Elementos de evolução e emergência

de vírus

Prof. Dr. Eurico Arruda

Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP
ÁRVORE “DA VIDA”
Por uma epistemologia da
virologia
Variabilidade
• Subtipos HA e NA (FLUA)
– 18 HA e 11 NA

• Subtipo único (FLUB)

– Duas linhagens
– Victoria e Yamagata

(Webster e Govorkova, 2014)

EMERGÊNCIA DE MUTANTES DE
VÍRUS INFLUENZA POR ‘SHIFT’
CIRCULAÇÃO DE VÍRUS INFLUENZA
 EMERGÊNCIA
Variabilidade genética +
Recombinação Cruzamento de
barreira entre Adaptação !!!
espécies

Drift
Diversidade *“Super-spreaders”

+
Seleção Natural
 VÍRUS INFLUENZA QUE SE ADAPTARAM A
SERES HUMANOS

Espanhola – H1N1 Asiática – H2N2 Hong Kong – H3N2 ~

~40 milhões de mortes em < ~ 70,000 mortes (EUA) 34,000 mortes (EUA)
1 ano (1957-1967) (1968-…)
(1918-1956)
Mutação em 2 resíduos do sítio de ligação do receptor muda
sua especificidade de AS--2,3-Gal (preferência de vírus
aviário) para AS--2,6-Gal (preferência de vírus humano)

Aviário Humano

Stevens et al, Science 2006

 Porque há vírus
pandêmicos com
virulência maior?
 - O maior surto de doença da
história da humanidade
- 40 a 50 milhões de óbitos
- 28% da população americana foi
acometida
- Mortalidade entre 15 e 34 anos
foi 20 vezes maior que em anos
anteriores

Gripe “Espanhola” - 1918

O que se pode aprender com
este episódio?
 Brevig Mission – 1918 Spanish Influenza

Letter carrier taken home by dog team.

Nov 15 – 20, 1918: 72 of 80 people died.
 1918 Spanish Influenza
Brevig Mission – The Complete Sequence

Jeffery Taubenberger
Johan Hultin
(Lamb and Jackson, Nature 2005)
 Vírus H1N1 de 1918

Razões de maior patogenicidade:

Sítio de AA básicos com mutações = HA é mais

suscetível a clivagem por proteases diversas

(Taubenberger et al, Nature 2005)

 TAXAS DE MUTAÇÃO

• Número de erros cometidos por

nucleotídeo incorporado

• Ex: 1,4 x 10-5 = 0,000014 erros por

nucleotídeo transcrito

• 1,4 erros por 100.000 nucleotídeos

 GENOMAS DE VÍRUS

RNA de fita simples (+) ou (-)

RNA de fita dupla
DNA de fita simples
DNA de fita dupla
> 1 erro/1000 nucleotídeos
Manfred Eigen
 RESPOSTA IMUNOLÓGICA

BARREIRAS IMUNIDADE IMUNIDADE IMUNIDADE

INTRÍNSECA INATA ADQUIRIDA
ANATÔMICAS
 Pontos de destaque em
evolução de vírus
• Grande progênie
• Alta frequência de mutações x Forte
seleção negativa
• Natureza (DNA ou RNA) fixa dos
genomas
• Em vírus de capsídeo fechado: o
tamanho do genoma não varia = não
podem criar inserções ou duplicações
 VIRUS ZIKA
Flaviviridae

Transmitido por Aedes

aegypti

Recentemente introduzido
no Brasil (2015)

Febre, cefaléia, dor Paciente com Zika virus,

ocular, mialgias, e RN, Brasil, 2015

exantema pruriginoso
EMERGÊNCIA DE VÍRUS ZIKA

WEAVER et al, Antiviral Res 2016

Aedes aegypti
Distribuição de Aedes aegypti
Acrani, Proença-Modena & Arruda. Ciência Hoje, 2012
 MICROCEFALIA

~ 6 MIL CASOS
NOTIFICADOS
 CASO DE MICROCEFALIA POR ZIKV
Feto abortado na 32a semana

Calcificações Calcificações
cerebrais placentárias

Ventrículos
laterais
dilatados

Mlakar et al, New Engl J Med 2016

 CASO DE MICROCEFALIA POR ZIKV

Calcificações
cerebrais

Astrocitose Microgliose
cortical

Mlakar et al, New Engl J Med 2016

 CASO DE MICROCEFALIA POR ZIKV

RT-PCR = 6.5 X 107 CÓPIAS DE RNA DE ZIKV/g CÉREBRO

Mlakar et al, New Engl J Med 2016

 ONDE ESTAMOS COM
RELAÇÃO A ZIKAVIRUS ?
 VIRULÊNCIA
X
TRANSMISSIBILIDADE
...???

A MAIORIA DOS
GENES DE VÍRUS
GIGANTES SÃO
DESCONHECIDOS,
SEM SIMILARES
NAS BASES DE
DADOS
Adapted from N. Philippe et al., Science 341:281–286, 2013
A árvore da vida

Acrani, Proença-Modena & Arruda. Ciência Hoje, 2012

1) proteínas de capsídeo do tipo double-jelly-roll (DJR-CP), encontradas em
vírus de DNA dupla fita, mas também em alguns vírus de DNA de fita
simples;

2) endonucleases de replicação do tipo círculo rolante (RCRE) codificadas

por grande parte dos vírus de DNA de fita simples, embora possam estar
também presentes em alguns vírus de DNA de dupla fita;

3) RNA-polimerase RNA-dependente (RdRp), que contêm o domínio de

"palma-da-mão" e está presente nos vírus de RNA;

4) transcriptase reversa (RT), presente em retrovírus e pertencente ao mesmo

ramo das RdRP que contêm domínio de "palma-da-mão";

5) superfamília 3 de helicases (S3H), que são codificadas pela maioria dos

vírus de RNA de fita simples e senso positivo, DNA de fita simples e de fita
dupla;

6) proteínas de capsídeo do tipo single-jelly-roll (SJR-CP), que são a forma mais

comum de proteínas de capsídeo entre os vírus de RNA de fita simples de
senso positivo e de DNA de fita simples
Árvore universal da vida com base
em filogenia estrutural

Folding superfamilies

Reprinted from A. Nasir et al., BMC Evol Biol 12:156, 2012

Incorporação de genes virais em
genomas hospedeiros

Adapted from V. A. Belyi et al., PLoS Pathog 6:e1001030, 2010, and V. A. Belyi et al., J Virol 84:12458–12462, 2010
Vespas parasitoides depositam ovos em
corpos de lagartas de borboletas e
mariposas

Acrani, Proença-Modena & Arruda. Ciência Hoje, 2012

Burke and Strand, Insects 2012
 Mayaro

ZIKA
SARS-CoV-2 O’Nyong-Nyong

Oropouche

Nilo Ocidental

Encefalite de St.
Louis

Diversas linhagens
de influenza