BIOTECNOLOGIA
ISBN:
978-85-921077-0-3
MARIA ANTONIA
MALAJOVICH
BIOTECNOLO
GIA
2a
EDIÇÃO
Rio de Janeiro Maria Antonia
Muñoz de Malajovich 2016
C A P Í T U L O 1. O QUE É
BIOTECNOLOGIA.......................................................................................................... 1 A biotecnologia
tradicional. A biotecnologia moderna. As definições de biotecnologia. O impacto da biotecnologia. Biotecnologia e
desenvolvimento. A história da biotecnologia.
C A P Í T U L O 2. CÉLULAS E
CROMOSSOMOS........................................................................................................9 A célula como unidade
estrutural e funcional dos seres vivos. Técnicas laboratoriais. Toda célula deriva de outra preexistente. Os
cromossomos e a teoria cromossômica da hereditariedade. As primeiras manipulações gênicas. Nature vs nurture.
Células e cromossomos como agentes biológicos.
C A P Í T U L O 3. OS
MICRORGANISMOS.............................................................................................................20 A diversidade
microbiana (Eubactérias, algas, arqueas, fungos e vírus). As técnicas microbiológicas. Biossegurança e
biosseguridade. Os microrganismos como agentes biológicos.
C A P Í T U L O 4. ENZIMAS E
ANTICORPOS..........................................................................................................32 As proteínas. Estrutura.
O proteoma. As bases de algumas técnicas laboratoriais. As enzimas. A catálise enzimática. Os anticorpos. A reação
antígeno- anticorpo. A produção de anticorpos no organismo e no laboratório. A utilização dos anticorpos.
C A P Í T U L O 5. OS ÁCIDOS
NUCLEICOS..............................................................................................................46 Os ácidos nucleicos. A
dupla hélice. O código genético. A expressão gênica. O fluxo da informação genética em células procarióticas e
eucarióticas. O complexo mundo dos RNAs. A diversidade existente. Interferência e silenciamento gênico. O genoma
humano: mapeamento e avanços posteriores. O DNA e o RNA como agentes biológicos.
C A P Í T U L O 6.
BIOPROCESSOS...........................................................................................................................58
Bioprocessos, processos fermentativos e indústria. Os microrganismos industriais. Noções sobre o metabolismo
primário e secundário. As fases de crescimento da população microbiana. Meios de cultura e matéria-prima. A
obtenção das linhagens. Os diferentes tipos de bioprocessos (tradicionais e submersos). Do laboratório à indústria
(mudança de escala, condução do processo e recuperação do produto. Bioprocessos na indústria: o ácido cítrico e
os biofertilizantes.
C A P Í T U L O 7. O CULTIVO DE CÉLULAS E
TECIDOS...........................................................................................71 A manipulação in vitro de células e
tecidos vegetais: as primeiras tentativas, os meios de cultura, as etapas do processo, as diferentes modalidades,
melhoramento e conservação da biodiversidade vegetal, a difusão da tecnologia. A manipulação in vitro das células
animais: as primeiras tentativas, as diferentes modalidades, os meios de cultivo, as linhagens celulares, condições de
cultivo, do laboratório à indústria.
C A P Í T U L O 8. A TECNOLOGIA DO DNA
...........................................................................................................83
As ferramentas disponíveis: as
nucleases ou enzimas de restrição, a eletroforese do DNA, hibridização e sondas gênicas, o método de Southern, o
Fingerprint, a síntese e amplificação de DNA, o sequenciamento do DNA. Os arrays.
C A P Í T U L O 9. A ENGENHARIA
GENÉTICA.........................................................................................................95
O nascimento da
biotecnologia moderna: as primeiras experiências, mitos e realidade. As bibliotecas de genes. A construção de um
microrganismo recombinante: Encontrar o gene, inserir o gene e identificar os microrganismos recombinantes. A
chegada da comunidade DIY. A construção de plantas transgênicas: o transgene, a transferência dos genes a células
vegetais, do laboratório ao campo. Células e animais transgênicos: a transferência gênica a células animais,
aplicações. As novas tecnologias de edição gênica baseadas no RNA interferente, nas nucleases sítio-dirigidas:
ZFN’S E TALEN, na imunidade bacteriana: CRISPR-CAS9.Biossegurança e regulação.
C A P Í T U L O 10. BIOTECNOLOGÍA E
INDÚSTRIA...............................................................................................114
O processo Weizmann. A
indústria química: as vias química e biotecnológica. Os produtos biotecnológicos: metabólitos de interesse comercial,
enzimas, biopolímeros e bioplásticos. Os biocombustíveis: etanol, biogás, biodiesel. Panorama atual. Biorrefinarias e
novas bioindústrias: os casos Amyris e Solazyme (TerraVia).
FIGURA 1.1. O campo da Biotecnologia FIGURA 2.1. A. A – Formação de clones B. B – Mecanismos de transferência lateral ou
horizontal de material genético FIGURA 3.2. Os vírus
Representações esquemáticas da estrutura celular FIG
A. Estrutura fundamental B. Morfologia de diferentes vírus C. (Os secundários FIGURA 6.4. A metodologia HTS para triagem e evoluçã
parasitam células humanas; o bacteriófago, bactérias). D. A m linhagens bacterianas FIGURA 6.5. Modelos de biorreatores utilizado
bacteriófago FIGURA 3.3. Logotipos utilizados como indi tradicionais
biológico FIGURA 4.1. A composição química de uma b A. Biorreator para fermentações em fase sólida B. A produção de vin
4.2. Aminoácidos e proteínas FIGURA 4.3. Cromatograf de Orléans) FIGURA 6.6. Modelo de biorreator utilizado em fermenta
FIGURA 4.4. Eletroforese FIGURA 4.5. Difração de raio submersas FIGURA 6.7. Fermentações, agentes biológicos e biorrea
O mecanismo da atividade enzimática 6.8. A mudança de escala, do laboratório à indústria FIGURA 6.9. A o
A. O modelo chave-fechadura B. A enzima diminui a energia d ácido cítrico por fermentação FIGURA 7.1. As diversas partes de um
FIGURA 4.7. A estrutura da molécula de anticorpo (IgG angiosperma FIGURA 7.2. O procedimento a seguir para se obter um
4.8. Os anticorpos e o reconhecimento do antígeno FIG asséptica no laboratório FIGURA 7.4. A cultura de meristemas FIGUR
encontro do linfócito B e do antígeno, e a seleção clona diferentes possibilidades dos cultivos de calos FIGURA 7.6. As possi
4.10. A produção de anticorpos no laboratório FIGURA cultivo de células vegetais FIGURA 7.7. As culturas de células de orig
ensaios imunológicos A. Etapas da cultura de leucócitos para a análise do cariótipo B. Etapas da c
A. Associação dos anticorpos com moléculas fluorescentes B. partir de um fragmento de tecido FIGURA 8.1: As enzimas de restrição (
FIGURA 5.1. Composição química dos ácidos nucleicos na sequência palindrômica GAATTC) FIGURA 8.2. A eletroforese do
5.3. O fluxo da informação genética FIGURA 5.4. A orga Os polimorfismos FIGURA 8.4. Hibridização de uma sequência de D
procarióticas FIGURA 5.5. A organização e regulação d complementar marcada FIGURA 8.5. A técnica de Southern FIGURA
5.6. As etapas da síntese de proteínas (Recapitulação) oligonucleotídeos
FIGURA 6.1. O processo fermentativo genérico FIGURA
6.3. As diversas fases do crescimento de uma populaçã SUMÁRIO v
A. As fases de crescimento de uma população B. A produção
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vi FIGURA 8.7. A síntese de cDNA por transcriptase reversa FIGURA 8.8. A reação em cadeia da polimerase
FIGURA 8.9. O sequenciamento de um fragmento de DNA FIGURA 8.10. Fundamentos da tecnologia de arrays
FIGURA 9.1. Cortar, colar, copiar: a experiência que deu origem à engenharia genética FIGURA 9.2. Sapobacter ou
Bactosapo? FIGURA 9.3. A construção de bibliotecas de genes FIGURA 9.4. A produção de somatotropina por
engenharia genética FIGURA 9.5. Algumas estratégias possíveis de clonagem FIGURA 9.6. A estrutura de um vetor
de expressão FIGURA 9.7. Semelhanças entre os Legos e os Biobricks (www.biochem.hku.hk/synbio/?_id=148)
A. Classificação hierárquica B. Construções intercambiando as partes FIGURA 9.8. A construção de uma planta
transgênica no laboratório FIGURA 9.9. As etapas da construção de uma planta transgênica FIGURA 9.10.
Construção de animais transgênicos
A. Microinjeção. B. Transfecção de células-tronco embrionárias FIGURA 9.11. A edição gênica com CRISPR-Cas9 FIGURA
10.1. As etapas necessárias para a produção de etanol a partir de diferentes matérias-primas FIGURA 10.2. A
produção de etanol a partir da cana-de-açúcar FIGURA 10.3. A biodigestão em condições aeróbias e anaeróbias.
FIGURA 10.4. As complexas etapas da produção de biogás dentro do biodigestor FIGURA 10.5. As utilizações do
biogás FIGURA 10.6. A reação de transesterificação FIGURA 10.7. O caso Amyris
A. Do quinghaosu à artemisina B. Produtos gerados na plataforma tecnológica baseada na engenharia metabólica da levedura
(via dos isoprenoides ou terpenos) FIGURA 10.8. O caso Solazyme FIGURA 11.1. A indústria de papel e de celulose.
FIGURA 11.2. Controle biológico do Aedes aegypti
A. Ciclo de vida do mosquito Aedes aegypti B. Controle por Wolbacchia C. Controle por irradiação D. Controle por engenharia
genética FIGURA 11.3. A compostagem FIGURA 11.4. O tratamento das águas residuais FIGURA 11.5. O
funcionamento de um biossensor TABELA 11.2. Os principais contaminantes do meio ambiente FIGURA 11.6. As
estratégias de biorremediação FIGURA 12.1. O transporte de plantas de um continente a outro FIGURA 12.2.
Distribuição da produção agrícola na área habitável do planeta FIGURA 12.3. Os vegetais na alimentação humana
FIGURA 13.1. O milho FIGURA 13.2. A produção de milho híbrido FIGURA 13.3. As etapas da construção de uma
planta transgênica FIGURA 13.4. Os elos que integram a cadeia produtiva da semente FIGURA 14.1. O Controle da
reprodução em bovinos FIGURA 14.2. Dolly, um clone obtido por transferência nuclear FIGURA 14.3. O salmão
transgênico AquAdvantage (Aquabounty Technologies) TABELA 14.2. Significado e alcance dos três Rs (do inglês
replacement, reduction, refinement) FIGURA 15.1. A panificação FIGURA 15.2. A vinificação FIGURA 15.4. A
produção de laticínios
A. Iogurte tradicional e iogurte batido B. Queijo. Os agentes biológicos intervêm nas etapas de coagulação e na maturação de
alguns produto FIGURA 15.5. A produção de xarope de frutose FIGURA 16.1. O que é um transgênico? FIGURA 16.2.
A estrutura de um transgene FIGURA 16.3. O símbolo de transgênico adotado no Brasil. FIGURA 17.1. As respostas
primária e secundária do organismo FIGURA 17.2. A memória imunológica FIGURA 17.3. A utilização da tecnologia
do DNA-recombinante na vacina contra a hepatite B. FIGURA 17.4. Os diferentes tipos de vacinas FIGURA 18.1.
Imagens comerciais de alguns dispositivos miniaturizados utilizados em testes diagnósticos
SUMÁRIO FIGURA 18.2. Imagem comercial dos sistemas API de Biomérieux
(http://www.tgw1916.net/Tests/api.html). FIGURA 18.3. O método direto e indireto de um teste positivo de ELISA.
FIGURA 18.4: As técnicas com base genética FIGURA 18.5. O sistema HLA
A. A herança dos haplótipos. B. Reação mista ou “cross-matching”. Colocam-se em contato as células do doador com
o soro do receptor, em presença de
complemento. Se as células do doador ficam intactas, há compatibilidade. FIGURA 18.6. O uso
de arrays no diagnóstico de mutações nos genes BRCA1 e BRCA2 FIGURA 19.1. As etapas
do desenvolvimento de um medicamento FIGURA 19.2: A fórmula da aspirina FIGURA 19.3.
A fórmula da penicilina FIGURA 19.4. A insulina humana A. A molécula de insulina B. A síntese
da insulina. FIGURA 20.1. O princípio da clonagem terapêutica FIGURA 20.2. A transformação
de uma célula normal em cancerosa por mutação (câncer de cólon). FIGURA 20.3. O
tratamento com sipuleucel-T (Provenge®).
A. Extração das células dendríticas B. Incubação das células com Provenge® C.
Reinfusão das células modificadas no paciente (3 vezes com 2 semanas de intervalo)
FIGURA 20.4: O princípio da terapia gênica. FIGURA 20.5: As tecnologias de
silenciamento gênico.
A. As ribozimas B. O
RNA anti-sense C. O
RNA interferente
LISTA DE
TABELAS
TABELA 1.1. Produtos e serviços de origem biotecnológica, em diferentes setores TABELA 1.2. A
linha do tempo TABELA 2.1. A função e a distribuição das estruturas celulares TABELA 2.2. As
células como agentes biológicos TABELA 3.1. Os microrganismos dentro do marco da uma
classificação biológica atual TABELA 3.2. As bactérias (Eubactérias e Arqueas) como agentes
biológicos TABELA 3.3. As algas como agentes biológicos TABELA 3.4. Os fungos como agentes
biológicos TABELA 4.1. As funções das proteínas no organismo TABELA 4.2. A classificação
internacional das enzimas TABELA 4.3. As enzimas como agentes biológicos TABELA 4.4. Os
anticorpos como agentes biológicos TABELA 5.1: O código genético TABELA 5.2. Os ácidos
nucleicos (DNA e RNA) como agentes biológicos TABELA 7.1. Os componentes do meio de cultura
para células vegetais TABELA 7.2. Os componentes de um meio de cultura básico para células
animais TABELA 7.3. Origem e utilização de algumas linhagens celulares TABELA 10.1. Diversidade
de produtos derivados de algumas matérias-primas renováveis TABELA 10.2. Metabólitos primários
e secundários obtidos por fermentação e/ou bioconversão enzimática TABELA 10.3. O poder
calorífico de vários combustíveis. TABELA 11.1. Alguns exemplos de utilização de agentes biológicos
como pesticidas TABELA 11.2. Os principais contaminantes do meio ambiente TABELA 12.1. Os
principais tipos de vegetais que entram em nossa alimentação TABELA 12.2. As plantas e a indústria
TABELA 12.3. Os centros de diversificação e os cultivos originários TABELA 14.1. O risco de
escapamento de um animal transgênico TABELA 14.2. Significado e alcance dos três Rs (do inglês
replacement, reduction, refinement) TABELA 16.1. As plantas geneticamente modificadas no mundo
(Dados do ISAAA, março de 2016) TABELA 17.1. A produção de vacinas no Brasil TABELA 18.1. As
qualidades de um bom teste de diagnóstico. TABELA 18.2. Algumas das mais de 8.000 doenças
genéticas descritas TABELA 19.1. A linha do tempo de entrada dos antibióticos e antibacterianos no
mercado TABELA 19.2. Alguns biofármacos de interesse médico TABELA 19.3. Os medicamentos
biológicos mais lucrativos em 2014 (Statista, Phrma)
vii
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CAPÍTULO1
O QUE É BIOTECNOLOGIA
A BIOTECNOLOGIA TRADICIONAL
A BIOTECNOLOGIA MODERNA
O QUE É BIOTECNOLOGIA? 3
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BIOTECNOLOGIA E DESENVOLVIMENTO
4 Por se tratar de uma coleção de tecnologias
diversas, o uso das biotecnologias não se restringe necessariamente aos países
desenvolvidos. Existe um espaço que os países emergentes podem ocupar, em função de
suas riquezas naturais, desde que existam prioridades econômicas e políticas definidas
claramente. A condição fundamental é contar com instituições competentes que formem uma
massa crítica de pesquisadores e pessoal técnico treinado.
A China e a Índia contam hoje com uma indústria biotecnológica avançada e diversificada.
Assim como a América Latina, concentrada principalmente na Argentina, no Brasil, no Chile, na
Colômbia, em Cuba e no México. Países como Uruguai e Venezuela também têm atividade em
algumas áreas, assim como, em menor escala, Equador, Costa Rica, Paraguai, Peru e Bolívia.
Na região, numerosas empresas incidem em vários setores: meio ambiente e indústria,
agroalimentos e pecuária, saúde animal e humana.
No entanto, a Biotecnologia suscita ainda opiniões e sentimentos controversos. Enquanto
alguns setores a percebem como uma tecnologia baseada em um sólido conhecimento
científico, para outros se trata de uma atividade antinatural e perigosa. O enfrentamento de
partidários e opositores ocorre com menos frequência no terreno das razões que no das
paixões, sejam elas políticas, religiosas ou ideológicas. Ao discutir se a biotecnologia é
progressista ou reacionária, boa ou ruim, se esquece que o que caracteriza uma tecnologia é o
uso que fazemos dela.
Produtos e processos inimagináveis cinquenta anos atrás entram em nosso cotidiano antes
que os alicerces científicos e tecnológicos correspondentes se insiram em nossa cultura,
através de uma divulgação ampla que atinja também o sistema educativo em todos os seus
níveis. Não existe possibilidade alguma de construir uma sociedade moderna se os seus
integrantes ignorarem os aspectos mais gerais de ciência e tecnologia. O desconhecimento
aumenta o risco de rejeitar tecnologias promissoras, capazes de abrir perspectivas novas, com
vistas a um desenvolvimento sustentável em áreas tão críticas como a saúde, a produção de
alimentos, a energia e o meio ambiente. A proposta deste livro é revisar os fundamentos das
biotecnologias e mostrar como se aplicam em diversos setores produtivos da sociedade,
destacando como exemplos alguns empreendimentos latino-americanos bem-sucedidos.
Esperamos que ele seja de ajuda para todos os que nos preocupamos com os alcances desta
fascinante (r)evolução tecnológica.
