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AULA 1/2: BASES EPISTEMOLGICAS E DEFINIES DE VIDA.

AULA 3/4: FUNDAMENTOS QUMICOS DA VIDA.


AULA 5/6: PROTENAS
AULA 7: MTODOS
AULA 8: ENZIMAS
AULA 9: CIDOS NUCLICOS.
AULA 10: CARBOIDRATOS
AULA 10: LIPDEOS
AULA 11: BIOENERGTICA E BASES DO METABOLISMO
AULA 12: GLICLISE

AULA 1/2: BASES EPISTEMOLGICAS E DEFINIES DE VIDA.


1.

Defina o conceito de Cincias Naturais.

Cincias Naturais compoem um ramo das cincias que estudam o universo interessadas
em regras ou leis de origem natural, fsica, no humana.
2.

Descreva 4 caractersticas fundamentais de um ser vivo.

Constituio fsica organizada de forma complexa e rica em informao; reproduz-se;


transforma energia; reage a estmulos.
3.

Defina o conceito de autopoiesis.

Autopoiesis pode ser definida como a lgica que guia a rede de processos de transformao
que cria, mantm e, continuamente, regenera a unidade que distingue o sistema, no caso, a clula
e sua membrana.
4.

Um vrus pode ser considerado um ser vivo?


A definio de vida baseada na autopoiesis pode ser submetida a trs critrios de validao:

Barreira semipermevel distingue o sistema e permite a comunicao com o meio


externo atravs da troca de matria e energia;

Rede de reaes formada pelos diversos processos de transformaes


bioqumicas que resulta na construo e regenerao do sistema. A barreira
produto dessas reaes;

Interdependncia a barreira existe pela rede de reaes e esta por aquela.

Como um vrus satisfaz apenas ao primeiro critrio, no podemos consider-lo vida segundo
a definio baseada na autopoiesis.
5.

Descreva 5 caractersticas determinantes da teoria de evoluo de Darwin.


Podemos resumir a teoria evolucionria de Darwin em cinco principais teses:
a) Evoluo como tal. Essa a tese de que o mundo no constante ou criado
recentemente nem eterno dando ciclos, mas que est firmemente mudando, e os
organismos so transformados com o tempo.

b) Descendncia Comum. Esta a tese de que todo grupo de organismos descende


de um antecessor comum, e que todos os grupos de organismos, incluindo animais, plantas,
e microrganismos, finalmente voltam para uma origem nica de vida na terra.
c) Multiplicao da espcie. Esta tese explica a origem da enorme diversidade
orgnica. Ela pressupe que as espcies se multiplicam, dividindo-se em espcies-filhas ou
por brotamento, isto , pelo estabelecimento de populaes geograficamente isoladas que
evoluem em novas espcies.
d) Gradualismo. Segundo esta tese, a mudana evolutiva ocorre atravs da mudana
gradual das populaes e no pelas repentinas (saltos) produo de novos indivduos que
representam um novo tipo.
e) Seleo Natural. Segundo esta tese, as mudanas evolutivas acontecem pela
abundante produo de variao gentica em cada gerao. Relativamente poucos
indivduos que sobrevivem, devido combinao particularmente bem-adaptada de
caracteres hereditrios, originam a prxima gerao.

AULA 3/4: FUNDAMENTOS QUMICOS DA VIDA.


6. Quais os 5 elementos mais comuns encontrados em seres vivos? Quais so os seus
respectivos nmeros atmicos?
1H;

Em ordem decrescente de ocorrncia nos seres vivos: oxignio 8O; carbono 6C; hidrognio
nitrognio 7N; fsforo 15P.
7.

Defina o conceito de Istopo.

So tomos do mesmo elemento, portanto tm mesmo nmero de prtons, porm diferentes


em massas atmicas.
8.

Defina quantidade de matria n.

a matria expressa em nmero de mols. D-se pela razo entre massa da amostra e
23
massa molar da substncia da amostra (a massa de 6,022 x 10 unidades elementares da
substncia).
9.

Qual seria peso de 1 mol de carbono?


Um mol de carbono 12C tem a massa exata de 12g.

10. O que a massa molecular.


23

a massa de 1 mol de uma determinada substncia, ou seja, a massa de 6,022 x 10


molculas da substncia. Para obt-la, basta somar as massas molares dos tomos que compem
a substncia em suas respectivas propores.
11. O que molaridade.
a medida de concentrao de soluto em uma soluo, expressa em mols de soluto por litro
de soluo mol/L ou, simplesmente, M.
12. Dada a estrutura ou o peso molecular de uma molcula, calcule a massa para obter
uma soluo de determinada molaridade.

