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REPRODUTIVAS (Figura 1)
Número de leitões nascidos vivos;
Número de leitões desmamados;
Peso da leitegada desmamada pelas matrizes.
DE DESEMPENHO E QUALIDADE DE CARNE (Figura 5)
Dias para alcançar peso de abate;
Espessura de toucinho;
Quantidade de carne na carcaça;
Podem ainda incluir conversão alimentar e para características de
qualidade da carne, a cor, pH, retenção de água e marmoreio.
* Para produção alternativa de suínos outras características como docilidade,
robustez, longevidade são também importantes.
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utilizando o modelo y=Xb + Zu + e, onde y é dos grupos de contemporâneos. também características quantitativas.
um vetor dos recordes, b é um vetor dos Animais não aparentados são Dessa forma, é possível identificar SNPs de
efeitos fixos e u é um vetor dos efeitos conectados por estarem no mesmo grupo. efeitos mais relevantes e utilizar essa
aleatórios (animais), X e Z são as respecti- Os grupos de contemporâneos necessitam informação nas estratégias de seleção.
vas matrizes de incidência dos efeitos fixos ser tão grandes quanto os recursos e as Outra abordagem que utiliza os painéis de
e aleatórios e e é o vetor dos erros aleatóri- instalações permitirem e devem representar SNPs em alta densidade é a seleção
os. Esse procedimento permite o selecio- progênie de no mínimo 2 a 3 reprodutores. genômica (Meuwissen et al., 2001). Esse
nador fazer melhor uso da informação para As vantagens da avaliação pelo BLUP método é mais eficiente por permitir
estimar o mérito genético do que os três incluem: mapear todos os QTLs do genoma
métodos já discutidos. Tanto VGE como a) Os valores genéticos estimados de capturando a variância genética total a partir
DEP são calculados pela solução de um animais de diferentes rebanhos ou grupos de dos marcadores. Para a seleção genômica
sistema de equações simultâneas, que contemporâneos podem ser comparados; há várias metodologias disponíveis, como a
incorpora informação de todos os recordes b) Os valores genéticos estimados podem Ridge Regression juntamente com o BLUP
conhecidos dos parentes do animal. Faz ser obtidos de características não expres- e os métodos bayesianos como o Bayes A,
isso por meio do uso da matriz de parentes- sas pelo animal (VGEs e DEPs dos cachaços Bayes B, Bayes C, Bayesian Lasso, entre
co entre os parentes dentro do rebanho ou para tamanho de leitegada por exemplo); outros. De qualquer forma, toda informação
da raça. Algum animal pode nem ter c) A informação coletada é otimamente contida nos painéis de SNPs pode ser
recorde para uma característica de utilizada em relação aos demais métodos, utilizada simultaneamente na avaliação
interesse mas, nesse caso, ele apenas portanto, produzindo estimativa mais genética via BLUP, sem grande modifica-
fornece os laços genéticos entre esse acurada do valor genético do que os ção da metodologia para ajustar efeitos dos
animal e aqueles que possuem recordes métodos discutidos previamente; SNPs e demais efeitos para a predição dos
(zero para não parentes, ½ para pai-filho, ¼ d) As tendências genéticas podem ser valores genéticos genômicos.
para avô-neto, etc). Adicionalmente os calculadas, o que permite ao selecionador Atualmente a seleção genômica para
animais também são conectados por terem monitorar o progresso genético para cada suínos já pode ser executada num único
sido criados no mesmo grupo de contem- característica no objetivo de seleção. procedimento, como demonstrado por
porâneos. Finalmente, as informações em As desvantagens da avaliação pelo Christensen at al. (2012), e efetuada de
outras características registradas no animal BLUP incluem a necessidade de programas maneira específica (Zhang et al. 2010).