A HISTÓRIA DA BIOTECNOLOGIA
A Tabela 1.2 reúne alguns dos mais importantes acontecimentos relacionados com a Biotecnologia.
----------------
TABELA 1.2. A linha do tempo
DATA ACONTECIMENTOS FUNDAMENTAIS
ANTIGUIDADE
Preparação e conservação de alimentos e bebidas por fermentação (pão, queijo, cerveja, vinho e vinagre); cultivo de
plantas (batata, milho, cevada, trigo etc.); domesticação de animais; tratamento de infecções (com produtos de
origem vegetal tais como pó de crisântemo e derivados de soja com fungos).
IDADE MÉDIA
Século XII Destilação do álcool.
O QUE É BIOTECNOLOGIA? IDADE MODERNA
Século XVI Cronistas registram a colheita de algas para alimentação, nos lagos do México, pelos astecas.
Século XVII Início da produção comercial de cerveja; extração de metais por ação microbiana na Espanha;
cultivo de fungos na França; Hooke descobre a existência de células (1665).
Século XVIII Invento da máquina a vapor (1752). A partir de 1750, cresce o cultivo de leguminosas na Europa
e se difunde a prática de rotação de cultivos, aumentando a produtividade e melhorando o uso da terra.
IDADE
CONTEMPORÂNEA
1797 Jenner inocula uma criança com um vírus que o protege contra a varíola.
1809 Appert utiliza o calor para esterilizar e conservar comida, processo que será utilizado nas
campanhas napoleônicas.
1863 a 1886 Pasteur inventa um processo para conservar alimentos sem alterar suas propriedades
organolépticas (Pasteurização, 1863), derruba a teoria da abiogênese (1864), investiga as doenças do
bicho-da-seda (1865), identifica a levedura como o agente responsável pela fermentação alcoólica (1876),
usa microrganismos atenuados para obter vacinas contra o antraz e a cólera (1881), faz os primeiros testes
de uma vacina contra a raiva (1881). Paralelamente, Koch inicia o desenvolvimento de técnicas fundamentais
para o estudo dos microrganismos (1876) e enuncia quatro postulados sobre os agentes infecciosos como
causa de doenças. Em 1865 Mendel apresenta o seu trabalho “Experiências de hibridização em plantas”.
1897 Büchner mostra que enzimas extraídas da levedura podem transformar açúcar em álcool.
1900 Redescobrimento das leis da hereditariedade, já enunciadas por Mendel em 1865, porém
esquecidas.
1905 O primeiro transplante de córnea se realiza com sucesso; isto porque a córnea não tem
antígenos.
1906 Ehrlich descobre o primeiro agente quimioterápico, chamado Salvarsan, que será utilizado
contra sífilis.
1912 a 1914 Rhöm obtém a patente de uma preparação enzimática para a lavagem de roupas; Weizmann
consegue a produção de acetona e butanol por
microrganismos.
1916 Imobilizam-se as enzimas, uma técnica que facilita sua utilização em processos industriais.
1918 Morrem de gripe espanhola mais de vinte milhões de pessoas, um número de vítimas superior ao da
Primeira Guerra Mundial. Constroem-se biodigestores para a produção de metano (China e Índia).
1919 O engenheiro agrícola húngaro Ereky utiliza pela primeira vez a palavra biotecnologia.
5
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1940 a 1950 Avanços na mecanização do trabalho agrícola.
1944 Produção em grande escala da penicilina (descoberta por Fleming em 1928, desenvolvida por
Florey e Chain).
1951 Inseminação artificial de gado utilizando sêmen congelado. Descoberta da presença de genes
saltatórios no milho por Bárbara Mc Clintock.
1959 Reinart regenera plantas de cenoura a partir de uma cultura de células (calo).
1960 Aumento da produção de ácido láctico, ácido cítrico, acetona e butanol por via fermentativa.
1961 Descoberta do código genético. Desenvolvimento de uma protease alcalina para uso em sabões
para a lavagem de roupas pela empresa dinamarquesa Novo. Inicia-se o cultivo in vitro de células-tronco
embrionárias pluripotentes.
1962 Plantio de novas variedades de trigo mais produtivas, no México, dando início ao que será
chamado de Revolução Verde.
1965 Hayflick observa que as células cultivadas se dividem um número finito de vezes antes de
morrer.
1973 Havendo desenvolvido técnicas de corte e reunião do DNA, Cohen e Boyer transferem um gene a
um organismo de outra espécie. Lançado no Brasil o programa de produção de álcool a partir de
biomassa (Proálcool).
1975 A Conferência de Asilomar pede ao National Institute of Health (NIH) que sejam estabelecidas
normas para a regulação dos experimentos com DNA-recombinante, o que acontecerá meses mais tarde.
1978 Genentech, Inc., a primeira empresa biotecnológica, fundada um ano antes por Boyer e Swanson,
obtém a proteína somatotropina (hormônio de crescimento) mediante a tecnologia do DNA-recombinante.
Nasce na Inglaterra Louise Brown, o primeiro bebê de proveta.
1980 A Suprema Corte de Justiça dos Estados Unidos aprova o princípio de patentes para as formas de
vida de origem recombinante. As primeiras patentes são de A. N. Chakrabarty, para um microrganismo
para biorremediação de petróleo, e de H. Cohen e S.Boyer, pelo processo de 1973. Erradicação da
varíola.
1982 A insulina humana de origem recombinante da Genentech, Inc. é comercializada. Uma licença será
obtida mais tarde pela empresa Eli Lilly, que a venderá com o nome de Humulina®. A primeira vacina de
DNA-recombinante para o gado é comercializada na Europa. S. Prusiner descobre os príons.
1986 A Environmental Protection Agency (EPA) dos Estados Unidos aprova a liberação de plantas de
tabaco transgênicas. Um grupo de especialistas em segurança em Biotecnologia da Organização para a
Cooperação Econômica e o Desenvolvimento (OECD) declara que a previsibilidade das mudanças
genéticas obtidas por Engenharia Genética é frequentemente maior que a correspondente às técnicas
tradicionais, e que os riscos associados com organismos transgênicos podem ser avaliados do mesmo
modo que os riscos associados aos outros organismos. Aprovada a primeira vacina biotecnológica para
uso humano, trata-se de Recombivax-HB, contra a hepatite B. alfa interferon para tratamento de câncer
(Biogen)
1987 Advanced Genetic Sciences libera em campo bactérias DNA-recombinante (Frostban) que inibem a
formação de gelo nos cultivos de morango, na Califórnia; a FDA aprova o fator ativador de plasminogênio,
obtido por engenharia genética, para o tratamento de ataques cardíacos.
1989 Com a criação do National Center for Human Genome Research se inicia o mapeamento do
genoma humano. Amgem libera o Epogen para tratamento de
anemia.
1990 Primeira experiência de terapia gênica para uma doença rara (ADA) em uma menina de 4 anos.
Pfizer comercializa Chy-Max TM, uma enzima de origem recombinante para a preparação de queijos.
GenPharm International, Inc. consegue uma vaca transgênica que produz no leite proteínas humanas para
alimentação infantil. A Universidade da Califórnia (UCSF) e a Universidade de Stanford contabilizam 100
patentes relativas ao DNA-recombinante. Aplicação da cultura de células na produção de agentes
bioterapêuticos.
1991 Obtida por engenharia genética a enzima β-glucorcerebrosidase para a doença de Gaucher
(Genzyme). Affymax lança os primeiros chips de
DNA.
1992 Uma técnica, elaborada por cientistas americanos e britânicos, permite testar anormalidades como a
fibrose cística e a hemofilia em embriões in vitro. A FDA declara que os alimentos de origem transgênica
não demandam uma regulação especial. Convenção Internacional sobre Diversidade Biológica (CDB).
1993 Aprovada a utilização do hormônio de crescimento bovino rBGH/rBST, produzido por Monsanto
Co., para aumentar a produção de leite.
1994 Lançamento no mercado do tomate FlavSavr®, que, devido à inativação de um gene, amadurece
na planta.
1997 No Reino Unido, nascem Dolly, uma ovelha clonada, e, meses mais tarde, uma segunda ovelha,
Polly, clonada e geneticamente modificada. Os cultivos transgênicos são introduzidos em vários países.
1998 Contabilizam-se mais de 1.500 empresas de Biotecnologia nos Estados Unidos e mais de 3.000 no
mundo. Células-tronco embrionárias são utilizadas para regenerar tecidos. Sequenciamento do primeiro
genoma animal, o verme Caenorrabditis elegans. Isolada a primeira linhagem de células-tronco
embrionárias humanas. A.Z. Fire e C. Mello descobrem o silenciamento gênico, a resposta antiviral a um
RNA de filamento duplo.
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M.A.MALAJOVICH - BIOTECNOLOGIA (2016) http://bteduc.com
2000 O rascunho do sequenciamento do genoma humano é anunciado simultaneamente por Collins, do
Consórcio do Genoma Humano, e Venter, da Celera Inc. Sequenciados também o genoma da mosca
Drosophila melanogaster, o primeiro genoma de uma planta (Arabidopsis thaliana) e, no Brasil, o de uma
bactéria que ataca os cítricos (Xylella fastidiosa). Protocolo de Cartagena. Moratória relativa ao uso da
tecnologia Terminator, previamente patenteada por Delta&Pine.
2003 Comercialização como mascote, do GloFish, um peixe transgênico que brilha na escuridão,
originalmente criado para detectar poluentes. Clonagem de vários tipos de animais e de espécies
ameaçadas de extinção. O Genoma Humano é completado. O Massachussets Institute of Technology
(MIT) organiza a primeira iGEM (International Genetically Engineered Machine).
2005 Publicação dos resultados do projeto HApMap com o mapa das variações do Genoma Humano.
2006 O grupo de pesquisadores liderado por S. Yamanaka consegue induzir a pluripotencialidade celular
em células somáticas. Criada a Biobricks Foundation, um registro de Partes Biológicas Standard - Open
Source. Mantida a moratória sobre a tecnologia Terminator (Curitiba).
2008 Pesquisadores japoneses desenvolvem a primeira rosa azul, geneticamente modificada. Plataformas
next generation diminuem os custos e aumentam a velocidade do sequenciamento. Uma equipe de
pesquisadores de Harvard cria linhagens de células-tronco para 10 doenças genéticas.
2009 Um grupo internacional obtém as primeiras células-tronco iPS, sem utilizar virus. Comercialização de
soja com alta concentração de ômega 3, o primeiro alimento biofortificado.
2010 Autorizada na União Europeia a comercialização da batata transgênica Amflora (Basf) para uso
industrial. Pesquisadores do Instituto Craig Venter constroem a primeira célula sintética. Desvendado o
genoma do Neanderthal. Primeiro teste clínico com células-tronco.
2012 Publicação dos resultados do Projeto ENCODE descrevendo as regiões ativas do genoma
humano. J.Doudna e E. Charpentier descrevem a técnica CRISPR-Cas de edição de
genomas.
2013 F.Zangh mostra que CRISPR/Cas9 também funciona em células de mamíferos, inclusive
humanas.
2014 Publicado o primeiro rascunho do proteoma humano.
CAPÍTULO2
CÉLULAS E CROMOSSOMOS
UNIDADE ESTRUTURAL
10
CÉLULAS E CROMOSSOMOS Os cromossomos e o nucléolo se encontram no núcleo, que funciona
como um centro de controle celular. A membrana nuclear, um envoltório com poros que separa
o núcleo do citoplasma, permite o intercâmbio de substâncias entre ambos.
Apesar de ter uma organização muito parecida, as células animais diferem das células
vegetais em alguns aspectos (Tabela 2.1). Nas células vegetais encontramos uma parede
celular ao redor da membrana plasmática; o citoplasma contém cloroplastos, onde ocorre a
fotossíntese, e grandes vacúolos, onde se armazenam substâncias e degradam
macromoléculas. Nenhuma dessas estruturas se observa nas células animais; estas têm um
centríolo que falta nas células vegetais.
A célula também é a unidade funcional de um organismo. O citoplasma é uma solução viscosa
onde continuamente ocorrem reações de síntese e degradação de substâncias, consumindo
ou liberando energia. Estas reações constituem o que denominamos metabolismo.
----------------
TABELA 2.1. A função e a distribuição das estruturas celulares
Estrutura FUNÇÃO CÉLULA BACTERIANA CÉLULA ANIMAL
11 CÉLULA VEGETAL
Parede celular Manutenção da forma e
proteção da célula.
Presente ou ausente Ausente Presente
Membrana plasmática Manutenção da
estabilidade do meio intracelular; controle das trocas entre a célula e o meio extracelular.
Presente
Carioteca ou membrana nuclear
Controle do fluxo de substâncias entre o núcleo e o citoplasma.
Ausente Presente
Cromossomo(s) Controle da estrutura e
do funcionamento celular.
Único e circular; apenas DNA.
Múltiplos e lineares; DNA e proteínas.
Nucléolo(s) Formação de ribossomos. Ausente(s) Presente(s)
Centríolos Formação de cílios e
flagelos; participação na divisão celular.
Ausentes Presentes Ausentes
Ribossomos Síntese de proteínas. Presentes
Retículo endoplasmático rugoso Síntese de proteínas.
Retículo endoplasmático liso Síntese de lipídios; armazenamento e inativação de substâncias.
Ausentes Presentes
Complexo de Golgi Secreção celular.
Mitocôndrias Respiração celular
aeróbia.
Vacúolo central Equilíbrio osmótico e
armazenamento.
Ausente Presente
Lisossomos Digestão intracelular.
Ausentes
Presentes Ausentes
Cloroplastos Fotossíntese. Ausentes Presentes
Citoesqueleto Manutenção da forma
celular; contração e ancoragem de organelas.
Ausente Presente
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UNIDADE FUNCIONAL
12 As reações metabólicas são facilitadas por proteínas com atividade
catalítica, denominadas enzimas. Assim como as proteínas estruturais, as enzimas se
sintetizam nos ribossomos, que são pequenos componentes citoplasmáticos, não
membranosos. A estrutura das proteínas depende da informação genética codificada no ácido
desoxirribonucleico (DNA), transcrita no ácido ribonucleico (RNA) e traduzida nos ribossomos.
As semelhanças de estrutura e funcionamento celulares decorrem de uma origem evolutiva
comum, aproximadamente 3,8 bilhões de anos atrás. Os dois tipos celulares que
reconhecemos hoje, as células procarióticas e as eucarióticas, apareceram entre um e um
bilhão e meio de anos mais tarde.
TÉCNICAS LABORATORIAIS
O estudo das células se vê facilitado por um conjunto de técnicas laboratoriais, tais como:
o Técnicas microscópicas que permitem uma visualização detalhada da célula.
- Microscopia óptica, que se utiliza para observar os cortes de tecidos. Geralmente, estes são fixados
(álcool, ácido acético, formaldeído) e tingidos com corantes que reagem com as proteínas ou com os
ácidos nucleicos, aumentando o contraste da imagem.
- Microscopia de contraste de fase, que transforma as diferenças de espessura ou de densidade do
fragmento observado em diferenças de contraste.
- Microscopia fluorescente, que associa anticorpos específicos a um reagente como o PVF (proteína
verde fluorescente de medusa), de forma a marcar as moléculas e visualizar sua distribuição nas células.
- Microscopia confocal, que combina a microscopia fluorescente com a análise eletrônica da imagem,
fornecendo uma imagem tridimensional.
- Microscopia eletrônica, que permite a observação em um plano de cortes tingidos com sais de metais
pesados (microscopia de transmissão) e a observação tridimensional de células (microscopia de
varredura).
- Microscopia de tunelamento, com os diversos tipos de microscópios de varredura por sonda (SPM, do
inglês scanning probe microscope) que, além de fornecer uma imagem de moléculas e átomos, permitem
medições e a manipulação de moléculas e átomos.
- Nanoscopia, baseada na utilização de moléculas fluorescentes, permite a visualização de moléculas
individuais dentro da célula viva (STED, do inglês Stimulated emission depletion microscopy; SMM, do
inglês single-molecule microscopy).
o Técnicas físicas como a centrifugação diferencial (ultracentrifugação, centrifugação em
gradiente)
para separar os componentes celulares para estudos bioquímicos posteriores.
o Técnicas instrumentais que possibilitam a contagem de células e a separação de populações
celulares (cell sorter) ou de cromossomos (flow sorter).
o Técnicas de cultura de células com objetivos diversos.
TODA CÉLULA DERIVA DE OUTRA PREEXISTENTE
Assim como uma planta se forma a partir de outra planta e um animal de outro animal, toda
célula deriva de outra preexistente. Este conceito, enunciado por R. Virchow em 1855, não foi
plenamente
CÉLULAS E CROMOSSOMOS aceito até dez anos mais tarde, quando L. Pasteur mostrou
experimentalmente que a proliferação de microrganismos em um meio orgânico estéril se deve
à contaminação deste com os microrganismos presentes no ar, que, ao encontrar um meio
propício, se multiplicam rapidamente.
Todo organismo multicelular resulta da multiplicação de uma única célula-ovo ou zigoto. As
células embrionárias diferenciam-se, formando centenas de tipos celulares com funções
específicas, cuja integração assegura a unidade do organismo. Nos vegetais, a persistência de
tecidos embrionários totipotentes (meristemas) na planta adulta permite o crescimento e a
regeneração durante a vida toda do organismo. Em condições apropriadas, células
especializadas podem reverter a um estado não diferenciado com a capacidade de regenerar
um organismo completo. Nessa propriedade se fundamenta a propagação de plantas in vitro.
Nos animais superiores, a totipotência se restringe às células do embrião com menos de quatro
dias, que são as únicas capazes de regenerar um organismo inteiro. Contudo, uma vez
passado esse período, algumas células internas pluripotentes do blastócito (células-tronco
embrionárias) conservam a capacidade de originar todos os tecidos do organismo (Figura 2.2).
Algumas células-tronco permanecem nos tecidos adultos, onde se multiplicam durante longos
períodos de tempo sem que ocorra a diferenciação. Estas células têm sido encontradas em
órgãos como a medula óssea e o cordão umbilical, o sangue, a córnea e a retina, a polpa
dentária, o fígado, a pele, o trato digestivo e o pâncreas.