Se expressarmos a molaridade de A como


; e o volume da soluo como

Assim,

; a massa como

; a massa molar como

, temos:

a massa de A em g para uma soluo de molaridade

e volume

13. Explique o que se entende por Energia de dissociao de uma ligao covalente.
uma medida de fora de ligao em uma molcula. Determina-se pela variao de entalpia
padro entre produtos e reagentes quando a ligao rompida por homlise, ou seja, AB A +
B.
14. Utilizando tabela de energia de dissociao, calcular energia de uma molcula.
Como exemplo, a molcula do etanol CH3-CH2-OH:
(I)

CH + 416 kJ/mol (EI)

C + H

(II)

CC + 345 kJ/mol (EII)

C + C

(III)

CO + 358 kJ/mol (EIII)

C + O

15. O que uma ligao sigma e uma ligao pi. Exemplos.


A ligao sigma ocorre pela fuso de orbitais ss, sp, ou pp de forma frontal.
Exemplos:
H2, HH, ligao ss;
CH4, CH, ligaes sp;
CH3CH3, CC, ligao pp.
J a ligao PI ocorre pela fuso de orbitais pp de forma lateral. Exemplo:
CH2CH2, CC, uma ligao pp e uma ligao ;
CHCH, CC, uma ligao pp e duas ligaes .

16. Caractersticas e exemplos de molculas formadas por carbono hibridizado sp3, sp2
e sp.
3

Metano: CH4, apenas ligaes sp entre H e C e hibridao sp . Tem geometria tetradica;


2

Eteno: CH2CH2, uma ligao pp e uma ligao entre C e hibridao sp . Tem


geometria planar 120;
Etino: CHCH, uma ligao pp e duas ligaes entre C e hibridao sp. linear.
17. Exemplos de orbitais deslocalizados.
Orbitais cannicos para a molcula de benzeno:

18. O que eletronegatividade e para que ela pode ser utilizada.


a medida da fora com que um tomo atrai um eltron. Com essa medida possvel
prever a polaridade de uma molcula.
19. Calcule o nmero de oxidao de molculas simples.
+

-2

H2O 2H 1O = 2x(+1)+1x(-2) = 0;
-2

+6

-2

(SO4) 1S 4O = 1x(+6)+4x(-2) = -2.


20. Defina qumica orgnica.
A definio moderna para qumica orgnica foi fornecida por Kekul em seu livro-texto
publicado em 1861: o estudo dos compostos do carbono.
21. Defina ismeros.
Compostos de mesmo frmula molecular, porm com estrutura qumica diferente.
22. O que conformao?
Conformao a posio relativa entre ligantes em uma ligao simples. D origem a
ismeros conformacionais.
23. O que configurao?
Configurao a posio relativa entre ligantes de um tomo assimtrico em um
estereoismero. Pode ser R ou S, L ou D.
24. O que quiralidade?

uma propriedade de assimetria na estrutura da molcula. Ela indica que para um mesmo
composto, os ligantes de um centro quiral podem estar diferentemente dispostos uns em relao
aos outros. Quando isso ocorre, geralmente os ismeros (estereismeros) apresentam
propriedades qumicas/bioqumicas diferentes.

25. Exemplos de forcas no-covalentes intermoleculares.


Ligao inica; ligao de hidrognio; foras de Van der Waals; efeito hidrofbico.

26. O que uma ligao de hidrognio. D exemplos.


a fora de atrao entre o H de uma molcula e o O, N ou F de outra. Compostos que
formam ligaes de hidrognio: H2O, HF, HNO3, aminocidos.
27. O que so as foras de Van der Waals.
So foras de atrao intermolecular geradas por dipolo instantneo. a mais fraca das
ligaes intermoleculares.
28. O que so ligaes inicas.
So ligaes geradas pela atrao de ons com cargas opostas. Podem ser calculadas pela
lei de Coulomb.
29. Porque a gua polar? Que implicaes para as suas caractersticas tem este fato?
A gua polar devido sua geometria e diferena de eletronegatividade entre o H e o O.
Essa polaridade resulta em que a gua um timo solvente polar e tem uma elevada constante
dieltrica. Suas ligaes de hidrognio permitem que seu estado seja lquido na na maior parte da
Terra.
30. Explique o efeito hidrofbico.
Buscando um meio energeticamente mais favorvel, molculas apolares dispersas em gua
buscam agregarem-se umas s outras, tendendo formao de fases. A isso chamamos efeito
hidrofbico.
31. O que se entende por anomalia da densidade da gua?
A gua tem sua densidade mxima em aproximadamente 4C. Pouco abaixo desse valor
(0C, por exemplo) suas molculas rearranjam-se em uma estrutura cristalina que possui um
espao vazio em seu retculo, fazendo com que a densidade diminua com a diminuio da
temperatura. Este no o comportamento da imensa maioria dos compostos na natureza.
32. Defina pH. Quando bsico/cido/neutro?
+

pH uma medida da concentrao de hidrognio livre no meio (H ). dado por:


.

Para entre 0 e 7, a soluo cida. A soluo neutra em pH 7 e bsica entre 7 e 14.

33. Defina tampo. Porque so importantes na bioqumica?


So solues capazes de manter o pH do meio em determinada faixa mesmo que haja
+
variao na concentrao de H . Este efeito tem papel fundamental na manuteno das reaes
bioqumicas, principalmente aquelas mais sensveis s variaes de pH.
34. Calcule o pH de uma determinada soluo de um cido/base forte.
+

Por exmplo, uma soluo de cido clordrico [HCl ] = 0,01 M. Portanto [H ] = 0,01 M:

35. O que um cido/ uma base forte?


cidos ou bases fortes, so compostos que se dissociam completamente quando em
soluo aquosa. Quando fracas, essa dissociao incompleta.

