos de
no próprio valor de viés. contagem de células foram avaliados para demonstrar

78.Examine o gráfico e observe qualquer a aplicação da avaliação de desempenho do método

dependência de concentração no viés ou na de contagem de células e análise comparativa de

variação. Bland-Altman.Figura 2mostra o CV médio e agrupado,


respectivamente, da série de concentração de 6
pontos de células Jurkat coradas com AO usando
ambos os sistemas de contagem de células.Tabela 4
SOLUÇÃO DE PROBLEMAS mostra os resultados numéricos para o CV médio e

Siga a solução de problemasTabela 3para agrupado. A faixa de concentração medida no

otimizar os experimentos e resultados. experimento foi ~ 5 × 105


para ~6 × 106células/mL. Tanto o Cellaca MX quanto o
Celigo têm CVs agrupados variando de 1,8 a 7,6% para
todas as réplicas por concentração. Com base nas
TEMPO medições emTabela 4, o coeficiente de

1.Etapa 1–26, manutenção de células CHO-S e Jurkat: determinação e o índice de proporcionalidade podem

20–30 min para passagem das células e medição ser calculados via análise de regressão.Figura 3mostra

de sua concentração e viabilidade por linha os ajustes proporcionais da série de concentração de 6

celular. pontos em função das frações de diluição para Cellaca


MX e Celigo. Os resultados para cada parâmetro são
2.Etapas 27–35, preparação de amostras de estoque de células a
mostrados emFigura 4eTabela 5. Tanto o Cellaca MX
partir da cultura de células: 15 min para coletar as células
como o Celigo apresentam valores comparáveis de
dos frascos de cultura de células, 5 min para contagem de
coeficiente de determinação (R2valores)
células e análise de viabilidade e 10 min

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


951
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

fTABELA 3
Tabela de solução de problemas.

Etapa Problema Razao possivel Solução


62, 63 CV é muito grande em Amostragem ou pipetagem fMisture e pipete adequadamente as amostras seguindo a célula ISO
um ou alguns DFs erro padrão de contagem
Erros de contagem devido a f Ajuste os parâmetros de contagem
aglomerados
f Remova os outliers se forem observados erros graves de contagem
67 Baixa Proporcionalidade Propagação de erro de f Diluir diretamente para gerar amostras de diluição independentes
pipetagem em vez de diluição em série para eliminar a propagação do erro de
pipetagem
68, Um grande viés Variação da amostra (ou seja, f Use o mesmo estoque de amostras de células para ambos os métodos de contagem de
70–78 entre duas células diferentes estoques de amostras) células
métodos de contagem
f Se possível, use a mesma amostra de células no mesmo consumível
para conduzir a comparação de contagem de células

fTeste a estabilidade da amostra de células para concentração


e viabilidade durante o ensaio. Se uma tendência for
observada, os resultados podem ser inválidos
Alteração da condição da amostra (por fPraticar avaliação de desempenho de contagem de células e
exemplo, fotobranqueamento, experimentos de comparação
secagem da amostra)
f Use predefinições no software

f Conclua as aquisições de imagens em um curto período de tempo

Análise de contagem de células fAjuste os parâmetros de imagem e contagem no


variação ysis (ex. software para garantir que as células sejam contadas corretamente
desagregação)
Comparação de instrumentos f Certifique-se de que os instrumentos exatos sejam comparados em
experimentos repetidos

Calibração do instrumento fCertifique-se de que ambos os instrumentos estejam bem calibrados e os dados
os parâmetros de aquisição e análise são otimizados antes do
uso.

e índices de proporcionalidade (PIs) dos ajustes inferior ao Cellaca MX nesta comparação do


proporcionais nesta avaliação do método de método de contagem de células. Como o valor
contagem de células. Não são observadas de 0 está fora do intervalo de confiança do viés,
diferenças significativas entre Cellaca MX e conclui-se que a diferença de concentração
Celigo para ambos R2ePIvalores. observada entre esses dois métodos de
Em seguida, o método de Bland-Altman é contagem de células é significativa (p < 0,05),
aplicado para comparar o desempenho entre os apesar de relativamente pequena. O viés exibe
métodos de contagem de células Cellaca MX e uma ligeira dependência da concentração de
Celigo.Figura 5mostra um gráfico Bland-Altman células neste caso. Espera-se que uma medição
representativo entre Cellaca MX e Celigo. Neste pareada adicional feita usando dois métodos
gráfico, uma porcentagem positiva indica uma nas mesmas condições caia dentro do intervalo
concentração mais alta para medições de Celigo. definido pelos LoA em aproximadamente 95%
Cada ponto no gráfico representa um par de dos casos.
medições determinadas por ambos os métodos Um resumo da avaliação do desempenho de contagem

de contagem de células. Os resultados do viés de células e resultados de comparação entre Cellaca MX e

de concentração, intervalo de confiança de 95% Celigo usando diferentes combinações de linhagens de

e desvio padrão do viés entre Cellaca MX e células alvo e soluções de coloração é mostrado emTabela

