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Sistemas de Terminologia e
Classificação em Saúde
Stefan Schulz
Universidade de Freiburg (Alemanha)
stschulz@uni-freiburg.de
Organização da disciplina
Calendário:
17.11. 18:30-21:30 Introdução, Aula expositiva
18.11. 18:30-21:30 Aula expositiva
24.11. 18:30-21:30 Aula expositiva / Laboratório
25.11. 18:30-21:30 Apresentação 01 / 02 / 03
01.12. 18:30-21:30 Apresentação 04 / 05 / 06
02.12. 18:30-21:30 Apresentação 07 / 08 / 09
05.12 18:30-21:30 Aula expositiva (UMLS), Laboratório
09.12. 18:30-21:30 Laboratório
10.12. 18:30-21:30 Apresentação 10
11.12. 18:30-21:30 Avaliação
Terminologias Classificações
Tesauros Nomenclaturas
Vocabulários Ontologias
Conteúdo da disciplina (III)
Casuística: Analise de sistemas concretos:
CID, MeSH, ICNP, NANDA, SNOMED CT, Read
Codes, LOINC, AMB CBHPM, SIA-SUS, SIH-SUS,
ICD-9 CM, GeneOntology, Digital Anatomist,
GALEN
(baseado em trabalhos de alunos)
Unified Medical Language System (UMLS)
(aulas práticas usando o UMLS knowledge
source server e as fontes em formato de texto)
Dados / Informações / Conhecimento
em Saúde e Ciências Biomédicas
Códigos / Linguagem
Vocabulário Natural
Controlado
Linguagem Termos controlados/
Natural Códigos
• Detalhada Exato
• Individual Compacto
• Espontânea Consistente
• Natural Processável
• Ambígua Rígido
• Imprecisa Não intuitivo
• Redundante Granularidade Fixa
• Imprevisível Caro (manutenção)
Exemplo (1)
Estatísticas epidemiológicas:
número de óbitos por malária no estado do
Pará em 2000
número de óbitos por causas externas em
Curitiba em 2000
http://www.datasus.gov.br/
Exemplo (2)
Pesquisa bibliográfica:
Recuperar artigos na MEDLINE sobre alérgicas
a antibióticos
Recuperar também trabalhos sobre e.g.
Asma e roxitromicina
Exantema associado com clindamicina
Henoch-Schonlein purpura associado com claritromicina
Exemplo (3)
Pesquisa em bancos de dados de
medicamentos:
Quais medicamentos podem causar exantema e
aumento de transaminases
Quais antibióticos indicados em gestantes com
abscesso periamigdaliano
Exemplo (4)
PEP: sistema de alerta contra efeitos
colaterais:
Paciente tem úlcera de duodeno – médico
prescreve Voltaren®
Paciente tem gastrite antral – médico prescreve
AAS
(regra: antiinflamatórios não esteróides
+ lesões do trato digestivo superior = >
ALERTA
Exemplo (5)
Extração de Informação de protocolo de
estudo clínico:
Selecionar todos os pacientes que tem
alterações do transito intestinal
...
Exemplo (6)
Fixar preços de procedimentos terapêuticos:
Agrupar procedimentos similares em termos de
custo, tempo, recursos
...
Semiótica
Teoria dos signos / símbolos
Um símbolo representa um objeto / uma
classe de objetos reais
Lingüística = Semiótica dos signos da
linguagem natural (palavras, frases...)
Cuidado: Não confundir signos com os
objetos designados, e.g.
heart is_a organ
heart is_a noun
Triangulo de Odgen & Richards
pensamento, referencia, interpretante, conceito
objeto ,
símbolo, signo instancia
„cadeira", "chair" referente
indivíduo
Triangulo de Odgen & Richards
Símbolo, signo: representação de um
conceito por meio de uma linguagem
Objeto, referente, instância, indivíduo:
Segmento de um mundo real ou fictício
pensamento, referencia, interpretante, conceito
Unidade de pensamento: Abstração de um
conjunto de objetos baseada em
propriedades que esses objetos têm em
comum
Dois classes de símbolos
Dados / Informações / Conhecimento
em Saúde e Ciências Biomédicas
Códigos / Linguagem
Vocabulário Natural
Controlado
Triangulo de Odgen & Richards
conceito de infarto de miocárdio
palavras hepatite
frases
hepatite tipo B
O vírus da hepatite tipo B é
transmitido sobretudo por meio
sentenças do sangue.