Em determinadas condições fisiológicas, as células-tronco adultas originam células
especializadas de vários tipos que asseguram a manutenção e o reparo do tecido onde se
encontram. Um único tipo de célula-tronco multipotente da medula óssea, por exemplo, gera
todas as células sanguíneas (hemácias, leucócitos e plaquetas). Na pele, células-tronco
unipotentes se diferenciam unicamente na linhagem celular dos queratinócitos.
As células-tronco adultas encontraram rapidamente aplicações terapêuticas promissoras, como
o transplante de células-tronco hematopoéticas em casos de leucemia aguda ou de linfoma.
Não aconteceu o mesmo com as células-tronco embrionárias, cuja utilização está limitada a
pesquisas e estudos laboratoriais.
As células-tronco embrionárias podem ser extraídas de um embrião obtido por transferência de
um núcleo a um ovócito anucleado, ou dos embriões supranumerários congelados nas clínicas
de fertilização assistida. Os dois métodos suscitaram grandes debates éticos em torno de quem
forneceria os ovócitos e do status do embrião.
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Espermatozóides
Massa interna de células Células de pâncreas Óvulo
Células de
medula óssea
Zigoto Cultura de
Blastocisto (corte) células-tronco Células de
5 a 7 dias embrionárias músculo cardíaco
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A polêmica esmoreceu em 2006 com o desenvolvimento, por K. Takahashi e S. Yamanaka,
14
da
tecnologia que permite, a partir de células somáticas, obter células iPS (do inglês, induced
pluripotent stem cells). Com algumas pequenas diferenças na expressão gênica, suas
propriedades são semelhantes às das células-tronco embrionárias. A indução de
pluripotencialidade mediante a inserção de alguns genes em células adultas é um passo
importante, porque acaba com a necessidade de utilizar embriões congelados.
Ainda no terreno laboratorial, a tecnologia de reprogramação celular se desenvolve
rapidamente, aumentando nosso conhecimento sobre o controle genético da diferenciação e
abrindo uma nova senda para a implementação de testes, medicamentos e tratamentos novos.
Entender os mecanismos que controlam o crescimento e a diferenciação celular é um dos
maiores desafios atuais, porque as células-tronco possibilitarão novos tratamentos de
regeneração celular para doenças cardíacas, diabetes e doença de Parkinson.
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FIGURA 2.3: Os cromossomos
Os nucleossomos são pequenas unidades estruturais que se repetem ao longo do cromossomo,
formando a cromatina. Sua condensação explica que 2 m de DNA estejam concentrados em um núcleo
de 5 μm de diâmetro.
A – Morfologia do cromossomo B- Estrutura da cromatina
C. Representação dos cromossomos humanos (Cariótipo) O arranjo segue uma classificação convencional que leva
em conta o tamanho, a posição do centrômero (tracejado no esquema) e o padrão das bandas de cada
cromossomo.
Fonte: http://www.molecularstation.com/molecular-biology- images/data/502/karyotype.png
Genes
Centrômero
Cromátides irmãs
Sem duplicar Duplicado
DNA
DNA enrolado sobre as histonas (nucleossomos)
Nucleossomos compactados (cromatina)
CÉLULAS E CROMOSSOMOS OS CROMOSSOMOS
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A confirmação desta hipótese decorreu dos trabalhos de T.H.Morgan e sua brilhante equipe na
Universidade de Columbia (Nova York), com a mosca da fruta, Drosophila melanogaster. Em
1910, depois de uma série de cruzamentos e de análises estatísticas, Morgan mostrou que a
herança da cor branca do olho do mutante white está associada à transmissão do cromossomo
X, que determina o sexo. Morgan e seus colaboradores identificaram numerosos outros
----------------
o Os genes estão ligados uns aos outros nos cromossomos, formando um determinado número
de
grupos de ligação.
o Os genes de cada par se separam durante a gametogênese, de acordo com a Primeira Lei de
Mendel
e, em consequência, cada gameta fica contendo apenas um conjunto de
genes.
o Entre os elementos pertencentes a cada grupo de ligação, ocorre uma troca ordenada
chamada permuta ou crossing-over, que leva à recombinação dos genes (Figura 2.4). A
frequência da permuta fornece a prova da linearidade dos genes em cada grupo de ligação e
permite determinar sua posição relativa.
Na genética clássica, um caráter pode ser considerado hereditário quando duas variações
fenotípicas podem ser atribuídas a dois alelos de um mesmo gene. Os primeiros mutantes de
Drosophila apareceram por acaso e em uma frequência tão baixa que limitava os estudos de
análise genética. Era necessário encontrar um método que acelerasse a obtenção de mutantes
para poder avançar. Já na década de 1920, H. Muller, um dos integrantes do “grupo das
moscas” liderado por Morgan, iniciou os experimentos de exposição das drosófilas a diferentes
tipos de radiação.
O tratamento gerou em poucas semanas mais de 100 mutantes, um número equivalente à
metade dos mutantes espontâneos encontrados nos 15 anos anteriores. A radiação podia
causar pequenas mutações de ponto, afetando um único gene e originando uma pequena
variação fenotípica. Contudo, os efeitos da radiação também podiam ser letais para a
descendência e/ou produzir vários tipos de alterações cromossômicas: translocações,
inversões, deleções, duplicações.
Muller viu claramente a importância do tratamento com radiação para a obtenção de novas
variáveis vegetais e no melhoramento agrícola; datam dessa época as primeiras mutações em
plantas de milho. A radiação é utilizada como agente mutagênico até os dias de hoje, sendo
uma prática considerada aceitável pelos agricultores orgânicos.
Percebendo o risco que a manipulação indiscriminada da radiação representava para o ser
humano, Muller teve um rol preponderante na conscientização dos trabalhadores da indústria e
da saúde sobre medidas de proteção e participou ativamente nas campanhas antinucleares das
décadas de 1940- 1950.
NATURE vs NURTURE
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o Alelismo múltiplo, quando um gene admite múltiplos alelos; dominantes, recessivos ou
18
codominantes (Sistema ABO, por exemplo).
o Pleiotropia, quando um gene determina diversos caracteres (pelagem e sobrevivência em
ratos,
por exemplo).
o Herança poligênica, quando um caráter está determinado por vários genes de efeito
cumulativo
(altura, cor dos olhos).
o Interação gênica, quando uma característica depende da ação de muitos genes.
Contudo, a variação observada nos seres vivos não se deve exclusivamente à hereditariedade:
o desenvolvimento de um ser vivo resulta de uma delicada inter-relação entre os genes e o
ambiente. No século XX, duas interpretações extremas sobre sua importância relativa
causaram grandes danos à humanidade.
Uma delas é o determinismo genético, base ideológica do eugenismo, movimento que postula
o melhoramento genético do homem mediante a esterilização dos indivíduos considerados
deficientes físicos ou mentais, uma categoria que incluía também os desajustados sociais.
Teve grande influência nos Estados Unidos, na Inglaterra, nos países do Báltico, na Alemanha
e no Japão.
No outro extremo, encontramos o determinismo ambiental, que, negando a influência dos
genes, se afirmou na União Soviética durante o período staliniano. Defendido por T. Lyssenko,
esse preceito foi uma das principais causas do fracasso da agricultura e da escassez de
alimentos sofrida pela população no período posterior à Segunda Guerra Mundial.
Em uma perspectiva histórica, os argumentos utilizados no debate atual sobre os organismos
geneticamente modificados conservariam algumas raízes nessa visão antagônica do século
XX sobre ciência burguesa reacionária vs ciência proletária progressista, ou ainda
capitalismo-direita- determinismo genético vs socialismo-esquerda-ambientalismo.
Para os geneticistas, o fenótipo de um indivíduo é o resultado da interação entre o genótipo e o
ambiente em que este se expressa. Os genes determinam o desenvolvimento dos seres vivos,
mas existem muitos traços que não são determinados exclusivamente pelos genes e
dependem, em maior ou menor grau, de influências ambientais.
CÉLULAS E CROMOSSOMOS COMO AGENTES BIOLÓGICOS
Um dos testes pioneiros de diagnóstico genético está baseado na observação microscópica
dos cromossomos de células somáticas durante a divisão celular (mitose). A identificação se
vê facilitada pela presença de regiões ou bandas reveladas mediante algumas técnicas de
coloração. O número e a estrutura dos cromossomos são analisados e apresentados em um
arranjo (cariótipo) que segue uma classificação convencional (Figura 2.3).
Os testes de diagnóstico genético envolvendo a análise de cariótipos estão amplamente
difundidos na prática médica, sendo facilitados atualmente pela utilização de corantes
específicos para cada par cromossômico.
Como agentes biológicos, as células encontram outras aplicações (Tabela 2.2). Células
vegetais cultivadas in vitro produzem substâncias de alto valor agregado, importantes para as
indústrias alimentar, cosmética e farmacêutica. Também são utilizadas para regenerar plantas.
A multiplicação de vírus em cultivos de células de insetos permite a comercialização de
práticas de controle biológico. A síntese de algumas substâncias importantes para a indústria
farmacêutica, como o fator ativador de plasminogênio, depende do cultivo in vitro de células
animais. Estas também substituem os animais nos testes toxicológicos e são utilizadas na
multiplicação de vírus para a preparação de vacinas. Também possibilitam a produção de
anticorpos.
CÉLULAS E CROMOSSOMOS As células-tronco são ferramentas fundamentais na pesquisa básica
sobre diferenciação celular. Sua utilização tem permitido avanços notáveis nos testes de
toxicidade, na triagem de medicamentos e na modelagem de doenças.
Combinando as técnicas de cultivo celular com o desenvolvimento de materiais biológicos
semelhantes ao colágeno, uma área nova de engenharia de tecidos visa a reparação ou
substituição de tecidos lesionados. Os enxertos de pele artificial, cultivada in vitro, saram
ferimentos e/ou queimaduras em seres humanos.
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TABELA 2.2. As células como agentes biológicos
Indústria alimentar e cosmética (adoçantes, corantes, flavorizantes e Vegetais
aromatizantes).
Indústria farmacêutica (alcaloides e esteroides).
CÉLULAS
Animais e/ou humanas
19 Estudos toxicológicos.
Diagnóstico clínico e aconselhamento genético (cariótipos).
Indústria farmacêutica (produção de anticorpos e vacinas, testes de toxicidade, triagem de medicamentos).
Medicina regenerativa (produção de tecidos de substituição).
CAPÍTULO3
OS MICRORGANISMOS
A DIVERSIDADE MICROBIANA
O termo microrganismos se aplica a um grupo heterogêneo de seres que vivem como células
independentes ou como agregados celulares: bactérias, arqueas, protozoários, algas e fungos
e, também, vírus (Tabela 3.1). Salvo estes últimos, que estão na fronteira entre o vivo e o não
vivo, os encontramos dentro dos três domínios em que se classificam os seres vivos: Bacteria,
Archaea e Eukarya.
Os microrganismos mostram uma diversidade surpreendente de estrutura e modos de vida.
Alguns são procariontes, como as bactérias; outros eucariontes, como os protozoários, as
algas e os fungos. Os aeróbios crescem se houver oxigênio, os anaeróbios, se não o houver.
Formas livres colonizam todos os ambientes terrestres, desde o cume das montanhas até as
profundidades dos oceanos. Mas há também parasitas que crescem à custa de outros seres
vivos, onde encontram abrigo e alimento, e os que mostram diversos graus de dependência de
outros seres vivos.
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TABELA 3.1. Os microrganismos dentro do marco da uma classificação biológica atual
DOMÍNIO BACTERIA ARCHAEA EUKARYA
REINO EUBACTERIA ARCHAEBACTERIA PROTOCTISTA FUNGI PLANTAE ANIMALIA
TIPO DE CÉLULA
Procariótica Procariótica Eucariótica Eucariótica Eucariótica Eucariótica
ESTRUTURA CELULAR
Parede celular com peptidoglicano.
Parede celular sem peptidoglicano.
Parede celular de celulose, em alguns. Presença de cloroplastos, em alguns.
Parede celular de quitina. Ausência de cloroplastos.
Parede celular de celulose.
Presença de cloroplastos.
Sem parede celular nem cloroplastos.
ORGANIZAÇÃO Unicelular Unicelular Uni ou
pluricelular
Pluricelular Pluricelular
NUTRIÇÃO (*) Autotrófica ou
Heterotrófica
Uni ou pluricelular
Autotrófica ou
Autotrófica ou
Autotrófica Heterotrófica Heterotrófica
Heterotrófica
(ingestão)
EXEMPLOS Eubactérias Arqueas Protozoários e
Algas
Heterotrófica (absorção)
Leveduras, Mofos, Bolores e Cogumelos.
Briófitas (musgos), Pteridófitos (samambaias), Gimnospermas e Angiospermas.
Invertebrados e Cordados
* Nutrição
Autotrófica: o organismo produz seu próprio alimento a partir de substâncias inorgânicas e de uma fonte de energia.
Os seres autotróficos podem realizar fotossíntese (para a qual a fonte de energia é a luz solar) ou quimiossíntese
(para a qual a fonte de energia é uma reação química exotérmica). Heterotrófica: o organismo se alimenta de
moléculas orgânicas elaboradas por outros seres vivos por absorção (captação de nutrientes dissolvidos na água),
ou ingestão (entrada de partículas de alimentos não dissolvidas).
BIOTECNOLOGIA: ENSINO E DIVULGAÇÃO (http://bteduc.com)
OS MICRORGANISMOS Os autótrofos sintetizam seus alimentos a partir de dióxido de carbono; os
fotossintéticos utilizam a luz como fonte de energia; e os quimiossintéticos, algumas reações
químicas inorgânicas. Os heterótrofos dependem das moléculas orgânicas elaboradas pelos
autótrofos, que absorvem ou ingerem.
O fato de mantê-los agrupados sob a denominação de “microrganismos” talvez obedeça menos
a uma questão de semelhança que a razões práticas; já que os mesmos métodos básicos de
estudo (isolamento, cultura in vitro, identificação) podem ser aplicados, com pequenas
variações, a esses grupos.
Em condições favoráveis de umidade, acidez e temperatura, as bactérias se multiplicam
rapidamente por fissão celular, produzindo em poucas horas milhões de células ou clones, em
uma das acepções da palavra. Algumas espécies bacterianas também mantêm formas de
reprodução sexuada, possibilitando a recombinação do material genético de plasmídeos. A
transferência horizontal de genes entre bactérias e arqueas ocorre em consequência da
infecção com bacteriófagos ou simplesmente por entrada de um DNA “nu” (Figura 3.1).
AS EUBACTÉRIAS
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superfície e no interior de um organismo. Denominadas microbiomas, essas comunidades
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são
provavelmente necessárias para o hospedeiro. Técnicas avançadas de amplificação e
sequenciamento de DNA permitem identificar os microrganismos que se desenvolvem em
diferentes localizações, seja a pele ou o tubo gastrointestinal.
----------------
FIGURA 3.1. Bactérias, clones e intercâmbio de material genético
Por divisão binária, uma bactéria gera um clone de bactérias semelhantes. O intercâmbio de material
genético entre bactérias responde a três mecanismos, mediados por DNA livre (transformação), por
plasmídeos (conjugação) ou por bacteriófagos (transdução).
A – Formação de clones
B – Mecanismos de transferência lateral ou horizontal de material genético
Conjugação
Transdução
Transformação natural
Bactéria
Bacteriófago Infecção Incorporação do DNA Bactéria infectada com um fragmento exógeno (Lisogenia)
de DNA bacteriano
Bactéria doadora Bactéria receptora
Lise celular Bactéria competente Bactéria transformada
Clones
OS MICRORGANISMOS Em relação ao meio ambiente, a participação bacteriana na reciclagem
dos elementos é fundamental do ponto de vista ecológico. Dela dependem o tratamento de
resíduos e de águas servidas e, também, a eliminação de compostos recalcitrantes
(biorremediação) e a extração de minérios (biolixívia). A fixação de nitrogênio e a produção de
toxinas pesticidas por bactérias contribuem para melhorar as práticas agrícolas.
Devido a suas propriedades metabólicas, muitas eubactérias são utilizadas na produção de
alimentos (laticínios, vinagre, picles e azeitonas) e de aditivos (vitaminas, aminoácidos, gomas
emulsificantes e estabilizantes), na indústria química (acetona, butanol e plásticos
biodegradáveis) e na indústria farmacêutica (vacinas, toxinas e antibióticos). Também são
usadas na produção de enzimas para uso industrial e médico (Tabela 3.2).
Nos últimos anos começaram a ser estudados os biofilmes, comunidades microbianas
protegidas em uma matriz extracelular aderente. Tanto se fixam nos dentes, onde formam a
placa dentária, como na cortina do chuveiro, na pia da cozinha, nos tubos metálicos, nos
sistemas de ar condicionado, ou nos cateteres médicos e equipamentos de hemodiálise. Os
biofilmes são extremamente resistentes aos ataques dos agentes antimicrobianos.
AS ARQUEAS
OS PROTOCTISTAS
OS FUNGOS
O Reino Fungi comporta mais de 100.000 espécies. Os fungos são organismos eucarióticos,
uni ou pluricelulares, com uma parede celular formada por quitina. Todos eles são heterótrofos
e podem se reproduzir sexuada ou assexuadamente.
As leveduras são fungos unicelulares que se desenvolvem em lugares úmidos e se reproduzem
por brotamento. Pertence a esse grupo um dos microrganismos de maior importância
econômica: Saccharomyces cerevisiae, o popular levedo de cerveja (ou, simplesmente,
levedura) utilizado tradicionalmente na preparação de alimentos e de bebidas, assim como na
produção de etanol, vitaminas e outros metabólitos.
Transformada mediante técnicas de engenharia genética, esta levedura produz uma vacina
contra a hepatite B (Tabela 3.4). Entretanto, nem todas as leveduras são benéficas; Candida
albicans, um microrganismo oportunista da flora normal humana pode, em certas condições,
proliferar de maneira anormal, tornando-se patogênica.
Nos bolores e mofos, as células formam um emaranhado de filamentos ou hifas, denominado
micélio. Os mofos crescem rapidamente por fragmentação do micélio e se disseminam
mediante esporos; como Aspergillus niger, um produtor de ácido cítrico; ou como Rhizopus, o
fungo preto do pão, que se expande sobre a superfície deste apesar dos conservantes
acrescentados; ou ainda como Aspergillus flavus, um bolor que ataca as sementes de
leguminosas (amendoim, feijão, soja) e produz uma toxina poderosa, a aflatoxina, causando
graves intoxicações.