Celigo são mostrados emTabela 6. Um viés de ~ 7. Os vieses de concentração são -2–6% para os métodos

-1,5% (n = 72 medições replicadas) indica que a de contagem de células pareadas nessas quatro contagens

concentração medida pelo Celigo é de ~1,5% de células

952 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

fFIGURA 2
Resultados da contagem de células para (a) concentrações médias e (b) CV agrupado de séries de concentração de 6 pontos de células Jurkat coradas com AO.

As concentrações médias e os valores de CV medidos por Cellaca MX e Celigo foram altamente comparáveis em cada fração de diluição. É claro que, à medida que a concentração
diminui, o CV combinado aumenta, provavelmente devido ao ruído de Poisson (erro aleatório) em concentrações mais baixas.

métodos. Como cada combinação de mancha apresentados aqui estão na faixa esperada da
de célula foi tratada independentemente, os qualidade da medição de contagem de células.
resultados não foram combinados e a taxa de O Padrão de Contagem de Células ISO Parte 2
descoberta falsa (FDR) ou a taxa de erro familiar permite que pesquisadores de terapia genética e
(FWER) não foram calculadas. No geral, celular conduzam experimentos para avaliar e
realizamos vários experimentos práticos comparar a qualidade dos processos de medição
seguindo o Padrão ISO de Contagem de Células de contagem de células. Nesta aplicação prática da
Parte 2 com Celigo e Cellaca MX, e os resultados norma, demonstramos a avaliação

fTABELA 4
Concentração média calculada e CV agrupado para cada fração de diluição usando o Padrão de
Contagem de Células ISO Parte 2.

Contagem de células DF n Média (células/mL) CV agrupado (%)


método
Cellaca MX 0,1 12 5.37E+05 7.5
0,3 12 1.78E+06 4.2
0,5 12 2.88E+06 3.3
0,7 12 3.93E+06 2.2
0,9 12 5.05E+06 3.8
1,0 12 5.74E+06 2.3
celigo 0,1 12 5.21E+05 7.6
0,3 12 1.71E+06 3.9
0,5 12 2.80E+06 3.6
0,7 12 3.91E+06 2.7
0,9 12 5.06E+06 3.6
1,0 12 5.80E+06 1.8

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


953
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

fFIGURA 3
Ajuste de regressão linear da série de concentração de 6 pontos em função das frações de diluição
(DFs), que mostra a distribuição das medições de concentração para Cellaca MX e Celigo em cada
fração de diluição.

da Cellaca MX e Celigo usando células também devem ser avaliados para estender os
Jurkat e CHO adaptadas às comunidades resultados do estudo a processos de medição
de bioprocessamento e terapia celular. semelhantes.
Os usuários do Padrão ISO de Contagem
de Células Parte 2 podem utilizar o
protocolo para avaliar um ou mais
métodos de contagem de células. Para a
PERGUNTAS FREQUENTES
avaliação de um método, pode-se 1. Podemos reduzir o número de
realizar experimentos para estabelecer amostras e medições replicadas?
uma linha de base para cada um dos a.Sim, até certo ponto; o desenho
parâmetros de qualidade, onde esta experimental mínimo recomendado
linha de base pode ser monitorada consiste em pelo menos 4 frações de
posteriormente com diferentes diluição alvo, 3 amostras replicadas e
operadores, instrumentos, processos, 3 medições replicadas.
etc. Para comparação de métodos de
b.Indicadores de qualidade de projetos
contagem de células, os parâmetros de
experimentais que não atendem a esses
qualidade podem ser comparados por
recomendações devem ser interpretadas
meio de análise bootstrap ou estudos
com cautela e podem exigir
replicados, e a diferença ou viés entre os
estudos adicionais para avaliar adequadamente a
métodos pode ser determinada usando a
proporcionalidade e precisão.
análise comparativa de Bland-Altman.