Granularidade
Os vírus da hepatite tipo B (HBV) e C
(HCV) são transmitidos sobretudo por
textos meio do sangue. Usuários de drogas
injetáveis e pacientes submetidos a
Token / Type / Lexema
quantas palavras ?
Palavras são...
ocorrências (tokens)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
“When flies fly behind flies, a fly is flying ahead”
formas (types)
1 2 3 4 2 5 3 6 7 8
“When flies fly behind flies, a fly is flying ahead”
p
ens
ame
nto
,re
fere
ncia
,in
terp
reta
nte
,co
nce
ito
ob je to,
símbolo
,s ig
no in
s ta ncia
„ca
deira
","chair" refe re nte
in
d iv íd
u o
Relações Semânticas (próprias)
Hiperônimos : conceito mais geral:
Coração Órgão
Hipónimos: conceito mais específico:
Órgão Coração
Holónimos:
}
inclusão:
Merónimos mão dedo
dedo mão
Relações Semânticas (próprias)
p
ens
ame
nto
,re
fere
ncia
,in
terp
reta
nte
,co
nce
ito
ob je to,
símbolo
,s ig
no in
s ta ncia
„ca
deira
","chair" refe re nte
in
d iv íd
u o
Conceitos fundamentais de
Filosofia e Lógica
Semântica de Categorias
Aristóteles: genus proximum et differentia specifica
Significação não é atômico: Pode ser reduzido a
unidades semânticas
feminina adulta humana
Homem - + +
Mulher + + +
Menina + - +
Fêmea + 0 -
Semântica e Lógica Formal
Descrição de relações semânticas entre entidades
(objetos, classes) usando linguagem formal:
Lógica de Primeira Ordem = Cálculo de
Predicados
Predicados unários classificam objetos:
médico(Eduardo) = True
médico(Roosewelt) = False
M = { x | médico(x)} é o conjunto de todos
os médicos
Predicados binários representam relações:
examina(Eduardo, João)
Semântica e Lógica Formal
Introdução de variáveis e quantificadores
permite asserções sobre classes de objetos:
x: cirurgião(x) médico(x)
x,y: opera(x,y) trata(x,y)
Relação taxonômica
Principal relação de ordem em sistemas de
classificação e terminologias
Relaciona conceitos (classes) gerais com
conceitos (classes) mais específicos
Corresponde a
Implicação entre predicados:
x: A(x) B(x)
Inclusão entre conjuntos EA EB
Relação is-a entre conceitos A is-a B
Cuidados
Não confundir is-a com outras relações:
hexose biosynthesis is-a monosaccharide
biosynthesis
hexose biosynthesis is a hexose metabolism
Não confundir is-a com instance-of:
medico(Eduardo)
Eduardo instance-of medico
Eduardo Emedico
Teoria de conjuntos nem sempre aplicável:
Marciano is-a Extraterrestre
Preservativos previnem DST
Outras relações semânticas
Propriedades algébricas:
reflexiva: x: R(x,x)
transitiva: x,y,z: R(x,y), R(y,z) R(x,z)
simétrica: x,y: R(x,y) R(y,x)
assimétrica: x,y: R(x,y) not(R(y,x))
Exemplos:
reflexiva transitiva simétrica assimétrica
pai - - - +
casado - - + -
subconjunto + + - -
descendente - + - +
Exercícios
Caracterize as propriedades de típicas
relações biomédicas
UMLS SN reflexiva transitiva simétrica assimétrica
part-of - + - +
has-location + (?) + - +
instance-of - - - +
is a + + - +
prevents - - (?) - +
causes - + (?) - +
precedes - + - +
treats - - - +
adjacent to - - + -
Sistemas de Terminologia
Biomédica
sinónimo: TERMINOLOGIAS
termo geral para
sistemas de codificação / classificação
vocabulários (bio)médicos / clínicos
nomenclaturas
thesauri
ontologias
Características
Conceitos/classes: entidades de
pensamento (abstrações de objetos)
Termos: descrições dos conceitos em
linguagem natural
Códigos: strings de caracteres não
ambíguos para designar um conceito
Conceitos, Termos, Códigos
Conceitos/classes
p
ens
ame
nto
,re
fere
ncia
,in
terp
reta
nte
,co
nce
ito
ob je to,
símbolo
,s ig
no in
s ta ncia
„ca
deira
","chair" refe re nte
in
d iv íd
u o
Termos, Objetos
Códigos
Exemplos de Códigos
Códigos nao significativos
246.809.753-00 Códigos aleatórios
6711272-3
Códigos seqüenciais
80020-100
D50.1
FR-CX 203