Neste grupo também se encontra o Penicillium, um gênero que conta com diversas espécies,
uma das quais é utilizada na indústria farmacêutica, para a produção de penicilina, e outras na
indústria de alimentos, para a maturação de queijos como o Roquefort, o Gorgonzola e o
Camembert.
Os cogumelos são os corpos reprodutivos de muitos fungos. Alguns são venenosos
(Ammanita), outros produzem substância alucinógena, tais como a psilobicina, utilizada por
grupos nativos mexicanos em rituais religiosos, ou a ergotamina, sintetizada quimicamente no
século XX com o nome de LSD (ácido lisérgico). Mas também os há comestíveis como o
Agaricus ou champignon, o Shiitake e o Pleurotus, que são cultivados e comercializados pelo
homem.
Em termos ambientais, um quarto da colheita de frutas e vegetais é destruído pelos fungos;
pragas como a ferrugem do café, o esporão do centeio e a vassoura-de-bruxa afetam
gravemente a
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agricultura. Na Irlanda no século XIX, o Phytophtora infestans atacou a batata, destruindo a
26
fonte
básica de alimentação; a praga causou um milhão de mortes e a emigração forçada de
boa parte da população.
Os liquens resultam da simbiose entre um fungo e uma alga. Alguns são comestíveis,
supondo-se que a Lecanora esculenta seja o maná referido na Bíblia. O grupo não tem sido
muito explorado economicamente, apesar de ter encontrado aplicações como corantes (tintura
de tornassol, um indicador de pH), no tingimento de tecidos e como fixadores na indústria de
perfumes. Também são indicadores de poluição (biomonitoramento).
Em contrapartida, outra associação, desta vez entre um fungo filamentoso e as raízes das
plantas vasculares, os micorrizos, ocupam um lugar de destaque na agricultura em solos
tropicais por facilitarem a solubilização dos fosfatos.
OS VÍRUS, NA FRONTEIRA DO VIVO E DO NÃO VIVO
Os vírus são partículas sem nenhuma atividade metabólica; atravessam os filtros de porcelana
e cristalizam. O seu tamanho varia entre 20 e 300 nanômetros (1 nm = 10-4 mm). Sendo
parasitas obrigatórios de bactérias, plantas ou animais, ao infetar uma célula viva os vírus
passam a utilizá-la para sua própria reprodução.
Apesar de variar muito em complexidade, uma partícula viral típica compreende um ácido
nucleico (DNA ou RNA, como filamento simples ou duplo) dentro de uma capa proteica ou
capsídeo e algumas enzimas que serão liberadas dentro da célula hospedeira: DNA
polimerase no caso dos poxvirus de DNA duplo que se multiplicam no citoplasma: transcriptase
reversa nos retrovírus; RNA replicase nos vírus que se replicam sem passar por DNA. Alguns
vírus que se integram no genoma da célula infectada (bacteriófagos, retrovírus) têm sido
utilizados na engenharia genética como vetores para introduzir genes em uma célula
hospedeira (Figura 3.2).
A entrada do vírus na célula depende do reconhecimento de um receptor na membrana celular
do hospedeiro, que seja específico para o vírus e essencial para a célula. A seguir, vários
cenários são possíveis: morte da célula infectada pelo sistema imune do hospedeiro; lise
celular e dispersão de partículas virais (vírus da influenza, poliovírus); brotação e saída
envelopada; permanência latente (herpesvírus); integração no hospedeiro e eventual
transformação das células em cancerosas (tumores devidos aos vírus da hepatite B e de
Epstein-Barr).
Várias doenças humanas são causadas por vírus (poliovírus, HIV, coronavírus [responsável
pela síndrome aguda respiratória ou SAR] etc.). A destruição de habitats naturais pelo homem
e as mudanças climáticas alteram a dinâmica das populações naturais, em que a relação entre
parasita e hospedeiros está bem estabelecida. O contato dos vírus com outros hospedeiros
possibilita a aparição de algumas doenças emergentes como o Ebola, que assolou
recentemente vários países da África ocidental, e o Zika, introduzido recentemente no Brasil. A
dispersão dos vírus se vê acelerada por fatores culturais e sociais e pelo incremento do
comércio e das viagens internacionais.
Na agricultura, o combate à lagarta da soja com o baculovírus evita a aplicação de 1,2 milhão
de litros de inseticidas por ano nas lavouras brasileiras. Em relação ao meio ambiente, pouco
se sabe do rol dos vírus, e dos microrganismos, nos oceanos. Uma questão relevante,
considerando que 1 litro de água de mar contém pelo menos 10 bilhões de micróbios e 100
bilhões de vírus, e que a maioria não está caracterizada nem identificada. Estudos recentes
destacam sua importância nos ciclos biogeoquímicos e, particularmente, na reciclagem do
carbono; a morte microbiana por infecção viral libera, na cadeia alimentar, de 370 milhões a
630 milhões de toneladas de carbono por ano.
Os príons são pequenas proteínas que podem agir como agentes transmissíveis de algumas
doenças raras do sistema nervoso central. Possivelmente ativam mecanismos do hospedeiro
para produzir proteínas semelhantes que polimerizam, causando danos locais (Kuru, doença
de Creutzfeldt-Jakob).
FIGURA 3.2. Os vírus
A. Estrutura fundamental
B. Morfologia de diferentes vírus
(Os adenovírus e o HIV parasitam células humanas; o bacteriófago, bactérias).
C. A multiplicação de um bacteriófago A infecção da bactéria pelo bacteriófago destrói a célula (ciclo lítico). Em
alguns casos, o DNA viral se integra no cromossomo, sendo transmitido às células filhas; em determinadas
condições, o vírus retoma sua atividade, reiniciando o ciclo lítico.
Bacteriófago Bactéria
Infecção
DNA viral O DNA viral se integra no
cromossomo bacteriano
e se transmite às
células-filhas
Eventualmente Infecção Adesão do bacteriófago
à parede celular e injeção
e injeção do DNA viral CICLO LISOGÊNICO
DNA viral
CICLO LÍTICO Podendo voltar
a se ativar
Lise da bactéria e liberação Multiplicação do DNA viral de novas partículas de vírus
Formação de
novos vírus Síntese de proteínas virais e
destruição do cromossomo bacteriano
Envelope (só nos vírus que se reproduzem por brotação)
Capsídeo (proteína)
Ácido nucleico (DNA ou RNA)
Enzimas virais (polimerases, transcriptase reversa)
OS MICRORGANISMOS HIV Adenovírus Bacteriófago
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AS TÉCNICAS MICROBIOLÓGICAS
28 Diversos tipos de técnicas facilitam o trabalho
laboratorial. A identificação de um microrganismo demanda a observação microscópica e a
utilização de alguns métodos específicos de coloração, complementados por testes
bioquímicos e eventualmente genéticos e imunológicos. Encontrar e manter um microrganismo
no laboratório demanda a aplicação de técnicas bacteriológicas aplicáveis também, com
algumas variações, a fungos e algas.
Cultivar microrganismos exige, além do desenho de um meio nutriente que satisfaça suas
necessidades metabólicas, um cuidado especial com as condições de temperatura e
iluminação em que este será incubado. Os meios nutrientes se empregam líquidos ou
solidificados com ágar, uma substância que lhes confere uma consistência gelatinosa. Os
recipientes mais comuns são tubos de ensaio e placas circulares de vidro com tampa (placas
de Petri); e, para inocular os meios, se utilizam alças de platina e pipetas de diferentes tipos.
A grande dificuldade do laboratório microbiológico está em conseguir a multiplicação do
microrganismo desejado evitando as contaminações, isto é a multiplicação de outros
microrganismos. Trabalha-se em condições assépticas, o que demanda a esterilização prévia
do material de vidro, dos meios nutrientes e dos instrumentos (alças, pipetas) que serão
utilizados. E, na transferência do material biológico, evita-se cuidadosamente toda
contaminação com os microrganismos do ar. Equipamentos especialmente desenhados para
trabalhar sob um fluxo de ar esterilizado ajudam o profissional. Também se evitam as
contaminações na hora de eliminar o material utilizado, a fim de não liberar microrganismos
prejudiciais no ambiente.
Os microrganismos são isolados a partir de amostras de solo, água, ar ou fluidos corporais. As
linhagens obtidas se conservam como culturas puras. Microrganismos com características
diferentes são obtidos induzindo mutações e selecionando as linhagens mutantes. Cada
laboratório mantém os estoques microbianos necessários, que também podem ser solicitados
a centros especializados (Coleções de Cultura).
O número de microrganismos em uma amostra pode ser estimado por diversos métodos:
contagem microscópica, contagem eletrônica, contagem em placa, turvação do meio, massa
seca, conteúdo de nitrogênio ou medidas indiretas da atividade microbiológica.
Em geral, as técnicas clássicas são trabalhosas e muito demoradas para o diagnóstico clínico,
por isso estão sendo substituídas por técnicas miniaturizadas mais rápidas que identificam os
microrganismos com base em algumas reações bioquímicas em kits padronizados. A
tendência geral é de automatização do laboratório microbiológico e de utilização de técnicas
moleculares.
A identificação de bactérias e arqueas pode ser realizada hoje por comparação do RNA
ribossômico. A centrifugação dos ribossomos em gradiente de cloreto de césio separa os
componentes, RNA 5S e RNA 23S na unidade maior e RNA 16S na menor. Modificações na
estrutura primária desta última fração não afetam sua função, de modo que, se uma pequena
parte está altamente conservada, o restante do rRNA de 16S varia entre as espécies, tendo se
transformado em um elemento chave para a classificação.
A Microbiologia Ambiental nos traz uma nova visão das populações microbianas presentes na
natureza. Nossa ignorância é ainda enorme: o número de espécies que conseguimos cultivar
no laboratório não representa mais do que 1 a 5 % da totalidade existente. Dependemos dos
avanços na área da genômica para ampliar nosso conhecimento das comunidades
microbianas do ambiente e para identificar genes de interesse para a indústria
(metagenômica).
BIOSSEGURANÇA E BIOSSEGURIDADE
De acordo com a Organização Mundial da Saúde, o termo biossegurança abrange os
princípios, técnicas e práticas necessárias para evitar a exposição acidental a patógenos e
toxinas assim como sua liberação acidental (Figura 3.3).
Os microrganismos são classificados segundo o risco de causarem danos aos profissionais
que trabalham com eles e à coletividade. Os critérios são: a patogenicidade para o homem, a
virulência, o modo de transmissão, a endemicidade e a existência ou não de uma terapêutica
eficaz. Segundo a Organização Mundial da Saúde, definem-se assim quatro grupos de risco:
o Grupo de Risco (nenhum ou baixo risco individual e coletivo). Um microrganismo que
provavelmente não pode causar doença no homem ou num animal. Exemplos: Bacillus cereus,
Bacillus subtilis, Escherichia coli (algumas linhagens), Lactobacillus sp. o Grupo de Risco 2
(risco individual moderado, risco coletivo baixo). Um agente patogênico que pode causar uma
doença no homem ou no animal, mas que é improvável que constitua um perigo grave para o
pessoal dos laboratórios, a comunidade, o gado ou o ambiente. A exposição a agentes
infecciosos no laboratório pode causar uma infecção grave, mas existe um tratamento eficaz,
além de medidas de prevenção, com risco de propagação de infecção limitado. Exemplos:
Salmonella, Toxoplasma, Schistosoma mansoni, Streptococcus sp, vírus da rubéola, vírus do
sarampo e vírus da hepatite B. o Grupo de Risco 3 (alto risco individual, baixo risco coletivo).
Um agente patogênico que causa geralmente uma doença grave no homem ou no animal, mas
que não se propaga habitualmente de uma pessoa a outra. Existe um tratamento eficaz, bem
como medidas de prevenção. Exemplos: Mycobacterium tuberculosis, Bacillus anthracis e vírus
da imunodeficiência humana (HIV). o Grupo de Risco 4 (alto risco individual e coletivo). Um
agente patogênico que causa geralmente uma doença grave no homem ou no animal e que se
pode transmitir facilmente de uma pessoa para outra, direta ou indiretamente. Nem sempre
estão disponíveis um tratamento eficaz ou medidas de prevenção. Exemplos: vírus Ebola, vírus
Lassa e vírus Marburg.
A classificação anterior é válida exclusivamente para o trabalho laboratorial. A cada grupo de
microrganismos correspondem normas estritas de trabalho, que abrangem desde a arquitetura
do laboratório e as características dos equipamentos até as precauções que devem ser
tomadas pelos profissionais e a forma como o lixo será descartado.
O conceito de biossegurança se complementa com o de biosseguridade, isto é, o conjunto de
medidas de proteção de uma instituição e dos trabalhadores necessárias para evitar a perda, o
roubo, o uso incorreto ou a liberação intencional de patógenos e toxinas (bioterrorismo). Um
exemplo é o envio de carta com antraz depois do atentado das Torres Gêmeas em Nova York
(2001), mas existem outros relacionados com aspectos econômicos, tais como a disseminação
de pragas agrícolas do café, do cacau, da soja etc.
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FIGURA 3.3. Logotipos utilizados como indicação de risco biológico
Biossegurança Biosseguridade
OS MICRORGANISMOS 29
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OS MICRORGANISMOS COMO AGENTES BIOLÓGICOS
30 A Tabela 3.5 apresenta uma
lista dos principais agentes biológicos microbianos e suas utilizações.
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TABELA 3.5. Principais destaques entre os agentes biológicos microbianos
ARQUEOBACTÉRIAS UTILIZAÇÃO
Thermus aquaticus Isolada em uma poça do parque nacional de Yellowstone (Estados Unidos), esta bactéria produz
uma enzima que copia o DNA a uma temperatura alta. Esta enzima permite obter milhões de cópias de um
fragmento de DNA em um processo automatizado que revolucionou a Biotecnologia, chamado PCR (Polymerase
Chain Reaction ou Reação em cadeia da polimerase).
Bactérias metanogênicas Vivem em lugares onde há ausência de oxigênio, seja no tubo digestivo de alguns animais
(gado, cupins) ou nos pântanos. Estas bactérias transformam o acetato resultante da degradação de celulose por
outras bactérias em metano, um gás combustível.
ALGAS UTILIZAÇÃO
Spirulina O seu alto teor proteico, que corresponde a 60% do peso seco, lhe confere um elevado valor nutritivo; as
proteínas representam aproximadamente 2% do peso seco da batata e 6-10% do trigo. Quando da chegada dos
espanhóis, os astecas já preparavam umas bolachas (tecuitlatl) com a Spirulina coletada no lago Texcoco. Na África,
no lago Tchad, ainda hoje ela é coletada e consumida como alimento. Spirulina, assim como Chlorella, são vendidas
em tabletes como complemento nutritivo.
Dunaliella Acumula glicerol em condições de alta salinidade, com o qual consegue evitar a desidratação. Pode
crescer no Mar Morto, sendo também cultivada em tanques ou lagoas, perto do Mar Vermelho, para a extração de
outros produtos metabólicos (glicerol e β-caroteno).
FUNGOS UTILIZAÇÃO
Saccharomy c es cerevisiae Conhecido como levedo de cerveja ou levedura, é utilizado na preparação de alimentos
(pão, biscoitos, fermento de padaria) e de bebidas (cerveja, vinho e destilados), assim como na produção de outras
substâncias de importância industrial (etanol, vitaminas e outros metabólitos). A levedura cresce facilmente em
laboratório. Também pode ser manipulada geneticamente. Nos fermentadores ou biorreatores industriais, onde se
multiplica rapidamente a partir de matérias-primas de baixo custo, ela permanece ativa durante períodos longos e,
ao concluir o processo, pode ser separada por filtração ou centrifugação. Com 12.000.000 de pares de bases e
6.000 genes em 16 cromossomos, Saccharomyces cerevisiae foi, em 1997, o primeiro organismo eucariótico a ter o
seu genoma sequenciado.
Aspergillus Algumas espécies alcançam grande importância industrial, como A.niger, utilizada para
a produção de ácido cítrico ou de enzimas (em linhagens modificadas geneticamente).
Penicillium Algumas espécies são utilizadas na indústria farmacêutica (penicilina) ou indústria de
alimentos (queijos azuis, como o Roquefort e o Gorgonzola; queijo Camembert).
OS MICRORGANISMOS EUBACTÉRIAS UTILIZAÇÃO
Bactérias lácticas Os gêneros Lactobacillus e Streptococcus são responsáveis por vários processos, tais como a
elaboração de queijos e de iogurtes, o envelhecimento dos vinhos, a conservação de alimentos (sauerkraut ou
repolho fermentado, silagem para o gado); a produção de ácido láctico, um aditivo utilizado na indústria de
alimentos como acidulante e estabilizante.
Bacillus thuringiensis Este microrganismo prolifera no solo e na superfície das plantas, sintetizando uma toxina
fatal para as larvas de insetos. Esta é produzida comercialmente há mais de 40 anos, representando 90% das
vendas de inseticidas biológicos e reduzindo a necessidade de aplicação de pesticidas químicos nas lavouras.
Nos últimos anos, o gene codificador da toxina tem sido transferido a plantas (algodão, milho) para que estas
sintetizem diretamente o inseticida.
Streptomyces Além do cheiro característico da terra removida, este gênero de bactérias do solo produz
substâncias antibióticas (estreptomicina, tetraciclina, eritromicina), antifúngicas (nistatina), herbicidas, antitumorais
e supressoras de rejeição a transplantes.
Pseudomonas Várias linhagens são utilizadas na eliminação de poluentes. Algumas quebram moléculas de
hidrocarbonetos, como os existentes nos acidentes de derramamento de petróleo; outras podem remover o
mercúrio aquático.
Agrobacterium tumefaciens Agente patogênico para as plantas dicotiledôneas que desenvolvem um tumor ou
galha quando infectadas. Com a remoção de um gene, perde a capacidade de provocar tumores, conservando a
capacidade infecciosa, utilizada na engenharia genética de vegetais.
