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  • Arabidopsis Proteome

    Enviado por

    Lucas Bolais
    6 visualizações5 páginas
    Este documento discute a proteômica de Arabidopsis thaliana, uma planta modelo amplamente estudada. Apresenta a metodologia utilizada para a obtenção e análise de dados proteômicos de diferentes tecidos de A. thaliana, incluindo sementes, flores, calos e raízes. Discutem os desafios e oportunidades da proteômica vegetal, como a preparação de amostras e especificidades da anotação do genoma de plantas.

    Descrição original:

    Ideia de projeto de pesquisa envolvendo o mapeamento do proteoma da planta Arabdopsis thaliana

    Título original

    Arabidopsis proteome

    Direitos autorais

    © © All Rights Reserved

    Formatos disponíveis

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    Arabidopsis Proteome

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    Este documento discute a proteômica de Arabidopsis thaliana, uma planta modelo amplamente estudada. Apresenta a metodologia utilizada para a obtenção e análise de dados proteômicos de diferentes tecidos de A. thaliana, incluindo sementes, flores, calos e raízes. Discutem os desafios e oportunidades da proteômica vegetal, como a preparação de amostras e especificidades da anotação do genoma de plantas.

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    de 5

    based draft of the

    Mergner, J., Frejno, M., List, M. et al. Nature, 2020

    Lucas Gabriel Bolais Ramos


    Proteômica II – 2021/2
     A célula, o gene, a mutação, o splicing de mRNA

    Proteômica e a recombinação do DNA foram descobertos


    em plantas

    de plantas  Diversas proteínas e compostos de importância


    industrial, biotecnológica, farmacêutica,
    nutricional e ecológica
    Arabidopsis thaliana

    Fácil cultivo Brassicacae


    Pequeno porte e rápido ciclo Família de diversas plantas
    reprodutivo alimentícias

    Amplamente estudada
    Estudos pioneiros de fototropismo e reparação de DNA
    Genoma sequenciado em 2000
    27000 genes e 35000 proteínas anotadas
    Metodologia
    Obtenção dos dados Análise dos dados
     Semente, inflorescência, calo,  Processamento no MaxQuant
    folha, raiz e cultura celular  Anotação do genoma: Araport11
     Digestão em solução com (2016)
    Tripsina  Missed cleavages: 2
     Pré-fracionamento: IMAC  Modif. Fixa: carbamidometilação
     UPLC (Dionex 3000) de cisteínas
    MS (QExactive Orbitrap HF)  Modif. Variáveis: oxidação de
     Aquisição: DDA metioninas e acetilação do N-
    terminal
     Quantificação Label-free (TOP3 e
    iBAQ)
    Desafios e oportunidades

    Área Procedimentos Fosfoproteômica


    diferente específicos

    Artigo de alta relevância Aprendizado sobre a Aprendizado sobre


    fora das áreas de Fisiologia, preparação de amostra e marcação, enriquecimento
    Farmacologia COVID outras especificidades da e interpretação dos dados
    proteômica vegetal de fosfoproteômica

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