Códigos significativos
AIS 6671
C10.228.228.180.500
00132V-691214-004
C003221
Códigos significativos vs. códigos
não significativos
Vantagens de códigos significativos
has
site has
has site
site has means
has object has object
has means has object
has means
Vantagens de pós-coordenação de
conceitos
Hierarquias simples /
Hierarquias múltiplas
árvore grafo dirigido
vértice
arco
Hierarquias Múltiplas /
Herança múltipla
Meningite
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Tesauros
Terminologia Vocabulários
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Terminologia / Tesauro
Vocabulário
Terminologia:
Lista de Termos
Tesauro:
terminologia classificada por ordem
alfabética ou por assunto, contendo
sinônimos (e outras relações semânticas)
Vocabulário:
Terminologia ou Tesauro acompanhado por
definições
(N de Keizer, MIM 2000)
Tesauros
Terminologia Vocabulários
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Terminologia
pâncreas
aparelho digestivo
fígado
Brasil
Tesauros
Terminologia Vocabulários
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
(3)
(1) has-part (2)
Tesauro
(1) has-part (3)
(1)
(2)
ANATOMIA
(1) aparelho digestivo
{trato digestivo,
digestive tracet}
(2) fígado
{liver, hepar}
(4)
(3) pâncreas
GEOGRAFIA
(4) Brasil
Tesauros
Terminologia Vocabulários
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
(3)
(1) has-part (2)
Vocabulário
(1) has-part (3)
(1)
Parte do organismo
onde ocorre a digestão (2)
dos alimentos
ANATOMIA
(1) aparelhoÓrgão
digestivo
onde ocorre a
metabolização da
{trato digestivo,
maior parte dos
nutrientes
digestive tracet}
Glândula que produz o
(2) fígado suco pancreático e
{liver, hepar}
alguns hormônios
(4)
(3) pâncreas
GEOGRAFIA Maior e mais populoso
país da América Latina
(4) Brasil
Tesauros
Terminologia Vocabulários
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Sistemas de Classificação
eu sou o mais
organizado...
Qual é a melhor classificação ?
Sistema de Classificação Ideal
Arvore (hierárquica simple) de classes
subclasses
Definição extensional das classes não
terminais
Disjunção de Classes:
Nenhum indivíduo pertence a dois classes
(não contando relação de inclusão de classes)
Exaustão:
Cada indivíduo pertence a uma classe
Problemas Práticos em Sistemas
de Classificação
Individualidade na definição e delimitação
das classes
Granularidade depende do objetivo da
classificação (estatística, tarifas para o
reembolso de serviços, documentação
Classes residuais “outros”, “não
especificado”
Exemplo: CID 10
Capítulo I Algumas doenças infecciosas e parasitárias (A00-B99)
Capítulo II Neoplasias [tumores] (C00-D48)
Capítulo III Doenças do sangue e dos órgãos hematopoéticos e alguns transtornos
imunitários (D50-D89)
Capítulo IV Doenças endócrinas, nutricionais e metabólicas (E00-E90)
Capítulo V Transtornos mentais e comportamentais (F00-F99)
Capítulo VI Doenças do sistema nervoso (G00-G99)
Capítulo VII Doenças do olho e anexos (H00-H59)
Capítulo VIII Doenças do ouvido e da apófise mastóide (H60-H95)
Capítulo IX Doenças do aparelho circulatório (I00-I99)
Capítulo X Doenças do aparelho respiratório (J00-J99)
Capítulo XI Doenças do aparelho digestivo (K00-K93)
Capítulo XII Doenças da pele e do tecido subcutâneo (L00-L99)
Capítulo XIII Doenças do sistema osteomuscular e do tecido conjuntivo (M00-M99)
Capítulo XIV Doenças do aparelho geniturinário (N00-N99)
Capítulo XV Gravidez, parto e puerpério (O00-O99)
Capítulo XVI Algumas afecções originadas no período perinatal (P00-P96)
Capítulo XVII Malformações congênitas, deformidades e anomalias cromossômicas (Q00-Q99)
Capítulo XVIII Sintomas, sinais e achados anormais de exames clínicos e de laboratório, não
classificados em outra parte (R00-R99)