Bactérias butíricas Na indústria têxtil, Clostridium butiricum libera as fibras vegetais durante a maceração do
cânhamo e do linho. Clostridium acetobutyricum é utilizado na produção industrial de acetona e butanol.
Clostridium botulinum produz uma toxina poderosíssima; calcula- se que um grama desta bastaria para matar um
milhão de pessoas. A ingestão de conservas contaminadas e mal esterilizadas resulta quase sempre em um
desfecho fatal. Devido a sua ação inibitória da contração muscular, a toxina botulínica é utilizada em
concentrações muito pequenas, para reduzir as rugas e marcas de expressão durante certo tempo (efeito
cosmético).
Escherichia coli Descoberta em 1855, esta bactéria Gram-negativa vive no trato digestivo do homem e de outros
animais. Tem forma de bastonete (0,002 mm de comprimento, 0,0008 mm de diâmetro), 1 a 4 moléculas de DNA e
15.000 a 30.000 ribossomos. Flagelos e pelos permitem que se movimente rapidamente.
Devido à facilidade com que ela pode ser cultivada no laboratório, Escherichia coli
tem se tornado uma ferramenta indispensável para estudos bioquímicos e
genéticos, incluindo a Engenharia Genética. O seu genoma compreende 4,6
milhões de pares de bases que codificam em torno de 4.000 proteínas diferentes.
ENZIMAS E ANTICORPOS
AS PROTEÍNAS
Todos os organismos estão formados por água e moléculas de diversos tipos, inorgânicas e
orgânicas (Figura 4.1). Entre estas últimas, há um grupo de macromoléculas, as proteínas, que
participam em numerosas atividades, cumprindo um papel fundamental para os seres vivos
(Tabela 4.1). Pertencem a este grupo as enzimas, moléculas de ação catalítica, e os anticorpos,
moléculas que participam na defesa do organismo.
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FUNÇÃO EXEMPLOS
Componentes estruturais Queratina do cabelo, colágeno da derme, actina e miosina das fibras
musculares.
Outras Transmissão de informação (hormônios proteicos), participação nos mecanismos de defesa (anticorpos,
citocinas), transporte e armazenamento de pequenas moléculas (hemoglobina).
Outras moléculas
(30%)
Água (70%)
Polissacarídeos(2%)
FIGURA 4.2. Aminoácidos e proteínas
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ESTRUTURA
As proteínas são macromoléculas formadas por 20 aminoácidos diferentes, que se distinguem
por ter, unidos ao átomo de carbono, um grupo amino (básico), um grupo carboxila (ácido) e
um radical variável (Figura 4.2 A). A presença de um carbono assimétrico resulta em duas
formas moleculares (L) e (D) que diferem por suas propriedades ópticas.
Os aminoácidos que compõem as proteínas correspondem à forma (L). A reação de
condensação entre o grupo carboxila de um aminoácido e o grupo amina de outro cria uma
ligação peptídica (Figura 4.2 B). A união de vários aminoácidos forma uma cadeia peptídica
que se caracteriza não só pelo número e tipo de aminoácidos que a compõem, como pela
sequência em que estes se encontram, denominada estrutura primária.
Ao se estabelecerem ligações entre os grupos que formam os enlaces peptídicos, a cadeia
adota uma estrutura regular ou estrutura secundária, geralmente em forma de hélice ou de
folha. As interações entre as cadeias laterais dos aminoácidos causam o dobramento da
proteína, resultando uma configuração espacial que é chamada de estrutura terciária. A forma
final de uma proteína dependerá ainda da associação entre vários polipeptídios, no que se
denomina de estrutura quaternária (Figura 4.2 C).
Quando sintetizada dentro da célula, uma proteína adotará espontaneamente a configuração
ENZIMAS E ANTICORPOS A. Fórmula dos aminoácidos
AMINOÁCIDO 1 AMINOÁCIDO 2
Grupo carboxila Grupo carboxila
Grupo amino Grupo amino
Cadeia lateral Cadeia lateral
B. Formação da união peptídica
Aminoácido 1 Aminoácido 2 União peptídica
C. Estrutura de uma proteína
Aminoácidos Folha pregueada Hélice
(Conformação β) (Conformação α)
α hélice
Folha pregueada
ESTRUTURA PRIMÁRIA ESTRUTURA SECUNDÁRIA ESTRUTURA TERCIÁRIA ESTRUTURA QUATERNÁRIA
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espacial que decorre de sua estrutura primária. Fatores ambientais como o pH, a
34
concentração salina
ou a temperatura podem causar alterações momentâneas ou definitivas
na forma da molécula.
O PROTEOMA
Uma das grandes surpresas reveladas pelos estudos do genoma humano foi encontrar um
número baixo de genes codificadores de proteínas, inferior ao esperado quando considerada a
diversidade de proteínas necessárias para o funcionamento celular. Diferentes tipos de
processamento no núcleo e modificações das proteínas no citoplasma explicam como, a partir
do pequeno número de genes conhecido, se formam todas as proteínas necessárias.
Essas observações chamaram a atenção sobre o proteoma, definido como o conjunto de
proteínas que uma célula, um tecido ou um organismo expressam em um momento dado, sob
determinadas condições. Também deram origem a uma nova disciplina, a proteômica.
Diferente do genoma que permanece essencialmente constante no tempo e em todas as
células do organismo, o proteoma abrange uma infinidade de variantes proteicas, diferentes
em cada célula e a cada momento. Publicado em 2014, o primeiro rascunho do proteoma
humano identificou os produtos correspondentes a 84% dos genes codificadores de proteínas,
que representam 1,5% do genoma.
As aplicações da proteômica abrangem desde os estudos estruturais para elaborar modelos
tridimensionais até a identificação das proteínas associadas a uma organela, descobrindo sua
função e sua relação com outras proteínas. Também compreendem estudos da expressão
quali e quantitativa das proteínas em duas condições, uma normal e a outra alterada por stress
ou doença.
Na área de saúde, as modificações do proteoma em células normais e cancerosas possibilitam
a identificação de biomarcadores para diagnóstico e monitoramento dos tratamentos. Em
agronomia, a proteômica pode esclarecer a inter-relação patógeno-hospedeiro nas infecções
microbianas ou na resposta das plantas aos animais herbívoros. Na área de microbiologia
possibilita o controle de qualidade nas diferentes etapas de produção de alimentos, com
ênfase em aspectos de biossegurança.
AS BASES DE ALGUMAS TÉCNICAS LABORATORIAIS
O estudo das proteínas depende do objetivo a alcançar. Se este for simplesmente a obtenção
de uma proteína para pesquisa ou uso comercial, as etapas a seguir envolverão sua
separação, purificação e medida da concentração e/ou quantidade obtida. As técnicas
bioquímicas utilizadas são clássicas e dependem dos recursos disponíveis. Mas se o objetivo
for a determinação das estruturas primária, secundária e terciaria dessa proteína, as técnicas
são bem mais complexas.
CROMATOGRAFIA
A cromatografia permite separar as substâncias de uma mistura com fins analíticos e
preparativos. Está baseada na migração diferencial das moléculas de uma mistura, colocada
em uma fase móvel, sobre um suporte estacionário ou matriz (Figura 4.3). A separação
obedece a três tipos de mecanismos: o Troca iônica. A matriz está formada por pequenas
partículas carregadas que retêm as moléculas de carga contrária. Como a associação depende
de fatores como o pH e a força iônica da solução, a modificação destes fatores permite
controlar a separação.
o Filtração em gel. A matriz consiste em partículas porosas que separam as proteínas em
função de
seu tamanho, como uma peneira molecular.
o Afinidade. As partículas da matriz estão unidas por ligações covalentes a moléculas
(enzimas, anticorpos) que interagem com a proteína de interesse. Para liberar a proteína retida
na coluna, muda-se o pH ou a concentração salina. Desse modo, consegue-se a proteína
purificada.
FIGURA 4.3. Cromatografia em coluna O processo está baseado na velocidade de migração diferencial
das moléculas proteicas em uma matriz imersa em um solvente.
FIGURA 4.4. Eletroforese Separação dos peptídeos de uma mistura, por migração diferencial em um
campo elétrico.
FIGURA 4.5. Difração de raios X
Amostra Solvente
Matriz
Saída do solvente
Tempo Frações coletadas
Mistura de peptídeos
Cátodo Ânodo
Aplicação de um campo elétrico
Migração e separação dos peptídeos
Raios X
Cristais
Difração dos Raios X
Filme
ENZIMAS E ANTICORPOS 35
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Diferentes modalidades dependem das características da fase estacionária: cromatografia
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em papel,
em camada delgada, cromatografia em gás, cromatografia líquida etc. Na
cromatografia em coluna, a separação das proteínas de uma mistura depende da estrutura da
matriz, sólida e permeável, que se encontra imersa em um solvente. A resolução é maior com
a técnica denominada HPLC (do inglês, High-Pressure Liquid Chromatography), que separa os
aminoácidos de uma mistura.
ELETROFORESE
Uma técnica analítica fundamental é a eletroforese, baseada na migração diferencial de
moléculas ionizadas colocadas em um campo elétrico. Se a carga for positiva, elas migrarão
para o polo negativo ou cátodo e, inversamente, se ela for negativa, a migração ocorrerá na
direção do polo positivo ou ânodo (Figura 4.4). Por outro lado, moléculas de menor peso
molecular migram mais rapidamente que moléculas maiores.
Se uma mistura de peptídeos for colocada em um campo elétrico, eles migrarão de acordo
com sua carga, forma e tamanho, formando cada um deles uma banda característica que será
visualizada mediante um corante ou uma reação química específica. Observe-se que a carga
de um peptídeo resulta da soma das cargas correspondentes aos grupos amina e carboxila
terminais e dos radicais dos aminoácidos que o compõem, e que essa carga varia com o pH do
meio.
A eletroforese permite separar os componentes de uma mistura. Existem numerosas variações
da técnica em função do suporte (papel de filtro, sílica-gel, membranas de acetato de celulose,
gel de agarose, amido ou poliacrilamida), da disposição da cuba (horizontal ou vertical), da
direção da migração (unidirecional ou bidirecional) etc. Na variante SDS-PAGE (do inglês
SDS-Polyacrilamide Gel Electrophoresis), por exemplo, as proteínas desnaturalizadas com
dodecilsulfato de sódio (SDS) migram em um gel de poliacrilamida.
OUTRAS TÉCNICAS
Utilizando métodos de ionização adaptados às moléculas biológicas como o MALDI (do inglês,
Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization), a espectrometria de massa se tornou nos últimos
anos uma ferramenta indispensável na identificação de proteínas, por comparação da massa
molecular com outras de um banco de dados. Também fornece uma análise estrutural da
molécula, indicando a sequência de aminoácidos.
A espectrometria de massa permite estudar o conjunto de proteínas de um organismo
(proteoma) e dissecar as interações das proteínas com outras moléculas. Por ser um método
automatizado e rápido, tem alcançado múltiplas aplicações em farmacologia e diagnóstico.
Os métodos mais adequados para determinar a estrutura tridimensional das proteínas são a
ressonância magnética nuclear (NMR) e a cristalografia de raios X. O primeiro revela a
estrutura atômica tridimensional de uma macromolécula em uma amostra em solução,
aplicando um campo magnético e interpretando o espectro resultante. O segundo fornece uma
imagem digital tridimensional da molécula, baseada na difração dos raios X ao atravessar um
cristal (Figura 4.5).
A bioinformática é uma ferramenta fundamental para a modelagem molecular e a interpretação
dos dados. Existem hoje bases de dados de sequências de proteínas de diferentes organismos
que permitem a identificação de moléculas e a comparação de sequências similares.
AS ENZIMAS
A CATÁLISE ENZIMÁTICA
As reações químicas que ocorrem nos seres vivos dependem da atividade catalítica de um tipo
de proteínas, as enzimas. Estas moléculas agem diminuindo a energia de ativação necessária
de uma reação química, sendo capazes de promovê-las e acelerá-las, sem ser alteradas ou
destruídas.
A molécula de enzima reconhece um substrato específico (S), formando com ele um complexo
molecular ou estado de transição (SE). O encaixe no sítio ativo da molécula facilita a
transformação do substrato no(s) produto(s) da reação (P). A enzima é recuperada no fim da
reação, podendo atuar inúmeras vezes (Figura 4.6). A reação pode ser representada como a
seguir:
A primeira característica das enzimas é a especificidade; uma enzima como a lactase, que
opera sobre a lactose, não agirá sobre a sacarose; duas enzimas que hidrolisem o amido
poderão fazê-lo cortando a molécula de maneira diferente, como a α-amilase e a β-amilase. A
segunda é que, em função de sua origem biológica, as enzimas são biodegradáveis e agem
em condições brandas de temperatura e pH. A ação enzimática depende do pH, da
temperatura, da presença de cofatores inorgânicos (zinco, ferro, cobre) e/ou orgânicos
(coenzimas, muitas das quais são vitaminas). Os metais pesados alteram a estrutura molecular
da enzima de maneira irreversível, impedindo sua ação catalítica (desnaturação). Uma inibição
da atividade enzimática ocorre quando moléculas muito parecidas com o substrato competem
com este para ocupar o sítio ativo da enzima (inibição competitiva), ou quando outras
moléculas se ligam a determinadas partes da enzima, alterando a estrutura espacial e
dificultando o encaixe com o substrato (inibição não competitiva).
OS DIVERSOS TIPOS DE ENZIMAS
Uma forma de classificar as enzimas é pelo tipo de reação que catalisam, acrescentando o
sufixo “ase” ao nome do substrato que é transformado: protease, lactase, amilase, lipase,
celulase. Também se pode adicionar “ase” ao nome da reação catalisada: hidrolase,
oxirredutase. Quando combinadas as duas regras anteriores, mencionam-se o nome do
substrato e da reação catalisada adicionando ”ase” como, por exemplo, em DNA-polimerase.
Porém, algumas enzimas, como a renina ou a trombina, conservam seus nomes tradicionais
(Tabela 4.2).
IMPORTÂNCIA ECONÔMICA DAS ENZIMAS
As enzimas apresentam numerosas vantagens quando utilizadas como agentes biológicos em
processos tecnológicos: especificidade, operação em condições facilmente controláveis e
biodegradabilidade. De um modo geral, os tratamentos enzimáticos diminuem a carga
poluidora dos efluentes industriais.
O mercado se distribui fundamentalmente entre as proteases (59%), as carboidrases (28%) e
as lipases (3%), três grandes conjuntos de enzimas que são utilizadas por diversas indústrias;
os 10% restantes do mercado correspondem às enzimas analíticas e farmacêuticas (Tabela
4.3).
Nos sabões lava-roupas, as enzimas prometem ao consumidor roupas limpas e com aparência
de novas. Um exército constituído por proteases, amilases e lipases digere as manchas difíceis
(sangue, leite, molho de tomate, capim, chocolate, batom etc.), enquanto que as celulases
removem as microfibrilas de celulose das roupas.
S + E SE P + E
ENZIMAS E ANTICORPOS 37
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Não sendo mais necessário esfregar as manchas, a limpeza se realiza com pouco esforço
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e sem
desgaste do tecido; como estas moléculas trabalham a temperaturas baixas, o consumo
de energia é menor. Com mais uma vantagem para o fabricante: as enzimas não representam
mais que uma fração muito pequena do sabão (0,4-0,8%), correspondente a 1% do seu custo.
Em 1988, a empresa Novozymes introduziu no mercado de detergentes a primeira enzima
degradadora de lipídios (Lipolase), obtida por engenharia genética.
As enzimas são empregadas também no acabamento de roupas. Para conseguir o aspecto
usado, os jeans eram lavados com pedras (stone washed), um processo que tinha o
inconveniente de causar a abrasão da maquinaria e o desgaste do tecido. Nos últimos anos, as
pedras foram substituídas por celulases, com resultados satisfatórios.
Os curtumes, em vez de excrementos de cachorro ou de pombo, se valem hoje de enzimas
pancreáticas para amaciar e desengordurar as peles.
Na indústria de alimentos e bebidas, as enzimas participam na produção de adoçantes, de
pão, biscoitos e bolachas e de queijos. Na extração de sucos de frutas, as pectinases
aumentam substancialmente o rendimento do processo, ao liberar o suco retido na pectina das
paredes celulares vegetais. Também facilitam a clarificação de vinhos e cervejas.
----------------
FIGURA 4.6. O mecanismo da atividade enzimática
A. O modelo chave-fechadura
B. A enzima diminui a energia de ativação
Substrato Produtos
Enzima Complexo enzima-substrato Enzima
Reação sem enzima Energia de ativação
(sem a enzima)
Energia de ativação Reagente Reação (com a enzima)
com enzima
Nível inicial de energia
Produtos
Nível final de energia
ENZIMAS E ANTICORPOS As enzimas são utilizadas em desodorantes e artigos para a higiene
bucal. Em dermatologia e cosmética, algumas das aplicações mais frequentes estão no
combate ao envelhecimento (proteases, lipases), no tratamento de acne e de caspa, no
desbridamento e limpeza de ferimentos infetados e na destruição de tecidos necrosados.
Como medicamentos, as enzimas são utilizadas em vários contextos, especialmente em
quimioterapia e nas terapias trombolíticas. E muitos entre os mais corriqueiros testes de
diagnóstico dependem de reagentes enzimáticos. As enzimas permitem a resolução de
misturas de moléculas racêmicas, nas que há duas formas isoméricas, tipo “mão direita” e
“mão esquerda”, com diferente atividade biológica. Desse modo, poderão ser evitados
problemas como o da talidomida, um medicamento que causou o nascimento de numerosos
bebês com deformações congênitas, na década de 1960. A tragédia teria sido consequência
da presença no produto comercial da forma molecular tipo “mão direita”, de ação teratogênica,
junto ao tipo “mão esquerda”, de ação calmante.
Atualmente, estão sendo estudados métodos enzimáticos para eliminar os príons responsáveis
pela denominada “doença da vaca louca”. Também se cogita a utilização de enzimas para
limpar áreas contaminadas com agentes químicos como o gás sarin.
---------------
TABELA 4.2. A classificação internacional das enzimas
CLASSE TIPO DE REAÇÃO CATALISADA EXEMPLOS
Oxirredutases Reações onde se transferem elétrons. Desidrogenases, oxidases.