AULA 5/6: PROTENAS


36. Escreva a estrutura bsica de um alfa-aminocido.

37. Reconhea os grupos funcionais de um aminocido.

38. Reconhea a configurao absoluta de um aminocido.


Por exemplo, a valina:

39. Qual a formula estrutural de um aminocido simples como alanina?

O
CH2
H3C

C
CH

OH

NH2
40. A glicina quiral?
No, pois possui dois H ligados ao carbono .

41. Desenhe com frmulas estruturais a reao entre duas alaninas.


O
H3C

C
CH
NH2

OH

H3C

H2O

C
CH

O
H3C

OH

NH2

CH3

C
CH
NH2

CH
NH

OH
C
O

42. Enumere 4 funes de protenas.


Transporte; catlise (enzimas); forma e movimentos celulares;
transcrio/replicao/traduo.
43. Descreva a ligao peptdica.
Ligao entre dois aminocidos dada por uma reao de desidratao entre o grupo
hidroxila de um e o grupo amina de outro.
44. O que N-terminal e C-terminal.

A cadeia de aminocidos (pela caracterstica dessa ligao) tem uma amina em uma
extremidade N-terminal e um grupo carboxila em outra C-terminal.

45. Defina a estrutura primria, secundria e terciria de protenas.


Estrutura primria: seqncia de aminocidos;
Estrutura secundria: conformao das estruturas primrias. Exemplos: -hlices, folhas-;
Estrutura terciria: enovelamento de estruturas secundrias formando domnios estruturais.
46. De exemplos de estrutura secundria.
-hlices:

Folhas- pregueadas:

47. Identifique diversos tipos de estrutura secundria numa protena.

48. Saiba identificar as duas principais regies do diagrama de Ramachandran.

As reas sombreadas em azul escuro refletem as conformaes que no envolvem


superposio estrica e, portanto, so inteiramente permitidas. As em azul mdio indicam
conformaes permitidas em limites extremos de contatos atmicos desfavorveis. Em azul claro,
reflete conformaes que so permissveis se uma pequena flexibilidade for permitida aos ngulos
de ligao.
49. O que inibio estrica?
a restrio ao movimento de um tomo ou radical na molcula causado pela presena de
outro tomo. Em outras palavras, a eletrosfera de um repele a do outro e isso limita os movimentos
de ambos.

50. Descreva em breves palavras uma alfa-helix.


Alfa-helix uma estrutura secundria das protenas. Ocorre quando uma seqncia
peptdica conforma-se em uma espiral direita que se estabiliza por ligaes de hidrognio.
51. Descreva em breves palavras uma folha-beta.
Folha-beta uma estrutura secundria das protenas. Ocorre com o emparelhamento de trs
seqncias peptdicas lateralmente, se estabilizando por ligaes de hidrognio. O arranjo pode
ser paralelo ou anti-paralelo.
52. O que uma ponte dissulfeto? Em que protenas elas so geralmente encontradas?
uma ligao covalente entre sulfetos na mesma cadeia ou em cadeias vizinhas. Estabiliza
estruturas secundrias.
53. Onde se encontram as principais ligaes de hidrognio numa alfa-helix? Onde
numa folha beta. E a cadeia lateral?
As principais ligaes ocorrem entre o H do grupo amina e o O do grupo carboxila, tanto
para as alfa-hlices quanto para as folhas-beta. As cadeias laterais voltam-se para o exterior da
espiral das alfa-hlices como das superfcies das folhas-beta.

54. Descreva o experimento de Anfinsen. Qual a importncia deste experimento?


Quando Anfinsen tratou molculas de ribonuclease com mercaptoetanol e uria
concentrada, verificou que a molcula havia perdido a atividade enzimtica, o que seria esperado
se a protena tivesse sido totalmente desdobrada. Quando a uria e o mercaptoetanol foram
removidos, as molculas, para sua surpresa, voltaram a apresentar atividade enzimtica. As
molculas ativas que foram reorganizadas a partir das protenas desdobradas eram idnticas, tanto
funcional como estruturalmente, s molculas no alteradas (isto , nativas) presentes no incio do
experimento. Aps inmeros estudos desses eventos, Anfinsen concluiu que a seqncia de
aminocidos de um polipeptdeo contm todas as informaes necessrias para assegurar a
conformao tridimensional da protena e, assim, o dobramento ocorre por automontagem.
55. Qual a funo da hemoglobina?
Sua principal funo transportar O2 s clulas.
56. O que exatamente o heme? Como ele liga O2?
A heme constitu de um grupo orgnico chamado protoporfirina e de um tomo central de
Fe.

Liga-se ao O2 atravs de seu sexto ponto de coordenao.