Capítulo XIX Lesões, envenenamento e algumas outras conseqüências de causas externas (S00-
T98)
Capítulo XX Causas externas de morbidade e de mortalidade (V01-Y98)
Capítulo XXI Fatores que influenciam o estado de saúde e o contato com os serviços de saúde
(Z00-Z99)
Problemas Práticos em Sistemas
de Classificação
Individualidade na definição e delimitação
das classes
Granularidade depende do objetivo da
classificação (estatística, tarifas para o
reembolso de serviços, documentação
Classes residuais “outros”, “não
especificado”
F17.4
Transtornos mentais e comportamentais devidos
ao uso de fumo - síndrome de abstinência com delirium
E12.5
Diabetes mellitus relacionado com a desnutrição -
com complicações circulatórias periféricas
I10
Hipertensão essencial (primária)
V62.2
Ocupante de um veículo de transporte pesado
traumatizado em colisão com um veículo a motor
de duas ou três rodas - pessoa viajando no exterior do
veículo traumatizada em um acidente não-de-trânsito
Problemas Práticos em Sistemas
de Classificação
Individualidade na definição e delimitação
das classes
Granularidade depende do objetivo da
classificação (estatística, tarifas para o
reembolso de serviços, documentação
Classes residuais “outros”, “não
especificado”
Classes residuais
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Nomenclaturas
Sistema de termos compostos obedecendo
regras de composição pré-estabelecidas
Consiste em “eixos” (idealmente) ortogonais
Cada eixo constitui, em si, um sistema de
classificação
Examples: SNOMED ICNP
11 Eixos de SNOMED
Topografico (anatômico)
Morfológico
Diagnóstico -
Procedimentos
Funcional
Organismos vivos
Químico
Agentes físicos, ações e forças
Contexto social
Ocupações
Geral
Exemplos
T-01000 (pele)
M-4300 (inflamação crônica)
M-01735 (eritema papulovesicular)
F-C3000 (reação de hipersensibilidade alérgica)
F-A2300 (coceira).
T-28000 (pulmão)
M-40000 (inflamação)
L-25116 (Streptococcus pneumoniae) .
Problemas Práticos em Sistemas
de Nomenclatura
Manuseio dificil
“Sinonímia”
- DB-6211 Diabetic nephropathy
- - DB-61 Diabetes mellitus + G-C025 Causing + D7-11 Nephropathy
- DB-61 Diabetes mellitus + G-C025 Causing + DF Disease + G-C006
Located In + T-71 Kidney
Redundancia
- DB-6211 Diabetic nephropathy + G-C006 Located In + T-71 Kidney,
NOS
Inconsistência
DB-6211 Diabetic nephropathy + G-C006 Located In + T-11 Bone
Nomenclaturas Classificações
Coleção de Dados Classificação de dados
Paciente Caso
Individual População
Caracterização Typing
Identificação Discriminação
Comunicativo Distributivo
Metas implícitas de observação Metas explícitas de observação
Pós-Coordenação Pré-Coordenação
Linguagem Containeres Pré - Definidos
! !
Individual Compatible Comparative General
Information Information Information Information
n : 1 : m
Data Collection Data Ordering
depending on the physician´s experience depending on differentiation criteria
(implicit goals of observation) (explicit goals of observation)
Sistemas de
Terminologia
Classificações Ontologias
Nomenclaturas
Exemplos de Sistemas de
Terminologia
Gene Ontology
Gene Ontology (I)
Vocabulário controlado para descrição de
componentes celulares, funções
moleculares e processos biológicos.
esforço colaborado e dirigido a necessidade
da descrição do produto de genes em
diferentes bases de dados.
Num contexto celular o GO descreve o
comportamento do produtos de gene
Gene Ontology (II)
Define conceitos comuns em toda biologia
Referência para classificar genes e produtos
de genes de várias bases
O que a Gene Ontology não é
Não é uma base de dados de seqüências de
genes, nem catalogo de produtos de genes.
Não é uma base de dados biológicas
unificada.
Não é um padrão ditado ou exigido a
nomenclatura através das bases de dados.