Transferases Reações onde se transferem grupos químicos. Transaminases, fosforilases.
Hidrolases Reações de hidrólise, isto é, de transferência de
grupos funcionais para a água.
39 Proteases, carboidrases, peptidases, lipases.
Liases Adição de grupos a duplas ligações ou formação de
duplas ligações por eliminação de grupos.
Decarboxilases (renina, trombina).
Isomerases Produção de isômeros por transferência de grupos
dentro de moléculas.
Isomerases, mutases.
Ligases Formação de ligações C-C, C-S, C-O e C-N por
reações de condensação.
Sintetases.
TABELA 4.3. As enzimas como agentes biológicos
AGENTES BIOLÓGICOS APLICAÇÕES
ENZIMAS
Indústria de alimentos e bebidas (clarificação de vinhos e sucos de frutas, substituição da maltagem pelo tratamento
do amido na elaboração de cervejas, fabricação de pão, biscoitos e bolachas, produção de adoçantes, fabricação de
laticínios, suplementação de rações animais).
Produtos de limpeza (detergentes e lava-roupas para a remoção de manchas difíceis, produtos para limpar
dentaduras e lentes de contato).
Indústria têxtil (desengomado de tecidos, acabamento de jeans).
Curtumes (amaciamento de couros).
Indústrias de papel e celulose (branqueamento de polpa de celulose).
Cosmética (produtos de higiene bucal, depilatórios, tratamento da acne e da caspa, cosmocêuticos em geral).
Indústria farmacêutica (reagentes para uso em análises clínicas, nucleases para a manipulação gênica,
bioconversões).
Tratamentos médicos (combate de inflamações, edemas e lesões; dissolventes de coágulos sanguíneos; agentes
terapêuticos em transtornos digestivos).
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OS ANTICORPOS
40 Assim como os animais vertebrados, os invertebrados e as plantas
devem se proteger do ataque de parasitas (vírus e bactérias) e da proliferação de células
estranhas ou aberrantes. Também devem reparar órgãos e tecidos de modo a conservar sua
integridade. Estudos recentes indicariam que todos os seres vivos apresentam algum tipo de
resposta imune inata e adquirida.
Dentro da estratégia de defesa de um vertebrado, os anticorpos são proteínas fundamentais no
reconhecimento do “eu” e na eliminação do “não eu” (antígeno). Uma parte importante da
resposta imune envolve a produção de anticorpos que reconhecem o antígeno,
desencadeando os mecanismos de destruição adequados.
A REAÇÃO ANTÍGENO- ANTICORPO
Os anticorpos são proteínas globulares (PM 150.000 - 200.000) que contém um número
pequeno de grupos carboidrato presentes no soro e em outros fluidos dos vertebrados. Sua
produção é induzida quando o sistema linfoide do indivíduo entra em contato com um antígeno
(Ig = imunoglobulinas).
Existem diferentes tipos de imunoglobulinas que cumprem funções diferentes no organismo,
mas, devido a sua importância como agentes biológicos de importância para as biotecnologias,
neste texto nos referiremos aos anticorpos contidos na fração proteica do soro sanguíneo
caracterizada por eletroforese como γ-globulina.
A molécula de IgG é formada por duas cadeias polipeptídicas leves e duas pesadas em forma
de Y, ao qual se associa um pequeno número de grupos carboidrato. Uma parte da molécula é
constante; as regiões variáveis localizadas nas extremidades dos braços do Y respondem pelo
reconhecimento do antígeno (Figura 4.7).
Em condições experimentais de laboratório, essa reação antígeno-anticorpo ocorre quando os
reagentes se encontram em meio líquido e nas concentrações adequadas, sendo visualizada
como uma precipitação, se os antígenos estiverem dissolvidos em um meio líquido ou em um
gel (poliacrilamida) ou uma aglutinação, se os antígenos estiverem localizados sobre partículas
(hemácias ou bactérias).
A união antígeno-anticorpo ocorre quando um anticorpo encontra no antígeno uma forma
complementar, geralmente parte de uma molécula livre ou ancorada na membrana celular. Um
antígeno pode ter várias destas formas (epítopos ou determinantes antigênicos) e ser
reconhecido por anticorpos diferentes (Figura 4.8).
----------------
FIGURA 4.7. A estrutura da molécula de anticorpo (IgG)
Cadeia leve Sítio de ligação com o antígeno
Cadeia pesada
Região constante
Região variável
A PRODUÇÃO DE ANTICORPOS NO ORGANISMO
As células responsáveis pela produção de anticorpos são os linfócitos B, que se formam na
medula óssea. Depois de um processo de diferenciação que envolve uma série de rearranjos
genéticos, cada linfócito pode reconhecer um único epítopo (Figura 4.9).
Ao encontrar o epítopo específico, o linfócito B prolifera, originando um clone de células
secretoras de anticorpos. Uma vez eliminado o antígeno, algumas células desse clone
permanecerão no organismo como células-memória. Em um contato posterior com o mesmo
epítopo, as células- memória darão início à resposta imune, que será mais rápida e mais
intensa que a primeira.
Apesar de cada linfócito ser capaz de reconhecer um único epítopo, todos os linfócitos podem
reconhecer aproximadamente 108 epítopos diferentes, o que explica a eficiência da resposta
imune.
----------------
FIGURA 4.8. Os anticorpos e o reconhecimento do antígeno
Observe-se que, ao compartilhar estruturas (determinantes antigênicos ou epítopos), alguns antígenos
podem ser reconhecidos por um mesmo anticorpo, dando origem a uma reação cruzada.
FIGURA 4.9. O encontro do linfócito B e do antígeno, e a seleção clonal
ENZIMAS E ANTICORPOS Antígeno 1 Antígeno 2
Anticorpos Anticorpos
Antígeno 3 Antígeno 4
Anticorpos Anticorpos
Antígeno
Linfócitos B de diferente especificidade
Seleção do linfócito específico
Proliferação celular e secreção do anticorpo correspondente
41
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A PRODUÇÃO DE ANTICORPOS NO LABORATÓRIO
Os anticorpos ocupam um lugar de destaque nos testes de diagnóstico clínico, por reunir duas
propriedades que os transformam em uma ferramenta ideal: especificidade e diversidade.
A injeção de animais (ratos, ovelhas, coelhos) com um antígeno induz em pouco tempo a
produção de anticorpos específicos que podem ser separados do soro sanguíneo do animal.
---------------- FIGURA 4.10. A produção de anticorpos no laboratório
. Obtenção de anticorpos policlonais B. Obtenção de anticorpos monoclonais
Injeção de uma mistura de moléculas
Linfócitos B Células de mieloma
Hibridomas
A: A produção de anticorpos policlonais. Recolhe-se o soro de um animal imunizado contra uma mistura
de moléculas entre as quais 42 Cada hibridoma origina um clone
está a molécula X. No soro se encontrarão misturados anticorpos de diferente especificidade, um dos
quais reconhece X.
B: A produção de anticorpos monoclonais. Injeta-se em um animal a mesma mistura de moléculas; dias
mais tarde, extrai-se o baço do animal e fusionam-se os linfócitos B (alguns dos quais reconhecem a
molécula X) com células de mieloma. Os hibridomas são separados, cultivados e testados para identificar
os que produzem anticorpos contra X.
Cada clone origina um único tipo de anticorpo
FIGURA 4.11. Os ensaios imunológicos
A. Associação dos anticorpos com moléculas fluorescentes O anticorpo marcado pode reconhecer diretamente o
antígeno (reação direta) ou reconhecer o anticorpo unido ao antígeno (reação indireta).
B. Associação dos anticorpos com enzimas
O antígeno pode ser reconhecido por um anticorpo associado a uma enzima que reage com o seu substrato,
formando um produto colorido (reação direta). Também pode ser reconhecido por um anticorpo específico, e este por
um anticorpo que reconhece a fração constante do anticorpo. O segundo anticorpo está associado a uma enzima
que, ao reagir com o seu substrato específico, forma um produto colorido (reação indireta).
ENZIMAS E ANTICORPOS REAÇÃO DE IMUNOFLUORESCÊNCIA DIRETA
Antígeno Anticorpo específico do antígeno,
associado a uma molécula fluorescente
REAÇÃO DE IMUNOFLUORESCÊNCIA INDIRETA
Antígeno Anticorpo Anticorpo específico para a fração
específico constante dos anticorpos, associado do antígeno a uma molécula fluorescente
REAÇÃO IMUNOENZIMÁTICA DIRETA
Substrato específico da enzima
Antígeno Anticorpo específico Formação de um produto
do antígeno, associado à enzima colorido
REAÇÃO IMUNOENZIMÁTICA INDIRETA
Substrato específico
da enzima
Antígeno Anticorpo Anticorpo específico para a
específico fração constante dos anticorpos, Formação de um produto do antígeno associado à enzima colorido
43
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Se o antígeno utilizado possuir vários epítopos, no soro extraído se encontrará uma mistura
44
de
anticorpos, chamados “policlonais”, resultantes da ativação de vários clones de linfócitos B,
cada um dos quais reconhece um dos epítopos do antígeno. Observe-se que, além dos
anticorpos específicos, o soro também terá anticorpos contra eventuais impurezas do antígeno,
e anticorpos contra outros antígenos aos que o animal esteve exposto anteriormente. Em
consequência, a purificação de um soro será um processo longo e complexo a ser repetido a
cada extração de sangue do animal. Contudo, reagentes de laboratório deste tipo foram
utilizados normalmente até a década de 1980.
Não é possível cultivar separadamente os linfócitos porque sobrevivem pouco tempo in vitro. A
obtenção de clones que sintetizem anticorpos específicos contra um único epítopo
(monoclonais) só se tornou possível com o desenvolvimento da tecnologia de hibridomas (G.
Kohler e C. Milstein, 1975). Um hibridoma resulta da fusão entre um linfócito B e uma célula
cancerosa de mieloma. Reunindo as propriedades de ambas as células, cada hibridoma é
capaz de sintetizar um único tipo de anticorpo (monoclonal) e de se multiplicar indefinidamente
no laboratório, seja em cultivo de tecidos, seja na cavidade do peritoneu de um animal
hospedeiro (Figura 4.10).
A UTILIZAÇÃO DOS ANTICORPOS
Os anticorpos monoclonais encontraram imediatamente aplicações, substituindo praticamente
os anticorpos policlonais, tanto na purificação de biomoléculas e células como nos testes de
diagnóstico clínico ou ambiental ou no controle de qualidade dos alimentos.
Anticorpos específicos fixados nas partículas de uma coluna de afinidade permitem separar
moléculas de uma mistura que circule por ela. Outra utilização extremamente engenhosa está
na separação de populações celulares em um aparelho denominado cell sorter. As células são
marcadas com anticorpos ligados a uma molécula fluorescente; ao passar através de raios
laser, adquirem cargas elétricas, sendo separadas mediante uma placa defletora do
equipamento.
A visualização da reação entre o antígeno e o anticorpo se vê facilitada quando o anticorpo
recebe alguma marcação direta, fluorescente ou radiativa, ou indireta, por associação com
uma enzima que, em presença do substrato correspondente, forma um produto colorido. No
Western blotting, por exemplo, um anticorpo marcado reconhece a presença de uma proteína
determinada em uma amostra, após eletroforese e transferência a uma membrana de
nitrocelulose.
Associados a uma molécula radiativa, os anticorpos são utilizados na dosagem de substâncias
presentes nos fluidos corporais, sendo quantificada a radioatividade por exposição de uma
placa sensível. Em cortes histológicos, o antígeno é localizado pelos anticorpos acoplados a
uma molécula fluorescente que possa ser identificada microscopicamente (Figura 4.11).
A obtenção de anticorpos contra a fração constante da molécula de anticorpos humanos
representa um avanço considerável na produção de reagentes para o diagnóstico clínico. Nos
ensaios imunoenzimáticos como o teste ELISA (do inglês, Enzyme-linked Immunosorbent
Assay), que detecta anticorpos específicos no soro humano e tem numerosas aplicações em
diagnóstico, utilizam-se os anticorpos acoplados a uma enzima que reage com o seu substrato,
formando um produto colorido (Figura 4.11).
A utilização de anticorpos monoclonais com fins terapêuticos demorou muito mais que o
esperado. Sendo produzidos por células de camundongo ou de rato, eles são reconhecidos
como estranhos quando injetados no homem, formando-se complexos imunes que lesionam
gravemente os rins.
A fim de evitar essas reações, começaram a ser elaborados anticorpos monoclonais
quiméricos (33% de proteína animal) e humanizados (10% de proteína animal). Estes
conservam parte das sequências animais, especialmente nas partes que reconhecem o
antígeno, sendo o restante da molécula substituído por sequências humanas. A obtenção de
anticorpos monoclonais humanos mediante técnicas de engenharia genética abre novos
caminhos para o diagnóstico e o tratamento de doenças (Tabela 4.4).
TABELA 4.4. Os anticorpos como agentes
.
biológicos
Imunoterapias.
ENZIMAS E
AGENTES BIOLÓGICOS APLICAÇÕES
ENZIMAS E
ANTICORPOS 45
ANTICORPOS 45 ENZIMAS E
Anticorpos
ANTICORPOS 45
Purificação de moléculas.
Reagentes de laboratório.
CAPÍTULO5
OS ÁCIDOS NUCLEICOS
OS ÁCIDOS NUCLEICOS
Embora descobertos em 1869, por F. Miescher, no pus das bandagens de ferimentos, o papel
dos ácidos nucleicos (DNA e RNA) na hereditariedade e no controle da atividade celular
começou a ser esclarecido apenas em meados do século XX.
O ácido desoxirribonucleico (DNA) carrega em sua estrutura as instruções necessárias
para a construção de um organismo, direcionando o desenvolvimento de suas características
bioquímicas, fisiológicas, anatômicas e, inclusive, algumas das comportamentais. Nos
cromossomos o DNA se encontra associado a diversas proteínas de importante ação
regulatória. O ácido ribonucleico (RNA) pode ser encontrado tanto no núcleo como no
citoplasma.
As células procarióticas contêm um cromossomo circular de DNA e uma ou duas
moléculas adicionais de DNA extracromossômico, denominadas plasmídeos. Nas células
eucarióticas, os cromossomos estão formados por moléculas lineares de DNA. O DNA está
localizado principalmente dentro do núcleo celular, mas há também DNA em algumas
organelas, como os cloroplastos e as mitocôndrias.
Do ponto de vista químico, os ácidos nucleicos (ácido ribonucleico e desoxirribonucleico)
são macromoléculas formadas por unidades chamadas nucleotídeos, unidos por ligações
químicas covalentes (Figura 5.1). Um nucleotídeo resulta da associação de três tipos de
elementos: uma molécula de ácido fosfórico, um açúcar de cinco carbonos (ribose ou
desoxirribose) e uma base cíclica nitrogenada: adenina, citosina, guanina, timina ou uracila. Da
união dos nucleotídeos entre as extremidades 5' e 3', formam-se as cadeias de
polinucleotídeos.
A DUPLA HÉLICE
47
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FIGURA 5.2. A molécula de DNA
Na molécula de DNA, o pareamento das bases ocorre sempre entre uma purina e uma pirimidina:
adenina e timina ou uracila; guanina e citosina. Na duplicação, a síntese de duas moléculas semelhantes
permite que cada célula receba uma cópia do material genético, com as instruções necessárias para a
construção e funcionamento do indivíduo. Observe-se que o processo de duplicação envolve numerosas
enzimas, sendo bem mais complexo do que está representado.
TABELA 5.1: O código genético
Abreviaturas: Asp = Ácido Aspártico; Glu = Ácido Glutâmico; Ala = Alanina; Arg = Arginina; Asn = Asparagina; Cys = Cisteína; Phe
= Fenilalanina; Gly = Glicina; Gln = Glutamina; His = Histidina; Ile = Isoleucina; Leu = Leucina; Lys = Lisina; Met = Metionina; Pro =
Prolina; Ser = Serina; Tyr = Tirosina; Thr = Treonina; Trp = Triptófano; Val = Valina.
PRIMEIRA BASE
48
SEGUNDA BASE URACILA (U) CITOSINA (C) ADENINA (A) GUANINA (G) TERCEIRA BASE URACILA (U)
(U) (C) (A) (G)
CITOSINA (C)
Phe
Ser
Tyr
Cys Phe
Ser
Tyr
Cys Leu
Ser
Stop
Stop Leu
Ser
Stop
Trp
(U) (C) (A) (G)
ADENINA (A)
Leu
Pro
His
Arg Leu
Pro
His
Arg Leu
Pro
Gln
Arg Leu
Pro
Gln
Arg
(U) (C) (A) (G)
GUANINA (G)
Ile
Thr
Asn
Ser Ile
Thr
Asn
Ser Ile Thr
Lys
Arg Met
Thr
Lys
Arg Val
Ala
Asp
Gly
(U) Val
Ala
Asp
Gly
(C) Val
Ala
Glu
Gly
(A) Val
Ala
Glu
Gly
(G)
Extremidade 3’ Nucleotídeo
Nucleotídeo Extremidade 5’
A DUPLA-HÉLICE DE DNA A DUPLICAÇÃO DO DNA
A tabela 5.1 mostra quais aminoácidos correspondem às diferentes trincas de bases ou códons
de mRNA. Alguns são codificados por uma única trinca, como o triptófano (UGG) ou a
metionina (AUG); outros admitem vários códons que geram sinonímia como, por exemplo, a
prolina (CCU, CCC, CCA, CCG). O início da sequência é sinalizado por AUG, o códon
correspondente a metionina, sendo este aminoácido removido posteriormente; o fim da
sequência é sinalizado por UAA, UAG ou UGA, três códons que significam stop.
Mudanças na sequência de bases do DNA podem ter como consequência a substituição de um
aminoácido por outro. No exemplo da figura 5.3, se GUG for substituído por CGU, no peptídeo
correspondente a valina será substituída por leucina. Mas, em função da sinonímia do código,
se a trinca GUG for substituída por GUA ou GUC, o aminoácido codificado continuará sendo a
valina. Perdas ou adições de uma base modificam o resto da sequência do peptídeo.