57. Explique como a ligao de O2 pelo heme de uma subunidade da hemoglobina


influencia a ligao de outros O2 protena. Qual a funo biolgica deste efeito?
A mudana de conformao da heme (com o Fe entrando no plano da porfirina)
transmitida para toda a estrutura da hemoglobina, o que faz com que a afinidade desta ligao
com o oxignio aumente a cada molcula que se liga a um centro ativo de heme (ligao
cooperativa). O resultado que a hemoglobina adquire maior carga de O2 com a mesma presso
relativa e, por isso, sua eficincia em transporte aumenta.
58. Explique a funo do BPG e o seu mecanismo de ao.
Maior a afinidade, maior a carga de O2 adquirida nos pulmes. Mas essa mesma afinidade,
se no regulada, afetaria de forma negativa a eficincia da hemoglobina, pois ela no seria capaz
de descarregar o gs nos tecidos. Para regular esse mecanismo, dentro das hemcias est
presente o composto 2,3-bisfosfoglicerato (BPG) que se liga no interior da hemoglobina na forma T
e limita o movimento de conformao para a forma R, limitando a afinidade pelo O 2 em uma
margem em que o efeito Bohr seja eficiente.
59. Explique o efeito Bohr e sua importncia/funo biolgica.
O efeito Bohr a queda drstica da afinidade da hemoglobina pelo O 2 nos tecidos, ocorrida
+
pela reduo de pH gerada pelo aumento nas concentraes de H e CO2 produzidos pela

atividade metablica. Isso faz com que a hemoglobina libere o O2 para as clulas dos tecidos,
cumprindo sua principal funo.
+

60. A hemoglobina aparentemente tambm transporta H no sangue. Explique o


mecanismo.
+

Respondem pelo efeito do H cadeias amino-terminais e cadeias laterais das histidinas 146 e -122. No tecido, quando cai o pH, a cadeia lateral da histidina -146 torna-se protonada e
forma-se, ento, uma ponte salina com o aspartato -94 e a estrutura quaternria da
desoxihemoglobina estabiliza-se.

61. A hemoglobina tambm transporta CO2 no sangue?


Sim. No momento em que descarrega o O2 nos tecidos, grupos CO2 ligam-se a cadeias
amino-terminais da hemoglobina, o que a estabilizam na forma desoxi, sendo depois liberados nos
pulmes. Isso responde por cerca de 14% do transporte de CO2 no sangue.

AULA 7: MTODOS
62. Descreva os 4 passos fundamentais de um processo biotecnolgico de produo de
produtos biolgicos.
a) Extrao: Extrao dos produtos intracelulares atravs de mtodos mecnicos,
qumicos, enzimticos;
b) Isolao: Separao mais grosseira do componente desejado dos demais compostos
obtidos na extrao. Exemplo: centrifugao diferencial ou isopcnica;
c) Purificao: Separao fina do componente desejado. Uso de mtodos mais elaborados,
como cromatografia preparativa;
d) Anlise: Anlise quantitativa do componente desejado. Uso de mtodos como
cromatografia analtica, espectrometrias, e demais mtodos da qumica analtica.
63. Descreva o mtodo de espectroscopia.
chamado de espectroscopia o mtodo utilizado para anlise de elementos simples, da
estrutura qumica de compostos inorgnicos ou grupos funcionais de uma substncia orgnica
utilizando radiao electromagntica. O exame pode ser destrutivo ou no destrutivo; os exames
mais interessantes so os que no destroem as amostras, e dos quais resultem dados precisos.
Sempre quando se excita uma substncia com uma fonte de energia, esta pode emitir como
absorver radiao em determinado comprimento de onda, desta forma permitindo uma observao
do comportamento do corpo de prova. Os resultados da anlise espectroscpica de uma amostra
providenciam dados sobre a estrutura do material, tais como geometria de ligao, natureza
qumica de ligandos de um dado tomo, comprimentos de ligaes qumicas, etc. A base da
espectroscopia a natureza ondulatria das radiaes eletromagnticas, cuja varivel a
freqncia fundamental. Esta determina o nmero de oscilaes realizadas pela onda por unidade
de tempo, e o comprimento de onda, distncia percorrida pela onda durante um perodo de tempo
correspondente a uma unidade de freqncia, sendo o produto destas definido como a velocidade
de propagao da onda.
64. Qual a equao de Lambert-Beer? Descreva um exemplo de aplicao desta
equao na prtica.

A equao dada por:

Onde:
transmitido;

a absorbncia;

a intensidade do feixe incidente;


-1

-1

a absorbitividade molar (M cm );

a intensidade do feixe

a concentrao molar; e

a distncia

percorrida pelo feixe na amostra.

Um exemplo de sua aplicao ilustrado pela curva de absorbncia versus concentrao de


glicose (umol/ml):

65. Protenas podem ser detectadas utilizando espectroscopia de absoro de UV a 280


nm. Explique.
Todos os tomos absorvem na regio ultravioleta (UV), porque estes so os ftons com
energia suficiente para excitar eltrons exteriores. Se a freqncia alta o suficiente, a
fotoionizao ocorre. Espectroscopia UV tambm utilizada na quantificao de protenas e DNA,
bem como a relao da protena com a concentrao de DNA em uma soluo. Vrios
aminocidos encontrados normalmente em protenas, como triptofano, absorvem luz na faixa de
280 nm e DNA absorve luz na faixa de 260 nm. Por esta razo, a proporo de 260/280 nm de
absorbncia um bom indicador geral da pureza relativa de uma soluo em termos destas duas
macromolculas. Estimativas razoveis de protena ou de concentrao de DNA tambm podem
ser feitas desse jeito, usando a lei de Beer.
66. Explique o principio bsico da cromatografia.