GO: Três Sub-Ontologias
Função Molecular (atividade): ação
característica de um produto de gene
(bioquímico)
Processo Biológicos: fenômeno marcado por
mudanças que conduzem a um resultado
particular, medidas por produtos de gene”
Componentes celular: é uma condição que
é parte de um objeto maior, podendo ser
uma estrutura anatômica.
Arquitetura da Gene Ontology
Dois princípios classificatórios
Is-a
Part-of
Hierarquias múltiplas
Gráficos Acíclicos Dirigidos (DAGs)
Conectada com um banco de dados de
genes e produtos de genes
Gene caracterizado por
conceitos das três sub-ontologias:
Processo Biológico
Componente Celular
Gene Função Molecular
Bibliografia
http://yanomami.fmrp.usp.br/cbab/programa.php
http://www.geneontology.org/doc/GO.doc.html
http://www.godatabase.org/dev/
Medical Subject Headings
(MeSH)
MeSH: Tesauro MeSH
Vocabulário controlado para descrever
trabalhos científicos em MEDLINE
Conjunto de termos denominados
descritores (descriptors) em uma
estrutura hierárquica que permite
pesquisa em vários níveis de
especificidade
MeSH: Hierarquias MeSH
No nível mais geral da estrutura hierárquica
estão as entradas mais amplas
“Anatomia”, “Desordens Mentais”
No nível mais específico são encontradas as
entradas mais específicas
“Tornozelo”, “Desordens de Condução Nervosa”
Existem hierarquias múltiplas.
Existem caminhos diferentes para alcançar um
descritor
MeSH: Hierarquias Múltiplas:
Exemplo
Tree numbers diferentes
Cells [A11]
Blood Cells [A11.118]
Leukocytes [A11.118.637]
Leukocytes, Mononuclear [A11.118.637.555]
Lymphocytes [A11.118.637.555.567]
A A
H Foco da H Tipo de
Portador B Beneficiário Ação B
Prática Juízo Alvo
G C G C
Probabilidade Freqüência Via Recursos
F D F D
Localização Duração Localização Tempo
anatômica E E
Topologia Topologia
CIPE: Classificação dos Fenômenos
de Enfermagem
Eixos:
A,B: A
obrigatórios H
Foco da
C,D,E,F,G,H: Portador Prática B
Juízo
opcionais
G C
Probabilidade Freqüência
F D
Localização Duração
anatômica E
Topologia
http://www.icn.ch/pdfinfo.htm
F D
Localização Tempo
E
Topologia
http://www.icn.ch/pdfinfo.htm
Somente um termo de cada eixo pode ser usado no diagnóstico.
CIPE: Ações e Intervenções
Ações de Enfermagem: Comportamento
das enfermeiras na prática
Intervenções de Enfermagem: Ação
realizada em resposta a um diagnóstico de
enfermagem, com a finalidade de produzir
um resultado de enfermagem. Uma
intervenção de enfermagem é composto por
conceitos contidos nos eixos da
Classificação das Ações.
CIPE: Definições dos eixos das Ações de
Enfermagem (I)
7 3
Topologia Unidade de
Cuidado
6 4
Descritor Idade
5
Potencialidade
EIXOS: DIMENSÃO DA RESPOSTA
HUMANA
1) Conceito diagnóstico – Principal elemento, a origem do
diagnóstico
2) Tempo – Duração de um período, agudo, crônico, intermitente
e contínuo
3) Unidade de Cuidado – A que população: indivíduo, família,
grupo
4) Idade – Extensão de tempo: feto, neonato, lactente, criança,
etc.
5) Estado de Saúde – Posição no “continuum”de saúde: bem
estar, risco, real
6) Descritor –limita ou especifica um significado : alterado,
ineficaz, potencial, aumentado
7) Topologia – Partes ou estruturas do corpo: auditivo, cerebral,
oral, renal, cutâneo, visual
NANDA - Exemplo
Nível Conteúdo
Domínio 11 Segurança e
proteção
Classe 2 Lesão Física
Conceito Integridade de
Diagnóstico Pele
Integridade de
pele prejudicada
Diagnósticos
Risco para
Aprovados
integridade de
CID (ICD)
Classificação Internacional de
Doenças
CID: Função
O CID (internacional) é designado para:
classificar dados de morbi-mortalidade
doenças;
armazenamento de dados e o seu
Hierarquias simples;
Monoaxialidade,
Porquê ?