podem ser utilizadas para estimar o valor sofisticados de computador para resolver o Apesar de ser uma realidade em
genético do animal para uma característica sistema de equações; e os VGEs e DEPs alguns programas de melhoramento, a
específica, se essas outras características são gerados para características individuais implementação da seleção genômica não é
forem geneticamente correlacionadas com ao invés de um único valor para ordenar os simples. Para uso eficaz do grande volume
a característica de interesse. Por exemplo, animais para seleção. As características de informações geradas pelas novas
espessura de toucinho é geneticamente individuais devem ser incluídas em índice. metodologias genômicas, é imprescindível
correlacionada de forma negativa com o desenvolvimento de competências e fer-
conversão alimentar, portanto, essa 4.1. Seleção genômica ramentas em bioinformática, que permitam
informação adicional pode ser utilizada para A crescente evolução da área de transformar a informação genômica em
estimar com maior acurácia o valor genético genômica tem despertado grande interes- conhecimento aplicável.
para conversão alimentar. Os VGEs são se das empresas de genética em utilizar
calculados como desvios em relação aos informações genômicas para aumentar a
animais da base. Um animal com um VGE competitividade dos programas de
para espessura de toucinho de -4,0 mm melhoramento genético. A inclusão de
significa 4,0 mm a menos em ET do que os informações genômicas na seleção dos
animais da base, o que é uma diferença animais permite a estimação mais acurada
genética. dos valores genéticos preditos e o aumento
Especialmente em avaliações entre dos ganhos genéticos anuais dos progra-
rebanhos é importante que os recordes mas de melhoramento genético de suínos
utilizados na análise sejam conectados. A (Legarra et al. 2009). O desenvolvimento de
conectividade pode acontecer de duas um painel de alta densidade de SNPs
formas. A primeira pelos laços genéticos (polimorfismos de base única) tornou
entre rebanhos. Esses laços podem ser possível a realização de estudos de
devido ao uso de inseminação artificial, associação global e de seleção genômica
onde um reprodutor produz progênie em em suínos (Ramos et al., 2009). Essas duas
vários rebanhos, ou onde os animais são estratégias de análise genômica apresen-
vendidos como reprodutores e produzem tam aplicabilidade nos programas de
progênie em outros rebanhos. Esses laços melhoramento.
entre rebanhos precisam existir e ser O estudo de associação global do
mantidos para uma ótima avaliação BLUP genoma é um procedimento para identificar
poder ser feita. A segunda forma de loci responsáveis pela variação de caracte-
conectividade vem do grupo de contempo- rísticas poligênicas (Figura 4), que consiste
râneos. Devido ao sistema de equações em correlacionar o genótipo de milhares de Fig. 4. Ilustração do uso da genômica na seleção.
BLUP ser resolvido simultaneamente para SNPs com fenótipos de interesse. Esses
os efeitos genéticos e de ambiente, é estudos têm possibilitado a identificação de
importante ter boa conectividade dentro loci que afetam várias doenças complexas e
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4.2. Acurácia dos VGEs e DEPs pelo BLUP podem ser calculados. As acurácias são quando nova informação tornar-se dis-
Os VGEs/DEPs são estimativas do maneiras de determinar quão próximo a ponível, as estimativas de VGE terão maior
verdadeiro mérito genético do animal. Tais estimativa do mérito genético está do chance de mudar, tanto na direção favo-
estimativas podem mudar sempre que verdadeiro mérito genético, e significa a rável ou não favorável, do que com altos
uma ou mais informações de parentes (ex. probabilidade de que a estimativa mude valores de acurácia (0,7 a 1,0), pois estes
irmãos mais jovens, progênie, etc.) quando mais informação for incluída no indicam que as chances de mudar com a
tornarem-se disponíveis. Os valores de cálculo dos VGEs ou DEPs. Esses valores inclusão de nova informação são baixas.
acurácia, que dão idéia ao usuário de de probabilidade variam de 0,0 até 1,0.
quanto os VGEs/DEPs podem mudar, Valores baixos (0,0 a 0,4) sugerem que
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ÍNDICES DE SELEÇÃO UTILIZADOS Índices utilizados no programa STAGES espessura de toucinho ajustada para 113 kg
N O P R O G R A M A S TA G E S , D O S (STAGES, 2014) do grupo testado.