Cromatografia uma tcnica de separao de misturas e identificao de seus


componentes. Esta separao depende da diferena entre o comportamento dos analitos entre a
fase mvel e a fase estacionria. A interao dos componentes da mistura com estas duas fases
influenciada por diferentes foras intermoleculares, incluindo inica, bipolar, apolar, e especficos
efeitos de afinidade e solubilidade.
67. Qual o principio por trs da cromatografia de gel-filtrao?
Este tipo de cromatografia efetua a separao de acordo com o tamanho efetivo das
molculas. A velocidade de deslocamento das molculas pequenas menor, pois estas precisam
passar atravs do gel ou suporte. As molculas grandes apresentam uma maior velocidade de
deslocamento dentro da coluna, emergindo mais rapidamente, promovendo a separao dos
componentes de acordo com o peso molecular.

68. Qual o principio por trs da cromatografia de troca inica?


A fase estacionria altamente carregada, sendo que os componentes com cargas de sinais
contrrios a estas so seletivamente adsorvidos da fase mvel. Os componentes adsorvidos
podem se subseqentemente eludos, por deslocamento com outros ons, com o mesmo tipo de
carga, porm com maior fora de interao com a fase estacionria. A afinidade entre ons da fase
mvel e a matriz podem ser controlados utilizando fatores como pH e a fora inica.

69. Qual o princpio por trs da cromatografia por afinidade?


Na cromatografia de afinidade ocorre uma ligao molecular especfica e reversvel entre o
soluto e um ligante imobilizado na fase estacionria. Esta tcnica utiliza-se especificamente para
separar produtos biolgicos, e como exemplos podemos citar: ligaes enzimas e substractos,
anticorpos e substractos e recepetores de hormonas.

70. Em que principio se baseia a cromatografia RP-HPLC?


O uso de presses elevadas permite uma reduo no dimetro das partculas da fase
estacionria, localizada no interior da coluna cromatogrfica. O uso de partculas menores (na
ordem de 5,0 m) no recheio da coluna resulta em uma rea superficial, o stio de adsoro, maior
(geralmente da ordem de centenas de metros quadrados por grama de fase estacionria), o que
promove uma separao mais eficiente dos componentes da amostra. Essa "miniaturizao" das
partculas da coluna permite o uso de colunas menores, volumes menores de amostras e um gasto
menor de fase mvel. Assim sendo, em cromatografia lquida de alta eficincia trabalha-se na faixa
dos microlitros (L).

71. Explique o principio bsico da eletroforese.


Aplicando um campo eltrico em um meio fixo gel, onde o analito est disperso. Por
diferena de cargas e tamanhos, as molculas so separadas pela resistncia migrao.

72. Explique o principio do SDS-PAGE.


Nesta tcnica, as protenas so desnaturadas com SDS, o que lhes confere carga,
facilitando a eletroforese dessas. Os resultados so registrados em um marcador especfico.

73. Em que est baseada a espectrometria de massas?


Um espectrmetro de massa bombardeia uma substncia com eltrons para produzir ons.
Os ons atravessam um campo magntico que curva suas trajetrias de modos diferentes,
dependendo de suas massas. O campo separa os ons em um padro chamado espectro de
massa. A massa e a carga dos ons podem ser medidas por sua posio no espectro.

74. D um exemplo de tcnicas baseadas no uso de anticorpos.

Um bom exemplo a imunofluorescncia, onde cora-se clulas com anticorpos acoplados a


substncias que permitem fluorescncia.

AULA 8: ENZIMAS
75. Qual a funo das enzimas.
Catalisar reaes bioqumicas.
76. D exemplos de enzimas.

Lactato desidrogenase enzima xido redutase:

C
NAD+

CH

NADH

H+

C
OH

H3C

Hexocinase enzima transferase:

ATP + D-hexose

C
+

H3C

ADP + D-hexose-6-fosfato

Lactato racemase enzima isomerase:

(S)-lactato

(R)-lactato

77. Explique a equao de Michaelis Menten.

Onde:

uma funo da velocidade da reao;

a constante de Michaelis-Menten; e

a velocidade mxima atingvel;

a concentrao de substrato.

A equao gera uma curva que descreve a elevao da velocidade de uma reao de dois
passos, onde o limitante a concentrao de substrato ( ).

78. O que significa Km e Vmax?


constante de Michaelis-Menten. Seu valor dado pela concentrao de substrato
quando a velocidade

igual metade de

. Pode ser usada como uma medida da afinidade

da enzima pelo substrato e, quanto menor o valor de

, maior essa afinidade.

79. Explique duas formas de inibio.


Dentro da categoria dos inibidores reversveis, temos os competitivos e os no-competitivos.
Os competitivos tm forma parecida com a do substrato e alocam-se no stio ativo da
enzima, competindo pela reao. Agem no incio das reaes, retardando a elevao da curva de
. Quando a concentrao do substrato muito maior que a do inibidor, alcana
e a reao
no sente mais os efeitos de inibio.
J os no competitivos alocam-se em outra parte da enzima, reduzindo sua capacidade
biocatalisadora. Nesse caso, no alcana
.