Classes mutuamente exclusivas - ideal para
Referência:
Tese de doutorado da Profª Cláudia Maria Moro Barra
FMA – Foundational Model of
Anatomy
Introdução
Anatomia
Anatomia é a base de todas as ciências
biomédicas
Manifestações da saúde e doenças referenciam
estruturas anatômicas que variam no tamanho das
moléculas às peças de corpo
Sistemas de classificação de doenças ou
procedimentos referenciam implícita (ex. CID) ou
explicitamente (ex. CIPE) – mas:
Não se usa um sistema de terminologia anatômica
na rotina clínica
Informação
Formas de representar
conhecimento anatômico:
Modelos gráficos:
Modelos simbólicos:
Brain has-part BrainStem
Heart has-part MitralValve
MitralValve is-a HeartValve
Digital Anatomist Foundational
Model of Anatomy:
Modelo simbólico mais elaborado e
completo da anatomia humana
Motivação original: Descrever estruturas
anatômicas de um atlas digital de Anatomia
FMA: Taxonomia
Taxonomia simples para todos os conceitos
anatômicos (sem hierarquias múltiplas)
Anatomical entity
Physical anatomical entity
Material physical anatomical entity
Organ part
Organ subdivision
Subdivision of brain
Subdivision of forebrain
Subdivision of telencephalon
Cerebral hemisphere
FMA: Partonomia
Partonomia (conceitos classificados por
“has-part”) . Hierarquias múltiplas.
Body
Nervous system
Neuraxis
Brain
Forebrain
Telencephalon
Cerebral hemisphere
Body
Head
Head proper
Brain
Forebrain
Telencephalon
Cerebral hemisphere
FMA: Outras relações
Subrelações de Part-of:
regional-part
systemic part
Relações de ramificação:
Brachial artery
Ulnar artery
Common interosseous artery
Anterior interosseous artery
FMA e uso em medicina
FMA representa anatomia canônica
(anatomia ideal)
Não contém conceitos de anatomia
patológica (ex. cisto renal, tumor de cólon...)
Interpretação estrita de part-of
(A implies part-of B B implies has-part A)
dificulta uso para representar conhecimento
sobre casos concretos:
(Apêndice part-of Intestino Intestino has-part Apêndice) ???
FMA links
Foundational Model Explorer:
http://fme.biostr.washington.edu:8080/FME/index.html
(Grupos 07 a 22)
Bloco 03 – Procedimentos Assistenciais de
G 02
Consulta
Ações Procedimentos
Bloco 01 Médica
Médicas Clínicos
Domiciliar
Básicas
Ortopedia Complexidade
AMOSTRA CREATININA
ESCALA
LÍQ.AMIN
QUANTITATIVA
LOINC
2159-2
MÉTODO
TEMPO
ENZIMÁTICO
MEDIDA PT
MASSA
LOINC Componente - Analito
•Nome principal
<[analito].[subclasse].[sub-subclasse]> ^ CALCIUM.IONIZED
HEPATITIS B VIRUS AB.IGG
CREATININE RENAL
•Ajuste CLEARANCE^^CORRECTED
<ajustes ou correções> FOR SURFACE AREA
Subcategorias:
Concentração (mg/dl);
Conteúdo (mg/g);
Razão;
Categorias/classes(mg/dia);
Fração (porcentagem).
LOINC Tempo - Amostra
Aspecto do tempo: amostra isolada ou coletada durante um
intervalo de tempo.