A frequência com que ocorrem estas pequenas mudanças aumenta em presença de alguns
agentes químicos e físicos como a luz ultravioleta e os raios X.
A EXPRESSÃO GÊNICA
O FLUXO DA INFORMAÇÃO GENÉTICA
A informação codificada no DNA é transcrita em uma molécula mensageira que a leva até os
ribossomos onde, após a tradução da linguagem dos ácidos nucleicos à linguagem das
proteínas, será montado o peptídeo correspondente. Deste modo, se estabelece na célula um
fluxo da informação genética que segue em uma direção única: do DNA ao RNA, do RNA ao
peptídeo (Figura 5.3).
----------------
FIGURA 5.3. O fluxo da informação genética
DNA Filamento codificador
Filamento molde
TRANSCRIÇÃO E PROCESSAMENTO
r RNA mRNA tRNA + aminoácidos
Ribossomo
TRADUÇÃO
Transporta os aminoácidos Onde ocorre a síntese e os coloca no lugar adequado
Peptídeo
OS ÁCIDOS NUCLEICOS 49
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Uma exceção a esta regra é a dos retrovírus, cujo material hereditário é RNA e que contam
50
com uma
enzima (transcriptase reversa) que lhes permite transcrever a informação no sentido
RNA→DNA.
Na síntese de proteínas intervêm, basicamente, um RNA codificador (RNA mensageiro ou
mRNA) e dois RNAs não codificadores, o RNA ribossômico (rRNA) e o RNA de transferência
(tRNA).
As células procarióticas e eucarióticas apresentam algumas diferenças em relação às etapas
da síntese de proteínas e aos mecanismos de regulação correspondentes (Figura 5.3). No
entanto, em ambos os tipos de organismos, a informação genética codificada no DNA é
transcrita no mRNA e traduzida no ribossomo com a participação dos tRNAs. O produto final é
um peptídeo.
CÉLULAS PROCARIÓTICAS
Uma bactéria pode contar com aproximadamente 2.500 genes; nem todos funcionando
simultaneamente. Se houver lactose no meio (e faltar glicose), as bactérias sintetizarão
aquelas enzimas que possibilitem sua utilização. E se faltar o aminoácido triptófano no meio,
produzirão os vários tipos de enzimas necessárias para sintetizá-lo.
----------------
FIGURA 5.4. A organização e regulação dos genes nas células procarióticas
O funcionamento do óperon depende da função exercida pelos genes (degradação ou síntese). Por isso, a presença
de lactose induz a transcrição do óperon lac, sendo sintetizadas várias enzimas necessárias para degradá-la; em
ausência de lactose, o óperon deixa de funcionar. Já no óperon Trp, a presença de triptófano reprime a transcrição
das enzimas necessárias para sintetizar esse aminoácido.
FIGURA 5.5. A organização e regulação dos genes nas células eucarióticas
As sequências sinalizadoras UTR não são traduzidas.
Gene
Sequências reguladoras Sequências reguladoras promotoras da transcrição finalizadoras da transcrição
UTR UTR
DNA
Unidade de transcrição Inclui as sequências iniciais e finais, os éxons e os íntrons
Início da transcrição Fim da transcrição
Óperon
Gene Gene Gene regulador promotor operador Genes estruturais
Gene 1 Gene 2 Gene 3
Sequência transcrita
Fim da transcrição
Em alguns óperons, o produto do gene regulador bloqueia a entrada da RNA-polimerase no operador; em outros a
desbloqueia
OS ÁCIDOS NUCLEICOS Isso se vê facilitado pela agrupação dos genes correspondentes em
baterias (óperons), que são ligadas ou desligadas em conjunto (Figura 5.4), permitindo que a
célula se adapte rapidamente e com economia de recursos às condições ambientais.
O processo de “ligar e desligar” envolve três regiões anteriores à sequência codificadora: o
promotor, o operador e o regulador. Para iniciar a síntese do mensageiro, a enzima
RNA-polimerase deve encaixar no promotor, de onde começará a se deslocar ao longo do
gene. O deslocamento depende de proteínas sintetizadas pelo gene regulador, que agem no
operador de modo a abrir ou bloquear a passagem. Este sistema regula a indução ou
repressão da transcrição da sequência codificadora.
Uma bactéria pode contar com aproximadamente 2.500 genes; nem todos funcionando
simultaneamente. Se houver lactose no meio (e faltar glicose), as bactérias sintetizarão aquelas
enzimas que possibilitem sua utilização. E se faltar o aminoácido triptófano no meio, produzirão
os vários tipos de enzimas necessárias para sintetizá-lo. Isto se vê facilitado pela agrupação
dos genes correspondentes em baterias (óperons), que são ligadas ou desligadas em conjunto
(Figura 5.4), permitindo que a célula se adapte rapidamente e com economia de recursos às
condições ambientais. Na célula procariótica, além dos genes funcionarem em bloco, a síntese
proteica começa quando o mRNA está ainda sendo transcrito, de maneira que a transcrição e a
tradução são simultâneas. Uma sequência específica que não é traduzida indica o sítio de
união ao ribossomo.
CÉLULAS EUCARIÓTICAS
As bactérias não são as únicas que ligam e desligam os seus genes, mas, salvo em
nematódeos, não foram achados óperons nas células eucarióticas; os genes responsáveis por
uma sequência de reações metabólicas se encontram dispersos em um ou em vários
cromossomos.
O controle da transcrição começa na compactação do cromossomo em redor das histonas e na
metilação de algumas bases, podendo dificultar o acesso da maquinaria de transcrição ao
DNA. Esta inclui fatores de ativação, fatores de transcrição e proteínas reguladoras, algumas
das quais dependem de outras sequências, estimuladoras e inibidoras, distantes do gene em
até vários milhares de bases (Figura 5.5). Fatores externos influenciam a expressão gênica nas
células somáticas. No entanto, estudos recentes indicam que esses efeitos epigenéticos podem
gerar alterações nos gametas, sendo transmitidos às seguintes gerações.
A
TRANSCRIÇÃO
O PROCESSAMENTO DO RNA
TRANSCRITO
51
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(éxons) formarão o RNA mensageiro que sairá do núcleo na direção do citoplasma. O número
e o tamanho das sequências intercalares variam em diferentes genes. As consequências
biológicas deste mecanismo são importantes. Basta um número pequeno de genes para
codificar numerosas proteínas que serão sintetizadas utilizando as vias alternativas de “corte e
reunião”. Também permite que um único gene se expresse de maneira diferente em diversos
tecidos. O corte e reunião dos fragmentos não é a única modificação do RNA transcrito; este
recebe um revestimento inicial ou cap (7-metilguanosina) que o dirigirá ao ribossomo, e uma
cauda de poli(A) que lhe dará estabilidade na sua viagem até a maquinaria de tradução.
A síntese proteica se inicia depois do mRNA atravessar a membrana nuclear e migrar para o
citoplasma. Assim como a transcrição, a tradução envolve a participação de numerosas
enzimas e proteínas reguladoras.
Algumas moléculas de mRNA levam sequências sinalizadoras que as dirigem até os
ribossomos associados ao retículo endoplasmático, sendo as proteínas sintetizadas secretadas
fora da célula. Outras moléculas de mRNA serão traduzidas nos ribossomos livres no citosol,
sendo as proteínas resultantes utilizadas no mesmo lugar ou nas organelas celulares.
----------------
Citoplasma
DNA Núcleo
DNA
Gene Proteínas
TRANSCRIÇÃO
hnRNA
PROCESSAMENTO
mRNA
mRNA
Na célula eucariótica, o
TRADUÇÃO
processamento envolve a adição
Proteína de um revestimento inicial e de
uma cauda de poli-A, além dos
mecanismos de corte e reunião
52
OS ÁCIDOS NUCLEICOS O mRNA reconhece o ribossomo mediante uma sequência específica, e a
associação entre ambos dá início à síntese peptídica. Cada tRNA carrega o aminoácido
correspondente até o ribossomo, onde a complementariedade entre seu anticódon e um dos
códons do mRNA garante que este coloque o aminoácido no lugar adequado na sequência.
Existem vários mecanismos de regulação. Um deles envolve a ação de proteínas associadas
ao complexo ribossômico, outro determina variações na vida média do mRNA e a tradução do
mRNA por vários ribossomos ao mesmo tempo.
O peptídeo sintetizado passará por diversas modificações e associações, até se constituir no
produto final ativo, uma proteína com uma estrutura quaternária determinada. Uma visão geral
comparativa da síntese proteica em células eucarióticas e procarióticas (Figura 5.6).
A DIVERSIDADE EXISTENTE
Na síntese proteica, o mRNA carrega uma parcela de informação genética do DNA até os
ribossomos, estruturas celulares formadas por rRNA e proteínas onde ocorre a síntese
proteica. Os aminoácidos são carregados por um dos 61 tipos de tRNA, cada um dos quais é
capaz de reconhecer simultaneamente um aminoácido e um códon do mRNA. Tanto o rRNA
como os tRNA são transcritos a partir de genes não codificadores de proteínas.
A participação dos RNAs na regulação da expressão gênica é bem conhecida. As ribozimas,
por exemplo, são RNAs com capacidade catalítica que desempenham funções na replicação e
no processamento do mRNA, sem necessidade de nenhum componente proteico. A existência
deste tipo de moléculas é um argumento a favor da existência de um mundo de RNA prévio à
aparição do DNA e das proteínas. Outras moléculas de RNA, os riboswitches, agem como
sensores afetando a expressão gênica, em resposta a fatores ambientais ou metabólicos.
A atividade regulatória do RNA é possível devido à sua estrutura molecular, que permite o
pareamento com uma molécula de sequência complementar. E também a suas propriedades
de se associar a proteínas e de desenvolver uma atividade catalítica.
Nos últimos anos começou a ser desvendada a existência de pequenas moléculas de RNA não
codificadoras (sRNA, do inglês small RNA), que regulam as atividades celulares. Em
procariontes, os sRNAs determinam modificações metabólicas e estão envolvidos na defesa
contra os vírus.
Em eucariontes, a variedade é muito ampla: os pequenos RNAs nucleares (snRNA)
associados a proteínas participam no mecanismo de corte e reunião e na remoção dos íntrons;
os pequenos RNAs nucleolares (snoRNA) processam o RNA ribossômico no nucléolo.
Originados a partir de diferentes moléculas precursoras, os microRNAs (miRNA) participam na
repressão do mecanismo de tradução.
Novos tipos de RNA, de sequência mais longa (lncRNA, do inglês, long non coding DNA)
cumprem funções regulatórias, como a inativação do cromossomo X. Menos clara por enquanto
é a função dos RNAs transcritos antisense e dos transcritos a partir de pseudogenes, que
sempre foram considerados não funcionais.
53
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desenvolvimento de
C. elegans, onde pequenas moléculas de RNA resultantes da clivagem de
RNAs transcritos inibem a tradução de diversos mRNAs.
Os microRNAs (miRNAs) são pequenas moléculas bifilamentares de 21 a 25 pares de
nucleotídeos que agem como silenciadores de mRNA, regulando a tradução. Sua descoberta,
mostrando como esses miRNA controlam a expressão dos genes, valeu a A. Fire e C. Mello o
Prêmio Nobel de Medicina de 2006. Estima-se que existiriam entre 300 e 500 miRNAs
regulando pelo menos a quarta parte dos genes humanos.
Nos últimos anos, esse fenômeno de silenciamento gênico tem se transformado em uma
importante ferramenta de pesquisa. Sintetizadas no núcleo, as moléculas de miRNA de
filamento duplo são clivadas por enzimas no citoplasma, formando pequenos fragmentos de
aproximadamente 20 nucleotídeos. A associação entre um pequeno fragmento de RNA e um
complexo proteico (RISC, do inglês RNA-induced silencing complex) desencadeia a
degradação de um dos filamentos. O filamento restante permanece associado a RISC,
podendo parear com qualquer molécula de RNA, parcial ou totalmente complementar, e causar
sua degradação (Figura 5.7). Trata-se de uma forma de controle da expressão gênica na célula,
porque o miRNA afeta a tradução de qualquer RNA homólogo.
Por outro lado, do ponto de vista biológico, o fenômeno de silenciamento constituiria
também uma reação de imunidade inata das bactérias à infecção por vírus de RNA. O
mecanismo de ação dos RNAs envolvidos é semelhante ao do miRNA, porque utilizam a
mesma maquinaria enzimática da célula.
Contudo, se no caso do miRNA de origem endógeno, descrito anteriormente, a molécula
precursora originava uma única molécula interferente, no caso da infecção por RNA exógeno
formam-se vários tipos de molécula interferente.
----------------
O silenciamento gênico é uma forma de controle da expressão gênica na célula, porque o miRNA
interfere na tradução de um mRNA homólogo; também é uma forma de resistência à infecção viral.
54
OS ÁCIDOS NUCLEICOS O fenômeno existe em bactérias, plantas, drosófilas, camundongos e em
seres humanos. Ferramenta poderosa no laboratório, a injeção na célula de um RNA artificial
de sequência parcialmente semelhante à do DNA de um gene determinado permite silenciar
parcialmente sua expressão, de maneira transiente e sem danificar a célula.
Espera-se que algumas das primeiras aplicações do knockdown por silenciamento de mRNA
estejam relacionadas com testes clínicos e com a repressão de genes implicados no câncer, na
degeneração macular devida à idade e na amiloidose.
O GENOMA HUMANO
O MAPEAMENTO DO GENOMA
O termo genoma designa o conjunto completo de cromossomos haploides que contém toda a
informação genética de um indivíduo. Na espécie humana, o genoma nuclear compreende as
24 moléculas de DNA que formam os diferentes cromossomos (22 autossômicos, X e Y).
Devido à presença de DNA nas mitocôndrias, existe também um genoma mitocondrial de
herança exclusivamente materna, que conta com 37 genes, incluindo os genes codificadores
de tRNA e rRNA utilizados na síntese proteica dentro dessa organela.
Em 1990, teve início o Projeto Genoma Humano (HGP, do inglês Human Genome Project), um
dos projetos científicos mais ambiciosos já realizados, envolvendo pesquisadores de mais de
18 países na tarefa de mapear e sequenciar o DNA humano e também o de outros
organismos.
O projeto encontrou grandes resistências, em parte devido a seu custo faraônico comparável
aos dos projetos Manhattan ou Apolo, em parte pelas consequências que poderia trazer para a
sociedade. A resposta ao público foi o lançamento como parte integral do projeto do programa
The Ethical, Legal and Social Implications (ELSI) Research Program de pesquisa básica e
aplicada sobre as implicações éticas, legais e sociais dos estudos sobre o genoma para os
indivíduos, as famílias e as comunidades. Paralelamente ao mapeamento do genoma humano,
milhares de outros organismos (microrganismos, plantas e animais) foram parcial ou totalmente
sequenciados.
Em junho do ano 2000, o International Human Genome Sequencing Consortium e a Celera
Genomics, uma empresa privada norte-americana, anunciaram simultaneamente ter
completado o primeiro rascunho do genoma humano. Os resultados foram publicados em
fevereiro de 2001, nas revistas Nature e Science. Em abril de 2003, cinquenta anos depois da
descoberta da dupla hélice, o Consórcio anunciou ter completado 99% do mapeamento. Os
seus resultados estão armazenados em bancos de dados públicos que podem ser acessados
via Internet. As principais conclusões podem ser resumidas da seguinte forma:
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o Independentemente de nossa origem étnica, compartilhamos com os outros seres
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humanos 99,9%
da sequência gênica. o As diferenças entre os seres humanos se devem a
variações de uma base em 3.000.000 de pontos dentro e fora dos genes. Estas variações são
denominadas polimorfismos de um nucleotídeo único ou SNPs (do inglês, single nucleotide
polymorphisms). Os SNPs podem dar informações sobre a base genética da susceptibilidade a
uma série de doenças ou servir como marcadores das mesmas (doença cardiovascular,
diabetes, artrite e cânceres). o Em vários genes foram encontradas sequências associadas a
doenças (câncer de mama, cegueira,
surdez, doenças musculares). Vários países de América Latina (Argentina, Brasil, Chile e
México) desenvolveram ou participam em projetos de genômica. De um modo geral, esses
projetos envolvem parcerias entre instituições públicas e privadas, sendo beneficiados por
acordos internacionais com países desenvolvidos (Estados Unidos, França, Alemanha) ou por
redes de cooperação inter-regionais (Brasil, Argentina, Chile, Uruguai e Paraguai). Um dos
primeiros êxitos foi o sequenciamento por pesquisadores brasileiros da bactéria Xylella
fastidiosa, causadora da praga do amarelinho das videiras (2000).
OS AVANÇOS POSTERIORES
Nos últimos anos, os custos e o tempo necessários para sequenciar um genoma diminuíram
extraordinariamente. Atualmente, muito do trabalho feito por robôs e computadores está
altamente automatizado, e a informação está armazenada em grandes bancos de dados,
acessíveis pela Internet. O desenvolvimento da Bioinformática, um conjunto de novas
tecnologias que utiliza métodos computacionais e matemáticos para analisar a informação, tem
sido fundamental para o progresso dos estudos sobre os genomas. Muitos dos estudos atuais
não são mais feitos in vivo nem in vitro, mas in silico.
Ao Projeto Genoma sucederam outros projetos, alguns deles concluídos e outros em
andamento, desenvolvidos por redes de cooperação internacional. O projeto HapMap (do
inglês, Map of Human Genetic Variation) publicou um catálogo das variações genéticas que
ocorrem nos seres humanos.
O projeto ENCODE confirmou ser pouco mais de 20.000 o número de genes codificadores de
proteínas e descobriu que 80% do DNA restante cumpre alguma função reguladora, de modo
que não pode ser considerado “lixo”.
O Projeto Epigenoma Humano irá identificar, catalogar e interpretar os padrões de metilação
dos genes humanos em cada tecido. Como estes padrões mudam em resposta a fatores
exógenos, o epigenoma pode ser um elo unindo genes, doença e ambiente.
O Projeto Genoma do Câncer fornece informação sobre a doença e especialmente sobre o
câncer de pulmão e o melanoma maligno.
O Projeto dos 1000 Genomas visa sequenciar o conjunto de um número amplo de pessoas. O
Projeto UK10K do Wellcome Trust, lançado em 2010, visa comparar os genomas de 4.000
pessoas saudáveis com os de 6.000 pessoas afetadas por uma doença de presumida origem
genética.