80. Identifique utilizando grficos de Michaelis-Menten ou Lineweaver-Burk casos de


inibio competitiva e no-competitiva.

81. Defina KD e IC-50.


Em uma reao simples da forma:

E + I

k1

EI

k-1
a constante de dissociao. Representa uma medida de equilibro da reao e indica
para onde a reao tende. Matematicamente:

IC50 um parmetro de eficincia de um componente em inibir uma reao. uma medida


quantitativa que indica quanto de inibidor necessrio para inibir um dado processo
(biolgico/bioqumico) pela metade.
82. Um IC-50 pode ser comparado sem mais utilizando experimentos diferentes?
No, pois a medida IC50 altamente dependente das condies do experimento. S
comparvel, quando o mtodo o mesmo.
83. Explique a teoria do estado de transio para o mecanismo de uma enzima.
De forma sucinta, a Teoria do Estado de Transio diz que uma enzima reduz a energia de
ativao do complexo reagentes/produtos por ter sua estrutura molecular com forma aproximada a
esse complexo. Assim, a atrao entre a enzima e o complexo faria parte do trabalho de formao
deste.

AULA 9: CIDOS NUCLICOS.


84. Explique em breves palavras os processos de replicao, transcrio e traduo.
a) Replicao: Para que o processo de replicao se inicie, necessria a atuao
de uma enzima, a DNA helicase. A enzima liga-se cadeia de DNA e desliza
sobre esta, quebrando as ligaes entre as duas cadeias de nucleotdeos ligaes de hidrognio - ficando ento as duas cadeias de DNA separadas. Em
seguida, os nucleotdeos livres existentes no ncleo ligam-se, por
complementaridade de bases, cadeia de DNA. De uma cadeia original de DNA
formam-se duas. Cada cadeia do DNA duplicada formando uma fita hbrida, isto
, a cadeia velha pareia com a cadeia nova formando um novo DNA, assim, de
uma molcula de DNA formam-se duas outras iguais a ela. Ao mesmo tempo em
que a DNA helicase vai abrindo a molcula de DNA, outra enzima chamada
polimerase liga um grupo de nucleotdeos que se pareiam com os nucleotdeos da
molcula-me;
b) Transcrio: o processo de formao do RNAm mensageiro a partir da cadeiamolde de DNA. Este tem como funo "informar" ao RNAt (RNA transportador) a
ordem correta dos aminocidos a serem sintetizados mais tarde em protenas,
atravs da traduo desse RNA. O processo catalisado pela enzima RNApolimerase. Os fatores de transcrio (auxiliares da RNA-polimerase) so
responsveis por romper as ligaes de hidrognio entre as bases nitrogenadas
dos dois filamentos de DNA, como um zper. A RNA-polimerase executa vrias
funes sem necessidade de outras enzimas, ao contrrio da DNA-polimerase,
que codifica o genoma inteiro.
A enzima destaca o filamento de RNA formado a partir do DNA e volta a unir as duas
cadeias de DNA.
Traduo: o processo biolgico no qual a sequncia nucleotdica de uma molcula
de mRNA (RNA mensageiro) utilizada para ordenar a sntese de uma cadeia polipeptdica
com sequncia de aminocidos que determinada uma protena.

Neste processo, molculas de RNA transportador (tRNA) operam a traduo


reconhecendo as seqncias nucleotdicas do mRNA e correlacionando-as com com a
sequncia que corresponde a determinados aminocidos. A molcula que fornece a
informao gentica a ser traduzida o RNA mensageiro. Este contm uma sequncia de
nucleotdeos que lida, pelo RNA transportador (que possui uma srie de anticdons) de
trs em trs bases. Cada trinca de bases do RNA mensageiro representa um cdon e est
relacionada a um aminocido especfico. A insero de aminocidos na cadeia polipeptdica
crescente ocorre na mesma ordem em que os seus respectivos cdons aparecem na
molcula de RNA mensageiro.

85. Qual a maior diferena estrutural entre o DNA e o RNA?


A maior diferena encontra-se no grupo OH da ribose:

OH

HO

O
Desoxi-ribose - DNA
OH
OH

HO

O
Ribose - RNA
OH OH

86. Quais so as 4 bases do DNA?

NH2

NH2

N
NH

NH

O
N
O

H3C

NH

NH

NH2

Guanina

Citosina

Adenina

O
NH
NH

Timina

87. Quais so as 4 bases do RNA?

NH2

NH2

N
NH

Adenina

NH

O
N
O

NH

Citosina

88. Qual o nome qumico correto do ATP?

O
NH

N
Guanina

NH2

NH
NH
Uracila

Adenosina-5-trifosfato.
89. Desenha a estrutura do ATP.
NH2
N
O
HO

O
O

O
O

OH

OH

O
N

OH

OH

90. Saiba emparelhar corretamente as bases A/T (U) e G/C.

91. Que fatos indicam que antes da apario do DNA existiu um mundo do RNA
O fato de que o DNA assemelha-se ao RNA, porm com estrutura mais estvel e
especializada, concentrando mais informaes, grande indicativo de que este precedeu aquele.
Alm disso, o experimento de Urey-Miler provou ser possvel a sntese de ribose sobre condies
extremas (simulando o mundo primitivo), permitindo, assim, a concepo de uma linha do tempo
ribose-RNA-DNA.
92. Qual a maior vantagem para armazenar informao do DNA se comparado com o
RNA?
Sua estabilidade e, por isso, menor suscetibilidade a falhas na codificao.

