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Universidade Federal de Pernambuco – UFPE

Centro de Biociências- CB
Disciplina – Genética 1
Monitores: Bruna Coelho, Evelyn Melo, Giovanna Fabyanne, Maria
Julieta Uchôa, Maria Luiza Silva e Pedro Maia

Atividade Revisão - Módulo 1

1. Qual é a principal função de uma enzima de restrição na clonagem gênica?


a) Induzir mutações em sequências específicas de DNA.
b) Cortar várias sequências do DNA plasmidial para que alguma consiga se
ligar ao gene de interesse.
c) Cortar todo o material genético de um organismo.
d) Cortar fragmentos específicos do DNA como o sítio EcoRI.
e) Silenciar genes através da restrição de fragmentos específicos do DNA
plasmidial.

2. Qual a importância da DNA ligase na clonagem gênica?


a) Permitir a replicação correta do DNA.
b) Ligar os fragmentos de DNA selando as lacunas.
c) Fornecer regiões 3’ para que o gene de interesse consiga se ligar.
d) Ligar o DNA plasmidial a proteínas do citoplasma.
e) Nenhuma das alternativas

3. É fato que algumas endonucleases, como a EcoRI, cortam o DNA produzindo


extremidades de fita única, chamadas algumas vezes de “extremidade pegajosa”. Qual a
importância da produção dessas extremidades?
a) Permitir terminações de fita simples que podem se ligar por complementaridade
de bases ao gene-alvo.
b) Formar extremidades de fácil ligação com a RNA polimerase.
c) Permitir a ligação do DNA bacteriano ao DNA plasmidial.
d) Permite a formação de uma extremidade dupla fita que se liga facilmente ao
gene-alvo.
e) Nenhuma das alternativas.

4. Quais dessas não é uma das possibilidades de ligação após o corte pela enzima de
restrição?
a) O plasmídio se fecha.
b) O gene-alvo se encaixa na direção correta.
c) O gene-alvo se encaixa na direção contrária.
d) As alternativas A, B e C estão corretas.
e) Nenhuma das alternativas.
5. Defina BLAST e explique a diferença entre BLASTn, BLASTx, tBLASTn e
BLASTp.

6. Quanto ao E-value, selecione a alternativa correta:


a) Quanto mais próximo de zero, menos confiabilidade terá o alinhamento.
b) Um alinhamento com E-value de 2e-10 é mais confiável do que outro com
E-value de 2e-05.
c) Quando o E-value for de 0.0, significa que o alinhamento é altamente confiável.
d) Quanto maior o E-value, melhor foi o seu alinhamento.
e) Nenhuma das alternativas

7. Imagine que você queira realizar uma pesquisa em um banco de nucleotídeos


utilizando uma sequência FASTA de nucleotídeos. Qual BLAST você deve realizar?
a) BLASTn
b) BLASTx
c) tBLASTn
d) BLASTp
e) Nenhuma das alternativas

8. Em que processo celular in vivo a técnica de PCR se baseia?

9. Cite as temperaturas (Cº) utilizadas nas principais etapas do PCR.

10. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) é uma técnica bastante utilizada em


laboratórios que consiste na amplificação cíclica de DNA a partir de uma amostra. Para
a realização de tal prática, são necessários alguns componentes, entre eles estão:
I) Taq polimerase
II) Um primer para a fita contínua e outros primers, sintetizados pela primase, para a
fita descontínua
III) DNA molde
IV) Dideoxinucleotídeos trifosfato (ddNTP’s)
Assinale a alternativa que contenha os componentes necessários:
a) I,II,III e IV estão corretas b) I, II e III estão incorretas.
c) II e IV estão incorretas d) I e IV estão corretas e) N.D.A

11. Marque V para verdadeiro e F para falso:


( ) A adição de um ddNTP na preparação do PCR interfere nas ligações de Hidrogênio
presente entre os nucleotídeos, favorecendo assim o sequenciamento proposto por
Sanger.
( ) A enzima de replicação usada no PCR é específica, pois, para que o processo
ocorra sem interrupções, a enzima tem que ser resistente a altas temperaturas, a exemplo
da Taq DNA polimerase.
( ) Na técnica de Sanger, os terminadores de cadeia (ddNTPs) não possuem corantes
fluorescentes, o que dificulta a identificação das bases durante a leitura.
( ) Desoxirribonucleotídeos (dNTP’s) e Dideoxinucleotídeos (ddNTP’s) diferem entre
si pela ausência da hidroxila situada no carbono 3’, situação encontrada nos dNTP’s.
( ) Primers com regiões complementares entre si devem ser evitados, pois há a
possibilidade de formação de dímeros de primers, o que impede seu anelamento e
consequente extensão.

12. Quais são as propriedades que fazem do DNA uma molécula informacional mais
estável?

13. Cite as enzimas envolvidas na replicação do DNA e explique as funções de cada


uma delas.

