BIB-5772 Biogeografia de plantas vasculares - 2016

Prof. Dr. José Rubens Pirani – IB-USP

Exercícios de FILOGEOGRAFIA

Nome: .......................................................................................................... Data: ...........................

1. Você amostrou 10 indivíduos de uma população, e todos eles têm um mesmo haplótipo. Qual das assertivas
abaixo não é uma explicação plausível ou fator contribuindo para essa observação?
a) Essa população tem muito poucos migrantes de outras populações.
b) Esse gene tem alta taxa de mutação.
c) Esses organismos têm tamanho populacional muito pequeno.
d) Essa população está atualmente passando por processo de gargalo (“bottleneck”).
e) Muito poucos adultos devem estar tendo sucesso reprodutivo a cada ano.

2. Duas espécies se separaram a partir do seu ancestral comum há 10 milhões de anos. Essas espécies têm uma
geração a cada 10 anos. Comparando 1000 pares de bases (bp) de sequências de DNA mitocondrial (mtDNA)
obtidas de cada espécie, encontrou-se que 100 bases são diferentes entre elas. A taxa de mutação desse gene
nessas plantas é:
a) 10% por milhão de gerações b) 5% por milhão de gerações
c) 5% por milhão de anos d) 1% por milhão de gerações
e) 1% por milhão de anos

3. Analise abaixo 10 sequências amostradas. Variações entre elas estão sublinhadas.

Espécime 1 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 2 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 3 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 4 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 5 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 6 AAATGCGTTCAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 7 AAATGCGCTGAATGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 8 AAATGCGCTCAACGCGATTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 9 AAATGCGCTCAATGCGTTTCCGCCCGTCGCTAAGAT
Espécime 10 AAATGCGCTCAATGCGATTCCGCCCGTAGCTAAGAT

1
a) Construa uma matriz de distância para essas sequências:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
1 X
2 X
3 X
4 X
5 X
6 X
7 X
8 X
9 X
10 X

b) Quantos haplótipos existem na amostragem? ..................

c) Qual a frequência de cada um desses haplótipos? ........................................................................................
d) Construa uma rede de haplótipos com essas sequências. Coloque a sequência ancestral num retângulo e insira
no retângulo e nos círculos da rede o número de cada haplótipo.

4. Qual das assertivas abaixo é falsa?

a) Baixa intensidade de migração rapidamente levará a homogeneização de populações estruturadas.
b) À medida que populações se tornam estruturadas, não se encontram tantos heterozigotos como se poderia
esperar.
c) Populações podem tornar-se estruturadas em decorrência de barreiras ou simplesmente por baixa dispersão.
d) Plantas anemófilas (polinizadas pelo vento) tendem a ter populações altamente estruturadas.

2
5. A figura abaixo ilustra a filogenia matrilinear e a rede de haplótipos de uma espécie rupícola do sul da África.
Que padrão filogeográfico poderia ser inferido nessa espécie?

3
6. A figura abaixo ilustra a filogenia matrilinear de três espécies distintas e simpátridas. Descreva sucintamente
as histórias filogeográficas hipotéticas representadas.

Exercícios 1 a 4 - elaborados a partir de exercícios propostos por Ronald Clouse.

Exercícios 5 e 6 extraídos de Morrone, J. 2009. Evolutionary Biogeography. Columbia Univ. Press. New York.