AULA 10: CARBOIDRATOS


93. Quais as duas principais funes biolgicas dos carboidratos?
Armazenamento de energia e formao do esqueleto do DNA e RNA.
94. Quais os dois tipos de carboidratos do ponto de vista qumico.

Derivados do gliceraldedo: aldoses (aldedos + grupos OH);

Derivados da dihidroxiacetona: cetoses (cetonas + grupos OH).

95. De exemplos de aldoses.


O

O
HC

HC

O
H

OH

HC

OH

HO

HO

OH

OH

HO

OH

OH

OH

OH

H2C

H2C

H2C

OH

OH

OH
D-glicose

D-galactose

D-ribose

96. De exemplos de cetoses.


OH

OH

H2C

H2C

HO

HO

OH

HO

OH

OH

H2C

H2C
OH

D-frutose

OH
D-tagatose

97. A que se refere a configurao D nas D-aldoses e D-cetoses?


Ao carbono quiral D comum a todas elas, provindo da D-gliceraldedo e da dihidroxiacetona.

98. D um exemplo de duas formas epmeras de uma aldose.


O

O
HC

HC
H

OH

HO

OH

OH

OH

OH

OH

OH

H2C

H2C

OH

OH
D-alose

D-altrose

99. Quais so as duas formas anomricas da glicose?


-D-glicopiranose e -D-glicopiranose.
100. Desenha a estrutura da glicose em forma aberta e em forma de piranose.
O
HC
H

OH

OH

OH
HO
H
H

OH

H
OH H

OH

HO

OH
H

OH

D-glicose

101. Desenha a estrutura da glicose em forma de cadeira.

HO
H
O
H
H
H
102. Escreva a frmula estrutural da glicose.
Idem 110.

OH
OH
H

OH

-D-glicopiranose

OH

HO

O OH

HO

OH

HO

H
OH H
H

-D-glicopiranose

H2C

103. Escreva a frmula estrutural da celobiose.

OH

OH
H

H
OH H

OH

H
O

H
OH H

O OH
H

HO
H

OH

OH

-D-glicopiranosil-(1,4)--D-glicopiranose

104. Escreva a frmula estrutural da maltose.

OH
H

H
OH H

OH

OH

H
O

H
OH H

OH

HO

OH
H

OH

OH

-D-glicopiranosil-(1,4)--D-glicopiranose

105. Escreva a frmula estrutural da sacarose.

OH
H

H
OH H

OH

HO
O

OH
O
H HO

HO
H

OH

OH

OH

-D-glicopiranosil-(1,2)--D-frutofuranose

106. Que tipo de ligao glicosdica apresenta a celulose? E o amido?


A celulose tem ligaes glicosdicas -1,4 e o amido, -1,4.
107. Legaes beta-1,4 so caractersticas de que tipo de saccardeos? E os alfa-1,4?
Celulose e amido, respectivamente.
108. Explique porque a celulose forma fibras rgidas e o amido no.
A celulose tem ligaes glicosdicas lineares, o que lhe confere maior resistncia
(principalmente ao esforo de trao) em oposio ao amido que tem a forma espiral.
109. Descreva a estrutura do amido.

O amido um polissacardeo formado por ligaes glicosdicas -1,4 e tem a forma


espiralada.
110. De que produto se deriva a maltose?
A maltose resultado da hidrlise do amido, realizada pela maltase.

111. Descreva a estrutura da Sacarose.


Resultado de uma reao de hidrlise entre uma -D-glicose e uma -D-frutose.

AULA 10: LIPDEOS


112. Quais so as 2 principais funes dos lipdeos?
Formao de membranas celulares e armazenamento de nutrientes.
113. Quais so os 4 principais tipos de lipdeos encontrados na natureza?
cidos graxos; triacilglicerdeos; fosfolipdeos; esterides.
114. Explique com um exemplo o que um cido graxo.
-

um lipdio de longa cadeia carbnica com ou sem insaturaes e um gupro COO .

O
H3C

O
Palmitato

115. Explique com um exemplo o que um triacilglicerdeo.


um tri-ster formado a partir de cidos graxos.
O
H2C

HC

O R

O
H2C

O
R

Triacilglicerol

116. Explique com um exemplo o que um fosfolipdeo.


um lipdio constitudo por uma molcula de glicerol, duas cadeias de cidos graxos (uma
saturada e uma insaturada), um grupo fosfato e uma molcula polar ligada a ele.