A Genômica surgiu como uma nova disciplina que tenta responder a algumas questões
fundamentais: Onde estão os genes? O que faz cada gene? Como diferem os organismos em
relação a seus genes? Cada uma dessas perguntas criou especialidades como a Genômica
estrutural, a Genômica funcional ou a Genômica comparativa.
No rastro do Genoma, outras perguntas começam a ser formuladas e surgem outras áreas de
investigação: o A transcriptômica, concernente ao RNA transcrito ou transcriptoma, isto é, aos
padrões de
expressão gênica.
OS ÁCIDOS NUCLEICOS o A proteômica, referente ao conjunto de proteínas da célula ou
proteoma, que varia ao se
diferenciarem as células e em resposta a estímulos ambientais. o A metabolômica, relativa ao
conjunto de substratos e subprodutos de reações enzimáticas que
incidem no fenótipo celular.
DNA E RNA COMO AGENTES BIOLÓGICOS
A genômica encontrou aplicações imediatas no campo médico e farmacológico, como os testes
genéticos e de medicamentos novos (Tabela 5.2). Em função da importância econômica dos
produtos farmacológicos, a questão das patentes voltou a estar no centro das atenções. Em
2013, a Suprema Corte dos Estados Unidos determinou que o DNA natural não pode ser
patenteado. A discussão está centrada atualmente em redor dos procedimentos e de
sequências especialmente desenhadas para testes de diagnóstico.
Nas áreas de agricultura e saúde, a interferência gênica tem sido utilizada na triagem de genes
funcionais em cultivos celulares e organismos modelos. Sabe-se que cumpre uma função
reguladora no amadurecimento das células sanguíneas em mamíferos e está envolvido em
vários tipos de câncer, obesidade e doenças autoimunes. Vários medicamentos baseados no
fenômeno de interferência gênica se encontram em fase de testes clínicos, sendo que a
principal dificuldade está na administração do RNA.
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TABELA 5.2. Os ácidos nucleicos (DNA e RNA) como agentes biológicos
AGENTES BIOLÓGICOS
57 APLICAÇÕES
DNA, RNA e genômica
Identificação de microrganismos patogênicos.
Controle da qualidade dos alimentos.
Medicina molecular (diagnósticos, tratamentos personalizados, terapias gênicas).
Testes genéticos (diagnósticos, avaliação dos riscos de saúde).
Agronomia e pecuária (métodos seletivos mais eficientes).
Indústria farmacológica (proteínas terapêuticas, vacinas recombinantes e de DNA).
Prática forense (identificação das pessoas).
Estudos antropológicos e evolutivos.
CAPÍTULO6
BIOPROCESSOS
OS MICRORGANISMOS INDUSTRIAIS
NOÇÕES SOBRE O METABOLISMO PRIMÁRIO E SECUNDÁRIO
o Respiração aeróbia:
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FIGURA 6.1. O processo fermentativo genérico
60 FIGURA 6.2. Respiração e fermentação
Na respiração, onde o último aceptor de elétrons é o oxigênio, a oxidação de glicose se completa até
chegar a CO2 e H2O, produzindo 36-38 moléculas de ATP. Na fermentação, o último aceptor de elétrons é
o piruvato ou algum outro derivado, produzindo 2 ATP.
Glicose
GLICÓLISE (2 ATP) Citoplasma
Ácido pirúvico Substância orgânica
Sem O2 (etanol, ácido láctico) Com O2
Citoplasma (procariontes) Mitocôndria (eucariontes)
CO2 , H2O e 36-38 ATP
FASE DE LABORATÓRIO
Preparação do inóculo
FASE INDUSTRIAL
Preparação do meio
Esterilização
Ar
Controles (temperatura, pH) Esterilização
Tratamento final
Subprodutos Produtos Resíduos
RESPIRAÇÃO Ciclo de Krebs e cadeia respiratória
FERMENTAÇÃO
Além das vias metabólicas primárias, que são comuns a todos os microrganismos, existem
outras vias metabólicas secundárias específicas. A ativação de umas e/ou de outras depende
do microrganismo e das condições em que ele se desenvolve em seu ambiente natural ou em
que irá ser cultivado.
Os metabólitos primários estão relacionados com o crescimento dos microrganismos e a
transformação de nutrientes em biomassa; sendo os principais exemplos o etanol, o ácido
láctico ou os aminoácidos. Mesmo não sendo essenciais, os metabólitos secundários permitem
a sobrevivência em ambientes extremamente competitivos e com escassos nutrientes. São
metabólitos secundários os antibióticos, os alcaloides, os pigmentos, algumas enzimas e
toxinas.
Com vistas ao desenvolvimento de um bioprocesso, a escolha do microrganismo terá que ser
feita em função de suas vias metabólicas; e as condições de cultivo dependerão do objetivo da
fermentação, um metabólito primário ou um metabólito secundário (Figura 6.3B).
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FIGURA 6.3. As diversas fases do crescimento de uma população microbiana e a produção de
metabólitos
A. As fases de crescimento de uma população
Log do número de células
Tempo
Fase lag Fase log Fase estacionária Fase de declínio
B. A produção de metabólitos primários e secundários
Os nutrientes do meio permitem a multiplicação celular e a formação do metabólito primário, que pode ser
utilizado pelas células para sintetizar o metabólito secundário (a); este pode também ser sintetizado
diretamente a partir de alguma substância do meio (b).
ab
Meio nutriente
Células
Metabólito primário
OS BIOPROCESSOS Metabólito secundário
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MEIOS DE CULTURA E MATÉRIA-PRIMA
62 A composição do meio de cultura depende das
necessidades metabólicas do microrganismo escolhido. Este deve conter todos os nutrientes
necessários nas concentrações adequadas, que variam em função do microrganismo e do
objetivo do processo. Em geral, os meios de cultura utilizados no laboratório incluem:
o Água.
o Uma fonte de energia e de carbono: glicose, amido etc.
o Uma fonte de nitrogênio: inorgânica (sulfato de amônia, nitrato de potássio etc.), orgânica (asparagina,
succinato de amônia, glutamato, ureia etc.) ou complexa (farinha de soja, peptona etc.).
o Sais minerais, tais como fosfato de potássio (K2HPO4 ou KH2PO4), sulfato de magnésio (MgSO4 7H2O),
cloreto
de cálcio (CaCl2) etc.
o Elementos-traço: ferro, zinco, manganês, cobre, cobalto, molibdênio.
Com vistas a uma exploração comercial, os meios definidos são substituídos na indústria por
matérias- primas de baixo custo como, por exemplo, soro de leite, melaço de cana ou de
beterraba, amido de milho etc. Em alguns casos, a matéria-prima passa por um tratamento
prévio com métodos físicos e/ou químicos.
No caso de se tratar de um processo enzimático, o meio deverá levar, além do substrato
adequado, os elementos necessários para que a enzima possa desenvolver sua atividade
catalítica (precursores, cofatores etc.).
A OBTENÇÃO DAS LINHAGENS
De um modo geral, para que o cultivo em um fermentador resulte economicamente viável, o
microrganismo deve ser capaz de se multiplicar rapidamente, sintetizando grande quantidade
do produto a partir de uma matéria-prima barata. Existem Bancos e Coleções de Cultura que
vendem esse tipo de linhagens de microrganismos como culturas puras, geneticamente
estáveis e aptas para o cultivo em grande escala.
Apesar de terem sido isoladas do meio ambiente, as linhagens industriais diferem
substancialmente das linhagens originais, em virtude de uma série de alterações genéticas
(mutações, recombinações) obtidas no laboratório. Atualmente, as grandes empresas
selecionam os microrganismos mais eficientes mediante um processo de evolução dirigida,
miniaturizado em plataformas robóticas (Figura 6.4). A triagem de alta produtividade (HTS, do
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FIGURA 6.5. Modelos de biorreatores utilizados em processos tradicionais
64 C. Biorreator para
fermentações em fase sólida
D. A produção de vinagre (Método de Orléans)
FIGURA 6.6. Modelo de biorreator utilizado em fermentações submersas
Tubo para adicionar o vinho
Entrada de ar Mãe do vinagre Mosto
Retirada do vinagre
Motor Vapor Entrada de ácido ou de base
Bomba Indicador de pressão
Sonda de pH (controle) Misturador Saída
de gases Sonda de temperatura (controle)
Vapor Entrada de ar
Saída do produto
Controles Injeção de ar Saída de ar Umidade
Bandejas com a matéria-prima para
o cultivo de microrganismos
Reatores STR
OS PROCESSOS SUBMERSOS
O desenho do biorreator deve se adequar ao objetivo do processo, respondendo
eventualmente a diversos imperativos, tais como a esterilização do sistema, a aeração e
homogeneização do meio, o acréscimo de nutrientes e de aditivos antiespumantes, a
manutenção do pH etc.
A maioria dos processos industriais se desenvolve em cubas de vidro ou de aço. Os agentes
biológicos submersos no meio de cultivo ocupam somente 75% da cuba porque, se for
necessário injetar ar, formará espuma.
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FIGURA 6.7. Fermentações, agentes biológicos e biorreatores
Reatores com agitação mecânica
Livres
Coluna de bolhas Reatores air-lift
Podem ser conduzidas por
Reatores com agitação pneumática
FERMENTAÇÕES SUBMERSAS
CÉLULAS E ENZIMAS
Em suportes inertes
Reatores de leito fixo
ou de leito fluidizado
Reatores em torre
ou com membranas planas
Imobilizadas
OS BIOPROCESSOS Entre membranas
Reatores de fibra oca
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A mudança de escala entre o processo laboratorial e o processo industrial cria vários problemas de índole
tecnológica.
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Fermentador de laboratório Fermentador piloto Fermentador industrial
1 - 10 litros 50 – 200 – 500 litros 5.000 – 50.000 – 200.000 litros
5 – 50 – 200 m3
INDÚSTRIA
INDÚSTRIA
LABORATÓRIO
Bancada
ILOTO
OS BIOPROCESSOS DO LABORATÓRIO À INDÚSTRIA
A MUDANÇA DE ESCALA
Uma operação simples de laboratório pode ser impraticável, ou pouco econômica, quando
realizada em grande escala. No laboratório, após a triagem das linhagens mais eficientes ou
das primeiras experiências realizadas na bancada, o processo passa a ser estudado em um
biorreator de até 10 litros de capacidade, onde se analisam o rendimento da linhagem
selecionada e as variáveis físico-químicas em outra escala.
A capacidade de uma cuba varia entre 1 e 10 L para um fermentador de laboratório, chegando
a 5.000 l em uma planta piloto e 100.000 l em uma planta industrial. Ao aumentar o tamanho do
equipamento, altera-se a relação superfície/volume, de modo que as condições de operação do
fermentador na planta piloto deverão ser ajustadas até se aproximar das correspondentes a um
processo comercial. Se a experiência na planta piloto for bem-sucedida, o processo poderá ser
desenvolvido em um fermentador industrial (Figura 6.8).
A automatização do monitoramento e do controle da fermentação permite que a informação
relativa aos parâmetros físicos e químicos (pH, temperatura, oxigênio, velocidade de agitação,
o nível do meio etc.) seja recolhida on-line por sondas e sensores. Para que o processo se
aproxime das condições ideais, a informação é analisada em relação a um modelo previamente
estabelecido. Como este se elabora a partir da experiência obtida com cubas menores
(laboratório, piloto), os ajustes à mudança de escala são de grande complexidade.
A CONDUÇÃO DO PROCESSO
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O produto se concentra por sedimentação, precipitação, filtração, centrifugação, extração
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por
solventes, destilação, evaporação do solvente e secagem. Se a purificação for necessária,
esta envolverá outros procedimentos, como a cristalização e os métodos cromatográficos.
O acondicionamento final dependerá do tipo de produto. Isto é fundamental no caso das
enzimas usadas em cosméticos, onde os problemas técnicos principais são a manutenção da
estabilidade do produto e sua ativação pela hidratação da pele.
Um problema a considerar é o despejo dos resíduos de uma fermentação, alguns dos quais
podem representar um perigo para o meio ambiente como, por exemplo, o vinhoto resultante
da produção de etanol ou o soro das indústrias de laticínios. Existem formas de tratamento,
como o crescimento de biomassa sobre resíduos industriais, que eliminam o problema e ainda
permitem a obtenção de mais um produto.
BIOPROCESSOS NA INDÚSTRIA
Na produção de bens e serviços, os bioprocessos participam em vários setores produtivos. Os
dois exemplos escolhidos referentes à produção de ácido cítrico e de fertilizantes ilustram sua
importância em áreas tão diversas como a indústria química e a agricultura.
O ÁCIDO CÍTRICO
Descoberto no século XVIII no suco de limão, o ácido cítrico é ainda extraído das frutas cítricas
em alguns países da África e no México. No entanto, a maior parte da produção atual depende
do fungo Aspergillus, do qual tem-se obtido mutantes muito produtivos. Os três procedimentos
que garantem atualmente a produção industrial de ácido cítrico são os seguintes: o O processo
Koji.
A fermentação ocorre na superfície, em meio sólido, com Aspergillus niger como agente
biológico. Depois de 80 a 100 horas de fermentação a 280C, o ácido cítrico é extraído com
água quente e purificado. Muito desenvolvido nos países asiáticos, este tipo de bioprocesso
garante ao Japão uma parte importante da produção anual de ácido cítrico. o Fermentação na
superfície do meio líquido.
Em meio estéril, incubação a 300C com injeção de ar esterilizado. Inoculação com esporos de
Aspergillus niger que germinam e, em 24 horas, cobrem a superfície do líquido, diminuindo o
pH a um valor inferior a 2. O processo demora entre 7 e 15 dias e, a seguir, o ácido cítrico é
extraído do meio de cultivo. Para recuperar uma quantidade maior de ácido cítrico, o micélio é
exprimido e lavado. Este processo responde por 20% da produção anual de ácido cítrico. o
Fermentação submersa em meio líquido.
Em grandes biorreatores de acero inoxidável com agitação mecânica ou em torres air-lift. É o
procedimento preferido porque resulta fácil de automatizar e fornece rendimentos altos (125
g/L). Responde por 80% da produção anual de ácido cítrico. A figura 6.9 mostra o
procedimento de separação downstream do ácido cítrico e sua purificação. A produção de
ácido cítrico por fermentação é um exemplo clássico de sucesso na utilização de bioprocessos
para a produção de insumos que atendam outras indústrias. O ácido cítrico é um composto
muito versátil, utilizado nas indústrias farmacêutica, de alimentos, de cosmética e de
detergentes. Devido a facilidade com que forma complexos metálicos, também é usado como
antioxidante e na limpeza de metais.
FIGURA 6.9. A obtenção de ácido cítrico por fermentação
Uma vez retirado o micélio por filtração, acrescenta-se cal no caldo restante para elevar o pH e precipitar
o citrato de cálcio. Este último é retirado por filtração e tratado com ácido sulfúrico concentrado,
formando-se sulfato de cálcio. Outra filtração retira o sulfato de cálcio, deixando o ácido cítrico dissolvido
no líquido. Eliminam-se as impurezas com carvão ativado, e o cálcio residual e outros cátions por
intercâmbio iônico. A evaporação do solvente facilita a cristalização do ácido cítrico, que é recuperado por
centrifugação e filtração. Uma vez seco, o ácido cítrico é empacotado e distribuído.
20 m3 de cultivo de Aspergillus niger (starter)
Filtração
Solução de ácido cítrico impuro
+ Ca (OH)2
Precipitado de citrato de cálcio Restos do meio nutriente
+ H2SO4 concentrado
Ácido cítrico + precipitado de sulfato de cálcio
Filtração
Solução de ácido cítrico puro Gipsita
Evaporação, cristalização, centrifugação, secagem e empacotamento
Ácido cítrico CO2H-CH2-C(OH)(COOH)- CO2H-CH2
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OS BIOFERTILIZANTES
O termo biofertilizante se aplica aos produtos que contém agentes biológicos vivos capazes de
favorecer o desenvolvimento vegetal. Um destes agentes é o Rhizobium, uma bactéria
simbionte das raízes de leguminosas que fixa o nitrogênio atmosférico, reduzindo a
necessidade de aplicar fertilizantes nitrogenados nas lavouras e permitindo assim a
substituição de produtos químicos derivados do petróleo por agentes biológicos, menos
prejudiciais para o meio ambiente.
Injeção de ar esterilizado
BIORREATOR (200 m3)
Retirada semanal do meio
Micélio Metano
Descarte
Controles de pH, temperatura, CO2, O2
Materiais estéreis: açúcar, melaço, nutrientes, algum agente antiespumante
Fermentador anaeróbico
OS BIOPROCESSOS Caldeiras
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Na América Latina, a produção de biofertilizantes envolve numerosas empresas, pequenas
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e médias,
que contam com um sólido suporte tecnológico originado em universidades e
instituições públicas de pesquisa agronômica. Vários países produzem inoculantes agrícolas;
entre eles: Argentina, Brasil, Chile, Colômbia, Cuba, México, Peru e Uruguai.
As linhagens bacterianas são estirpes selecionadas por sua eficiência em uma ampla gama de
cultivares e amplamente adaptadas às condições locais. O crescimento da população
microbiana ocorre em etapas sucessivas, utilizando recipientes cada vez maiores até chegar a
biorreatores de 1.500 litros. Os microrganismos recuperados são veiculados em meio líquido
ou em turfa estéril e, uma vez empacotados, vendidos aos agricultores. Segundo a legislação
do Mercosul, durante o prazo de validade do produto, a concentração deverá ser de 108
microrganismos viáveis por grama de produto. Até o presente, a indústria baseia a produção
dos microrganismos na tecnologia clássica, mas com mapeamento do genoma de
microrganismos como o Rhizobium etli (México) e o Gluconacetobacter diazotrophicus (Brasil),
a biotecnologia moderna começa a se inserir neste campo. Frente as mudanças climáticas e a
necessidade de aumentar a produtividade agrícola, os novos métodos de triagem de estirpes
são uma ferramenta de incalculável valor para o estudo da relação simbionte entre o
microrganismo e a planta hospedeira.