954 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

fFIGURA 4
Comparação do R2ePIvalores entre Cellaca MX e Celigo. o R2ePIos valores são altamente
comparáveis.

c.Por exemplo, se um projeto experimental a.Deve ser adequado para a faixa típica de
tiver apenas 2 medições replicadas, a concentrações de células que você
avaliação do CV diretamente desse projeto pretende avaliar para o seu tipo de célula.
experimental e a análise estatística podem
3.Devemos verificar os pipetadores?
não ser apropriadas,
no entanto, a avaliação da proporcionalidade a.Sempre use pipetas calibradas

ainda pode ser realizada. profissionalmente

eu.Nesse caso, um segundo experimento b.Realizar uma verificação nos pipetadores

com medições mais replicadas de menos aumentará a confiança nos resultados

amostras e/ou menos frações de diluição c.A ISO 20391-2 também sugere uma
pode ser conduzido para abordar mais abordagem para gerar diluição medida
diretamente a precisão do método. frações, onde a massa de solução pipetada
durante a geração das frações é usada para

2.Qual é a faixa de concentração celular que calcular um valor de fração de diluição

devemos usar? medido mais preciso para uso na análise de


R2ePI. Nesse caso, pequenos erros na
fTABELA 5 pipetagem podem ser contabilizados no
R-quadrado calculado ePIvalores para avaliação de
ajuste do modelo proporcional.
desempenho.

R-Quadrado PI 4.O que os resultados podem nos dizer?


Cellaca MX 0,997 0,44
celigo 0,997 0,42 a.Os indicadores de qualidade fornecem um meio

Significado Não Não para quantificar e comparar a qualidade

Informações sobre Terapia Celular e Genética - ISSN: 2059-7800


955
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

fFIGURA 5
Gráfico de Bland-Altman entre os métodos de contagem de células Cellaca MX e Celigo.

As diferenças percentuais calculadas mostram uma tendência crescente à medida que a concentração aumenta.

fTABELA 6
Resultados da análise comparativa de Bland-Altman entre Cellaca MX e Celigo.

Viés Limite de acordo CI de viés


- 1,5% - 6,9% a 3,9% - 2,1% a -0,8%

fTABELA 7
Tabela de resumo da avaliação de desempenho de contagem de células e resultados de comparação.

Célula Coloração Cellaca MX celigo Viés LOA 95% signif-


linha solução R2 agrupados PI R2 agrupados PI IC de ICÂNCIA

cv cv viés de preconceito

faixa faixa
(%) (%)
Jurkat Nuclear 0,998 3,8% para 0,30 0,997 3,7% para 0,37 3,4% - 6,0% 2,3% Y
verde 6,1% 7,4% para para
12,8% 4,5%
Jurkat AO 0,997 2,2% para 0,44 0,997 1,8% para 0,42 - 1,5% - 6,9% - 2,1% Y
7,5% 7,6% para 3,9% para
- 0,8%
CHO Nuclear 0,998 3,4% para 0,40 0,999 2,7% para 0,35 5,6% - 3,4% 4,5% Y
verde 5,8% 6,8% para para
14,6% 6,7%
CHO AO 0,998 2,7% para 0,44 0,996 2,7% para 0,35 5,1% - 2,4% 4,2% Y
7,0% 6,4% para para
12,5% 5,9%

956 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

de métodos de contagem de células baseados c.A análise comparativa de Bland-Altman


em princípios fundamentais para a contagem: indicará a diferença percentual entre
precisão e proporcionalidade os 2 métodos.

b.A análise da Parte 2 do Padrão de Contagem d.Essas abordagens não indicam ou


ISO não faz suposições sobre a verdadeira comparam a precisão dos métodos de
contagem de células e pode tirar conclusões contagem de células.
sobre a qualidade do método na ausência de
e.A seleção do método de contagem de células
um material de referência ou método de
deve ser feita com base na qualidade do
referência.
método e no que é adequado para suas
necessidades de medição.

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957
TERAPIA CELULAR E GÊNICAPERCEPÇÕES

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células. BioProcesso Int.2006. Materiais, Instituto Nacional de
Yongyang Huang
Padrões e Tecnologia, Gaithersburg,
23. Carkeet A. Uma Revisão do Uso de Intervalos de Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento
MD, EUA
Confiança para Limites de Concordância de de Tecnologia Avançada, Nexcelom Bioscience

Bland-Altman em Optometria e Ciência da LLC, Lawrence, MA, EUA David Newton


Visão.Optometria Vision Sci. 2020; 97(1): 3–8. Divisão de Engenharia Estatística,
Jordan Bell
Laboratório de Tecnologia da
Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento
Informação, Instituto Nacional de
de Tecnologia Avançada, Nexcelom Bioscience
24. Carkeet A. Intervalos de confiança paramétricos
Padrões e Tecnologia, Boulder, CO, EUA
LLC, Lawrence, MA, EUA
exatos para limites de Bland-Altman de