14. O que são as DNA polimerases? Quais são as suas características?

15. Na duplicação do DNA, cada fita na dupla hélice atua como modelo para a síntese
de uma nova fita complementar. Dessa forma, a duplicação é:
a) Conservativa
b) Dependente
c) Semiconservativa
d) Complementar
e) Nenhuma das anteriores

16. Explique quais são as proteínas reguladoras na expressão gênica em procariotos e


suas respectivas funções.

17. Não é uma proteína codificada pelo Operon Lac:


a) Permease
b) β-galactosidase
c) Ribulocinase
d) Transacetilase
e) Nenhuma das alternativas

18. Sobre o mecanismo que codifica enzimas de absorção e digestão de lactose do meio
em procariotos, o Operon Lac, assinale V ou F para as alternativas:

( ) A expressão das três proteínas codificadas pelo Operon policistrônico é regulada


pelo gene I.
( ) No Operon existe apenas a região do operador que é o local onde inicia a
transcrição e também são locais de controle.
( ) O Operon Lac é constituído por um promotor, um operador e dois genes estruturais.
( ) O gene I é capaz de codificar um repressor e na ausência de lactose esse repressor
se liga a região do operador e bloqueia a transcrição.
( ) A enzima permease é responsável por transportar lactose do meio extracelular para
o intracelular através da membrana celular bacteriana, pois a lactose não é capaz de
ultrapassar a bicamada lipídica sem uma proteína carreadora.

19. Explique a relação entre AMPc e Glicose.

20. O que são Operon Ara e Operon Triptofano e quais as suas funcionalidades?

21. Assinale (V) para verdadeiro e (F) para falso:


a) ( ) A sequência TATA box, que fica localizada na região promotora do gene,
serve para que os fatores de transcrição reconheçam o local e se liguem para que
a RNA polimerase II se ligue e possa ir adicionando os nucleotídeos com uma
orientação correta.
b) ( ) O processo para formar o RNAm maduro consiste na adição do CAP 5' na
extremidade 5' e na adição da cauda Poli A na extremidade 3'.
c) ( ) O CAP e a cauda PoliA tem a função de proteger e auxiliar o transcrito a ser
transportado para o ribossomo.
d) ( ) O splicing consiste na remoção das chamadas "sequências lixo", os íntrons.
Essas sequências são reconhecidas e removidas pelos chamados spliceossomos.
e) ( ) Nos eucariotas, uma única RNA polimerase transcreve todos os tipos de
RNA , mas nos procariotas existem três RNA polimerases diferentes: RNA
polimerase I, RNA polimerase II e a RNA polimerase III.

22. Qual a função do tRNA e por que uma de suas estruturas possui a nomenclatura
“anti-códon”?

23. Explique como ocorre o posicionamento correto do ribossomo no mRNA para o


início da tradução, diferenciando o processo entre procariontes e eucariontes.

24. O ribossomo possui 3 sítios de ligação. Quais seriam esses sítios e o que ocorre em
cada um deles? Descreva.

25. Na síntese de proteínas, há um códon de iniciação que é padrão, o “AUG”. Com isso
todas as proteínas iniciam sua cadeia polipeptídica a partir do mesmo aminoácido, que
é:
a) Leucina
b) Serina
c) Ácido Glutâmico
d) Metionina
e) Nenhuma das respostas

26. O que são dímeros de timina, qual a consequência dos mesmos e qual o mecanismo
de reparo que repara essa mutação?
27. No reparo de um pareamento errado, como se sabe a fita a ser usada como guia para
o pareamento (a fita mais nova)?

28. Quais as quatro enzimas ligadas ao reparo por excisão de bases?

29. Em termos gerais, defina como funciona o sistema de reparo citando e explicando as
4 fases gerais.

30. Quais as características essenciais para um plasmídeo ser selecionado para


clonagem?

31. Sobre mutações e danos no DNA, marque V para verdadeiro e F para falso:
( ) Mutações em células germinativas são herdadas pelos descendentes enquanto
mutações em células somáticas permanecem no mesmo indivíduo.
( ) A mutação gênica por substituição de bases pode ser classificada em transição e
transversão, sendo a transição mais crítica por haver a substituição de bases púricas por
bases pirimidicas.
( ) A anemia falciforme é uma condição em que as hemácias de um indivíduo sofrem
mutações em sua sequência gênica alterando apenas sua conformação. Essa mutação é
classificada como uma transição, já que há a substituição de uma adenina por uma
timina, ambas bases púricas.
( ) O códon GCC expressa a proteína Alanina; ocorreu uma substituição de bases,
formando agora o códon GCU, porém a Alanina continuou sendo expressa. A mutação a
qual nos referimos é uma mutação silenciosa.

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