ALPHA 1 ANTITRYPSIN CLEARANCE:VRAT:24H:SER/PLAS+STL:QN
HEMATOCRIT:VFR:PT:CSF:QN
Exemplos:
MAGNESIUM:SCNC:PT:SER/PLAS:QN:
* ordem alfabética
CBHPM: O Código : S&S
Extensor próprio do dedo gordo (extensor hallucis longus) 3.07.03.003-2
Proced. cirurg. e invasivos
Sistema músculo esquelético e articulações*
Transplantes Musculares
(com microanastomoses vasculares) *
Nº seqüencial*
Checksum
* ordem alfabética
CBHPM: Classificação
Código significativo
Possui uma estrutura de montagem
Definições extensionais
um conceito amplo define vários específicos
Termos complexos
várias classes dentro de um conceito
Hierarquia simples. Semântica do tipo is_a
R$ 16,00 + R$ 11,50 x 0,200 = R$ 2,30 = R$ 18,30 ± 20%
SIA/SIH-SUS x CBHPM
SIA/SIH-SUS CBHPM
SUS Particulares, convênios
Define habilitações Ética e valoriza o
Define critérios de trabalho médico
permanência, faixa Definida pelas
etária e sexo Sociedades e pela AMB
Definida por estados, Tabela de referência
municípios, secretarias para médicos
de saúde
Valores impostos
Sistema de Saúde
CBHPM: Conclusão
Cumpre sua finalidade
Estrutura organizada
Consulta online : trabalhosa
Como referencial para cobranças é prática,
mas não traz detalhes sobre os
procedimentos
Bibliografia
www.amb.org.br
A tabela
SNOMED
Systematized Nomenclature of
Medicine
SNOMED: Histórico
1965-1976: Systematized Nomenclature of
Pathology (SNOP) Systematized
Nomenclature of Medicine (SNOMED)
1993: SNOMED Internacional
1998: SNOMED RT (Reference Terminology)
Descrições lógicas de conceitos
2000: SNOMED CT (Fusão com Read Codes)
2004 – 2009: SNOMED CT livremente
disponível nos EEUU
SNOMED: Características (I)
SNOMED é um sistema terminológico multi-
axial tipo nomenclatura:
Vantagem: Permite a codificação muito
detalhada de qualquer tipo de entidade
Desvantagens:
Processo de codificação trabalhoso
Existem várias alternativas para codificar a
mesma entidade
Risco de codificação redundante e
inconsistente
SNOMED: Características (II)
SNOMED é composta de 11 eixos:
Topografico (anatômico) - T : anatomia funcional para
medicina humana e veterinária
Morfológico - M: alterações encontradas nas células,
tecidos e organismos
Diagnóstico - D: classificação de condições reconhecidas
clinicamente encontradas na medicina humana e
veterinária
Procedimentos - P: procedimentos administrativos,
diagnósticos e terapêuticos
Funcional - F: sinais e sintomas; fisiologia e fisiopatologia
dos processos da doença
SNOMED: Características (III)
Funcional - F: sinais e sintomas; fisiologia e fisiopatologia dos
processos da doença
Organismos vivos - L: organismos com vida de etiologia
significante na doença humana e animal
Químico - C: drogas, produtos biológicos e manufaturados
farmacêuticos
Agentes físicos, ações e forças - A: compêndio de ações
físicas, perigos físicos, e forças da natureza
Contexto social - S: condições sociais e suas relações de
importância para a medicina
Ocupações - J: termos que descrevem a ocupação
Geral - G: ligações, descrições e qualificações que se
associam ou que modificam os termos contidos em cada eixo
SNOMED: Exemplo 1
D-13510 (Pneumonia pneumocócica) é
equivalente a combinação de :
Relações p
ensa
m e
nto,re
fere
ncia
,in
terp
reta
nte
,co
nce
ito
fe
ta
to,
re
iv
nc
n
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u
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te
o
Relações
p
ens
ame
nto
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fere
ncia
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terp
reta
nte
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nce
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380 M
Semânticas
MRREL
obje to,
símbolo,sig
no in
s ta ncia
„ca
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","chair" re
fe re nte
in
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outros
UMLS META
Relações p
ensa
m e
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terp
reta
nte
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to,
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ia
te
o
Relações
p
ens
ame
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terp
reta
nte
,co
nce
ito
380 M
Semânticas
MRREL
obje to,
símbolo,sig
no in
s ta ncia
„ca
deira
","chair" re
fe re nte
in
d iv íd
u o
outros
UMLS MRCON
C0023886|ITA|P|L1234371|PF|S1476317|Ascesso epatico amebico|3|
