Biologia Molecular, LB 2023/2024

Exercícios Bloco 2
Transcrição Procariotas e Eucariotas

1. Faça a legenda da seguinte figura:

Qual a polaridade da cadeia que está a ser usada como molde?

2. Quando a RNA polimerase adiciona nucleótidos à molécula de RNA em síntese

verifica-se que:

a) Os nucleótidos dATP, dCTP, dGTP e dUTP, a serem incorporados, vão ser

hidrolisados com libertação de fosfato inorgânico;

b) os nucleótidos ATP, CTP, GTP e UTP, a serem incorporados, vão ser hidrolisados
dando origem respectivamente a ADP, CDP, GDP e UDP;

c) os nucleótidos ADP, CDP, GDP e UDP, a serem incorporados, vão ser

hidrolisados dando origem respectivamente a AMP, CMP, GMP e UMP;

d) os nucleótidos ATP, CTP, GTP e UTP, a serem incorporados, vão ser hidrolisados
libertando uma molécula de pirofosfato por nucleótido;

e) a única molécula que tem de ser hidrolisada é o ATP.

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3. Qual destes pares ilustra corretamente o emparelhamento de nucleótidos de DNA e

RNA?

A GTTACG D GTTACG
CAATCG ACCGTA
B GTTACG E GTTACG
CAAUGC UAACAU
C GTTACG F GTTACG
GTTACG TAACGT

4. Uma cadeia de uma molécula de DNA tem a seguinte sequência de bases

5′.…ATTCGTACGATCGACTGACTGACAGTC….3′

a) Indique a sequência de bases complementares na outra cadeia de DNA.

b) Indique a sequência de RNA resultante da transcrição do seguinte fragmento

5. Uma cadeia de DNA possui a seguinte sequência:

3'-AGTACAAACTATCCACCGTC-5 ‘

a) Para que ocorra a transcrição dessa cadeia, qual a sequência de reconhecimento

específica que deveria estar presente e onde deveria estar localizada

b) Em que direção ocorrerá a transcrição

c) Indique a sequência de RNA resultante da transcrição deste fragmento, não

esquecendo a polaridade da cadeia

6. Uma RNA polimerase está a transcrever um segmento de DNA que contém a

seguinte sequência:

5ʹ-GTAACGGATG-3ʹ

3ʹ-CATTGCCTAC-5ʹ

a) Qual das cadeias de DNA serve de molde se a bolha de transcrição se estiver a

mover da esquerda para a direita?

b) Qual será a sequência do RNA resultante?

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7. Considere a figura abaixo representada em que as regiões A, B, C e D abrangem

ambas as cadeias

a) Qual a região da sequência de DNA que mais provavelmente será transcrita em

mRNA?

b) O início da sequência do transcrito será ....

c) Quais são as regiões que, no seu conjunto, constituem o promotor bacteriano?

d) Como classifica as diferentes regiões de acordo com a sua posição?

8. Considere a sequência de um terminador independente de Rho

5’-CCCAGCCCGCCUAAUGAGCGGGCUUUUUUUU -3’

Explique porque é que uma mutação pontual em qualquer um dos nucleótidos

assinalados perturba a terminação da transcrição.

9. Explique o que acontece na regulação do operão lac nas seguintes condições?

10. Tendo em conta os seguintes mutantes de E. coli para o operão lac e as condições
descritas em A e B, como prevê que se dê a expressão do gene lacZ (não há expressão,
nível basal de expressão ou nível elevado de expressão)

A. Um mutante tem uma mutação no operador que impede a ligação do repressor

a. Na presença de glucose, ausência de lactose

b. Na presença de glucose e lactose
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c. Na ausência de glucose e lactose

d. Na ausência de glucose, presença de lactose

B. Um mutante tem uma mutação no promotor (para os genes lacZ, lacY, e lacA) que
impede a ligação da RNA polimerase

a. Na presença de glucose, ausência de lactose

b. Na presença de glucose e lactose
c. Na ausência de glucose e lactose
d. Na ausência de glucose, presença de lactose

11. Considerando o seguinte diagrama, qual das seguintes frases é verdadeira

relativamente ao RNA maduro transcripto deste gene? Justifique

A. Todos os nucleótidos no transcrito primário encontram-se no transcrito maduro

B. Todos os nucleótidos no transcrito maduro encontram-se no transcrito primário

C. A transcrição começa na posição +1

D. A tradução começa na posição +1

E. Nenhuma das opções anteriores

12. O processamento de um transcripto primário para produzir uma mRNA maduro

inclui todos os processos seguintes EXCEPTO:

A. Poliadenilação

B. Capping

C. Metilação de adenina

D. Splicing

E. Todos fazem parte do processamento de RNA

13. Assumindo que todos os exões podem sofrer splicing alternativo, quantos mRNAs
distintos podem ser gerados pelo gene da figura?
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A. 3

B. 6

C. 7

D. 24

E. 72

14. Considere a heterodúplice observada em microscopia electrónica, resultante da

hibridação de um mRNA, isolado de um organismo eucariótico, com o correspondente
fragmento de DNA

a) Qual é a cadeia de mRNA?

b) Quantos intrões possui o gene em

causa?

15. Assuma que um gene eucariótico contém dois exões e um intrão. Considerando as
moléculas correspondentes de DNA, pre-mRNA e mRNA, refira onde pode encontrar
o seguinte:

A) codão de fim da tradução

B) região do promotor
C) sequência de consenso AAUAAA
D) início da transcrição (+1)
E) região 3’ não traduzida (3’-UTR)
F) Intrões
G) exões
H) região 5’ não traduzida (5’-UTR)
I) codão de início da tradução
J) cauda poli-A
K) cap 5’
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Soluções:
1. (1.) Cadeia codificante ou não-molde; (2.) Cadeia molde; (3.) Nucleótidos livres; (4.) Bolha de
transcrição. Polaridade da cadeia molde: 3’-5’
2. d)
3. B
4. (a) 3’...TAAGCATGCTAGCTGACTGACTGTCAG...5’;
(b) 5’ ...AUUCGUACGAUCGACUGACUGACAGUC...3’
5. (a) Promotor, à direita; (b) Cadeia molde 5’-3’, direção da transcrição da direita para a esquerda;
(c) 5’-CUGCCACCUAUCAAACAUGA-3’
6. (a) 3´-5’; (b) 5’-GUAACGGAUG-3’
7. (a) Região A; (b) 5’ GUACGUACAGU 3’; (c) Regiões B e C; (d) Região A: upstream (montante),
Regiões B, C, D: downstream (jusante)
8. Sequências invertidas. Qualquer mutação nestes nucleótidos impediria a formação do hairpin
(stem-loop), necessário para levar à terminação da transcrição.
9. (1) Ocorre transcrição do operão lac a um nível basal. Na presença de lactose, o repressor é
inactivado pela sua interação com o indutor (alolactose), pelo que não se liga ao operador.
Embora nestas condições a RNA polimerase consiga ligar-se à região promotora para iniciar
transcrição, a sua afinidade com as sequências de reconhecimento da região promotora é baixa,
levando a uma baixa eficiência de transcrição. Para que a RNA polimerase estabeleça uma ligação
forte com o promotor e transcreva eficientemente os genes dos operão, necessita do auxílio de
um activador (complexo CAP-cAMP) que se liga a um local adjacente. Contudo, na presença de
glucose, não se forma o complexo CAP-cAMP, porque não há cAMP disponível para se ligar à
proteína activadora CAP; (2) Não ocorre transcrição. Na ausência de lactose, a proteína repressora
(repressor) não é inactivada, permanecendo ligada ao operador. Sempre que a proteína
repressora se encontra ligado ao operador, a RNA polimerase não consegue estabelecer ligação
com o promotor; (3) Ocorre transcrição eficiente do operão lac – genes lac fortemente expressos.
A transcrição eficiente do operão lac implica não só que indutor esteja presente (depende da
presença de lactose) para inactivar o repressor lac, como também que cAMP esteja disponível
para se ligar a CAP (depende da ausência de glucose) que se liga ao DNA para facilitar a
transcrição.
10. (A): a),b) – nível basal de expressão; c),d) nível elevado de expressão; (B) Não há expressão,
independentemente das condições descritas, uma vez que a RNA polimerase não se pode ligar.
11. C
12. C
13. C
14. (a) As ansas correspondem a intrões que ficaram por emparelhar na hibridação de DNA:mRNA,
pelo que a cadeia de mRNA é a que não tem ansas; (b) 7.
15. (A) DNA, pre-mRNA e mRNA; (B) DNA; (C) pre-mRNA e mRNA; (D) DNA; (E) DNA, pre-mRNA
e mRNA; (F) DNA, pre-mRNA; (G) DNA, pre-mRNA e mRNA; (H) DNA, pre-mRNA e mRNA; (I) DNA,
pre-mRNA e mRNA; (J) mRNA; (K) mRNA.