RELATÓRIO PRÁTICO

BIOINFORMÁTICA

Viven Janai Adolfo Lopes

SANTA CRUZ DO SUL

2023
1-INTRODUÇÃO

A bioinformática é uma área em constante crescimento que une a biologia, a

computação e a estatística para analisar dados biológicos a partir de técnicas
computacionais. Ela inclui a coleta, armazenamento, processamento e análise
de dados biológicos, e é essencial para a compreensão de muitos processos
biológicos, como a expressão gênica, a evolução e a descoberta de novas
drogas.

A bioinformática tem sido usada para entender o funcionamento dos

organismos vivos e a relação entre os diversos componentes celulares, como
as proteínas, os genes e as vias metabólicas. Esses dados podem ser usados
para identificar alvos terapêuticos e acelerar o desenvolvimento de novas
drogas, bem como para aprimorar a compreensão dos processos biológicos.

Atualmente, existem várias técnicas e ferramentas usadas na bioinformática,

como análise de sequências de DNA e proteína, modelagem molecular,
análise de vias metabólicas e análise de imagem.

Em conclusão, a bioinformática é uma ferramenta necessária para entender

melhor os processos biológicos e acelerar o desenvolvimento de novas
terapias. É uma disciplina em constante evolução, que oferece oportunidades
ilimitadas para tornar a pesquisa em biologia mais eficaz e eficiente

2-AULAS PRÁTICAS

Atividade prática - BLAST.

 1) realização de alinhamento das sequências no MEGA8.Primeiro se baixou o
programa. Na primeira aula prática cada aluno recebeu uma sequência de
um Gene abaixo a minha sequencia:
GENE:SEQUENCIA PARCIAL (ESTUDANTES EXTRA M)

MTTCCGGCTCCGAAGGTGCATCCAAGGCCAGCAAGTCCAAGACATCTTGCTCCACGAT
TTACCTTTCCGATGTGGCTGTCCCATCTGGCACCACCTTGGATCTCACGGACCTCAATG
ACGGTACCCACGTCATCTTCCAAGGAGAAACCACATTCGGCTACGAAGAATGGAAGGGC
CCTCTGGTGTCTGTTTCTGGGACCGATATTACCGTCGAAGGTGAGAGTGGCGCCGTCTT
GAATGGTGA

Após foi acessado o site do NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) e se

recuperou as sequências nucleotídica e proteica do gene de acordo com as
instruções do BLAST. Então se obteve a descrição do Gene completo e da da
região do Gene CDS: >XM_025608732.1 Aspergillus sclerotioniger CBS
115572 pectinase 3 (BO94DRAFT_479088), partial mRNA.
Nesta prática podemos notar que diversas são as sequências encontradas
no banco de dados, ou seja, esta sequência de nucleotídeos que formam os
aminoácidos e posteriormente as proteínas podem ser encontradas em
diversos organismos.

2)Aula Prática: Bancos de dados biológicos I: Nesta aula pelo site NCBI, foi
usada a sequência do Gene CDS >XM_025608732.1 Aspergillus sclerotioniger CBS
115572 pectinase 3 (BO94DRAFT_479088), partial mRNA; para se localizar 15
espécies diferentes se usou a o FAST e se observou as inúmeras sequências onde
se escolheu 15 diferentes, que foram arquivadas no documento de estudo da
aula,após foi feito no software Mega o sequenciamento.Se pode observar a
sequencia do domínio da proteína o que inclui sua grande família,pela classificação
glicoside hidrolase family 28 proteína.Nesta aula também se aprendeu a desenhar a
proteína.

3) Aula Prática: Bancos de dados biológicos II:Nesta aula o

professor indicou diversos sites para pesquisa utilizando o CDS da proteína como o
site Clustalw/muscle, que traz como informação uma investigação mais profunda
sobre a minha proteína. Pesquisando mais um pouco se encontra a predição do
domínio protéico,o funcionamento das membranas.Pela análise de Peptídeo sinal e
no programa Target se pode observar o pico do corte,por meio de imagens de
gráficos se observa o corte preciso.
Já o site Expasy poderia fornecer mais informações sobre minha proteína ,mas não
foi possível neste site encontrar alguma informação.No site Uniprot,de forma mais
clara e objetiva se encontram todas as informações referentes a proteína
Pectinase, a predição do domínio protéico( a minha proteína não tem domínio tem
função dentro e fora da membrana).Também se encontram informações sobre os
locais fosforilados,e as mudanças traducionais.

4) Aula Prática: Bancos Amplificação de sequências e desenho de

primers. Nesta aula se aprendeu através do banco de dados do site NCBI a

encontrar os Primers e sua sequência utilizada para os amplificar, inclusive se criou
2 projetos para treinar clones de primers. Ainda como informação pode se observar
pelo Banco de dados informações sobre a Patente da proteína(n° da patente,data
de apenção,organismo e descrição).

Resultados

Em conclusão, os bancos de dados biológicos são uma ferramenta fundamental

para a pesquisa em bioinformática. Eles fornecem acesso a uma grande quantidade
de informações e dados sobre sequências genéticas, proteínas, interações
moleculares e outras informações biológicas importantes. Além disso, esses bancos
de dados permitem que os pesquisadores analisem e visualizem esses dados de
maneiras que não seriam possíveis de outra forma. Com o uso desses bancos de
dados, a comunidade científica pode avançar na compreensão de processos
biológicos complexos e desenvolver novas terapias e tratamentos para doenças. No
entanto, é importante lembrar que esses bancos de dados contêm informações
sensíveis e valiosas que precisam ser protegidas para garantir a privacidade e a
segurança dos dados.
Referências Bibliográficas e textos complementares

1. NCBI: A Science Primer - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/About/primer/index.htm

13/03/23
2. https://services.healthtech.dtu.dk/cgi-bin/webface2.cgihttp://www.enzim.hu/hm
mtop/index.php 20/03/23
3. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/About/primer/bioinformatics.html 10/04/23
4. https://www.uniprot.org/uniprotkb/A0A317V101/entry 03/04/23

5. https://www.expasy.org/ 03/04/23
6. https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/ 20/03/23