ESTADOS UNIDOS Índice de produtividade da porca M = Porcentagem predita de carne
SPI = 100 + 6,5(L) + W calculada para o indivíduo menos a média
No Brasil ainda não existe um da porcentagem predita de carne do grupo
programa de melhoramento genético de Índice de linha materna testado.
suínos centralizado, como existe nos países MLI = 100 + 6(L) + 0,4(W) - 1,6(D) - 81(B) F = Conversão alimentar calculada para
líderes da suinocultura. O programa TSI - Esse índice pode variar se existir cada indivíduo, ou para a baia, dos animais
americano STAGES serve de modelo para a informação de carne e de conversão menos a média da conversão alimentar para
implantação de um programa brasileiro. alimentar, tomando as seguintes formas: todas as baias ou animais (se forem
O índice de seleção considera o alimentados individualmente) no grupo de
potencial para resposta à seleção para cada Índice de linha paterna módulo B contemporâneos.
característica, o valor econômico de cada TIB = 100 - 1,4(D) - 106(B) G = Ganho médio diário medido no
característica, como informado no objetivo indivíduo menos a média do ganho médio
Índice de linha paterna módulo músculo
de seleção e a mudança correlacionada diário do grupo de contemporâneos.
TIM = 100 - 1,4(D) + 12(M)
esperada nas outras características, Tais índices apresentarão média 100
quando uma delas é mudada pela seleção. Se for medida a conversão alimentar e para cada grupo testado e devem apre-
O cálculo do índice de seleção é sentar um desvio padrão de cerca de 25.
ET medida pelo módulo B
simplificado quando combinado com o Um grupo testado deve ter aproxima-
I = 100 + 52(G) – 92(B) – 68(F) ou
sistema de avaliação genética. As DEPs são damente a distribuição dos valores do
calculadas considerando as variâncias e %de carne predita índice mostrada na Quadro 3.
correlações genéticas entre as característi- I = 100 + 55(G) + 11(M) – 76(F) O índice mais simples consiste de todas
cas e utilizam toda a informação disponível as DEPs adicionadas juntas. Por exemplo,
dos parentes para aumentar a acurácia da Onde, se um produtor estiver interessado em
avaliação. Nesse caso, o selecionador pode L = Número ajustado de leitões tamanho da leitegada-L, crescimento-D e
simplesmente multiplicar a DEP de cada nascidos vivos da porca menos a média do espessura de toucinho-B, o índice seria:
característica pelo respectivo valor número ajustado de nascidos vivos do I* = 100 + DEPL + DEPD + DEPB
econômico e somar os resultados para se grupo de contemporâneas desta.
O uso de valores econômicos para cada
obter o índice. W = Peso da leitegada da porca ajustado
característica vai ponderar a informação
Utilizam-se três diferentes índices de para 21 dias menos a média dos pesos das
genética pela importância econômica
seleção nos programas de avaliação leitegadas ajustados para 21 dias no grupo
relativa de cada característica. Utilizando os
genética de suínos nos Estados Unidos. de contemporâneas desta.
valores da Quadro 4 para as mesmas
D = Dias ajustados para 113 kg do
características daria o seguinte índice:
Índice de reprodutor terminal -TSI indivíduo menos a média dos dias ajustados
Utilizados para seleção e descarte em para alcançar 113 kg do grupo testado. I = 100 + 13,5 x DEPL + 0,12 x DEPD + 15 x DEPB
rebanhos que tem raças paternas ou B = Espessura de toucinho do indivíduo, *Lembrando que as melhores DEPs para D e B
terminais. Inclui apenas características pós- ajustada para 113 kg, menos a média da são as mais negativas.
desmama.