HC

O R
R

CH3
H3C

H2C

CH2
CH2

CH3

CH2

O
Fosfatidilcolina

117. Quais as funes dos fosfolipdeos.


So os principais constituintes das membranas celulares. Por ter uma parte polar e outra
apolar, permitem a passagem seletiva de substncias atravs da parede das clulas.
118. Que caracterstica dos fosfolipdeos faz eles formarem em solues aquosas as
membranas biolgicas?
Suas duas ramificaes derivadas dos cidos graxos conferem-lhe uma forma cilndrica,
assim, devido ao seu carter anfiptico, suas molculas tendem a aglutinar-se na forma de
membranas. Caso tivesse apenas uma ramificao (como nos detergentes) formaria micelas.
119. Que cidos graxos so considerados mais saudveis, os saturados ou os
insaturados?
Os insaturados. Reduzem o risco de doenas cardiovasculares.
120. Quais cidos graxo insaturados so considerados mais saudveis, os com ligaes
trans, ou com ligaes cis?
Os da forma cis.
121. Porque fosfolipdeos com cidos graxos com ligaes em cis aumentam a fluidez da
membrana citoplasmtica?
Quanto maior o nmero de insaturaes, mais fluida a membrana pois menor ser a
possibilidade de interao entre molculas vizinhas.
122. Qual a funo do colesterol em relao a membranas biolgicas?
A concentrao de colesterol influencia na fluidez: quanto mais colesterol, menos fluida. O
colesterol, por ser menor e mais rgido, interage mais fortemente com os lipdeos adjacentes,
diminuindo sua capacidade de movimentao.
123. Como os lipdeos so transportados pelo sangue?
So transportados em forma de lipoprotenas. Estas so compostas por um ncleo formado
de triglicridos e colesterol. O ncleo apolar envolvido por uma camada polar de fosfolipdeos,
colesterol livre e por um componente protico denominado apoprotena.

124. Qual dos complexos protena/colesterol considerado como bom colesterole qual
como colesterol ruim?
HDL considerado bom e LDL e VLDL so considerados ruins (geram arterioesclerose).
125. Descreva a estrutura de uma membrana celular.
constituda por duas camadas lipdicas fluidas e contnuas onde esto inseridas molculas
proticas, receptores especficos, que confere o modelo mosaico fluido.
As molculas lipdicas constituem 50% da massa da maioria das membranas de clulas
animais, sendo o restante, constitudo de protenas. As molculas lipdicas so anfipticas, pois
possuem uma extremidade hidroflica ou polar (solvel em meio aquoso) e uma extremidade
hidrofbica ou no-polar (insolvel em gua). Os trs principais grupos de lipdios da membrana
so os fosfolipdeos, o colesterol e os glicolipdeos.
Os fosfolipdeos possuem uma cabea polar e duas caudas de hidrocarboneto hidrofbicas
(caracterstica que confere a dupla camada lipdica). As caudas so normalmente cidos graxos
com diferenas no comprimento, o que influi na fluidez da membrana.
As molculas de colesterol aumentam as propriedades de permeabilidade das duplas
camadas lipdicas. Ela torna a bicamada lipdica menos sujeita a deformaes, e assim, diminui a
permeabilidade da membrana.
Os glicolipdeos auxiliam na proteo da membrana plasmtica em condies adversas,
como pH baixo. Sua presena altera o campo eltrico atravs da membrana e das concentraes
dos ons na superfcie da membrana. Acredita-se que essas molculas participem dos processos
de reconhecimento celular, e alguns glicolipdeos propiciam pontos de entrada para algumas
toxinas bacterianas.

126. Descreva a estrutura da parede celular de bactrias.


Nas bactrias, a camada interna da membrana coberta por uma camada adicional de
peptdeoglicano. Caso a membrana no possua camada externa (gran +) a camada de
peptdeoglicano mais espessa. Do contrrio (gran -) essa camada mais fina e permanece entre
as camadas fosfolipdicas interna e externa.

AULA 11: BIOENERGTICA E BASES DO METABOLISMO

127. O que metabolismo? Qual a diferena entre anabolismo e catabolismo?


Metabolismo o nome dado a reaes qumicas que envolvem quebra sntese de ATP.
Catabolismo a fosforilao de ADP, sendo transformado em ATP, processo que exige energia.
Anabolismo a quebra do ATP em ADP, liberando energia.
128. Qual a funo principal do ATP?
O ATP uma fonte imediata de energia para a realizao das diversas formas de trabalho
celular.

AULA 12: GLICLISE


129. Qual a formula geral da gliclise?
130. O que acontece com o piruvato produzido na gliclise em condies anaerbicas?
So dois os caminhos para o piruvato na ausncia de O2: fermentao alcolica ou lctica.
Na fermentao alcolica, o piruvato convertido em aldedo actico pela piruvato
descarboxilase e, depois, em etanol pela lcool desidrogenase.
aldedo
actico

piruvato
+

CO2

CH

H3C

CH2
H3C

lcool
desidrogenase

piruvato
descarboxilase

H3C

NAD

NADH + H

C
C

etanol
+

Na fermentao lctica, piruvato convertido em lactato pela lactato desidrogenase.


piruvato

lactato
NADH + H+

O
O

NAD+
O

C
C
H3C

O
C
CH

O
lactato
desidrogenase

H3C

OH

OH

131. Qual a reao total da fermentao alcolica da glicose?

glicose + 2Pi + 2ADP + 2H+

2 etanol + 2CO2 + 2ATP + 2H2O

132. Qual a reao total da fermentao lctica da glicose?

glicose + 2Pi + 2ADP

2 lactato + 2ATP + 2H2O