C0023886|POR|P|L0319334|PF|S0427639|ABSCESSO HEPATICO AMEBIANO|3|
C0023886|POR|S|L0425515|PF|S0549797|AMEBIASE HEPATICA|3|
C0023886|POR|S|L0429003|PF|S0553285|ENTAMEBIASE HEPATICA|3|
C0023886|POR|S|L2361076|PF|S2796947|Abcesso amebiano do figado|3|
C0023886|RUS|P|L0901413|PF|S1105230|PECHENI ABSTSESS AMEBNYI|3|
C0023886|RUS|S|L1508281|PF|S1804190|AMEBIAZ PECHENI|3|
C0023886|SPA|P|L0613063|PF|S0779557|ABSCESO HEPATICO AMEBIANO|3|
C0023886|SPA|S|L0442067|PF|S0566349|ENTAMEBIASIS HEPATICA|3|
C0023886|SPA|S|L0613260|PF|S0779749|AMEBIASIS HEPATICA|3|
C0023886|SPA|S|L2342901|PF|S2778756|Absceso hepatico amebiano|3|
C0023889|DUT|P|L2053941|PF|S2392163|Circulatie, lever-|3|
C0023889|DUT|S|L2065427|PF|S2403649|Levercirculatie|3|
C0023889|ENG|P|L0023889|PF|S0058030|Liver Circulation|0|
C0023889|ENG|P|L0023889|VC|S0421389|liver circulation|0|
C0023889|ENG|P|L0023889|VW|S0025533|Circulation, Liver|0|
C0023889|FIN|P|L1559216|PF|S1855125|maksan verenkierto|3|
C0023889|FRE|P|L0170066|PF|S0234547|CIRCULATION HEPATIQUE|3|
C0023889|GER|P|L1270517|PF|S1512463|Leberkreislauf|3|
C0023889|GER|S|L1270498|PF|S1512444|Leberblutkreislauf|3|
UMLS MRCON: Campos
CUI: identificador de conceito
(Código principal do UMLS )
LAT: Linguagem
TS: Term status
LUI: identificador de lexema
STT: String type
SUI: identificador de string
STR: String
LRL: Nível de restrição mínima
UMLS MRCON: Sinonímia (I)
CUI LAT TS LUI STT SUI STR LRL
C0004238|ENG|P|L0004238|PF |S0016668|Atrial Fibrillation|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VCW|S0220832|Fibrillation, atrial|3|
C0004238|ENG|P|L0004238|VCW|S0288232|FIBRILLATION ATRIAL|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VCW|S1623628|Fibrillation atrial|3|
C0004238|ENG|P|L0004238|VCW|S1912105|Fibrillation;atrial|3|
C0004238|ENG|P|L0004238|VC |S0353486|ATRIAL FIBRILLATION|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VC |S0356997|Atrial fibrillation|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VC |S0415228|atrial fibrillation|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VP |S0016669|Atrial Fibrillations|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VWP|S0041388|Fibrillations, Atrial|0|
C0004238|ENG|P|L0004238|VW |S0372707|Fibrillation, Atrial|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|PF |S0016899|Auricular Fibrillation|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|VC |S0353545|AURICULAR FIBRILLATION|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|VC |S0357130|Auricular fibrillation|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|VP |S0016900|Auricular Fibrillations|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|VWP|S0041389|Fibrillations, Auricular|0|
C0004238|ENG|S|L0004327|VW |S0372708|Fibrillation, Auricular|0|
C0004238|ENG|S|L0495689|PF |S0580463|AF - Atrial fibrillation|3|
Lexemas vs. Strings
ocorrências (tokens)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
“When flies fly behind flies, a fly is flying ahead”
Auricular S0016900
Fibrillations (plural variant)
Auricular
Fibrillations
UMLS MRCON: Homógrafos
14:34 schulz@supreme:/data/data/umls2003AA/2003AA/META )
grep -i "|COLD <" MRCON | more
C0009264|ENG|S|L0009264|PF|S0007170|Cold <1>|0|
C0009443|ENG|S|L0009264|PF|S0007171|Cold <2>|0|
C0010412|ENG|S|L0009264|PF|S1556597|Cold <4>|0|
C0024117|ENG|S|L0009264|PF|S0829315|COLD <3>|0|
C0234192|ENG|S|L0009264|PF|S1556598|Cold <5>|0|
C0719425|ENG|S|L0009264|PF|S1789118|Cold <6>|0|
UMLS META
Relações p
ensa
m e
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Relações
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Relações entre Conceitos
1º CUI 2º CUI
Relações como:
broader
narrower
parent
child
is-a
has-location
part-of...
Relações p
ensa
m e
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,in
terp
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,co
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iv
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o
Relações
p
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,in
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380 M
Semânticas
MRREL
obje to,
símbolo,sig
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s ta ncia
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","chair" re
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outros
Outros Arquivos de UMLS META
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