Quadro 3. Distribuição dos valores do índice de seleção.
Índice de linha materna - MLI
Utilizados em linhas maternas e de duplo VALOR DO ÍNDICE PORCENTAGEM DE ANIMAIS DESTINO
propósito. Inclui características reproduti- Valor maior que 150 2 Selecionados para linha pura
vas e de pós-desmama, mas as característi- Centrais de cachaços
125 a 150 14
cas reprodutivas recebem o dobro da
ênfase econômica do que as de pós- 100 a 125 34 Monta natural
desmama. 75 a 100 34 Descarte
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1ª edição (2016) Versão Eletrônica
5. Proposta da Embrapa Suínos e Aves
As características principais de um
programa de melhoramento genético de
sucesso incluem:
Medições das características economica-
mente importantes de forma consis-
tente e acurada nos animais;
2. Formação de uma base de dados Fig. 6. Software de cadastro de dados da Embrapa Suínos e Aves
confiável em cada granja. Isto é, passar as
informações das fichas para uma base de nascidos vivos, número de desmamados Requisitos para Programas Centralizados
dados. e peso da leitegada desmamada); de Melhoramento entre Produtores e
A Embrapa Suínos e Aves desenvolveu Anotações dos dados do leitão (mossa, Agroindústrias de Carne Suína (NSIF, 1997)
um programa de captura de dados para data de nascimento, peso ao nascer, a
Uniformidade - Trabalhar no estabeleci-
formação de base de dados (Figura 6). desmama, ao final de creche e ao final do mento de processos uniformes e acurados,
Chama-se CAPED e encontra-se no teste de granja, com as respectivas datas). para medir e anotar os dados do desempe-
seguinte endereço www.cnpsa.embra- Teste de granja dos 23 aos 115 kg e nho de crescimento dos suínos, que
pa.br/caped/inicio.php. formação de grupos de contemporâneos poderão ser úteis para as organizações.
A Embrapa Suínos e Aves também (anotar peso, consumo e espessura do Desenvolvimento - Auxiliar as organiza-
desenvolveu, em parceria com a Agriness, toicinho, profundidade de músculo). ções membros e/ou suas afiliadas no
um exportador de dados do programa S2 Digitar os dados na base de dados. desenvolvimento de seus programas
para planilhas eletrônicas, que pode ser 5. Análise rotineira (com periodicidade men- individuais, consistentes com as necessida-
utilizado por qualquer usuário sob o controle sal) dos dados para estimativas das DEPs. des dos seus membros e com a meta
da Embrapa Suínos e Aves. comum de todos os programas de forma-
6. Estimativa dos índices de seleção (SPI, ção de base de dados.
3. Capacitar técnicos e trabalhadores das MLI e TSI). Cooperação - Desenvolver cooperação
granjas de seleção e das centrais de 7. Centralização das informações na base entre todos os segmentos da indústria
cachaços nos procedimentos necessários de dados da ABCS. suína na compilação e utilização dos dados
para o melhoramento genético e para a de desempenho e de qualidade, para
8. Credenciamento do programa no Minis- melhorar a eficiência da produção suína.
escolha do sêmen de animais com os
tério da Agricultura, Pecuária e Abaste- Educação - Encorajar os membros para
índices necessários para cada caso.
cimento - Mapa. desenvolver programas educacionais,
4. Procedimentos necessários nas granjas: 9. Implantar seleção genômica nos pro- enfatizando o uso e interpretação dos dados
Fichas de parto, de leitões e de cachaços; gramas que dispoem de recursos. de desempenho e de qualidade no melhora-
mento da eficiência da produção suína.
Construção do pedigree e compatibiliza-
10. Criar mecanismos de intercâmbio de Confiança - Desenvolver confiança
ção dos acasalamentos;
material genético com programa de exce- crescente da indústria suína no potencial
Anotação dos dados da porca (número de
lência. econômico dos testes de desempenho.
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