Acordo.Optometria Vision Sci. 2015;


Jean Qiu
Dmitry Kuksin
Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento
92(3): e71–e80. Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento
de Tecnologia Avançada, Nexcelom Bioscience
de Tecnologia Avançada, Nexcelom Bioscience
25. Abu-Arafeh A, Jordan H, Drummond LLC, Lawrence, MA, EUA
LLC, Lawrence, MA, EUA
G. Relatórios de estudos de comparação de
Leo Li-Ying Chan
métodos: uma revisão de conselhos, uma Sumona Sarkar
Autor para correspondência: Departamento de
avaliação da prática atual e sugestões Divisão de Biossistemas e
Pesquisa e Desenvolvimento de Tecnologia
específicas para relatórios futuros.Br. J. Biomateriais, Laboratório de Medição
Avançada, Nexcelom Bioscience LLC, Lawrence,
Anestesia 2016; 117(5): 569–75. de Materiais, Instituto Nacional de
MA, EUA
Padrões e Tecnologia, Gaithersburg,
26. Navidi W.Estatística para engenheiros e lchan@nexcelom.com
MD, EUA
cientistas.Nova York: McGraw-Hill; 2013.
Laura T Pierce
27. Sokal RR, Rohlf FJ.Biometria. Nova Iorque: Biossistemas e Biomateriais
WH Freeman and Company; 1969.

958 DOI: 10.18609/cgti.2021.126


PERCEPÇÃO INOVADORA

AUTORIA E CONFLITO DE INTERESSES

Contribuições:Leo Li-Ying Chan e Jean Qiu conceberam o estudo e o projeto experimental. Dmitry Kuksin realizou a cultura celular e forneceu as
células Jurkat e CHO-S para a experimentação. Jordan Bell e Yongyang Huang desenvolveram um aplicativo de software para os parâmetros da Parte
II dos Padrões de Contagem de Células ISO e o método de análise Bland-Altman. Yongyang Huang conduziu experimentos de comparação e avaliação
de desempenho do método de contagem de células. Sumona Sarkar e Laura T Pierce contribuíram para o desenvolvimento da padronização da
contagem de células, da qual este protocolo foi derivado. David Newton contribuiu para o desenvolvimento e descrição da análise estatística. Leo Li-
Ying Chan, Yongyang Huang, Jordan Bell, Sumona Sarkar e Laura T Pierce escreveram o manuscrito.

Reconhecimentos:Os autores gostariam de agradecer a Pauline N. Mitchell por fornecer a obra de arte do diagrama do processo de medição e
preparação de amostras Cell.

Divulgação e potenciais conflitos de interesse:Yongyang Huang, Jordan Bell, Dmitry Kuksin, Jean Qiu e Leo Li-Ying Chan declaram interesses
conflitantes. A aplicação da avaliação e comparação do desempenho do método de contagem de células empregou sistemas de contagem de células
e reagentes da Nexcelom Bioscience LLC.

Isenção de responsabilidade de direitos autorais do NIST:Contribuição oficial do Instituto Nacional de Normalização e Tecnologia; não está sujeito a direitos autorais nos

Estados Unidos.

Isenção de responsabilidade do produto comercial do NIST:Certos equipamentos, instrumentos ou materiais comerciais são identificados neste
trabalho para especificar o procedimento experimental adequadamente. Tal identificação não pretende implicar recomendação ou endosso pelo
Instituto Nacional de Padrões e Tecnologia, nem pretende implicar que os materiais ou equipamentos identificados sejam necessariamente os
melhores disponíveis para o efeito.

Declaração de financiamento:Os autores não receberam nenhum apoio financeiro para a pesquisa, autoria e/ou publicação deste artigo.

ARTIGO E INFORMAÇÕES DE DIREITOS AUTORAIS

Direito autoral:Publicado por Cell and Gene Therapy Insights sob Creative Commons License Deed CC BY NC ND 4.0, que permite a qualquer pessoa
copiar, distribuir e transmitir o artigo, desde que devidamente atribuído da maneira especificada abaixo. Sem uso comercial sem permissão.

Atribuição:Copyright © 2021 Nexcelom Bioscience. Publicado por Cell and Gene Therapy Insights sob Creative Commons License Deed CC
BY NC ND 4.0.

Fonte do artigo:Convidamos; revisado externamente por pares.

Enviado para revisão por pares:2 de julho de 2021;Manuscrito revisado recebido:19 de agosto de 2021;Data de publicação:15 de setembro de 2021.

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959
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RFP) e espécies reativas de oxigênio (ROS)

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